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1、第一章氨基酸與蛋白質(zhì) 第一章氨基酸與蛋白質(zhì)文/哦噢,第一章氨基酸與蛋白質(zhì)(一)名詞解釋1兩性離子:指在同一氨基酸分子上含有等量的正負(fù)兩種電荷,又稱兼性離子或偶極離子。2必需氨基酸:指人體(和其它哺乳動物)自身不能合成,機體又必需,需要從飲食中獲得的氨基酸。3.氨基酸的等電點:指氨基酸的正離子濃度和負(fù)離子濃度相等時的pH值,用符號pI表示。4稀有氨基酸:指存在于蛋白質(zhì)中的20種常見氨基酸以外的其它罕見氨基酸,它們是正常氨基酸的衍生物。5非蛋白質(zhì)氨基酸:指不存在于蛋白質(zhì)分子中而以游離狀態(tài)和結(jié)合狀態(tài)存在于生物體的各種組織和細(xì)胞的氨基酸。6構(gòu)型:指在立體異
2、構(gòu)體中不對稱碳原子上相連的各原子或取代基團的空間排布。構(gòu)型的轉(zhuǎn)變伴隨著共價鍵的斷裂和重新形成。7蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸的排列順序,以及二硫鍵的位置。8構(gòu)象:指有機分子中,不改變共價鍵結(jié)構(gòu),僅單鍵周圍的原子旋轉(zhuǎn)所產(chǎn)生的原子的空間排布。一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時,不涉及共價鍵的斷裂和重新形成。構(gòu)象改變不會改變分子的光學(xué)活性。9蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu):指在蛋白質(zhì)分子中的局部區(qū)域內(nèi),多肽鏈沿一定方向盤繞和折疊的方式。10結(jié)構(gòu)域:指蛋白質(zhì)多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進一步卷曲折疊成幾個相對獨立的近似球形的組裝體。11蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上借助各種次級鍵卷曲折疊成特定的球狀分
3、子結(jié)構(gòu)的構(gòu)象。12氫鍵:指負(fù)電性很強的氧原子或氮原子與N-H或O-H的氫原子間的相互吸引力。13蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu):指多亞基蛋白質(zhì)分子中各個具有三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈以適當(dāng)方式聚合所呈現(xiàn)的三維結(jié)構(gòu)。14離子鍵:帶相反電荷的基團之間的靜電引力,也稱為靜電鍵或鹽鍵。15超二級結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)分子中相鄰的二級結(jié)構(gòu)單位組合在一起所形成的有規(guī)則的、在空間上能辨認(rèn)的二級結(jié)構(gòu)組合體。16疏水鍵:非極性分子之間的一種弱的、非共價的相互作用。如蛋白質(zhì)分子中的疏水側(cè)鏈避開水相而相互聚集而形成的作用力。17范德華力:中性原子之間通過瞬間靜電相互作用產(chǎn)生的一種弱的分子間的力。當(dāng)兩個原子之間的距離為它們的范德華半徑之和時,范德華
4、力最強。18鹽析:在蛋白質(zhì)溶液中加入一定量的高濃度中性鹽(如硫酸氨),使蛋白質(zhì)溶解度降低并沉淀析出的現(xiàn)象稱為鹽析。19鹽溶:在蛋白質(zhì)溶液中加入少量中性鹽使蛋白質(zhì)溶解度增加的現(xiàn)象。20蛋白質(zhì)的變性作用:蛋白質(zhì)分子的天然構(gòu)象遭到破壞導(dǎo)致其生物活性喪失的現(xiàn)象。蛋白質(zhì)在受到光照、熱、有機溶劑以及一些變性劑的作用時,次級鍵遭到破壞導(dǎo)致天然構(gòu)象的破壞,但其一級結(jié)構(gòu)不發(fā)生改變。21蛋白質(zhì)的復(fù)性:指在一定條件下,變性的蛋白質(zhì)分子恢復(fù)其原有的天然構(gòu)象并恢復(fù)生物活性的現(xiàn)象。22蛋白質(zhì)的沉淀作用:在外界因素影響下,蛋白質(zhì)分子失去水化膜或被中和其所帶電荷,導(dǎo)致溶解度降低從而使蛋白質(zhì)變得不穩(wěn)定而沉淀的現(xiàn)象稱為蛋白質(zhì)的沉
5、淀作用。23凝膠電泳:以凝膠為介質(zhì),在電場作用下分離蛋白質(zhì)或核酸等分子的分離純化技術(shù)。24層析:按照在移動相(可以是氣體或液體)和固定相(可以是液體或固體)之間的分配比例將混合成分分開的技術(shù)。19,Edman降解(Edmandegradation):從多肽鏈游離的N末端測定氨基酸殘基的序列的過程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修25,別構(gòu)效應(yīng)(allostericeffect):又稱為變構(gòu)效應(yīng),是寡聚蛋白與配基結(jié)合改變蛋白質(zhì)的構(gòu)象,導(dǎo)致蛋白質(zhì)生物活性喪失的現(xiàn)象。26,鐮刀型細(xì)胞貧血?。╯ickle-cellanemia):血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的一種疾病,病人的大部分紅細(xì)胞呈鐮刀狀。其特點是
6、病人的血紅蛋白亞基N端的第六個氨基酸殘缺是纈氨酸(vol),而不是下正常的谷氨酸殘基(Ghe)。23.波爾效應(yīng)(Bohreffect):CO2濃度的增加降低細(xì)胞內(nèi)的pH,引起紅細(xì)胞內(nèi)血紅蛋白氧親和力下降的現(xiàn)象。(二)填空題1氨;羧基;216;6.253谷氨酸;天冬氨酸;絲氨酸;蘇氨酸4苯丙氨酸;酪氨酸;色氨酸;紫外吸收5負(fù)極6組氨酸;半胱氨酸;蛋氨酸7-螺旋結(jié)構(gòu);-折疊結(jié)構(gòu)8C=O;N=H;氫;0.54nm;3.6;0.15nm;右9脯氨酸;羥脯氨酸10極性;疏水性11藍(lán)紫色;脯氨酸12肽鍵;二硫鍵;氫鍵;次級鍵;氫鍵;離子鍵;疏水鍵;范德華力13表面的水化膜;同性電荷14谷胱甘肽;巰基15增
7、加;鹽溶;減?。怀恋砦龀?;鹽析;蛋白質(zhì)分離16帶電荷量;分子大??;分子形狀;方向;速率17兩性離子;最小18FDNB法(2,4-二硝基氟苯法);Edman降解法(苯異硫氫酸酯法)19沉降法;凝膠過濾法;SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳法(SDS-PAGE法)20不動;向正極移動;向負(fù)極移動;21兩性離子;負(fù);223.2223氫鍵;24C;a;b2516672;66687;2650圈;27nm(三)選擇題1D:5種氨基酸中只有賴氨酸為堿性氨基酸,其等電點為9.74,大于生理pH值,所以帶正電荷。2B:人(或哺乳動物)的必需氨基酸包括賴氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、蘇氨酸8
8、種,酪氨酸不是必需氨基酸。3A:酪氨酸和苯丙氨酸在280nm處的克分子消光系數(shù)分別為540何120,所以酪氨酸比苯丙氨酸有較大吸收,而且大多數(shù)蛋白質(zhì)中都含有酪氨酸。肽鍵的最大吸收在215nm,半胱氨酸的硫原子在280nm和215nm均無明顯吸收。4D:在此4種氨基酸中,只有賴氨酸的R基團可接受氫質(zhì)子,作為堿,而其它3種氨基酸均無可解離的R側(cè)鏈。5B:氨基酸的-碳上連接的是亞氨基而不是氨基,所以實際上屬于一種亞氨基酸,而其它氨基酸的-碳上都連接有氨基,是氨基酸。6B:天然蛋白質(zhì)的-螺旋結(jié)構(gòu)的特點是,肽鏈圍繞中心軸旋轉(zhuǎn)形成螺旋結(jié)構(gòu),而不是充分伸展的結(jié)構(gòu)。另外在每個螺旋中含有3.6個氨基酸殘基,螺距
9、為0.54nm,每個氨基酸殘基上升高度為0.15nm,所以B不是-螺旋結(jié)構(gòu)的特點。7C:蛋白質(zhì)處于等電點時,凈電荷為零,失去蛋白質(zhì)分子表面的同性電荷互相排斥的穩(wěn)定因素,此時溶解度最??;加入少量中性鹽可增加蛋白質(zhì)的溶解度,即鹽溶現(xiàn)象;因為蛋白質(zhì)中含有酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸,所以具有紫外吸收特性;變性蛋白質(zhì)的溶解度減小而不是增加,因為蛋白質(zhì)變性后,近似于球狀的空間構(gòu)象被破壞,變成松散的結(jié)構(gòu),原來處于分子內(nèi)部的疏水性氨基酸側(cè)鏈暴露于分子表面,減小了與水分子的作用,從而使蛋白質(zhì)溶解度減小并沉淀。8C:甘氨酸的-碳原子連接的4個原子和基團中有2個是氫原子,所以不是不對稱碳原子,沒有立體異構(gòu)體,所以不具
10、有旋光性。9B:雙縮脲反應(yīng)是指含有兩個或兩個以上肽鍵的化合物(肽及蛋白質(zhì))與稀硫酸銅的堿性溶液反應(yīng)生成紫色(或青紫色)化合物的反應(yīng),產(chǎn)生顏色的深淺與蛋白質(zhì)的含量成正比,所以可用于蛋白質(zhì)的定量測定。茚三酮反應(yīng)是氨基酸的游離的-NH與茚三酮之間的反應(yīng);凱氏定氮法是測定蛋白質(zhì)消化后產(chǎn)生的氨;紫外吸收法是通過測定蛋白質(zhì)的紫外消光值定量測定蛋白質(zhì)的方法,因為大多數(shù)蛋白質(zhì)都含有酪氨酸,有些還含有色氨酸或苯丙氨酸,這三種氨基酸具有紫外吸收特性,所以紫外吸收值與蛋白質(zhì)含量成正比。10D:靡蛋白酶即胰凝乳蛋白酶作用于酪氨酸、色氨酸和苯丙氨酸的羧基參與形成的肽鍵;羧肽酶是從肽鏈的羧基端開始水解肽鍵的外肽酶;氨肽酶
11、是從肽鏈的氨基端開始水解肽鍵的外肽酶;胰蛋白酶可以專一地水解堿性氨基酸的羧基參與形成的肽鍵。11A:蛋白質(zhì)的等電點是指蛋白質(zhì)分子內(nèi)的正電荷桌能總數(shù)與負(fù)電荷總數(shù)相等時的pH值。蛋白質(zhì)鹽析的條件是加入足量的中性鹽,如果加入少量中性鹽不但不會使蛋白質(zhì)沉淀析出反而會增加其溶解度,即鹽溶。在等電點時,蛋白質(zhì)的凈電荷為零,分子間的凈電斥力最小,所以溶解度最小,在溶液中易于沉淀,所以通常沉淀蛋白質(zhì)應(yīng)調(diào)pH至等電點。12A:在蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)中,通常是疏水性氨基酸的側(cè)鏈存在于分子的內(nèi)部,因為疏水性基團避開水相而聚集在一起,而親水側(cè)鏈分布在分子的表面以充分地與水作用;蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是多肽鏈中氨基酸的排列順序,
12、此順序即決定了肽鏈形成二級結(jié)構(gòu)的類型以及更高層次的結(jié)構(gòu);維持蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的作用力主要是次級鍵。13C:-折疊結(jié)構(gòu)是一種常見的蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的類型,分為平行和反平行兩種排列方式,所以題中C項的說法是錯誤的。在-折疊結(jié)構(gòu)中肽鏈處于曲折的伸展?fàn)顟B(tài),氨基酸殘基之間的軸心距離為0.35nm,相鄰肽鏈(或同一肽鏈中的幾個肽段)之間形成氫鍵而使結(jié)構(gòu)穩(wěn)定。14A:用凝膠過濾柱層析分離蛋白質(zhì)是根據(jù)蛋白質(zhì)分子大小不同進行分離的方法,與蛋白質(zhì)分子的帶電狀況無關(guān)。在進行凝膠過濾柱層析過程中,比凝膠網(wǎng)眼大的分子不能進入網(wǎng)眼內(nèi),被排阻在凝膠顆粒之外。比凝膠網(wǎng)眼小的顆??梢赃M入網(wǎng)眼內(nèi),分子越小進入網(wǎng)眼的機會越多,因此不同
13、大小的分子通過凝膠層析柱時所經(jīng)的路程距離不同,大分子物質(zhì)經(jīng)過的距離短而先被洗出,小分子物質(zhì)經(jīng)過的距離長,后被洗脫,從而使蛋白質(zhì)得到分離。15A:蛋白質(zhì)的變性是其空間結(jié)構(gòu)被破壞,從而引起理化性質(zhì)的改變以及生物活性的喪失,但其一級結(jié)構(gòu)不發(fā)生改變,所以肽鍵沒有斷裂。蛋白質(zhì)變性的機理是維持其空間結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的作用力被破壞,氫鍵、離子鍵和疏水鍵都是維持蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的作用力,當(dāng)這些作用力被破壞時空間結(jié)構(gòu)就被破壞并引起變性,所以與變性有關(guān)。16A:蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)即蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸的排列順序決定蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象,因為一級結(jié)構(gòu)中包含著形成空間結(jié)構(gòu)所需要的所有信息,氨基酸殘基的結(jié)構(gòu)和化學(xué)性質(zhì)決定了所組成的蛋白
14、質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)的類型以及三級、四級結(jié)構(gòu)的構(gòu)象;二硫鍵和次級鍵都是維持蛋白質(zhì)空間構(gòu)象穩(wěn)定的作用力,但不決定蛋白質(zhì)的構(gòu)象;溫度及pH影響蛋白質(zhì)的溶解度、解離狀態(tài)、生物活性等性質(zhì),但不決定蛋白質(zhì)的構(gòu)象。17E:氨基酸分子上的正電荷數(shù)和負(fù)電荷數(shù)相等時的pH值是其等電點,即凈電荷為零,此時在電場中不泳動。由于凈電荷為零,分子間的凈電斥力最小,所以溶解度最校18B:蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是指蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸的排列順序,蛋白質(zhì)中所含氨基酸的種類和數(shù)目相同但排列順序不同時,其一級結(jié)構(gòu)以及在此基礎(chǔ)上形成的空間結(jié)構(gòu)均有很大不同。蛋白質(zhì)分子中多肽鏈的折疊和盤繞是蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的內(nèi)容,所以B項是正確的。(19見)(四)是
15、非判斷題1錯:脯氨酸與茚三酮反應(yīng)產(chǎn)生黃色化合物,其它氨基酸與茚三酮反應(yīng)產(chǎn)生藍(lán)色化合物。2對:在肽平面中,羧基碳和亞氨基氮之間的鍵長為0.132nm,介于CN單鍵和CN雙鍵之間,具有部分雙鍵的性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn)。3錯:蛋白質(zhì)具有重要的生物功能,有些蛋白質(zhì)是酶,可催化特定的生化反應(yīng),有些蛋白質(zhì)則具有其它的生物功能而不具有催化活性,所以不是所有的蛋白質(zhì)都具有酶的活性。4錯:-碳和羧基碳之間的鍵是CC單鍵,可以自由旋轉(zhuǎn)。5對:在20種氨基酸中,除甘氨酸外都具有不對稱碳原子,所以具有L-型和D-型2種不同構(gòu)型,這兩種不同構(gòu)型的轉(zhuǎn)變涉及到共價鍵的斷裂和從新形成。6錯:由于甘氨酸的-碳上連接有2個氫原子,所
16、以不是不對稱碳原子,沒有2種不同的立體異構(gòu)體,所以不具有旋光性。其它常見的氨基酸都具有不對稱碳原子,因此具有旋光性。7錯:必需氨基酸是指人(或哺乳動物)自身不能合成機體又必需的氨基酸,包括8種氨基酸。其它氨基酸人體自身可以合成,稱為非必需氨基酸。8對:蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸的排列順序,不同氨基酸的結(jié)構(gòu)和化學(xué)性質(zhì)不同,因而決定了多肽鏈形成二級結(jié)構(gòu)的類型以及不同類型之間的比例以及在此基礎(chǔ)上形成的更高層次的空間結(jié)構(gòu)。如在脯氨酸存在的地方-螺旋中斷,R側(cè)鏈具有大的支鏈的氨基酸聚集的地方妨礙螺旋結(jié)構(gòu)的形成,所以一級結(jié)構(gòu)在很大程度上決定了蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象。9錯:一氨基一羧基氨基酸為中性氨基
17、酸,其等電點為中性或接近中性,但氨基和羧基的解離度,即pK值不同。10錯:蛋白質(zhì)的變性是蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的破壞,這是由于維持蛋白質(zhì)構(gòu)象穩(wěn)定的作用力次級鍵被破壞所造成的,但變性不引起多肽鏈的降解,即肽鏈不斷裂。11對:有些蛋白質(zhì)是由一條多肽鏈構(gòu)成的,只具有三級結(jié)構(gòu),不具有四級結(jié)構(gòu),如肌紅蛋白。12對:血紅蛋白是由4個亞基組成的具有4級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),當(dāng)血紅蛋白的一個亞基與氧結(jié)合后可加速其它亞基與氧的結(jié)合,所以具有變構(gòu)效應(yīng)。肌紅蛋白是僅有一條多肽鏈的蛋白質(zhì),具有三級結(jié)構(gòu),不具有四級結(jié)構(gòu),所以在與氧的結(jié)合過程中不表現(xiàn)出變構(gòu)效應(yīng)。13錯:Edman降解法是多肽鏈N端氨基酸殘基被苯異硫氫酸酯修飾,然后從多肽
18、鏈上切下修飾的殘基,經(jīng)層析鑒定可知N端氨基酸的種類,而余下的多肽鏈仍為一條完整的多肽鏈,被回收后可繼續(xù)進行下一輪Edman反應(yīng),測定N末端第二個氨基酸。反應(yīng)重復(fù)多次就可連續(xù)測出多肽鏈的氨基酸順序。FDNB法(Sanger反應(yīng))是多肽鏈N末端氨基酸與FDNB(2,4-二硝基氟苯)反應(yīng)生成二硝基苯衍生物(DNP-蛋白),然后將其進行酸水解,打斷所有肽鍵,N末端氨基酸與二硝基苯基結(jié)合牢固,不易被酸水解。水解產(chǎn)物為黃色的N端DNP-氨基酸和各種游離氨基酸。將DNP-氨基酸抽提出來并進行鑒定可知N端氨基酸的種類,但不能測出其后氨基酸的序列。14對:大多數(shù)氨基酸的-碳原子上都有一個自由氨基和一個自由羧基,
19、但脯氨酸和羥脯氨酸的-碳原子上連接的氨基氮與側(cè)鏈的末端碳共價結(jié)合形成環(huán)式結(jié)構(gòu),所以不是自由氨基。15對:蛋白質(zhì)是由氨基酸組成的大分子,有些氨基酸的R側(cè)鏈具有可解離基團,如羧基、氨基、咪唑基等等。這些基團有的可釋放H+,有的可接受H+,所以使得蛋白質(zhì)分子即是酸又是堿,是兩性電解質(zhì)。蛋白質(zhì)分子中可解離R基團的種類和數(shù)量決定了蛋白質(zhì)提供和接受H+的能力,即決定了它的酸堿性質(zhì)。16對:在具有四級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)分子中,每個具有三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈?zhǔn)且粋€亞基。17錯:具有兩個或兩個以上肽鍵的物質(zhì)才具有類似于雙縮脲的結(jié)構(gòu),具有雙縮脲反應(yīng),而二肽只具有一個肽鍵,所以不具有雙縮脲反應(yīng)。18錯:二硫鍵是由兩個半胱氨酸的巰基脫氫氧化而形成的,所以兩個半胱氨酸只能形成一個二硫鍵。19對:鹽析引起的蛋白質(zhì)沉淀是由于大量的中性鹽破壞了蛋白質(zhì)膠體的穩(wěn)定因素(蛋白質(zhì)分子表面的水化膜及所帶同性電荷互相排斥),從而使蛋白質(zhì)溶解度降低并沉淀,但并未破壞蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu),所以不引起變性。根據(jù)不同蛋白質(zhì)鹽析所需的鹽飽和度分段鹽析可將蛋白質(zhì)進行分離和純化。20錯:蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)包括二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)和四級結(jié)構(gòu)三個層次,三級結(jié)構(gòu)只是其中一個層次。21錯:維持蛋白質(zhì)三級結(jié)
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