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文檔簡介

1、北方民族大學(xué) 基因:原核、真核生物以及病毒的 dna 和 rna 分子中具有遺傳效應(yīng)的核苷酸序列,是遺傳的基本單位和突變單位及控制性狀的功能單位。它包括編碼蛋白質(zhì)和 rna 的結(jié)構(gòu)基因以及具有調(diào)節(jié)控制作用的調(diào)控基因。 基因組:含有一個生物體生存、發(fā)育、活動和繁殖所需要的全部遺傳信息的整套核酸。即單倍體細(xì)胞中的全部基因?yàn)橐粋€基因組。 c 值:真核生物單倍體基因組所包含的全部 dna 含量稱為該生物的 c值。用皮克表示(1pg=10-12g, 屬于質(zhì)量單位)c 值矛盾(c 值悖理):c 值矛盾指真核生物中 dna 含量的反?,F(xiàn)象。即 dna 含量與進(jìn)化復(fù)雜性不呈線性關(guān)系,表現(xiàn)為:l c 值不隨著生

2、物的進(jìn)化程度和復(fù)雜性而增加。l 關(guān)系密切的生物 c 值相差很大。l 真核生物 dna 的量遠(yuǎn)大于編碼蛋白等物質(zhì)所需的量。啟動子:是 rna 聚合酶識別、結(jié)合和啟動轉(zhuǎn)錄的一段 dna 序列,它含有 rnapol 特異結(jié)合和轉(zhuǎn)錄起始所需的保守位點(diǎn),但啟動子本身不被轉(zhuǎn)錄。原核啟動子分兩類:rnapol 能直接識別并結(jié)合的核心啟動子;啟動子上游部位,即 up 元件,是在 rnapol 作用時需要的輔因子及其結(jié)合的位點(diǎn)。原核啟動子結(jié)構(gòu)有 4 個保守特征:即轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、-10 區(qū)、-35 區(qū)以及-10 區(qū)和-35 區(qū)之間的間隔序列10 區(qū)(-10box),是 dna 解旋酶的重要部位,突變導(dǎo)致解鏈速率降低

3、。35 區(qū)(sextama box),是 因子識別的重要部位,突變降低了 rna 聚合酶的結(jié)合速率。 復(fù)制叉:在復(fù)制起點(diǎn),已解鏈形成的單鏈模板與未解鏈的雙鏈 dna 之間形成的“y 字形”連接區(qū)域,稱為復(fù)制叉。它是和復(fù)制有關(guān)的酶和蛋白質(zhì)組裝成復(fù)合物和新鏈合成的部位。 復(fù)制眼:原核生物的染色體和質(zhì)粒都是環(huán)狀雙鏈分子,復(fù)制從 oric(復(fù)制起點(diǎn))開始以順時針和逆時針雙向進(jìn)行,dna 在復(fù)制叉處兩條鏈解開,各自合成其互補(bǔ)鏈,中間產(chǎn)物形成形結(jié)構(gòu),在電鏡下可看到形如眼的結(jié)構(gòu),即復(fù)制眼。 半保留復(fù)制:dna 復(fù)制時,以親代 dna 的每一條鏈作為模板,合成完全相同的兩個雙鏈子代 dna,產(chǎn)生的每個子代雙鏈

4、 dna 中都含有一條親代dna 鏈和一條新合成的互補(bǔ)鏈,這就是半保留復(fù)制。 半不連續(xù)復(fù)制:以復(fù)制叉移動的方向?yàn)榛鶞?zhǔn),一條模板鏈?zhǔn)?35,以此為模板新生成的 dna 鏈合成沿 53方向連續(xù)進(jìn)行,另一條模板鏈的方向?yàn)?3,以此為模板的新鏈合成方向也是 53,但與復(fù)制叉前進(jìn)方向相反,復(fù)制是不連續(xù)的,可先分段合成為不連續(xù)的岡崎片段,岡崎片段再由 dna 連接酶連接完整的 dna 鏈,這種合成方式稱為 dna 合成的半不連續(xù)復(fù)制。 岡崎片段:dna 復(fù)制時,復(fù)制方向由 5向 3端進(jìn)行,前導(dǎo)鏈合成是連2013.07.07北方民族大學(xué)續(xù)的,而滯后鏈的合成是不連續(xù)的,滯后鏈的合成中出現(xiàn)的不連續(xù)的核苷酸小片段

5、,稱之為岡崎片段。 發(fā)夾結(jié)構(gòu):當(dāng)同一個核酸分子中,一段堿基序列附近緊挨著一段它的互補(bǔ)序列時,核酸鏈有可能自身回折配對產(chǎn)生反向平行的雙螺旋結(jié)構(gòu),稱為發(fā)夾結(jié)構(gòu)。發(fā)夾結(jié)構(gòu)由稱為莖的堿基互補(bǔ)雙螺旋區(qū)和不能配對的突環(huán)區(qū)構(gòu)成。 超螺旋:簡單地說就是螺旋的螺旋。常態(tài)的 dna 分子以縱軸方向額外的多或少轉(zhuǎn)幾圈,就會使螺旋結(jié)構(gòu)產(chǎn)生分子內(nèi)張力,當(dāng)分子兩端固定或分子本身是環(huán)狀的,使分子不能自由轉(zhuǎn)動,額外張力不能釋放,分子就會發(fā)生扭曲以抵消張力。這種扭曲后的結(jié)構(gòu)為超螺旋。 負(fù)超螺旋:超螺旋本身具有方向性,當(dāng)超螺旋方向與右手螺旋方向相反時,形成負(fù)超螺旋。把具有負(fù)超螺旋的 dna 叫盤繞不足 dna。假基因:是指在基因

6、組中形成的穩(wěn)定和無活性的拷貝,類似于某些有功能的基因但無表達(dá)活性的 dna 序列。它不表現(xiàn)任何功能,是基因的退化形式。用“”表示。結(jié)構(gòu)基因:能編碼蛋白質(zhì)或 rna 的 dna 序列。斷裂基因:在真核生物中,基因的編碼序列被不編碼序列間隔開,使一個完整的基因分隔成不連續(xù)的若干區(qū)段的基因稱為斷裂基因或不連續(xù)基因。重疊基因:指兩個或兩個以上的基因共有一段 dna 序列,在重疊基因中同一段 dna 序列可以使用不同的閱讀方式來編碼 2 種或 2 種以上的蛋白質(zhì)。溶解溫度:即 tm,紫外光吸收值達(dá)到最大值的 50%時的溫度稱為 dna的溶解溫度。堿基中,g+c 的比例越高,tm 值越高?;蚣易澹赫婧松?/p>

7、物基因組中來源相同,結(jié)構(gòu)相似,功能相關(guān)的一組基因。超基因家族:其各基因序列間沒有同源性,但其表達(dá)產(chǎn)物的功能卻相似,在整體上有相同的結(jié)構(gòu)特征。21 基因超家族:是指一組由多基因家族及單基因組成的更大的基因家族。它們的結(jié)構(gòu)有程度不等的同源性,可能都起源于相同的祖先基因,但是它們的功能并不一定相同。最典型的基因超家族是免疫球蛋白基因超家族。22 trna 的二級結(jié)構(gòu)三葉草形l 氨基酸臂l dhu 環(huán)l 反密碼環(huán)l 額外環(huán)l tc 環(huán)2013.07.07北方民族大學(xué)23 信號肽:又稱前導(dǎo)肽,存在于蛋白質(zhì)分子 n 端的一段長度為 1530 個氨基酸的多肽片段,它使蛋白質(zhì)具備了通過細(xì)胞膜的分泌能力,蛋白質(zhì)

8、分泌之后, 信號序列被移除。它的功能是引導(dǎo)多肽鏈穿過 er 膜進(jìn)入腔內(nèi)。24 操縱子:原核生物基因表達(dá)和調(diào)控的單位,包括功能相關(guān)的幾個結(jié)構(gòu)基因和能被調(diào)控基因產(chǎn)物識別的 dna 控制元件。25 轉(zhuǎn)座子:存在于細(xì)菌染色體 dna 上可自主復(fù)制和位移的一段 dna 序列,包括插入序列(is)和復(fù)合轉(zhuǎn)座子(tn)。26 同源重組:指一般性重組,由兩條同源區(qū)的 dna 分子,通過配對、鏈斷裂和再連接而產(chǎn)生的片段間交換的過程。27 cpg 島:在哺乳動物基因組中,某些基因上游的轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)及其附近, 存在著成串的 cpg 二核苷酸序列,長度可達(dá) 12kb,其上的大部分 cpg 不被甲基化。這種富含 cpg

9、的區(qū)段稱為 cpg 島。28 sd 序列:部分或所有細(xì)菌 mrna 上 aug 起始密碼之前的 aggagg 序列,與 16s rrna 上 3末端序列互補(bǔ),促使核糖體與 mrna 結(jié)合,有利于翻譯的起始。29 密碼子:在 mrna 鏈上三個相鄰的核苷酸能夠決定一個特定的氨基酸, 這三個連續(xù)的核苷酸就是一個密碼子。共有 64 組密碼。起始密碼子有:aug,終止密碼子:uaa、uag、uga。30 反密碼子:trna 上的三個堿基決定著攜帶氨基酸的種類,并能按堿基配對原則與 mrna 上的三個特點(diǎn)堿基配對,稱為反密碼子。反密碼子可以與密碼子反向互補(bǔ)。31 轉(zhuǎn) 錄 :以 dna 為 模 板 , 在

10、 rna 聚 合 酶 的 催 化 下 以 四 種ntp(atp/ctp/gtp/utp)為原料,沿 35方向合成 rna 的過程。32 轉(zhuǎn)錄時 rna 聚合酶的幾個亞基:l 亞基功能:酶的裝配。l 亞基功能:與啟動子上游元件和活化因子結(jié)合。l 因子亞基:為起始亞基,識別啟動子,促進(jìn)轉(zhuǎn)錄的起始。33 多順反子 mrna:原核基因組 dna 序列中功能相關(guān)的基因往往叢集存在,形成一個轉(zhuǎn)錄單元,被一起轉(zhuǎn)錄成為含有多個 mrna 的分子,稱為多順反子 mrna。34 單順反子 mrna:真核基因由一個結(jié)構(gòu)基因與相關(guān)的調(diào)控區(qū)組成,轉(zhuǎn)錄生成一條 mrna,翻譯產(chǎn)生一種基因產(chǎn)物。2013.07.07北方民族

11、大學(xué)35 端粒酶:由 rna 和蛋白質(zhì)構(gòu)成的核酸-蛋白質(zhì)復(fù)合物,是一種自身攜帶模板的反轉(zhuǎn)錄酶,功能在于合成染色體端粒的重復(fù)序列,維持端粒長度的穩(wěn)定性。36 減色效應(yīng):隨著核酸的復(fù)性,核酸在 260nm 處的紫外吸收值降低的現(xiàn)象, 即減色效應(yīng)。37 轉(zhuǎn)座:一個轉(zhuǎn)座子由基因組的一個位置轉(zhuǎn)移到另一個位置的過程。38 dna 的雙螺旋:dna 分子的二級結(jié)構(gòu)。兩條反向平行的多核苷酸鏈相互纏繞形成一個右手雙螺旋結(jié)構(gòu)。堿基位于雙螺旋內(nèi)側(cè),磷酸與堿基在外側(cè),通過磷酸二酯鍵相連,形成核酸的骨架,維持該結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的力主要是堿基堆積力。39 核酸:以核苷酸為基本單位,通過 3,5磷酸二酯鍵形成鏈狀多聚體。核苷酸由含

12、氮堿基、戊糖和磷酸構(gòu)成。依據(jù)所含的戊糖種類的不同而分為核糖核酸(rna)和脫氧核糖核酸(dna).40 復(fù)制子:基因組內(nèi)能獨(dú)立進(jìn)行復(fù)制的單位稱為復(fù)制子,即一個復(fù)制單位。它包括復(fù)制起點(diǎn)到終點(diǎn)的區(qū)域。41 復(fù)制起始位點(diǎn):用 ori 表示。dna 的復(fù)制要從 dna 分子的特點(diǎn)部位開始,此特點(diǎn)部位稱為復(fù)制起始位點(diǎn)。在原核生物中復(fù)制起始位點(diǎn)只有一個,而真核生物具有多個復(fù)制起始位點(diǎn)。42 ssb 蛋白:即單鏈結(jié)合蛋白,能選擇性結(jié)合在 dna 單鏈上,使 dna 能以單鏈形式穩(wěn)定存在的蛋白質(zhì)。其阻止復(fù)制時解開的單鏈重新締合成雙螺旋, 保護(hù)單鏈部分不被核酸酶降解。43 轉(zhuǎn)座酶:由轉(zhuǎn)座元件編碼的一種自身的位點(diǎn)

13、特異性的重組酶,也是整合酶。在轉(zhuǎn)座酶作用下,轉(zhuǎn)座元件在同一細(xì)胞內(nèi)從一個 dna 位置轉(zhuǎn)移到另一個位置。44 轉(zhuǎn)座重組:發(fā)生在序列不相同(非同源)的 dna 分子間,在形成重組分子時往往依賴于 dna 的復(fù)制而不依賴 dna 序列間的同源性,使一個 dna 分子插入到另一個 dna 分子中,完成重組過程。45 插入序列:即 is,是最簡單的一類轉(zhuǎn)座元件,不含有任何宿主基因,它們是細(xì)菌染色體或質(zhì)粒 dna 的正常組成部分,is 序列是可以獨(dú)立存在的單元, 帶有介導(dǎo)自身移動的蛋白質(zhì)。46 反向重復(fù)序列:兩個順序相同的拷貝在 dna 鏈上呈反向排列,人類基因組約含 5%的反向重復(fù)序列,散布于整個基因組

14、中,常見于基因組調(diào)控區(qū)內(nèi), 可能與復(fù)制、轉(zhuǎn)錄的調(diào)控相關(guān)。47 單拷貝序列:在單倍體基因組中只出現(xiàn)一次或數(shù)次的序列,復(fù)性速度很慢。2013.07.07北方民族大學(xué)48 終止子:促進(jìn)轉(zhuǎn)錄終止的 dna 序列,在 rna 水平上通過轉(zhuǎn)錄出的終止子序列形成莖-環(huán)結(jié)構(gòu)而起作用,又可分為依賴因子的終止子和不依賴因子的終止子兩類。49 增強(qiáng)子:指能使與它連鎖的基因(位于同一條 dna 鏈上,但可遠(yuǎn)程作用) 轉(zhuǎn)錄效率明顯增加的 dna 序列。50 沉默子:指某些基因的一種負(fù)調(diào)控元件,可通過與相關(guān)特異蛋白質(zhì)結(jié)合,對基因轉(zhuǎn)錄起阻遏作用。51 絕緣子(隔離子):一類特殊的順式作用元件,一般長幾百個核苷酸,其作用是阻

15、止激活或失活效應(yīng)在染色質(zhì)上的傳遞,使染色質(zhì)的活性限定于一定范圍。52 衰減子:即弱化子,操縱子中位于操縱區(qū)和結(jié)構(gòu)基因之間的一段能終止轉(zhuǎn)錄作用的核苷酸序列,并且這種終止是被調(diào)節(jié)的。53 順式作用元件:指與結(jié)構(gòu)基因表達(dá)調(diào)控相關(guān)能夠被基因調(diào)控蛋白特異性識別和結(jié)合的特異 dna 序列。包括啟動子、上游啟動子元件、增強(qiáng)子、沉默子和一些應(yīng)答元件。54 反式作用因子:指真核細(xì)胞內(nèi)含有的大量可以通過直接或間接結(jié)合順式作用元件而調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄活性的蛋白質(zhì)因子。55 開放閱讀框:orf,從 mrna 5 端起始密碼子 aug 到 3 端終止密碼子之間的核苷酸序列,各個三聯(lián)體密碼連續(xù)排列編碼一個蛋白質(zhì)多肽鏈,稱為開放

16、閱讀框。56 調(diào)節(jié)基因:是編碼那些參與基因表達(dá)調(diào)控的 rna 和蛋白質(zhì)的特異 dna序列。57 操縱基因:是操縱子中的控制基因,在操縱子上一般與啟動子相鄰,通常處于開放狀態(tài),使 rna 聚合酶能夠通過它作用于啟動子而啟動轉(zhuǎn)錄。58 正轉(zhuǎn)錄調(diào)控:調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是激活蛋白,起著提高結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄水平的作用。59 負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控:調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是阻遏蛋白,起著阻止結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄的作用。 大腸桿菌參加復(fù)制的酶,有三種 dna 聚合酶,dna 聚合酶 i 主要參與校對、dna 聚合酶 ii 僅參與修復(fù)、dna 聚合酶 iii 主要參與復(fù)制。除聚合酶外還需要:dna 解旋酶、拓?fù)洚悩?gòu)酶、dna 連接酶、單鏈結(jié)合蛋

17、白(ssb).基因分為三類:細(xì)胞核基因、細(xì)胞質(zhì)基因和細(xì)胞器基因。2013.07.07北方民族大學(xué)順式作用元件有:啟動子、絕緣子、增強(qiáng)子、沉默子和應(yīng)答元件。復(fù)制的三種方式:形復(fù)制、滾環(huán)式復(fù)制、d-環(huán)式復(fù)制。復(fù)制的起始復(fù)合物是 orc,基因轉(zhuǎn)錄的起始復(fù)合物是 pic,翻譯的起始復(fù)合物:著色性干皮病是一種隱性遺傳性疾病,是由于患者對紫外線照射造成的核苷酸損傷切除修復(fù)缺陷所致。原核啟動子結(jié)構(gòu)有 4 個保守特征:即轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、-10 區(qū)、-35 區(qū)以及-10區(qū)和-35 區(qū)之間的間隔序列10 區(qū)(-10box),是 dna 解旋酶的重要部位,突變導(dǎo)致解鏈速率降低。35 區(qū)(sextama box),是 因

18、子識別的重要部位,突變降低了 rna 聚合酶的結(jié)合速率。反式作用因子有:激活因子、阻遏因子。p308反式作用因子 3 個功能結(jié)構(gòu)域:dna 結(jié)合結(jié)構(gòu)域、轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域、二聚化結(jié)構(gòu)域。p326反式作用因子 dna 結(jié)合結(jié)構(gòu)域 :螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋、鋅指結(jié)構(gòu)、亮氨酸拉鏈、螺旋-環(huán)-螺旋。原核 dna 復(fù)制時和肽鏈延長有關(guān) dna 聚合酶;解開雙鏈的解旋酶; 連接岡崎片段的 dna 連接酶。真核生物主要有三類 rna 聚合酶:rna 聚合酶 i,rna 聚合酶 ii 和rna 聚合酶 iii;它們分別催化 rrna , mrna 和 trna.原核生物(大腸桿菌)的 rna 聚合酶全酶包括核心酶和 因

19、子。dna 復(fù)制顯著特征:半保留復(fù)制、半不連續(xù)復(fù)制。用于轉(zhuǎn)錄的鏈稱為模板鏈或負(fù)鏈(反義鏈);對應(yīng)的鏈稱為非模板鏈或正鏈(有義鏈),非模板鏈又稱為編碼鏈。細(xì)菌有兩種類型的效應(yīng)物:誘導(dǎo)物、輔阻遏物。氨基酸活化中,原核生物起始氨基酸是:甲酰甲硫氨酸;真核生物起始氨基酸是:甲硫氨酸。dna 的物理圖譜是 dna 分子的限制性內(nèi)切酶酶解片段的排列順序。根據(jù)復(fù)性動力學(xué)(cot)曲線,真核生物基因組的 dna 分為單拷貝 dna2013.07.07北方民族大學(xué)序列、低度重復(fù)序列、中度重復(fù)序列、高度重復(fù)序列。根據(jù)重復(fù)單位的數(shù)目多少以及其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)高度重復(fù)序列分為衛(wèi)星 dna 序列、小衛(wèi)星 dna 序列、微衛(wèi)星d

20、na 序列真核轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控:1. 真核生物的轉(zhuǎn)錄是由反式作用因子、順式作用元件和 rna 聚合酶的相互作用實(shí)現(xiàn)的,主要是反式作用因子結(jié)合順式作用元件后影響轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成。2. 轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物形成,tf2d 與 tata 框結(jié)合形成 tf2d-dna 閉合復(fù)合物,其他轉(zhuǎn)錄因子與 rna 聚合酶結(jié)合形成開放復(fù)合物。3. 反式作用因子特點(diǎn),有三個功能域,dna 結(jié)合域,轉(zhuǎn)錄激活域和二聚化結(jié)合域;與上游的反式作用元件結(jié)合;對轉(zhuǎn)錄有正調(diào)控和負(fù)調(diào)控作用。4. 轉(zhuǎn)錄起始后的調(diào)控;l 反式作用因子的活性調(diào)節(jié):a 表達(dá)式調(diào)節(jié) 反式作用因子合成出來就具有活性,且只在需要時才合成,并迅速降解,不能積累。b

21、共價修飾 磷酸化 去磷酸化和糖基化。c 配體結(jié)合 很多激素受體是反式作用因子,需要與激素結(jié)合后才被激活。d 蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的作用 形成同源或異源二聚體后才有調(diào)控活性。l 反式作用因子與順式作用元件結(jié)合;反式作用因子被激活后可以結(jié)合順式作用元件和增強(qiáng)子的保守序列,調(diào)控轉(zhuǎn)錄。l 反式作用因子的作用方式;反式作用因子的結(jié)合位點(diǎn)距離其調(diào)控的基因和 rna 聚合酶結(jié)合位點(diǎn)較遠(yuǎn),一般通過成環(huán)、扭曲和滑動來影響轉(zhuǎn)錄。l 反式作用因子的組合調(diào)控;雖然每種方式轉(zhuǎn)座因子與順式作用元件接合后都能起促進(jìn)作用或抑制作用,但是反式作用因子的對轉(zhuǎn)錄的調(diào)控不是單個因子就能完成的,需要幾個因子的組合,才能完成特定功能。乳糖操縱

22、子機(jī)制1. 乳糖操縱子有 zya 三個結(jié)構(gòu)基因,分別編碼半乳糖苷酶、透性酶和半乳糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶, 催化乳糖分解成葡萄糖和半乳糖。此外還有,一個操縱基因、一個啟動子和一個調(diào)控基因, 以及啟動子基因上游的 cap 結(jié)合位點(diǎn),cap 結(jié)合位點(diǎn)、操縱基因和啟動子構(gòu)成了乳糖操縱子的調(diào)控區(qū)。乳糖操縱子同時受到阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控和 cap 的正調(diào)控的,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄寵物店協(xié)調(diào)表達(dá)。2. 阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控;乳糖不存在時,調(diào)控基因合成阻遏蛋白,結(jié)合操縱基因,阻遏乳糖操縱子的活性,使其不能轉(zhuǎn)錄,不能合成分解乳糖的三種酶。乳糖存在時,乳糖為誘導(dǎo)物,誘導(dǎo)阻遏蛋白變構(gòu),使其不能結(jié)合操縱基因,誘導(dǎo)乳糖操縱子轉(zhuǎn)錄活性,使其合成分解

23、乳糖的三種酶。3. cap 的正調(diào)控;當(dāng)葡萄糖缺乏時,camp 的濃度升高,與 cap 結(jié)合形成 camp-cap 復(fù)合物,cap 結(jié)合到位于操縱基因附近的 cap 結(jié)合位點(diǎn),激活 rna 聚合酶的活性,促進(jìn)結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄,加速分解乳糖的三種酶的合成。當(dāng)葡萄糖充足時,葡萄糖抑制使腺苷酸活化酶,減少環(huán)腺苷酸的合成,而與其為配體而結(jié)合的 cap 不能一起形成 camp-cap 復(fù)合物,不能調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄。協(xié)調(diào)調(diào)控;阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控和 cap 的正調(diào)控相互協(xié)調(diào),相互制約。色氨酸操縱子機(jī)制;2013.07.07北方民族大學(xué)1. 色氨酸操縱子由 abcde 五個結(jié)構(gòu)基因組成,分別編碼色氨酸合成途徑所需的各種

24、酶和酶亞基,5端為調(diào)控區(qū);阻遏基因、啟動子、操縱區(qū)、前導(dǎo)序列和弱化子區(qū)。色氨酸操縱子通常處于開放狀態(tài),其服阻遏蛋白不能結(jié)合結(jié)構(gòu)基因,調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄。色氨酸操縱子主要參與調(diào)控一系列用于色氨酸合成代謝的酶蛋白的轉(zhuǎn)錄合成。2. 色氨酸濃度高時,調(diào)控基因合成祖爾蛋白結(jié)合到操縱基因,使其不能表達(dá),使色氨酸操縱子處于阻遏狀態(tài),實(shí)現(xiàn)色氨酸操縱子的負(fù)調(diào)控。但是由于阻遏能力不強(qiáng),部分 rna 聚合酶逃脫,使前導(dǎo)序列的合成正常進(jìn)行,核糖體順利通過兩個相鄰的色氨酸密碼子,在 4 區(qū)沒有轉(zhuǎn)錄之前就到達(dá) 2 區(qū),2-3 區(qū)不能配對,3-4 區(qū)配對形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄在弱化子區(qū)終止, 色氨酸操縱子被關(guān)閉。3. 色氨酸濃度低時,色

25、氨酸使阻遏蛋白的阻遏作用消除,發(fā)揮正調(diào)控作用,由于色氨酸濃度低,負(fù)載有色氨酸的 trna 少,核糖體通過兩個相鄰的色氨酸密碼子時會很慢,在 4 區(qū)轉(zhuǎn)錄完成后,才加入到 1 區(qū),2-3 區(qū)配對,3-4 區(qū)不能形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄繼續(xù),直至色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)基因全部轉(zhuǎn)錄完。色氨酸的阻遏系統(tǒng)是色氨酸生物合成途徑的第一水平調(diào)控,決定轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)與否,色氨酸的弱化系統(tǒng)是合成途徑的第水平調(diào)控,決定已經(jīng)起點(diǎn)的轉(zhuǎn)錄是否繼續(xù)。轉(zhuǎn)座機(jī)制1.原核生物轉(zhuǎn)座,復(fù)制型和非復(fù)制型。復(fù)制型轉(zhuǎn)座,相互作用時,轉(zhuǎn)座因子被復(fù)制,轉(zhuǎn)座實(shí)體實(shí)際是轉(zhuǎn)座子的一個拷貝,而作為轉(zhuǎn)座子移動的部分被拷貝,其中一個拷貝留在原位點(diǎn),另一個插入到新的位點(diǎn)。整

26、個轉(zhuǎn)座過程涉及兩種酶,轉(zhuǎn)座酶和拆分酶。非復(fù)制型轉(zhuǎn)座,轉(zhuǎn)座因子通過轉(zhuǎn)座作用直接插入到新的位點(diǎn),并保留在欣慰點(diǎn),過程只有轉(zhuǎn)座酶,其結(jié)果是原位點(diǎn)丟失一個轉(zhuǎn)座因子,欣慰點(diǎn)增加一個轉(zhuǎn)座因子。實(shí)現(xiàn)表型的變化。2.真核生物轉(zhuǎn)座,逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座通過將 rna 轉(zhuǎn)錄成 dna 拷貝的能力而遷移,dna 拷貝的同時被整合到欣慰點(diǎn),逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座只發(fā)生在真核生物,逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座因子都有一個共同特點(diǎn)就是在欣慰點(diǎn)形成短的正向重復(fù)序列。holliday 模型holliday 模型可以較好的解釋同源重組現(xiàn)象。聯(lián)會兩個同源 dna 分子之一發(fā)生斷裂斷裂后形成的單鏈 3游離端,插入雙鏈 dna 中,尋找同源區(qū)域并結(jié)合,形成短的鏈置換區(qū)。形

27、成 holliday 中間體。通過 ruva 和 ruvb 發(fā)生分支遷移,形成異源雙鏈 dna通過 ruvc 形成拆分口,將 4 鏈 dna 復(fù)合物沿不同方向拆分,形成片段重組體和拼接重組體。原核啟動子1. 啟動子是 dna 鏈上可以與 rna 聚合酶結(jié)合并起始 mrna 合成的 dna 序列。原核啟動子由兩個彼此分開又高度保守的核苷酸序列組成。對 mrna 的合成非常重要。2. pribnow 盒,位于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游 5-10 個堿基,長度為 6-8 個堿基。又稱-10 區(qū)。啟動子的來源不同,導(dǎo)致堿基順序變化。2013.07.07北方民族大學(xué)3.-35 區(qū),位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游 35 個堿基

28、又稱-35 區(qū),長度為 19 個堿基。啟動子有強(qiáng)弱之分, 雖然原核生物鐘一種 rna 聚合酶可以合成所有的 rna,但是不能識別真核啟動子,原核生物內(nèi)常見的強(qiáng)啟動子有乳糖啟動子,色氨酸啟動子,和乳糖以及色氨酸的雜合啟動子。真核啟動子真核生物含有三種 rna 聚合酶,各種酶有自己的啟動子。1 類型,rrna 基因的啟動子,分為兩類,核心啟動子和上游啟動元件。2 類型,mrna 基因的啟動子,分為核心啟動子和上游啟動子元件。核心啟動子分為 4 個小元件,起始子、tata 框,tf2b 元件、下游啟動元件。3 類型,分為兩類,基因內(nèi)啟動子和轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游啟動區(qū),tata 盒、遠(yuǎn)端序列元件和近端序列元

29、件。蛋白質(zhì)生物合成1. 氨基酸的活化,游離的氨基酸需要經(jīng)過活化獲得能量才能參與蛋白質(zhì)的合成,氨酰-trna合成酶的催化下,消耗 1 分子 atp,合成氨酰-trna.由 gtp 水解供能。2. 肽鏈合成的起始,由起始因子參與,mrna 和 30s 小亞基,50s 大亞基以及起始甲酰甲硫氨酰-trna 一起合成 70s 起始復(fù)合物。由 gtp 水解供能。3. 肽鏈合成的延伸,起始復(fù)合物形成后即開始延長肽鏈,首先是氨酰-trna 結(jié)合到核糖體的a 位點(diǎn),然后由肽酰轉(zhuǎn)移酶催化和 p 位點(diǎn)的起始氨基酸和肽?;Y(jié)合形成肽鍵。trnaf 或空載rna 仍留在 p 位點(diǎn),最后核糖體沿 mrna5-3方向移動

30、一個密碼子的距離,最后 a 位點(diǎn)上延長了一個氨基酸單位的肽酰-trna 移動到 p 位點(diǎn)。延伸過程需要延伸因子,ef-tu,ef-ts, 由 gtp 水解供能。4. 肽鏈合成的終止,當(dāng)核糖體轉(zhuǎn)移至終止密碼子 uaa/uag/uga 時,終止因子 rf-1,rf-2, 識別并結(jié)合終止密碼子,同時將肽酰轉(zhuǎn)移酶的活性變?yōu)樗庾饔?,水?p 位點(diǎn)的肽酰-trna, 釋放肽鏈,轉(zhuǎn)錄終止。真核基因組特點(diǎn)真核生物基因組分子質(zhì)量大,有多個復(fù)制起始位點(diǎn),各個復(fù)制子大小不一。真核基因的 dna 和組蛋白形成染色質(zhì),被包裹在核膜內(nèi),核外也有遺傳組分,即線粒體 dna。存在重復(fù)序列。真核基因由一個結(jié)構(gòu)基因和調(diào)節(jié)基因組

31、成,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為單順反子 mrna.非編碼序列所占比例高,占 90%以上。真核基因組基因的編碼序列是不連續(xù)的即斷裂基因。存在可移動的 dna 序列即自私基因。結(jié)構(gòu)功能相關(guān)的基因一起組成各種基因家族。原核生物基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)原核基因組通常為為雙鏈環(huán)狀 dna 分子。只有一個復(fù)制起始點(diǎn)。無重疊基因。無內(nèi)含子。有操縱子序列,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為多順反子 mrna.結(jié)構(gòu)基因?yàn)閱慰截悺?013.07.07北方民族大學(xué)有很多調(diào)控序列,如啟動子、終止子等。存在可移動的插入序列和轉(zhuǎn)座因子等 dna 序列。編碼序列所占比例大。成熟的真核生物 mrna 特點(diǎn):5端存在帽子結(jié)構(gòu);3端存在 poly(a)尾巴;無內(nèi)含子;部分堿基發(fā)

32、生甲基化。密碼子(遺傳密碼)的特點(diǎn):三聯(lián)密碼;無標(biāo)點(diǎn)符號;不重疊;通用性和變異性;簡并性;起始密碼子和終止密碼子原核生物蛋白質(zhì)合成(翻譯)分為四個階段:氨基酸的活化、肽鏈合成的起始、延伸和終止。氨基酸的活化:活化反應(yīng)由氨酰-trna 合成酶催化,最終氨基酸連接在trna3端 amp 的 3-oh 上,合成氨酰-trna。 肽鏈合成的起始:首先 if1 和 if3 與 30s 亞基結(jié)合,以阻止大亞基的結(jié)合;接著 if2 和 gtp 與小亞基結(jié)合,以利于隨后的起始 trna 的結(jié)合;形成的小亞基復(fù)合物經(jīng)由核糖體結(jié)合點(diǎn)附著在 mrna 上,起始 trna 和 aug 起始密碼子配對并釋放 if3 并

33、形成 30s 起始復(fù)合物。大亞基與 30s 起始復(fù)合物結(jié)合,替換 if3 和 if2+gdp,形成 70s 起始復(fù)合物,這樣在 mrna 正確部位組裝成完整核糖體。 肽鏈的延伸:分三步進(jìn)行,進(jìn)位、轉(zhuǎn)肽、移位。 肽鏈合成的終止與釋放:釋放因子識別終止密碼子,并在 if3 作用下, 促使肽酰轉(zhuǎn)移酶在肽鏈上加上一個水分子并釋放肽鏈。真核生物基因組的特點(diǎn):1) 真核生物基因組的相對分子質(zhì)量大,具有多個復(fù)制起點(diǎn),每個復(fù)制子大小不一。2) 真核生物基因組 dna 與組蛋白等構(gòu)成染色質(zhì),被包裹在核膜內(nèi),核外也存在遺傳組分, 如線粒體 dna.3) 真核生物基因由一個結(jié)構(gòu)基因與相關(guān)的調(diào)控區(qū)組成,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為單順

34、反子 mrna.4) 存在大量重復(fù)序列,或集中成簇或分散于基因間。5) 基因組大部分為非編序列,占 90%以上。6) 基因編碼區(qū)一般是不連續(xù)的,即斷裂基因。7) 功能相關(guān)的基因構(gòu)成各種基因家族。8) 存在可移動的 dna 序列,即自私基因。原核生物(細(xì)菌)基因組特點(diǎn):原核基因組通常僅有一條環(huán)狀雙鏈 dna 分子組成。 基因組中只有 1 個復(fù)制起始點(diǎn)。2013.07.07北方民族大學(xué)具有操縱子結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄的 rna 為多順反子。一般無重疊基因。無內(nèi)含子。編碼蛋白質(zhì)的 dna 在基因組中所占比例較大。結(jié)構(gòu)基因?yàn)閱慰截悺;蚪M dna 具有多種調(diào)控區(qū),如復(fù)制起始區(qū)、復(fù)制終止區(qū)、轉(zhuǎn)錄啟動子等序列。存在插

35、入序列和轉(zhuǎn)座子等可移動的 dna 序列。原核生物(細(xì)菌) rna(基因)轉(zhuǎn)錄過程:l 起始階段:由全酶上的 因子辨認(rèn)結(jié)合在 dna 模板上的-35 區(qū),然后移向-10區(qū)并跨入轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn),局部 dna 解鏈,以 dna 的一條鏈為模板,ntp 為原料,按堿基互補(bǔ)配對原則,由 pppa 或 pppg 啟動轉(zhuǎn)錄。l 轉(zhuǎn)錄延長:起始后 因子離開,核心酶構(gòu)象改變,沿 dna 模板 35方向進(jìn)行聚合作用使鏈延長,轉(zhuǎn)錄生成 dna-rna 雜交雙鏈,由于 dna-rna 雙鏈比 dna-rna 雜交雙鏈更穩(wěn)定,隨后 dna 互補(bǔ)鏈取代 rna 鏈,恢復(fù) dna 雙螺旋結(jié)構(gòu)。l 轉(zhuǎn)錄終止:當(dāng)模板上出現(xiàn)終止信號

36、,轉(zhuǎn)錄便自行終止,依據(jù)是否需要蛋白質(zhì)因子的參與,原核生物轉(zhuǎn)錄終止分為非依賴 rho 因子和依賴 rho 因子兩大類。真核生物 rna(基因)轉(zhuǎn)錄過程真核生物轉(zhuǎn)錄起始時,rna 聚合酶不直接與模板結(jié)合。各種轉(zhuǎn)錄因子相互作用結(jié)合到 tata 盒上,rna 聚合酶再結(jié)合上去形成轉(zhuǎn)錄起始前化合物。轉(zhuǎn)錄的延長中有核小體移位和解聚現(xiàn)象。轉(zhuǎn)錄的終止伴隨有 rna 的加尾修飾。轉(zhuǎn)錄結(jié)束后,需經(jīng)過加工,轉(zhuǎn)移到細(xì)胞質(zhì)才開始翻譯。真核生物基因表達(dá)調(diào)控主要的七個層次:染色體水平上的結(jié)構(gòu)變化與基因活化。轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控,如基因的開與關(guān),轉(zhuǎn)錄效率的高與低。rna 加工水平上的調(diào)控,包括對初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的剪接、修飾、活化、編

37、輯等。轉(zhuǎn)錄后加工產(chǎn)物在從細(xì)胞核向細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)中的調(diào)控。翻譯水平的控制,對哪一種 mrna 結(jié)合核糖體進(jìn)行翻譯的選擇及蛋白質(zhì)合成量的控制。蛋白質(zhì)合成后選擇性的被激活的控制,蛋白質(zhì)和酶分子水平上的剪切、活化水平的控制??刂?mrna 選擇性的降解的調(diào)控。真核生物基因表達(dá)調(diào)控的特點(diǎn):多層次。個體發(fā)育復(fù)雜。正調(diào)控占主導(dǎo)。轉(zhuǎn)錄與翻譯間隔進(jìn)行。2013.07.07北方民族大學(xué)試述乳糖操縱子的調(diào)控機(jī)制答:(1)、乳糖操縱子的組成:大腸桿菌乳糖操縱子含 z、y、a 三個結(jié)構(gòu)基因,分別編碼-半乳糖苷酶、透酶和半乳糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶,此外還有一個操縱序列o, 一個啟動子 p 和上游的分解代謝物基因激活蛋白(cap)結(jié)合

38、位點(diǎn),構(gòu)成乳糖操縱子的調(diào)控區(qū)。在操縱子的上游還有一個調(diào)節(jié)基因 i,編碼一種阻遏蛋白,后者可與 o 序列結(jié)合而使操縱子處于關(guān)閉狀態(tài)。(2) 、乳糖操縱子的負(fù)性調(diào)節(jié):當(dāng)細(xì)菌以葡萄糖為能源時,i 基因編碼一種阻遏蛋白, 同等學(xué)力分子生物學(xué)考試 g 蛋白偶聯(lián)受體氨基酸的類型、.與 o 序結(jié)合,阻礙 rna 聚合酶 與p 序列結(jié)合和向結(jié)構(gòu)基因移動,而抑制結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄。(3) 、乳糖操縱子的正性調(diào)節(jié):當(dāng)細(xì)菌只能以乳糖為能源時,乳糖轉(zhuǎn)變?yōu)榘肴樘牵笳吲c阻遏蛋白結(jié)合,使其構(gòu)象變化而不能結(jié)合 o 序列,從而誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄過程。同時,細(xì)胞內(nèi)的 camp 的含量升高,camp 與 cap 結(jié)合,使 cap 結(jié)合到cap

39、位點(diǎn)上,促進(jìn)轉(zhuǎn)錄過程。乳糖操縱子控制模型的主要內(nèi)容及其調(diào)控機(jī)制主要內(nèi)容:z、y、a 基因的產(chǎn)物由同一條多順反子的 mrna 分子所編碼;該 mrna 分子的啟動區(qū)(p)位 于阻遏基因(i)與操縱區(qū)(o)之間,不能單獨(dú)起始半乳糖苷酶和透過酶基因的高效表達(dá);操縱區(qū)是 dna 上的一小段序列,是阻遏物結(jié)合的位點(diǎn);當(dāng)阻遏物與操縱區(qū)結(jié)合時,lac mrna 的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制; 誘導(dǎo)物通過與阻遏物結(jié)合,改變其三維構(gòu)象,使之不能與操縱區(qū)結(jié)合,從而激活 lac mrna 能夠合成。調(diào)控機(jī)制:a:阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控:當(dāng)大腸桿菌在沒有乳糖的環(huán)境中生存時,lac 操縱子處于阻遏狀態(tài)。r 基因在其自身的啟動子控制下,

40、低水平、組成性表達(dá)產(chǎn)生阻遏蛋白 r,每個細(xì)胞中僅維持約 10 個分子的阻遏蛋白。r 以四聚體形式與操縱子結(jié)合,阻礙了 rna 聚合酶與啟動子 plac 的結(jié)合,阻止了基因的轉(zhuǎn)錄起動。r 的阻遏作用不是絕對的, r 與偶爾解離,使細(xì)胞中還有極低水平的 半乳糖苷酶及透過酶的生成。當(dāng)有乳糖存在時,乳糖受 半乳糖苷酶的催化轉(zhuǎn)變?yōu)閯e乳糖,與 r 結(jié)合, 使 r 構(gòu)象變化,r 四聚體解聚成單體,失去與的親和力,與解離,基因轉(zhuǎn)錄開放,使 半乳糖苷酶在細(xì)胞內(nèi)的含量可增加 1000 倍。這就是乳糖對 lac 操縱子的誘導(dǎo)作用。b、cap 的正調(diào)控細(xì)菌中的 camp 含量與葡萄糖的分解代謝有關(guān),當(dāng)細(xì)菌利用葡萄糖分

41、解產(chǎn)生能量時,camp 生成少而分解多,camp 含量低;相反,當(dāng)環(huán)境中無葡萄糖可供利用時,camp 含量就升高。細(xì)菌中有一種能與 camp 特異結(jié)合的 camp 受體蛋白 crp(camp receptor protein),當(dāng) crp 未與 camp 結(jié)合時它是沒有活性的, 當(dāng) camp 濃度升高時,crp 與 camp 結(jié)合并發(fā)生空間構(gòu)象的變化而活化,稱為cap(crp-camp activated protein),能以二聚體的方式與特定的 dna 序列結(jié)合。在lac 操縱子的啟動子 plac 上游端有一段序列與 plac 部分重疊的序列,能與 cap 特異結(jié)合,稱為 cap 結(jié)合位點(diǎn)

42、(cap binding site)。cap 與這段序列結(jié)合時,可增強(qiáng) rna 聚合酶的轉(zhuǎn)錄活性,使轉(zhuǎn)錄提高 50 倍。相反,當(dāng)有葡萄糖可供分解利用時,camp 濃度降低,crp 不能被活化,lac 操縱子的結(jié)構(gòu)基因表達(dá)下降。2013.07.07北方民族大學(xué)分子生物學(xué)的研究內(nèi)容:dna 重組技術(shù)?;虮磉_(dá)調(diào)控的研究。生物大分子結(jié)構(gòu)與功能的研究?;蚪M、功能基因組的研究。dna 雙螺旋模型的特征:主鏈:脫氧核糖和磷酸基通過 3,5,-磷酸二酯鍵連接形成骨架。堿基配對:dna 是反向平行的互補(bǔ)雙鏈,a 和t 互補(bǔ)配對形成兩個氫鍵; g 和 c 互補(bǔ)配對形成三個氫鍵。螺旋的參數(shù):堿基平面和螺旋軸垂直

43、,相鄰堿基距離 0.34nm,螺距為3.4nm,兩個相鄰堿基對之間繞螺旋軸旋轉(zhuǎn)夾角為 360,每圈 10 個堿基對。大溝和小溝:大溝寬 2.2nm,小溝寬 1.2nm.u基因與基因組的大?。夯虻拇笮≡诤艽蟪潭壬先Q于其所含的非編碼序列,即內(nèi)含子的數(shù)目和長度,由于內(nèi)含子通常比外顯子大的多,從而導(dǎo)致了整個基因比其編碼區(qū)域長很多。因此一個基因比它實(shí)際編碼蛋白質(zhì)的序列要大得多,與一個完整基因相比,真正編碼蛋白質(zhì)的序列很短,外顯子的大小與基因大小沒有必然聯(lián)系?;蚪M大小用全部 dna 堿基對的總數(shù)表示。一個單倍體基因組的 dna 含量總是恒定的,即 c 值。(真核、原核)dna 復(fù)制的酶體系:u dn

44、a 聚合酶:催化 dna 新鏈中脫氧核苷酸之間的聚合反應(yīng),不能催化兩個游離核苷酸之間的磷酸二酯鍵的形成,只能通過從 3端添加新的核苷酸來延長已存在的多核苷酸鏈。u 解旋酶:dna 復(fù)制時,親代 dna 雙鏈必須先解開雙螺旋成為單鏈分子,才能作為模板指導(dǎo)新鏈的合成,由 dna 解旋酶催化解鏈過程。u 引物酶:是特殊的 rna 聚合酶,有從頭合成新鏈的能力,能在單鏈模板上合成與之互補(bǔ)的短 rna 引物,再由 dna 聚合酶從引物的 3端開始 dna 鏈的合成。u dna 拓?fù)洚悩?gòu)酶:既能水解又能連接磷酸二酯鍵,解除 dna 解鏈過程中的纏繞、打結(jié)現(xiàn)象。u dna 連接酶:可在一條 dna 鏈的 3

45、端和另一條鏈的 5端之間生成磷酸二酯鍵,從而連接兩條鏈。不能作用于兩條單獨(dú)存在的 dna 鏈,只能連接 dna 雙鏈中一條鏈上缺口的兩個相鄰末端。2013.07.07北方民族大學(xué)原核、真核 dna 復(fù)制的區(qū)別:比較項(xiàng)目原核真核復(fù)制起點(diǎn)一般為單復(fù)制起點(diǎn)一般為多復(fù)制起點(diǎn)主要的酶dna 聚合酶dna 聚合酶 復(fù)制叉移動速度快,5kb/min慢,13kb/min復(fù)制的延伸無核小體的解聚及重新組裝有核小體的解聚及重新組裝復(fù)制終止復(fù)制叉相遇即終止端粒處大腸桿菌 dna 復(fù)制起始復(fù)合物的形成過程:首先 2040 個 dnaa 與 atp 結(jié)合形成 dnaa/atp 多聚體,連同 hu 蛋白一起結(jié)合在包含 4

46、 個 9 聚體的 oric 重復(fù)序列位點(diǎn)上形成起始復(fù)合物。大腸桿菌 dna 復(fù)制起始復(fù)合物各組分(哪些蛋白組成)及其作用:u dnaa:oric 的識別和解鏈;u dnab 和 dnac:解旋酶,解開雙鏈;u topii:復(fù)制叉的移動;u ssb:使單鏈穩(wěn)定;u dnag:合成引物。dna 復(fù)制的方式:形復(fù)制:(環(huán)狀雙鏈,雙向等速)復(fù)制從 oric(復(fù)制起點(diǎn))開始以順時針和逆時針雙向進(jìn)行,dna 在復(fù)制叉處兩條鏈解開,各自合成其互補(bǔ)鏈,中間產(chǎn)物形成形結(jié)構(gòu)。 滾環(huán)式復(fù)制:(單向)是復(fù)制環(huán)狀 dna 的一種模式,dna 聚合酶結(jié)合在一個缺口鏈的 3端繞環(huán)合成與模板鏈互補(bǔ)的 dna,每一輪都是新合成

47、 dna 取代前一輪合成的dna。復(fù)制中間產(chǎn)物形似字母 . d-環(huán)式復(fù)制:(單向)又稱取代環(huán)復(fù)制,兩條鏈合成不對稱,一條鏈先復(fù)制,另一條鏈保持單鏈而被取代,電鏡下呈 d-環(huán)形狀。(大多數(shù)線粒體 dna 以其復(fù)制)dna 復(fù)制的調(diào)控機(jī)制:l 原核生物的整個基因組上一般只有一個復(fù)制起始位點(diǎn),在 dna 復(fù)制整個過程中,只有復(fù)制起始受細(xì)胞周期的嚴(yán)格調(diào)控。l 真核細(xì)胞中 dna 復(fù)制受 3 個水平的調(diào)控:細(xì)胞生活周期水平的調(diào)控,許多細(xì)胞因子和外部因素參與此調(diào)控。染色體水平的調(diào)控,決定不同染色體或同一染色體不同部位的復(fù)制子均按一定順序在 s 期起始復(fù)制。復(fù)制子水平的調(diào)控,決定復(fù)制的起始與否。dna 的損

48、傷:又稱 dna 突變,指生物體生命過程中 dna 雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)生的任何改變包括, 單個堿基的改變(點(diǎn)突變);雙螺旋結(jié)構(gòu)異常扭曲(堿基缺失、插入和堿基二聚體)。2013.07.07北方民族大學(xué)dna 的損傷修復(fù):修復(fù)是指針對已發(fā)生的缺陷而進(jìn)行的補(bǔ)救機(jī)制。1) 直接修復(fù):以光修復(fù)為代表,通過光修復(fù)酶催化完成,需要 300600nm 波長照射即可活化,可使嘧啶二聚體分解為原來的非聚合狀態(tài),dna 恢復(fù)正常。2) 切除修復(fù):在一系列酶作用下,“切除修復(fù)系統(tǒng)識”別并切除掉 dna 分子中受損部分,然后在 dna 聚合酶作用下,以露出的單鏈為模板,合成新的互補(bǔ)鏈,最后由連接酶將缺口連接起來。3) 重組修

49、復(fù):先復(fù)制再修復(fù)。復(fù)制時,有損傷的部分模板被跳過,則新合成子鏈將有一段空缺。細(xì)胞從另一條沒有損傷的親代鏈上將相應(yīng)核苷酸序列片段移至這段子鏈缺口處, 被移去一段序列的親代再用其剛合成的子鏈為模板來填補(bǔ)空缺。4) 錯配修復(fù):用于提高復(fù)制的精確度,識別錯配形成的結(jié)構(gòu)異常,并去除錯配堿基對中錯誤加入的堿基,再通過 dna 聚合酶和 dna 連接酶的作用,合成正確配對的雙鏈 dna.5) sos 修復(fù):應(yīng)急性的修復(fù)方式,由于 dna 損傷廣泛至難以繼續(xù)復(fù)制,由此而誘發(fā)出一系列復(fù)雜的反應(yīng)。同源重組的分子模型(holliday 模型):同源重組分子模型是由 holliday 等在 1964 年提出的,hol

50、liday 模型能夠較好解釋同源重組現(xiàn)象。步驟如下:兩條同源染色體聯(lián)會。兩個同源 dna 分子之一發(fā)生雙鏈斷裂。斷裂后形成單鏈 3游離端,后者侵入對雙鏈 dna 內(nèi),尋找同源區(qū)域并配對結(jié)合, 產(chǎn)生短的鏈置換區(qū)。形成 holliday 中間體。通過 ruva 和 ruvb 引發(fā)分支遷移,產(chǎn)生異源雙鏈 dna通過 ruvc 形成拆分口,將四鏈 dna 復(fù)合體按不同方向拆分,形成片段重組體和拼接重組體。細(xì)菌的基因轉(zhuǎn)移和 dna 重組:細(xì)菌可以通過多種途徑進(jìn)行細(xì)胞間基因轉(zhuǎn)移,并通過基因重組以適應(yīng)隨時改變的環(huán)境。細(xì)菌基因轉(zhuǎn)移有四種機(jī)制:接合、轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)和細(xì)胞融合。轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座的特征:轉(zhuǎn)座不依賴 reca轉(zhuǎn)

51、座后靶序列重復(fù)轉(zhuǎn)座子有插入選擇性區(qū)域性優(yōu)先轉(zhuǎn)座具有排他性轉(zhuǎn)座有極性效應(yīng)活化臨近的沉默基因轉(zhuǎn)座子的分類:l 插入序列:以 is 表示,最簡單的轉(zhuǎn)座子。l 復(fù)合轉(zhuǎn)座子:以 tn 表示,結(jié)構(gòu)較大而復(fù)雜。2013.07.07北方民族大學(xué)轉(zhuǎn)座機(jī)制: 原核生物轉(zhuǎn)座作用的機(jī)制分為:復(fù)制型和非復(fù)制型兩類。 復(fù)制型:在相互作用時,轉(zhuǎn)座子被復(fù)制,因此轉(zhuǎn)座實(shí)體是原核轉(zhuǎn)座子的一個拷貝。轉(zhuǎn)座子中作為移動的部分被拷貝。一個拷貝保留在原點(diǎn),而另一個則插入到新位點(diǎn),復(fù)制型轉(zhuǎn)座涉及兩種類型的酶,轉(zhuǎn)座酶和拆分酶。 非復(fù)制型轉(zhuǎn)座:轉(zhuǎn)座因子直接從原來位置上轉(zhuǎn)座插入到新的位置并保留在插入位置上,這種轉(zhuǎn)座只需轉(zhuǎn)座酶的作用。非復(fù)制型轉(zhuǎn)座的

52、結(jié)果是在原來的位置上丟失了轉(zhuǎn)座因子,而在插入位置上增加了轉(zhuǎn)座因子,造成表型的變化。 真核生物轉(zhuǎn)座作用的機(jī)制:逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子。通過將 rna 轉(zhuǎn)錄成 dna 拷貝的能力而遷移,dna 拷貝同時被整合進(jìn)基因組的新位點(diǎn),反轉(zhuǎn)座作用出現(xiàn)在真核生物,所有反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子都有一個共同特點(diǎn),即在其插入位點(diǎn)上產(chǎn)生短的正向重復(fù)序列。花玉米顏色與轉(zhuǎn)座:ac-ds 系統(tǒng),即激活-解離系統(tǒng),是玉米轉(zhuǎn)座系統(tǒng)之一,ac 即激活因子,ds 即解離因子。無 ds,玉米呈紫色;無 ac,有 ds 時不轉(zhuǎn)座,可使鄰近的色素基因 c 斷裂或抑制。玉米無色。ac 使 ds 轉(zhuǎn)座離開 c 后,玉米呈花斑。rna 轉(zhuǎn)錄的一般特點(diǎn):轉(zhuǎn)錄具有選擇性,即只對基因組或 dna 分子中的編碼區(qū)進(jìn)

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