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DNA的結(jié)構(gòu)與功能DNA的結(jié)構(gòu)與功能DNA的結(jié)構(gòu)與功能1DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/20242DNA的結(jié)構(gòu)
1.DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)
2.DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)
3.DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)4.真核生物DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)
5.DNA的性質(zhì)2DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/2024DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)3?DNA分子中各脫氧核苷酸之間的連接方式(3′-5′磷酸二酯鍵)和排列順序叫做DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu),簡(jiǎn)稱為堿基序列。
一級(jí)結(jié)構(gòu)的走向規(guī)定為5′→3′。5′3′3DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/2024DNA一級(jí)結(jié)構(gòu)的表示法45′3′結(jié)構(gòu)式5′3′
p
p
p
pOH3′ACTG1′線條式5′
ACTGCATAGCTCGA3′字母式4DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/2024DNA一級(jí)結(jié)構(gòu)的基本特點(diǎn)51、雙鏈反向平行配對(duì)而成2、脫氧核糖和磷酸交替連接,構(gòu)成DNA骨架,堿基排在內(nèi)側(cè)3、內(nèi)側(cè)堿基通過氫鍵互補(bǔ)形成堿基對(duì)(A:T,C:G)4、DNA在堿性條件下穩(wěn)定性強(qiáng),不斷裂。pH=11.5時(shí)仍穩(wěn)定,而RNA易被堿水解5DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/20242.DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)61953沃森和克里克根據(jù)DNA纖維X射線晶體衍射圖,提出了DNA分子結(jié)構(gòu)的雙螺旋模型。FrancisCrickandJamesWatson(獲1962年諾貝爾生理學(xué)醫(yī)學(xué)獎(jiǎng))6DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/2024DNA雙螺旋的基本特征7
兩條鏈反向平行,圍繞同一中心軸構(gòu)成右手雙螺旋。
相臨堿基對(duì)間距離為0.34nm,每周螺距為3.4nm(10bp),d為2nm。
雙螺旋有兩種不同的溝(大溝和小溝)。大溝攜帶分子可識(shí)別信息,是蛋白質(zhì)識(shí)別DNA堿基序列產(chǎn)生相互作用的基礎(chǔ)。7DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/2024DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定因素81.堿基對(duì)間的氫鍵2.堿基堆積力(1)相鄰堿基對(duì)間的范德華力(2)堿基對(duì)間的疏水作用力3.磷酸基上負(fù)電荷被胞內(nèi)組蛋白或正離子中和,降低靜電張力8DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/2024DNA雙螺旋類型9A-DNA20
0.26
2.6
11右B-DNA60.34
2.0
10右Z-DNA7
0.371.812左雙螺旋堿基傾角/(。)堿基間距/nm螺旋直徑/nm每輪堿基數(shù)螺旋方向9DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/20243.DNA三級(jí)結(jié)構(gòu)10DNA在細(xì)胞內(nèi)以雙螺旋為基礎(chǔ)進(jìn)一步旋轉(zhuǎn)折疊成超螺旋結(jié)構(gòu)。超螺旋正超螺旋負(fù)超螺旋盤繞方向與DNA雙螺旋方向相同盤繞方向與DNA雙螺旋方向相反
DNA超螺旋結(jié)構(gòu)10DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/202411DNA超螺旋是由DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶(拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ)產(chǎn)生的。環(huán)狀DNA分子常以超螺旋結(jié)構(gòu)存在,并以負(fù)超螺旋為主,有利于轉(zhuǎn)錄的起始。11DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/20244.真核生物DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)12
真核生物DNA與蛋白質(zhì)形成非常致密的復(fù)合物存在于細(xì)胞核內(nèi),基本結(jié)構(gòu)式核小體。核小體DNA組蛋白H2A、H2B、H3、H4:八聚體核心組蛋白H1:連接區(qū)12DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/2024核小體的結(jié)構(gòu)13DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/2024核小體鏈(11nm,每個(gè)核小體200bp)纖絲(30nm,每圈6個(gè)核小體)突環(huán)(150nm,每個(gè)突環(huán)大約75000bp)玫瑰花結(jié)(300nm,6個(gè)突環(huán))螺旋圈(700nm,每圈30個(gè)玫瑰花)染色體(1400nm,每個(gè)染色體含10個(gè)玫瑰花200bp)--人的染色體壓縮8000-10000DNA(2nm)14DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/2024核小體盤繞及染色體示意圖1515DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/2024DNA的性質(zhì)16
DNA的變性
定義:某些理化因素會(huì)導(dǎo)致DNA雙鏈互補(bǔ)堿基之間的氫鍵發(fā)生斷裂,使雙鏈DNA解離為單鏈。只改變DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu),不改變它的核苷酸序列。
變性因素:過量酸、堿,加熱,離子強(qiáng)度改變等。
變性后理化性質(zhì)的主要改變:粘度下降比旋光度下降OD260增色(增色效應(yīng))16DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/202417DNA變性的本質(zhì)是雙鏈間氫鍵的斷裂17DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/202418
DNA的增色效應(yīng)—DNA變性時(shí)其溶液OD260值增高18DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/202419
解鏈曲線(meltingcurve)
解鏈溫度(溶解溫度,Tm)在解鏈過程中,UV吸收值的變化達(dá)到最大變化值一半時(shí)對(duì)應(yīng)的溫度,此溫度時(shí),50%DNA雙鏈打開。
Tm值與DNA均一性和長(zhǎng)短、堿基GC含量、溶液離子強(qiáng)度、相關(guān),GC含量越高,Tm值越高。19DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/202420
Tm值的計(jì)算及應(yīng)用Tm=69.3+0.41×(G+C)/(G+C+A+T)×100%小于20bp的寡核苷酸片段Tm=4(G+C)+2(A+T)PCR退火溫度比Tm值低4~6℃20DNA的結(jié)構(gòu)與功能5/9/202421
DNA的復(fù)性
定義:DNA回復(fù)成雙鏈結(jié)構(gòu),稱為復(fù)性。
影響復(fù)性的因素:樣品的性質(zhì)、DNA片段的大小、DNA濃度、溫度、離子強(qiáng)度等。
復(fù)性后理化性質(zhì)的改變:粘度增大;比旋光度變大;OD260下降(低色效應(yīng))21DNA
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