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文檔簡介
1、蛋白質(zhì)、糖蛋白與蛋白聚糖、脂蛋白、細胞信號傳導(dǎo)名詞解釋:1、構(gòu)型:指一個有機分子中各個原子特有的固定的空間排列。這種排列不經(jīng)過共價鍵的斷裂和重新形成是不會改變的。不同構(gòu)型之間相互轉(zhuǎn)化會涉及化學(xué)鍵的斷裂,構(gòu)型的改變往往使分子的光學(xué)活性發(fā)生變化。2、構(gòu)象:構(gòu)成分子的原子和基團因為化學(xué)鍵的旋轉(zhuǎn)而形成在三維空間的不同的排布、走向。不同的構(gòu)象之間可以相互轉(zhuǎn)化而不涉及化學(xué)鍵的破裂。構(gòu)象改變不會改變分子的光學(xué)活性。3、肽平面:肽鍵具有部分雙鍵性質(zhì)而不能自由旋轉(zhuǎn),這樣C、N原子同它們連接的O、H和兩個C共六個原子就被約束在一個剛性平面上,這個平面被稱為肽平面。4、基序或模體:相鄰的幾個二級結(jié)構(gòu)相互作用形成有規(guī)
2、則的組合體稱為超二級結(jié)構(gòu),是特殊的序列或結(jié)構(gòu)的基本組成單元,又稱為基序或模體。5、結(jié)構(gòu)域:蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu)進一步組合折疊成半獨立緊密的球狀結(jié)構(gòu)域。6、糖蛋白:在分子組成中以蛋白質(zhì)為主,其一定部位以共價鍵與若干糖鏈(約4%)相連所構(gòu)成的分子。7、蛋白聚糖:蛋白聚糖是一類由蛋白質(zhì)和糖胺聚糖通過共價鍵相連而成的化合物,其分子中的含糖量通常為50%90%。8、血脂:血漿所含的脂類統(tǒng)稱為血脂,它包括甘油三酯、磷脂、膽固醇及游離脂酸。9、血漿脂蛋白:在血漿中血脂與蛋白質(zhì)結(jié)合,形成血漿脂蛋白。10、載脂蛋白:血漿脂蛋白中蛋白質(zhì)部分稱為載脂蛋白。11、脂蛋白受體:脂蛋白受體是一類位于細胞膜上的糖蛋白,它們能
3、以高親和性的方式與其相應(yīng)的脂蛋白配體相互作用,介導(dǎo)細胞對脂蛋白的攝取和代謝,從而進一步調(diào)節(jié)血漿脂蛋白和血脂的水平。12、細胞通訊(cell communication):指一個細胞發(fā)出的信息通過介質(zhì)傳遞到另一個細胞產(chǎn)生相應(yīng)反應(yīng)的過程。13、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)(signal transduction):指外界信號(如光、電、化學(xué)分子)與細胞細胞表面受體作用,通過影響細胞內(nèi)信使的水平變化,進而引起細胞應(yīng)答反應(yīng)的一系列過程。14、第二信使:在細胞內(nèi)傳遞信息的小分子化學(xué)物質(zhì)稱為第二信使(secondary messenger) 。15、第三信使:負責(zé)細胞核內(nèi)、外信息傳遞的物質(zhì)稱為第三信使(third messe
4、nger) ,又稱為DNA結(jié)合蛋白。16、受體(receptor):是指存在于靶細胞膜上或細胞內(nèi)能特異識別與結(jié)合生物活性分子(配體),進而引起靶細胞生物學(xué)效應(yīng)的分子。17、配體(ligand):能與受體呈特異性結(jié)合的生物活性分子,包括細胞間信息物質(zhì)、藥物、維生素、毒物等。18、鈣調(diào)蛋白(CaM):是一種分子量為17kD,耐熱、耐酸的蛋白質(zhì),由148個氨基酸殘基構(gòu)成。一分子的鈣調(diào)蛋白可結(jié)合四分子的Ca2+。當(dāng)其與Ca2+結(jié)合后,可發(fā)生變構(gòu),從而激活依賴鈣調(diào)蛋白的蛋白激酶。19、IP3:為三磷酸肌醇,胞外信息分子與相應(yīng)質(zhì)膜G蛋白偶聯(lián)性受體結(jié)合,使G蛋白q、11、15、或16活化,從而使磷脂酶C(P
5、I-PLC)活化,后者作用于膜內(nèi)側(cè)4,5-二磷酰磷脂酰肌醇(PIP2)使之水解生成IP3及DG。20、PKC:存在于胞液中,可催化底物蛋白質(zhì)絲氨酸或蘇氨酸殘基的磷酸化,有12種同工酶。經(jīng)典的蛋白激酶C需在Ca2+,DAG和磷脂酰絲氨酸(PS)的存在下才能被激活。21、孤兒受體:是指存在細胞膜中的一類甾類或者腎甲狀腺類激素受體,但是還沒有找到相應(yīng)的配體,故稱之為孤兒受體。簡答題1、糖蛋白中聚糖與多肽鏈的連接方式 N-糖苷鍵型:寡糖鏈(GlcNAC的-羥基)與Asn的酰胺基、N-未端的a-氨基、Lys或Arg的W-氨基相連 O-糖苷鍵型:寡糖鏈(GalNAC的-羥基)與Ser、Thr和羥基賴氨酸、
6、羥脯氨酸的羥基相連。 S-糖苷鍵型:以半胱氨酸為連接點的糖肽鍵。 酯糖苷鍵型:以天冬氨酸、谷氨酸的游離羧基為連接點。2、簡述糖蛋白的生物學(xué)功能(1)糖蛋白攜帶某些蛋白質(zhì)代謝去向的信息。糖蛋白寡糖鏈末端的唾液酸殘基,決定著某種蛋白質(zhì)是否在血流中存在或被肝臟除去的信息。(2)寡糖鏈在細胞識別、信號傳遞中起關(guān)鍵作用。淋巴細胞正常情況應(yīng)歸巢到脾臟,而切去唾液酸后,結(jié)果競歸巢到了肝臟。在原核中表達的真核基因,無法糖基化。(3)有些糖蛋白的糖對于糖蛋白自身成機體起著保護作用或潤滑作用。(4)細胞表面的糖蛋白形成細胞的糖衣、參與細胞的粘連,這在胚和組織的生長、發(fā)育以及分化中起著關(guān)鍵性作用。3、糖蛋白分子中聚
7、糖的功能(一)聚糖可影響糖蛋白生物活性Ø 保護糖蛋白不受蛋白酶的水解,延長其半衰期;Ø 蛋白質(zhì)的聚糖也可起屏障作用,影響糖蛋白的作用;Ø 聚糖還可以避免蛋白質(zhì)中抗原決定簇被免疫系統(tǒng)識別而產(chǎn)生抗體。 (二)糖蛋白聚糖加工可參與新生肽鏈折疊 Ø 糖蛋白的糖基化與肽鏈的折疊及分揀密切相關(guān) 。Ø 參與新生肽鏈的折疊并維持蛋白質(zhì)的正確的空間構(gòu)象; (三)糖蛋白聚糖可參與維系亞基聚合具有功能的糖蛋白的二聚體,往往依靠糖-蛋白或糖-糖相互作用維系亞基的聚合和構(gòu)象。 (四)聚糖對蛋白質(zhì)在細胞內(nèi)的分揀、投送和分泌中的作用有些蛋白質(zhì)的投送信號存在于肽鏈內(nèi),但有些是
8、與其糖鏈有關(guān)。 4、簡述糖蛋白、蛋白聚糖在結(jié)構(gòu)、功能上的異同 在結(jié)構(gòu)上:糖蛋白與蛋白聚糖都是蛋白質(zhì)與糖類以共價鍵結(jié)合形成復(fù)合物,其中糖蛋白分子中的含糖量為2% 50%,蛋白聚糖的含糖量為50% 90%。糖蛋白分子由聚糖和核心蛋白組成,蛋白聚糖分子通常由糖胺聚糖和核心蛋白兩部分組成。糖蛋白分子中糖的數(shù)目常為一至數(shù)百個,蛋白聚糖分子中糖的數(shù)目巨大,遠遠超過糖蛋白中糖的含量。糖蛋白中糖的結(jié)構(gòu)形式為由若干單糖連接而成的糖鏈與氨基酸側(cè)鏈相連,蛋白聚糖的結(jié)構(gòu)形式通常由若干二糖重復(fù)單位構(gòu)成的糖鏈與氨基酸側(cè)鏈相連。在功能上:糖蛋白攜帶某些蛋白質(zhì)去向的信息;寡糖鏈細胞識別、信號傳遞過程中起關(guān)鍵作用;有些糖蛋白的
9、糖對于糖蛋白自身起著保護作用或潤滑作用;細胞表面的糖蛋白還形成細胞的糖衣、參與細胞的粘連,這在胚胎和組織的生長、發(fā)育以及分化中起著關(guān)鍵性的作用。蛋白聚糖最主要的功能是構(gòu)成細胞間的基質(zhì)分布于任何組織中;某些蛋白聚糖還有特殊作用,如肝素是重要的抗凝劑,透明質(zhì)酸可以吸附大量水分子,使組織疏松,細胞易于移動,等等。5、簡述血漿脂蛋白的代謝及功能血漿脂蛋白包括乳糜微粒(CM)、極低密度脂蛋白(VLDL)、低密度脂蛋白(LDL)和高密度脂蛋白(HDL)。人體內(nèi)血漿脂蛋白的代謝途徑主要有三條:(1)外源性代謝途徑:指小腸利用飲食攝入的膽固醇和甘油三酯等合成CM及其代謝過程;(2)內(nèi)源性代謝途徑:指由肝臟合成
10、VLDL,后者轉(zhuǎn)變?yōu)镮DL和LDL,LDL被肝臟或其他器官代謝的過程;(3)膽固醇逆向轉(zhuǎn)運途徑:指HDL代謝過程,即將膽固醇帶到肝臟并代謝的過程。功能:CM參與轉(zhuǎn)運外源性甘油三酯及膽固醇酯;VLDL參與轉(zhuǎn)運內(nèi)源性甘油三酯;LDL將肝合成的內(nèi)源性膽固醇轉(zhuǎn)運至肝外組織;而HDL與LDL相反,它主要是將組織的內(nèi)源性膽固醇轉(zhuǎn)運至肝臟代謝。6、簡述載脂蛋白的基因結(jié)構(gòu)人apoaA、apoA、apoA、apoC、apoC及apoE基因的結(jié)構(gòu)頗為相似:(1)除apoA基因缺少第一個內(nèi)含子外,其余載脂蛋白基因均含有四個外顯子和三個內(nèi)含子,內(nèi)含子插入到基因組的5非翻譯區(qū);內(nèi)含子插入到緊鄰信號肽基因酶切位點的密碼區(qū)
11、;內(nèi)含子則插入到成熟肽基因酶切位點的密碼區(qū)。(2)它們的前3個外顯子核苷酸長度非常接近,總mRNA長度差異主要是由于第四個外顯子不同而造成的。7、簡述Lp(a)的結(jié)構(gòu)與功能Lp(a)的脂質(zhì)成分類似于LDL,但其所含的載脂蛋白部分除一分子apoB100外,還含有一分子apo(a),Lp(a)的內(nèi)核為疏水性脂質(zhì),外周包裹著蛋白質(zhì)和磷脂復(fù)合物。功能:有研究表明,Lp(a)是動脈粥樣硬化的獨立危險因素之一,Lp(a)在血液中的含量分布差別極大(0100mg/dL);當(dāng)Lp(a) 30 mg/dL 時,表明As危險性增高。所以血液中Lp(a)的水平的高低可以作為As危險因素的檢測指標(biāo)之一。8、簡述LDL
12、受體的基因缺陷及與疾病的關(guān)系 LDL受體缺陷是常染色體顯性遺傳病,為LDL受體基因突變所致,患者如為純合子則細胞膜LDL受體完全缺失;如為雜合子則細胞膜LDL受體數(shù)目減少一半,LDL受體缺陷有三種不同的情況:無受體結(jié)合活性,稱R0;受體結(jié)合活性降低(為正常的1% 10%),稱Rb-;受體活性正常,但不能內(nèi)吞,即LDL不能進入細胞。LDL受體缺陷將導(dǎo)致血漿LDL分解減少,而IDL轉(zhuǎn)化為LDL的量增加,使血漿LDL顯著增加,是引起家族性高膽固醇血癥的重要原因。9、受體作用的特點高度特異性、高度親和力、可逆性、可飽和性、可被調(diào)節(jié)性、協(xié)同性與放大效應(yīng)。10、簡述受體測定的基本原理用放射性核素標(biāo)記的配體
13、,使之選擇性結(jié)合于受體的結(jié)合部位,然后用離心、過濾等方法快速分離與受體結(jié)合及游離的配體,進行放射量測定,即可獲得受體的最大結(jié)合量、親和力大小,有無協(xié)同效應(yīng)等。配體與受體的結(jié)合是可逆的,可飽和的,其反應(yīng)式為: (1)L為游離配體濃度 R為游離受體濃度 LR為配體-受體復(fù)合物濃度k1為正向反應(yīng)速率常數(shù), k2為反向反應(yīng)速率常數(shù)當(dāng)反應(yīng)達到平衡時,正反應(yīng)速率等于反向反應(yīng)速率,即k1LR= k2LR (2)令Kd=k2k1, 則Kd=LRLR (3) 當(dāng)受體的一半與配體結(jié)合時,即LR=R,則Kd=L,所以Kd是配體與受體反應(yīng)達到半飽和時配體的濃度。由(3)式可得,Kd越小,則LR解離越少,即受體與配體的
14、親和力越大,反之,Kd越大,表明LR解離大,表明配體與受體的親和力越小。因此,Kd又稱為受體的親和力常數(shù)。 由(3)式可得: LRL=-LR Kd + BmaxKd作圖:從上圖的Scatchard作圖可測得:受體的最大結(jié)合容量Bmax,代表受體的數(shù)量;受體的親和力常數(shù)Kd值;受體與配體的結(jié)合有無協(xié)同效應(yīng)。11、簡述G蛋白的概念、分類及及在細胞信號傳導(dǎo)中的作用G蛋白又稱鳥苷酸結(jié)合蛋白,是一類能與鳥苷酸可逆結(jié)合的膜蛋白,是由、和三個亞基組成的異三聚體,和亞基總是緊密結(jié)合在一起作為一個功能單位G 。G蛋白偶聯(lián)受體的結(jié)構(gòu)特點:這些受體均為具有7次跨膜的螺旋結(jié)構(gòu)的7螺旋跨膜蛋白,肽鏈形成7個由疏水氨基酸
15、組成的-螺旋,反復(fù)7次穿過細胞的脂質(zhì)雙層膜。這類受體在結(jié)構(gòu)上均為單體蛋白,氨基末端位于細胞外表面,羧基末端在胞膜內(nèi)側(cè)。完整的肽鏈要反復(fù)跨膜七次,稱為七次跨膜受體。G蛋白在細胞信號傳導(dǎo)中的作用有:(1)調(diào)節(jié)腺苷酸環(huán)化酶的活性;(2)調(diào)節(jié)視網(wǎng)膜cGMP磷酸二酯酶的活性;(3)調(diào)節(jié)磷脂酶C的活性;(4)調(diào)節(jié)離子通道的功能。12、簡述cAMP-PKA、IP3-DG-PKC及受體酪氨酸蛋白激酶信號傳遞途徑cAMP-PKA信號傳遞途徑:IP3-DG-PKC信號傳遞途徑:激素+受體G蛋白PI-PLCIP3+DGIP3誘導(dǎo)釋放Ca2+,Ca2+促進DG激活PKC底物蛋白磷酸化影響細胞代謝或基因表達受體酪氨酸蛋
16、白激酶信號傳遞途徑:生長因子酪氨酸蛋白激酶受體Grb2(含SH2/SH3)Sos(GEF活性) Ras·GDP(無活性) Ras·GTP(有活性) MAP蛋白激酶 MEK(MAPKK) Raf(絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶) (絲/蘇氨酸蛋白激酶 (酪/蘇氨酸蛋白激酶) 醫(yī)學(xué)常用技術(shù)名詞解釋1、電泳:是指帶電粒子在電場中向與自身所帶電荷相反的電極移動的現(xiàn)象。2、電泳技術(shù) : 利用電泳現(xiàn)象對混合物進行分離分析的技術(shù)。3、電滲現(xiàn)象:液體在電場中對于一個固體支持物的相對移動,稱為電滲現(xiàn)象。4、不連續(xù)凝膠電泳:指在電泳系統(tǒng)中采用了兩種或兩種以上的緩沖液、pH值和孔徑,不連續(xù)電泳能使稀的樣
17、品在電泳過程中濃縮成層,從而提高分辨能力。5、核酸分子雜交 : 是在DNA變性和復(fù)性的基礎(chǔ)上建立起來的一種分子生物學(xué)技術(shù)。 其原理是具有一定同源性的兩條核酸單鏈在一定條件下根據(jù)堿基互補的原則可以形成雙鏈(堿基對之間非共價健形成穩(wěn)定的雙鏈)。6、核酸探針:是指用放射性核素、生物素或其他活性物質(zhì)標(biāo)記而便于檢測的,能與特定的核酸序列發(fā)生特異性互補的已知DNA或RNA片段。7、cDNA 探針:cDNA探針是指互補于mRNA的DNA分子,是由逆轉(zhuǎn)錄酶催化而產(chǎn)生的。該酶以RNA為模板,根據(jù)堿基配對原則,按照RNA的核苷酸順序合成DNA(其中U與A配對), 無內(nèi)含子和非編碼序列。 8、原位雜交:不須提取DN
18、A或RNA。直接用培養(yǎng)/采集的細胞(涂載玻片上)、組織切片(固定載玻片上)和細菌菌落(復(fù)印至濾膜上)與標(biāo)記核酸探針雜交。 可測知特定基因的存在或表達狀況。還可觀察被測基因在細胞內(nèi)或染色體上的定位。9、Southern 印跡雜交:是一種將待測DNA酶切、電泳、轉(zhuǎn)移(?。┎⒐潭ㄔ诠滔嘀С治锷?,用已知DNA探針進行檢測的方法。10、Northern印跡雜交:這是一種將待測RNA從瓊脂糖凝膠中轉(zhuǎn)印并固定到膜上、然后再與已知的DNA或RNA探針雜交的方法。11、PCR:PCR技術(shù)實際上是在模板DNA,引物和4種脫氧核糖核苷三磷酸(dNTP)存在的條件下依賴DNA聚合酶的酶促合成反應(yīng)。12、平臺期(Pla
19、teau):PCR反應(yīng)初期,靶序列DNA片段的增加呈指數(shù)形式,隨著PCR產(chǎn)物的逐漸積累,被擴增的DNA 片段而進入線性增長期或靜止期, 即出現(xiàn)“停滯效應(yīng)” ,這種效應(yīng)稱平臺期(Plateau)。13、Ct值:每個反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號到達設(shè)定的域值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。14、DNA芯片:DNA芯片是指通過微加工技術(shù)將大量的DNA以預(yù)先設(shè)計的排列方式有序地固定在載體表面,形成儲存有大量信息的DNA陣列。該陣列與用熒光標(biāo)記的核酸雜交后,通過檢測每個探針分子雜交信號的強度,從而獲取樣品分子的數(shù)量和序列信息。 15、基因敲除:指利用DNA體外重組技術(shù)構(gòu)建基因敲除的打靶載體,然后根據(jù)同源重組的原理將打靶載體導(dǎo)入
20、受體細胞中,使特定基因活性喪失。16、RNA干涉(RNAi):由短雙鏈RNA(21-23nt)誘導(dǎo)的同源RNA降解的過程。簡答題1、簡述凝膠電泳的基本原理不同的大分子物質(zhì)在不同的PH條件下帶電荷不同,將一定PH的電泳緩沖液制成凝膠置于電場中,那么帶有電荷的大分子物質(zhì)會向所帶電荷性質(zhì)相反的方向移動(即帶正電荷的大分子向負極移動,帶負電荷的大分子向正極移動),根據(jù)U=/E=Q/6 ,不同大小和構(gòu)象的大分子由于所受到的來自電場的驅(qū)動力和來自凝膠分子篩網(wǎng)孔的阻力差異,具有不同的遷移率,以此達到分離的目的。2、影響電泳速度的外界因素電場強度:電場強度越高,帶電顆粒移動速度越快;溶液的PH值:溶液的pH值
21、決定了帶電顆粒解離的程度,也決定了物質(zhì)所帶凈電荷性質(zhì)和多少;溶液的離子強度:電泳液中的離子增加會使電泳遷移率降低;電滲現(xiàn)象:液體在電場中對于一個固體支持物的相對移動,稱為電滲現(xiàn)象,當(dāng)液體的電滲方向與帶電粒子的遷移方向一致時,會增加粒子的遷移速度,反之,則會降低粒子的遷移速度。溫度的影響:電泳過程中由于通電產(chǎn)生焦耳熱,熱對電泳有很大的影響, 溫度每升高1,遷移率約增加2.4%。;支持物的影響:支持物要求均勻和吸附力小。3、簡述核酸分子雜交的基本原理核酸分子雜交是在核酸變性及復(fù)性原理基礎(chǔ)上建立的實驗技術(shù),是指具有一定同源序列的兩條核酸單鏈在一定條件下按堿基互補原則退火形成異質(zhì)雙鏈的過程。雜交的雙方
22、為待測核酸序列和探針,待測核酸序列為克隆的DNA片段 、未克隆化的基因組DNA或細胞總RNA, mRNA。4、簡述PCR的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過程,PCR由變性-退火-延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成: 1): 模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至94左右后,雙鏈DNA變性解離為單鏈DNA ; 2): 模板DNA與引物的退火(復(fù)性):溫度降至55左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合; 3): 引物的延伸:DNA模板-引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復(fù)制鏈。重復(fù)循環(huán)變性-退火
23、-延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需24分鐘, 23小時就能將目的基因擴增放大幾百萬倍。 5、PCR擴增產(chǎn)物的分析 1):凝膠電泳分析:PCR產(chǎn)物電泳,EB溴乙錠染色紫外儀下觀察,初步判斷產(chǎn)物的特異性。PCR產(chǎn)物片段的大小應(yīng)與預(yù)計的一致。 2): 酶切分析:根據(jù)PCR產(chǎn)物中限制性內(nèi)切酶的位點,用相應(yīng)的酶切、獲得符合理論的片段,此法既能進行產(chǎn)物的鑒定,還能進行變異性研究。 3): 分子雜交:分子雜交是檢測PCR產(chǎn)物特異性的有力證據(jù),也是檢測PCR 產(chǎn)物堿基突變的有效方法。 4):核酸序列分析:是檢測PCR產(chǎn)物特異性的最可靠方法。 6、
24、載體及其條件 有復(fù)制子(replicon),能自主穩(wěn)定復(fù)制 多克隆位點(multiple cloning site,MCS) 有篩選標(biāo)志 表達型載體還應(yīng)具備完整的轉(zhuǎn)錄單位 插入容量大 分子量小,拷貝多 安全7、基因克隆的基本過程 限制性內(nèi)切酶分別消化目的基因和載體 DNA連接酶連接目的基因和載體 將連接好的環(huán)狀DNA導(dǎo)入宿主細胞 篩選并擴增后獲得重組克隆基因組學(xué)與蛋白質(zhì)組學(xué)名詞解釋1、基因組:泛指一個有生命體、病毒或細胞器的全部遺傳物質(zhì),包括基因和基因間區(qū)域。包括原核生物基因組、真核生物基因組和病毒基因組。2、基因組學(xué):就是發(fā)展和應(yīng)用DNA制圖、測序新技術(shù)以及計算機程序,分析生命體全部基因組結(jié)
25、構(gòu)和功能。3、結(jié)構(gòu)基因組學(xué):是以全基因組為研究對象,進行基因作圖、序列分析、基因鑒定。4、蛋白質(zhì)組:是指一個基因組、一種生物、一種細胞或組織所表達的全套蛋白質(zhì)。5、蛋白質(zhì)組學(xué):蛋白質(zhì)組學(xué)是在整體水平上研究細胞內(nèi)蛋白質(zhì)組成及其活動規(guī)律的科學(xué).簡答題1、結(jié)構(gòu)基因組學(xué)的4種圖譜(1)遺傳圖譜:是利用人類基因組中的一些特殊位點作為遺傳標(biāo)志而進行的基因組分區(qū)。即通過計算遺傳標(biāo)記的重組率,以重組率的大小反映遺傳標(biāo)志間的相對距離繪制遺傳圖譜。(2)物理圖譜:是利用已知序列的DNA片段為基因組分區(qū),位點距離用bp表示。常見的作圖標(biāo)志有限制性內(nèi)切酶的酶切位點、基因、序列標(biāo)簽位點。(3)轉(zhuǎn)錄圖譜:是指轉(zhuǎn)錄體(RN
26、As)或其反轉(zhuǎn)錄而成的cDNA在基因組中的位置,又稱基因圖譜或表達圖譜(expression map);是根據(jù)組織細胞中可表達片段標(biāo)簽(expressed sequence tags, EST)繪制的圖譜; 是將mRNA逆轉(zhuǎn)錄合成的cDNA或EST的部分cDNA片段作為“探針”與基因組DNA進行分子雜交, 標(biāo)記轉(zhuǎn)錄基因,繪制出可表達基因的轉(zhuǎn)錄圖。(4)序列圖譜:序列圖譜(sequence map)是人類基因組的全部核苷酸的排列順序。將人類基因組DNA分段克隆,然后逐段進行序列分析,在按標(biāo)志將各重疊片段拼接,構(gòu)成完整的基因組DNA序列圖。2、HGP在醫(yī)學(xué)上的意義基因結(jié)構(gòu)和功能的研究;基因組信息與
27、疾病易感性的研究;基因組與癌癥研究;疾病的遺傳背景;藥物基因組學(xué)的研究。3、白質(zhì)組學(xué)三大基本支撐技術(shù)二維聚丙烯酰胺凝膠電泳技術(shù)計算機圖象分析和大規(guī)模數(shù)據(jù)處理技術(shù)生物質(zhì)譜技術(shù)4、質(zhì)組學(xué)研究的主要技術(shù)路線(1)樣品選擇和處理(2)蛋白質(zhì)分離(3)蛋白質(zhì)的識別和鑒定其流程圖為:蛋白質(zhì)樣品的制備 2-DE 圖像分析若有不明斑點,則繼續(xù)切割該不明斑點 生物質(zhì)譜 肽指紋圖譜 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫搜索若為新的蛋白質(zhì)串聯(lián)質(zhì)譜蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫搜索仍沒有該蛋白質(zhì)的信息蛋白質(zhì)測序基因突變與生物信息學(xué)名詞解釋1、基因突變:指基因組DNA分子中發(fā)生堿基的增添、缺失或改變而引起的基因結(jié)構(gòu)的改變,進而引起遺傳表型的改變。2、生物信息學(xué)
28、:生物信息學(xué)是一門交叉科學(xué),它包含了生物信息的獲取、處理、存儲、分發(fā)、分析和解釋等在內(nèi)的所有方面,它綜合運用數(shù)學(xué)、計算機科學(xué)和生物學(xué)的各種工具,來闡明和理解大量數(shù)據(jù)所包含的生物學(xué)意義。簡答題1、述基因突變的分類和特性(1)根據(jù)基因突變的DNA堿基改變分類:點突變:DNA被化學(xué)修飾或復(fù)制時發(fā)生錯配 ,使一個堿基變成另一個堿基。插入突變:DNA鏈中插入1個或多個堿基(轉(zhuǎn)座子Tn),突變后可引起DNA序列閱讀框架改變。堿基缺失:DNA鏈中1個或多個堿基發(fā)生丟失,突變后可引起DNA序列閱讀框架改變。(2)根據(jù)基因突變的密碼效應(yīng)分類:同義突變:堿基被替代后沒有密碼子改變,其產(chǎn)物AA序列也無變化。錯義突變
29、:堿基序列的改變引起AA序列改變。無義突變:某個堿基改變使某個AA的密碼子成為蛋白質(zhì)合成的終止密碼子,從而使蛋白質(zhì)合成中斷?;蛲蛔兊奶匦裕海?) 突變的平行性、重演性和可逆性平行性:是指親緣關(guān)系相近的物種因遺傳基礎(chǔ)較近似而發(fā)生相似基因突變的現(xiàn)象。重演性:相同的基因突變可以在同種生物的不同個體間重復(fù)發(fā)生,稱為重演性??赡嫘裕夯蛲蛔兊陌l(fā)生方向是可逆的。(2) 突變的多方向性與復(fù)等位基因多方向性:指基因突變可以多方向發(fā)生,即基因內(nèi)部多個突變部位分別改變后會產(chǎn)生多種等位基因形式。復(fù)等位基因:位于同一基因位點上的多種等位基因。(3) 隨機性生物個體發(fā)育的任何時期 體細胞突變 不遺傳給后代 生殖細胞突
30、變遺傳給后代(4) 廣泛性和有害性(多數(shù))2、簡述生物信息學(xué)研究的主要內(nèi)容生物學(xué)數(shù)據(jù)的收集、存儲、管理與提供基因組序列信息的提取和分析功能基因組相關(guān)信息分析生物大分子結(jié)構(gòu)模擬和藥物設(shè)計生物信息分析的技術(shù)與方法研究應(yīng)用與發(fā)展研究染色體與基因表達調(diào)控名詞解釋1、核小體:染色質(zhì)在電子顯微鏡下呈串珠狀纖維,附著的顆粒稱為核小體,核小體是真核染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位。2、轉(zhuǎn)錄單位:轉(zhuǎn)錄時,RNA聚合酶從啟動子和轉(zhuǎn)錄起點開始直至轉(zhuǎn)錄終止子合成原始轉(zhuǎn)錄體所需的DNA節(jié)段,稱為轉(zhuǎn)錄單位。3、多順反子:在原核生物體中,一條原始轉(zhuǎn)錄體能翻譯成幾條不同的多肽鏈,這條原始轉(zhuǎn)錄體就稱為多順反子。4、順式作用元件:凡能激活或
31、阻遏基因轉(zhuǎn)錄的DNA序列稱為順式作用元件。5、反式作用因子:凡直接或間接與順式元件相互作用并影響基因表達的調(diào)節(jié)蛋白,統(tǒng)稱為反式作用因子。6、轉(zhuǎn)錄因子:與核心啟動子特異結(jié)合并啟動轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)蛋白稱為轉(zhuǎn)錄因子。7、啟動子:位于基因區(qū)編碼上游并為RNA聚合酶識別、結(jié)合和啟動轉(zhuǎn)錄的DNA序列,稱為啟動子。8、增強子:能加強其上游或下游基因轉(zhuǎn)錄的DNA序列稱為增強子。9、終止子:基因編碼區(qū)下游能促使RNA聚合酶識別并終止RNA合成的DNA序列稱為轉(zhuǎn)錄終止子。10、沉默子:與增強子作用相反,能抑制上游或下游基因轉(zhuǎn)錄的DNA序列稱為沉默子。11、轉(zhuǎn)座子:在基因組中能移動或易位的DNA片段,稱為轉(zhuǎn)座子。12、反
32、轉(zhuǎn)座子:經(jīng)RNA中間體的反轉(zhuǎn)錄復(fù)制和易位的散在重復(fù)DNA序列,稱為反轉(zhuǎn)座子。13、基序(模體):一般指具有功能意義的亞結(jié)構(gòu)域或小結(jié)構(gòu)域,為蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu)。簡答題1、簡述常染色質(zhì)與異染色質(zhì)的異同在分裂間期,細胞核形成兩類結(jié)構(gòu)與功能明顯不同的染色質(zhì):常染色質(zhì)與異染色質(zhì)。常染色質(zhì)堿性染料著色淺而均一,DNA復(fù)制較早,對核酸酶敏感,富含基因、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白和乙酰組蛋白,核小體陣列不規(guī)則,壓縮程度低。而異染色質(zhì)堿性染料著色深而不均一,DNA復(fù)制晚而慢,對核酸酶不敏感,所含基因和轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白甚少,富含高度重復(fù)序列、低乙酰組蛋白和異染色質(zhì)相關(guān)蛋白,核小體陣列規(guī)則,高度壓縮。2、簡述真核基因組DNA的特征(
33、1)單順反子:一般真核基因為單順反子,即一個基因編碼一條多肽鏈或RNA鏈,每個基因轉(zhuǎn)錄有各自的調(diào)節(jié)原件。(2)斷裂基因:真核基因有外顯子和內(nèi)含子,外顯子是編碼序列,內(nèi)含子雖然也轉(zhuǎn)錄,可是在后續(xù)的mRNA的修飾過程中會被剪接掉,所以為非編碼序列。這樣的基因被稱為斷裂基因。(3)重復(fù)序列:真核基因組另一顯著特征是含重復(fù)序列。該序列是指多拷貝的相同或近似DNA片段。根據(jù)變性DNA濃度和復(fù)性時間,將重復(fù)DNA分為高度重復(fù)和中度重復(fù)。3、簡述真核基因組DNA的類型(1)單拷貝:即真核基因組中的非重復(fù)序列。(2)中度重復(fù):超過103次重復(fù)為中度重復(fù)。(3)高度重復(fù):超過106次重復(fù)為高度重復(fù)。4、簡述DN
34、A與蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)構(gòu)特征 (1)螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(HTH)基序:蛋白質(zhì)通過HTH結(jié)構(gòu)與DNA結(jié)合,從而發(fā)揮轉(zhuǎn)錄因子的作用。 (2)堿性亮氨酸拉鏈(bLZ)基序:這種基序含卷曲螺旋或纖維狀蛋白,以二聚體的形式卷曲螺旋像八字形的筷子與DNA結(jié)合。 (3)鋅指基序:這類序列為金屬蛋白,有鋅指重復(fù)序列?;蛟\斷、基因治療與腫瘤相關(guān)基因名詞解釋1、基因診斷:應(yīng)用分子生物學(xué)技術(shù),從DNA/RNA水平檢測分析致病基因的存在,變異和表達狀態(tài)從而對疾病作出診斷的技術(shù)2、基因治療:指應(yīng)用DNA重組技術(shù),將外源正?;?qū)氚屑毎?,以糾正或補償因基因缺陷和異常引起的疾病,以達到治療的目的。3、RFLP:是限制性片
35、段長度多態(tài)性,是由于突變使DNA長度改變或使酶切位點發(fā)生改變時,電泳圖譜發(fā)生變化的一種性質(zhì)。4、基因敲除技術(shù):指通過基因同源重組的過程定向的在活細胞中從基因組移出特定基因的過程,從而建立基因剔除細胞和基因剔除生物。5、反義RNA:是指與mRNA互補的RNA分子,通常由15-20個核苷酸組成 。這種反義RNA能與mRNA分子特異性地互補結(jié)合形成二聚體,從而阻止靶核酸的表達。6、RNA干涉(RNAi):是一種由雙鏈RNA誘發(fā)的基因沉默現(xiàn)象。在此過程中,與雙鏈RNA有同源序列的信使RNA(mRNA)被降解,從而抑制該基因的表達。7、癌基因(oncogene,onc):是指細胞內(nèi)或病毒內(nèi)存在的,能促進
36、細胞生長和分裂的基因,它的結(jié)構(gòu)異?;虮磉_異常,可引起細胞癌變。 8、病毒癌基因 (v-onc):存在于病毒基因組的癌基因稱為病毒癌基因。它不編碼病毒的結(jié)構(gòu)成分,對病毒的復(fù)制也沒有作用,但其異常表達可以使宿主細胞持續(xù)增殖, 產(chǎn)生腫瘤或使培養(yǎng)細胞轉(zhuǎn)化成癌細胞。 9、細胞癌基因(c-onc):存在于正常細胞基因組的癌基因稱為細胞癌基因。在正常細胞內(nèi)可以表達,其表達產(chǎn)物具有調(diào)節(jié)細胞生長、增殖和分化的功能。只有在一定的條件下發(fā)生改變而有過度表達時,才可能與腫瘤的發(fā)生有關(guān),正常狀態(tài)下為非活化形式即原癌基因。 10、抑癌基因:一類抑制細胞過度生長、增殖,從而遏制腫瘤形成,當(dāng)缺失或變異抑癌功能喪失導(dǎo)致腫瘤生成
37、的基因。問答題:1、簡述定點突變技術(shù)的原理:本技術(shù)是利用化學(xué)合成的含有突變堿基的寡核苷酸短片段作為引物,啟動單鏈DNA分子進行復(fù)制,隨后這段寡核苷酸引物便成為新合成DNA子鏈的一個組成部分,新生成的鏈便已具有突變的堿基序列。為了使靶基因的特定位點發(fā)生突變,所設(shè)計的寡核苷酸引物的序列除了所需的突變堿基外,其余的序列則與靶基因編碼鏈的特定區(qū)域完全互補。2、 簡述基因診斷的5個特點(1)針對性強: 以探測疾病基因為目標(biāo),屬于“病因診斷” 。 (2)特異性高: 以分子雜交技術(shù)為基本原理 (3)靈敏度高: 基因探針帶有十分敏感的檢測標(biāo)記,可從人 類長達3×106kb的基因組中檢測出某一基因的單堿基改變。而且待測標(biāo)本
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