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DB41DB41/T1422—2017蝴蝶蘭建蘭花葉病毒實時熒光RT-PCR檢測方法2017-07-07發(fā)布2017-10-07實施河南省質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局發(fā)布I1蝴蝶蘭建蘭花葉病毒實時熒光RT-PCR檢測方法建蘭花葉病毒為ssRNA病毒,通過反轉(zhuǎn)錄酶和DNA聚合酶的作用將RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,針對核酸保守時PCR所需的循環(huán)次數(shù)為Ct值,與樣本細(xì)胞中表達(dá)穩(wěn)定、豐度較低的基因(內(nèi)參基因,2蝴蝶蘭建蘭花葉病毒的實時熒光RT-PCR特異性引物為Cymv-F:5’-TGCCAGACGGTGCTATCGTA-3’、Cymv-R:5’-AGAAAGGTGGAAG蝴蝶蘭實時熒光RT-PCR內(nèi)參引物為PeActin-F:5’-CTCTTTCACAACCACTGCGG-3’、PeActin-R:5’-TGGGCACCTAAATCTCTCAGC-3’3將制備好的樣品置于實時熒光PCR儀上,設(shè)置95查看擴(kuò)增曲線(圖2)。擴(kuò)增曲線包括熒光背景信號階段、熒光信號指數(shù)擴(kuò)增階段和平臺46.6.1待測樣品內(nèi)參基因PeActin引物Ct值為18≤Ct≤20,Cymv引物Ct值為40時,判定結(jié)果為陰6.6.2待測樣品內(nèi)參基因PeActin引物Ct值為18≤Ct≤20,Cymv引物Ct值為≤35時,則判定結(jié)果6.6.3待測樣品內(nèi)參基因PeActin引物Ct值為18≤Ct≤20,Cymv引物Ct值為35<Ct<40時,應(yīng)重新進(jìn)行測試。如果測試的Cymv引物Ct值為40時,則判定結(jié)果為陰性;如果重新測試的Cymv引物Ct5建蘭花葉病毒病毒顆粒呈線狀,長度475nm,寬度13nm,螺旋對糖蛋白體,有一種結(jié)構(gòu)蛋白(外殼蛋白)和基因組ssRNA組成。外殼蛋白的分子量為23.6kDa左右220個氨基酸組成。核酸為線性正義鏈ssRNA,分子量為稀釋限點5×10-5,鈍化溫度65℃~70℃。通過一次PEG沉淀,在蔗糖密度梯度離心后病毒成明顯的條CymMV的RNA基因組全長為6227bp,3’末端有poly(A)加尾,5’端有帶帽結(jié)構(gòu),與馬鈴薯X屬類似。其基因組結(jié)構(gòu)包括5個開放式閱讀框(ORFORF1編碼CymMV所編碼的蛋白與馬鈴薯X病毒屬其它成員編碼的對應(yīng)蛋白有很高的同源性。不
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