林木基因組與生物信息學(xué)

1、林木基因組與生物信息學(xué)博士學(xué)位研究生培養(yǎng)方案（090720）一、 培養(yǎng)目標(biāo)培養(yǎng)博士學(xué)位研究生（以下簡稱博士生）必須堅(jiān)持德、智、體全面發(fā)展的方針，貫徹“面向現(xiàn)代化、面向世界、面向未來”的原則，從社會(huì)主義現(xiàn)代化建設(shè)和科學(xué)技術(shù)發(fā)展的需要出發(fā)，把培養(yǎng)博士生的創(chuàng)新能力作為培養(yǎng)工作的重點(diǎn)。具體要求：1、 堅(jiān)持四項(xiàng)基本原則，熱愛祖國，遵紀(jì)守法，品行端正，具有強(qiáng)烈的事業(yè)心和為科學(xué)事業(yè)獻(xiàn)身的精神；2、 至少熟練掌握一門外國語，能進(jìn)行國際間的學(xué)術(shù)交流；3、 在林木遺傳育種學(xué)科上掌握?qǐng)?jiān)實(shí)寬廣的基礎(chǔ)理論和系統(tǒng)深入的專門知識(shí)，熟悉本專業(yè)研究方向的現(xiàn)狀及前沿動(dòng)態(tài)，具有獨(dú)立進(jìn)行科學(xué)研究和開辟新領(lǐng)域作出創(chuàng)造性新成果的能力；4

2、、 具有健康的體魄。二、 研究方向1、 林木基因組學(xué)從森林樹種的全部遺傳信息（即基因組）研究和探討結(jié)構(gòu)與功能、生長與發(fā)育、遺傳與變異、適應(yīng)性與抗性及進(jìn)化的分子機(jī)制。2、 林木蛋白質(zhì)組學(xué)研究林木細(xì)胞中蛋白質(zhì)的合成與降解、修飾與加工及蛋白質(zhì)間的相互作用，從蛋白質(zhì)水平上分析細(xì)胞的各項(xiàng)功能和各種生理生化過程等。3、 生物信息學(xué)應(yīng)用先進(jìn)的數(shù)據(jù)管理技術(shù)、數(shù)學(xué)分析模型和計(jì)算機(jī)軟件對(duì)各種生物信息（特別是分子生物學(xué)信息）進(jìn)行提取、儲(chǔ)存、處理和分析，研究復(fù)雜生命現(xiàn)象的形成模式與演化規(guī)律。三、學(xué)習(xí)年限和時(shí)間安排脫產(chǎn)博士生學(xué)習(xí)年限一般為三年（包括學(xué)位論文答辯時(shí)間），必要時(shí)可提前和延長。一般前半年至一年時(shí)間為課程學(xué)習(xí)階

3、段，后兩年至兩年半時(shí)間主要從事科學(xué)研究和撰寫學(xué)位論文階段。在職博士生學(xué)習(xí)年限最多可延長三年。四、培養(yǎng)方式對(duì)博士生的培養(yǎng)以科學(xué)研究為主，結(jié)合導(dǎo)師的科研項(xiàng)目從事博士生科研工作和撰寫論文。指導(dǎo)老師要關(guān)心博士生健康成長，要求博士生認(rèn)真學(xué)習(xí)政治理論課、時(shí)事政策和參加公益勞動(dòng)等活動(dòng)。根據(jù)培養(yǎng)目標(biāo)的要求，博士生應(yīng)繼續(xù)學(xué)習(xí)一些課程。以拓寬知識(shí)面，加深專業(yè)的理論基礎(chǔ)及主要知識(shí)，掌握本學(xué)科前沿動(dòng)態(tài)、發(fā)展趨勢(shì)和最新成果，掌握新的科學(xué)實(shí)驗(yàn)手段。博士生要參加一定的教學(xué)、生產(chǎn)實(shí)習(xí)和社會(huì)實(shí)踐，有利于博士生培養(yǎng)多方面的工作能力。教學(xué)、生產(chǎn)實(shí)習(xí)和社會(huì)實(shí)踐要完成40學(xué)時(shí)（不計(jì)學(xué)分）。具體時(shí)間和內(nèi)容由導(dǎo)師安排。博士生培養(yǎng)工作由導(dǎo)師

4、負(fù)責(zé)，指導(dǎo)方式采取導(dǎo)師指導(dǎo)和以導(dǎo)師為首的指導(dǎo)小組（35人）集體培養(yǎng)相結(jié)合的方法，要充分發(fā)揮指導(dǎo)教師、指導(dǎo)小組和博士生三個(gè)方面的積極性。貫徹因材施教的原則，方式靈活多樣，提倡和鼓勵(lì)相關(guān)學(xué)科之間的交叉，以開辟新興學(xué)科和邊緣學(xué)科。博士生應(yīng)積極參加校內(nèi)、外的學(xué)術(shù)討論會(huì)，并創(chuàng)造條件與國內(nèi)外單位之間的學(xué)術(shù)交流與合作，以開闊科學(xué)視野，活躍學(xué)術(shù)思想。博士生在進(jìn)入論文階段前對(duì)業(yè)務(wù)課進(jìn)行一次綜合考試（資格考試），綜合考試包括基礎(chǔ)理論和專業(yè)知識(shí)?？荚嚪绞接杀緦W(xué)科專業(yè)和相關(guān)學(xué)科專業(yè)的三位副教授以上職稱人員組成考試小組（含導(dǎo)師）負(fù)責(zé)主持進(jìn)行。綜合考試和外語考試合格者進(jìn)入論文階段，考試不合格者按有關(guān)規(guī)定和學(xué)籍管理辦法處理

5、。五、課程設(shè)置為了使博士生在林木基因組與生物信息學(xué)科上掌握?qǐng)?jiān)實(shí)寬廣的基礎(chǔ)理論和系統(tǒng)深入的專門知識(shí)，要求博士生修完并取得總學(xué)分不少于15個(gè)學(xué)分（同等學(xué)歷者不少于18個(gè)學(xué)分），其中學(xué)位課程不少于11學(xué)分。1、公共學(xué)位課程 5學(xué)分 （1）現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)革命與馬克思主義 2學(xué)分 （2）第一外語 3學(xué)分2、專業(yè)學(xué)位課 9學(xué)分 （1）功能基因組學(xué)專題 3學(xué)分 （2）生物信息學(xué)專題 3學(xué)分 （3）蛋白質(zhì)組學(xué)專題 3學(xué)分3、選修課 （1）群體與數(shù)量遺傳學(xué)專題 3學(xué)分 （2）森林遺傳改良原理專題 3學(xué)分（3）進(jìn)化遺傳學(xué)專題 2學(xué)分（4）發(fā)育遺傳學(xué)專題 2學(xué)分 （5）生物物理學(xué) 2學(xué)分 （6）基因分析儀器應(yīng)用專題

6、2學(xué)分根據(jù)論文選題和導(dǎo)師要求，可選修一門及一門以上碩士研究生課程（本學(xué)科或相關(guān)學(xué)科）?？鐚W(xué)科或同等學(xué)歷者考取的博士生選修兩門以上碩士研究生專業(yè)課程。第二外語2學(xué)分作為選修課，其它選修每門不超過2學(xué)分。六、課程說明和教學(xué)內(nèi)容1、功能基因組學(xué)專題介紹結(jié)構(gòu)基因組和功能基因組的研究進(jìn)展，并結(jié)合介紹相關(guān)的技術(shù)平臺(tái)對(duì)功能基因組發(fā)展的影響。2、蛋白質(zhì)組學(xué)專題介紹蛋白質(zhì)組學(xué)的研究進(jìn)展，并結(jié)合現(xiàn)代分析技術(shù)，蛋白質(zhì)雙向電泳、質(zhì)譜分析等手段，對(duì)蛋白質(zhì)組發(fā)展所起的作用。3、生物信息學(xué)專題 介紹生物信息學(xué)研究進(jìn)展，特別是超級(jí)計(jì)算機(jī)不斷更新和算法的改進(jìn)，對(duì)功能基因組和蛋白質(zhì)組的信息處理作用。七、綜合考試1、博士生在完成課

7、程學(xué)習(xí)后進(jìn)入學(xué)位論文工作之前，必須進(jìn)行一次綜合考試和外語考試，以取得開展學(xué)位論文工作的資格。2、綜合考試是對(duì)博士生基礎(chǔ)理論和專業(yè)知識(shí)掌握情況的一次綜合檢查，綜合考試采用筆試或口試的發(fā)生。筆試應(yīng)具有一定的深度和廣度，大體覆蓋三門以上專業(yè)課基礎(chǔ)和專業(yè)課程的內(nèi)容。口試課組織由57名專家組成的考試委員會(huì)（基礎(chǔ)、專業(yè)基礎(chǔ)、專業(yè)和跨學(xué)科課程教師）結(jié)合開題報(bào)告進(jìn)行，對(duì)研究領(lǐng)域的前沿動(dòng)態(tài)、課題實(shí)施方案和該博士生應(yīng)具備的知識(shí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行口頭答辯，三分之二專家通過為合格。博士生一般應(yīng)于入學(xué)一年后（或?qū)W位論文開始前）進(jìn)行綜合考試。綜合考試未通過者，課允許補(bǔ)考一次，補(bǔ)考仍未通過者，停止做博士論文，終止其學(xué)業(yè)。3、外語考試統(tǒng)一參加學(xué)校的過關(guān)考試。八、學(xué)位論文工作博士學(xué)位論文應(yīng)表明作者具有獨(dú)立從事科學(xué)研究工作的能力，應(yīng)在科學(xué)和專門技術(shù)上做出創(chuàng)造性的工作，反映作者在本學(xué)科上掌握了堅(jiān)實(shí)寬廣的基礎(chǔ)理論和深入的專門知識(shí)。博士生入學(xué)后，應(yīng)在導(dǎo)師指導(dǎo)下收集資料，確定研究課題，一般應(yīng)在第二學(xué)期（或第三學(xué)期）提出學(xué)位論文的開題報(bào)告。開題報(bào)告應(yīng)由博士生在系學(xué)術(shù)會(huì)議上宣讀，并聘請(qǐng)相關(guān)學(xué)科專業(yè)的專家參加，廣泛聽取意見。論文題目確定后，由博士生在導(dǎo)師指導(dǎo)下擬訂具體工作計(jì)劃，用于論文工作的時(shí)間，不能少于整個(gè)博士生學(xué)習(xí)年限的三分之二，以后應(yīng)按階段在系學(xué)術(shù)會(huì)議上報(bào)告論文工作的進(jìn)展情況。在研究過程中，應(yīng)完成階段