pubmed文獻(xiàn)檢索課件

PubMed網(wǎng)上MEDLINE檢索5/9/20241pubmed文獻(xiàn)檢索課件

基本情況檢索方法結(jié)果處理5/9/20242pubmed文獻(xiàn)檢索課件基本情況5/9/20243pubmed文獻(xiàn)檢索課件PubMed簡(jiǎn)介PubMed系統(tǒng)是由美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心（NCBI）開(kāi)發(fā)的用于檢索MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)的網(wǎng)上檢索系統(tǒng)。5/9/20244pubmed文獻(xiàn)檢索課件進(jìn)入PubMed的方法Http:///pubmed5/9/20245pubmed文獻(xiàn)檢索課件數(shù)據(jù)來(lái)源MEDLINEInProcessCitations

Publisher-SuppliedCitations

5/9/20246pubmed文獻(xiàn)檢索課件Medline收錄文獻(xiàn)起止時(shí)間1948年以來(lái)醫(yī)學(xué)、護(hù)理、牙科、獸醫(yī)、衛(wèi)生保健、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)70多個(gè)國(guó)家和地區(qū)的5000多種生物期刊,在線圖書書目文摘條目2000萬(wàn)條5/9/20247pubmed文獻(xiàn)檢索課件InProcess1998年開(kāi)始建立，是一個(gè)臨時(shí)性醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)收錄由出版商提供的尚未經(jīng)過(guò)規(guī)范化處理的新數(shù)據(jù)提供簡(jiǎn)單的書目信息和文摘數(shù)據(jù)每周轉(zhuǎn)入MEDLINE一次有inprocess的標(biāo)記5/9/20248pubmed文獻(xiàn)檢索課件Publisher-SuppliedCitations

由出版商提供的電子文獻(xiàn)記錄，不屬于MEDLINE收錄范圍的標(biāo)記為:[PubMed]或[PubMed–assuppliedbypublisher]出版商提供的先于印刷版文獻(xiàn)出現(xiàn)的網(wǎng)絡(luò)版題錄[Epubaheadofprint]5/9/20249pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202410pubmed文獻(xiàn)檢索課件檢索方法5/9/202411pubmed文獻(xiàn)檢索課件基本檢索功能Limits檢索功能高級(jí)檢索功能主題詞數(shù)據(jù)庫(kù)檢索功能其他檢索功能5/9/202412pubmed文獻(xiàn)檢索課件基本檢索功能自動(dòng)詞語(yǔ)匹配功能強(qiáng)制檢索功能截詞檢索布爾檢索字段檢索5/9/202413pubmed文獻(xiàn)檢索課件自動(dòng)詞語(yǔ)匹配功能

自動(dòng)詞語(yǔ)匹配是PubMed最具特色的檢索功能之一，PubMed會(huì)自動(dòng)對(duì)輸入的檢索詞進(jìn)行分析、匹配、轉(zhuǎn)換并檢索，是一種智能化的檢索過(guò)程。5/9/202414pubmed文獻(xiàn)檢索課件自動(dòng)詞語(yǔ)匹配基本原理對(duì)輸入的檢索詞，系統(tǒng)首先在多個(gè)索引詞表

MeSH轉(zhuǎn)換表刊名轉(zhuǎn)換表著者索引及轉(zhuǎn)換表進(jìn)行搜索、比對(duì)，并自動(dòng)轉(zhuǎn)換為相應(yīng)的MeSH主題詞、著者或刊名5/9/202415pubmed文獻(xiàn)檢索課件自動(dòng)詞語(yǔ)匹配基本原理再將檢索詞在allfields（所有字段）中檢索，并執(zhí)行“OR”布爾邏輯運(yùn)算。如果輸入多個(gè)檢索詞或短語(yǔ)詞組，系統(tǒng)會(huì)繼續(xù)將其拆分為單詞后分別在allfields（所有字段）中檢索，單詞之間的布爾邏輯關(guān)系為“AND”。5/9/202416pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202417pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202418pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202419pubmed文獻(xiàn)檢索課件如果在3個(gè)轉(zhuǎn)換表中都沒(méi)有把詞組分開(kāi)重復(fù)進(jìn)行自動(dòng)匹配直到找到匹配詞為止。如果還沒(méi)有找到匹配詞系統(tǒng)將把單個(gè)詞用邏輯”與”組配并到所有字段中檢索。5/9/202420pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202421pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202422pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202423pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202424pubmed文獻(xiàn)檢索課件singlecell("singleperson"[MeSHTerms]OR("single"[AllFields]AND"person"[AllFields])OR"singleperson"[AllFields]OR"single"[AllFields])AND("cell"[AllFields]OR"cells"[MeSHTerms]OR"cells"[AllFields])5/9/202425pubmed文獻(xiàn)檢索課件強(qiáng)制檢索功能如果將短語(yǔ)作為一個(gè)詞組進(jìn)行檢索，可用“”將其引起來(lái)。系統(tǒng)不進(jìn)行自動(dòng)詞語(yǔ)匹配的轉(zhuǎn)換系統(tǒng)不能進(jìn)行擴(kuò)展檢索5/9/202426pubmed文獻(xiàn)檢索課件“singlecell”

single-cell

singlecell[ti]

5/9/202427pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202428pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202429pubmed文獻(xiàn)檢索課件截詞檢索截詞符“*”可代表多個(gè)字符PubMed一次最多可以檢索出600個(gè)詞形變異詞。截詞功能只限于單詞，對(duì)詞組無(wú)效5/9/202430pubmed文獻(xiàn)檢索課件布爾檢索布爾運(yùn)算符AND，OR，NOT必須大寫從左至右進(jìn)行布爾運(yùn)算以通過(guò)加圓括符改變運(yùn)算順序5/9/202431pubmed文獻(xiàn)檢索課件

檢索詞后附加字段標(biāo)識(shí)字段標(biāo)識(shí)要用方括號(hào)括起來(lái)，位于檢索詞之后例如dna[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]字段限定檢索5/9/202432pubmed文獻(xiàn)檢索課件字段標(biāo)識(shí)字段名稱簡(jiǎn)要說(shuō)明ADAffiliation第一責(zé)任者的工作單位、地址，合同號(hào)ALLAllFields全字段AUAuthorName著者姓名IPIssue期刊的期號(hào)TAJournalTitle期刊名稱或ISSN號(hào)LALanguage語(yǔ)言文種MAJRMeSHMajorTopic主要MeSH主題詞MHMeSHTerms全部MeSH主題詞PGPageNumber期刊頁(yè)碼DPPublicationDate文獻(xiàn)出版日期PTPublicationType文獻(xiàn)類型包括綜述、臨床試驗(yàn)、通信等TWTextWords題名詞和文摘詞TITitlewords題名詞VIVolume期刊卷號(hào)5/9/202433pubmed文獻(xiàn)檢索課件Limits限定檢索功能出版日期出版類型語(yǔ)種研究對(duì)象限制檢索子集年齡性別可以對(duì)全文、文摘限制檢索可以限制檢索字段5/9/202434pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202435pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202436pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202437pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202438pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202439pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202440pubmed文獻(xiàn)檢索課件練習(xí)查找1997-2000高血壓（hypertension）與鼻出血（nosebleed）的有關(guān)文獻(xiàn)5/9/202441pubmed文獻(xiàn)檢索課件高級(jí)檢索(advancedsearch)檢索欄searchbox檢索編輯器searchbuilder檢索史history更多資源moreresources檢索細(xì)節(jié)details5/9/202442pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202443pubmed文獻(xiàn)檢索課件檢索編輯器searchbuilder5/9/202444pubmed文獻(xiàn)檢索課件查找微量元素銅、鐵、鋅與白血病的文獻(xiàn)CopperIronZincleukemia5/9/202445pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202446pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202447pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202448pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202449pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202450pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202451pubmed文獻(xiàn)檢索課件MeshDatabase檢索瀏覽Mesh詞表選擇規(guī)范化主題詞選擇副主題詞查看主題詞注釋瀏覽樹(shù)狀結(jié)構(gòu)表建立檢索式5/9/202452pubmed文獻(xiàn)檢索課件利用MeSH主題詞檢索有關(guān)艾滋病的文獻(xiàn)5/9/202453pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202454pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202455pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202456pubmed文獻(xiàn)檢索課件MeSH主題詞檢索是PubMed最具特色的檢索功能之一，能保證較好的查全率和查準(zhǔn)率。這是因?yàn)椋海?）主題詞對(duì)同一概念的不同表達(dá)方式進(jìn)行了規(guī)范。（2）主題詞可以組配相應(yīng)的副主題詞，使檢索結(jié)果更加專指。5/9/202457pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202458pubmed文獻(xiàn)檢索課件（3）用主題詞的樹(shù)狀結(jié)構(gòu)表，可以很方便進(jìn)行主題詞的擴(kuò)展檢索（Explode）。默認(rèn)狀態(tài)下，系統(tǒng)自動(dòng)對(duì)含有下位概念的主題詞進(jìn)行擴(kuò)展檢索，點(diǎn)選DoNotExplodethisterm則不進(jìn)行主題詞擴(kuò)檢。

5/9/202459pubmed文獻(xiàn)檢索課件4）應(yīng)用MeSH主題詞的MajorTopic（主要主題詞）檢索：可以使檢索結(jié)果更加準(zhǔn)確。點(diǎn)選RestrictionsSearchtoMajorTopicheadingsonly，限定檢索結(jié)果為主要主題詞。5/9/202460pubmed文獻(xiàn)檢索課件建立檢索式如果有多個(gè)主題詞，可以先分別對(duì)每個(gè)主題詞進(jìn)行檢索，再在高級(jí)檢索的SearchHistory中用檢索序號(hào)進(jìn)行布爾邏輯運(yùn)算；也可以通過(guò)主題詞檢索頁(yè)面的PubMedsearch直接建立檢索式5/9/202461pubmed文獻(xiàn)檢索課件膝關(guān)節(jié)滑囊炎的診斷，要求膝關(guān)節(jié)為主要主題詞5/9/202462pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202463pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202464pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202465pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202466pubmed文獻(xiàn)檢索課件其他檢索功能5/9/202467pubmed文獻(xiàn)檢索課件特定文獻(xiàn)檢索點(diǎn)擊singlecitationmatcher或batchcitationmatcher按界面提示輸入所知信息點(diǎn)擊search5/9/202468pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202469pubmed文獻(xiàn)檢索課件ClinicalQueries臨床咨詢研究范疇:一般疾病的病因?qū)W、預(yù)后、診斷、預(yù)防以及治療FindingSystematicReviews：提供系統(tǒng)評(píng)價(jià)、meta分析、臨床試驗(yàn)綜述臨床指南等循證醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)信息的查找MedicalGeneticsSearches5/9/202470pubmed文獻(xiàn)檢索課件5/9/202471pubmed文獻(xiàn)檢索課件檢索結(jié)果的處理顯示保存與輸出

5/9/202472pubmed文獻(xiàn)檢索課件顯示—默認(rèn)格式5/9/202473pubmed文獻(xiàn)檢索課件顯示設(shè)置5/9/202474pubmed文獻(xiàn)檢索課件保存與輸出5/9/202475pubmed文獻(xiàn)檢索課件其他工具M(jìn)YNCBISAVEHISTORY5/9/202476pubmed文獻(xiàn)檢索課件小結(jié)1、PubMed基本檢索提供的自動(dòng)詞語(yǔ)匹配功能一般適合檢索經(jīng)驗(yàn)有限的初級(jí)用戶，也適合對(duì)課題做初步檢索，大致了解檢索結(jié)果的分布情況。因?yàn)樽詣?dòng)詞語(yǔ)匹配檢索有較好的查全率，但因?yàn)樽詣?dòng)進(jìn)行詞語(yǔ)拆分，查準(zhǔn)率有時(shí)不能令人滿意。5/9/202477pubmed文獻(xiàn)檢索課件2.PubMed的主題詞檢索是其最具特色的功能之一，能保證較好的查準(zhǔn)率及查準(zhǔn)率。主題詞組配副主題詞使檢索結(jié)果更為專指，限定在主要主題詞檢索能使結(jié)果更準(zhǔn)確。5/9/202478pubmed文獻(xiàn)檢索課件3.但是主題詞檢索也有一些固有的缺陷，比如很多專指的概念沒(méi)有相應(yīng)的主題詞，一些新出現(xiàn)的概念要幾年后才收錄為主題詞這種情況下，不宜采用主題詞檢索，采用字段限定檢索等方法也能得到較好的查準(zhǔn)率。此外，主題詞檢索還可能會(huì)漏掉一些最新的文獻(xiàn)（inprocesscitations），這也是需要注意的。5/9/202479pubmed文獻(xiàn)檢索課件4.熟練運(yùn)用PubMed限定功能，和臨床查詢、引文匹配等工具能大大提高檢索效率。5/9/202480pubmed文獻(xiàn)檢索課件作業(yè)

1．查找有關(guān)活體供（Livingdonor）肝移植（livertransplantation）的有關(guān)信息，要求查找2005年以來(lái)的臨床試驗(yàn)，并且用英文發(fā)表的文獻(xiàn)2.用Meshdatabase檢索主要內(nèi)容為前列腺癌(prostatecancer)的文獻(xiàn)。將檢索的結(jié)果的題錄和文摘存儲(chǔ)到本地硬盤