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文檔簡介
1、生物化學知識點總結一、蛋白質蛋白質的元素組成:C、H、O、N、S 大多數(shù)蛋白質含氮量較恒定,平均16%,即1g氮相當于6.25g蛋白質。6.25稱作蛋白質系數(shù)。樣品中蛋白質含量=樣品中含氮量6.25蛋白質紫外吸收在280nm,含3種芳香族氨基酸,可被紫外線吸收等電點(pI):調節(jié)氨基酸溶液的pH值,使氨基酸所帶凈電荷為零,在電場中,不向任何一極移動,此時溶液的pH叫做氨基酸的等電點。脯氨酸和羥脯氨酸與茚三酮反應產生黃色物質,其余的氨基酸與茚三酮反映均產生藍紫色物質。氨基酸與茚三酮反應非常靈敏,幾微克氨基酸就能顯色。肽平面:肽鍵由于C-N鍵有部分雙鍵的性質,不能旋轉,使相關的6個原子處于同一平面
2、,稱作肽平面或酰胺平面。生物活性肽:能夠調節(jié)生命活動或具有某些生理活動的寡肽和多肽的總稱。1) 谷胱甘肽:存在于動植物和微生物細胞中的一種重要三肽,由谷氨酸(Glu)、半胱氨酸(Cys)和甘氨酸(Gly)組成,簡稱GSH。由于GSH含有一個活潑的巰基,可作為重要的還原劑保護體內蛋白質或酶分子中的巰基免遭氧化,使蛋白質或酶處在活性狀態(tài)。寡肽:10個以下氨基酸脫水縮合形成的肽多肽:10個以上氨基酸脫水縮合形成的肽蛋白質與多肽的區(qū)別:蛋白質:空間構象相對穩(wěn)定,氨基酸殘基數(shù)較多多肽:空間構象不穩(wěn)定,氨基酸殘基數(shù)較少蛋白質的二級結構:多肽鏈在一級結構的基礎上,某局部通過氫鍵使肽鍵平面進行盤曲,折疊,轉角
3、等形成的空間構象。-螺旋的結構特點:1) 以肽鍵平面為單位,以-碳原子為轉折盤旋形成右手螺旋;肽鍵平面與中心軸平行。2) 每3.6個氨基酸殘基繞成一個螺圈,螺距為0.54nm,每個氨基酸上升0.15nm。3) 每一個氨基酸殘基中的NH和前面相隔三個殘基的C=O之間形成氫鍵,氫鍵的方向與中心軸大致平行,是穩(wěn)定螺旋的主要作用力4) 肽鏈中的氨基酸R基側鏈分布在螺旋的外側,R基團的大小、性狀及帶電荷情況都對螺旋的形成與穩(wěn)定起作用。 蛋白質的三級結構:球狀蛋白質的多肽鏈在二級結構、超二級結構和結構域等結構層次的基礎上,組裝而成的完整的結構單位稱三級結構。次級鍵。蛋白質的四級結構:許多蛋白質由兩個或兩個
4、以上具有三級結構的亞單位組成,其中每一個亞單位稱為亞基。亞基間通過非共價鍵聚合而形成特定的構象。結構域:在一些相對較大的蛋白質分子中,在空間折疊時往往先分別折疊成幾個相對獨立的區(qū)域,在組裝成更復雜的球狀結構,這種在二級或超二級結構基礎上形成的特定區(qū)域叫結構域。蛋白質的變性:蛋白質由于受到物理、化學因素的作用使蛋白質空間構象發(fā)生改變與生物學活性的喪失,此過程稱蛋白質的變性。 變性的標志:生物活性喪失/疏水基團外露,分子結構伸展松散,易被蛋白酶水解。 變形后果:維持蛋白質空間構象的次級鍵和二硫鍵的斷裂,引起蛋白質二、三、四級結構的破壞,而不涉及一級結構的改變和肽鍵的斷裂。 變性因素: 1物理因素:
5、加熱、劇烈震蕩或攪拌、紫外線及X射線照射、超聲波等。 2化學因素:強酸、強堿、重金屬鹽、有機酸、有機溶劑、尿素、胍、 b-硫基乙醇、去污劑等。二、酶大多數(shù)的酶是蛋白質,也有一些RNA具有催化功能,稱為核酶。酶:有活細胞合成的具有高度催化效能和高度特異性的生物催化劑(絕大多數(shù)是蛋白質)。酶的特點:1)高效性 2)專一性 3)容易失活 4)容易調控酶的化學本質:對酶進行酸堿水解處理,水解的最終產物經分析為氨基酸;用蛋白質的變性劑處理酶可使酶失活;酶和其他蛋白質一樣,具有不能通過半透膜等膠體性質。酶的化學組成:酶可分為單純蛋白質(僅由氨基酸殘基組成)與綴合蛋白質(除氨基酸殘基外還有金屬離子、有機小分
6、子等化學成分,又稱全酶)。全酶:全酶中的蛋白質部分稱為脫輔酶,非蛋白質部分稱為輔因子。脫輔酶和輔因子單獨存在時均無催化活性,只有由二者結合而成的全酶分子才具有催化活性。屬于有機分子的輔因子稱為輔酶。與脫輔酶結合強叫輔基,結合松弛叫輔酶。透析可去除的小分子有機物(輔酶) 透析去不掉的(輔基)酶的類型:單體酶(三級結構):只有一條肽鏈的酶稱為單體酶。屬于這類酶為數(shù)不多,而且常常為水解酶。寡聚酶(四級結構):有幾個或多個亞基組成的酶稱為寡聚酶。多酶復合物:幾個酶嵌合而成的復合物稱為多酶復合物。酶的活性部位:必需基團:酶分子中與酶活性密切相關的基團稱為必需基團。活性中心(active site):有些
7、必需基團在一級結構上可能相距甚遠,但在空間結構上彼此靠近,集中在一起形成具有一定空間結構的區(qū)域,能與底物特異的結合,并將底物轉化成產物。結合基團(專一性):作用是與底物結合使底物與酶形成復合物。催化基團(活性):作用是影響底物中某些化學鍵的穩(wěn)定性,催化底物發(fā)生化學反應,使之轉化成產物。頻率最高的活性中心的氨基酸殘基:Ser、His、Cys、Tyr、Asp、Glu、Lys 。同工酶:指具有催化相同的化學反應,但酶蛋白的分子結構、理化性質、免疫學性質都不同的一組酶。 底物濃度對反應速度的影響抑制劑:凡使酶的必需基團或酶活性部位中的基團的化學性質改變而降低酶活力甚至使酶完全喪失活性的物質,稱為抑制劑
8、(I)。其作用稱為抑制作用。抑制作用一般分為不可逆抑制作用(與酶的必需基團以共價鍵結合,永久失活)和可逆抑制作用(與酶蛋白以非共價鍵結合,暫時性喪失)。 可逆抑制劑:(1)競爭性抑制劑 (2)非競爭性抑制劑 (3)反競爭性抑制劑最適溫度:在該溫度下,酶的活力最強最適pH:在該pH值下,酶促反應速率最大三、核酸核酸的組成:C、H、O、N、P(恒定9-10%)DNA的結構:DNA是由數(shù)量龐大的4種脫氧核苷酸通過3,5-磷酸二酯鍵連接而成的,DNA的一級結構就是指這些脫氧核苷酸在分子中的排列順序。雙螺旋結構的維系力:1.堿基對間的氫鍵 2.上下堿基對的堆積力 3.環(huán)境中的正離子 RNA的結構和功能t
9、RNA一級結構特點: 1)RNA中最小的,由60-90個核苷酸組成 2)含有最多的稀有堿基,每個平均含有7-15個稀有堿基3)其3端有CCA-OH 4)其5端一般是pGtRNA二級結構特點:呈三葉草型,由四環(huán)和四臂組成。 tRNA三級結構特點:呈“倒L”型核酸在260nm處有強的紫外吸收。增色效應:當核酸發(fā)生變性后,260nm處紫外吸收會明顯增加,此現(xiàn)象稱為增色效應(核酸變性,雙螺旋結構解開,260nm吸收會明顯增加)。當核酸發(fā)生復性后,260nm處紫外吸收會明顯下降,此現(xiàn)象稱為減色效應。解鏈溫度(熔解溫度或熔點,Tm):雙鏈DNA50%發(fā)生變性的溫度。影響Tm的因素:(1)DNA序列的復雜性越小,Tm的溫度范圍越小 (2)G-C含量越高(三鍵),Tm的值越大
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