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文檔簡介
1、第一章 緒論1. 分子生物學要研究的主要內(nèi)容是() ()() 參考答案是:基因工程;基因表達調(diào)控研究;結構分子生物學 第二章 DNA 結構一、填空題 (6 分)1. 天然存在的 DNA 分子形式為右手()型螺旋 參考答案是: B2. Cot 曲線方程為: ()參考答案是: C/C0=1/( 1+K2C0t)3. DNA 復性必須滿足兩個條件: ()() 參考答案是:鹽濃度必須高;溫度必須適當高4. DNA 攜帶有兩類不同的遺傳信息,即()信息和()信息。 參考答案是:基因編碼;基因選擇性表達二、判斷題 (12 分)1拓撲異構酶I解旋需要ATP酶。參考答案是:不正確2假基因通常與它們相似的基因位
2、于相同的染色體上。參考答案是:不正確3水蜥的基因組比人的基因組大。參考答案是:正確4一段長度100bp的DNA,具有4100種可能的序列組合形式。參考答案是:正確5單個核苷酸通過磷酸二酯鍵連接到DNA骨架上。參考答案是:正確6在高鹽和低溫條件下由DNA單鏈雜交形成的雙螺旋表現(xiàn)出幾乎完全的互補性,這一過程可看作是一個復性(退火)反應。參考答案是:不正確7生物的遺傳密碼只存在于細胞核中參考答案是:不正確8. Top I解旋需要ATP參考答案是:不正確DNA9瓊脂糖凝膠電泳一EBr電泳法分離純化超螺旋DNA原理是根據(jù)EBr可以較多地插入到超螺旋中,因而遷移速度較快參考答案是:不正確10高等真核生物的
3、大部分DNA是不編碼蛋白質(zhì)的參考答案是:正確11. Cot1/2與基因組復雜性有關參考答案是:正確12. Cot1/2與基因組大小有關參考答案是:正確三、單選題 (4 分)1. DNA變性是由于(D)A 磷酸二酯鍵斷裂;B 多核苷酸解離;C 堿基的甲基化修飾;D 互補堿基之間氫鍵斷裂;E 糖苷鍵斷裂;2.1953 年, Watson 和 Crick 提出( A)A 多核苷酸 DNA 鏈通過氫鍵連接成一個雙螺旋;B DNA 的復制是半保留的,常常形成親本-子代雙螺旋雜合鏈;C 三個連續(xù)的核苷酸代表一個遺傳密碼;D 遺傳物質(zhì)通常是 DNA 而非 RNA。四、名詞解釋 (3 分)1. GT-AG l
4、aw: (3 分)GT-AG法則,內(nèi)含子兩側的序列具有一定的保守性,上有為GT,下游一般為 AG.第三章 基因和基因組一、填空題 (9 分)1. 列舉一個受發(fā)育調(diào)控的復雜多基因家族的例子:()參考答案是:珠蛋白基因家族2. 內(nèi)含子和外顯子聯(lián)結處的序列遵守()法則參考答案是: GT-AG3基因重疊現(xiàn)象是英國分子生物學家()在測定噬菌體X174的DNA序列時發(fā)現(xiàn)的。參考答案是: Sanger4人類基因組計劃完成后要獲得四張圖,即()圖參考答案是:物理圖;遺傳圖;轉錄圖;序列圖5人類基因組計劃中中國完成了的比例是()。參考答案是: 1%6人類基因組的大小是()。參考答案是: 3X109bp二、判斷題
5、 (1 分)1假基因通常與它們相似的基因位于相同的染色體上參考答案是:不正確三、單選題 (6 分)1下面敘述哪些是正確的?( C)AC值與生物的形態(tài)復雜性呈正相關B C值與生物的形態(tài)復雜性呈負相關C每個門的最小 C值與生物的形態(tài)復雜性是大致相關的2關于外顯子和內(nèi)含子的敘述正確的是(C)A外顯子在DNA模板上有相應的互補序列,內(nèi)含子沒有B hnRNA上只有外顯子而無內(nèi)含子序列C 除去內(nèi)含子的過程稱為拼接D 除去外顯子的過程稱為拼接3基因組是(D)A 一個生物體內(nèi)所有基因的分子總量;B 一個二倍體細胞中的染色體數(shù);C 遺傳單位;D 生物體的一個特定細胞內(nèi)所有基因的分子的總量四、名詞解釋 (21 分
6、)l.transcriptomics : (3分)轉錄組學,是一門在整體水平上研究細胞中基因轉錄的情況及轉錄調(diào)控規(guī)律的學科。簡而言之, 轉錄組學是從 RNA 水平研究基因表達的情況。 轉錄組即一個活細胞所能轉錄出來的所有RNA 的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。2. C值矛盾:(3分)一般而言,隨著生物的進化,生物體的結構與功能越復雜,其C 值也越大。但真核生物中 DNA 含量并不與生物的復雜性相一致,這種反?,F(xiàn)象稱為C值矛盾3. 衛(wèi)星 DNA: (3 分)DNA的浮力密度決定于它的 G+ C含量,G+ C含量越高,浮力密度越大。p = 1.660 + 0.00098(G+ C)%
7、g/cm3,在高度重復序列中,常有一些AT含量很高的簡單重復序列,AT含量有時高達97%(如螃蟹DNA中的衛(wèi)星DNA)。在CsCl密度梯度離心時,易與其它DNA分開,形成兩個以上的峰,即含量較多的主峰和高度重復序列的小峰。小峰在主峰旁似衛(wèi)星,稱為衛(wèi)星DNA。4. 基因組: (3 分 ) 對真核生物而言,是指能維持二倍體生物的配子或配子體正常功能的最低數(shù)目的一整套染色體上包含的一整套基因。對原核生物而言,是指它的單個染色體所包含的全部基因5. 多順反子 mRNA: (3分)含有一種以上多肽結構基因的遺傳信息,可翻譯一種以上多肽產(chǎn)物的mRNAo如絕大多數(shù)原核生物、真核生物細胞器,某些動植物病毒和噬
8、菌體的mRNA。6. 假基因: (3分)是基因組中因突變而失活的基因,它和同一家族的活躍基因在結構上和DNA序列上有相似性,但它不具有功能,不能轉錄或翻譯成成熟的mRNA或Pr,或產(chǎn)生過早終止的無活性肽鏈,或由于錯誤的閱讀框架形成無活性的Pr,這種序列成為假基因。7. 基因家族: (3 分)真核生物基因組中有許多來源相同、結構相似、功能相關的一系列基因,成串地排列在一起。這 樣一組基因稱為基因家族。五、簡答題 (70 分)1. 非轉錄間隔區(qū)與轉錄間隔區(qū)分別位于rRNA 重復的什么位置?轉錄間隔區(qū)與內(nèi)含子有何區(qū)別? (10分)rRNA的非轉錄間隔區(qū)位于串聯(lián)轉錄單位之間,而轉錄間隔區(qū)位于轉錄單位的
9、18S RNA基因與28SRNA基因之間。2. 如何確定一個基因所含有的內(nèi)含子的數(shù)目和大小?(10 分)3在真核生物中有哪幾種 RNA聚合酶?簡述他們的特點?(10分)真核生物有三種 DNA pol ( DNA pol inm) : RNA聚合酶I:轉錄產(chǎn)物是 28、18、5.8SrRNA RNA 聚合酶II:轉錄產(chǎn)物是 mRNA RNA聚合酶III:轉錄產(chǎn)物是tRNA、5SrRNA。4. 基因家族有哪些類型?并各舉一個例子。(10分)1) 、簡單多基因家族:rRNA基因。2) 、復雜多基因家族:組蛋白基因及果蠅tRNA基因。3)、發(fā)育調(diào)控的復雜多基因家族:珠蛋白基因5. 什么是蛋白質(zhì)組學?設
10、計一蛋白質(zhì)組學方面的實驗,并說明蛋白質(zhì)組學的基本技術流程?(10分)蛋白質(zhì)組學是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細胞內(nèi)所有蛋白質(zhì)及其動態(tài)變化規(guī)律的科學。蛋白質(zhì)組學研究能闡明某一群體蛋白質(zhì)的功能,也能豐富蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫,是從生物大分子到細胞水平研究 的重要橋梁。實驗設計流程:樣品制備、雙向電泳、質(zhì)譜、生物信息學分析、免疫雜交等6什么是C值矛盾,C值矛盾具體表現(xiàn)在哪些方面。(10分)一般而言,隨著生物的進化,生物體的結構與功能越復雜,其C 值也越大。但真核生物中 DNA 含量并不與生物的復雜性相一致,這種反常現(xiàn)象稱為C值矛盾。C值矛盾表現(xiàn)在:1) 、結構、功能相似的同一類生物中,甚至親緣關系十分接近的物種
11、之間,它們的C值可相差10 倍乃至上千倍。2)、較低等生物的 C值大于較高等生物的 C值3)、真核生物的C值之大,遠遠超過其基因編碼所需人的單倍體基因組由 3X 109bp組成,如將內(nèi)含子算上,哺乳動物的一個基因長約58Kb,少數(shù)可達10Kb,若按此計算,哺乳動物應有4060萬個基因。目前研究表明,實際基因數(shù)估計不會超過這個數(shù)值的10% (3 4萬)。有些基因的序列不編碼蛋白質(zhì),則基因組中只含有2%3%的DNA序列用于編碼蛋白質(zhì)。7. 試比較原核生物基因組和真核生物基因組的特點。(10分)原核生物基因組的特點:不具備明顯的核結構,只有核類,即DNA相對集中的區(qū)域。基因組小,一般只有一個染色體,
12、大多為雙鏈環(huán)狀,少數(shù)為單鏈或線形。染色體DNA并不于Pr固定地結合,不具核小體結構。結構簡練,重復序列和非編碼序列很少,體現(xiàn)經(jīng)濟原則。功能密切相 關的基因構成轉錄單元,并常轉錄成含多基因信息的mRMA分子,稱為多順子反子 mRMA。有重疊基因:同一段 DNA片段可以編碼 2-3中Pr分子。真核生物基因的特點:結構復雜,基因極龐大。有若干個染色體,一般不呈環(huán)狀,DNA與Pr緊密結合形成染色體,具多個復制起始點。存在核膜,DNA的轉錄和翻譯存在時空差別。有很多不編碼序列(內(nèi)含子,內(nèi)元,intron )或介入序列。有大量的重復序列功能上密切相關的基因 集中程度中程度不如原核生物高,大多分散在不同的染
13、色體上,但有許多基因家族和假基因存在。有細胞器基因,chl-DNA mit-DNA,其密碼子有特異性。第四章 DNA 復制一、填空題 (9 分)1復制叉上DNA雙螺旋的解旋作用由()催化的,它利用來源于ATP水解產(chǎn)生的能量沿 DNA鏈單向移動。參考答案是:DNA解旋酶2. DNA pol S的生物學功能是()參考答案是:前導鏈合成3. DNA pol a的生物學功能是()參考答案是:前導鏈起始和后續(xù)鏈合成4在DNA復制過程中,另一條非連續(xù)合成的子鏈稱為()。參考答案是:后續(xù)鏈5在DNA復制過程中,連續(xù)合成的鏈稱為()。參考答案是:前導鏈6在DNA復制過程中,另一條非連續(xù)合成的子鏈稱為()。參考
14、答案是:后續(xù)鏈7在DNA復制過程中,連續(xù)合成的鏈稱為()參考答案是:前導鏈8. © X174環(huán)狀DNA的復制方式為()型復制。參考答案是:滾環(huán)9. E. coli DNA的復制方式是()型復制;參考答案是:0二、判斷題 (4 分)1. DNA的復制需要 DNA聚合酶和 RNA聚合酶。參考答案是:正確2所謂半保留復制就是以DNA親本鏈作為合成新子鏈 DNA的模板,這樣產(chǎn)生的新的雙鏈DNA分子由一條舊鏈和一條新鏈組成。參考答案是:正確3在原核細胞內(nèi)DNA引物酶是同解旋酶緊密地耦聯(lián)在一起的,而真核細胞的DNA引物酶是同DNA pola緊密地耦聯(lián)在一起的參考答案是:正確4在DNA復制中,先導
15、鏈上 DNA沿5X 3/方向合成,而在后續(xù)鏈上則沿3X 5 /方向合成。參考答案是:不正確三、單選題 (8 分)1使DNA超螺旋結構松馳的酶是(C)A 引發(fā)酶B 解旋酶C 拓撲異構酶D 端粒酶E 連接酶2真核生物復制子有下列特征,它們(C )A 比原核生物復制子短得多,因為有末端序列的存在B 比原核生物復制子長得多,因為有較大的基因組C 通常是雙向復制且能融合D全部立即啟動,以確保染色體的S期完成復制E 不是全部立即啟動,在任何給定的時間只有大約15%具有活性3個復制子是(C)A細胞分裂期間復制產(chǎn)物被分離之后的DNA片段B復制的DNA片段和在此過程中所需的酶和蛋白質(zhì)C任何自發(fā)復制的 DNA序列
16、(它與復制起點相連)D 任何給定的復制機制的產(chǎn)物(如單環(huán))E復制起點和復制叉之間的DNA片段4原核生物 DNA復制中, DNA Pol III;解鏈酶; DNA Pol I;DNA指導的RNA Pol;DNA連 接酶;SSB它們的作用順序是(E )A ;B ;C ;D ;E 四、名詞解釋 (19分)1. semi-conservation replication : (3 分)半保留復制,DNA復制時新合成的 DNA的一條鏈是新合成的,一條鏈由原DNA保留,故稱DNA的復制為半保留復制。2. 復制體:(3分)DNA復制時由許多酶和蛋白質(zhì)聚集在一起構成復制體。3. 試闡述原核生物 DNA復制與真
17、核生物 DNA復制的異同點:(10分) 相同點:都都是保留和半不連續(xù)復制,復制過程都有起始,延長和終止三階段,都必須有相應功能的Pr (如 SSB和DNA pol參加。不同點: DNA pol inm,其中 DNA pol川是主要的 DNA pol。真核生物有 DNA pol a、B、丫、,其中DNA pola、DNA pol 3是主要的DNA pol :復制起點和速度不同:原核生物只有一個 復制起點,而真核生物有多個復制起點。原核生物復制速度大于真核生物;真核生物在完成復制 之前,各個起始點上的 DNA的復制不能再開始,而在快速生長的原核生物中,復制起始點上可以連 續(xù)開始新的DNA復制。引物
18、酶:原核細胞中引物酶同解族酶偶聯(lián),而真核細胞內(nèi)引物酶同后滯鏈 的復制酶DNA pol a偶聯(lián)。鏈的延伸:原核生物中DNA pol川同時負責前導鏈和后續(xù)鏈合成,而真核生物由pol a合成后滯鏈,pol 3負責合成前導鏈。4. 回環(huán)模型: (3 分)DNA 雙螺旋是同時進行復制的,在復制叉處后滯鏈模板形成一個環(huán),以適應雙鏈同時進行復制。 這種復制模型稱為回環(huán)模型。回環(huán)模型認為,DNA聚合酶川不對稱二聚體復合物能同時完成前導鏈和后滯鏈的合成,但前導鏈總比后滯鏈先形成一個片段,后滯鏈總遲緩一個片段,所以同時進入合 成反應的兩條親代模板鏈片段不互補。在復制體結構中,后滯鏈模板繞聚合酶形成一180 0折返
19、環(huán),穿過聚合酶川的裂縫,從而使這兩條模板鏈在此呈相同的5/走向。隨著后滯鏈模板在聚合酶中穿行,聚合酶便從 RNA引物合成岡崎片段。當合成子鏈達到前一段岡崎片段的5 / -P端時,后滯鏈模板即脫離開 DNA聚合酶川,回環(huán)解開。與此同時,前移的復制體內(nèi)引物酶又起始轉錄一段新的 RNA引物。復制體中的 DNA聚合酶川而聚體總是同時合成出兩條子鏈,只是與前導鏈相比,后滯鏈 總是推移了一個岡崎片段。五、簡答題 (30 分)1簡述DNA復制的過程。(10分)2以大腸桿菌為例,說明 DNA復制的起始過程。(10分)1、DnaA結合到OriC右側的4個9bp共同序列上,直到達 20-40個DnaA單體蛋白結合
20、成一個核 心。然后DnaA蛋白作用于 OriC左側的3個13bp重復序列上,這幾個位點的 DNA融化解鏈,形成 開放復合物。2、DnaB和DnaC以聚集體的形式與開放復合物偶聯(lián),形成一個復合物。3、 每個DnaB六聚體結合6個DnaC單體,產(chǎn)生的蛋白聚集體為 480KD,直徑6nm球狀體。4、 DnaA旋轉酶使解旋產(chǎn)生的正超恢復為負超,SSB使產(chǎn)生的單鏈保持單鏈狀態(tài)。5、DNA pol從Ori區(qū)閱讀,并在 Ori區(qū)終止,產(chǎn)生一段 RNA引物,其3'-OH引導DNA pol的合成反 應。3試述DNA復制過程中需要哪些酶和蛋白質(zhì)參與,各有何功能?(10分)DNA聚合酶:DNA合成引物酶和
21、RNA 聚合酶:合成引物解螺旋酶:解開螺旋SSB使解開的螺旋保持單鏈狀態(tài)DNA連接酶:岡崎片段的連接 旋轉酶:超螺旋變?yōu)樨摮菪谖逭?基因的轉錄一、填空題 (13 分)1發(fā)現(xiàn)乳糖操縱子而獲得諾貝爾獎的兩位科學家是()和()參考答案是: Jacob, Monod2. E.coli RNA pol全酶中3亞基的功能是()。參考答案是:識別起始位點3. E.coli RNA pol全酶中沒有()亞基的酶稱為核心酶。參考答案是: 34.E.coli RNA pol 全酶的亞基組成為()參考答案是:a 2 3 2 S y5真核生物的mRNA加工過程中,在 3 /端加上()結構參考答案是: polyA6
22、識別轉錄終止部位的是()因子參考答案是:p7. RNA轉錄過程中識別轉錄啟動子的是()因子 參考答案是: S8. 在3 /端加上的polyA尾巴由()酶催化參考答案是:PolyA聚合酶9. 真核生物的mRNA加工過程中,5 /端加上() 參考答案是:帽子結構10. 基因轉錄時,產(chǎn)物 RNA鏈有()bp個核苷酸與模板形成 RNA-DNA雜合雙鏈。 參考答案是: 1211. 在RNA pol結合和轉錄的 DNA模板區(qū)域,有()bp DNA形成解鏈區(qū), 參考答案是: 1712. 真核生物中已發(fā)現(xiàn)三種 RNA Pol,其中()催化的轉錄產(chǎn)物是mRNA。參考答案是: RNA Pol II二、判斷題 (1
23、 分 )1. 所有高等真核生物的啟動子中都有TATA盒結構參考答案是:不正確三、單選題 (10 分)1. 下列關于mRNA的描述錯誤的是(A )A原核細胞的mRNA在翻譯開始前需加 Poly (A)尾巴B在原核細胞的許多 mRNA攜帶著幾個多肽鏈的結構信息C真核細胞mRNA在5 /端有特殊的帽子結構D真核細胞轉錄生成的 mRNA經(jīng)常被加工E真核細胞 mRNA是由RNA Pol II催化合成的2. 無論是在原核生物還是在真核生物中,初級轉錄產(chǎn)物都需經(jīng)過一定程度的修飾和加工,才能表現(xiàn)其功能。在真核生物,mRNA有多種修飾方式但不包括(C)A 5 /端加帽子結構;B 經(jīng)剪接移除內(nèi)含子;C 3/端加C
24、CA結構;D 3/端加Poly (A)尾巴;3. 真核生物中tRNA和5S rRNA的轉錄由哪種酶催化(D )A RNA Pol I;B 逆轉錄酶;C RNA Pol I;ID RNA Pol III;E RNA Pol 全酶;4. 關于啟動子的敘述哪項是正確的(C)A mRNA開始被翻譯的序列;B開始轉錄生成 mRNA的DNA序列;C RNA Pol開始結合的 DNA序列;D 產(chǎn)生阻遏物的基因;E阻遏蛋白結合 DNA的部位;5. 下列哪一項是對三元轉錄復合物的正確描述(C )A Z因子、核心酶和雙鏈 DNA在啟動子形成的復合物;B全酶、TFI和解鏈DNA雙鏈形成的復合物;C全酶、模板DNA和
25、新生RNA形成的復合物;D Z因子、核心酶和促旋酶形成的復合物四、名詞解釋 (25 分)1. CAP蛋白如何作為乳糖操縱子的正調(diào)節(jié)物起作用?:(10分)CAP即cCAM活化蛋白,結合cCAM的CAP可與乳糖操縱子的調(diào)節(jié)區(qū)結合, 使RNA聚合酶對該 DNA 的轉錄增強。2. promoter : (3 分)啟動子,啟動子是位于結構基因 5 /端上游的一段 DNA序列,能夠指導全酶(holoenzyme)同模板正 確結合,活化 RNA聚合酶,啟動基因轉錄。3. housekeeping gene: (3 分) 看家基因,某些基因產(chǎn)物對生命全過程都是必須的,這類基因在一個生物個體的幾乎所有細胞中均表
26、達。4. RNA interference : (3 分)NA干擾,RNAi是指在進化過程中高度保守的、由雙鏈RNA( double-stranded RNA , dsRNA)誘發(fā)的、同源mRNA高效特異性降解的現(xiàn)象。5. RNA編輯:(3分)RNA編輯,基因轉錄產(chǎn)生的 mRNA分子中,由于核苷酸的缺失,插入或置換,基因轉錄物的序列 不與基因編碼序列互補,使翻譯生成的蛋白質(zhì)的氨基酸組成,不同于基因序列中的編碼信息,這種 現(xiàn)象稱為RNA編輯。6. 暫停信號: (3 分)DNA模板中4種堿基對RNA pol都是同等的,但當RNA pol遇到特殊序列時,轉錄的速度會突然出 現(xiàn)變化,可少于 0.1bp
27、/s,這段序列稱為暫停信號。暫停狀態(tài)的模板鏈多為GC富集區(qū)或反向重復序列五、簡答題 (30 分)1. mRNA前體加工中加尾和加帽的生物學功能有哪些?(10分)加尾的功能:有利于 mRNA穿過核孔;穩(wěn)定 mRNA ;增強翻譯效率。加帽的功能:mRNA穩(wěn)定;增加蛋白質(zhì)合成效率;帽子結構對mRNA前體剪接是必需的。2. 試比較原核生物和真核生物啟動子結構的差別(10分)Pribnow box (-10 序列)、Sexfama box (-35 序列)TATA box( Hogness box)、 CAAT box、 GC box3. 試比較原核生物和真核生物基因轉錄的差異(10分) DNA pol
28、的差別:原核生物只有一種 DNA pol負責轉錄所有類型的 RNA;而真核生物有三種 DNApol ( DNA pol inm),負責不同類型基因的轉錄,合成不同類型的RNA。 轉錄產(chǎn)物的差別:真核生物的初始產(chǎn)物包含內(nèi)含子序列,因此轉錄產(chǎn)物需經(jīng)過剪切,連接等過程除去內(nèi)含子;原核生物的初始產(chǎn)物與Pr序列成線性關系。 轉錄產(chǎn)物的加工:真核生物轉錄產(chǎn)物要經(jīng)過修飾作用,即與5/端帽化和3/端聚合化。 與基因結構相吻合,原核生物mRNA是多順子反子,而真核生物mRNA是單順反子。時空差異:真核生物成熟的 mRNA轉移到細胞質(zhì)內(nèi)參與 Pr的生物合成,轉錄和翻譯相對獨立;而原 核生物的轉錄和翻譯在細胞的同一
29、部位進行。六、論述題 (10 分)1.(10分)試比較真核生物 RNA聚合酶II識別的啟動子與原核生物 RNA聚合酶所識別的啟動子的結構 特點,各結構單元的功能是什么?第六章 蛋白質(zhì)的生物合成一、填空題 (5 分)1. DNA 后隨鏈合成的起始要一段短的() ,它是由()以核糖核苷酸為底物合成的。 參考答案是:RNA引物;DNA引發(fā)酶2在DNA復制和修復過程中,修補 DNA螺旋上缺口的酶稱為()。參考答案是:DNA連接酶3真核生物蛋白質(zhì)生物合成的終止因子是() 參考答案是: eRF4原核生物多肽合成的起始氨基酸為() 參考答案是: Met5真核生物多肽合成的起始氨基酸為()參考答案是: fMe
30、t二、判斷題 (5 分)1無義密碼子同等于終止密碼子。參考答案是:正確2核糖體小亞基最基本的功能是連接mRNA與tRNA,大亞基則催化肽鍵的形成。參考答案是:正確3密碼的偏愛性是指不同種屬的生物對簡并密碼具有不同的使用頻率 參考答案是:正確4因為AUG是蛋白質(zhì)合成的起始密碼子,所以甲硫氨酸只存在于蛋白質(zhì)的N末端。參考答案是:不正確5搖擺堿基位于密碼子的第三位和反密碼子的第一位參考答案是:正確三、單選題 (20 分)1細菌核糖體由()及()亞基組成。(B)A 20S, 40SB 30S, 50SC 40S, 60SD 50S, 70S2以下哪些不是遺傳密碼的特征? (A)A 密碼子與氨基酸的數(shù)量
31、相同B 密碼子幾乎在任一物種中都通用C 一些氨基酸由多個密碼子編碼D 密碼子是簡并的3“同工 tRNA” 是(C)A識別冋義mRNA密碼子(具有第三堿基簡并性)的多個tRNAB 識別相同密碼子的多個 tRNAC 代表相同氨基酸的多個 tRNAD由相同的氨酰tRNA合成酶識別的多個 tRNAE 多種識別終止密碼子并導致讀的 tRNA4反密碼子中哪個堿基對參與了密碼子的簡并性(搖擺性)? (A)A 第一個B 第二個C 第三個D 第一個與第二個E 第二個與第三個5. 核糖體的 E 位點是( B)A 真核 mRNA 加工位點B tRNA 離開原核生物核糖體的位點C 核糖體中受 EcoR I 限制的位點
32、D 電化學電勢驅(qū)動轉運的位點6. 起始因子 IF-3 的功能是( B)A 如果同 40S 亞基結合,將促進 40S 與 60S 亞基的結合B如果同30S亞基結合,將促進 30S與50S亞基的結合C如果同30S亞基結合,促進 30S亞基的16S rRNA與mRNA的SD序列相互作用D指導起始tRNA進入30S亞基中與 mRNA結合的P位點E激活核糖體的GTP酶,以催化與亞基相連的 GTP的水解7. 下列敘述不正確的是( A)A 共有 20 個不同的密碼子代表遺傳密碼B 色氨酸和甲硫氨酸都只有一個密碼子C 每個核苷酸三聯(lián)體編碼一個氨基酸D 不同的密碼子可能編碼同一個氨基酸E 密碼子的第三位具有可變
33、性8. 下列關于蛋白質(zhì)的生物合成的描述錯誤的是( A)A活化氨基酸的羧基與相應 tRNA 5 /端核苷酸中核糖上的 3 /羥基以酯鍵連接B 完成多肽鏈合成以前,甲酰甲硫氨酸殘基就從 N 端切掉C mRNA上密碼子的閱讀方向是由 5、3 /端D多肽鏈從N端tC端延伸E 新合成的多肽鏈需經(jīng)加工修飾才具有生物活性9反密碼子是UGA,它可識別下列哪個密碼子(C)A ACUB CUAC UCAD UAC10. 稀有核苷酸存在于下列哪一類核酸中(C )A rRNA;B mRNA;C tRNA;D 核仁 DNA;E mitDNA;四、名詞解釋 (38 分) 1.密碼偏愛性: (10 分 )終止并需要 tRN
34、A有助于終止的發(fā)P 位點離開核糖2. 簡述真核細胞中翻譯終止的過程:(10分)由于氨酰tRNA上沒有反密碼子能夠與三個終止密碼子互補配對,因此翻譯終止。的協(xié)助,此時沒有氨基酸能夠連接到位于P位點的肽酰tRNA上。釋放因子(eRF)生,可能使tRNA上的氨基酸C端不需要轉肽基和脫酰基而發(fā)生轉位。新生肽直接從體并進入細胞質(zhì)(細胞質(zhì)核糖體)或進入轉位酶通道(內(nèi)質(zhì)網(wǎng)核糖體)。3.ORF:(3 分)開放閱讀框,從起始密碼子ATG開始到終止密碼子為止的編碼AA的核苷酸序列。4. trans-acting factor : (3 分) 反式作用因子,是直接或間接識別和結合在各類順式作用元件核心序列上,參與調(diào)
35、控靶基因轉錄 的蛋白質(zhì)。5. 反 SD 序列: (3 分)與mRNA上的SD序列相對應,在核糖體小亞基16SrRNA上含有一段 UCCUC(序列,成為反 SD序列6. 延伸因子 EF:(3 分)原核生物蛋白質(zhì)合成過程中負責氨酰-tRNA進入核糖體的 A位的延伸因子為 EF-Tu和EF-Ts負責移位的是 EF-G。7.SD序列:(3分)AUG上游的9 13個核苷酸有一段可與核糖體結合的共同序列,一般為 AGGAGG稱為SD序列。 與核糖體16S rRNA的3端的CCUCCU互補,使結合于 30S亞基上的起始 tRNA正確定位于 mRNA的 起始密碼子 AUG。8 .擺動假說: (3 分)1966
36、年,Crick提出了擺動假說(wobble),認為密碼子與反密碼子的配對中,前兩對嚴格遵守堿基 配對原則,第三對堿基有一定自由度可以擺動,因而使某些tRNA可以識別1個以上的密碼子。擺動假說也稱為三中讀二( 2 out of 3 reading)。五、簡答題 (40 分)1簡述啟動子、帽子結構、AUG的區(qū)別? (10分)2. 原核生物的蛋白質(zhì)合成分為哪些階段?簡述各階段的主要事件。(10分)3. 簡述真核與原核細胞中翻譯起始的主要區(qū)別(10分)1、 起始因子不同:原核生物翻譯起始因子為IF1, IF2, IF3。真核生物起始因子為elF、elF2、elF3等。2、模板不同:真核生物有帽子、尾巴
37、,原核無。3、 真核生物40S復合物形成需要帽子結合蛋白,原核30S起始復合物形成不需要。4、 核糖體不同:真核翻譯起始有關核糖體為40S,原核為30S。5、 起始氨基酸:真核生物為fMet ,原核為 Met 。4. 論述原核生物蛋白質(zhì)生物合成過程(10分)蛋白質(zhì)合成起始:IF1、IF2、IF3、GTP等(2分)蛋白質(zhì)合成延伸:進位(EF-Tu EF-TS,肽鍵的形成,移位(EF-G)( 6分)蛋白質(zhì)合成終止: RF-1、 RF-2、 RF-3( 2 分)第七章PCR技術一、填空題 (4 分)1采用PCR技術可擴增兩個引物之外的未知序列。參考答案是:反向 PCR2設計PCR反應引物時,引物 3
38、 /末端的末位堿基最好不用()參考答案是: A3. PCR的英文全稱是()參考答案是: polymerase cha in reaction4. PCR是由美國科學家()等人在1983年發(fā)明的參考答案是:Mullis二、判斷題(1分)1所謂引物就是同 DNA互補的一小段 RNA分子參考答案是:不正確三、名詞解釋(12分).multiple cloning site : (3 分)多克隆位點,MCS,是包含多個限制性酶切位點的一段很短的DNA序列。也稱為多位點接頭。 多克隆位點廣泛應用于分子克隆和亞克隆工程中。2. RT-PCR (3 分)反轉錄PCR先反轉成CDNA再用cDNA為模板進行PCR
39、擴增,一般用于基因表達分析。3. nested-PCR (3 分)巢式PCR先用一對外引物擴增,然后以第一次PCR擴增產(chǎn)物為模板,再用內(nèi)引物進行擴增。4. “中途進退式” PCR (3分)Drop-in Drop-out PCR外引物設計得比內(nèi)引物長一些,且用量較少,同時在第一次PCR時采用較高的退火溫度,而第二次PCR采用較低的退火溫度,這樣在第一次PCR時,由于較高的退火溫度內(nèi)引物不能與模板結合,故只有外引物擴增產(chǎn)物。經(jīng)過若干循環(huán),待外引物基本消耗完畢后,無須取出第一次PCR產(chǎn)物,只需降低退火溫度,即可直接進行第二次 PCR擴增.四、簡答題(50分)1.inverse PCR(10分)反向
40、PCR用于擴增靶 DNA區(qū)段之外的兩側未知 DNA序列的方法。2. 已知A基因的cDNA序列如下,起始密碼和終止密碼均用框標出,試設計一對引物擴增該基因的 ORF。(10 分)上游引物:5 -ATGTCCGAAGTAATCGAAGAACATC(20-25bp 均正確)下游引物:5 -TTAatatcgtctcgtcgtccttcctc-反向互補,終止密碼子包括在內(nèi))3. PCR引物設計時應該注意哪些問題?(10分)引物長度以16-30為宜;2)引物擴增跨度:以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至 10kb的片段;3)引物堿基:G+C含量以40-60%為宜;4)堿基分布的隨機性:ATGC
41、隨機分布,避免 5個以上的相同堿基成串排列。尤其是引物的3 端,不應有連續(xù) 3個G或C; 5)避免引物內(nèi)部出現(xiàn)二級結構,避免兩條引物間互補,特別是3'端的互補,否則會形成引物二聚體,產(chǎn)生非特異的擴增條帶。6)兩引物之間不互補,一對引物之間不應多于 4個連續(xù)堿基有互補性, 以免產(chǎn)生引物二聚體; 7)引物3 '端是引發(fā)延伸的點,不應錯配:由于ATGC引起錯配有一定規(guī)律,以引物 3'端A影響最大,因此,3 '端的末位堿基最好選TCG而不選A。8)引物的特異性:引物應與核酸序列數(shù)據(jù)庫的其它序列無明顯同源性。同源性不要超過70%或有連續(xù)8個互補堿基同源;9)引物5
42、9;端可以修飾4. 寫出一 PCR反應體系和反應條件(10分)PCR反應體系(4分)10XPCR Buffer2.5ulMgCl21.5uldNTPs3ulP11ulP21ul模板1ulTaqase0.5ulQQH2O14.5ulPCR反應條件(3分)94 C 3min , 34cycles (94 C 50s, 55 C 50s, 72 C 1min ), 72 C 8min , 4C hold5試述PCR技術的基本原理及其應用 (10分)依據(jù)體內(nèi) DNA 的半保留復制機理及 DNA 分子在不同溫度下雙鏈和單鏈可以相互轉變的性質(zhì),人 為地控制體外合成系統(tǒng)的溫度,使雙鏈DNA變成兩條單鏈 DN
43、A,單鏈DNA用4種dNTPs在引物和DNA pol的作用下合成新生的 DNA互補鏈。包括高溫變性、低溫退火和適溫延伸三個階段。PCR的應用:在分子生物學中的應用;在臨床醫(yī)學中的應用;在法醫(yī)鑒定方面的應用。第八章 分子生物學實驗一、填空題 (1 分)1. RNA提取時,由于 RNA易降解,需要對離心管、槍頭等用()水處理參考答案是: DEPC二、名詞解釋 (38 分).Southern blotting : (3 分)Southern雜交是分子生物學的經(jīng)典實驗方法。其基本原理是將待檢測的DNA樣品固定在固相載體上 ,與標記的核酸探針進行雜交 ,在與探針有同源序列的固相DNA 的位置上顯示出雜交
44、信號。通過Southern雜交可以判斷被檢測的 DNA樣品中是否有與探針同源的片段以及該片段的長度。2. BLAST: (3 分)BLAST (Basic Local Alig nment Search Tool)是 一套在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫或 DNA數(shù)據(jù)庫中進行相似性比 較的分析工具。3. NCBI網(wǎng)站包含哪些信息和功能?:(10分)NCBI網(wǎng)站包括PubMed數(shù)據(jù)庫、核酸數(shù)據(jù)庫、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫、蛋白質(zhì)結構數(shù)據(jù)庫、EST數(shù)據(jù)庫等。可以查找序列、序列比對等功能。4. gene chip: (3 分)基因芯片, 該技術系指將大量探針分子固定于支持物上后與標記的樣品分子進行雜交,通過檢測每個探針分子的雜交
45、信號強度進而獲取樣品分子的數(shù)量和序列信息。通俗地說,就是通過微加工 技術,將數(shù)以萬計、乃至百萬計的特定序列的DNA片段(基因探針),有規(guī)律地排列固定于 2cm2的硅片、玻片等支持物上,構成的一個二維DNA探針陣列,與計算機的電子芯片十分相似,所以被稱為基因芯片。5. Blastn: (10分)BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在 DNA數(shù)據(jù)庫中進行相似性比較的分析工具, 用DNA序列在DNA序列數(shù)據(jù)庫中進行比對的方法。6. Blastp: (3 分)BLAST (Basic Local Alig nment Search Too是 一套在蛋
46、白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中進行相似性比較的分析工具, 用蛋白質(zhì)序列在蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫中進行比對的方法。7. NCBI: (3分)美國國家生物技術信息中心,是三大核酸序列數(shù)據(jù)庫之一,其網(wǎng)址是 。8. RACE: (3 分)rapid amplification of cDNA end。包括 5 RACE技術和 3' RACE技術。三、簡答題 (180 分)1. 如何設計簡并引物?(10 分 )2.列舉 2-3 個常用的分子標記。(10分)3.如何查找一個基因的序列? (10 分)4. 列舉 2-3 個你知道的生物信息學常用軟件。(10 分 )5. RNA提取過程中要注意
47、哪些問題?(10分)6如何確定RNA提取的質(zhì)量? (10分)7. 引物設計時應該注意什么? (10 分)8重組載體構建中,限制性內(nèi)切酶如何確定?(10分)9簡述如何將一個基因轉入大腸桿菌中?(10分)10. 簡述DNA提取的步驟(10分)11. 什么是RT-PCR可應用在分子生物學的哪些方面?(10分)12. 簡述核酸分子雜交的種類及其作用原理(10分)Southern 雜交和 Northern 雜交。Southern雜交原理:研究基因拷貝數(shù)的一個方法。將電源分離的待測DNA片段轉印并結合到膜上,然后用標記的 DNA探針檢測待測 DNA的一種方法。Northern雜交原理:研究基因表達的一個方
48、法。雜交受體是RNA,探針是DNA或RNA片段。原理是將待測的 RNA樣品經(jīng)電泳分離后轉印并結合到膜上,然后用標記的DNA探針檢測待測 RNA的一種方法。13. 據(jù)你所知,分子生物學實驗中所涉及的引物有哪幾種,各有何用途和特點(10分)1、PCR引物:一對,擴增引物之間的序列。2、簡并引物:一個氨基酸可能有多個遺傳密碼,包含所有氨基酸可能的密碼的一組引物。 簡并引物可以通過氨基酸序列或核苷酸序列比對后設計。3、隨機引物:一定數(shù)量的核苷酸隨機排列,可用作反轉錄。4、ologo (dT) 17引物:用于RT-PCF或反轉錄。14什么是RACE技術?如何采用RACE技術克隆得到基因的 cDNA全長序
49、列? (10分)RACE是一項基于已知 cDNA序列快速克隆5 '和3'末端序列的技術。常用的方法是:先獲取 mRNA,去掉mRNA 5 '端帽子,加上寡聚接頭,逆轉錄后,以寡聚接頭部分序列和3'端反向引物進行PCR擴增,獲得5 '端序列。3' RACE以5 '基因特異引物和 3'端寡聚dT下游部分序列為引 物進行PCR擴增獲得3 '端序列。5' RACE 3 RACE和核心片段通過拼接得到基因cDNA全長15. 通過Northern雜交我們可以獲取什么信息?(10分)可以表明探針所代表的基因在特定時段、特定條件下
50、或某一發(fā)育階段的mRNA 水平的表達情況。由 Northern 雜交信號的強弱可比較同一基因在不同組織、不同發(fā)育階段或不同條件下的表達差 異。16. 敘述微生物(大腸桿菌) 、植物和動物轉基因最常用的方法及原理 (10分)微生物轉化方法:CaCI2轉化法,微生物用 CaCI2制作感受態(tài)細胞,用熱擊方法將重組載體導入 感受態(tài)細胞,通過含相應抗生素的培養(yǎng)基平板篩選,挑選抗性單菌落,PCR鑒定。植物轉化方法:農(nóng)桿菌介導法,將重組載體轉入農(nóng)桿菌中獲得重組農(nóng)桿菌,用農(nóng)桿菌浸染植物 傷口,共培養(yǎng)后農(nóng)桿菌中T-DNA片段可與植物核 DNA發(fā)生重組,通過組織培養(yǎng)方法再生出完整植株, 抗生素篩選抗性植株,PCR
51、鑒定。動物轉基因方法:顯微注射法。用極細的注射針將外源基因片段直接注射到胚胎細胞,通過胚胎 培養(yǎng)獲得轉基因動物。17. 如何將一個基因轉入大腸桿菌中,簡單寫出實驗流程(10分)RNA提取、反轉錄合成 cDNA、基因PCR擴增、回收、重組載體構建、大腸桿菌感受態(tài)的制備、 轉化、挑單斑、PCR檢測18. 什么是藍白斑篩選法?長出的白斑一定是轉基因的嗎?為什么?(10分)很多載體都攜帶有一段來自大腸桿菌的Lac操縱子DNA區(qū)段,其中含有 LacZ基因,它編碼3 -半乳糖苷酶N端的116個氨基酸,載體轉化的宿主細胞為LacZ基因型,它表達3斗乳糖苷酶的 C端肽鏈,當載體與宿主細胞同時表達兩個片段時,宿
52、主細胞才有3 -半乳糖苷酶活性,使特異的底物X-Gal變?yōu)樗{色化合物,而重組子由于基因插入使基因失活,不能形成互補,在含有X-Gal的平板上,含陽性重組子的細菌為無色菌落。白色菌落并不一定是轉基因菌株。因為以下情況也會出現(xiàn)白斑:載體自連;Amp、IPTG Xgal沒涂均勻;有時插入片段也出現(xiàn)藍斑,只要編碼框沒有被破壞。四、論述題 (20 分)1. (20分)將Bt基因轉入煙草,從載體的選擇到外源基因的表達,列舉你用的步驟Bt基因首先克隆入合適的克隆載體,再轉入植物雙元表達載體,使Bt基因轉入雙元表達載體的MCS中,上游是CaMV啟動子,利用雙元載體的 T-DNA進行基因的轉移、整合。重組的雙元
53、表達載 體以根癌農(nóng)桿菌介導, 轉入煙草愈傷組織,利用葉盤法進行轉化,外源Bt基因整合到煙草基因組中, 伴隨宿主基因的表達而表達。轉基因植株的篩選可以利用 T-DNA 左右邊界間的抗性標記進行,如卡拉抗性標記。抗性植株的 Southern雜交證實 DNA水平上 Bt基因的整合;Northern雜交,確證 Bt基因的轉錄; Western雜交 確證表達的蛋白質(zhì)。分子生物學綜合測試卷 1一、填空題 (31 分)1. 真核生物蛋白質(zhì)生物合成的終止因子是()。 參考答案是: eRF2. 真核生物mRNA的5'末端有一個帽子結構是(),3'末端有一個尾巴是()。參考答案是: m7GpppA
54、p; polyA3. 內(nèi)含子和外顯子聯(lián)結處的序列遵守()法則。參考答案是: GT-AG4基因重疊現(xiàn)象是英國分子生物學家()在測定噬菌體 X174的DNA序列時發(fā)現(xiàn)的。參考答案是: Sanger5在RNA pol結合和轉錄的DNA模板區(qū)域,有()bpDNA形成解鏈區(qū),產(chǎn)物 RNA鏈有()個核 苷酸與模板形成RNA-DNA雜合雙鏈。參考答案是: 17;126. DNA pol a的生物學功能是(),DNA pol S的生物學功能是()。參考答案是:前導鏈起始和后續(xù)鏈合成;前導鏈合成7設計PCR反應引物時,引物 3 /末端的末位堿基最好不用()。參考答案是: A8. PCR是由美國科學家()等人在 1983年發(fā)明的,PCR的英文全稱是()。參考答案是: KB Mullis; polymerase chain reaction9在個體發(fā)育中,位于人類第()號染色體上的a型珠蛋白亞基的表達時間順序是(),位于人類第()號染色體上的B型珠蛋白亞基的表達時間順序是()。參考答案是:16; E - a ; 11 ; £ - y -3 - 310. E. coli DNA的復制方式是()型復制;© X174環(huán)狀DNA的復制方式為()型復制。參考答案是:0,滾環(huán)11. 人類基因組的大小是(),人類基因組計
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