基于最小偏態(tài)閾值的分割法在MRI圖像人類腦部實(shí)質(zhì)提取的應(yīng)用_第1頁(yè)
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基于最小偏態(tài)閾值的分割法在MRI圖像人類腦部實(shí)質(zhì)提取的應(yīng)用_第4頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、圖形圖像基于最小偏態(tài)閾值的分割法在MRI圖像人類腦部實(shí)質(zhì)提取的應(yīng)用唐聞(中南大學(xué)信息物理工程學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程研究所,長(zhǎng)沙410083)摘要:針對(duì)于MRI圖像人類腦部實(shí)質(zhì)的提取,提出結(jié)合形態(tài)學(xué)的基于最小偏態(tài)指標(biāo)閾值分割3方法,該方法采用最小偏態(tài)指標(biāo)從人腦MRI圖像中自動(dòng)提取大腦皮層和顱骨及其他非腦成分,結(jié)合形態(tài)學(xué)的處理最終僅保留大腦部分。試驗(yàn)證明該方法簡(jiǎn)單可行,且效果很好。關(guān)鍵詞:最小偏態(tài);腦實(shí)質(zhì);MRI;圖像分割0引言醫(yī)學(xué)圖像分割到今天仍然沒(méi)有獲得很好的解決,樣本數(shù)據(jù)的均值為樣本的一階統(tǒng)計(jì)矩,它衡量數(shù)據(jù)的平均值大小;方差為樣本的二階統(tǒng)計(jì)中心矩,它衡量隨機(jī)數(shù)據(jù)離散的程度;而偏態(tài)指標(biāo)為樣本的三階中

2、心統(tǒng)計(jì)矩,它衡量隨機(jī)數(shù)據(jù)分布偏離正態(tài)分布的程度。設(shè)隨機(jī)樣本為x(t),其概率密度分布函數(shù)為p(t),則其定義分別為:ux=lim1t2x=lim1tt一個(gè)重要的原因是醫(yī)學(xué)圖像的復(fù)雜性和多樣性1。由于組織本身的特性差異,醫(yī)學(xué)圖像成像過(guò)程中受到諸如噪聲、偏移場(chǎng)效應(yīng)、部分容積效應(yīng)和組織運(yùn)動(dòng)等的影響,醫(yī)學(xué)圖像與普通圖像比較,不可避免地具有模糊、均勻性差等特點(diǎn)。另外,人體解剖組織結(jié)構(gòu)的形狀復(fù)雜,即便相同的解剖結(jié)構(gòu),人與人之間也存在相當(dāng)大的差別,這些都給醫(yī)學(xué)圖像分割帶來(lái)了困難。傳統(tǒng)的分割技術(shù),例如單一的分割方法,或基于單一的特征信息進(jìn)行分割,都很難獲得好的分割效果。臨床應(yīng)4乙tx(t)dt=t乙xp(x)

3、dx-2+(1)2乙x(t)-uxdt=2乙(x-u)p(x)dx-x+(2)用對(duì)醫(yī)學(xué)圖像分割的準(zhǔn)確度和分類算法的速度要求又較高,因此醫(yī)學(xué)圖像分割算法仍然是醫(yī)學(xué)圖像處理中的一個(gè)非常重要的研究課題2。目前,對(duì)于大腦的研究主要集中于其內(nèi)部主要核團(tuán)或某些特定感興趣部位,例如灰質(zhì)、腦積液、丘腦、腫瘤等區(qū)域。在圖像中對(duì)上述內(nèi)容進(jìn)行提取、分析等方法研究時(shí),圖像中的顱骨部分往往會(huì)降低研究結(jié)果的精度并影響方法的研究,因此,有必要對(duì)圖像進(jìn)行預(yù)處理,將其顱骨與腦實(shí)質(zhì)部分加以分離,提取腦實(shí)質(zhì)部分,這將更有利于進(jìn)行圖像的分割、配準(zhǔn)、特殊區(qū)域的提取分析等工作7。k3=乙+-(x-ux)p(x)dxx(3)設(shè)一幅圖像只由

4、目標(biāo)物和背景組成,其灰度分布范圍為0G;已知其灰度級(jí)分布概率密度分別為p1(t)和p2(t),假設(shè)p1(t)和p2(t)均服從正態(tài)分布,其灰度均值分別為u1(t)和u2(t),方差分別為1(t)和2(t),偏態(tài)指標(biāo)分別為k1,k2。則設(shè)圖像灰度級(jí)按閾值t劃分為目標(biāo)和背景兩類,這里認(rèn)為圖像是由亮背景上的暗物體所組成,因此凡是灰度級(jí)小于t的像素皆標(biāo)認(rèn)為目標(biāo)物,大于t的像素皆作為背景。設(shè)圖像歸一化直方圖為h(i),(i=0G),目標(biāo)物像素占全圖像像素?cái)?shù)比為(t),則:(t)=h(i)i=0t221最小偏態(tài)指標(biāo)閾值分割由文獻(xiàn)3介紹的方法可知,在數(shù)理統(tǒng)計(jì)中,隨機(jī)現(xiàn)代計(jì)算機(jī)(總第三一七期)(4)收稿日期:

5、2009-09-02修稿日期:2009-10-13作者簡(jiǎn)介:唐聞(1981-),男,湖南株洲人,碩士,講師,研究方向?yàn)閿?shù)字圖形圖像和計(jì)算機(jī)軟件ODERNCTER200910趶趩圖形圖像u1(t)=h(i)i/(t),u2(t)=1-u1(t)i=0t(5)像大體已經(jīng)被分割出來(lái),但是對(duì)于顱骨內(nèi)的部分非腦組織,也在第一步分割的同時(shí),隨顱骨一起被分割出來(lái),因此,有必要利用形態(tài)學(xué)的方法,將上一步分割結(jié)果,進(jìn)行二次分割,以獲得正確的顱骨圖像。(1)利用一個(gè)3×3的結(jié)構(gòu)元素,對(duì)第一步分割完畢的圖像進(jìn)行閉合運(yùn)算;(2)將膨脹結(jié)果進(jìn)行4-連通的統(tǒng)計(jì),找到像素點(diǎn)值為1的所有符合4-連通的區(qū)塊大小,并將

6、其存入數(shù)組L;(3)找到數(shù)組當(dāng)中最大的連通區(qū)塊,并將最大連1(t)=i-u2(t)h(i)/(t),i=0Gt2(t)=i-u2(t)h(i)/(1-(t)i=t+1t23(6)k1(t)=i-u(t)h(i)1i=01(t)·,k2(t)=i-u(t)h(i)i=t+1G2(t)·(1-)(7)通區(qū)域提取出來(lái);偏態(tài)指標(biāo)定義為:k3(t)=k1(t)+k2(t)(8)(4)分割出正確的顱骨圖像。根據(jù)下面公式(9),可選取分割的閾值T:T=Argmink3(t)0<tg(9)2算法描述(c)第一次分后割圖(d)進(jìn)一步分割后圖像2.1最小偏態(tài)閾值分割獲取顱骨圖像本文以最小

7、偏態(tài)指標(biāo)作為分割的閾值指標(biāo),利用這一指標(biāo)可以有效地從圖像中分割出顱骨以及部分的非腦軟組織,這是實(shí)現(xiàn)腦實(shí)質(zhì)提取的第一步。(1)讀入腦部的MRI圖像,并將其轉(zhuǎn)化為灰度圖圖2進(jìn)一步分割后獲取的結(jié)果2.3提取腦實(shí)質(zhì)圖像直接利用圖像相減無(wú)法獲取最佳的分割效果。觀察圖3,在圖3中經(jīng)過(guò)第一步處理之后還存在少數(shù)的、孤立的非腦組織,因此在最后的腦實(shí)質(zhì)提取過(guò)程中,我們?cè)俅斡玫阶畲筮B通的方式進(jìn)一步優(yōu)化分割結(jié)果。(1)將原MRI圖像的灰度圖,減去進(jìn)一步分割后所獲得的正確顱骨圖像,得到初步的腦實(shí)質(zhì)圖;(2)對(duì)上一步處理完成的圖像,利用一個(gè)4×4的結(jié)構(gòu)元素進(jìn)行開(kāi)運(yùn)算;(3)使用上一節(jié)介紹的形態(tài)學(xué)方法,再次提取最

8、大連通區(qū)域;im;(2)計(jì)算將im進(jìn)行直方圖圖均衡化,令i從0變化到G,分別利用公式(5)-(8)計(jì)算出圖像的一階統(tǒng)計(jì)矩u1、u2,并通過(guò)u1、u2計(jì)算出三階統(tǒng)計(jì)矩k1、k2,將k1、k2的絕對(duì)值之和存入數(shù)組k3;(3)將k3中的最小值,作為閾值T,對(duì)im進(jìn)行分割,如果im當(dāng)中的像素點(diǎn)灰度大于T,則將其設(shè)為255,如果小于T則將其設(shè)為0。(4)完成分割?,F(xiàn)代計(jì)算機(jī)(總第三一七期)(a)原始圖像灰度圖(b)分割后圖像圖1一幅腦部MRI圖像進(jìn)行最小偏態(tài)分割后獲取的結(jié)果(a)初步提取的腦實(shí)質(zhì)(b)最大連通區(qū)域(c)最終分割結(jié)果圖3完成后的分割結(jié)果2.2利用形態(tài)學(xué)方法進(jìn)一步分割完整顱骨圖像由圖1可以看

9、出,經(jīng)過(guò)第一步的分割,顱骨的圖3試驗(yàn)結(jié)果以一組3D人體大腦的MRI圖像做為目標(biāo)圖像MRNCOMPUTER200圖形圖像檢驗(yàn)該方法,下列圖4為4幅MRI腦部圖像的灰度圖,經(jīng)過(guò)本文的方法處理,最終取得的結(jié)果如圖5所示(圖5圖像序列與圖4一一對(duì)應(yīng)):由這一組結(jié)果可以看出,本文的方法對(duì)于腦部實(shí)質(zhì)的提取結(jié)果令人滿意。圖4入了二次分割的思想,提取較完整的顱骨圖像,而后再次經(jīng)過(guò)形態(tài)學(xué)處理,得到最終的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,實(shí)驗(yàn)表明該算法具有有效性和良好的性能。下一步研究的方向是改良本文算法用于解決對(duì)復(fù)雜圖像成分的精確分割。參考文獻(xiàn)3陳果,左洪福.基于最小偏態(tài)指標(biāo)的圖像閾值分割新技術(shù).小型微型計(jì)算機(jī)系統(tǒng),2003,24(2

10、):2552605岡薩雷斯.數(shù)字圖像處理(第二版).電子工業(yè)出版社圖56CUIYI.ImageAnalysis-ApplicationsandMethodsofMathematicalMorphologyM.Beijing:SciencePress,2000(InChinese)7陳瑛,聶生東,顧順德,章魯.邊界跟蹤法在MRI圖像大腦實(shí)質(zhì)提取中的應(yīng)用.生物醫(yī)學(xué)工程與臨床,2001,5(1):4結(jié)語(yǔ)為了獲得好的分割效果,就需要充分利用待分割圖像的全局和局部特點(diǎn)。根據(jù)腦部MRI圖像的特點(diǎn),筆者發(fā)現(xiàn)所求閾值與圖像全局和局部特點(diǎn)之間的關(guān)系,將分割工作分作兩步,利用最小偏態(tài)指標(biāo)作為閾值對(duì)圖像進(jìn)行處理的方

11、法先提取顱骨與非腦組織,引46ApplicationofImageSegmentationBasedonMinimumBias-NormalDistributionIndexinExtractingBrainStructuresfromMRITANGWen(InstituteofBiomedicalEngineering,DepartmentofInformationandPhysicalEngineering,CentralSouthUniversity,Changsha410083)Abstract:Presentsanimagesegmentationbasedonminimumbias-normaldistributionindexwhichisusedtoextractbrainstructuresfromMRI.Findstheskullfieldbytheimagesegmentationmethod,extractsthebrainfieldbythemorphologicalmethod.Themethodreportedisarapi

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