中國部分Botryosphaeriaceae真菌的系統(tǒng)發(fā)育及模式種Botryosphaeriadothidea的遺傳多樣性研究

1、中國部分Botryosphaeriaceae真菌的系統(tǒng)發(fā)育及模式種Botryosphaeriadothidea的遺傳多樣性研究葡萄座腔菌科（Botryosphaeriaceae）（子囊菌門Ascomycota,座囊菌綱Dothideomycetes）真菌分布廣泛，種類繁多，寄主類型多樣，在我國引起多種重要的經(jīng)濟樹木枝條或主干發(fā)生潰瘍病，包括楊樹和多種果樹等。長期以來病原真菌的命名多根據(jù)病害和寄主來命名，造成了同菌異名、同名異菌的問題，引起了該科真菌的命名和分類混亂的問題。該屬模式種Botryosphaeriadothidea是該科最常見的種之一，是引起樹木潰瘍病最重要的病原，在我國多個氣候區(qū)均

2、有發(fā)生，闡明該種不同地理群體間的遺傳多樣性和遺傳分化，對病害的檢測和防治具有重要意義。為了澄清我國樹木潰瘍病病原真菌的種類和調(diào)查葡萄座腔菌科真菌在我國分布的多樣性，針對引起楊樹和薔薇科果樹病害的葡萄座腔菌科病原進行研究，采用形態(tài)學(xué)和系統(tǒng)發(fā)育學(xué)的方法，從我國南北方的5個典型氣候區(qū)分離到58株寄主為楊樹和37株寄主為薔薇科果樹的試驗菌株，結(jié)合形態(tài)學(xué)和系統(tǒng)發(fā)育分析方法，鑒定葡萄座腔菌科5個屬8（或9）種真菌。Botryosphaeriadothidea種群具有中度偏高的遺傳多樣性，Neis基因多樣性指數(shù)（H）為0.6777。利用形態(tài)學(xué)結(jié)合ITS、B-tubulin和EF1-a序列J比較分析表明，發(fā)生

3、于楊樹上的種類包括Botryosphaeriadothidea、Neofusicoccumparvum、Diplodiaseriata、D.mutila、Dothiorellaviticola和一個未定名新種Fusicoccumsp.1，其中，共有53株為B.dothidea，其它種各1株；發(fā)生于薔薇科果樹上的有B.dothidea、Lasiodiplodiapseudotheobromae、Neof.parvum/Neof.ribis復(fù)合種和另一個未定名新種Fusicoccumsp.2，其中，B.dothidea15株，L.pseudotheobromae和Neof.parvum/Neof.

4、ribis各有3株，F(xiàn)usicoccumsp.2有6株。上述種類中，D.seriata在我國是第一次報道發(fā)生在楊樹上；Do.viticola是第一次報道于滇青岡。根據(jù)B-tubulin序列系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究，對B.rhodina與其無性型L.theobromae的對應(yīng)關(guān)系提出質(zhì)疑，認為B.rhodina的無性型應(yīng)為L.pseudotheobromae。研究表明，除了L.pseudotheobromae只發(fā)生于南亞熱帶外，其余絕大多數(shù)試驗菌株在我國的分布與氣候區(qū)沒有直接的聯(lián)系。培養(yǎng)特征的比較和LSU序列、ITS/EF1-a序列聯(lián)合建立的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進一步支持了兩個未定名種Fusicoccumsp.

5、1和Fusicoccumsp.2的系統(tǒng)地位，屬于Botryosphaeriacomplex。Fusicoccumsp.1與Fusicoccumfabicercianum表現(xiàn)出最近的親緣關(guān)系，F(xiàn)usicoccumsp.1和Fusicoccumsp.2與Botryosphaeriacomplex其它種存在著顯著的培養(yǎng)特征上的區(qū)別：它們的菌落均呈現(xiàn)環(huán)狀，且培養(yǎng)至第10天氣生菌絲仍未變灰。Botryosphaeriadothidea為兩類寄主上的優(yōu)勢種類，其分布區(qū)域橫跨南亞熱帶到中溫帶，顯示出對不同地理和寄主的適應(yīng)性。為了分析B.dothidea種群的遺傳分化和遺傳多樣性，從文獻記載的標(biāo)記中篩選出來1

6、0個簡單序列重要（SSR標(biāo)記用于分析來自5個地區(qū)種群77個試驗菌株的遺傳多樣性和種群遺傳結(jié)構(gòu)，分別來自5個氣候區(qū)：中溫帶亞濕潤型氣候大區(qū)、暖溫帶亞濕潤型氣候大區(qū)、北亞熱帶濕潤型氣候大區(qū)、中亞熱帶濕潤型氣候大區(qū)和南亞熱帶濕潤型氣候大區(qū)。結(jié)果表明各種群的多樣性指數(shù)均為中度偏高（H=0.6777）；群體間的遺傳分化程度較低（平均Fst=0.0758），且遺傳差異大多來自群體內(nèi)部，而群體間的遺傳差異較小。除中溫帶亞濕潤型氣候大區(qū)種群外，其余4個種群都有自己特定的等位基因，其特有等位基因數(shù)依次為21、2、2、3個。77個試驗菌株構(gòu)成的不同地理群體間的分化程度低，基因流動較大，可能與菌株來源于人為活動頻繁的地區(qū)有關(guān)，并且與寄主的反復(fù)遷移有直接關(guān)系，尤其是楊樹。楊樹和薔薇科寄主的菌株沒有表現(xiàn)也寄主分化特征。但同時也發(fā)現(xiàn)了不同種群特定的等位基因，包括北亞熱帶濕潤型氣候大區(qū)種群的407bp和425bp,中亞熱帶濕潤型氣候大區(qū)種群的424bp和429bp,南亞熱帶