《生存分析醫(yī)學(xué)生》PPT課件

1、2020/7/6,1,引例 現(xiàn)用新舊兩種方法治療某癌病患者各100人，結(jié)果如下表，試評(píng)價(jià)其療效 表3新舊兩種方法治療某癌病 死亡人數(shù) 新法組 舊法組 RR 一年 16 15 1.01,二年 25 35 0.70,五年 40 80 0.50 *,2020/7/6,2,生存分析,2020/7/6,3,一、基本概念,生存時(shí)間（survival time)：疾病治療的預(yù)后情況，一方面看結(jié)局好壞，另一方面還要看出現(xiàn)這種結(jié)局所經(jīng)歷的時(shí)間長(zhǎng)短。所經(jīng)歷的時(shí)間稱為生存時(shí)間。 完全與不完全數(shù)據(jù) 一部分研究對(duì)象可觀察到死亡，從而得到準(zhǔn)確的生存時(shí)間，所提供的信息是完全的，稱為完全數(shù)據(jù)；另一部分病人由于失訪、意外事故、

2、或到觀察結(jié)束時(shí)仍存活等原因，無(wú)法知道確切的生存時(shí)間，它提供了不完全的信息，稱為不完全數(shù)據(jù)（截尾數(shù)據(jù)、刪失數(shù)據(jù):censor data）。,2020/7/6,4,始點(diǎn)終點(diǎn),2020/7/6,5,始點(diǎn)終點(diǎn),2020/7/6,6,生存分析(survival analysis)：生存時(shí)間一般是通過(guò)隨訪收集。不完全數(shù)據(jù)提供了部分信息。須要用專(zhuān)門(mén)的方法進(jìn)行統(tǒng)計(jì)處理，這類(lèi)統(tǒng)計(jì)方法起源于對(duì)壽命資料的統(tǒng)計(jì)分析，故稱為生存分析。,2020/7/6,7,“ 生存”的概念 生物生存 與死亡,儀器始使正常 與出現(xiàn)故障,疾病產(chǎn)生 與治愈,疾病治愈 與復(fù)發(fā),陰性 與陽(yáng)性,2020/7/6,8,截尾數(shù)據(jù)的處理,因?yàn)椴惶锰幚?/p>

3、截尾數(shù)據(jù)，很多臨床研究工作者常常將失訪或中止等原因造成的截尾數(shù)據(jù)在分析時(shí)拋棄。截尾數(shù)據(jù)提供的信息雖然是不完全的，但也很有價(jià)值，不應(yīng)隨便刪掉它。,2020/7/6,9,生存分析的主要內(nèi)容,第一，描述生存過(guò)程 研究生存時(shí)間的分布特點(diǎn)，估計(jì)生存率，生存曲線； 第二，比較生存過(guò)程（假設(shè)檢驗(yàn)） 對(duì)兩組或多組生存率進(jìn)行比較； 第三，影響生存時(shí)間的因素分析 了解影響生存過(guò)程的主要因素為改善預(yù)后提供指導(dǎo)。,2020/7/6,10,例在對(duì)資料進(jìn)行描述時(shí)： 5名癌癥患者存活時(shí)間（月） 6 10 14 20 20 n=5 平均生存時(shí)間, mean=18，median=,7 8+ 25 35 + 50 當(dāng)有截尾數(shù)據(jù)時(shí)

4、，?,2020/7/6,11,死亡概率(mortality probability),是指死于某時(shí)段內(nèi)的可能性大小.記為q，年死亡概率計(jì)算公式為： 某年內(nèi)死亡數(shù) q 某年年初人口數(shù) 若年內(nèi)有刪失，則分母用校正人口數(shù)： 校正人口數(shù)年初人口數(shù) 1/ 2 刪失數(shù),二、生存資料常計(jì)算的幾種率,2020/7/6,12,死亡概率（2）,死亡概率是指已活滿t時(shí)刻的個(gè)體，在此后一段時(shí)期內(nèi)（t至 ）死亡的可能性。死亡概率的計(jì)算公式為,2020/7/6,13,若t至 內(nèi)有截尾值，上式的死亡概率也偏低，可對(duì)分母加以調(diào)整，為： 如果很短，即 時(shí)，死亡概率為t時(shí)刻的瞬時(shí)死亡概率，或稱為危險(xiǎn)函數(shù)（hazard funct

5、ion, h(t)），其意義為剛剛活過(guò)t時(shí)刻的個(gè)體在t時(shí)刻死亡的概率。,2020/7/6,14,生存概率(survival probability),表示在某單位時(shí)段開(kāi)始時(shí)存活的個(gè)體到該時(shí)段結(jié)束時(shí)仍存活的可能性大小,記為p。年生存概率計(jì)算公式為： 活滿某一年人數(shù) p 1q 某年年初人口數(shù) 若年內(nèi)有刪失，則分母用校正人口數(shù)。,2020/7/6,15,若在t至 時(shí)段內(nèi)有截尾值，也應(yīng)計(jì)算調(diào)整生存概率 生存概率與死亡概率之間有以下關(guān)系: p=1-q,2020/7/6,16,生存率與生存函數(shù),累積生存概率，簡(jiǎn)稱生存率，是指病人經(jīng)過(guò)t個(gè)時(shí)間單位之后仍存活的概率。 若令s(t)為任意時(shí)刻t的生存率，T為生存

6、期，得s(t)=p(Tt) 0t ，稱s(t)為生存率函數(shù)，簡(jiǎn)稱生存函數(shù),2020/7/6,17,三、生存率估計(jì)（描述）,醫(yī)學(xué)研究中的生存資料分布常常不規(guī)則、不確定或未知分布，因而常用非參數(shù)法估計(jì)生存率。 根據(jù)樣本含量的大小可分別選擇 乘積極限估計(jì)法（小樣本時(shí)） 壽命表法（大樣本時(shí)）,2020/7/6,18,1.乘積限估計(jì)法 Product-limit method,簡(jiǎn)稱積限法或PL法,直接用概率乘法原理估計(jì)生存率，它是由統(tǒng)計(jì)學(xué)家Kaplan和Meier于1958年首先提出的,因此又稱為Kaplan-Meier法. 基本思想：將生存時(shí)間（包括截尾數(shù)據(jù)）逐個(gè)由小到大依次排列，并對(duì)其中的每個(gè)死亡點(diǎn)

7、進(jìn)行死亡概率、生存概率和生存率估計(jì)。 應(yīng)用條件：數(shù)據(jù)個(gè)數(shù)較少時(shí)。,2020/7/6,19,2.壽命表法（Life table method）,簡(jiǎn)稱LT法。 基本思想：隨訪時(shí)間劃分成若干個(gè)時(shí)間區(qū)間，t時(shí)刻的生存率為t時(shí)刻前各時(shí)間區(qū)間生存概率的乘積。 應(yīng)用條件：數(shù)據(jù)個(gè)數(shù)多，經(jīng)分組時(shí)應(yīng)用。,2020/7/6,20,3. Kaplan-meier法計(jì)算生存率,此法計(jì)算生存率時(shí)，先將每個(gè)個(gè)體的生存時(shí)間按照由小到大的順序排列，排序時(shí)若截尾值與非截尾值的觀察時(shí)間相同，則規(guī)定非截尾值小于截尾值，排在截尾值之前。 然后依次計(jì)算出各時(shí)段的死亡概率、生存概率，進(jìn)而計(jì)算出從觀察開(kāi)始至各時(shí)刻的生存率及其標(biāo)準(zhǔn)誤。,202

8、0/7/6,21,小樣本生存分析 Kaplan-Meier方法在SPSS中的實(shí)現(xiàn),生存狀態(tài)：1死亡，0截尾,2020/7/6,22,SPSS 軟件實(shí)現(xiàn)方法,FileOpen相應(yīng)數(shù)據(jù)文件 Analyze SurvivalKaplan-Meier Time(時(shí)間)Status Define event single value(1) Continue OK,2020/7/6,23,2020/7/6,24,選擇選項(xiàng),2020/7/6,25,2020/7/6,26,例1：某臨床試驗(yàn)對(duì)20名第III或第IV期黑色素瘤的患者進(jìn)行隨訪研究，截至研究期結(jié)束，記錄的生存資料見(jiàn)下表，試計(jì)算100周的生存率。,4.

9、大樣本壽命表法,2020/7/6,27,表1 20名第III或第IV期黑色素瘤的患者的治療后的生存時(shí)間（周）,2020/7/6,28,建立數(shù)據(jù)文件“生存分析.sav” 定義兩個(gè)變量： 反應(yīng)變量，即生存時(shí)間變量，“time” 分類(lèi)變量，即生存狀態(tài)變量，“status”,2020/7/6,29,AnalyzeSurvivalLife Tables.,2020/7/6,30,2020/7/6,31,本例100周生存率為53%。,2020/7/6,32,2020/7/6,33,三、生存過(guò)程的比較（假設(shè)檢驗(yàn)）,非參數(shù)方法: 對(duì)數(shù)秩檢驗(yàn) (log-rank test) 廣義Wilcoxon檢驗(yàn) 似然比（L

10、ikelihood ratio)檢驗(yàn),生存率組間比較實(shí)際上是對(duì)兩條或多條生存曲線的分布情況比較（齊性檢驗(yàn)）特點(diǎn)：檢驗(yàn)過(guò)程一般不顧及生存率，而是利用死亡數(shù)和死亡率函數(shù)作統(tǒng)計(jì)推斷,2020/7/6,34,應(yīng)用范圍,均為兩組或多組生存率比較的方法： 對(duì)數(shù)秩檢驗(yàn) Logrank test ：且近似服從 Weibull分布， 數(shù)值較小的失效時(shí)間所起的作用較大，（是SAS默認(rèn)的選項(xiàng)檢驗(yàn)方法）； 廣義Wilcoxon檢驗(yàn)：最適合數(shù)值較大的失效時(shí)間所起的作用較大。 似然比（Likelihood ratio)檢驗(yàn)：最適合生存資料近似服從指數(shù)分布。,2020/7/6,35,例題：22例非小細(xì)胞肺癌患者在不同日期經(jīng)隨機(jī)化分配到放療組和放化療聯(lián)合組，從緩解出院日開(kāi)始隨訪，隨訪時(shí)間（月）見(jiàn)下表，試比較放療和放化療聯(lián)合兩種治療方案的生存率曲線有無(wú)差別。 甲（放療組）：1，2，3，5，