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第八章
方差分析Analysisofvariance(ANOVA)2024/11/71第八章方差分析方差的計(jì)算公式離均差平方和:分母為自由度:n-12第八章方差分析方差分析方差分析的基本思想完全隨機(jī)設(shè)計(jì)的單因素隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)的兩因素方差分析多個(gè)樣本均數(shù)間的多重比較2×2析因設(shè)計(jì)的方差分析(一般了解內(nèi)容)3第八章方差分析第一節(jié)方差分析的基本思想用途:檢驗(yàn)3組及以上總體均數(shù)是否相等。通過分析處理組均數(shù)之間的差別,推論它們所代表的k個(gè)總體均數(shù)間是否存在差別,或k個(gè)處理組間的差別是否具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。4第八章方差分析總變異=組間變異+組內(nèi)變異表糖尿病患者、IGT異常及正常人的載脂蛋白測定結(jié)果糖尿病IGT正常人85.7096.00144.00105.20124.50117.00………111.0099.00159.00106.50120.00115.00均數(shù)105.45(11)102.39(9)122.80(10)X=110.35第八章方差分析全部實(shí)驗(yàn)結(jié)果存在三種不同的變異總變異:全部實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)大小不等。變異的大小用觀察值與總均數(shù)的離均差平方和表示,記為SS總組間變異:各處理組的樣本均數(shù)也大小不等,變異的大小用各組均數(shù)與總體均數(shù)的離均差平方和表示,記為SS組間。組內(nèi)變異:各處理組內(nèi)部觀察值也大小不等,可用各處理組內(nèi)部每個(gè)觀察值與組均數(shù)的離均差平方和表示。記為SS組內(nèi)。6第八章方差分析總變異=組間變異+組內(nèi)變異總變異:組間變異:組內(nèi)變異:
總=N-1組間=k-1組內(nèi)=N-k7第八章方差分析F=MS組間/MS組內(nèi)如果:各樣本均數(shù)來自同一總體(H0:m1=m2=
=mk),即各組均數(shù)之間無差別。則:組間變異與組內(nèi)變異均只能反映隨機(jī)誤差,此時(shí):F值應(yīng)接近1。反之,若各樣本均數(shù)不是來自同一總體,組間變異應(yīng)較大,F(xiàn)值將明顯大于1,則不能認(rèn)為組間的變異僅反映隨機(jī)誤差,也就是認(rèn)為處理因素有作用。8第八章方差分析F值要到多大才有
統(tǒng)計(jì)學(xué)意義呢?在各樣本來自正態(tài)總體,各樣本所來自的總體方差相等的假定之下,當(dāng)H0成立時(shí),檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量F服從自由度
組間=k-1,
組內(nèi)=N-k的F分布,表示為:
F~F(
組間,
組內(nèi))可由F界值表查出在某一水準(zhǔn)下F分布的單尾界值F
。當(dāng)F<F(
組間,
組內(nèi)),P>
。F9第八章方差分析方差分析的基本思想根據(jù)資料的設(shè)計(jì)類型,將全部觀察值總的離均差平方和及自由度分解為兩個(gè)或多個(gè)部分,除隨機(jī)誤差(如SS組內(nèi))外,其余每個(gè)部分的變異(如SS組間)可由某個(gè)因素的作用(或某幾個(gè)因素的交互作用,如A因素×B因素)加以解釋。通過比較不同變異來源的均方,借助F分布作出統(tǒng)計(jì)推斷,從而了解該因素對觀測指標(biāo)有無影響。10第八章方差分析方差分析對數(shù)據(jù)的基本假設(shè)
(方差分析的應(yīng)用條件)任何兩個(gè)觀察值之間均不相關(guān)每一水平下的觀察值均來自正態(tài)總體各總體方差相等,即方差齊性(homogeneityofvariance)本章僅介紹:完全隨機(jī)設(shè)計(jì)的單因素方差分析隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)的兩因素方差分析2×2析因設(shè)計(jì)的方差分析(不考)11第八章方差分析第二節(jié)完全隨機(jī)設(shè)計(jì)資料的
單因素方差分析在實(shí)驗(yàn)研究中,將受試對象隨機(jī)分配到一個(gè)研究因素的多個(gè)水平中去,然后觀察實(shí)驗(yàn)效應(yīng)。如將30名乙型腦炎患者隨機(jī)分為三組,分別用單克隆抗體、胸腺肽和利巴韋林三種藥物治療(藥物這個(gè)研究因素分為3個(gè)水平),觀察治療后的退熱時(shí)間。在觀察研究中,按某個(gè)因素的不同水平分組,比較該因素的效應(yīng)。如比較糖尿病患者,IGT異常和正常人的載脂蛋白有無差別(人群這個(gè)研究因素分為3個(gè)水平)。12第八章方差分析一、完全隨機(jī)設(shè)計(jì)如何分組:可以利用隨機(jī)數(shù)字表(醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)中的研究設(shè)計(jì)介紹)13第八章方差分析二、變異分解:例:某社區(qū)隨機(jī)抽取了30名糖尿病患者(11例),IGT異常(9例)和正常人(10例)進(jìn)行載脂蛋白(mg/dL)測定,問三種人的載脂蛋白有無差別?14第八章方差分析1.完全隨機(jī)設(shè)計(jì)方差分析中變異的分解
總變異=組間變異+組內(nèi)變異表糖尿病患者、IGT異常及正常人的載脂蛋白測定結(jié)果糖尿病IGT正常人85.7096.00144.00105.20124.50117.00………
111.0099.00159.00106.50120.00115.00均數(shù)105.45(11)102.39(9)122.80(10)X=110.315第八章方差分析2.分析計(jì)算步驟建立檢驗(yàn)假設(shè)和確定檢驗(yàn)水準(zhǔn)H0:三種人載脂蛋白的總體均數(shù)相等,即
m1=m2=m3H1:三種人載脂蛋白的總體均數(shù)不全相等
=0.05計(jì)算檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量F值16第八章方差分析表糖尿病患者、IGT異常及正常人的載脂蛋白測定結(jié)果糖尿病IGT正常人85.7096.00144.00105.20124.50117.00………111.0099.00159.00106.50120.00115.00∑Xij
116011105.45123509.5912.59102.3996045.412283309.51030122.80110.3153420372974.9niX∑Xij217第八章方差分析表糖尿病患者、IGT異常及正常人的載脂蛋白測定結(jié)果糖尿病IGT正常人∑Xij
116011105.45123509.5912.59102.3996045.412283309.51030122.80110.3153420372974.9niX∑Xij2
C=3309.52/30=365093
(校正數(shù))SS總=372974.87-365093=7881.87SS組間=11602/11+921.52/9+12282/10-365093=2384.03SS組內(nèi)=SS總-SS組間=7881.87-2384.03=5497.8418第八章方差分析
確定P值和作出推斷結(jié)論查附表4F界值表(P216~219),
1=2,
2=27F0.05(2,27)=3.35,F0.01(2,27)=5.49本例F=5.85>F0.01(2,27),故P<0.01。可認(rèn)為三種人的載脂蛋白不同。方差分析計(jì)算表變異來源SS
MSFP組間2384.0321192.015.85<0.01組內(nèi)5497.8427203.62總7811.872919第八章方差分析以上結(jié)論表明總的來說三種人的載脂蛋白有差別,但并不表明任何兩種人的載脂蛋白均有差別。要了解哪些組均數(shù)間有差別,需進(jìn)一步作兩兩比較。當(dāng)k=2時(shí),對同一資料,F(xiàn)=t2
。20第八章方差分析第三節(jié)隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)的方差分析(randomizedblockdesign,two-wayANOVA)亦稱配伍組設(shè)計(jì),是配對設(shè)計(jì)的擴(kuò)大。例對小白鼠喂以A、B、C三種不同的營養(yǎng)素,目的是了解不同營養(yǎng)素增重的效果。采用隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)方法,以窩別作為劃分區(qū)組的特征,以消除遺傳因素對體重增長的影響?,F(xiàn)將同品系同體重的24只小白鼠分為8個(gè)區(qū)組,每個(gè)區(qū)組3只小白鼠。三周后體重增量結(jié)果(克)列于下表。問小白鼠經(jīng)三種不同營養(yǎng)素喂養(yǎng)后所增體重有無差別?21第八章方差分析一、隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)如何分組:先將全部受試對象按某種或某些特征分為若干個(gè)區(qū)組(block),使每個(gè)區(qū)組內(nèi)的觀察對象隨機(jī)地接受研究因素某一水平的處理。由于區(qū)組內(nèi)的個(gè)體特征比較一致,減少了個(gè)體差異對結(jié)果的影響。22第八章方差分析
表A、B、C三種營養(yǎng)素喂養(yǎng)小白鼠所增體重區(qū)組號(hào)A營養(yǎng)B營養(yǎng)C營養(yǎng)均數(shù)150.1058.2064.5057.60Xij247.8048.5062.4052.90…761.9053.0051.2055.37842.2039.8046.2042.73均數(shù)53.9053.9559.1455.6623第八章方差分析二、變異分解隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)方差分析中變異的分解:
SS總=SS處理+SS區(qū)組+SS誤差24第八章方差分析SS總=SS處理+SS區(qū)組+SS誤差表A、B、C三種營養(yǎng)素喂養(yǎng)小白鼠所增體重區(qū)組號(hào)A營養(yǎng)B營養(yǎng)C營養(yǎng)均數(shù)150.1058.2064.5057.60Xij247.8048.5062.4052.90…761.9053.0051.2055.37842.2039.8046.2042.73均數(shù)53.9053.9559.1455.6625第八章方差分析2.分析計(jì)算步驟建立檢驗(yàn)假設(shè)和確定檢驗(yàn)水準(zhǔn)H0:三種營養(yǎng)素喂養(yǎng)的小白鼠體重增量相等,即
m1=m2=m3H1:三種營養(yǎng)素喂養(yǎng)的小白鼠體重增量不全相等
=0.05計(jì)算檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量F值26第八章方差分析表隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)方差分析的計(jì)算公式27第八章方差分析表方差分析結(jié)果變異來源SS
MSFP處理間144.92272.462.98>0.05區(qū)組間2376.387339.4813.96<0.01誤差340.541424.32總2861.842328第八章方差分析確定P值和作出推斷結(jié)論:F0.05(2,14)=3.74,P>0.05。尚不能認(rèn)為三種營養(yǎng)素喂養(yǎng)的小白鼠體重增量有差別。
F0.01(7,14)=4.28,P<0.01??烧J(rèn)為8個(gè)區(qū)組的小白鼠體重增量有差別,即遺傳因素對小白鼠體重增量有影響(但一般更關(guān)注處理組間差別的假設(shè)檢驗(yàn))。29第八章方差分析
一般而言,隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)較成組設(shè)計(jì)更容易檢驗(yàn)出處理組間的差別,提高了研究效率。但不是在任何情況下都能提高研究效率。如果區(qū)組效應(yīng)無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,則并不能提高研究效率,甚至?xí)档脱芯啃省#ㄈ绻鸐S區(qū)組<MS誤差)30第八章方差分析區(qū)組效應(yīng)是否具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義是重要的,它表明區(qū)組的劃分是否成功。即達(dá)到:區(qū)組內(nèi)各實(shí)驗(yàn)單位很均勻,而不同區(qū)組內(nèi)的實(shí)驗(yàn)單位具有很大差異。若沒有足夠理由顯示不同區(qū)組間的差別確有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,則寧可不分區(qū)組。31第八章方差分析第四節(jié)多個(gè)樣本均數(shù)間的多重比較multiplecomparison概念無效假設(shè)的兩種情況常用方法32第八章方差分析一、概念指出哪幾組均數(shù)之間的差別具有或不具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。當(dāng)對比組數(shù)大于2時(shí),為什么不能用t檢驗(yàn)?因?yàn)闀?huì)增加第一類錯(cuò)誤的概率,使本來無無差別的兩總體均數(shù)判為有差別。如有5個(gè)樣本均數(shù),可作10次t檢驗(yàn)。每次不犯第一類錯(cuò)誤的概率為1-0.05=0.95。每次比較均不犯第一類錯(cuò)誤的概率僅為0.9510=0.5987,每次犯第一類錯(cuò)誤的概率為1-0.5987=0.4013,明顯增加了犯第一類錯(cuò)誤的概率。33第八章方差分析二、無效假設(shè)的兩種情況檢驗(yàn)?zāi)硯讉€(gè)特定總體均數(shù)是否相等,其無效假設(shè)稱為部分無效假設(shè)。檢驗(yàn)全部k個(gè)總體均數(shù)是否相等,其無效假設(shè)稱為完全無效假設(shè)。34第八章方差分析1.檢驗(yàn)?zāi)硯讉€(gè)特定總體均數(shù)是否相等H0:
i=j(ij)在試驗(yàn)設(shè)計(jì)階段就根據(jù)研究目的或?qū)I(yè)知識(shí)決定了某些均數(shù)間的兩兩比較,常用于事先有明確研究假設(shè)的證實(shí)性研究。如
多個(gè)處理組與對照組比較;處理后不同時(shí)間與處理前比較;幾個(gè)特定的處理組間比較35第八章方差分析2.檢驗(yàn)全部k個(gè)總體均數(shù)是否相等H0:
1=2=...=k。在研究設(shè)計(jì)階段對實(shí)驗(yàn)結(jié)果知道不多的探索性研究,或經(jīng)數(shù)據(jù)結(jié)果的提示后,才決定作多個(gè)均數(shù)間的兩兩比較。一般涉及到每兩個(gè)均數(shù)的兩兩比較。全部兩兩比較的排列組合比較次數(shù)為:36第八章方差分析三、常用方法BonferroniTukeyDunnett-t檢驗(yàn)Tamhane’sT2LSD-t檢驗(yàn)(leastsignificantdifference)SNK-q檢驗(yàn)(Student-Newman-Keuls)37第八章方差分析SPSS統(tǒng)計(jì)軟件中的兩兩比較方法38第八章方差分析1.LSD-t檢驗(yàn)Leastsignificantdifferencettest,最小有意義差異,比較k組中一對或幾對在專業(yè)上有特殊意義的均數(shù)差值的總體均數(shù)是否為“0”;39第八章方差分析LSD-t檢驗(yàn)公式以誤差自由度
誤差(或
組內(nèi))和檢驗(yàn)水準(zhǔn)
查t界值表缺點(diǎn):沒有調(diào)整多重比較的檢驗(yàn)水準(zhǔn),比較的次數(shù)愈多,犯I類錯(cuò)誤的可能性愈大。40第八章方差分析2.Dunnett-tk-1個(gè)實(shí)驗(yàn)組與一個(gè)對照組均數(shù)差別的多重比較。根據(jù)算得的t值,誤差自由度
誤差,試驗(yàn)組數(shù)k-1,以及檢驗(yàn)水準(zhǔn)
查Dunnett-t
界值表,作出推斷結(jié)論。41第八章方差分析3.SNK-q檢驗(yàn)(書中介紹)Student-Newman-Keuls,q檢驗(yàn)一般在方差分析結(jié)果拒絕H0時(shí),再用q檢驗(yàn)進(jìn)行多重比較缺點(diǎn):沒有調(diào)整多重比較的檢驗(yàn)水準(zhǔn),比較的次數(shù)愈多,犯I類錯(cuò)誤的可能性愈大。42第八章方差分析組次123
均數(shù)102.39105.45122.80
組別IGT異常糖尿病患者正常人表三個(gè)樣本均數(shù)兩兩比較的q檢驗(yàn)對比組兩均數(shù)之差標(biāo)準(zhǔn)誤q值組數(shù)q界值
0.050.01P值1與3-20.414.63614.402433.494.45<0.051與2-3.064.53500.674822.893.89>0.052與3-17.354.40873.935422.893.89<0.01例將3個(gè)樣本均數(shù)從小到大排序:43第八章方差分析4.Bonferroni應(yīng)用于:樣本數(shù)一般≤4,這時(shí)的檢驗(yàn)效率高于Tukey法。特點(diǎn):調(diào)整了多重比較時(shí)的檢驗(yàn)水準(zhǔn):
=/比較的總次數(shù),當(dāng)計(jì)算所得的t≥t(
,)時(shí),則以P<稱所比較的兩組均數(shù)的差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。是SPSS統(tǒng)計(jì)軟件推薦的方法之一。44第八章方差分析5.Tukey應(yīng)用于:當(dāng)比較的樣本數(shù)大于5時(shí),檢驗(yàn)效率高于Bonferroni。特點(diǎn):調(diào)整了多重比較時(shí)的檢驗(yàn)水準(zhǔn),也是SPSS統(tǒng)計(jì)軟件推薦的方法。45第八章方差分析BonferroniandTukeyTheBonferroniandTukeyshonestlysignificantdifferencetestsarecommonlyusedmultiplecomparisontests.46第八章方差分析BonferroniTheBonferronitest,basedonStudentststatistic,adjuststheobservedsignificancelevelforthefactthatmultiplecomparisonsaremade.Forasmallnumberofpairs,Bonferroniismorepowerful.47第八章方差分析TukeyTukeyshonestlysignificantdifferencetestusestheStudentizedrangestatistictomakeallpairwisecomparisonsbetweengroupsandsetstheexperimentwiseerrorratetotheerrorrateforthecollectionforallpairwisecomparisons.Whentestingalargenumberofpairsofmeans,TukeyshonestlysignificantdifferencetestismorepowerfulthantheBonferronitest.48第八章方差分析容易得出有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義結(jié)論的,依次為:LDS(最容易)SNKTukeybonferroni(最不容易)49第八章方差分析6.方差不齊時(shí)的兩兩比較Tamhane’sT2法:Conservativepairwisecomparisonstest(保守的兩兩比較檢驗(yàn),I類錯(cuò)誤小)basedonattest.Thistestisappropriatewhenthevariancesareunequal.Dunnett’sT3Games–HowUDunnett’sC50第八章方差分析多個(gè)方差的齊性檢驗(yàn)
LeveneTestAhomogeneity-of-variancetestthatislessdependentontheassumptionofnormalitythanmosttests.Foreachcase,itcomputestheabsolutedifferencebetweenthevalueofthatcaseanditscellmeanandperformsaone-wayanalysisofvarianceonthosedifferences.51第八章方差分析SPSS操作與結(jié)果解釋方差分析52第八章方差分析建立SPSS數(shù)據(jù)工作表
g:分組
1-對照組;2-藥物組I;3-藥物組II
X:肺活量表6-2三組足球運(yùn)動(dòng)員的第一秒用力肺活量(L)對照組藥物組I藥物組II3.253.713.493.373.693.67………3.233.453.323.313.523.41均數(shù)3.387(12)3.584(12)3.454(12)見書中p49例題6.153第八章方差分析2.選用SPSS過程54第八章方差分析One-wayANVOA對話框
將x選入DependentList欄,
g選入Factor欄55第八章方差分析單擊PostHoc…按鈕56第八章方差分析選擇Bonferroni和S-N-K法,
單擊Continue返回57第八章方差分析單擊Options…按鈕58第八章方差分析選擇Descriptive,Homogeneity…
單擊Continue返回59第八章方差分析單擊OK按鈕運(yùn)行ANOVA過程60第八章方差分析3.結(jié)果解釋
三組均數(shù)(L)依次為:
對照組(3.3875)、藥物組I(3.5842)
和藥物組II(3.4542)。61第八章方差分析經(jīng)方差齊性檢驗(yàn),P=0.934,
按
=0.05水準(zhǔn),還不能認(rèn)為3個(gè)總體方差不等。62第八章方差分析經(jīng)完全隨機(jī)設(shè)計(jì)的單因素方差分析,
F=5.118,P=0.012,可認(rèn)為三組運(yùn)動(dòng)員的第一秒用力肺活量的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。63第八章方差分析經(jīng)Bonferroni檢驗(yàn),對照組和藥物組I之間的第一秒用力肺活量差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.011)、而其他兩兩比較均無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。64第八章方差分析經(jīng)S-N-K檢驗(yàn),藥物組I和對照組,藥物組I和藥物組II之間的第一秒用力肺活量差異都有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)、而對照組和藥物組II之間無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。65第八章方差分析從剛才不同比較方法的結(jié)果可以看出:經(jīng)Bonferroni檢驗(yàn),對照組和藥物組I之間的第一秒用力肺活量差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義經(jīng)S-N-K檢驗(yàn),藥物組I和對照組,藥物組I和藥物組II之間的第一秒用力肺活量差異都有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義66第八章方差分析隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)的兩因素方差分析在不同的室溫下測定家兔的血糖濃度。室溫分七組,家兔分四個(gè)種屬,每一種屬七只。問不同溫度的血糖濃度有無差別及不同水平血糖濃度均數(shù)的變化趨勢?家兔種屬
室溫5101520253035Ⅰ1301108282110120140Ⅱ12013011083100140160Ⅲ150140100110120120160Ⅳ120100748210011013067第八章方差分析1.建立SPSS數(shù)據(jù)工作表家兔種屬
室溫5101520253035Ⅰ1301108282110120140Ⅱ12013011083100140160Ⅲ150140100110120120160Ⅳ120100748210011013068第八章方差分析求不同溫度的血糖濃度均值
Analyze
Comparemeans
Means69第八章方差分析1.選用SPSS過程:Analyze
GeneralLinearModel
Univariate70第八章方差分析在Univariate對話框,將血糖濃度選入DependentVariable欄;將室溫選入Fixfactors欄;將家兔種屬選入Randomfactors欄71第八章方差分析單擊Model按鈕72第八章方差分析選擇Custom73第八章方差分析將室溫和家兔種屬選入Model欄,從下拉菜單選擇Maineffents(因不能分析交互作用)。單擊Continue返回。74第八章方差分析單擊PostHoc按鈕75第八章方差分析將變量:室溫選入PostHocTestsfor欄,以便進(jìn)行兩兩比較。由于組數(shù)多,選擇
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