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1、MicroPulser電穿孔儀操作手冊(cè)2018年12月27日1、 介紹(1)基本原理MicroPulser電穿孔儀用于細(xì)菌、酵母和其他眾多微生物的電擊轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)化時(shí),高壓電脈沖作用于懸浮在小體積高阻介質(zhì)中的樣品。本系統(tǒng)由一個(gè)脈沖發(fā)生器(pulse generator)模塊、一個(gè)電擊腔(shocking chamber)和一個(gè)裝有電極的電擊杯(cuvette)組成。樣本放置于電擊杯的電極之間。MicroPulser模塊包含一個(gè)電容器,將電容器充電至高電壓,然后模塊將電容器中的電流放電到試管中的樣品中。MicroPulser的電容放電電路產(chǎn)生具有指數(shù)衰減波形的電脈沖,如下圖。當(dāng)電容器放電至樣品時(shí),跨
2、越電極的電壓迅速上升至最大電壓(or峰值電壓,peak voltage;也稱為初始電壓,Vo),并隨時(shí)間(t)減小,如下式:其中=RC,為時(shí)間常數(shù),是脈沖長度的簡(jiǎn)便表達(dá)式。 R為電路電阻,單位為ohms(歐姆)。 C為電容,單位為microfarad(微法拉)。根據(jù)方程1,是電壓下降至峰值電壓1/e(37%)的時(shí)間。MicroPulser的內(nèi)部電路被設(shè)計(jì)以使E.coli、釀酒酵母及其他許多微生物可以得到最佳電穿孔,最佳轉(zhuǎn)化效率發(fā)生在大約5ms的時(shí)間常數(shù)內(nèi)。這些電穿孔條件是通過使用10微法拉電容器和將600歐姆電阻與樣品池并聯(lián)以及將30歐姆電阻與樣品池串聯(lián)來實(shí)現(xiàn)的。除時(shí)間常數(shù)外,電場(chǎng)強(qiáng)度是另一個(gè)
3、決定轉(zhuǎn)化效率的重要參數(shù)。電場(chǎng)強(qiáng)度E,是施加于電極間的電壓,公式為:其中,V為施加的電壓,d為電極間的距離,單位為cm。電場(chǎng)強(qiáng)度和細(xì)胞的尺寸(size)決定了橫貫每個(gè)細(xì)胞的電壓降,正是電壓降可能是電穿孔中電壓效應(yīng)的重要表現(xiàn)。30歐姆串聯(lián)電阻的目的是在發(fā)生電弧的情況下保護(hù)設(shè)備電路。在正常操作條件下,當(dāng)樣本在高電阻介質(zhì)中,電阻不會(huì)影響施加在樣本上的電壓。但是,當(dāng)樣本的電阻較低時(shí),電阻將極大地降低施加在樣品上的電壓。施加在樣品上的電壓的分壓降(fractional drop)由下式得到:當(dāng)Rsample為600歐姆,對(duì)于樣品就會(huì)有5%的電壓降(30/(30+600)=0.048)?;谶@個(gè)原因,當(dāng)樣品
4、溶液的電阻低于600歐姆時(shí),不應(yīng)進(jìn)行電穿孔試驗(yàn)。這包括培養(yǎng)基未徹底從細(xì)胞中去除的樣本,殘留有NaCl的DNA樣本或連接混合物。MicroPulser能夠測(cè)量樣本的電阻,若樣本介質(zhì)電阻過低則不會(huì)進(jìn)行操作。(2)儀器參數(shù)操作(Manipulation of instrument parameters)MicroPulser儀器的一些參數(shù)可以進(jìn)行設(shè)置以達(dá)到最大轉(zhuǎn)化效率,包括場(chǎng)強(qiáng)E,時(shí)間常數(shù),截?cái)嘀笖?shù)衰減脈沖的寬度。場(chǎng)強(qiáng)的設(shè)置可以有兩種方式進(jìn)行操作。一是,介于200-3000V電壓可以直接在儀器上設(shè)置,這是最容易控制的。改變電壓而保持其他條件不變是大多數(shù)電穿孔優(yōu)化程序的基礎(chǔ)。第二,使用不同電極間隙寬度
5、的電轉(zhuǎn)杯也是改變場(chǎng)強(qiáng)的一種方法。對(duì)于微生物的電穿孔,0.1和0.2cm間隙的電轉(zhuǎn)杯最常被使用。E.coli的電穿孔當(dāng)使用0.1cm電轉(zhuǎn)杯時(shí)通常使用1.8kV電壓(E=18kV/cm),而使用0.2cm電轉(zhuǎn)杯時(shí)使用2.5kV電壓(E=12.5kV/cm)。這些電穿孔條件作為預(yù)設(shè)程序內(nèi)置于MicroPulser中,分別位于細(xì)菌設(shè)置菜單中的Ec1(V=1.8kV)和Ec2(V=2.5kV)。另外,細(xì)菌設(shè)備菜單中的第三個(gè)程序Ec3的電壓為3.0kV(當(dāng)電轉(zhuǎn)杯為0.2cm時(shí)E=15kV/cm),我們發(fā)現(xiàn)可以得到比2.5kV更高的轉(zhuǎn)化效率。時(shí)間常數(shù)可以通過改變樣品的電阻而改變。樣品電阻的改變可以通過兩種方
6、式。一是,增加電穿孔介質(zhì)的鹽濃度或緩沖濃度會(huì)降低樣品的電導(dǎo),反之亦然,結(jié)果導(dǎo)致時(shí)間常數(shù)的改變。第二,電轉(zhuǎn)杯中樣品體積與樣品電阻呈反比,降低樣品體積會(huì)增加樣品電導(dǎo)。樣品體積對(duì)電導(dǎo)的影響在低電阻介質(zhì)中是最顯著的。這些影響因素將會(huì)在后面部分進(jìn)一步介紹。MicroPulser還包括一種在電壓大于600V時(shí)比預(yù)期時(shí)間常數(shù)更快截?cái)嘀笖?shù)衰減脈沖的方法。當(dāng)脈沖被MicroPulser終止時(shí),電壓只在樣品上作用指定長度的時(shí)間,可能在1.0 4.0 ms之間。下圖顯示了這種波形和真正的指數(shù)衰減脈沖的差異。2、 影響電穿孔的因素通過多年的研究,證實(shí)了微生物電穿孔的電條件(see Chang, et al., 199
7、2, and Nickoloff, 1995, for overviews as well as for protocols on electroporation of numerous species)。對(duì)大多數(shù)微生物而言,最佳電轉(zhuǎn)化發(fā)生在與E.coli和釀酒酵母所使用的電轉(zhuǎn)化條件相似的條件下,E.coli和釀酒酵母是當(dāng)今研究中最常使用的兩個(gè)物種。對(duì)于E.coli的電穿孔,文獻(xiàn)報(bào)道最常使用的條件是0.2cm電轉(zhuǎn)杯,40l細(xì)胞樣本,電壓2.5kV,時(shí)間5ms。對(duì)釀酒酵母,報(bào)告中最常使用的條件是0.2cm電轉(zhuǎn)杯,40l細(xì)胞樣品,1.5kV電壓和時(shí)間常數(shù)5ms。對(duì)許多細(xì)菌而言,如沙門氏菌屬(Sal
8、monella)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、幽門螺桿菌(Helicobacter)、包柔式螺旋體屬(Borrelia)、鏈球菌屬(Streptococcus)、乳球菌屬(Lactococcus)和腸球菌屬(Enterococcus),電穿孔條件與E.coli一樣。而對(duì)于其他的細(xì)菌,改變電場(chǎng)強(qiáng)度可以得到更高的電轉(zhuǎn)化效率。一個(gè)相似的案例可見于其他種屬的酵母。MicroPulser的設(shè)計(jì)可以精確施加E.coli和釀酒酵母獲得最佳轉(zhuǎn)化效率所需的脈沖參數(shù)。當(dāng)使用高阻樣本時(shí),時(shí)間常數(shù)被設(shè)置為5ms。對(duì)于這些微生物,MicroPulser預(yù)先設(shè)定了在0.1或0.2 cm的電擊杯中電穿孔大腸桿菌,
9、或在0.2或0.4 cm的電擊杯中電穿孔釀酒酵母時(shí)輸送正確電壓的程序。(1) 細(xì)胞生長(Cell Growth)對(duì)于大多數(shù)細(xì)菌而言,在對(duì)數(shù)生長期的早期或中期收獲細(xì)胞,可以得到最高的轉(zhuǎn)化效率。對(duì)于E.coli,當(dāng)細(xì)胞進(jìn)行穩(wěn)定期,轉(zhuǎn)化效率劇烈下降(Dower,1990)。相反,大多數(shù)酵母通常在對(duì)數(shù)生長的中期至晚期收獲細(xì)胞。對(duì)于釀酒酵母(S.cerevisiae),對(duì)數(shù)生長晚期的培養(yǎng)物相比早期的培養(yǎng)物,轉(zhuǎn)化效率提高了60倍(Becker and Guarente,1991)。獲取細(xì)胞的最佳生長期通常隨細(xì)胞種類而異。當(dāng)制備一種新的物種的感受態(tài)細(xì)胞時(shí),最好使用為同種屬而制定的程序。對(duì)所需考慮因素的建議和
10、常用的制備感受態(tài)細(xì)胞的方法在Dower et al(1992)和Trevors et al(1992)的文章中被詳細(xì)討論。(2) DNA大多數(shù)的電穿孔應(yīng)用是將質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)入細(xì)胞中,需要提及的是,幾乎任何形式的分子都可以通過電穿孔被導(dǎo)入細(xì)胞中,包括DNA、蛋白、糖類、小分子等。除了少數(shù)例外,當(dāng)導(dǎo)入自主復(fù)制質(zhì)粒時(shí),使用超螺旋質(zhì)粒進(jìn)行電穿孔可以提高轉(zhuǎn)化效率。但是,將整合入宿主基因組的質(zhì)粒當(dāng)使用線性化質(zhì)粒時(shí),轉(zhuǎn)化效率較高。例如,假絲酵母、畢赤酵母和四膜蟲使用線性質(zhì)粒比超螺旋質(zhì)粒效率更高。在E.coli和單核細(xì)胞增多性李斯特氏菌(Listeria monocytogenes)電穿孔轉(zhuǎn)化時(shí),使用松弛型環(huán)狀
11、質(zhì)粒(relaxed circular plasmid)僅比使用超螺旋質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化效率略低(Leonardo and Sedivy,1990,Park and Stewart,1990)。但是,在E.coli和Streptococcus pyogenes(釀膿鏈球菌)的電穿孔轉(zhuǎn)化時(shí),線性質(zhì)粒比環(huán)狀質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化效率低103-104倍(Shigekawa and Dower, 1988, Simon and Ferretti, 1991)。在大多數(shù)物種中,每mol數(shù)量的質(zhì)粒的電穿孔效率隨著質(zhì)粒大小的增加而降低,包括E. coli (Leonardo and Sedivy, 1990, Siguret
12、et al., 1994),Pseudomonas aeruginosa(假單胞菌屬)(Dennis and Sokol, 1995),和Streptococcus thermophilus(嗜熱鏈球菌屬)(Somkuti and Steinberg,1988)。但是,有些物種,包括Lactococcus lactis(乳球菌屬)(Holo and Nes,1995),Enterococcus faecalis(腸球菌屬)(Cruz-Rodz and Gilmore,1990)和Clostridium perfringens(產(chǎn)氣莢膜梭菌)(Allen and Blaschek,1990),轉(zhuǎn)
13、化效率似乎與質(zhì)粒大?。词垢哌_(dá)20-30Kb)無關(guān)。盡管微生物的轉(zhuǎn)化使用各種方法提取的質(zhì)粒都可以完成,但質(zhì)粒的純度是影響轉(zhuǎn)化效率的一個(gè)因素。未純化的小量制備的質(zhì)粒DNA的轉(zhuǎn)化效率明顯低于經(jīng)過各種方法純化的質(zhì)粒DNA。利用Bio-Rad Quantum matrix制備的質(zhì)粒與CsCl純化質(zhì)粒轉(zhuǎn)化效率相當(dāng)。 通常,對(duì)于所有種類的微生物,轉(zhuǎn)化頻率隨著DNA濃度的增加而增加。對(duì)于E.coli,轉(zhuǎn)化頻率(轉(zhuǎn)化子/活細(xì)胞)受DNA濃度影響的范圍在106(10 pg/ml to 7.5 g/ml),在這個(gè)范圍內(nèi),DNA濃度決定了細(xì)胞被轉(zhuǎn)化的概率。在較高的DNA濃度,高達(dá)80%的活細(xì)胞可被轉(zhuǎn)化(Dower
14、et al,1988)。因?yàn)楂@得的轉(zhuǎn)化子的數(shù)量是轉(zhuǎn)化頻率和細(xì)胞數(shù)量的產(chǎn)物,轉(zhuǎn)化效率(轉(zhuǎn)化子/ug DNA)在109-31010細(xì)胞/ml范圍內(nèi)隨細(xì)胞濃度增加而增加。因此,為了獲得高的轉(zhuǎn)化頻率(transformation frequency),請(qǐng)使用高的DNA濃度。為了獲得高的轉(zhuǎn)化效率(transformation efficiency),請(qǐng)使用高的細(xì)胞濃度(和低的DNA濃度以防止共轉(zhuǎn)化cotransformation)。在每個(gè)實(shí)例中,小的樣本體積(20-50l)允許經(jīng)濟(jì)地使用DNA和細(xì)胞(see Dower et al., 1988, for a detailed discussion of
15、 these factors)。(3) 電穿孔介質(zhì)(Electroporation Media)MicroPulser被設(shè)計(jì)以使用具有高阻介質(zhì)的樣本?;诖?,當(dāng)制備感受態(tài)細(xì)胞時(shí),洗滌以徹底去除培養(yǎng)基是非常重要的。若未徹底去除細(xì)胞中的培養(yǎng)基將導(dǎo)致電穿孔時(shí)在樣本中產(chǎn)生電弧。細(xì)胞應(yīng)該用水或低離子強(qiáng)度的溶液如蔗糖、甘油、葡萄糖、山梨醇或PEG洗滌至少3次。對(duì)許多微生物而言,甘油是一種方便的電穿孔介質(zhì),因甘油通常被用于細(xì)胞保存的冷凍保存液。下圖展示了幾種不同生物學(xué)上的重要離子溶液對(duì)樣品電阻的濃度效應(yīng)。注意幾點(diǎn): 體積對(duì)樣品的電阻有重要影響對(duì)離子溶液,樣品電阻和電轉(zhuǎn)杯中樣品的體積呈反比; 含有二價(jià)離子的溶
16、液的電阻比含有相同濃度單價(jià)離子的溶液電阻低; 緩沖溶液的電阻受pH值影響。即使極低濃度的離子化合物的加入都可以顯著降低樣品的電導(dǎo),進(jìn)而引發(fā)電弧作用。通過乙醇沉淀法制備的DNA中殘留的鹽應(yīng)該在用水或TE buffer溶解DNA前洗滌DNA以降低鹽濃度。表1表明,雖然將含有10mM Tris,1mM EDTA,pH8.0溶液的質(zhì)粒加入水中,確實(shí)會(huì)降低樣品的電導(dǎo),但這應(yīng)該不會(huì)導(dǎo)致不能使用MicroPulser進(jìn)行電穿孔試驗(yàn)。可以直接使用酶反應(yīng)的DNA進(jìn)行轉(zhuǎn)化,但進(jìn)行高壓脈沖操作時(shí),最終電穿孔樣品中的鹽濃度應(yīng)該保持在低于5meq的水平。最后,連接混合物可能可以用于轉(zhuǎn)化,但DNA加入量必須極低或者通過稀
17、釋(Willson and Gough,1988)、透析(Heery and Dunican,1989;Jacobs et al., 1990)或乙醇沉淀(Bttger, 1988;Zabarovsky and Winberg,1990)降低離子強(qiáng)度。3、 MicroPulser操作說明參見圖1了解MicroPulser的各個(gè)組件,圖5標(biāo)注了各個(gè)按鈕和LED的名稱。3.1 設(shè)置MicroPulser系統(tǒng) 將黑色電源線連接到MicroPulser脈沖發(fā)生器模塊的后面板。將電源線插入墻上的插座或電源線。 拉下MicroPulser底部的折疊腳。將該腳插入電擊腔底部的軌道中。將電擊腔滑塊滑入電擊腔。
18、 將從電擊腔引出的導(dǎo)線連接到MicroPulser前面板上的輸出接口上;極性對(duì)電穿孔過程并不重要。 打開電源開關(guān)。LED燈應(yīng)亮起并且顯示為“Ec1”,隨后LED指示細(xì)菌設(shè)置狀態(tài)(Bacteria Setteing)。3.2 MicroPulser的操作(1)選擇預(yù)設(shè)的程序MicroPulser預(yù)設(shè)了數(shù)種常見的微生物的電擊程序如下:循環(huán)按“Settings”鍵選擇“Bacteria”、“Fungi”和“Manual”。當(dāng)“Fungi”旁的LED燈亮?xí)r,預(yù)存儲(chǔ)的真菌轉(zhuǎn)化程序即被調(diào)出。按“上”和“下”鍵可在不同的真菌轉(zhuǎn)化程序間切換。電擊的參數(shù)自動(dòng)按顯示的程序設(shè)定。同樣的,選擇“Bacteria”程序
19、相同。不管是選擇“Bacteria”,還是“Fungi”程序,同時(shí)按住“上”“下”鍵可以在LED屏上顯示選定程序的參數(shù)。顯示屏上首先顯示的是電壓值,然后是“t”。如果一個(gè)程序的時(shí)間和多次脈沖相關(guān),則顯示“P”,然后顯示“2”,表示將會(huì)進(jìn)行兩次連續(xù)的脈沖。如果沒有給定“t”,則脈沖是非截短的(not truncated),而如果沒有“P”被給定,則是單次脈沖。(2)使用MicroPulser的手動(dòng)模式A. 改變電壓按“Settings”鍵,當(dāng)“Manual”旁的LED燈亮?xí)r,顯示屏顯示電壓值(單位kV)。按“上”和 下鍵在0.20 kV-3.00kV之間改變電壓。如果儀器剛剛打開,顯示值為“0.
20、00”。B. 截短脈沖.當(dāng)“Manual”旁的LED燈亮?xí)r,同時(shí)按“上”和 下鍵LED屏顯示“t-”,表示為脈沖選擇了時(shí)間。開機(jī)時(shí)的默認(rèn)設(shè)置為標(biāo)準(zhǔn)的指數(shù)衰減脈沖,或衰減過程不被截短,顯示為“-”。同時(shí)按“上”和 下鍵后只松開“下”鍵,顯示數(shù)字為截短的脈沖持續(xù)時(shí)間,單位為毫秒,從1毫秒“t1.0”開始以0.1毫秒為增量一直到4毫秒“t4.0”。這將限定脈沖時(shí)間在1-4毫秒之間。同時(shí)按“上”和 下鍵后只松開“上”鍵,可以調(diào)整指定的脈沖截短時(shí)間到更短。(3)脈沖功能按“Pulse”鍵到電容充電至設(shè)定電壓;顯示屏上顯示“PLS”。當(dāng)脈沖完成后會(huì)發(fā)出一次響聲,如果是一次設(shè)置好的多重脈沖則在整個(gè)脈沖過程中
21、每次脈沖后均會(huì)發(fā)出一次響聲,“PLS”則一直在顯示屏上顯示。要想手動(dòng)進(jìn)行多重脈沖,則可以在一次脈沖完成且響聲停止后,再次按“Pulse”鍵。如果發(fā)出比較低程度的響聲,伴隨著“Arc”在顯示器上顯示,則表明系統(tǒng)預(yù)防和淬滅(ARQ)系統(tǒng)被啟動(dòng),脈沖被中止。這通常是電擊杯被擊穿的跡象,如果樣品電阻太小,電擊杯仍可能被擊穿。因?yàn)樵凇癆RQ”事件中釋放的能量很低,重新設(shè)置一個(gè)不會(huì)產(chǎn)生電弧的參數(shù)對(duì)樣品重新電擊也可能會(huì)得到可接受的結(jié)果。但是,不建議使用經(jīng)歷了兩次電弧事件的樣品。(4)測(cè)量按“Measurements”鍵可以點(diǎn)亮Actual kV LED. 顯示最后一次脈沖試驗(yàn)的實(shí)際電壓(單位kV),如果儀器
22、剛剛開機(jī)并且沒有使用過,顯示器顯示0.00。再次按“Measurements”鍵可以點(diǎn)亮“Time ms”LED,顯示上次脈沖持續(xù)時(shí)間。按住“測(cè)量”按鈕,LED顯示屏將在實(shí)際電壓和時(shí)間常數(shù)之間切換。3.3 使用MicroPulser進(jìn)行電穿孔 將細(xì)胞懸液移入電轉(zhuǎn)杯中,輕敲液體使之落入電轉(zhuǎn)杯底部。0.2cm電轉(zhuǎn)杯最多可裝0.4ml溶液,0.1cm電轉(zhuǎn)杯最多可裝80l溶液。注意,溫度會(huì)對(duì)轉(zhuǎn)化頻率產(chǎn)生重要影響。某些微生物的電轉(zhuǎn),包括E.coli和釀酒酵母,在冷的電轉(zhuǎn)杯中轉(zhuǎn)化效率更高。 將電轉(zhuǎn)杯插入電擊腔的滑槽中。將滑槽推入電擊腔使電轉(zhuǎn)杯與電擊腔的電極緊密接觸。 按黃色“Pulse”按鈕,給電容器充電
23、并發(fā)出脈沖;LED顯示屏將顯示“PLS”,直到一個(gè)聲響結(jié)束表明脈沖已經(jīng)給出。LED顯示屏將顯示程序,時(shí)間常數(shù),或?qū)嶋H輸出的電壓,這取決于選擇的LED。 從電擊腔取出滑槽,并取出電擊杯,處理電擊好的樣品細(xì)胞。 按下“測(cè)量”按鈕,在顯示屏LED上顯示發(fā)送到樣品的時(shí)間常數(shù)和實(shí)際電壓。當(dāng)“Actual kV”旁的LED亮起時(shí),電壓顯示為“kV”。再次按下“measurement”按鈕即可顯示時(shí)間常數(shù)?!癟ime ms”旁邊的LED燈亮;時(shí)間常數(shù)以“ms”為單位。 按下電源按鈕關(guān)閉儀器。如果需要,樣品電擊腔現(xiàn)在可以安全地?cái)嚅_。在導(dǎo)線斷開之前,不要拆卸電擊腔蓋。4、 E.coli的高效電轉(zhuǎn)化E.coli電
24、轉(zhuǎn)化的轉(zhuǎn)化效率可達(dá)109-1010轉(zhuǎn)化子/g,這比最好的化學(xué)轉(zhuǎn)化法的轉(zhuǎn)化效率都要高。下面的protocol描述了一種用于高效電轉(zhuǎn)化的E.coli感受態(tài)細(xì)胞的制備方法。我們也對(duì)通過電穿孔轉(zhuǎn)化的其他菌株感興趣,并將此信息收錄在我們的電轉(zhuǎn)化手冊(cè)的后續(xù)版本中。4.1 制備電轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞參考Ausubel et al.(1987)、Miller和Nickoloff(1995)的文章獲得更詳細(xì)信息。 向500ml LB培養(yǎng)基中按1%接種量接種新鮮的過夜E.coli菌液。 37、300rpm培養(yǎng)至OD600約為0.5-0.7(對(duì)數(shù)生長早期至中期收獲的細(xì)胞可獲得最佳的轉(zhuǎn)化結(jié)果,因此,適當(dāng)?shù)募?xì)胞密度取決于菌株
25、和生長條件)。 將菌液在冰上放置20min。隨后的步驟中,盡可能保持細(xì)胞接近0(置于冰/水浴中),在加入細(xì)胞之前,在冰上預(yù)冷所有的容器。轉(zhuǎn)移細(xì)胞至預(yù)冷的離心管中,4、4000g離心15min。 小心倒去上清液。為了徹底去除培養(yǎng)基,寧可倒去部分細(xì)胞、犧牲收率。 用500ml冰預(yù)冷的10%甘油溶液輕柔重懸細(xì)胞沉淀。4、4000g離心15min,小心倒去上清液。 用250ml冰預(yù)冷的10%甘油溶液輕柔重懸細(xì)胞沉淀。4、4000g離心15min,小心倒去上清液。 用20ml冰預(yù)冷的10%甘油溶液輕柔重懸細(xì)胞沉淀。轉(zhuǎn)移至一個(gè)30ml無菌Oakridge管中。4、4000g離心15min。小心倒去上清液。
26、 用1-2ml冰預(yù)冷的10%甘油溶液輕柔重懸細(xì)胞沉淀。細(xì)胞濃度應(yīng)在1-31010 cells/ml范圍內(nèi)。本懸液可以冷凍在干冰或-70冰箱中,在該條件下,細(xì)胞可以穩(wěn)定保存至少6個(gè)月。4.2 電轉(zhuǎn)化 冰上解凍感受態(tài)細(xì)胞。對(duì)將要電轉(zhuǎn)的每個(gè)樣品,預(yù)先準(zhǔn)備一個(gè)1.5ml EP管和0.1或0.2cm電轉(zhuǎn)杯冰上預(yù)冷。 在預(yù)冷的1.5ml PP管內(nèi),混合40l細(xì)胞懸液和1-2l DNA(DNA應(yīng)該為低離子強(qiáng)度溶液,如TE)。混勻,冰上孵育1min。注意:最好是在一個(gè)微量離心管中混合質(zhì)粒和細(xì)胞,因電擊杯的小槽不利于樣品的均勻混合。 若選擇0.1cm電擊杯,請(qǐng)?jiān)O(shè)置MicroPulser程序?yàn)椤癊c1”,若選擇0
27、.2cm電擊杯,則選擇程序“Ec2”或“Ec3”。具體儀器操作可見操作說明部分。 轉(zhuǎn)移DNA和細(xì)胞的混合物至預(yù)冷的電擊杯中,輕彈懸液使其落入電擊杯底部。將電擊杯放入電擊腔滑槽。將滑槽推入電擊腔,直至電擊杯固定于電擊腔的接觸電極間。電擊一次。 從電擊腔中移出電擊杯,立即加入1ml SOC培養(yǎng)基。用移液器迅速而輕柔地懸浮細(xì)胞。電擊后至將細(xì)胞轉(zhuǎn)移至生長培養(yǎng)基的時(shí)間間隔對(duì)E.coli轉(zhuǎn)化子恢復(fù)生長是非常關(guān)鍵的(Dower et al,1988)。這一過程即使只延遲1min,都會(huì)導(dǎo)致轉(zhuǎn)化效率3倍的降低。延遲10min則降低20倍。 轉(zhuǎn)移細(xì)胞懸液至17100mm PP管,37、225rpm振蕩培養(yǎng)1小時(shí)。
28、 檢查和記錄脈沖參數(shù)。時(shí)間常數(shù)應(yīng)接近5ms。電場(chǎng)強(qiáng)度可以通過實(shí)際電壓(kV)/電擊杯間隙寬度(cm)獲得。 在篩選平板上涂平板。4.3 電轉(zhuǎn)化所需溶液和試劑 LB:10g Bacto tryptone,5g Bacto yeast extract,5g NaCl;溶于1L水,高壓滅菌。 10%(v/v)甘油:12.6g甘油(密度為1.26g/cc)于90ml水。高壓或無菌過濾。 TE:10mM Tris-HCl,pH8.0,1mM EDTA。 SOC:2% Bacto tryptone,0.5% Bacto yeast extract,10mM NaCl,2.5mM KCl,10mM MgCl
29、2,10mM MgSO4,20mM葡萄糖。5、 釀酒酵母(Saccharomyces cerevisciae)的電轉(zhuǎn)化5.1 感受態(tài)細(xì)胞的制備參考Becker & Guarantee(1991)和Ausubel et al.(1987)的文獻(xiàn)獲取更多信息。 用2.8L三角培養(yǎng)瓶裝500ml YPD培養(yǎng)基,向其中接種0.1-0.5ml(原文為an aliquot一小份,未規(guī)定具體接種量)過夜菌液。釀酒酵母在30條件下的的倍增時(shí)間大約為2小時(shí)。 30過夜培養(yǎng),250rpm,至細(xì)胞密度為1108cells/ml(OD600=?)。 于冰水浴中迅速冷卻以停止生長。 將細(xì)胞倒入2個(gè)250ml離心瓶中,4
30、、3000g離心5min。 小心倒掉上清液。將有細(xì)胞沉淀的離心瓶置冰上。 向每個(gè)離心瓶中加入50ml無菌、冰預(yù)冷的水,斡旋以重懸細(xì)胞沉淀。調(diào)整瓶內(nèi)液體的體積至250ml。4、3000g離心5min。倒去上清液。 用250ml無菌、冰預(yù)冷的水按上一步驟重復(fù)洗滌細(xì)胞一次。 用20ml無菌、冰預(yù)冷的1M山梨醇溶液重懸細(xì)胞,轉(zhuǎn)移細(xì)胞懸液至一個(gè)預(yù)冷的30ml Oakridge管。4、3000g離心5min。小心倒去上清液。 用0.5ml無菌、冰預(yù)冷的1M山梨醇溶液重懸細(xì)胞沉淀。最終的細(xì)胞體積約1.3ml,細(xì)胞濃度約11010cells/ml。將細(xì)胞置于冰上并盡快使用。5.2 電轉(zhuǎn) 吸取待轉(zhuǎn)化的DNA樣品
31、(5-100ng/5l)至一個(gè)1.5ml無菌EP管,置于冰上預(yù)冷。 如果使用0.2cm電擊杯,向每個(gè)DNA樣品加入40l感受態(tài)細(xì)胞;如果使用0.4cm電擊杯,則加入80l感受態(tài)細(xì)胞。輕柔混勻,冰上孵育5min。 若使用0.2cm電擊杯,則設(shè)置MicroPulser程序?yàn)椤癝c2”;若使用0.4cm電擊杯,則設(shè)置程序?yàn)椤癝c4”。 轉(zhuǎn)移DNA-細(xì)胞混合物樣本至選定的且用冰預(yù)冷的電擊杯中,輕彈電擊杯使樣本落于電擊杯底部。將電擊杯放入電擊腔滑槽。將滑槽推入電擊腔直至電擊杯固定于電擊腔的接觸電極間。電擊一次。 從電擊腔中移出電擊杯,立即加入1ml冰預(yù)冷的1M山梨醇。輕柔轉(zhuǎn)移細(xì)胞懸液至一個(gè)無菌管中。 檢
32、查和記錄脈沖參數(shù)。時(shí)間常數(shù)應(yīng)接近5ms。電場(chǎng)強(qiáng)度可以通過實(shí)際電壓(kV)/電擊杯間隙寬度(cm)獲得。 在含有1M山梨醇的篩選平板上涂平板。30培養(yǎng)48-72小時(shí)。5.3 電轉(zhuǎn)化所需溶液和試劑 YPD:10g yeast extract,20g peptone,溶于900ml水,高壓滅菌。使用前加入100ml無菌葡萄糖。 1M山梨醇:182.2g山梨醇,溶于800ml水,定容至1L。高壓滅菌。 20%葡萄糖:20g葡萄糖,溶于60ml水。定容至100ml。0.22m濾膜過濾除菌。6、 畢赤酵母(Pichia pastoris)的電轉(zhuǎn)化6.1 感受態(tài)細(xì)胞的制備參考Cregg & Russell(
33、1998)的文獻(xiàn)獲取更多信息。 用2.8L三角培養(yǎng)瓶裝500ml YPD培養(yǎng)基,向其中接種0.1-0.5ml(原文為an aliquot一小份,未規(guī)定具體接種量)過夜菌液。畢赤酵母在30條件下的的倍增時(shí)間大約為2小時(shí)。 30過夜培養(yǎng),300rpm,至細(xì)胞密度為5-7107cells/ml(OD600=?)。 將細(xì)胞倒入2個(gè)250ml無菌離心瓶中,4、3000g離心5min。 小心倒掉上清液。 向每個(gè)離心瓶中加入50ml無菌YPD/HEPES,斡旋以重懸細(xì)胞沉淀;加入1.25ml 1M DTT至每個(gè)離心瓶中,輕柔混勻。30孵育15min。 用200ml無菌、冰預(yù)冷的1M山梨醇重懸細(xì)胞沉淀。4、3
34、000g離心5min。倒去上清。 用50ml無菌、冰預(yù)冷的1M山梨醇溶液斡旋重懸細(xì)胞,用無菌、冰預(yù)冷的1M山梨醇調(diào)節(jié)溶液體積至250ml。4、3000g離心5min。倒去上清液。 用10ml無菌、冰預(yù)冷的1M山梨醇重懸細(xì)胞,匯總轉(zhuǎn)移細(xì)胞懸液至一個(gè)預(yù)冷的30ml Oakridge管。4、3000g離心5min。小心倒去上清液。 用0.5ml無菌、冰預(yù)冷的1M山梨醇溶液重懸細(xì)胞沉淀。最終的細(xì)胞體積約1.3ml,細(xì)胞濃度約1109cells/ml。將細(xì)胞置于冰上并盡快使用。5.2 電轉(zhuǎn) 吸取待轉(zhuǎn)化的DNA樣品(可多達(dá)10ug)至一個(gè)1.5ml無菌EP管,置于冰上預(yù)冷。 加入40l感受態(tài)細(xì)胞每個(gè)DNA
35、樣本,輕柔混勻。 設(shè)置MicroPulser程序?yàn)椤癙ic”。 轉(zhuǎn)移DNA-細(xì)胞混合物樣本至冰預(yù)冷的0.2cm電擊杯中,輕彈電擊杯使樣本落于電擊杯底部。將電擊杯放入電擊腔滑槽。將滑槽推入電擊腔直至電擊杯固定于電擊腔的接觸電極間。電擊一次。 從電擊腔中移出電擊杯。當(dāng)用營養(yǎng)缺陷突變株進(jìn)行互補(bǔ)篩選時(shí),立即加入1ml冰預(yù)冷的1M山梨醇。若用抗性篩選方法,則立即加入1ml冰預(yù)冷的YPD/山梨醇。輕柔轉(zhuǎn)移細(xì)胞懸液至一個(gè)無菌管中。 檢查和記錄脈沖參數(shù)。時(shí)間常數(shù)應(yīng)接近5ms。電場(chǎng)強(qiáng)度可以通過實(shí)際電壓(kV)/電擊杯間隙寬度(cm)獲得。 用營養(yǎng)缺陷突變株進(jìn)行互補(bǔ)篩選時(shí),細(xì)胞應(yīng)立即涂布至含有1M山梨醇的限定瓊脂
36、平板(minimal agar plate)上。當(dāng)用抗性篩選方法時(shí),電轉(zhuǎn)后的細(xì)胞在30振蕩培養(yǎng)1-2小時(shí);在含有1M山梨醇的YPD瓊脂平板上,用適當(dāng)?shù)目股剡M(jìn)行電穿孔細(xì)胞的培養(yǎng)。30培養(yǎng)72-96小時(shí)。5.3 電轉(zhuǎn)化所需溶液和試劑 YPD/HEPES:100ml YPD培養(yǎng)基,20ml 1M HEPES,pH8.0。 1M DTT:1.55g DTT,溶于8ml水,定容至10ml,過濾除菌。 YPD/山梨醇:10g yeast extract,20g peptone,182.2g山梨醇,溶于700ml水,定容至900ml。高壓滅菌。臨用前加入100ml無菌20%葡萄糖。References1.
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