pubmed數(shù)據(jù)庫使用指南

1、PubMed數(shù)據(jù)庫第五章第二節(jié) 本節(jié)重點 重點： Basic search（基本檢索） Advanced search（高級檢索） Mesh search（主題詞檢索） 難點 details按鈕的功能 主題詞檢索(Mesh database)美國國立醫(yī)學圖書館簡介 (National Library of Medicine, NLM)(National Library of Medicine, NLM) 美國的三大國立圖書館之一，是美國醫(yī)學、藥理學、醫(yī)藥生物學與醫(yī)藥化學專業(yè)情報中心，也是世界上最大的醫(yī)學圖書館 。NLM外景 PubMedPubMed是美國國立醫(yī)學圖書館下屬的國家生物技術(shù)信息中心

2、（NCBI）開發(fā)的、基于WWW的查詢系統(tǒng)。網(wǎng)址： /pubmed 或者 http:/ PubMed 網(wǎng)上更新速度是每周一次，目前收錄2400多萬篇文獻。PubMed數(shù)據(jù)庫收錄的文獻大多數(shù)原始語種也是英語，一般有英文摘要，5%文獻有免費全文，大部分文獻有全文鏈接。檢索區(qū)高級檢索臨床查詢主題詞數(shù)據(jù)庫基本檢索出版日期按出版日期排序摘要格式顯示二、高級檢索（Advanced search）檢索框編輯框檢索歷史Pubmed中姓名表示外文作者：如：john smith用 Smith Jau中文作者： 胡大一 表示為

3、 Hu DYau 或 Hu, Da yi fau Hu, Da-yi fau 在pubmed檢索你的名字，該如何拼寫？期刊的表示 外文期刊：直接輸入期刊名，最好加上字段，如：Cellta 中文期刊：用漢語拼音表示，注意專有名詞要拼寫在一起，例如中華內(nèi)科雜志 Zhonghua nei ke za zhita 比如黑龍江醫(yī)藥 Heilongjiang yi yaota地址或單位的表示 用地址或單位的標準英語拼寫舉例：檢索山東大學張運老師發(fā)表在中華心血管病雜志的文章點擊三、主題詞檢索點擊所選主題詞選擇需要的副主題詞四、檢索細節(jié)（Search details）檢索：高血壓的檢索細節(jié)Lung cance

4、r 的檢索細節(jié)檢索歷史五、顯示結(jié)果的處理六、Pubmed的秘密兩大特點 詞匯自動轉(zhuǎn)換功能 鏈接功能1、詞匯自動轉(zhuǎn)換功能 （1）MeSH轉(zhuǎn)換表（MeSH Translation Table），包括MeSH詞、參見詞、副主題詞等。如果系統(tǒng)在該表中發(fā)現(xiàn)了與檢索詞相匹配的詞，就會自動將其轉(zhuǎn)換為相應(yīng)的MeSH詞和全字段詞進行檢索。 例如：鍵入“Pancreatic cancer”，鍵入“Pancreatic cancer”，系統(tǒng)將其轉(zhuǎn)換成： “pancreatic neoplasms ”MeSH Terms OR (“pancreatic” All Fields AND “neoplasms”All F

5、ields ) OR pancreatic neoplasmsAll Fields OR (pancreaticAll Fields AND cancerAll Fields) OR pancreatic cancerAll Fields” 2、刊名轉(zhuǎn)換表包括刊名全稱、MEDLINE形式的縮寫和ISSN號。該轉(zhuǎn)換表能把鍵入的刊名全稱轉(zhuǎn)換為“MEDLINE縮寫Journal Name”后進行檢索。如：在檢索提問框中鍵入：“New England journal of medicine, PubMed將其轉(zhuǎn)換為N Engl J MedJournal后進行檢索。注意：中文版直接用漢語拼音表示，如：

6、中華內(nèi)科雜志表示為：zhonghua nei ke za zhi. 短語表（確定檢索詞是否為固定詞組） 作者索引外文作者：如：john smith用 Smith Jau中文作者： 胡大一 表示為 Hu DYau 或表示為 Hu, Da yifau Hu, Da-yifau3、強制檢索功能 在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入一個短語后點擊“search”，系統(tǒng)會高速用自動轉(zhuǎn)換功能查找到相應(yīng)的匹配詞后再進行檢索； 但是，當鍵入的詞語無匹配詞時，PubMed就會將鍵入的詞語斷開后再重復(fù)上述自動詞匯轉(zhuǎn)換過程，若仍然沒有匹配詞，系統(tǒng)就將短語分解成單詞，再用AND聯(lián)在一起在全部字段中檢索。很明顯，這樣檢

7、索的結(jié)果是不符合用戶要求的。 因此，PubMed允許使用雙引號（“”）來強制系統(tǒng)進行短語檢索。 例如，在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入“Single cell”，并用雙引號引起來，然后點擊“Search”，系統(tǒng)會將其作為一個不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫的全部字段中進行檢索。使用雙引號檢索，會自動關(guān)閉詞匯轉(zhuǎn)換功能。Single cell 的例子 免費全文鏈接 PubMed系統(tǒng)為免費的全文設(shè)置 【Free Article】的相關(guān)超級鏈接七、PubMed數(shù)據(jù)庫使用的運算符號 1 截詞符 * PubMed允許使用 號作為截詞符進行截詞檢索。如：鍵入“physi*”，系統(tǒng)會找到那些前一部分是physi的單

8、詞（如phsics，physical，physiology等），并對其分別進行檢索。 截詞功能只限于單詞，對詞組無效。 使用截詞檢索功能時，PubMed系統(tǒng)會自動關(guān)閉詞匯轉(zhuǎn)換功能。 2、強制檢索符“ ” 3 3、布爾邏輯運算符 運算符號AND 、OR、 NOT 4.字段限定檢索符號 例如：“zhang y” au擴充內(nèi)容尋找相關(guān)文章 PubMed檢索時除了在自己數(shù)據(jù)庫中檢索之外還可以在其他數(shù)據(jù)庫中做檢索。例如： BioSystems 、Books、Gene、 Protein（蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫、Nucleotide(核酸序列)數(shù)據(jù)庫、OMIM(孟德爾人類遺傳)數(shù)據(jù)庫、Structure（分子結(jié)構(gòu)

9、模型）數(shù)據(jù)庫和Genome(基因組序列)數(shù)據(jù)庫。 Clinical Queries（臨床查詢） 專為臨床醫(yī)生設(shè)置，通過過濾的方式專門搜索治療、診斷、病原學、預(yù)后和臨床醫(yī)學指南5個范圍的文獻。Topic-Specific Queries（主題查詢） 可以按臨床、主題、特殊期刊、其他特殊要求查詢Pubmed 臨床試驗數(shù)據(jù)庫檢索詞的選擇 盡量使用主題詞。 注意先組檢索詞的使用。在利用詞表查詞時要找全每個詞的下位詞有無此先組型詞組。如“乳腺癌”(Breast Cancer)，應(yīng)首先在MeSH中順著“腫瘤”的下位詞去找。必須注意，詞表中的上下位詞是按概念成族的。因此“乳腺癌”只能作為腫瘤的下位詞出現(xiàn)，而

10、不會作為“乳腺”的下位詞。如果詞表中有“乳腺癌”這一先組式主題詞，就不應(yīng)該用“ Breast AND Cancer”或“ Breast AND Neoplasms”的提問式來檢索。 選擇規(guī)范的專業(yè)檢索詞。不規(guī)范的檢索詞易造成誤檢、漏檢甚至檢索失敗。如檢索某細菌的“耐藥性檢測”的課題，如果用 “drug tolerance AND detection”就會造成檢索失敗，因為“tolerance”是不規(guī)范的檢索詞,規(guī)范的專業(yè)檢索詞應(yīng)該是“drug resistance”。 My NCBI上機作業(yè) 1 檢索胰腺腫瘤方面的綜述 2 檢索2006-2015年中華內(nèi)科雜志被PUBMED收錄的文獻 3 檢索泰山醫(yī)學院2000年至今被pubmed所收錄的文獻THANKS! PubMedPubMed是美國國立醫(yī)學圖書館下屬的國家生物技術(shù)信息中心（NCBI）開發(fā)的、基于WWW的查詢系統(tǒng)。網(wǎng)址： /pubmed 或者 http:/ http:/w