蛋白質(zhì)組信息學(xué)智慧樹(shù)知到期末考試答案章節(jié)答案2024年中南大學(xué)

蛋白質(zhì)組信息學(xué)智慧樹(shù)知到期末考試答案+章節(jié)答案2024年中南大學(xué)Ensembl是非冗余的已測(cè)序的脊椎動(dòng)物的基因組信息。（）

答案:錯(cuò)SILAC即細(xì)胞培養(yǎng)條件下穩(wěn)定同位素標(biāo)記技術(shù)。（）

答案:對(duì)MaxQuant能在蘋(píng)果系統(tǒng)上運(yùn)行。（）

答案:錯(cuò)Mascot被認(rèn)為是蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)。（）

答案:對(duì)固定修飾是指某一種氨基酸殘基可能會(huì)被某種基因修飾。（）

答案:錯(cuò)六框翻譯數(shù)據(jù)庫(kù)是識(shí)別6個(gè)氨基酸信息作為翻譯數(shù)據(jù)庫(kù)。（）

答案:錯(cuò)ProteoSuite是可視化mzQuantML文件的工具。（）

答案:對(duì)修飾肽段鑒定可以使用denova方法計(jì)算。（）

答案:錯(cuò)2020年4月，Luck等在自然《Nature》雜志上發(fā)表了《人類二元蛋白質(zhì)相互作用的參考圖譜》是迄今為止規(guī)模最大的人類蛋白互作組數(shù)據(jù)庫(kù)。（）

答案:對(duì)缺失值過(guò)多蛋白通常不具有分析價(jià)值。（）

答案:對(duì)蛋白組數(shù)據(jù)可以推導(dǎo)出基因序列。（）

答案:錯(cuò)修飾肽段可以不經(jīng)過(guò)富集直接檢測(cè)。（）

答案:對(duì)TraML是一種基于xml的編碼轉(zhuǎn)換表，用于靶向蛋白質(zhì)組學(xué)方法，如選擇反應(yīng)監(jiān)測(cè)（SRM）。（）

答案:對(duì)UniProt中的數(shù)據(jù)都是經(jīng)過(guò)審核驗(yàn)證，并保證格式一致性。（）

答案:錯(cuò)UniProt為科學(xué)界提供全面、高質(zhì)量和免費(fèi)獲取的蛋白質(zhì)序列和功能信息資源。（）

答案:對(duì)有關(guān)mzML描述正確的是（）

答案:mzML是一種基于XML的質(zhì)譜數(shù)據(jù)格式;吸取了mzData和mzXML兩種格式的優(yōu)點(diǎn);mzML框架具有較好的靈活性與穩(wěn)定性;存儲(chǔ)從質(zhì)譜儀輸出的質(zhì)譜數(shù)據(jù)及其元數(shù)據(jù)ProteomeXchangeConsortium成員中，來(lái)自美國(guó)的有（）

答案:MassIVE;PeptideAtlas;Panorama以下哪些屬于蛋白基因組學(xué)工具（）。

答案:MutationDB;customProDB;Pypgatk如何計(jì)算聚類分析里的“相似”程度（）。

答案:距離度量;相似度度量進(jìn)行蛋白質(zhì)的功能富集分析常用的工具有和（）。

答案:Metascape;DAVID將蛋白質(zhì)酶切成肽段，（）。

答案:減少了蛋白質(zhì)的復(fù)雜性;低豐度蛋白質(zhì)的鑒定概率;提高了蛋白質(zhì)的采樣率;翻譯后修飾的鑒定概率研究蛋白質(zhì)的相互作用方法主要有（）。

答案:信息分析學(xué)方法;分子生物學(xué)方法;遺傳學(xué)方法;生物物理化學(xué)方法利用蛋白質(zhì)組信息學(xué)對(duì)細(xì)胞和組織進(jìn)行哪維度的蛋白質(zhì)組分析（）

答案:總蛋白豐度、活性和磷酸化計(jì)量化學(xué);蛋白質(zhì)理化特性;組織分布、翻譯后修飾、細(xì)胞周期、周轉(zhuǎn)、豐度、同源異構(gòu)體、定位和相互作用等;細(xì)胞周期、定位和周轉(zhuǎn)率肽質(zhì)量指紋圖譜存在的主要問(wèn)題有（）。

答案:蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)中，肽段的數(shù)量是很龐大，很多肽段的質(zhì)量非常接近;長(zhǎng)鏈蛋白里的多肽數(shù)目較多，被隨機(jī)匹配的概率加大;不適合分析復(fù)雜樣品一個(gè)mzTab文件最多包括幾個(gè)部分。（）

答案:元數(shù)據(jù);肽;肽譜匹配（PSM）;小分子;蛋白質(zhì)PNGaseF（）。

答案:是一個(gè)酶;是糖基化修飾肽段鑒定中需要用到的一個(gè)試劑構(gòu)建特定樣本的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)的流程包括（）

答案:采用下一代全基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序;取得某一組織樣本;識(shí)別和量化肽和蛋白質(zhì);基因突變分析、選擇剪接、基因融合和從頭表達(dá)MassIVE提供的功能有（）

答案:獲取公共數(shù)據(jù)集;結(jié)果比較;搜索識(shí)別（初始和重新分析）;重新分析質(zhì)譜;共享重新分析蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)是（）

答案:揭示蛋白質(zhì)功能與細(xì)胞生命活動(dòng)規(guī)律;當(dāng)前生物學(xué)研究的熱點(diǎn)和發(fā)展最快的學(xué)科領(lǐng)域;分析細(xì)胞內(nèi)動(dòng)態(tài)變化的蛋白質(zhì)組成成分、表達(dá)水平與修飾狀態(tài);了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與聯(lián)系質(zhì)譜由三部分組成（）。

答案:離子源;檢測(cè)器;質(zhì)量分析器mzIdentML不包括以下信息（）

答案:原始質(zhì)譜數(shù)據(jù)RefSeq的顯著特征（）

答案:非冗余一級(jí)質(zhì)譜所測(cè)量的碎裂前的離子稱為（）。

答案:母離子蛋白組學(xué)的質(zhì)譜數(shù)據(jù)通常（）。

答案:由色譜圖和質(zhì)譜圖組成目前多肽譜匹配鑒定的統(tǒng)計(jì)學(xué)評(píng)估算法有基于概率模型的方法和（）。

答案:PSM可信度評(píng)估方法當(dāng)前蛋白質(zhì)組分析的主流技術(shù)是（）

答案:串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)質(zhì)譜圖的橫軸就是質(zhì)荷比，縱軸是離子強(qiáng)度。（）。

答案:質(zhì)荷比，離子強(qiáng)度使用參考基因組注釋數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行蛋白組分析（）。

答案:可以對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行定量下列哪一個(gè)數(shù)據(jù)倉(cāng)儲(chǔ)不是ProteomeXchangeConsortium成員。（）

答案:GPMDBBottom-up又被稱為（）。

答案:鳥(niǎo)槍法蛋白質(zhì)組學(xué)磷酸化的修飾位點(diǎn)不包括（）。

答案:精氨酸STRING數(shù)據(jù)庫(kù)中設(shè)置更改互作網(wǎng)絡(luò)的標(biāo)簽為（）。

答案:Settings以下哪種不是分類方法（）。

答案:主成分分析下列哪一個(gè)軟件工具未采用mzIdentML格式（）

答案:PASSELBottom-up方法基本思路是：先用蛋白酶把蛋白序列進(jìn)行酶切，再（）。

答案:針對(duì)酶切后的肽段進(jìn)行鑒定突變蛋白研究的數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建需要（）。

答案:基因組上蛋白編碼區(qū)上的錯(cuò)義突變信息二級(jí)質(zhì)譜檢測(cè)是（）。

答案:肽段的碎片下列哪一個(gè)數(shù)據(jù)倉(cāng)儲(chǔ)不是以物種為中心的聯(lián)盟（）

答案:EnsemblR語(yǔ)言可以進(jìn)行質(zhì)譜定量數(shù)據(jù)分析，但是不能鑒定譜圖特征。（）

答案:錯(cuò)R語(yǔ)言是（）。

答案:可以在蘋(píng)果系統(tǒng)上使用;一個(gè)免費(fèi)的軟件R語(yǔ)言有Bioconductor和CRAN2個(gè)官方在線倉(cāng)庫(kù)。（）

答案:對(duì)R語(yǔ)言（）。

答案:可以直接讀取文件PSM是質(zhì)譜圖與理論肽段譜圖匹配程度高，通過(guò)了統(tǒng)計(jì)學(xué)校正的圖譜數(shù)據(jù)表。（）

答案:對(duì)蛋白基因組目前的主要研究方向（）。

答案:基因注釋;宏蛋白質(zhì)組;突變蛋白檢測(cè)以下哪個(gè)選項(xiàng)不屬于目前蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)步驟（）。

答案:肽段富集蛋白基因組和蛋白質(zhì)組最大的區(qū)別是提取蛋白質(zhì)的方法不一樣。（）

答案:錯(cuò)肽段鑒定離不開(kāi)好的譜圖質(zhì)量。（）

答案:對(duì)蛋白基因組學(xué)是（）。

答案:探討基因組和蛋白質(zhì)之間聯(lián)系目前翻譯后修飾相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)多集中在泛素化和糖基化。（）

答案:錯(cuò)蛋白質(zhì)修飾類型包括（）。

答案:糖基化;磷酸化;甲基化;泛素化翻譯后修飾檢索的參數(shù)設(shè)置不包括（）。

答案:設(shè)置碎裂電壓蛋白質(zhì)翻譯后修飾的預(yù)測(cè)工具通常是根據(jù)臨近序列特征進(jìn)行預(yù)測(cè)。（）

答案:對(duì)翻譯后修飾肽段的鑒定步驟（）。

答案:定量肽段表達(dá)值;識(shí)別具有修飾的肽段;確定化學(xué)修飾位置分層聚類是把原本多個(gè)變量化為少數(shù)幾個(gè)綜合指標(biāo)的一種統(tǒng)計(jì)分析方法。（）

答案:錯(cuò)聚類算法對(duì)基因表達(dá)數(shù)據(jù)的分析主要是分為以下幾個(gè)層次（）。

答案:分析單個(gè)基因的表達(dá)水平;將基因分組，研究基因的共同功能、相互作用及調(diào)控等;推斷潛在的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)從整體上來(lái)看GO注釋系統(tǒng)是一個(gè)有向無(wú)環(huán)圖。（）

答案:對(duì)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和核糖體屬于哪一類GO術(shù)語(yǔ)（）。

答案:細(xì)胞組分質(zhì)心法定義（）。

答案:兩個(gè)類的質(zhì)心間的距離作為兩類間距離石油醚自上而下運(yùn)動(dòng)的一相，一般是氣體或液體，稱為（）。

答案:流動(dòng)相質(zhì)譜儀是用來(lái)測(cè)定氣態(tài)離子質(zhì)荷比（m/z）的儀器。（）

答案:對(duì)可以使用低溫條件下操作來(lái)減少蛋白質(zhì)降解。（）

答案:對(duì)串聯(lián)質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)的方法主要包括和（）。

答案:基于蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索;從頭測(cè)序?qū)Φ鞍踪|(zhì)進(jìn)行變性的作用是打開(kāi)蛋白質(zhì)的高級(jí)結(jié)構(gòu)，同時(shí)（）。

答案:增加蛋白質(zhì)的溶解度基于XML的質(zhì)譜相關(guān)的數(shù)據(jù)格式是（）

答案:mzML;mzQuantML;mzIdentMLmzML格式吸取了哪些格式的優(yōu)點(diǎn)（）

答案:mzData;mzXMLHUPO-PSI制定的蛋白質(zhì)組信息學(xué)標(biāo)準(zhǔn)屬于ISO標(biāo)準(zhǔn)。（）

答案:錯(cuò)質(zhì)譜數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)的制定組織主要有（）

答案:EBI;PSI;ISBHUPO-PSI制定的質(zhì)譜相關(guān)的受控詞表主要有（）

答案:PSI-MSProteomeXchangeConsortium成員有（）

答案:JPOST;PRIDE;Panorama;MassIVE;iProx;PeptideAtlasUniProt包括（）

答案:UniProt參考集（UniRef）;UniProt知識(shí)庫(kù)（UniProtKB）;UniProt存檔庫(kù)（UniParc）;物種蛋白質(zhì)組(SpeciesProteomes)下列哪一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)不是以物種為中心的聯(lián)盟（）

答案:EnsemblRefSeq是非冗余的參考序列數(shù)據(jù)庫(kù)（）

答案:對(duì)Ensembl的顯著特征是（）

答案:基于證據(jù)的物種基因集蛋白質(zhì)組信息學(xué)應(yīng)用于（）

答案:發(fā)育研究;肽、蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)復(fù)合物研究;亞細(xì)胞和細(xì)胞上研究;細(xì)胞外和細(xì)胞內(nèi)研究屬于無(wú)凝膠的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的是（）

答案:LC-MS;Proteinchip蛋白質(zhì)組學(xué)源于基因組學(xué)，但是超越了基因組學(xué)，這是因?yàn)椋海ǎ?/p>

答案:由于選擇性剪接等原因，