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文檔簡介
三、其他操縱子的調控機制
1.半乳糖操縱子大腸桿菌半乳糖操縱子(galactoseoperon)包括3個結構基因:
異構酶(UDP-galactose-4epimerase,galE),
半乳糖-磷酸尿嘧啶核苷轉移酶(galactosetransferase,galT),
半乳糖激酶(galactosekinase,galk)。
這3個酶的作用是使半乳糖變成葡萄糖-1-磷酸。GalR與galE、T、K及操縱區(qū)O等離得很遠,而galR產物對galO的作用與lacI-lacO的作用相同。
gal操縱子的特點:
①它有兩個啟動子,其mRNA可從兩個不同的起始點開始轉錄;
②它有兩個O區(qū),一個在P區(qū)上游-67--53,另一個在結構基因galE內部。因為半乳糖的利用效率比葡萄糖低,人們猜想葡萄糖存在時半乳糖操縱子不被誘導,但實際上有葡萄糖存在時,gal操縱子仍可被誘導?,F已分離到一些突變株,其中一類突變株能在不含葡萄糖的培養(yǎng)基中高水平合成半乳糖代謝酶類(gal結構基因高效表達);而另一類突變株中gal基因的表達完全依賴于葡萄糖,培養(yǎng)基中如無葡萄糖存在,這些細菌的gal基因不表達,不合成半乳糖代謝酶類。分析gal操縱子P-O區(qū)的DNA序列發(fā)現,該操縱子確實存在兩個相距僅5bp的啟動子,可以分別起始mRNA的合成。每個啟動子擁有各自的RNA聚合酶結合位點S1和S2。
從S1起始的轉錄只有在培養(yǎng)基中無葡萄糖時,才能順利進行,RNA聚合酶與S1的結合需要半乳糖、CAP和較高濃度的cAMP。從S2起始的轉錄則完全依賴于葡萄糖,高水平的cAMP-CAP能抑制由這個啟動子起始的轉錄。當有cAMP-CAP時,轉錄從S1開始,當無cAMP-CAP時,轉錄從S2開始。為什么gal操縱子需要兩個轉錄起始位點?
半乳糖不僅可以作為唯一碳源供細胞生長,而且與之相關的物質--尿苷二磷酸半乳糖(UDPgal)是大腸桿菌細胞壁合成的前體。在沒有外源半乳糖的情況下,UDP-gal是通過半乳糖差向異構酶的作用由UDP-葡萄糖合成的,該酶是galE基因的產物。生長過程中的所有時間里細胞必須能夠合成差向異構酶?,F在設想只有S1一個啟動子,那么由于這個啟動子的活性依賴于cAMP-CRP,當培養(yǎng)基中有葡萄糖存在時就有能合成異構酶。假如唯一的啟動子是S2,那么,即使在葡萄糖存在的情況下,半乳糖也將使操縱子處于充分誘導狀態(tài),這無疑是一種浪費。無論從必要性或經濟性考慮,都需要一個不依賴于cAMP-CAP的啟動子(S1)對高水平合成進行調節(jié)。2.阿拉伯糖操縱子
阿拉伯糖(arabinose)是另一個可以為代謝提供碳源的五碳糖。在大腸桿菌中阿拉伯糖的降解需要3個基因:araB、araA和araD,分別編碼3個酶:araB基因編碼核酮糖激酶(ribulokinase),araA編碼L-阿拉伯糖異構酶(L-arabinoseisomerase),araD編碼L-核酮糖-5-磷酸-4-差向異構酶(L-ribulose-5phosphate-4epimerase)。與araBAD相鄰的是一個復合的啟動子區(qū)域和一個調節(jié)基因araC,這個AraC蛋白同時顯示正、負調節(jié)因子的功能。AraBAD和araC基因的轉錄是分別在兩條鏈上以相反的方向進行的。在標準的遺傳學圖譜上,araBAD基因簇從啟動子PBAD開始向左進行轉錄,而araC基因則是從Pc向右轉錄。AraC蛋白作為PBAD活性正、負調節(jié)因子的雙重功能是通過該蛋白的兩種異構體來實現的。Pr是起阻遏作用的形式,可以與現在尚未鑒定的類操縱區(qū)位點相結合,而Pj是起誘導作用的形式,它通過與PBAD啟動子結合進行調節(jié)。在沒有阿拉伯糖時,Pr形式占優(yōu)勢;一旦有阿拉伯糖存在,它就能夠與AraC蛋白結合,使平衡趨向于Pi形式。這樣,阿拉伯糖的誘導作用就可以解釋為阿拉伯糖與Pr的結合,使Pr離開它的結合位點,然后,產生大量的Pi,并與啟動子結合。因為培養(yǎng)基中含有葡萄糖,所以cAMP-CAP沒有與操縱區(qū)位點相結合,AraC蛋白處于Pr形式并與A位點結合,RNA聚合酶很少再與Pc結合,araC基因雖然仍有轉錄,但受到抑制,只有少量AraC蛋白形成,整個系統(tǒng)幾乎處于靜止狀態(tài)。
沒有葡萄糖,也沒有阿拉伯糖,因為沒有誘導物,盡管有cAMP-CAP與操縱區(qū)位點相結合,AraC蛋白仍以Pr形式為主,無法與操縱區(qū)B位點相結合,無araBADmRNA轉錄。無葡萄糖,阿拉伯糖時,大量araC基因產物以Pi形式存在,并分別與操縱區(qū)B、A位點相結合,在cAMP-CAP的共同作用下,araC和araBAD基因大量表達,操縱子充分激活。3.組氨酸操縱子
與His降解代謝有關的兩組酶類被稱為hut酶(histidineutilizingenzyme),控制這些酶合成的操縱子被稱為hutoperon。由一個多重調節(jié)的操縱子控制,有兩個啟動子,兩個操縱區(qū)及兩個正調節(jié)蛋白。
Hut操縱子共編碼4種酶和一個阻遏物。4種酶分別由hutG、hutH、hutI及hutU基因編碼,阻遏物則由hutC基因編碼。在產氣克氏菌中,以上基因構成兩個轉錄單位,hutI、hutG、hutC和hutU、hutH分別被轉錄合成兩條mRNA長鏈。這兩個轉錄單位各自都有一個啟動子和一個操縱區(qū),其轉錄過程都是從左向右進行的,hutC阻遏物能與每個操縱區(qū)相結合。無論以組氨酸作為唯一碳源或氮源,hut操縱子都會處于有活性狀態(tài)。Hut操縱子的每一個啟動子上都有cAMP-CAP結合位點,當碳供應匱乏時,能合成cAMP,出現cAMP-CAP復合物,并與操縱區(qū)上的相應位點結合,誘發(fā)基因轉錄。雖然尚不清楚氮源缺乏時的信號是什么,但它很可能也是一個正效應子。4.多啟動子調控的操縱子
I.rRNA操縱子
大腸桿菌rRNA操縱子(rrnE)上有兩個啟動子,P1和P2。P1是強啟動子,營養(yǎng)充沛時,由P1起始的轉錄產物比由P2起始的轉錄產物高3-5倍。當營養(yǎng)匱乏時,P1的作用被抑制,但P2仍有功能。II.核糖體蛋白SI操縱子
核糖體蛋白SI操縱子(rpsA),它也受應急反應調節(jié)。RpsA有4個啟動子,P1、P2是強啟動子,平時主要依靠它們來啟動基因的表達,合成SI蛋白。P3、P4是弱啟動子,只有在緊急情況下,P1、P2啟動子受ppGpp的抑制,由P
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