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文檔簡(jiǎn)介
1、實(shí)驗(yàn)室常用緩沖液配置方案1)1 M Tris-HCl (pH7.4, 7.6, 8.0)組份濃度:1 M Tris-HCl配制量:1 L 配制方法: 1. 稱量121.1 g Tris置于1 L燒杯中。 2. 加入約800 ml的去離子水,充分?jǐn)嚢枞芙狻?3. 按下表量加入濃鹽酸調(diào)節(jié)所需要的pH值。PH值 濃HCl 7.4 約70ml 7.6 約60ml 8.0 約42ml 4. 將溶液定容至1 L。 5. 高溫高壓滅菌后,室溫保存。 注意:應(yīng)使溶液冷卻至室溫后再調(diào)定pH值,因?yàn)門ris溶液的pH值隨溫度的變化差異很大,溫度每升高1,溶液的pH值大約降低0.03個(gè)單位。 2)10×T
2、E Buffer (pH7.4, 7.6, 8.0)組份濃度:100 mM Tris-HCl, 10 mM EDTA配制量:1 L 配制方法: 1. 量取下列溶液,置于1 L燒杯中。1M TrisHCl Buffer(PH7.4,7.6,8.0) 100ml 500mM EDTA(PH8.0) 20ml 2. 向燒杯中加入約800 ml的去離子水,均勻混合。 3. 將溶液定容至1 L后,高溫高壓滅菌。 4. 室溫保存。3)1.5 M Tris-HCl (pH8.8)組份濃度:1.5 M Tris-HCl配制量:1 L 配制方法: 1. 稱量181.7 g Tris置于1 L燒杯中。 2. 加入
3、約800 ml的去離子水,充分?jǐn)嚢枞芙狻?3. 用濃鹽酸調(diào)節(jié)pH值至8.8。 4. 將溶液定容至1 L。 5. 高溫高壓滅菌后,室溫保存。 注意:應(yīng)使溶液冷卻至室溫后再調(diào)定pH值,因?yàn)門ris溶液的pH值隨溫度的變化差異很大,溫度每升高1,溶液的pH值大約降低0.03個(gè)單位。4)3 M 醋酸鈉(pH5.2)組份濃度:3M 醋酸鈉 配制量:100ml配制方法: 1.稱量40.8g NaAc·3H2O(或者24.6g無(wú)水 NaAc)置于100-200ml燒杯中,加入月40ml的去離子水?dāng)嚢枞芙?2.加入冰醋酸調(diào)節(jié)pH值至5.23.加去離子水將溶液定容至100ml4高溫高壓滅菌后,室溫保存
4、。 5)PBS Buffer組份濃度:137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 2 mM KH2PO4配制量:1 L 配制方法: 1. 稱量下列試劑,置于1 L燒杯中。NaCl 8g KCl 0.2g Na2HPO4 1.42g KH2PO4 0.27g 2. 向燒杯中加入約800 ml的去離子水,充分?jǐn)嚢枞芙狻?3. 滴加濃鹽酸將pH值調(diào)節(jié)至7.4,然后加入去離子水將溶液定容至1 L。 4. 高溫高壓滅菌后,室溫保存。 注意:上述PBS Buffer中無(wú)二價(jià)陽(yáng)離子,如需要,可在配方中補(bǔ)充1 mM CaCl2和0.5 mM MgCl2。 6)10 M 醋酸
5、銨 組份濃度:10 M 醋酸銨配制量:100 ml配制方法: 1. 稱量77.1 g醋酸銨置于100200 ml燒杯中,加入約30 ml的去離子水?dāng)嚢枞芙狻?2. 加去離子水將溶液定容至100 ml。 3. 使用0.22 mm濾膜過(guò)濾除菌。 4. 密封瓶口于室溫保存。 注意:醋酸銨受熱易分解,所以不能高溫高壓滅菌。 7)苯酚/氯仿/異戊醇 (25 : 24 : 1)配制方法: 1. 說(shuō)明:從核酸樣品中除去蛋白質(zhì)時(shí)常常使用苯酚/氯仿/異戊醇(25 : 24 : 1)。氯仿可使蛋白質(zhì)變性并有助于液相與有機(jī)相的分離,而異戊醇則有助于消除抽提過(guò)程中出現(xiàn)的氣泡。 2. 配制方法:將Tris-HCl平衡苯
6、酚與等體積的氯仿/異戊醇(24 : 1)混合均勻后,移入棕色玻璃瓶中4保存。8)10 (W/V) SDS組份濃度:10 (W/V)SDS配制量:100ml配制方法: 1.稱量10g高純度的SDS置于100-200ml燒杯中,加入約80ml的去離子水,68加入溶解 2.滴加濃鹽酸調(diào)節(jié)pH值至7.23.將溶液定容至100ml后,室溫保存。 9)2 N NaOH組份濃度:2 N NaOH配制量:100 ml配制方法: 1. 量取80 ml去離子水置于100200 ml塑料燒杯中(NaOH溶解過(guò)程中大量放熱,有可能使玻璃燒杯炸裂)。 2. 稱取8 g NaOH小心地逐漸加入到燒杯中,邊加邊攪拌。 3.
7、 待NaOH完全溶解后,用去離子水將溶液體積定容至100 ml。 4. 將溶液轉(zhuǎn)移至塑料容器中后,室溫保存。10)2.5 N HCl組份濃度:2.5 N HCl配制量:100 ml配制方法: 1. 在78.4 ml的去離子水中加入21.6 ml的濃鹽酸(11.6 N),均勻混合。 2. 室溫保存。 11)5 M NaCl組份濃度:5 M NaCl配制量:1 L 配制方法: 1. 稱取292.2 g NaCl置于1 L燒杯中,加入約800 ml的去離子水后攪拌溶解。 2. 加去離子水將溶液定容至1 L后,適量分成小份。 3. 高溫高壓滅菌后,4保存。 11)20 (W/V) Glucose組份濃
8、度:20 (W/V) Glucose配制量:100 ml配制方法: 1. 稱取20 g Glucose置于100200 ml燒杯中,加入約80 ml的去離子水后,攪拌溶解。 2. 加去離子水將溶液定容至100 ml。 3. 高溫高壓滅菌后,4保存。12)Solution I(質(zhì)粒提取用)組份濃度:25 mM Tris-HCl(pH8.0), 10 mM EDTA, 50 mM Glucose配制量:1 L 配制方法: 1. 量取下列溶液,置于1 L燒杯中。1M Tris-HCl(PH8.0) 25ml 0.5M EDTA(PH8.0) 20ml 20Glucose(1.11M) 45ml dH
9、2O 910ml 2. 高溫高壓滅菌后,4保存。 3. 使用前每50 ml的Solution I中加入2 ml的RNase A(20 mg/ml)。13) Solution II(質(zhì)粒提取用)組份濃度:200mM NaOH,1(W/V)SDS配制量:500ml配制方法: 1.量取下列溶液,置于500ml燒杯中 10 SDS 50ml2N NaOH 50ml 2.加滅菌水定容至500ml,充分混勻 3.室溫保存,此溶液保存時(shí)間最好不要超過(guò)一個(gè)月 注意:SDS易產(chǎn)生氣泡,不要?jiǎng)×覕嚢?4)Solution III(質(zhì)粒提取用)組份濃度:3 M KOAc, 5 M CH3COOH配制量:500 ml
10、配制方法: 1. 稱量下列試劑,置于500 ml燒杯中。KOAc 147g CH3COOH 57.5ml 2. 加入300 ml去離子水后攪拌溶解。 3. 加去離子水將溶液定容至500 ml。 4. 高溫高壓滅菌后,4保存。15)0.5 M EDTA(pH8.0)組份濃度:0.5 M EDTA配制量:1 L 配制方法:稱取186.1 g Na2EDTA·2H2O,置于1
11、L燒杯中。 2. 加入約800 ml的去離子水,充分?jǐn)嚢琛?3. 用NaOH調(diào)節(jié)pH值至8.0(約20 g NaOH)。 注意:pH值至8.0時(shí),EDTA才能完全溶解。 4. 加去離子水將溶液定容至1 L。 5. 適量分成小份后,高溫高壓滅菌。 6. 室溫保存。16)1 M DTT組份濃度:1 M DTT配制量:20 ml配制方法: 1. 稱取3.09 g DTT,加入到50 ml塑料離心管內(nèi)。 2. 加20 ml的0.01 M NaOAc(pH5.2),溶解后使用0.22 mm濾器過(guò)濾除菌。 3. 適量分成小份后,-20保存。17)10 mM ATP 組份濃度:10 mM ATP配制量:20
12、 ml配制方法: 1. 稱取121 mg Na2ATP·3H2O,加入到50 ml塑料離心管內(nèi)。 2. 加20 ml的25 mM Tris-HCl(pH8.0),攪拌溶解。 3. 適量分成小份后,-20保存。一.常用貯液與溶液1mol/L亞精胺(Spermidine): 溶解2.55g亞精胺于足量的水中,使終體積為10ml。分裝成小份貯存于-20。1mol/L精胺(Spermine):溶解3.48g精胺于足量的水中,使終體積為10ml。分裝成小份貯存于-20。10mol/L乙酸胺(ammonium acetate):將77.1g乙酸胺溶解于水中,加水定容至1L后,用0.22um孔徑的
13、濾膜過(guò)濾除菌。10mg/ml牛血清蛋白(BSA):加100mg的牛血清蛋白(組分V或分子生物學(xué)試劑級(jí),無(wú)DNA酶)于9.5ml水中(為減少變性, 須將蛋白加入水中,而不是將水加入蛋白),蓋好蓋后,輕輕搖動(dòng),直至牛血清蛋白完全溶解為止。不要渦旋混合。加水定容到10ml,然后分裝成小份貯存于-20。1mol/L二硫蘇糖醇(DTT):在二硫蘇糖醇5g的原裝瓶中加32.4ml水,分成小份貯存于-20?;蜣D(zhuǎn)移100mg的二硫蘇糖醇 至微量離心管,加0.65ml的水配制成1mol/L二硫蘇糖醇溶液。8mol/L乙酸鉀(potassium acetate):溶解78.5g乙酸鉀于足量的水中,加水定容到100
14、ml。1mol/L氯化鉀(KCl):溶解7.46g氯化鉀于足量的水中,加水定容到100ml。3mol/L乙酸鈉(sodium acetate):溶解40.8g的三水乙酸鈉于約90ml水中,用冰乙酸調(diào)溶液的pH至5.2,再加水定容到100ml。0.5mol/L EDTA:配制等摩爾的Na2EDTA和NaOH溶液(0.5mol/L),混合后形成EDTA的三鈉鹽?;蚍Q取186.1g的Na2EDTA·2H2O和20g的NaOH,并溶于水中,定容至1L。1mol/L HEPES:將23.8gHEPES溶于約90ml的水中,用NaOH調(diào)pH(6.8-8.2),然后用水定容至100ml。1mol/
15、L HCl:加8.6ml的濃鹽酸至91.4ml的水中。25mg/ml IPTG:溶解250mg的IPTG(異丙基硫代-D-半乳糖苷)于10ml水中,分成小份貯存于-20。1mol/LMgCl2:溶解20.3g MgCl2·6H2O于足量的水中,定容到100ml。100mmol/L PMSF:溶解174mg的PMSF(苯甲基磺酰氟)于足量的異丙醇中,定容到10ml。分成小份并用鋁箔將裝液管包裹 或貯存于-20。20mg/ml蛋白酶K(proteinase K):將200mg的蛋白酶L加入到9.5ml水中,輕輕搖動(dòng),直至蛋白酶K完全溶解。不要渦旋混合。加水定容到10ml,然后分裝成小份貯
16、存于-20。10mg/mlRnase(無(wú)DNase)(DNasefree RNase):溶解10mg的胰蛋白R(shí)NA酶于1ml的10mmol/L的乙酸鈉水溶液中(pH 5.0)。溶解后于水浴中煮沸15min,使DNA酶失活。用1mol/L的TrisHCl調(diào)pH至7.5,于-20貯存。(配制過(guò)程中要戴手套)5mol/L氯化鈉(NaCl):溶解29.2g氯化鈉于足量的水中,定容至100ml。10N氫氧化鈉(NaOH):溶解400g氫氧化鈉顆粒于約0.9L水的燒杯中(磁力攪拌器攪拌),氫氧化鈉完全溶解后用水定容至1L。10SDS(十二烷基硫酸鈉):稱取100gSDS慢慢轉(zhuǎn)移到約含0.9L的水的燒杯中,
17、用磁力攪拌器攪拌直至完全溶解。用水定容至1L。2mol/L山梨(糖)醇(Sorbitol):溶解36.4g山梨(糖)醇于足量水中使終體積為100ml。100三氯乙酸(TCA):在裝有500gTCA的試劑瓶中加入100ml水,用磁力攪拌器攪拌直至完全溶解。(稀釋液應(yīng)在臨用前配制)2.5 Xgal(5-溴-4-氯-3-吲哚-半乳糖苷):溶解25mg的Xgal于1ml的二甲基甲酰胺(DMF),用鋁箔包裹裝液管,貯存于-20。100×Denhardt試劑(Denhardt's regent)成分及終濃度 配制100ml溶液各成分的用量 2聚蔗糖(Ficoll,400型) 2聚乙烯吡咯
18、烷酮(PVP-40) 2BSA(組分V) 水 2g 2g 2g 加水至總體積為100ml 依照上表稱取各組分,溶于水中定容。過(guò)濾除菌及雜質(zhì),分裝成小份于-20貯存。10×標(biāo)準(zhǔn)DNA連接酶緩沖液(standard DNA ligase buffer)(粘端、平端連接)成分及終濃度 配制10ml溶液各成分的用量 0.5mol/L Tris-HCl100mmol/L MgCl2100mmol/L DTT2mmol/L ATP5mmol/L 鹽酸亞精胺(可選) 0.5mg/ml BSA(組分V)(可選) 水 5ml 1mol/L 貯液 1ml 1mol/L 貯液 1ml 1mol/L 貯液
19、200ul 100 mmol/L 貯液 50ul 1 mmol/L 貯液 0.5ml 10 mg/mL 貯液 2.25ml 將配制好的緩沖液分裝成小份,貯存于-20 。100 mmol/L dNTP 溶液(dNTP solutions) 可以購(gòu)買到100mmol/L純dNTPs貯液,-80可貯存至少6個(gè)月。10mmol/L dNTP混合液成分及終濃度 配制20ul溶液各成分的用量 10mmol/L dATP10mmol/L dCTP 10mmol/L dGTP10mmol/L dTTP水 2ul 100 mmol/L dATP 貯液 2ul 100 mmol/L dCTP 貯液 2ul 100
20、 mmol/L dGTP 貯液 2ul 100 mmol/L dTTP 貯液 12ul 20PEG 8000/2.5M NaCl成分及終濃度 配制10ml溶液各成分的用量 質(zhì)量濃度為20聚乙二醇 2.5mol/L 氯化鈉 水 20g 50ml 5 mol/L 氯化鈉 或 14.6g 固體氯化鈉 補(bǔ)足100ml 加聚乙二醇于含有氯化鈉的燒杯中,加水至終體積100ml,用磁力攪拌器攪拌溶解。20×SSC成分及終濃度 配制1L溶液各成分的用量 300mmol/L 檸檬酸三鈉(二水) 3mol/L 氯化鈉 水 88.2g 175.3g 補(bǔ)足1L 溶解檸檬酸三鈉(二水)和氯化鈉于約0.9L水中
21、,加幾滴10N NaOH溶液調(diào)pH為7.0,用水補(bǔ)足體積至1L。DEPC(焦碳酸二乙酯)處理水 加100ul DEPC 于 100ml 水中,使DEPC的體積分?jǐn)?shù)為0.1。在37溫浴至少12h,然后在15 psi 條件下高壓滅菌20min,以使殘余的DEPC失活。DEPC會(huì)與胺起反應(yīng),不可用DEPC處理Tris緩沖液。甲酰胺(deionized formamide) 直接購(gòu)買或加Dowex XG8 混合樹脂于裝有甲酰胺的玻璃燒杯中,用磁力攪拌器輕輕攪拌1h,可去除甲酰胺中的離子。經(jīng)Whatman 1號(hào)濾紙過(guò)濾除去樹脂后分成小份,充氮?dú)庥?80貯存(防止氧化)。磷酸緩沖液(phosphate b
22、uffer) 按照下表所給定的體積,混合1 mol/L 的磷酸二氫鈉(單堿)和1mol/L 磷酸氫二鈉(雙堿)貯液,獲得所需pH的磷酸緩沖液。配制1 mol/L 的磷酸二氫鈉(NaH2PO4·H2O)貯液:溶解138g于足量水中,使終體積為1L;1mol/L 磷酸氫二鈉(Na2HPO4)貯液:溶解142g于足量水中使終體積為1L。1mol/L 磷酸二氫鈉(ml) 1mol/L 磷酸氫二鈉(ml) 最終pH值 877850815775735685625565510450390330280 123150185225265315375435490550610670720 6.06.16.2
23、6.36.46.56.66.76.86.97.07.17.2 TE(用于懸浮和貯存DNA)成分及終濃度 配制100ml溶液各成分的用量 10mmol/L TrisHCl1mmol/L EDTA水 1ml 1mol/L Tris-HCl(pH7.4-8.0,25) 200ul 0.5 mol/L EDTA(pH 8.0) 98.8ml Tris緩沖液(Tris-HCl buffer) 將121g的Tris堿溶解于約0.9L水中,再根據(jù)所要求的pH(25下)加一定量的濃鹽酸(11.6N),用水調(diào)整終體積至1L。濃鹽酸的體積(ml) pH 8.6142128.53846566671.376 9.08
24、.88.68.48.28.07.87.67.47.2 二.電泳緩沖液、染料和凝膠加樣液電泳緩沖液50×Tris-乙酸(TAE)緩沖液成分及終濃度 配制1L溶液各成分的用量 2mol/L Tris堿 1mol/L 乙酸 100 mmol/L EDTA水 242g 57.1 ml的冰乙酸(17.4 mol/L) 200ml的0.5 mol/L EDTA(pH 8.0) 補(bǔ)足1L 5×Tris-硼酸(TBE)緩沖液成分及終濃度 配制1L溶液各成分的用量 445 mmol/L Tris堿 445 mmol/L 硼酸鹽 10 mmol/L EDTA水 54g 27.5g 硼酸 20
25、ml的0.5 mol/L EDTA(pH 8.0) 補(bǔ)足1L 染料1溴酚藍(lán)(bromophenol blue) 加1g水溶性鈉型溴酚藍(lán)于100ml水中,攪拌或渦旋混合直到完全溶解。1二甲苯青FF(xylene cyanole FF) 溶解1g二甲苯青FF于足量水中,定容到100ml。10mg/ml的溴化乙錠(ethidium bromide) 小心稱取1g溴化乙錠,轉(zhuǎn)移到廣口瓶中,加100ml水,用磁力攪拌器攪拌直到完全溶解。用鋁箔包裹裝液管,于4貯存。凝膠上樣液(gel loading solutions) 6×堿性凝膠上樣液(室溫貯存)成分及終濃度 配制10ml溶液各成分用量 0
26、.3 N 氫氧化鈉 6 mmol/L EDTA18聚蔗糖(400型) 0.15溴甲酚綠 0.25二甲苯青FF水 300ul 10N 氫氧化鈉 120ul 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 1.8g15mg25mg補(bǔ)足到10ml 6×聚蔗糖凝膠上樣液(室溫貯存)成分及終濃度 配制10ml溶液各成分用量 0.15溴酚藍(lán) 0.15二甲苯青FF5 mmol/L EDTA15聚蔗糖(400型) 水 1.5ml 1溴酚藍(lán) 1.5ml 1二甲苯青FF100ul 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 1.5g補(bǔ)足到10ml 6×溴酚藍(lán)/二甲苯青/聚蔗糖凝膠上樣液(室溫貯存)成分
27、及終濃度 配制10ml溶液各成分用量 0.25溴酚藍(lán) 0.25二甲苯青FF15聚蔗糖(400型) 水 2.5ml 1溴酚藍(lán) 2.5ml 1二甲苯青FF1.5g 補(bǔ)足到10ml 6×甘油凝膠上樣液(4貯存)成分及終濃度 配制10ml溶液各成分用量 0.15溴酚藍(lán) 0.15二甲苯青FF5 mmol/L EDTA50甘油 水 1.5ml 1溴酚藍(lán) 1.5ml 1二甲苯青FF100ul 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 3ml 3.9ml 6×蔗糖凝膠上樣液(室溫貯存)成分及終濃度 配制10ml溶液各成分用量 0.15溴酚藍(lán) 0.15二甲苯青FF5 mmol/L EDTA4
28、0聚蔗糖 水 1.5ml 1溴酚藍(lán) 1.5ml 1二甲苯青FF100ul 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 4g 補(bǔ)足到10ml 10×十二烷基硫酸鈉/甘油凝膠上樣液(室溫貯存)成分及終濃度 配制10ml溶液各成分用量 0.2溴酚藍(lán) 0.2二甲苯青FF200 mmol/L EDTA0.1SDS50甘油 水 20mg20mg4ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)100ul 10 SDS5ml補(bǔ)足到10ml 三.常用培養(yǎng)基LB培養(yǎng)基 將下列組分溶解在0.9L水中:蛋白胨 10g 酵母提取物 5g 氯化鈉 10g 如果需要用1N NaOH(1ml)調(diào)整pH至7.0,再補(bǔ)足
29、水至1L。注:瓊脂平板需添加瓊脂粉12g/L,上層瓊脂平板添加瓊脂粉7g/L。SOB培養(yǎng)基 將下列組分溶解在0.9L水中:蛋白胨 20g 酵母提取物 5g 氯化鈉 0.5g 1 mol/L 氯化鉀 2.5ml 用水補(bǔ)足體積到1L。分成100ml的小份,高壓滅菌。培養(yǎng)基冷卻到室溫后,再在每100ml的小份中加1ml滅過(guò)菌的1mol/L氯化鎂。SOC培養(yǎng)基 成分、方法同SOB培養(yǎng)基的配制,只是在培養(yǎng)基冷卻到室溫后,除了在每100ml的小份中加1ml滅過(guò)菌的1mol/L氯化鎂外,再加2ml滅菌的1mol/L葡萄糖(18g葡萄糖溶于足夠水中,再用水補(bǔ)足到100ml,用0.22um的濾膜過(guò)濾除菌)。TB培養(yǎng)基 將下列組分溶解在0.9L水中:蛋白胨 12g 酵母提取物 24g 甘油 4ml 各組分溶解后高壓滅菌。冷卻到60,再加100ml滅菌的170mmol/L KH2PO4/0.72 mol/L K2HPO4的溶液(2.31g的KH2PO4和12.54gK2HPO4溶在足量的水中,使終體積為100ml。高壓滅菌或用0.22um的濾膜過(guò)濾除菌)。2×YT培養(yǎng)基 將下列組分溶解在0.9L水中:蛋白胨 16g 酵母提取物 10g 氯化鈉 4ml 如果需要用1N NaOH(1ml)調(diào)整pH至7.0,再補(bǔ)足水至1L。注:瓊脂平
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