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文檔簡(jiǎn)介
1、異硫氰酸胍強(qiáng)用力的蛋白質(zhì)變性劑,能迅速溶解蛋白質(zhì),導(dǎo)致細(xì)胞結(jié)構(gòu)破碎,核蛋白由于其二級(jí)結(jié)構(gòu)的破壞消失而迅速與核酸分離。胍鹽是破壞蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的離液劑,在通常使用的蛋白質(zhì)變性劑中作用最強(qiáng)的是異硫氰酸胍,它們可以使多數(shù)蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)換成一隨機(jī)的卷曲狀態(tài)。含有強(qiáng)力的陰離子和陽(yáng)離子基團(tuán),它們可以形成較強(qiáng)的氫鍵。在還原劑存在的情況下,異硫氰酸胍可以斷裂氫鍵,而去垢劑,如SDS存在的情況下,可以破壞疏水作用。鹽酸胍、尿素鹽酸胍是一個(gè)核酸酶的強(qiáng)抑制劑,它并不是一種足夠強(qiáng)的變性劑,可以允許完整的RNA從富含RNase的組織中提取出來(lái)。4-8M可斷裂氫鍵,有兩種可能機(jī)制:1變性蛋白和鹽酸胍、尿素優(yōu)先結(jié)合,形成變性蛋白
2、-變性劑復(fù)合物,當(dāng)復(fù)合物被除去,從而引起N-D反應(yīng)平衡向右移動(dòng),隨著變性劑濃度增加,天然狀態(tài)的蛋白不斷轉(zhuǎn)變?yōu)閺?fù)合物,最終導(dǎo)致蛋白質(zhì)完全變性;2鹽酸胍、尿素對(duì)氨基酸的增溶作用,能形成氫鍵,當(dāng)濃度高時(shí),能破壞水的氫鍵結(jié)構(gòu),結(jié)果鹽酸胍、尿素就稱(chēng)為非極性殘基的較好溶劑,使蛋白質(zhì)內(nèi)部的疏水殘基伸展和溶解性加強(qiáng),鹽酸胍、尿素引起的變性往往是不可逆的。高濃度尿素使蛋白質(zhì)變性并抑制Rnase活性十二烷基肌氨酸鈉 使蛋白質(zhì)解體 變性巰基試劑1防止蛋白質(zhì)或酶等(如輔酶A)分子中SH基團(tuán)氧化成二硫鍵,2在某些酶反應(yīng)過(guò)程中維持體系的還原環(huán)境。DTT,DDTE、巰基乙醇應(yīng)用最廣,谷胱甘肽也常應(yīng)用,由于他是生物體內(nèi)的還原
3、劑,同時(shí)氧化后能被谷胱甘肽還原酶原位釋放。DNA提取中,常使用巰基乙醇,維持緩沖液的還原環(huán)境,防止多酚類(lèi)氧化,由于具有一定的毒性,濃度不應(yīng)高于2%。巰基乙醇-巰基乙醇的主要作用是破壞RNase蛋白質(zhì)中的二硫鍵(肽和蛋白質(zhì)分子中的半胱氨酸殘基中的鍵)。1 還原蛋白質(zhì)二硫鍵,使Rna酶變性2 抑制酚類(lèi)氧化,若氧化,核酸會(huì)變成灰黑色,苯酚的氧化產(chǎn)物苯醌等氧化物引起磷酸二酯鍵的斷裂及導(dǎo)致RNA和DNA的交聯(lián)3 保護(hù)蛋白質(zhì)的巰基 蛋白質(zhì)提取中需要巰基乙醇還原二硫鍵,使RNA酶失活化學(xué)變性劑SDS、尿素、鹽酸胍能破壞疏水鍵、鹽鍵、氫鍵、范德華力使蛋白質(zhì)變性但不影響肽鍵和二硫鍵,不能使蛋白質(zhì)徹底變性加上還原
4、劑巰基乙醇或DTT,能還原二硫鍵,使RNA徹底變性DTT二硫蘇糖醇刺激性氣味要小很多,毒性也比巰基乙醇低很多。而且DTT比巰基乙醇的濃度低7倍時(shí),兩者效果相近,但DTT價(jià)格略高一些。由于容易被空氣氧化,因此DTT的穩(wěn)定性較差;但冷凍保存或在惰性氣體中處理能夠延長(zhǎng)它的使用壽命。由于質(zhì)子化的硫的親核性較低,隨著pH值的降低,DTT的有效還原性也隨之降低;DTT或含有DTT的溶液不能進(jìn)行高壓處理。抑制Rnase活性TCEP 三(2-甲酰乙基)膦鹽酸鹽半胱氨酸Trizol苯酚、異硫氰酸胍、8羥基喹啉、-巰基乙醇等。TRIzol的主要成分是苯酚。苯酚的主要作用是裂解細(xì)胞,使細(xì)胞中的蛋白,核酸物質(zhì)解聚得到
5、釋放。苯酚雖可有效地變性蛋白質(zhì),但不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中還加入了8羥基喹啉、異硫氰酸胍、-巰基乙醇等來(lái)抑制內(nèi)源和外源RNase(RNA酶)。0.1%的8羥基喹啉可以抑制RNase,與氯仿聯(lián)合使用可增強(qiáng)抑制作用。異硫氰酸胍屬于解偶劑,是一類(lèi)強(qiáng)力的蛋白質(zhì)變性劑,可溶解蛋白質(zhì)并使蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)消失,導(dǎo)致細(xì)胞結(jié)構(gòu)降解,核蛋白迅速與核酸分離。-巰基乙醇的主要作用是破壞RNase蛋白質(zhì)中的二硫鍵。液氮組織破碎,裂解細(xì)胞SDS十二烷基硫酸鈉 陰離子去垢劑,高溫(55-65)裂解細(xì)胞,使染色體離析,蛋白變性,形成SDS/蛋白質(zhì)/多糖復(fù)合物,釋放核酸,提高鹽(KAc或NaAc)濃度并降低溫
6、度(冰?。?,使SDS/蛋白質(zhì)/復(fù)合物轉(zhuǎn)變?yōu)槿芙舛雀〉拟淃}酸形式,使蛋白質(zhì)及多糖雜質(zhì)沉淀更加完全、離心后除去沉淀,上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,乙醇沉淀水相中的DNA操作簡(jiǎn)單,溫和,可提取到高分子量的DNA,但產(chǎn)物多糖類(lèi)雜質(zhì)較多陽(yáng)離子強(qiáng)表面活性劑,通常與蛋白酶K和抗氧化劑、螯合劑一起使用可破壞細(xì)胞膜、核膜,并使組織蛋白與DNA分離溶解膜類(lèi)蛋白SDS 能裂解細(xì)胞。使細(xì)胞中的蛋白質(zhì)和核酸之間常借著靜電引力或配位鍵結(jié)合,陰離子去污劑能夠破壞這種價(jià)鍵,使染色體離析,蛋白變性,釋放核酸。(1)SDS是一種陰離子表面活性劑,能使蛋白質(zhì)的氫鍵和疏水鍵打開(kāi),并結(jié)合到蛋白質(zhì)的疏水部位;(2)SDS可引起蛋白質(zhì)
7、構(gòu)象改變(3)SDS是一種良好的解離劑,可使蛋白質(zhì)溶解,變性(4)形成SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物,并使復(fù)合物帶負(fù)電質(zhì)粒方面:在1的SDS溶液中慢慢加入5 N的 NaCl,你會(huì)發(fā)現(xiàn)SDS在高鹽濃度下是會(huì)產(chǎn)生沉淀的。因此高濃度的鹽導(dǎo)致了SDS的沉淀。但如果你加入的不是NaCl而是 KCl,你會(huì)發(fā)現(xiàn)沉淀的量要多的多。這其實(shí)是十二烷基硫酸鈉 (sodium dodecylsulfate)遇到鉀離子后變成了十二烷基硫酸鉀 (potassium dodecylsulfate, PDS),而PDS是水不溶的,因此發(fā)生了沉淀。如此看來(lái),溶液III加入后的沉淀實(shí)際上是鉀離子置換了SDS中的納離子形成了不溶性的PDS,
8、而高濃度的鹽,使得沉淀更完全。大家知道SDS專(zhuān)門(mén)喜歡和蛋白質(zhì)結(jié)合,平均兩個(gè)氨基酸上結(jié)合一個(gè)SDS分子,鉀鈉離子置換所產(chǎn)生的大量沉淀自然就將絕大部分蛋白質(zhì)沉淀了,讓人高興的是大腸桿菌的基因組DNA也一起被共沉淀了?;蚪MDNA一旦發(fā)生斷裂,只要是50100 kb大小的片斷,就沒(méi)有辦法再被 PDS共沉淀了CTABCTAB:十六烷基三甲基溴乙胺,低溫時(shí)易沉淀陽(yáng)離子去污劑一種在高鹽下能和核酸結(jié)合形成可溶、穩(wěn)定的復(fù)合物,低鹽濃度下可沉淀的表面活性劑是一種陽(yáng)離子去污劑, 低離子強(qiáng)度(0.1-0.5M NaCl),沉淀核酸與酸性多聚糖,而蛋白質(zhì)和中性多聚糖仍留在溶液中。在高離子強(qiáng)度的溶液中(>0.7m
9、ol/L NaCl),CTAB與蛋白質(zhì)和多聚糖形成復(fù)合物,只是不能沉淀核酸。通過(guò)有機(jī)溶劑抽提,去除蛋白,多糖,酚類(lèi)等雜質(zhì)后加入乙醇沉淀即可使核酸分離出來(lái)。CTAB可從大量產(chǎn)生黏多糖的植物及某些革蘭氏陰性菌制備純化的DNA,這種去污劑加入調(diào)節(jié)至高離子強(qiáng)度的細(xì)菌和細(xì)胞裂解液中(0.7M NaCl),經(jīng)過(guò)連續(xù)的酚/氯仿抽提,去除CTAB/黏多糖/ 蛋白質(zhì)復(fù)合體,異丙醇/無(wú)水乙醇沉淀上清即可將DNA分離出來(lái)CTAB還有提高DNA互補(bǔ)鏈復(fù)性速率及穩(wěn)定已形成的DNA雙螺旋的作用CTAB法的主要特點(diǎn)是用用較廣 CTAB溶液在低于15度會(huì)形成沉淀析出,因此在將其加入冰冷的植物材料時(shí),必須預(yù)熱,且離心溫度不低于
10、15度EDTA酶抑制劑,螯合二價(jià)金屬,抑制金屬依賴(lài)性的酶螯合Mg2+或Mn2+離子,抑制細(xì)胞中DNase的活性,該酶可降解DNAEDTA是去垢劑,結(jié)合離子用,而它結(jié)合的部分離子是能夠誘發(fā)或者促進(jìn)RNA酶活性的,比如Ca2+。EDTA是一種二價(jià)離子熬合劑,能熬合Mg2+和Ca2+等二價(jià)陽(yáng)離子,而多種RNA酶的活性是需要依賴(lài)二價(jià)陽(yáng)離子的,所以EDTA能通過(guò)熬合二價(jià)陽(yáng)離子來(lái)抑制RNA酶的活性堿性條件下才能夠溶解,要和NaOH粉末混合后,再加水,然后用NaOH水溶液調(diào)節(jié)pH。0.01M,DNase酶基本失活。BSA酶抑制劑,使一些降解酶的活性的表面變性精胺或其他多胺酶抑制劑,降低核酸酶的影響氰化物酶抑
11、制劑,降低重金屬氧化酶的影響PVP減少酚類(lèi)、醌類(lèi)、單寧類(lèi)物質(zhì)的影響,抗氧化作用,絡(luò)合多酚和萜類(lèi)物質(zhì),防止多酚類(lèi)褐變而氧化,去除多糖和色素,色素是PCR強(qiáng)抑制劑,必須去除樣品液氮研磨及提取緩沖液中加入PVP或PVPP等能絡(luò)合多酚和萜類(lèi)物質(zhì),離心或氯仿抽提出去,有效防止多酚氧化成醌類(lèi),避免溶液變褐色而具有抗氧化能力提取液中加入適量的PVP或PVPP能提高DNA的純度,用量根據(jù)雜質(zhì)而定(1-6%),PVP同時(shí)能去除多糖,因此將PVP和巰基乙醇配合使用并調(diào)整用量,能有效防止多酚污染PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的絡(luò)合物,能與多酚形成一種不溶的絡(luò)合物質(zhì),有效去除多酚,減少DNA中酚的污染;同時(shí)它也能和多糖
12、結(jié)合,有效去除多糖。Triton-x100Triton X100之類(lèi)的去垢劑有苯環(huán)結(jié)構(gòu),所以在280nm有很強(qiáng)的吸收。蛋白酶K蛋白酶K:切割活性較廣的絲氨酸蛋白酶,切割脂族和芳香族氨基酸的羧基端肽鍵,將蛋白質(zhì)降解成小肽或氨基酸,使DNA分子完整地分離出來(lái)。蛋白酶K 在較廣的pH范圍內(nèi)均有活性(pH 4-12.5) 溫度范圍37-60度 鹽濃度3M GuHCl 或4M尿素中均有活性 在一些去污劑:Tween20(5%)、Triton X-100 (1%)和SDS(1%)條件下也有活性。蛋白酶K消化裂解法適用于所有標(biāo)本的消化處理,尤以DNA樣品為佳.如組 織細(xì)胞(包括石蠟包埋組織)絨毛、
13、毛發(fā)、精斑、血液(血清、血漿、全血)局部分泌 物、尿,糞便等.蛋白酶K的一般工作濃度是50100g/ml蛋白酶(蛋白酶K 或鏈酶蛋白酶) 可以降解蛋白質(zhì),滅活核酸酶(DNase 和RNase) ,DNase 和RNase 也用于去除不需要的核酸,有人使用蛋白酶替代DEPC處理水的,但有些人說(shuō)效果不好。蛋白酶 K,威力巨大的廣譜蛋白酶,95C 加熱10 分鐘,則完全失活。數(shù)年前首次使用它替代 DEPC 處理 RNA 抽提用的離心管和槍頭,效果不錯(cuò);后來(lái)又用于處理 RNase-Free的水,效果也是一級(jí)棒。從此就再也不用 DEPC 了。配制 RNA 裂解試劑時(shí),直接用滅菌的雙蒸水配制,最后,加入蛋
14、白酶 K 至終濃度 1ug/ml。輕輕混勻,室溫放置 15 分鐘后即可。槍頭及離心管去除 RNase:先將槍頭及離心管清洗干凈后,移入預(yù)先混好的含 1ug/ml 蛋白酶 K 的雙蒸水,徹底浸入。室溫放置 30 分鐘后,連水一起高壓滅菌。棄水后,烘干即可。RNase-Free 水的獲得:直接在滅菌的雙蒸餾水中加入蛋白酶 K 至終濃度 1ug/ml。輕輕混勻,室溫放置 15 分鐘后,滅菌處理即可。該蛋白質(zhì)的殘留對(duì)后續(xù)實(shí)驗(yàn)沒(méi)有可見(jiàn)的影響。無(wú)蛋白質(zhì)殘留的RNase-Free 水的獲得:這比較麻煩。直接在滅菌的雙蒸餾水中加入蛋白酶 K 至終濃度 1ug/ml。輕輕混勻后,倒入專(zhuān)用的蒸餾器中。放置 15
15、分鐘后,加熱蒸餾,流出的就是無(wú)蛋白質(zhì)殘留的RNase-Free 水。要提醒的是,該專(zhuān)用蒸餾器頭幾次流出來(lái)的水,只能當(dāng)普通蒸餾水用,因?yàn)橥ǖ乐须y確保 RNase-Free 的環(huán)境;另外,一定要主要密閉性,否則,流出的水又被污染了。DNA裂解液的作用是破壞細(xì)胞膜、核膜,并使組織蛋白與DNA分離,抑制細(xì)胞中Dnase的活性,而蛋白酶k的作用是將蛋白質(zhì)降解成小肽或氨基酸,使DNA分子完整地分離出來(lái)!溶菌酶溶壁酶DnaseRnase多糖水解酶:水解多糖飽和酚酚是一種有機(jī)溶劑,預(yù)先要用STE 緩沖液飽和,因未飽和的酚會(huì)吸收水相而帶走一部分核酸。酚也易氧化發(fā)黃,而氧化的酚可引起核酸鏈中磷酸二酯鍵斷裂或使核酸
16、鏈交聯(lián):故在制備酚飽和液時(shí)要加入82羥基喹嚀,以防止酚氧化。苯酚非極性分子 水為極性分子使蛋白質(zhì)變性,同時(shí)抑制了DNase的降解作用。用苯酚處理勻漿液時(shí),由于蛋白與DNA 聯(lián)結(jié)鍵已斷,蛋白分子表面又含有很多極性基團(tuán)與苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。使用酚的優(yōu)點(diǎn):1. 有效變性蛋白質(zhì);2. 抑制了DNase的降解作用。能有效使蛋白質(zhì)變性而出去,酚形成的有機(jī)相破壞蛋白質(zhì)的膠體穩(wěn)定性,從而蛋白質(zhì)不會(huì)分布在水相中,避免核酸污染缺點(diǎn):1. 能溶解10-15%的水,從而溶解一部分poly(A)RNA。2. 不能完全抑制RNase的活性。酚變性大,但與水相有一定程度的互溶,大約10-15%
17、的水溶在酚相中,使核酸損失酚(Phenol)對(duì)蛋白質(zhì)的變性作用遠(yuǎn)大于氯仿,按道理應(yīng)該用酚來(lái)最大程度將蛋白質(zhì)抽提掉,但是水飽和酚的比重略比水重,碰到高濃度的鹽溶液(比如4M的異硫氰酸胍),離心后酚相會(huì)跑到上層,不利于含質(zhì)粒的水相的回收;但加入氯仿后可以增加比重,使得酚/氯仿始終在下層,方便水相的回收;還有一點(diǎn),酚與水有很大的互溶性,如果單獨(dú)用酚抽提后會(huì)有大量的酚溶解到水相中,而酚會(huì)抑制很多酶反應(yīng)(比如限制性酶切反應(yīng)),應(yīng)此如果單獨(dú)用酚抽提后一定要用氯仿抽提一次將水相中的酚去除,而用酚/氯仿的混合液進(jìn)行抽提,跑到水相中的酚則少得多,微量的酚在乙醇沉淀時(shí)就會(huì)被除干凈而不必?fù)?dān)心酶切等反應(yīng)不能正常進(jìn)行。
18、至于異戊醇的添加,其作用主要是為了讓離心后上下層的界面更加清晰,也方便了水相的回收。氯仿非極性分子 水為極性分子去除脂肪,使更多蛋白質(zhì)變性,從而提高提取效率克服酚的缺點(diǎn);加速有機(jī)相與液相分層。最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的跡量酚。(酚易溶于氯仿中)氯仿變性不如酚好,但與水不混溶,不會(huì)帶走DNA因此混合使用最佳,經(jīng)酚第一次抽提的水相有殘留的酚,由于酚和氯仿互溶,可用氯仿第二次帶走酚,也可在第二次抽提中混合使用,比例為1:1苯酚/氯仿苯酚、氯仿抽提去除蛋白質(zhì)非極性分子 水為極性分子,當(dāng)?shù)鞍姿芤号c他們混合時(shí),蛋白質(zhì)分子見(jiàn)的水分子被擠去,使蛋白失去水合狀態(tài)而變性,經(jīng)離心,變性蛋白密度比對(duì)大,而與水
19、相分離,苯酚/氯仿比重大,保留在最下層苯酚氯仿 使蛋白質(zhì)變性 量要足夠,因?yàn)楸椒尤コ鞍资怯幸欢ǖ娘柡投鹊?,超過(guò)飽和度,裂解體系中蛋白質(zhì)不能被一次性去除,必須多次抽提。離心后分三層,下層有機(jī)層中有一些脂溶性的雜質(zhì),中間層白色絮狀沉淀是蛋白,上清液中即含有核酸; 變性后的蛋白質(zhì)從水相中析出,位于苯酚中或苯酚與水相之間。異戊醇抽提DNA,為混合均勻,容易產(chǎn)生氣泡,氣泡會(huì)阻止相互間的充分作用,加入異戊醇降低分子表面張力,一般采用氯仿:異戊醇=24:1或酚:氯仿:異戊醇=25:24:1(不必先配置,臨用前加入即可)減少操作過(guò)程中產(chǎn)生的氣泡。減少蛋白質(zhì)變性操作過(guò)程中產(chǎn)生的氣泡。異戊醇可以降低表面張力,從
20、而減少氣泡產(chǎn)生。另外,異戊醇有助于分相,使離心后的上層含DNA的水相、中間的變性蛋白相及下層有機(jī)溶劑相維持穩(wěn)定。NaCl提供一個(gè)高鹽環(huán)境,使DNA充分溶解于液相沉淀DNA時(shí)總會(huì)加入高濃度的鹽,加鹽的目的是破壞能使蛋白質(zhì)保持穩(wěn)定的兩個(gè)因素,使蛋白和DNA分離并沉淀下來(lái).而此時(shí)鹽的陽(yáng)離子會(huì)與DNA結(jié)合形成DNA-陽(yáng)離子鹽溶于溶液中,再用無(wú)水乙醇可以將DNA-陽(yáng)離子鹽沉淀下來(lái)提取DNA時(shí)先加0.14mol/L氯化鈉,因?yàn)樵谶@種濃度的氯化鈉溶液中,DNA的溶解度最低,而蛋白質(zhì)的溶解度增加,這樣通過(guò)過(guò)濾能將DNA分離開(kāi),以除去蛋白質(zhì)。再加入95%的酒精能使DNA沉淀,因?yàn)樵谶@個(gè)濃度下DNA溶解度最低。如
21、果直接加酒精不先加氯化鈉,DNA和蛋白質(zhì)都能被酒精所沉淀,就無(wú)法將DNA和蛋白質(zhì)分離開(kāi)。所以必須先加氯化鈉后加酒精,順序不能顛倒。DNA溶液是DNA以水合狀態(tài)穩(wěn)定存在,當(dāng)加入乙醇時(shí),乙醇會(huì)奪去DNA周?chē)乃肿樱笵NA失水而易于聚合。這樣可以是DNA沉淀出來(lái)在pH為8左右的溶液中,DNA分子是帶負(fù)電荷的,加一定濃度的NaAc或NaCl,使Na+中和DNA分子上的負(fù)電荷,減少DNA分子之間的同性電荷相斥力,易于互相聚合而形成DNA鈉鹽沉淀,當(dāng)加入的鹽溶液濃度太低時(shí),只有部分DNA形成DNA鈉鹽而聚合,這樣就造成DNA沉淀不完全,當(dāng)加入的鹽溶液濃度太高時(shí),其效果也不好。在沉淀的DNA中,由于過(guò)多
22、的鹽雜質(zhì)存在,影響DNA的酶切等反應(yīng),必須要進(jìn)行洗滌或重沉淀。檸檬酸鈉它可以控制反應(yīng)體系的離子強(qiáng)度,同時(shí)還有一定的緩沖作用,保證體系PH的相對(duì)穩(wěn)定狀態(tài),總之檸檬酸鈉在這里的作用類(lèi)似于食物中的防腐劑。DEPC焦碳酸二乙酯,它通過(guò)和RNA酶的活性基團(tuán)組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性,從而抑制酶的活性。與肝素何用效果增強(qiáng)。在Tris中不穩(wěn)定,很快會(huì)分解為二氧化碳和乙醇。強(qiáng)烈但不徹底的RNA酶抑制劑 0.1%濃度Tris-HCl緩沖體系,使pH變化不會(huì)太大異丙醇加入異丙醇之后立即出現(xiàn)絮狀沉淀,我一直以為這是正確的,看了帖子才知道是蛋白質(zhì)污染,異丙醇的沉淀效果要比無(wú)水乙醇的沉淀效果要好,但是異丙醇沉淀有一
23、個(gè)弊端就是會(huì)沉淀下來(lái)好多的鹽和蛋白質(zhì)這樣會(huì)影響下一步的操作,一般我加異丙醇是等體積的效果還可以。70%乙醇70%乙醇洗滌DNA沉淀(因?yàn)樵?0%乙醇里DNA是不溶的,而鹽離子卻可溶),用無(wú)水乙醇則達(dá)不到這個(gè)目的!乙醇對(duì)于蛋白質(zhì)、核酸的沉淀效應(yīng)隨分子量加大而增大,小分子的核酸和蛋白質(zhì)碎片是可以溶于75%乙醇的。漂洗DNA,是為了去除殘余的鹽類(lèi),去除過(guò)量SDS和酚等雜物,因?yàn)镾DS在70%的乙醇中保持溶解狀態(tài),不與DNA共沉淀,從而通過(guò)棄上清液去除這種去污劑,避免對(duì)以后PCR反應(yīng)的影響。DEPC(焦碳酸二乙酯):常用RNA酶抑制劑,與RNA酶的活性基團(tuán)組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性,強(qiáng)烈但不徹底的RNA酶抑制劑甲酰胺用高濃度甲酰胺替代苯酚從細(xì)胞裂解物的蛋白酶K消化物中分離抽提DNA,
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