液體檢測進(jìn)展

肺癌基因檢測新進(jìn)展目錄驅(qū)動(dòng)基因檢測對肺癌個(gè)體化治療的指導(dǎo)液體活檢基礎(chǔ)上的基因分型在肺癌診治中的應(yīng)用基于基因分型和基因組學(xué)特點(diǎn)的個(gè)體化醫(yī)療：

癌癥分子診斷領(lǐng)域的變革單個(gè)生物標(biāo)記物檢測：SangerDNA測序or

PyrosequencingRT-PCRFISHIHC多個(gè)熱點(diǎn)突變檢測：PCR-basedSNapShotPCR-basedMassArraySNPSequenom

高通量技術(shù):

SNP/CNVDNA芯片RNA芯片表型基因調(diào)節(jié)下一代基因測序：全基因組或外顯子組測序（DNA）全基因組或靶向轉(zhuǎn)錄測序（RNA）顯型測序LiTH,etal.JClinOncol2013.“從單基因到多基因”的動(dòng)態(tài)檢測變革能更充分地利用有限的腫瘤標(biāo)本獲得更多的信息指導(dǎo)個(gè)體化治療——能更充分地利用有限的腫瘤標(biāo)本獲得更多的信息指導(dǎo)個(gè)體化治療腺癌鱗癌TheCancer

GenomeAtlas

Research

Network,

Nature,

2012,2014.腺癌的全基因組分析TheCancerGenomeAtlasResearchNetwork，Nature.

2012Sep27;489(7417):519-25.PabloPMetal,ClinCancerRes.2012

;18(9):2443-51.CirielloGetal,NatGenet.2013;45(10):1127-1133.

晚期NSCLC鱗癌的驅(qū)動(dòng)基因肺癌治療從基于臨床、病理特點(diǎn)到基因分型的治療變革PresentedByEnriquetaFelipat2015ELCC越來越多的已知驅(qū)動(dòng)基因進(jìn)入臨床應(yīng)用LCMC2.0KRAS AKT1EGFR ALK(FISH)BRAF MET(FISH)HER2

RET(FISHorNGS)PI3K

ROS1(FISHorNGS)MEK

PTEN(IHC*orNGS)NRAS

MET(IHC**)KrisMG,etal.WCLC2013PL03.07.*細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)138G4;**VentanaSP44.基于EGFR外的驅(qū)動(dòng)基因個(gè)體化治療顯示良好的治療療效新的驅(qū)動(dòng)基因仍在不斷被發(fā)現(xiàn)、認(rèn)識(shí)和深入研究Fernandez-CuestaL,etal.WCLC2013,O04.01.WCLCO04.01：CD74-NRG1，肺腺癌一種新的致癌融合基因在24例肺腺癌中的一種粘液性腫瘤中發(fā)現(xiàn)了一種新的易位，即CD74-NRG1(Nerurogelin1)這種融合基因還見于4/15(27%)的其他粘液性肺部腫瘤(與KRAS突變相互排斥)這種融合基因與ERBB3磷酸化相關(guān)，進(jìn)而激活PI3K-AKT通路(H2052)，顯示出致癌特征(NIH-3T3)ElzaC.deBruin,etal.Science2014;346:251-258NSCLC在空間和時(shí)間上基因的不穩(wěn)定性決定腫瘤異質(zhì)性和腫瘤耐藥模式的復(fù)雜性，實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)地進(jìn)行多基因平行檢測，有助于實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)治療Annu.Rev.Pathol.Mech.Dis.2013腫瘤異質(zhì)性使根據(jù)初診時(shí)標(biāo)本指導(dǎo)后續(xù)治療可能產(chǎn)生偏倚實(shí)時(shí)監(jiān)測耐藥的不同機(jī)制對指導(dǎo)后續(xù)治療的重要性。多基因平行檢測基礎(chǔ)上的靶向治療研究模式ClinCancerRes2015;21:1514–24.目錄驅(qū)動(dòng)基因檢測對肺癌個(gè)體化治療的指導(dǎo)液體活檢基礎(chǔ)上的基因分型在肺癌診治中的應(yīng)用精準(zhǔn)治療時(shí)代肺癌組織診治的困境與挑戰(zhàn)腫瘤組織的異質(zhì)性？對耐藥的有效檢測？怎樣實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)、定量、多基因的平行檢測？血液檢測應(yīng)運(yùn)而生Crowley,E.etal.Nat.Rev.Clin.Oncol.2013,10:472–484SourceofcfDNA--tumornecrosis/apoptosis--tumorexosome/microvesicles--normaltissueapoptosis--inflammatorycellscfDNA的特點(diǎn)與優(yōu)勢

Real-timemonitoringRepresentingsummationofspatialheterogeneitycf-DNAEGFR敏感性突變檢測的臨床應(yīng)用-

具有高的特異性和療效預(yù)測的準(zhǔn)確性O(shè)SBai,etal.J.Clin.Oncol:2009MokT,etal.2015CCR，

敏感性為82%;特異性為92%，血漿、組織檢測的一致性78%敏感性為76%；特異性為96%，組織、血漿檢測一致性88%EGFR突變+(血漿)EGFR突變-(血漿)總數(shù)EGFR突變+(組織)692190EGFR突變-(組織)5129134總數(shù)74150224

TumorCasenumberEGFR+EGFR-plasmaEGFR+631679EGFR-14137151Casenumber77153230*一致性敏感性特異性PPVNPVn/N(%)95%CIn/N(%)95%CIn/N(%)95%CIn/N(%)95%CIn/N(%)95%CI亞太(n=1687)1310/1687(77.7)75.6,

79.6343/692(49.6)45.8,

53.4967/995(97.2)96.0,

98.1343/371(92.5)89.3,

94.9967/1316(73.5)71.0,

75.8俄羅斯(n=894)767/894(85.8)83.3,

88.033/109(30.3)21.8,

39.8734/785(93.5)91.5,

95.133/84(39.3)28.8,

50.5734/810(90.6)88.4,

92.5IGNITstudyHanBaohui,etal.2015

ELCC

96O.MokT,etal.2013WCLCO01.06.cf-DNAEGFR敏感檢測的臨床應(yīng)用-動(dòng)態(tài)監(jiān)測FASTACT-2:在基線期、第3周期（C3）以及疾病進(jìn)展時(shí)（PD）進(jìn)行連續(xù)血漿樣本分析，監(jiān)測血漿游離DNA和pEGFR突變DNA的動(dòng)態(tài)定量變化血漿游離DNA以及EGFR突變特異性DNA在C3降低，并在治療進(jìn)展時(shí)恢復(fù)ORAL16.06:QuantificationofMutantAllelesinctDNA–Tongtong

AnMedian

PFSMedian

OSPlasma

EGFR

WT6.7m23.8mPlasma

EGFR

MT

Low11.1m29.3mPlasma

EGFR

MT

High15.4m44.5mcf-DNAEGFR敏感檢測的臨床應(yīng)用-定量檢測YangX,etal.Oncotarget，2015,accepted對耐藥性突變的預(yù)測：TIGER-X研究

Rociletinib(所有劑量)治療血漿T790M+患者的最佳療效100806040200-20-40-60-80-100500mgbidHBr625mgbidHBr750mgbidHBr1000mgbidHbr正在進(jìn)行之中長徑總和自基線的變化(%)SequistLV,etal.2015ASCO;oralabstract8001.500mg625mg750mg1000mg總計(jì)N3049653147ORR(%)5755496753DCR(%080848210082組織全部陽性陰性組織不足血漿陽性1552312190陰性3712857全部1923520247當(dāng)收集到不充分組織標(biāo)本時(shí)，血漿檢測可發(fā)現(xiàn)和組織檢測同樣多的T790M+患者T790組織陰性血漿陽性并非假陽性：后續(xù)檢測的7個(gè)樣本中，5個(gè)樣本確認(rèn)了血漿T790M組織參考：T790m活化突變陽性一致比例81%(155/192)87%(193/221)Gefitinib(n=81)Placebo(n=61)T790Mmutation-positive(n=142)MedianPFS,months4.65.3HRa(95%CI)=0.97(0.67,1.42);p=0.88IMPRESS研究:cfDNA中T790M突變陽性患者的無病進(jìn)展生存時(shí)間T790MctDNAstatusassessedatbaselineCI,confidenceinterval;ctDNA,circulatingfreetumor-derivedDNA;HR,hazardratio;PFS,progression-freesurvivalPatientsatrisk:

Gefitinib 81 64 50 19 8 4 2 0

Placebo 61 46 40 18 8 1 1 01.00.90.80.70.60.50.40.20.30.10.00281014ProbabilityofPFSTimeofrandomization(months)Gefitinib(n=81)Placebo(n=61)4612aPrimaryCoxanalysiswithcovariatesAHR<1impliesalowerriskofprogressionwithgefitinibT790M突變陽性患者化療有更好效價(jià)比Gefitinib(n=46)Placebo(n=59)T790Mmutation-negative(n=105)MedianPFS,months6.75.4HRa(95%CI)=0.67(0.43,1.03);p=0.07IMPRESSStudy:cfDNA中T790M陰性患者的無病進(jìn)展生存時(shí)間T790MctDNAstatusassessedatbaselineCI,confidenceinterval;ctDNA,circulatingfreetumor-derivedDNA;HR,hazardratio;PFS,progression-freesurvivalPatientsatrisk:

Gefitinib 46 43 37 20 16 7 4 0

Placebo 59 46 38 17 7 4 3 0aPrimaryCoxanalysiswithcovariatesAHR<1impliesalowerriskofprogressionwithgefitinib1.00.90.80.70.60.50.40.20.30.10.00281014ProbabilityofPFSTimeofrandomization(months)4612Gefitinib(n=46)Placebo(n=59)T790M突變陰性患者繼續(xù)TKIs聯(lián)合化療有延長PFS的趨勢Gefitinib說明書更新(ctDNA伴隨診斷）中國Gefitinib說明書更新(2015年2月13日cFDA已批準(zhǔn)更新)歐洲說明書更新(2014年9月)第4頁篩選入組：1.IV期肺腺癌；2.年齡18-75；3.PS0-2；4.血漿cf-DNA中EGFR經(jīng)ddPCR確定為突變型；5.提供組織標(biāo)本；6.有可測量病灶。收集血漿cf-DNA*（ddPCR法）收集組織標(biāo)本*（ARMS法）

EGFRM+

EGFR突變檢測吉非替尼

250mg/天每2個(gè)月收集外周血標(biāo)本直至PD*PD血漿cf-DNA基因檢測（ARMS法）回顧性前瞻性收集血漿標(biāo)本*，及組織標(biāo)本***為必須性，**為可選擇性一項(xiàng)評價(jià)吉非替尼在血漿游離DNA經(jīng)ddRCR確定的EGFR突變型晚期肺腺癌患者中作為一線治療的療效及安全性的開放、單臂、多中心臨床試驗(yàn)（BENEFITStudy)）N=178

T790MpositiveinctDNAEGFRsensitivmutationwithrareT790MclonesinctDNAClinicalprogression

ThirdgenerationTKIsPresentstrategypreventstrategyEGFR-TKIsEGFR-TKIsThirdgenerationTKIsThirdgenerationTKIs

preventstrategyEGFR-TKIsBloodmonitorBloodmonitorBloodmonitorBloodmonitorThirdgenerationTKIs

ThirdgenerationTKIs

展望一:cfDNA動(dòng)態(tài)檢測有助于對耐藥的應(yīng)對從治療到預(yù)防的轉(zhuǎn)變Naturemedicine

AcquiredEGFRC797Smutationmediatesresista