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回歸課本之新教材的查缺補(bǔ)漏-13基因工程(PCR技術(shù))1、反應(yīng)過(guò)程:PCR一般要經(jīng)歷三十多次循環(huán),每次循環(huán)可以分為變性、復(fù)性和延伸三步。從第二輪循環(huán)開(kāi)始,上一次循環(huán)的產(chǎn)物也作為模板參與反應(yīng),并且由引物Ⅰ延伸而成的DNA單鏈會(huì)與引物Ⅱ結(jié)合,進(jìn)行DNA的延伸,這樣,DNA聚合酶只能特異地復(fù)制處于兩個(gè)引物之間的DNA序列,使這段固定長(zhǎng)度的序列成指數(shù)擴(kuò)增。2、實(shí)驗(yàn)操作(1)PCR反應(yīng)體系:緩沖液、DNA模板,四種脫氧核苷酸原料、熱穩(wěn)定的DNA聚合酶、兩種RNA引物、水。(2)實(shí)驗(yàn)操作步驟:①按照PCR反應(yīng)體系配方配制反應(yīng)液;②將PCR反應(yīng)體系50μL用微量移液器轉(zhuǎn)移到微量離心管(0.5mL)中;③將微量離心管放到PCR儀中;④設(shè)置PCR儀的工作參數(shù);⑤DNA在PCR儀中大量擴(kuò)增。1.關(guān)于“DNA片段的擴(kuò)增及電泳鑒定”實(shí)驗(yàn),下列相關(guān)敘述正確的是(
)A.PCR儀實(shí)質(zhì)上就是一臺(tái)能自動(dòng)調(diào)控溫度的儀器,但在使用時(shí)需根據(jù)擴(kuò)增的DNA片段以及引物的情況人工設(shè)定合適的溫度B.PCR反應(yīng)體系中的10倍濃縮的擴(kuò)增緩沖液中含有Mg2?、4種脫氧核糖核苷酸等成分C.為避免外源DNA等因素的污染,PCR實(shí)驗(yàn)中使用的微量離心管、槍頭、蒸餾水和移液器等在使用前都必須進(jìn)行高壓滅菌處理D.電泳時(shí),電泳緩沖液不能沒(méi)過(guò)凝膠導(dǎo)致凝膠加樣孔中的電泳樣液流出2.下圖為利用逆轉(zhuǎn)錄方法和PCR技術(shù)擴(kuò)增目的基因片段的過(guò)程示意圖。據(jù)圖分析,下列說(shuō)法錯(cuò)誤的是(
)A.③過(guò)程使用90~95℃的高溫處理是為了讓目的基因充分變性B.⑤過(guò)程使用70~75℃的溫度處理既可以防止DNA變性,還能促進(jìn)子鏈的延伸C.④過(guò)程兩種引物通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)與兩條單鏈DNA結(jié)合D.若RNA單鏈中A與U之和占該鏈堿基含量的40%,則其逆轉(zhuǎn)錄合成的雙鏈DNA中,A與U之和也占該DNA堿基含量的40%1.引物存在的必要性DNA聚合酶只能催化脫氧核糖核苷酸加至已有核酸鏈的游離3'-羥基上,而不能使脫氧核糖核苷酸自身發(fā)生聚合,即它需要引物鏈的存在。引物是一小段DNA或RNA,它能與DNA母鏈的一段堿基互補(bǔ)配對(duì)。細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制以RNA作引物,從新合成的岡崎片段上發(fā)現(xiàn)含有一短暫存在的小的RNA片段附著在5'端這一事實(shí),可說(shuō)明DNA復(fù)制時(shí)需要RNA引物,這些引物長(zhǎng)5~10bp,現(xiàn)已知RNA引物的合成是由一種特殊的RNA合成酶——引物酶所催化的。PCR反應(yīng)以DNA作引物。2、引物的作用DNA聚合酶不能從頭開(kāi)始合成DNA,只能從3'端延伸DNA鏈。當(dāng)引物與DNA母鏈通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合后,DNA聚合酶就能從引物的3'端開(kāi)始延伸DNA鏈。不同的引物可結(jié)合不同的目的基因并進(jìn)行擴(kuò)增。3、設(shè)計(jì)引物的原則引物是根據(jù)目的基因特有的一段已知的核苷酸序列設(shè)計(jì)合成的,能與目的基因的模板鏈通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)特異性地結(jié)合。設(shè)計(jì)引物的主要原則:①引物長(zhǎng)度應(yīng)大于16個(gè)核苷酸,可防止隨機(jī)結(jié)合;②引物與靶序列間的Tm不應(yīng)過(guò)低;③引物不應(yīng)有發(fā)夾結(jié)構(gòu),即不能有4bp以上的回文序列;④2個(gè)引物間不應(yīng)有4bp以上的互補(bǔ)序列或同源序列,在3'端不應(yīng)有任何互補(bǔ)的堿基;⑤引物中堿基的分布盡可能均勻,G+C含量接近50%。4、引物的處理由于引物延伸從3'端開(kāi)始,3'端不能進(jìn)行任何修飾,引物5'端對(duì)擴(kuò)增特異性影響不大,因此,可給予修飾而不影響擴(kuò)增特異性。引物5'端修飾包括加酶切位點(diǎn)、標(biāo)記生物素、熒光等。為了使經(jīng)PCR擴(kuò)增的目的基因能與運(yùn)載體正常結(jié)合,需要在2種引物的5'端添加不同的限制酶的識(shí)別序列。在2種引物的5'端上添加不同的限制酶識(shí)別序列,是為了保證目的基因定向插入運(yùn)載體并可避免目的基因自身環(huán)化。5、引物的特點(diǎn)①引物能與DNA模板通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合;②2種引物之間不能互補(bǔ)配對(duì);③某一引物不能自身折疊出現(xiàn)局部堿基互補(bǔ)配對(duì);④需要在2種引物的5'端添加不同的限制酶的識(shí)別序列;⑤引物不能太短。3.PCR又稱聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),在基因工程中常用它特異性地快速擴(kuò)增目的基因。下列有關(guān)PCR的敘述錯(cuò)誤的是(
)A.以DNA半保留復(fù)制為原理,反應(yīng)需要在緩沖液中進(jìn)行B.耐高溫的DNA聚合酶只能從引物的5'端開(kāi)始連接脫氧核苷酸C.反應(yīng)過(guò)程中的每一輪循環(huán)依次包括變性、復(fù)性、延伸三步D.常采用瓊脂糖凝膠電泳來(lái)鑒定PCR的產(chǎn)物4.新冠病毒包膜表面的S蛋白能識(shí)別人體細(xì)胞膜表面的ACE2受體并導(dǎo)致病毒入侵人體細(xì)胞。制備重組亞單位新冠疫苗的線路是:提取新冠病毒RNA→通過(guò)RT-PCR(反轉(zhuǎn)錄酶聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))技術(shù)擴(kuò)增篩選RBD蛋白(S蛋白中真正與ACE2結(jié)合的關(guān)鍵部分)基因(圖1)→構(gòu)建基因表達(dá)載體(圖2)→導(dǎo)入CHO細(xì)胞并培養(yǎng)→提取并純化RBD蛋白→制成疫苗。圖3為利用電泳技術(shù)對(duì)PCR的產(chǎn)物進(jìn)行純度鑒定,1號(hào)泳道為標(biāo)準(zhǔn)(Marker),2號(hào)泳道為陽(yáng)性對(duì)照組,3號(hào)泳道為實(shí)驗(yàn)組。下列相關(guān)敘述錯(cuò)誤的是(
)A.利用RT-PCR技術(shù)獲取RBD蛋白基因時(shí),需加入逆轉(zhuǎn)錄酶、TaqDNA聚合酶B.利用PCR擴(kuò)增含有限制酶切點(diǎn)的RBD蛋白基因時(shí),應(yīng)選擇的引物為引物4、引物5C.2號(hào)泳道是以(提純的)RBD蛋白基因片段為材料所做的陽(yáng)性對(duì)照組D.為提高目的基因和運(yùn)載體的正確連接效率,應(yīng)選擇限制酶EcoRI切割PCR的原理是DNA分子的半保留復(fù)制,所以要根據(jù)DNA分子的2條模板鏈設(shè)計(jì)2種引物。PCR循環(huán)時(shí)需要的引物數(shù)量的計(jì)算有2種方法。方法1∶第n次循環(huán)產(chǎn)生的DNA數(shù)為2",根據(jù)DNA分子的半保留復(fù)制可知,需要的引物數(shù)為2n個(gè),從第1次循環(huán)開(kāi)始,需要引物的個(gè)數(shù)依次為2個(gè)、22個(gè)、23個(gè)……2n個(gè),故PCR過(guò)程經(jīng)過(guò)n次循環(huán),需要的引物總個(gè)數(shù)是2+21+22+……+2n=2n+1-2。方法2∶PCR經(jīng)過(guò)n次循環(huán)產(chǎn)生的DNA數(shù)為2",一共有2"'條鏈,其中有2條鏈?zhǔn)荄NA母鏈,不含引物,其他的每1條鏈均含1個(gè)引物,并且2種引物的數(shù)量相等,故PCR過(guò)程經(jīng)過(guò)n次循環(huán),需要的引物總個(gè)數(shù)是2n+1-2,需要某一種引物的總個(gè)數(shù)是(2n+1-2)×1/2=2n-1。2n個(gè)DNA中,一個(gè)DNA由1條母鏈和第1種引物延伸的子鏈組成,另一個(gè)DNA由另一條母鏈和第2種引物延伸的子鏈組成,其他的DNA均由2種引物延伸的2條子鏈組成。5.新冠疫情的快速控制,離不開(kāi)我國(guó)政府的科學(xué)決策和對(duì)新冠病毒(一種RNA病毒)的快速檢測(cè)能力。熒光定量PCR可定量檢測(cè)樣本中DNA含量,其原理是在PCR反應(yīng)體系中加入引物的同時(shí),加入與某條模板鏈互補(bǔ)的熒光探針,當(dāng)耐高溫的DNA聚合酶催化子鏈延伸至探針處會(huì)水解探針并生成熒光分子,即DNA每擴(kuò)增一次,就有一個(gè)熒光分子生成(如圖),熒光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)隨時(shí)接收熒光信號(hào)變化。每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號(hào)到達(dá)設(shè)定閾值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)次數(shù)稱為循環(huán)閾值(Ct值)。下列說(shuō)法正確的是(
)A.細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制的引物種類(lèi)與PCR所用引物種類(lèi)相同B.一個(gè)初始DNA分子經(jīng)過(guò)4次循環(huán)后,得到6個(gè)等長(zhǎng)的DNA分子C.Ct值越大,被檢測(cè)樣本中病毒數(shù)目越多,對(duì)被檢測(cè)者的危害性越大D.最終監(jiān)測(cè)的熒光強(qiáng)度與起始時(shí)反應(yīng)管內(nèi)樣本DNA的含量呈正相關(guān)6.PCR引物的3'端為結(jié)合模板DNA的關(guān)鍵,5'端無(wú)嚴(yán)格限制,可用于添加限制酶切點(diǎn)等序列,dNTP(四種脫氧核苷酸)是DNA合成的原料。下列相關(guān)說(shuō)法錯(cuò)誤的是(
)A.圖示環(huán)節(jié)所需的溫度比上一個(gè)環(huán)節(jié)的低B.dNTP作為擴(kuò)增的原料會(huì)依次連接到3'端C.Taq酶催化相鄰的dNTP間形成磷酸二酯鍵D.經(jīng)過(guò)1個(gè)循環(huán)后,獲得的子代DNA的雙鏈中脫氧核苷酸數(shù)量相同PCR的每次循環(huán)可分為3步:1、變性(90~95℃)變性的溫度與目的基因中G+C含量有關(guān);變性時(shí)間的長(zhǎng)短與目的基因的長(zhǎng)短有關(guān),目的基因越長(zhǎng),變性的時(shí)間就越長(zhǎng)。2、復(fù)性(55~60℃)復(fù)性是讓2種引物通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)與2條單鏈DNA結(jié)合,復(fù)性的溫度與引物中G+C含量有關(guān),G-C堿基對(duì)間有3個(gè)氫鍵,A-T堿基對(duì)間只有2個(gè)氫鍵,引物中G+C含量較高,復(fù)性時(shí)溫度就較高;復(fù)性時(shí)間的長(zhǎng)短與引物的長(zhǎng)短有關(guān),引物越長(zhǎng),復(fù)性的時(shí)間就越長(zhǎng)。3、延伸(70~75℃)延伸的溫度不能太高,以防止新合成的子鏈DNA與母鏈DNA解聚為單鏈,延伸的溫度也不能太低,是為了保證Taq酶的活性;延伸所需要的時(shí)間長(zhǎng)短與目的基因的長(zhǎng)短有關(guān),目的基因越長(zhǎng),延伸所需要的時(shí)間就越長(zhǎng)。7.熒光定量PCR技術(shù)可定量檢測(cè)樣本中DNA含量,其原理是:在PCR反應(yīng)體系中加入引物的同時(shí),加入與某條模板鏈互補(bǔ)的熒光探針,當(dāng)TaqDNA聚合酶催化子鏈延伸至探針處會(huì)水解探針,使熒光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)接收到熒光信號(hào),即每擴(kuò)增一次,就有一個(gè)熒光分子生成(如圖)。Ct值(循環(huán)閾值)的含義為:每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號(hào)到達(dá)設(shè)定閾值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。下列說(shuō)法不正確的是(
)A.檢測(cè)新冠病毒時(shí),需加入逆轉(zhuǎn)錄酶將新冠病毒RNA轉(zhuǎn)化為cDNAB.PCR每個(gè)循環(huán)包括變性、復(fù)性(引物和模板結(jié)合)、延伸3個(gè)階段C.Ct值越大表示被檢測(cè)樣本中病毒數(shù)目越多,患者危險(xiǎn)性更高D.若樣本被污染,RNA酶將病毒RNA降解,檢測(cè)結(jié)果可能為陰性8.下列有關(guān)PCR的敘述,錯(cuò)誤的是()A.PCR的原理是DNA復(fù)制,解旋和復(fù)制是同時(shí)進(jìn)行的B.PCR的過(guò)程主要包括變性→延伸→復(fù)性,溫度逐漸降低C.PCR技術(shù)擴(kuò)增時(shí),一個(gè)DNA分子經(jīng)過(guò)n輪復(fù)制共需引物2n-1對(duì)D.每一循環(huán)都消耗引物和原料,需要在操作中及時(shí)補(bǔ)充1.重疊延伸PCRSOEPCR技術(shù)是1989年由Horton等創(chuàng)建的,它依據(jù)目的基因的核苷酸序列,將目的基因分為多條引物,設(shè)計(jì)多對(duì)具有互補(bǔ)末端的引物,先分段對(duì)模板進(jìn)行擴(kuò)增,再將PCR產(chǎn)物混合,通過(guò)重疊鏈的相互搭橋、互為模板而延伸,最終將不同來(lái)源的擴(kuò)增片段重疊拼接起來(lái)(圖1)。重疊PCR技術(shù)彌補(bǔ)了一般PCR技術(shù)對(duì)短于100bp和長(zhǎng)度為幾十bp片段DNA重組的困難,并可不依賴于內(nèi)切酶的消化方式,簡(jiǎn)潔快速地獲得PCR產(chǎn)物,有效避免加入的非目的基因序列的連接對(duì)目的基因的影響,從而在體外獲得高質(zhì)量的目的基因序列,而且目的產(chǎn)物特異性高,不需要構(gòu)建DNA文庫(kù)進(jìn)行篩選。但由于該技術(shù)所使用的引物序列較長(zhǎng)(“引發(fā)”部分和“重疊”部分,各約25~30bp),故該技術(shù)的退火溫度較難把握,對(duì)實(shí)驗(yàn)的成功率造成很大影響。該技術(shù)在大片段基因的人工合成(如圖2-a)、基因定點(diǎn)突變(如圖2-b)等方面有廣泛應(yīng)用。大片段基因的人工合成是根據(jù)目的基因的序列,設(shè)計(jì)n條單鏈寡核苷酸片段為引物(如圖2-a中P1~P15),相鄰近的每2條引物之間均有15~25bp的序列反向互補(bǔ)。原理是先取中間4條單鏈的寡核苷酸引物P6、P7、P8和P9進(jìn)行第1輪的PCR反應(yīng),得到目的片段后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳回收。下面每輪循環(huán)都以上輪的PCR反應(yīng)產(chǎn)物為模板,依次在兩側(cè)引入2條寡核苷酸引物,互為動(dòng)態(tài)模板,最終實(shí)現(xiàn)目的基因的合成?;蚨c(diǎn)突變是根據(jù)的基因的序列,設(shè)計(jì)4條單鏈寡核苷酸片段為引物(如圖2-b中的引物A~D),其中2條引物(B、C)堿基序列反向互補(bǔ),且此2條引物的中間為突變堿基。原理是取引物A、B進(jìn)行PCR1反應(yīng),以及引物C、D進(jìn)行PCR2反應(yīng),得到的2種目的片段分別進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳回收。將回收的片段混合,片段互為模板和引物進(jìn)行PCR3反應(yīng),最后以PCR3產(chǎn)物為模板,加入引物A、D完成PCR4反應(yīng),最終實(shí)現(xiàn)基因特定位置堿基的增添、缺失、替換。2.等位基因特異PCRAS-PCR又稱作ARMS(amplificationrefractorymutationsystem),是由Newton等1989年研發(fā)的一種PCR技術(shù),該技術(shù)的原理是:根據(jù)單核苷酸多態(tài)性(single-nucleotidepolymorphism,SNP)位點(diǎn)設(shè)計(jì)3′末端與SNP位點(diǎn)堿基互補(bǔ)或錯(cuò)配的特異PCR引物,通過(guò)凝膠電泳等方法檢測(cè)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的有或無(wú),從而檢測(cè)基因型中SNP(如圖3)。根據(jù)等位基因WT和MT之間存在的1個(gè)核苷酸T-G的突變,設(shè)計(jì)引物1、2、3。其中引物1為公共引物,引物2與MT配對(duì),與WT不配對(duì),故引物1、2僅在MT中有擴(kuò)增產(chǎn)物;同理,引物1、3僅在WT中有擴(kuò)增產(chǎn)物。由于生物中SNP數(shù)量多、分布廣、穩(wěn)定性強(qiáng),故該技術(shù)是一個(gè)快速、簡(jiǎn)便、可靠的檢測(cè)基因型SNP的技術(shù),也是有效開(kāi)發(fā)SNP分子標(biāo)記的方法。但該技術(shù)的反應(yīng)體系有很高的靈敏性,對(duì)鎂離子、Taq酶、dNTP的濃度要求比較嚴(yán)格,實(shí)際操作還需要多次預(yù)實(shí)驗(yàn)予以確定。圖3.等位基因特異PCR原理3.熱不對(duì)稱性PCRTAIL-PCR技術(shù)是一種用來(lái)分離與已知序列鄰近的未知DNA序列的PCR技術(shù),該技術(shù)由Liu和Whitter于1995年首先研究并報(bào)道,其原理是:利用一系列序列特異性的嵌套引物與一個(gè)短的簡(jiǎn)并引物指導(dǎo)擴(kuò)增已知序列的側(cè)翼序列的反應(yīng),由于兩類(lèi)引物的退火溫度不同,可通過(guò)控制反應(yīng)過(guò)程中的退火溫度而有效地控制特異性和非特異性產(chǎn)物的擴(kuò)增。操作時(shí),根據(jù)目標(biāo)序列旁邊的已知序列設(shè)計(jì)3個(gè)嵌套的特異性引物(specialprimer,SP1、SP2、SP3),用它們分別和1個(gè)具有低Tm值的短的隨機(jī)簡(jiǎn)并引物(arbitrarydegenerate,AD)組合,以基因組DNA作為模板,根據(jù)引物的長(zhǎng)短和特異性的差異設(shè)計(jì)不對(duì)稱的溫度循環(huán),通過(guò)分級(jí)反應(yīng)來(lái)擴(kuò)增特異片段。第1輪PCR反應(yīng)包括5次高嚴(yán)謹(jǐn)性反應(yīng)、一次低嚴(yán)謹(jǐn)性反應(yīng)、10次較低嚴(yán)謹(jǐn)性反應(yīng)和12次熱不對(duì)稱的超級(jí)循環(huán)。首先,5次高嚴(yán)謹(jǐn)性的反應(yīng)使長(zhǎng)的高退火溫度的特異引物SP1與已知的序列結(jié)合并延伸。此過(guò)程中目標(biāo)序列呈直線式上升,由AD引物結(jié)合產(chǎn)生的非特異性產(chǎn)物的濃度較低,之后進(jìn)行1次低退火溫度反應(yīng),使簡(jiǎn)并引物結(jié)合到較多的目標(biāo)序列上,接下來(lái)10次較低嚴(yán)謹(jǐn)性的反應(yīng)使2種引物均能與模板互補(bǔ)配對(duì),從而使原來(lái)由高嚴(yán)謹(jǐn)性循環(huán)所產(chǎn)生的單鏈靶DNA復(fù)制成雙鏈DNA,為下一輪線性擴(kuò)增模板做準(zhǔn)備,最后進(jìn)行12次熱不對(duì)稱的TAIL循環(huán),使目的片段擴(kuò)增量大大超過(guò)非目標(biāo)片段。經(jīng)過(guò)上述過(guò)程,得到濃度不同的3類(lèi)產(chǎn)物:產(chǎn)物Ⅰ是在特異引物和任意引物之間擴(kuò)增的,即目標(biāo)產(chǎn)物(大量);產(chǎn)物Ⅱ是單獨(dú)由特異引物擴(kuò)增的(大量);產(chǎn)物Ⅲ是單獨(dú)由任意引物引發(fā)的產(chǎn)物(少量)。接下來(lái)進(jìn)行第2輪PCR反應(yīng),使產(chǎn)物Ⅰ的分子數(shù)逐漸升至最高,產(chǎn)物Ⅱ、產(chǎn)物Ⅲ基本不變。用稀釋后的第2輪PCR產(chǎn)物為模板,進(jìn)行第3輪PCR,最終獲得目標(biāo)產(chǎn)物為主的PCR產(chǎn)物(圖4)。對(duì)此PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,即實(shí)現(xiàn)從已知序列中分離到其鄰近的未知側(cè)翼序列這一目的。以基因組DNA作為模板,利用依照目標(biāo)序列旁的已知序列設(shè)計(jì)的3個(gè)較高退火溫度的引物SP,和1個(gè)AD引物組合,通過(guò)特殊的熱循環(huán)程序(低嚴(yán)謹(jǐn)PCR、高嚴(yán)謹(jǐn)PCR交替進(jìn)行),使得特異性PCR產(chǎn)物得以有效擴(kuò)增,從而獲得已知序列的側(cè)翼序列(圖4)。TAIL-PCR方法直接通過(guò)3輪PCR反應(yīng)得到目的片段,能彌補(bǔ)常規(guī)PCR不能對(duì)已知DNA序列側(cè)翼的未知序列進(jìn)行擴(kuò)增的不足,從而快速分離到目標(biāo)序列。但該方法對(duì)反應(yīng)條件要求精準(zhǔn),其中任一輪出現(xiàn)失誤,都將直接影響下一循環(huán),進(jìn)而影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果;另外,由于引物組合較多,且AD引物存在有限的結(jié)合位點(diǎn),即使使用不同的簡(jiǎn)并引物也有可能導(dǎo)致擴(kuò)增不出產(chǎn)物。目前,TAIL-PCR在對(duì)基因側(cè)翼序列的克隆中發(fā)揮了重要作用,在圖位克隆、遺傳圖譜繪制、基因測(cè)序等方面也被廣泛應(yīng)用。圖4.典型TALL-PCR流程4.熒光定量PCRFQ-PCR于1992由Higuchi提出設(shè)想,1995年由美國(guó)PE(PerkinElmer)公司研發(fā),是一種在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基因,利用熒光信號(hào)的積累,對(duì)整個(gè)PCR進(jìn)程進(jìn)行檢測(cè),最后通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的PCR技術(shù)。例如Taq‐Man探針工作原理是探針保持完整狀態(tài)時(shí),R所發(fā)射的熒光能量被Q基團(tuán)吸收,不會(huì)檢測(cè)到熒光。在PCR延伸過(guò)程中,探針被5′-3′核酸外切酶特異性地切割并釋放5′端的熒光基團(tuán),發(fā)出熒光信號(hào),熒光量與產(chǎn)物中雙鏈的量呈正相關(guān)(圖5、圖6)。熒光定量PCR具有重復(fù)性好、特異性強(qiáng)、靈敏度高、定量精準(zhǔn)、操作簡(jiǎn)便和自動(dòng)化程度高等一系列優(yōu)點(diǎn),在基礎(chǔ)生物學(xué)研究、食品檢測(cè)、環(huán)境檢測(cè)、醫(yī)學(xué)診斷等領(lǐng)域有廣泛應(yīng)用。但該技術(shù)在操作的規(guī)范性(如檢測(cè)樣品的數(shù)量是否滿足生物學(xué)重復(fù)和技術(shù)重復(fù)使用、實(shí)驗(yàn)室采用的統(tǒng)計(jì)方法對(duì)結(jié)果呈現(xiàn)的影響度等)、實(shí)驗(yàn)耗材的費(fèi)用(熒光探針費(fèi)用昂貴,且損耗快)等方面仍存在不足。圖5.熒光定量PCR原理5.鍋柄式PCR鍋柄式PCR是一種環(huán)狀PCR技術(shù),該技術(shù)于1997年由Felix和Jones報(bào)道,采用已知的5′端序列和未知的3′端伴侶基因序列以形似一個(gè)鍋和一個(gè)柄的模板擴(kuò)增基因DNA,從而擴(kuò)增2.0~9.0kb的大片段未知序列(如圖7)。PanhandlePCR是高度特異性擴(kuò)增與已知位點(diǎn)相鄰大于3.0kb的人類(lèi)基因組DNA的最佳技術(shù)。其已廣泛運(yùn)用于啟動(dòng)子、基因調(diào)節(jié)結(jié)構(gòu)域定位、轉(zhuǎn)座子整合位點(diǎn)測(cè)定等領(lǐng)域。圖7.鍋柄式PCR原理除上述5種常用新型PCR技術(shù)外,目前還有低變性溫度PCR、AnglerPCR、脈沖PCR等多種PCR技術(shù),他們都各有優(yōu)勢(shì)、各有側(cè)重,在分子生物學(xué)研究領(lǐng)域發(fā)揮著重要作用。隨著制造業(yè)的發(fā)展及其他技術(shù)的配合,定會(huì)有更多升級(jí)版、改進(jìn)版的PCR技術(shù)問(wèn)世,為基因結(jié)構(gòu)和功能的研究提供更好的技術(shù)支持。9.利用重疊延伸PCR技術(shù)進(jìn)行定點(diǎn)突變可以實(shí)現(xiàn)對(duì)纖維素酶基因進(jìn)行合理性改造,其過(guò)程如下圖所示。下列分析不正確的是()A.PCR1過(guò)程中的產(chǎn)物AB是依賴引物a和引物b擴(kuò)增的結(jié)果B.引物c和引物b上均含有與模板鏈不能互補(bǔ)的堿基C.①過(guò)程需要先加熱至90℃以上后再冷卻至50℃左右D.②過(guò)程需要利用引物a和引物d獲得突變產(chǎn)物AD10.實(shí)時(shí)熒光定量PCR可用于對(duì)樣品中特定DNA序列進(jìn)行定量分析。將熒光標(biāo)記的Taqman探針與待測(cè)樣本DNA混合,當(dāng)探針完整時(shí),不產(chǎn)生熒光。在PCR過(guò)程中,與目的基因結(jié)合的探針被TaqDNA聚合酶水解,R與Q分離后,在特定光的激發(fā)下R發(fā)出熒光,隨著循環(huán)次數(shù)的增加,熒光信號(hào)強(qiáng)度增加,通過(guò)實(shí)時(shí)檢測(cè)熒光信號(hào)強(qiáng)度,可得Ct值(達(dá)到熒光閾值所經(jīng)歷的循環(huán)次數(shù))。下列相關(guān)敘述正確的是(
)A.熒光基因R連接在探針的3’端B.該反應(yīng)體系中并未加入ATP,所以新鏈的合成不需要消耗能量C.TaqDNA聚合酶在該反應(yīng)中的作用是合成磷酸二酯鍵D.Ct值越小,說(shuō)明樣品中特定DNA序列的含量越多11.重疊延伸PCR技術(shù)是采用具有互補(bǔ)末端的引物,使PCR產(chǎn)物形成重疊鏈,從而在隨后的擴(kuò)增反應(yīng)中通過(guò)重疊鏈的延伸,獲得想要的目的基因。某科研團(tuán)隊(duì)運(yùn)用重疊延伸PCR技術(shù)在水蛭素基因的特定位點(diǎn)引入特定突變,以實(shí)現(xiàn)基因的定點(diǎn)突變,原理見(jiàn)圖。下列說(shuō)法錯(cuò)誤的是(
)A.過(guò)程②需要含Mg2+的緩沖液、DNA模板、引物、四種脫氧核苷酸、耐高溫的DNA聚合酶等B.若引物1、引物2組成的反應(yīng)系統(tǒng)和引物3、引物4組成的反應(yīng)系統(tǒng)中均進(jìn)行一次DNA分子的復(fù)制后,一共會(huì)產(chǎn)生2種DNA分子C.經(jīng)過(guò)過(guò)程④獲得的雜交DNA有2種,其中只有一種可以經(jīng)過(guò)過(guò)程⑤獲得目的基因D.過(guò)程⑤使用耐高溫的DNA聚合酶延伸,不需要引物12.利用PCR技術(shù)擴(kuò)增目的基因,其原理與細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制類(lèi)似(如圖所示)。圖中引物為單鏈DNA片段,它是子鏈合成延伸的基礎(chǔ)。下列敘述錯(cuò)誤的是(
)A.延伸的溫度必須大于復(fù)性溫度,而小于變性溫度B.設(shè)計(jì)引物時(shí)需要避免引物之間堿基互補(bǔ)配對(duì)而造成引物自連C.復(fù)性溫度過(guò)高可能導(dǎo)致PCR反應(yīng)得不到任何擴(kuò)增產(chǎn)物D.第四輪循環(huán)產(chǎn)物中同時(shí)含有引物A和引物B的DNA片段所占的比例為15/1613.隨著全球轉(zhuǎn)基因作物大規(guī)模種植和全球一體化下頻繁的貿(mào)易流通,轉(zhuǎn)基因監(jiān)管的任務(wù)將越來(lái)越重。為了還給消費(fèi)者知情權(quán)和選擇權(quán),多個(gè)國(guó)家和地區(qū)對(duì)轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品實(shí)行標(biāo)識(shí)管理制度,這些法規(guī)實(shí)施的前提就是要建立穩(wěn)定、準(zhǔn)確的轉(zhuǎn)基因檢測(cè)技術(shù)。PCR轉(zhuǎn)基因檢測(cè)技術(shù)被多國(guó)檢測(cè)工作者使用,該技術(shù)通常包括核酸提取、核酸擴(kuò)增、擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)3個(gè)步驟。某研究小組設(shè)計(jì)并完成了“轉(zhuǎn)基因抗草甘膦大豆定性PCR檢測(cè)”實(shí)驗(yàn),請(qǐng)參與實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)并回答相關(guān)問(wèn)題(草甘膦為常用除草劑;轉(zhuǎn)基因抗草甘膦大豆的外源基因構(gòu)建圖如圖1所示):圖1抗草甘膦外源基因結(jié)構(gòu)圖(CaMV35S為外源啟動(dòng)子、NOS為外源終止子)(1)提取DNA:取待測(cè)大豆組織裂解破碎,進(jìn)行DNA提取和純化,得到待測(cè)大豆基因組DNA。該過(guò)程的常用的試劑有EDTA、SDS、NaCl、酒精等。在研磨液中加入NaCl的目的是________________,提取到的DNA可以用______________試劑鑒定。(2)DNA擴(kuò)增:①在確定擴(kuò)增對(duì)象后,從___________________中獲得待擴(kuò)增基因序列,以此為依據(jù)可設(shè)計(jì)引物。該小組擬定的引物設(shè)計(jì)如表所示,其引物設(shè)計(jì)有一個(gè)是不科學(xué)的,請(qǐng)指出并說(shuō)明原因____________?;蛞镄蛄挟a(chǎn)物片段大小基因來(lái)源LectinF-5'GCCCTCTACTCCACCCCCATCC-3'R-5'GCCCATCTGCAAGCCTTTTTGTG-3'118內(nèi)源基因CaMV35SF-5'GGGATT-3'R-5'AATCCC-3'195外源基因NOSF-5'GAATCCTGTTGCCGGTCTTG-3'R-5'TTATCCTAGTTTGCGCGCTA-3'180外源基因CP4-EPSPSF-5'CTTCTGTGCTGTAGCCACTGATGC-3R-5'CCACTATCCTTCGCAAGACCCTTC-3320外源基因注:內(nèi)源基因指大豆基因組內(nèi)基因,外源基因指大豆基因組外基因。②PCR擴(kuò)增:在4個(gè)反應(yīng)體系中分別加入________________(模板)、相應(yīng)引物、________________酶、________________等,并將PCR儀的溫度設(shè)定為:變性94℃30s、復(fù)性58℃30s、延伸72℃40s,循環(huán)30次?!把由臁钡臏囟仍O(shè)定為72℃,是因?yàn)樵摐囟认耞_______________。在設(shè)定的PCR體系下可以特異性擴(kuò)增目標(biāo)DNA片段,主要是因?yàn)開(kāi)_________________________________具有特異性。(3)擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè):可采用________________的方法檢測(cè)。部分實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖2、3所示。據(jù)圖2初步判斷,該大豆為_(kāi)_______________(填“轉(zhuǎn)基因”或“非轉(zhuǎn)基因”)大豆。據(jù)圖2、圖3分析,其實(shí)驗(yàn)結(jié)果是________________(填“可信的”或“不可信的”)。注:M:標(biāo)準(zhǔn)參照物,1:陽(yáng)性對(duì)照(基因標(biāo)準(zhǔn)品),2:陰性對(duì)照(普通大豆),3:核酸提取空白對(duì)照,4:待鑒定樣本14.新型冠狀病毒的結(jié)構(gòu)如圖甲所示。病毒外有包膜,這層包膜主要來(lái)源于宿主細(xì)胞膜,包膜還含有病毒自身的糖蛋白,其中糖蛋白S可與人體細(xì)胞表面的ACE2蛋白結(jié)合,從而使病毒識(shí)別并侵入宿主細(xì)胞。新型冠狀病毒是一種單股正鏈RNA病毒,以ss(+)RNA表示。圖乙表示新冠病毒在宿主細(xì)胞內(nèi)增殖過(guò)程,回答下列問(wèn)題。(1)新冠病毒的糖蛋白S可與人體細(xì)胞表面的ACE2蛋白結(jié)合體現(xiàn)了膜的_____________功能,研究表明吸煙更容易感染新冠病毒,可能的原因是_____________。(2)推測(cè)新冠病毒進(jìn)入宿主細(xì)胞后,在_____________(細(xì)胞器)的作用下脫去包膜,暴露出遺傳物質(zhì)。據(jù)圖分析新冠病毒增殖的過(guò)程中遺傳信息的傳遞方向是_____________(用文字和箭頭表示)。(3)新冠病毒核酸檢測(cè)可采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),1~2h內(nèi)即可得到檢測(cè)結(jié)果。圖丙表示該技術(shù)的基本流程,其原理是PCR擴(kuò)增過(guò)程(一種體外大量擴(kuò)增DNA的技術(shù))中加入與特定模板鏈互補(bǔ)的熒光探針,再通過(guò)檢測(cè)產(chǎn)物的熒光信號(hào)即可確定是否為陽(yáng)性。①圖中酶A為_(kāi)____________,酶B能水解雜化雙鏈中的_____________(填“DNA”或“RNA”),酶C的作用類(lèi)似于DNA聚合酶,推測(cè)其起作用時(shí)______________(填“需要”或“不需要”)模板。②PCR擴(kuò)增過(guò)程的原理是_____________。15.在聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)中,除了作為復(fù)制對(duì)象的長(zhǎng)鏈DNA之外,反應(yīng)溶液中還添加有作為引物的短鏈DNA、dNTP(脫氧三磷酸核苷酸,N表示任意某一種堿基)和酶。實(shí)驗(yàn)時(shí)需要使反應(yīng)溶液的溫度周期性地發(fā)生變化以完成“變性—復(fù)性—延伸”的循環(huán)。DNA復(fù)性溫度與互補(bǔ)堿基對(duì)之間的氫鍵數(shù)呈正相關(guān)。(1)PCR反應(yīng)溶液中添加的酶為_(kāi)_____,作用是______。(2)實(shí)驗(yàn)1:在圖1的引物1到引物4中,只使用1種作為引物,復(fù)性的溫度設(shè)定為T(mén)℃,PCR后只合成出了與模板DNA2相同的單鏈。該實(shí)驗(yàn)使用的引物是______。實(shí)驗(yàn)2:將引物變更為圖1中的引物3和引物4,其他條件與實(shí)驗(yàn)1相同的情況下進(jìn)行PCR雙鏈DNA完全沒(méi)有被復(fù)制,請(qǐng)?jiān)诖痤}卡中,將引物3和引物4與模板鏈結(jié)合的關(guān)系繪制出來(lái)。______(3)實(shí)驗(yàn)3:對(duì)圖2中的雙鏈DNA,使用引物5和引物6,將復(fù)性的溫度設(shè)定為T(mén)℃,進(jìn)行了PCR。結(jié)果是雙鏈DNA完全得不到復(fù)制。而當(dāng)設(shè)定溫度改變后,雙鏈DNA得到了復(fù)制。溫度改變的大致思路是______。(4)實(shí)驗(yàn)4:PCR技術(shù)與電泳鑒定結(jié)合進(jìn)行DNA測(cè)序。以待測(cè)序的DNA鏈作為模板鏈,使用3′TATA……ATGCGCA-5′末端結(jié)合了高靈敏度檢測(cè)化合物X的DNA單鏈序列作為引物,在第1次實(shí)驗(yàn)中,用dNTP進(jìn)行反應(yīng)。第2次實(shí)驗(yàn),在第1次實(shí)驗(yàn)使用上述dNTP的基礎(chǔ)上,將反應(yīng)混合物分為四個(gè)試管,分別加入四種雙脫氧三磷酸核苷酸即ddNTP,即核苷酸在2、3號(hào)都脫氧(ddATP、ddCTP、ddTTP、ddGTP,結(jié)構(gòu)見(jiàn)圖4),每個(gè)試管只加一種。第1次與第2次實(shí)驗(yàn)四支試管,在經(jīng)過(guò)相同的溫度變化循環(huán)后,對(duì)反應(yīng)溶液進(jìn)行了適當(dāng)?shù)奶幚恚谷康腄NA以單鏈DNA的形式存在。使用能區(qū)分開(kāi)一個(gè)堿基長(zhǎng)度差異的凝膠電泳法對(duì)含有化合物X的單鏈DNA進(jìn)行分析,獲得了如圖5所示的結(jié)果。①ddNTP一旦參與聚合反應(yīng),則DNA單鏈延伸即終止,原因是______。②請(qǐng)根據(jù)下圖寫(xiě)出模板鏈堿基序列:______16.鹽芥是十字花科鹽芥屬植物,因生長(zhǎng)于農(nóng)田區(qū)的鹽漬化土壤而得名。為研究鹽芥iTS基因在植物逆境脅迫應(yīng)答中的重要作用,科研人員做了一系列研究。(1)取待測(cè)鹽芥組織裂解破碎,進(jìn)行DNA提取和純化,得到待測(cè)鹽芥基因組DNA。該過(guò)程常用的試劑有EDTA、SDS、NaCl、酒精等。在研磨液中加入NaCl的目的是_____________;純化DNA時(shí)可使用酒精,是因?yàn)開(kāi)____________________________。(2)為了特異性擴(kuò)增iTS基因序列,需根據(jù)_____________設(shè)計(jì)特異性引物。在反應(yīng)體系中加入相應(yīng)物質(zhì)和原料后,將PCR儀的溫度設(shè)定為:變性94℃(30s)、復(fù)性58℃(30s)、延伸72℃(40s)?!把由臁钡臏囟仍O(shè)定為72℃,是因?yàn)樵摐囟认耞____________。若iTS基因的數(shù)量為a個(gè),上游引物數(shù)∶下游引物數(shù)=1∶50,該體系擴(kuò)增進(jìn)行5輪循環(huán)后,上游引物剛好耗盡,則上游引物的數(shù)量等于_____________條。(3)用限制酶M切割某DNA分子,過(guò)程如圖1所示,其中虛線部分為鹽芥iTS基因。圖1中的DNA分子上限制酶M的切割位點(diǎn)有_____________個(gè),它能夠特異性識(shí)別的序列是_____________,下圖2中能與iTS基因進(jìn)行重組的Ti質(zhì)粒是_____________。(所示堿基序列為不同載體中方框內(nèi)的序列)(4)將獲得的重組質(zhì)粒通過(guò)____________法導(dǎo)入大豆愈傷組織中,最終獲得轉(zhuǎn)基因大豆植株,iTS基因能否在大豆植株體內(nèi)維持和表達(dá)其遺傳特性的關(guān)鍵是____________。(5)為驗(yàn)證iTS基因能提高大豆的耐鹽性,研究人員進(jìn)行了以下實(shí)驗(yàn),結(jié)果如下表所示。大豆類(lèi)型處理方式葉片中葉綠素含量根部細(xì)胞滲透壓野生型大豆0.15mol/L的NaCl溶液處理低低轉(zhuǎn)iTS基因大豆高高綜合上述研究,iTS基因能提高植物耐鹽性的機(jī)理是_______________________________。參考答案:1.A【分析】RCR全稱為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一項(xiàng)在生物體外復(fù)制特定DNA的核酸合成技術(shù)。原理:DNA復(fù)制?!驹斀狻緼、PCR儀實(shí)質(zhì)上就是一臺(tái)能自動(dòng)調(diào)控溫度的儀器,但在使用時(shí)需根據(jù)擴(kuò)增的DNA片段以及引物的情況人工設(shè)定合適的溫度,用于完成DNA的擴(kuò)增,A正確;B、10倍緩沖液中不包含dNTP,B錯(cuò)誤;C、為避免外源DNA等因素的污染,PCR實(shí)驗(yàn)中使用的微量離心管、槍頭、蒸餾水等在使用前都必須進(jìn)行高壓滅菌處理,移液器不需要高壓蒸汽滅菌,C錯(cuò)誤;D、電泳時(shí),電泳緩沖液以沒(méi)過(guò)凝膠1mm為宜,D錯(cuò)誤。故選A。2.D【分析】PCR技術(shù):(1)概念:PCR全稱為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一項(xiàng)在生物體外復(fù)制特定DNA的核酸合成技術(shù)。(2)原理:DNA復(fù)制。(3)前提條件:要有一段已知目的基因的核苷酸序列以便合成一對(duì)引物。(4)條件:模板DNA、四種脫氧核苷酸、一對(duì)引物、熱穩(wěn)定DNA聚合酶(Taq酶)。(5)過(guò)程:①高溫變性:DNA解旋過(guò)程;②低溫復(fù)性:引物結(jié)合到互補(bǔ)鏈DNA上;③中溫延伸:合成子鏈。PCR擴(kuò)增中雙鏈DNA解開(kāi)不需要解旋酶,高溫條件下氫鍵可自動(dòng)解開(kāi)?!驹斀狻緼、③過(guò)程為變性,變性過(guò)程使用90~95℃的高溫處理是為了讓目的基因的雙鏈解開(kāi),充分變性,A正確;B、⑤過(guò)程為延伸,延伸過(guò)程使用70~75℃的溫度處理既可以防止DNA變性,還能促進(jìn)子鏈的延伸,B正確;C、④過(guò)程為復(fù)性,復(fù)性過(guò)程使用55℃的溫度處理,使兩種引物通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)與兩條單鏈DNA結(jié)合,C正確;D、RNA中含有U,DNA中不含有U,含有T,D錯(cuò)誤。故選D。3.B【分析】PCR是利用DNA在體外攝氏95°高溫時(shí)變性會(huì)變成單鏈,低溫(經(jīng)常是60°C左右)時(shí)引物與單鏈按堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則結(jié)合,再調(diào)溫度至DNA聚合酶最適反應(yīng)溫度(72°C左右),DNA聚合酶沿著磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互補(bǔ)鏈?;诰酆厦钢圃斓腜CR儀實(shí)際就是一個(gè)溫控設(shè)備,能在變性溫度,復(fù)性溫度,延伸溫度之間很好地進(jìn)行控制?!驹斀狻緼、PCR是體外進(jìn)行DNA復(fù)制,以半保留復(fù)制為原理,為了維持反應(yīng)的穩(wěn)定,反應(yīng)需要在緩沖液中進(jìn)行,A正確;B、耐高溫的DNA聚合酶只能從引物的3'端開(kāi)始連接脫氧核苷酸,B錯(cuò)誤;C、反應(yīng)過(guò)程中的每一輪循環(huán)依次包括變性(高溫解旋)、復(fù)性(引物結(jié)合)、延伸(子鏈延伸)三步,C正確;D、常采用瓊脂糖凝膠電泳來(lái)鑒定PCR的產(chǎn)物,按相對(duì)分子質(zhì)量大小分離DNA的凝膠電泳技術(shù),D正確。故選B。4.D【分析】PCR全稱為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一項(xiàng)在生物體外復(fù)制特定的DNA片段的核酸合成技術(shù),利用的原理是DNA復(fù)制,需要條件有模板DNA、四種脫氧核苷酸、一對(duì)引物、熱穩(wěn)定DNA聚合酶(Taq酶),過(guò)程包括:①高溫變性:DNA解旋過(guò)程(PCR擴(kuò)增中雙鏈DNA解開(kāi)不需要解旋酶,高溫條件下氫鍵可自動(dòng)解開(kāi));②低溫復(fù)性:引物結(jié)合到互補(bǔ)鏈DNA上;③中溫延伸:合成子鏈?!驹斀狻緼、RT-PCR技術(shù)是將RNA的反轉(zhuǎn)錄和cDNA的聚合酶鏈?zhǔn)綌U(kuò)增(PCR)相結(jié)合的技術(shù),利用RT酶PCR技術(shù),獲取S蛋白基因時(shí),需加入逆轉(zhuǎn)錄酶、Taq酶,A正確;B、引物與模板鏈的3'端堿基互補(bǔ)配對(duì),故引物1、引物2、引物7和引物8不合適,擴(kuò)增得到的RBD蛋白基因也應(yīng)該含有限制酶的酶切位點(diǎn),故引物3和引物6不合適,故選引物4和引物5,B正確;C、PCR的產(chǎn)物可通過(guò)電泳鑒定,設(shè)置如下:1號(hào)泳道為標(biāo)準(zhǔn)(Marker),2號(hào)泳道是以RBD蛋白基因片段為材料做的陽(yáng)性對(duì)照組,3號(hào)泳道為實(shí)驗(yàn)組,C正確;D、質(zhì)粒上沒(méi)有SmaⅠ酶切位點(diǎn),且若使用EcoRⅠ酶切,易造成目的基因和質(zhì)粒自身環(huán)化,故應(yīng)該選擇BamHⅠ和HindⅢ,D錯(cuò)誤。故選D。5.D【分析】PCR全稱為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一項(xiàng)在生物體外復(fù)制特定DNA的核酸合成技術(shù)。熒光定量PCR技術(shù)可定量檢測(cè)樣本中某種DNA含量的原理是在PCR體系中每加入一對(duì)引物的同時(shí)加入一個(gè)與某條模板鏈互補(bǔ)的熒光探針,當(dāng)耐高溫的DNA聚合酶催化子鏈延伸至探針處,會(huì)水解探針,使熒光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)接收到熒光信號(hào),即每擴(kuò)增一次,就有一個(gè)熒光分子生成,實(shí)現(xiàn)了熒光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物的形成完全同步?!驹斀狻緼、細(xì)胞內(nèi)DNA的復(fù)制時(shí),引物是通過(guò)RNA聚合酶合成的RNA鏈,而PCR反應(yīng)中所需的引物是人工合成的DNA或RNA鏈,A錯(cuò)誤;B、一個(gè)初始DNA分子經(jīng)過(guò)4次循環(huán)后,得到8個(gè)等長(zhǎng)的DNA分子,B錯(cuò)誤;C、Ct值越小,說(shuō)明所需循環(huán)的次數(shù)越少,可以理解為樣本中的病毒含量相對(duì)較高,越容易被檢測(cè)到,而Ct值越高,說(shuō)明所需循環(huán)的次數(shù)越多,檢測(cè)到時(shí)需要更多的時(shí)間與循環(huán),提示樣本中病毒的含量相對(duì)較少,即新冠病毒含量越少,Ct值越高,新冠病毒含量越多,Ct值越低,C錯(cuò)誤;D、題干中提出“加入一個(gè)與某條模板鏈互補(bǔ)的熒光探針”,并且“每擴(kuò)增一次,就有一個(gè)熒光分子生成”,因此反應(yīng)最終的熒光強(qiáng)度與起始狀態(tài)模板DNA含量呈正相關(guān),D正確。故選D。6.D【分析】1.PCR全稱為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一項(xiàng)在體外復(fù)制特定的DNA的核酸合成技術(shù)。2.原理:DNA復(fù)制。3.條件:模板DNA、四種脫氧核苷酸、引物、熱穩(wěn)定DNA聚合酶(Tag酶)?!驹斀狻緼、圖示環(huán)節(jié)為引物與模板堿基互補(bǔ)配對(duì),表示的是復(fù)性環(huán)節(jié),復(fù)性的上一環(huán)節(jié)為變性,復(fù)性的溫度比變性的溫度低,A正確;B、在PCR擴(kuò)增中,脫氧核苷酸只能連接在3'端,所以dNTP作為擴(kuò)增的原料會(huì)依次連接到3'端,B正確;C、Tag酶催化形成磷酸二酯鍵,磷酸二酯鍵是相鄰的兩個(gè)脫氧核苷酸之間形成的,C正確;D、由于兩個(gè)引物均不在該片段的端點(diǎn),因此一個(gè)循環(huán)后,得到的兩個(gè)DNA片段中脫氧核苷酸的數(shù)量不一定相同,D錯(cuò)誤。故選D。7.C【分析】PCR技術(shù)的條件:模板DNA、四種脫氧核苷酸、一對(duì)引物、熱穩(wěn)定DNA聚合酶(Taq酶);PCR的操作過(guò)程:①高溫變性:DNA解旋過(guò)程(PCR擴(kuò)增中雙鏈DNA解開(kāi)不需要解旋酶,高溫條件下氫鍵可自動(dòng)解開(kāi));低溫復(fù)性:引物結(jié)合到互補(bǔ)鏈DNA上;③中溫延伸:合成子鏈?!驹斀狻緼、新冠病毒的遺傳物質(zhì)是RNA,因此,檢測(cè)新冠病毒時(shí),需加入逆轉(zhuǎn)錄酶將新冠病毒RNA轉(zhuǎn)化為cDNA,A正確;B、PCR技術(shù)中每個(gè)循環(huán)均包括變性、復(fù)性(引物和模板結(jié)合)、延伸3個(gè)階段,一個(gè)循環(huán)后DNA數(shù)量增加一倍,B正確;C、Ct值越大表示被檢測(cè)樣本中病毒數(shù)目越少,患者危險(xiǎn)性更低,C錯(cuò)誤;D、若樣本被污染,RNA酶將病毒RNA降解,則逆轉(zhuǎn)錄無(wú)法得到相應(yīng)DNA,檢測(cè)結(jié)果可能為陰性,D正確。故選C。8.ABD【分析】PCR全稱為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一項(xiàng)在生物體外復(fù)制特定DNA的核酸合成技術(shù),該技術(shù)的原理是DNA復(fù)制,實(shí)現(xiàn)的前提條件是要有一段已知目的基因的核苷酸序以便合成一對(duì)引物,其他的條件有模板DNA、四種脫氧核苷酸、一對(duì)引物、熱穩(wěn)定DNA聚合酶(Taq酶)。PCR過(guò)程:①高溫變性:DNA解旋過(guò)程(PCR擴(kuò)增中雙鏈DNA解開(kāi)不需要解旋酶,高溫條件下氫鍵可自動(dòng)解開(kāi));②低溫復(fù)性:引物結(jié)合到互補(bǔ)鏈DNA上;③中溫延伸:合成子鏈?!驹斀狻緼、由分析可知,PCR的原理是DNA復(fù)制,該過(guò)程中解旋和復(fù)制不是同時(shí)進(jìn)行的,A錯(cuò)誤;B、PCR的過(guò)程主要包括高溫變性→低溫復(fù)性→中溫延伸,可見(jiàn)該過(guò)程中不是溫度逐漸降低,B錯(cuò)誤;C、PCR技術(shù)擴(kuò)增時(shí),一個(gè)DNA分子經(jīng)過(guò)n輪復(fù)制產(chǎn)生的子代DNA數(shù)目為2n個(gè),其中的單鏈數(shù)目為2(n+1)個(gè),每個(gè)子鏈的延伸都需要引物,即除了兩條最初的模板鏈中沒(méi)有引物,因此該過(guò)程中共需引物2n-1對(duì),C正確;D、PCR過(guò)程中的引物和原料是一次性添加的,不需要補(bǔ)充,D錯(cuò)誤。故選ABD。9.D【分析】多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增DNA片段:PCR原理:在解旋酶作用下,打開(kāi)DNA雙鏈,每條DNA單鏈作為母鏈,以4中游離脫氧核苷酸為原料,合成子鏈,在引物作用下,DNA聚合酶從引物3'端開(kāi)始延伸DNA鏈,即DNA的合成方向是從子鏈的5'端向3'端延伸的。實(shí)際上就是在體外模擬細(xì)胞內(nèi)DNA的復(fù)制過(guò)程?!驹斀狻緼、PCR技術(shù)中DNA單鏈延伸的方向是沿著引物的5'端向3'端延伸的,據(jù)此可分析,PCR1過(guò)程中的產(chǎn)物AB是依賴引物a和引物b擴(kuò)增的結(jié)果,A正確;B、根據(jù)突變位點(diǎn)的產(chǎn)生可推知,引物c和引物b上均含有與模板鏈不能互補(bǔ)的堿基,B正確;C、①過(guò)程是雙螺旋解開(kāi)的過(guò)程,即氫鍵斷裂可通過(guò)先加熱至90~95℃完成,而后再冷卻至55~60℃使氫鍵形成,為子鏈的延伸做準(zhǔn)備,C正確;D、②過(guò)程為子鏈延伸的過(guò)程,該過(guò)程需要利用AB上鏈和CD下鏈之間的互補(bǔ)配對(duì)實(shí)現(xiàn)子鏈的延伸過(guò)程,D錯(cuò)誤。故選D。10.D【分析】實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)中,TaqDNA聚合酶有兩個(gè)作用,一是形成子鏈的磷酸二酯鍵,二是水解探針,破壞磷酸二酯鍵;破壞探針導(dǎo)致熒光出現(xiàn),Ct值越大,即是熒光強(qiáng)度越大,說(shuō)明樣品中特定DNA序列的含量越多?!驹斀狻緼、因?yàn)橐锏淖饔檬鞘笵NA聚合酶能夠從引物的3'端開(kāi)始連接脫氧核苷酸,從圖中引物1的方向可以分析出,R端是5'端,A錯(cuò)誤;B、該反應(yīng)體系中并未加入ATP,但新鏈的合成需要消耗能量,解旋的能量來(lái)自于高溫,聚合的能量來(lái)自于原料,B錯(cuò)誤;C、在該反應(yīng)中TaqDNA聚合酶有兩個(gè)作用,一是形成子鏈的磷酸二酯鍵,二是水解探針,破壞磷酸二酯鍵,C錯(cuò)誤;D、Ct值越小,達(dá)到熒光閾值所經(jīng)歷的循環(huán)次數(shù)越少,說(shuō)明樣品中特定DNA序列的含量越多,D正確。故選D。11.B【分析】PCR原理:在高溫作用下,打開(kāi)DNA雙鏈,每條DNA單鏈作為母鏈,以4種游離脫氧核苷酸為原料,合成子鏈,在引物作用下,DNA聚合酶從引物3'端開(kāi)始延伸DNA鏈,即DNA的合成方向是從子鏈的5'端向3'端延伸的。實(shí)際上就是在體外模擬細(xì)胞內(nèi)DNA的復(fù)制過(guò)程。DNA的復(fù)制需要引物,其主要原因是DNA聚合酶只能從3′端延伸DNA鏈。【詳解】A、過(guò)程②為PCR反應(yīng),需要在一定的添加Mg2+的緩沖液中才能進(jìn)行,需提供模板DNA、分別與兩條模板鏈結(jié)合的引物、4種脫氧核苷酸和耐高溫的DNA聚合酶等,A正確;B、兩個(gè)反應(yīng)系統(tǒng)中各自形成兩種DNA分子,但由于引物1和引物4形成兩個(gè)與原DNA相同的DNA分子,所以含有引物1和4的DNA屬于同一種DNA,故總共形成3種DNA分子,B錯(cuò)誤;C、過(guò)程④獲得的雜交DNA有2種,一種3′端為單鏈,一種5′端為單鏈,5′端為單鏈的雜交DNA為所需DNA,C正確;D、過(guò)程⑤是延伸過(guò)程,該過(guò)程使用耐高溫的DNA聚合酶進(jìn)行催化,不需要引物,D正確。故選B。12.D【分析】用PCR方法擴(kuò)增目的基因時(shí),要有一段已知目的基因的核苷酸序列,以便根據(jù)這一序列合成引物(兩種)。引物與模板鏈結(jié)合后,耐高溫的DNA聚合酶使子鏈從引物的3'端延伸?!驹斀狻緼、變性是使DNA雙鏈解旋,需要較高溫度;復(fù)性目的是使兩種引物通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)與兩條DNA單鏈結(jié)合,需要溫度較低,延伸的溫度必須大于復(fù)性溫度,而小于變性溫度,A正確;B、設(shè)計(jì)引物時(shí),需要避免引物之間形成堿基互補(bǔ)配對(duì)而造成引物自連,B正確;C、復(fù)性的目的是使兩種引物通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)與兩條DNA單鏈結(jié)合,因此復(fù)性溫度過(guò)高可能引起兩種引物不能與兩條DNA單鏈結(jié)合,進(jìn)而導(dǎo)致PCR反應(yīng)得不到任何擴(kuò)增產(chǎn)物,C正確;D、DNA復(fù)制為半保留復(fù)制,第四輪循環(huán)即DNA復(fù)制4次,共形成24=16個(gè)DNA分子,其中含有最初模板鏈的2個(gè)DNA分子含有引物A或引物B,其余14個(gè)DNA分子均含有引物A和引物B,所以第四輪循環(huán)產(chǎn)物中同時(shí)含有引物A和引物B的DNA片段所占的比率為14/16=7/8,D錯(cuò)誤。故選D。13.(1)溶解DNA二苯胺(2)序列數(shù)據(jù)庫(kù)CaMV35S的引物設(shè)計(jì)不科學(xué),原因是引物太短、特異性弱,并且兩個(gè)引物之間會(huì)互補(bǔ)結(jié)合待測(cè)大豆基因組DNATaq(熱穩(wěn)定DNA聚合)4種脫氧核苷酸Taq酶活性較高引物與模板DNA的結(jié)合(3)瓊脂糖凝膠電泳(或電泳)非轉(zhuǎn)基因不可信的【分析】1、DNA粗提取和鑒定的原理:(1)DNA的溶解性:DNA和蛋白質(zhì)等其他成分在不同濃度NaCl溶液中溶解度不同;DNA不溶于酒精溶液,但細(xì)胞中的某些蛋白質(zhì)溶于酒精。(2)DNA的鑒定:在沸水浴的條件下,DNA遇二苯胺會(huì)被染成藍(lán)色。2、PCR技術(shù):概念:PCR全稱為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一項(xiàng)在生物體外復(fù)制特定DNA的核酸合成技術(shù)。原理:DNA復(fù)制。前提條件:要有一段已知目的基因的核苷酸序以便合成一對(duì)引物。條件:模板DNA、四種脫氧核苷酸、一對(duì)引物、熱穩(wěn)定DNA聚合酶(Taq酶)。過(guò)程:高溫變性:DNA解旋過(guò)程(PCR擴(kuò)增中雙鏈DNA解開(kāi)不需要解旋酶,高溫條件下氫鍵可自動(dòng)解開(kāi));低溫復(fù)性:引物結(jié)合到互補(bǔ)鏈DNA上;中溫延伸:合成子鏈?!驹斀狻浚?)DNA不溶于水,不溶于酒精,但在2mol/LNaCl溶液中溶解度較高,故在研磨液中加入NaCl的目的是溶解DNA。提取到的DNA可以用二苯胺試劑鑒定。(2)①可從序列數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取常見(jiàn)基因的信息,故在確定擴(kuò)增對(duì)象后,從序列數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得待擴(kuò)增基因序列,以此為依據(jù)可設(shè)計(jì)引物。CaMV35S的引物設(shè)計(jì)不科學(xué),原因是引物太短,有可能在模板上存在許多能結(jié)合的部位,特異性弱;并且兩個(gè)引物之間不能有大量互補(bǔ)序列,否則復(fù)性時(shí)兩種引物會(huì)結(jié)合,降低引物與模板結(jié)合的概率。②要測(cè)定某大豆基因組中是否有特定的基因,模板要選待測(cè)大豆基因組DNA。延伸是在Taq酶的作用下,以4種脫氧核苷酸為原料延伸子鏈,“延伸”的溫度設(shè)定為72℃,是因?yàn)樵摐囟认耇aq酶活性較高。在設(shè)定的PCR體系下可以特異性擴(kuò)增目標(biāo)DNA片段,主要是因?yàn)榧尤肓伺c特定部位結(jié)合的引物,引物可以通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)特異性結(jié)合到模板DNA的相應(yīng)位置。(3)擴(kuò)增產(chǎn)物DNA可采用瓊脂糖凝膠電泳的方法鑒定。據(jù)圖2初步判斷,圖中沒(méi)有180的片段,因此該大豆并未擴(kuò)增出NOS終止子,表明其基因組中沒(méi)有NOS終止子,故為非轉(zhuǎn)基因大豆。據(jù)圖3分析,lectin是內(nèi)源基因,每個(gè)大豆都應(yīng)該有的基因,但是不僅待測(cè)樣本沒(méi)擴(kuò)增出來(lái),第2組普通大豆也沒(méi)有擴(kuò)增出來(lái),表明實(shí)驗(yàn)的某環(huán)節(jié)出現(xiàn)問(wèn)題。比如:提取DNA的環(huán)節(jié)并未提取到DNA,PCR環(huán)節(jié)并沒(méi)有發(fā)揮擴(kuò)增的作用等,故由于圖3分析出的這些問(wèn)題,圖2的實(shí)驗(yàn)結(jié)果也不可信了。14.(1)信息傳遞吸煙者肺部細(xì)胞ACE2基因的表達(dá)顯著增加,其肺部細(xì)胞膜表面ACE2比不吸煙者肺部細(xì)胞膜表面ACE2多(2)溶酶體(3)逆轉(zhuǎn)錄酶RNA需要DNA雙鏈復(fù)制【分析】新型冠狀病毒(COVID-19)是一種單股正鏈RNA病毒,病毒外有包膜,這層包膜主要來(lái)源于宿主細(xì)胞膜,包膜還含有病毒自身的糖蛋白,其中糖蛋白S可與人體細(xì)胞表面的ACE2蛋白結(jié)合,從而使病毒識(shí)別并侵入宿主細(xì)胞?!驹斀狻浚?)新冠病毒的糖蛋白S可與人體細(xì)胞表面的ACE2蛋白結(jié)合體現(xiàn)了膜的信息傳遞功能;吸煙更容易感染新冠病毒,可能的原因是吸煙者肺部細(xì)胞ACF2基因的表達(dá)顯著增加,其肺部細(xì)胞膜表面ACE2比不吸煙者肺部細(xì)胞膜表面ACE2多。(2)溶酶體有多種水解酶,可將新冠病毒的包膜脫去;新冠病毒的遺傳物質(zhì)是RNA,據(jù)圖分析新冠病毒增殖的過(guò)程中遺傳信息的傳遞方向包括RNA的復(fù)制和翻譯過(guò)程,故可表示如下:。(3)圖丙中①過(guò)程是利用RNA逆轉(zhuǎn)錄得到DNA,因此需要逆轉(zhuǎn)錄酶催化;酶B能水解雜化雙鏈中的RNA,酶C的作用類(lèi)似于DNA聚合酶,起作用時(shí)需要以雜化雙鏈中的DNA為模板合成互補(bǔ)子鏈;PCR是體外擴(kuò)增DNA的過(guò)程,擴(kuò)增過(guò)程的原理是DNA雙鏈復(fù)制。15.(1)耐高溫的DNA聚合酶(或Taq酶)將游離的脫氧核苷酸鏈接到引物的3′端(2)引物-2(3)適當(dāng)降
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