生物化學(xué)中期復(fù)習(xí)

1、生物化學(xué)生物化學(xué)中期復(fù)習(xí)中期復(fù)習(xí)第第1章章 糖類化合物糖類化合物v糖類化合物的定義糖類化合物的定義v糖的功能糖的功能v糖的分類糖的分類v單糖單糖 醛糖醛糖/酮糖，還原糖酮糖，還原糖/非還愿糖，呋喃糖非還愿糖，呋喃糖/吡喃糖吡喃糖 空間構(gòu)型：空間構(gòu)型：d,l, -,-， 葡萄糖、果糖、半乳糖（三種結(jié)構(gòu)式）葡萄糖、果糖、半乳糖（三種結(jié)構(gòu)式）v雙糖雙糖: 糖苷鍵糖苷鍵 乳糖，麥芽糖，蔗糖（三種結(jié)構(gòu)式）乳糖，麥芽糖，蔗糖（三種結(jié)構(gòu)式）v三糖三糖v多糖多糖 淀粉（直鏈淀粉（直鏈/支鏈），纖維素支鏈），纖維素ooohohohch2ohoohohch2ohohooohohohch2ohoohohch2oho

2、hoooohohohch2ohch2ohohohch2ohooohohch2ohoohohch2ohooohohch2ohohoooohohch2ohoohohch2ooohohch2ohohoooohohch2ohoohohch2ohooooohch2ohoohohch2ohooohch2ohoohoho第第2章章 蛋白質(zhì)化學(xué)蛋白質(zhì)化學(xué)v蛋白質(zhì)的化學(xué)組成蛋白質(zhì)的化學(xué)組成 元素組成元素組成/蛋白質(zhì)的換算系數(shù)蛋白質(zhì)的換算系數(shù)v20種天然氨基酸種天然氨基酸 分子結(jié)構(gòu)分子結(jié)構(gòu) 氨基酸的分類氨基酸的分類 氨基酸的解離方程氨基酸的解離方程/氨基酸的等電點(diǎn)及其計(jì)算氨基酸的等電點(diǎn)及其計(jì)算 (1) (-nh2

3、) ， (-cooh)(2) -c(3)構(gòu)成蛋白質(zhì)的氨基酸都是- 氨基酸h2nccoohrhnh2ccoohrhl-amino acidd-amino acid疏水性氨基酸疏水性氨基酸不帶電荷氨基酸不帶電荷氨基酸帶電荷氨基酸帶電荷氨基酸極性氨基酸極性氨基酸芳香族氨基酸芳香族氨基酸脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸arg,lys,his,asp,gluphe,tyr,trygly,ala,val, leu,ile,met,proser,thr,gln,asn,cys兼性離子兼性離子+h3nccoohrh+h3nccoo-rhh2nccoo-rhaa+aa+-aa-oh-oh-(zwitterion)pk1

4、pk2中性中性aa: pi=1/2(pk1+pk2)酸性酸性aa: pi=1/2(pk1+pk2)堿性堿性aa：pi=1/2(pk2+pk3)v蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu) 一級(jí)結(jié)構(gòu)：肽鍵一級(jí)結(jié)構(gòu)：肽鍵 二級(jí)結(jié)構(gòu)：二級(jí)結(jié)構(gòu)：超二級(jí)結(jié)構(gòu)、結(jié)構(gòu)域超二級(jí)結(jié)構(gòu)、結(jié)構(gòu)域 三級(jí)結(jié)構(gòu)三級(jí)結(jié)構(gòu) 四級(jí)結(jié)構(gòu)：四級(jí)結(jié)構(gòu)：亞基亞基 超二級(jí)結(jié)構(gòu)超二級(jí)結(jié)構(gòu)若干相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)中的構(gòu)象單元彼此相互作用，形若干相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)中的構(gòu)象單元彼此相互作用，形成有規(guī)則的在空間結(jié)構(gòu)上能辨認(rèn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體。成有規(guī)則的在空間結(jié)構(gòu)上能辨認(rèn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體。結(jié)構(gòu)域結(jié)構(gòu)域v結(jié)構(gòu)域是球蛋白的折疊單位。多肽鏈在超二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)結(jié)構(gòu)域是球蛋白的折疊單

5、位。多肽鏈在超二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)一步折疊成緊密的近似球狀的結(jié)構(gòu)。一步折疊成緊密的近似球狀的結(jié)構(gòu)。v對(duì)于較大的蛋白分子或亞基，多肽鏈往往由兩個(gè)以上的相對(duì)獨(dú)對(duì)于較大的蛋白分子或亞基，多肽鏈往往由兩個(gè)以上的相對(duì)獨(dú)立的結(jié)構(gòu)域締合而成三級(jí)結(jié)構(gòu)。立的結(jié)構(gòu)域締合而成三級(jí)結(jié)構(gòu)。v對(duì)于較小的蛋白分子或亞基，結(jié)構(gòu)域和三級(jí)結(jié)構(gòu)往往是一個(gè)意對(duì)于較小的蛋白分子或亞基，結(jié)構(gòu)域和三級(jí)結(jié)構(gòu)往往是一個(gè)意思。思。v亞基亞基 多肽鏈相互以非共價(jià)鍵聯(lián)結(jié)成一個(gè)相對(duì)穩(wěn)定的單位，這種多肽鏈相互以非共價(jià)鍵聯(lián)結(jié)成一個(gè)相對(duì)穩(wěn)定的單位，這種肽鏈就稱為該蛋白質(zhì)的亞基（亞基單獨(dú)存在，無(wú)生物活力或活肽鏈就稱為該蛋白質(zhì)的亞基（亞基單獨(dú)存在，無(wú)生物活力或活

6、力很?。┝苄。﹙蛋白質(zhì)的性質(zhì)蛋白質(zhì)的性質(zhì) 變性變性/影響蛋白質(zhì)變性的因素影響蛋白質(zhì)變性的因素 v蛋白質(zhì)的沉淀蛋白質(zhì)的沉淀 活性蛋白的沉淀（三種方法）活性蛋白的沉淀（三種方法） 非活性蛋白的沉淀（三種方法）非活性蛋白的沉淀（三種方法）v蛋白質(zhì)的純化蛋白質(zhì)的純化 原理原理 純化過(guò)程純化過(guò)程v原理原理 溶解性溶解性 蛋白分子大小蛋白分子大小 電荷電荷 特異性的親和作用特異性的親和作用(pi沉淀沉淀, 鹽析鹽析, 有機(jī)溶劑有機(jī)溶劑, 溫度溫度)(透析透析, 超濾超濾, 密度梯度密度梯度,凝膠層析凝膠層析)(電泳、離子交換電泳、離子交換)(親和層析親和層析)蛋白樣品的選擇蛋白樣品的選擇預(yù)處理預(yù)處理粗提

7、粗提純化純化純蛋白純蛋白(離子交換離子交換, 凝膠過(guò)濾凝膠過(guò)濾, 親和層析親和層析,電泳等電泳等)(有機(jī)溶劑有機(jī)溶劑, 硫酸銨硫酸銨, 等電點(diǎn)等電點(diǎn))(均質(zhì)和溶解均質(zhì)和溶解 )第第3章章 脂類和生物膜脂類和生物膜v脂類的生物學(xué)功能脂類的生物學(xué)功能（三個(gè)）（三個(gè)）v脂的分類脂的分類v甘油三酯的分子結(jié)構(gòu)甘油三酯的分子結(jié)構(gòu)v脂肪酸的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)脂肪酸的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) 飽和脂肪酸（例？） 不飽和脂肪酸（例？） 必需脂肪酸（簡(jiǎn)單脂質(zhì)/復(fù)合脂） 單純甘油酯單純甘油酯 混合甘油酯混合甘油酯c h2occ hocc h2ocr1r2r3ooov軟脂酸軟脂酸 c16:0v硬脂酸硬脂酸 c18:0v油酸油酸 c18:1

8、 9v亞油酸亞油酸linoleic acid (c18:2 9,12)v亞麻酸亞麻酸linolenic acid (c18:3 9,12,15)v花生四烯酸花生四烯酸arachidonic acid (c20:4 5,8,11,14)必需脂肪酸必需脂肪酸常見脂肪酸常見脂肪酸細(xì)胞膜細(xì)胞膜v膜的化學(xué)組成膜的化學(xué)組成 膜蛋白膜蛋白 膜脂類膜脂類 膜糖類膜糖類v膜的結(jié)構(gòu)膜的結(jié)構(gòu)膜蛋白膜蛋白膜脂膜脂v磷脂磷脂v固醇固醇v其它脂類其它脂類磷脂酰膽堿、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰磷脂酰膽堿、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰絲氨酸、磷脂酰肌醇、鞘磷脂等。絲氨酸、磷脂酰肌醇、鞘磷脂等。膜糖類膜糖類v糖蛋白糖蛋白/糖脂糖脂v在細(xì)胞質(zhì)

9、膜表面分布較多，一般占質(zhì)膜總量的在細(xì)胞質(zhì)膜表面分布較多，一般占質(zhì)膜總量的210左右。左右。v中性糖、氨基糖和唾液酸。中性糖、氨基糖和唾液酸。v與細(xì)胞的抗原結(jié)構(gòu)、受體、細(xì)胞免疫反應(yīng)、細(xì)胞識(shí)別、血型及與細(xì)胞的抗原結(jié)構(gòu)、受體、細(xì)胞免疫反應(yīng)、細(xì)胞識(shí)別、血型及細(xì)胞癌變等均有密切關(guān)系。細(xì)胞癌變等均有密切關(guān)系。vs.j.singer/g.nicolson流動(dòng)鑲嵌模型流動(dòng)鑲嵌模型第第4章章 核酸核酸v幾個(gè)重要的事件幾個(gè)重要的事件：1944，1953，1960v核酸的分類和化學(xué)組成核酸的分類和化學(xué)組成 核酸的分類 元素組成 分子組成 v核苷與核苷酸的結(jié)構(gòu)核苷與核苷酸的結(jié)構(gòu)核酸核苷酸核苷磷酸戊糖堿基daohohh

10、hhhch2ohaohohhhhch2hop-oo-oadampv核酸的結(jié)構(gòu)核酸的結(jié)構(gòu) dnav一級(jí)結(jié)構(gòu)（一級(jí)結(jié)構(gòu)（dna的書寫格式的書寫格式）v二級(jí)結(jié)構(gòu)二級(jí)結(jié)構(gòu)v三級(jí)結(jié)構(gòu)三級(jí)結(jié)構(gòu) rnav一級(jí)結(jié)構(gòu)（一級(jí)結(jié)構(gòu)（rna的書寫格式）的書寫格式）v二級(jí)結(jié)構(gòu)：二級(jí)結(jié)構(gòu)：trna的三葉草結(jié)構(gòu)的三葉草結(jié)構(gòu)v三級(jí)結(jié)構(gòu)：三級(jí)結(jié)構(gòu)：trna的倒的倒l型結(jié)構(gòu)型結(jié)構(gòu)v核酸的性質(zhì)核酸的性質(zhì)dna 的書寫格式的書寫格式vagtvpapgptvpa-g-tp3app3g3t5ohohhhhpooo-ohohhhc h2hpoo-ohohhhc h2hc h2poo-o-oagtdna 二級(jí)結(jié)構(gòu)二級(jí)結(jié)構(gòu)(雙螺旋雙螺旋)v核

11、酸的性質(zhì)核酸的性質(zhì) 紫外吸收紫外吸收 變性變性/影響核酸變性的因素：影響核酸變性的因素：tm（解鏈溫度（解鏈溫度/熔點(diǎn)）熔點(diǎn)）/影響影響tm的因素的因素 復(fù)性復(fù)性 兩性解離兩性解離v結(jié)束結(jié)束解鏈溫度解鏈溫度tm （熔點(diǎn)）（熔點(diǎn)）紫外吸收的增加量達(dá)最大增量一半時(shí)的溫紫外吸收的增加量達(dá)最大增量一半時(shí)的溫度稱熔解溫度度稱熔解溫度 (tm ).tm69.30.41g-c%g-c%=（tm69.3）2.44影響影響tm的因素的因素vg-c含量含量v溶液的離子強(qiáng)度溶液的離子強(qiáng)度 離子強(qiáng)度較低的介質(zhì)中，離子強(qiáng)度較低的介質(zhì)中，tm較低；較低； 分子生物學(xué)研究中需核酸變性時(shí)，常采用較低的離子強(qiáng)度。分子生物學(xué)研究

12、中需核酸變性時(shí)，常采用較低的離子強(qiáng)度。v溶液的溶液的ph ph大于大于11.3時(shí)，時(shí)，dna完全變性。完全變性。v變性劑變性劑 尿素、甲醛、甲酰胺尿素、甲醛、甲酰胺 對(duì)單鏈對(duì)單鏈dna電泳時(shí)，常在凝膠中加入電泳時(shí)，常在凝膠中加入naoh和變性劑和變性劑以維持變性狀態(tài)。以維持變性狀態(tài)。第第5章章 酶酶v酶的分類 按照組成（輔因子）按照組成（輔因子） 按照酶催化反應(yīng)的性質(zhì)（酶分類號(hào)按照酶催化反應(yīng)的性質(zhì)（酶分類號(hào)e.c.3.4.21.4 ）v酶的催化特性 高效性高效性 高專一性高專一性絕對(duì)專一性，相對(duì)專一性（基團(tuán)專一絕對(duì)專一性，相對(duì)專一性（基團(tuán)專一 性，鍵專性，鍵專一性，立體異構(gòu)專一性）一性，立體異

13、構(gòu)專一性）v酶的催化機(jī)制 必需基團(tuán)必需基團(tuán)/活性中心活性中心 酶的結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系酶的結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系v一級(jí)結(jié)構(gòu)是酶活性的基礎(chǔ)一級(jí)結(jié)構(gòu)是酶活性的基礎(chǔ)。v酶的空間結(jié)構(gòu)保證了酶的活性；酶的空間結(jié)構(gòu)保證了酶的活性；v只要酶的活性中心完整，即使酶的一級(jí)只要酶的活性中心完整，即使酶的一級(jí)結(jié)構(gòu)被破壞，仍具有催化活性。結(jié)構(gòu)被破壞，仍具有催化活性。幾個(gè)學(xué)說(shuō)幾個(gè)學(xué)說(shuō)v中間產(chǎn)物學(xué)說(shuō)中間產(chǎn)物學(xué)說(shuō)：v鎖鑰學(xué)說(shuō)鎖鑰學(xué)說(shuō)：v誘導(dǎo)鍥合學(xué)說(shuō)誘導(dǎo)鍥合學(xué)說(shuō)：v酶只是提高反應(yīng)的速率，并不改變反應(yīng)前后能量的變化v酶的活性中心與底物的形狀如鎖和鑰匙一樣完全吻合v 兩個(gè)結(jié)構(gòu)都是剛性的固定的。v底物的結(jié)合誘導(dǎo)酶的活性中心構(gòu)象的改變，使酶與

14、底物能很好地結(jié)合v酶動(dòng)力學(xué) 酶反應(yīng)的初速度 影響酶反應(yīng)速度的因素 底物濃度（米氏方程，底物濃度（米氏方程，km） 酶濃度酶濃度 溫度溫度 ph 激活劑激活劑 抑制劑抑制劑v酶的抑制酶的抑制 對(duì)于競(jìng)爭(zhēng)性可逆抑制：對(duì)于競(jìng)爭(zhēng)性可逆抑制： km值增大，值增大，v不變。不變。可逆抑制可逆抑制 競(jìng)爭(zhēng)性可逆抑制競(jìng)爭(zhēng)性可逆抑制/非競(jìng)爭(zhēng)性可逆抑制非競(jìng)爭(zhēng)性可逆抑制 不可逆抑制不可逆抑制 對(duì)于非競(jìng)爭(zhēng)性可逆抑制：對(duì)于非競(jìng)爭(zhēng)性可逆抑制： km值不變，值不變，v減小。減小。v酶的別構(gòu)效應(yīng)酶的別構(gòu)效應(yīng)/別構(gòu)酶別構(gòu)酶v酶活力的測(cè)定酶活力的測(cè)定 幾個(gè)重要概念：酶活力、酶單位、比活力、總活力幾個(gè)重要概念：酶活力、酶單位、比活力、總活力v酶活力的測(cè)定程序與注意事項(xiàng)酶活力的測(cè)定程序與注