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文檔簡(jiǎn)介
1、SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳分離大腸桿菌全蛋白,實(shí)驗(yàn)六,LOGO,Your site here,實(shí)驗(yàn)?zāi)康?學(xué)習(xí)SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳的基本原理; 掌握SDS-聚丙烯酰胺凝膠分離蛋白質(zhì)的操作技術(shù)(基礎(chǔ)性很強(qiáng),使用范圍廣泛); 學(xué)習(xí)蛋白質(zhì)的考馬斯亮藍(lán)染色鑒定。,LOGO,Your site here,實(shí)驗(yàn)原理,聚丙烯酰胺凝膠: 是由單體丙烯酰胺(Acr)和交聯(lián)劑N,N-甲叉雙丙烯酰胺(Bis)在催化劑N,N,N,N四甲基乙二胺(TEMED)和過(guò)硫酸銨(AP)或核黃素的作用下聚合交聯(lián)成三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的凝膠,以此凝膠為支持物的電泳稱為聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)。 AP提供自由基,TEMED是催化劑
2、,催化自由基引起的聚合反應(yīng)進(jìn)行。,LOGO,Your site here,實(shí)驗(yàn)原理,(聚丙烯酰胺),LOGO,Your site here,實(shí)驗(yàn)原理,LOGO,Your site here,聚丙烯酰胺凝膠有下列特性:,凝膠透明,有彈性,機(jī)械性能好; 化學(xué)性能穩(wěn)定,與被分離物不起化學(xué)反應(yīng); 對(duì)pH和溫度變化較穩(wěn)定,幾乎無(wú)吸附和電滲作用; 樣品用量少,靈敏度可達(dá)10-6g; 凝膠孔徑可調(diào)節(jié); 分辨率高。,LOGO,Your site here,SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳,是在聚丙烯酰胺凝膠系統(tǒng)中引進(jìn)SDS(十二烷基磺酸鈉); 蛋白質(zhì)在一定濃度的含有強(qiáng)還原劑的SDS溶液中,與SDS分子按比例結(jié)合,形
3、成帶負(fù)電荷的SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物。,LOGO,Your site here,由于十二烷基硫酸根帶負(fù)電,使各種蛋白質(zhì)SDS復(fù)合物都帶上相同密度的負(fù)電荷,它的量大大超過(guò)了原蛋白質(zhì)分子的電荷量, 因而掩蓋了不同種蛋白質(zhì)間原有的電荷差別,SDS與蛋白質(zhì)結(jié)合后,還可引起構(gòu)象改變,蛋白質(zhì)SDS復(fù)合物形成近似“雪茄煙”形的長(zhǎng)橢圓棒。 因此在進(jìn)行電泳時(shí),蛋白質(zhì)分子的電泳遷移率主要取決于它的分子量,而與所帶電荷和形狀無(wú)關(guān)。因此,可以利用SDS-PAGE測(cè)定蛋白質(zhì)分子量。,LOGO,Your site here,凝膠系統(tǒng)的分類,連續(xù)性凝膠電泳,不連續(xù)凝膠電泳,連續(xù)系統(tǒng)電泳體系中緩沖液pH值及凝膠濃度相同,帶電顆粒
4、在電場(chǎng)作用下,主要靠電荷和分子篩效應(yīng)。,不連續(xù)系統(tǒng)中由于緩沖液離子成分,pH,凝膠濃度及電位梯度的不連續(xù)性,帶電顆粒在電場(chǎng)中泳動(dòng)不僅有電荷效應(yīng)、分子篩效應(yīng),還具有濃縮效應(yīng)。,LOGO,Your site here,實(shí)驗(yàn)原理,SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳的三種效應(yīng),濃縮效應(yīng) 電荷效應(yīng) 分子篩效應(yīng),LOGO,Your site here,濃縮效應(yīng),不連續(xù)體系由電極緩沖液、濃縮膠及分離膠組成: 濃縮膠是由AP催化聚合而成的大孔膠,凝膠緩沖液為pH6.8的Tris-HC1; 分離膠是由AP催化聚合而成的小孔膠,凝膠緩沖液為pH8.8的Tris-HC1; 電極緩沖液是pH8.3的Tris-甘氨酸緩沖液。,
5、LOGO,Your site here,濃縮效應(yīng)-1(凝膠孔徑的不連續(xù)性),濃縮膠的凝膠濃度較小,孔徑較大,把較稀的樣品加在濃縮膠上,樣品的移動(dòng)速度較快,最終使樣品“堆積”在濃縮膠和分離膠之間而被濃縮至一個(gè)狹窄的區(qū)帶,大大提高了電泳的靈敏度。,LOGO,Your site here,在pH6.8的凝膠緩沖體系中: 前導(dǎo)離子或快離子:HCl (解離)Cl,Cl泳動(dòng)速度最快; 尾隨離子(trailing ion)或慢離子: CH2(NH2)COOH CH2(NH2)COO,泳動(dòng)速度最慢; 蛋白質(zhì)(P)泳動(dòng)速度介于快慢離子之間; 電泳時(shí),Cl超過(guò)P走在最前面,其后形成一個(gè)離子濃度較低的低電導(dǎo)區(qū)較高電
6、位梯度P和慢離子加速移動(dòng)P壓縮成層; mclclmppmGG(Cl代表氯離子,P代表蛋白質(zhì),G代表甘氨酸根離子),有效遷移率=m,m為遷移率,為解離度。 當(dāng)進(jìn)入pH8.8的分離膠時(shí) 甘氨酸解離度增加,其有效遷移率超過(guò)蛋白質(zhì)時(shí),不再形成高電壓。,濃縮效應(yīng)-2(緩沖體系離子成分及pH值的不連續(xù)性 ),LOGO,Your site here,實(shí)驗(yàn)原理,考馬斯亮藍(lán)是一種染料,和蛋白質(zhì)結(jié)合呈藍(lán)色。 G250用來(lái)測(cè)定蛋白質(zhì)含量;R250用來(lái)對(duì)電泳條帶染色。,LOGO,Your site here,SDS-PAGE,LOGO,Your site here,實(shí)驗(yàn)方法,分離膠的制備,濃縮膠的制備,加樣,待分離樣
7、品的準(zhǔn)備,電泳,染色,脫色,LOGO,Your site here,分離膠的制備,置小燒杯中,混勻,迅速用移液器滴入二塊玻璃板之間(短玻璃朝外),凝膠加至橫板的2/3; 用滴管加少許水,在室溫中聚合20-30分鐘。 注意:acr/bis有神經(jīng)毒/制膠時(shí)避免產(chǎn)生氣泡,LOGO,Your site here,濃縮膠的制備,將分離膠上層的水倒去,并用濾紙擦干 置小燒杯中,混勻,迅速加入配制好的濃縮膠溶液至接近短玻璃的頂端,插入加樣梳, 聚合30分鐘;,LOGO,Your site here,加樣,樣品制備:取大腸桿菌培養(yǎng)物1ml,6000rpm離心5分鐘,棄上清,用100ul蒸餾水重懸,加25ull
8、oading buffer沸水煮沸5分鐘,10000rpm離心5min; 聚合后,將凝膠板取出,置于電泳槽中,短玻璃朝內(nèi),加入電泳緩沖液,小心拔去加樣梳,用微量進(jìn)樣器吸取10ul樣品,加入凝膠的每個(gè)凹槽中。 注意:加樣前先倒入電泳緩沖液,沒(méi)過(guò)短玻璃;上樣時(shí)不要扎破加樣孔,也要避免樣品溢出。,LOGO,Your site here,電泳,在電泳槽中注入Tris-甘氨酸緩沖液,樣品端接負(fù)極(短玻璃的一邊),電壓控制在180V,電泳約11.5小時(shí),溴酚藍(lán)距離分離膠底端1cm。,LOGO,Your site here,染色和脫色,染色:電泳結(jié)束后,撬開(kāi)玻璃板,將凝膠板做好標(biāo)記后放在大培養(yǎng)皿內(nèi),加入染色液,染色30min; 脫色:染色后的凝膠板用蒸餾水漂洗數(shù)次,再用脫色液脫色20min,更換脫色液過(guò)夜 。 剝膠時(shí)要小心,保持膠完好無(wú)
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