第八期生物數(shù)據(jù)分析技能實訓(xùn)會_第1頁
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文檔簡介

1、第八期生物數(shù)據(jù)分析技能實訓(xùn)會隨著高通量組學(xué)技術(shù)的蓬勃發(fā)展,生物醫(yī)學(xué)正加速進(jìn)入大數(shù)據(jù)時代。借助生物醫(yī)學(xué)多組學(xué)、多層次的海量數(shù)據(jù),可以從前所未有的廣度和深度來研究生物體運行機(jī)制,但海量復(fù)雜數(shù)據(jù)帶來的挑戰(zhàn)同樣巨大。由于生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)多呈分散復(fù)雜特征,因此常需要深入分析已有數(shù)據(jù)。在此基礎(chǔ)上,以海量數(shù)據(jù)發(fā)掘與解析為主體內(nèi)容的生物信息學(xué)技能就成為科研必要手段,如疾病的病因?qū)W、臨床診斷標(biāo)志物、作用靶點識別,關(guān)鍵大分子的發(fā)現(xiàn)與功能預(yù)測,以及遺傳調(diào)控機(jī)制等方面。會議特邀倫永志教授擔(dān)任主講教師。本課程曾分別用名基因序列分析技術(shù)和功能基因組信息分析技術(shù),后將上述兩門課程整合更名為生物數(shù)據(jù)分析技能。自第七期會議起,倫老

2、師對課程內(nèi)容進(jìn)行了較大幅度更新,以順應(yīng)學(xué)科發(fā)展和學(xué)員需要。授課繼續(xù)沿用倫老師獨創(chuàng)的TPS(Teaching-Practicing-Showing)教學(xué)模式,著力于以實際問題為引線,將理論授課與上機(jī)實踐有機(jī)地融為一體,逐步介紹涉及的各項技能,并指導(dǎo)學(xué)員將其融會貫通以真正掌握相關(guān)的基本方法與常用工具。TPS教學(xué)模式多年來在本科、研究生教學(xué)及二十余期培訓(xùn)會議中取得了極佳的教學(xué)效果,受到廣大學(xué)員的一致好評和推崇。主辦單位:北京華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司時間地點:2018年7月12日(周四)報到,7月13日15日授課。南京錦江都城酒店,地址:南京市雨花臺區(qū)安德門大街50號。培訓(xùn)日程(全部課程均含上機(jī)實踐

3、):日期時間授課題目授課內(nèi)容7月12日16:00-21:00報到(外地學(xué)員)7月13日08:00-08:30報到(本地學(xué)員)08:30-09:00預(yù)裝軟件.調(diào)試網(wǎng)絡(luò)09:00-12:00核酸信息注釋l NCBI數(shù)據(jù)庫常用資源:Nucleotide、Gene、Unigene子數(shù)據(jù)庫的功能及信息注釋;常見序列格式的轉(zhuǎn)換。l EBI數(shù)據(jù)庫常用資源:HGNC、Expression Atlas子數(shù)據(jù)庫的功能及信息注釋。l 序列比對工具:局部比對工具BLAST;全局比對工具ClustalX;保守信息圖形化工具Weblogo。14:00-16:00核酸信息注釋l 基因結(jié)構(gòu)注釋在線工具:內(nèi)含子剪切位點、可變剪

4、接、啟動子序列、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點。16:00-18:00蛋白質(zhì)信息注釋l 蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫:UniProt數(shù)據(jù)庫的功能及信息注釋。l 蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫:String數(shù)據(jù)庫的信息注釋。l 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫:PDB數(shù)據(jù)庫的信息注釋。7月14日09:00-12:00非編碼RNA信息注釋及靶基因預(yù)測l miRNA信息注釋及靶基因預(yù)測:miRBase/TargetScan/miRTarBase等數(shù)據(jù)庫l LncRNA信息注釋及靶基因預(yù)測:NONCODE/LNCipedia/lncrnadb等數(shù)據(jù)庫14:00-18:00基因集功能富集分析l Gene Ontology、KEGG pathway數(shù)據(jù)庫的

5、信息注釋l 利用DAVID在線工具富集分析基因集功能l 利用Excel軟件/Venn在線工具繪制基因集功能富集圖及維恩圖(Venn分析)7月15日09:00-12:00基因表達(dá)數(shù)據(jù)處理與分析l 利用ArrayTools軟件處理從NCBI GEO子數(shù)據(jù)庫下載的表達(dá)數(shù)據(jù)l 利用Cluster/Treeview軟件進(jìn)行聚類分析l 基因集共表達(dá)分析14:00-17:00交互作用網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)可視化分析l 利用Cytoscape軟件進(jìn)行關(guān)聯(lián)基因注釋及其交互關(guān)系、分子間相互作用及基因表達(dá)的可視化分析。具體事宜:1、培訓(xùn)期間提供午餐,晚餐自理。2、上機(jī)實踐需自帶筆記本電腦,會場將布置充足的電源插座。請確保電腦配置

6、無線網(wǎng)卡,操作系統(tǒng)為Win XP/ 7/ 8/ 10,而非Mac系統(tǒng)或上網(wǎng)本(個別軟件不能運行)。3、會場除正常無線wifi覆蓋外,將單獨鋪設(shè)網(wǎng)線以保證上網(wǎng)條件。盡管如此,為提高上網(wǎng)效率,建議學(xué)員自行攜帶4G無線上網(wǎng)卡。4、授課幻燈PDF版、軟件(附帶安裝指南)及上機(jī)實踐文檔已上傳至百度網(wǎng)盤,在報到通知中會告知登錄名及密碼。軟件請事先下載并安裝,如安裝有問題,請咨詢客服或提前到達(dá)會場咨詢。5、嚴(yán)格按照培訓(xùn)日程授課,最后一天(7月15日)下午仍有重要課程,外地學(xué)員需合理安排返程時間。6、住宿統(tǒng)一安排在南京錦江都城酒店(南京南站店),主辦單位可為學(xué)員代訂房間,標(biāo)準(zhǔn)間單住380元/人、合住190元/

7、人(含早餐),費用自理;學(xué)員也可自行上網(wǎng)預(yù)訂。住宿費發(fā)票在退房時由酒店開具。對于需要合住的學(xué)員,會務(wù)組將按報到先后順序安排,最后出現(xiàn)單人無法安排的情況,需要自補房間差價。注冊費用:2800元/人,同一單位三人以上2600元/人。授課期間發(fā)放紙質(zhì)邀請函(蓋章)和發(fā)票。按繳費先后順序確定座位號。繳費方式:賬戶名稱:北京華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司 賬戶號:0200245009200091577開戶行:中國工商銀行北京豐益橋支行 匯款用途處寫明:生物數(shù)據(jù)分析+姓名或報到當(dāng)天現(xiàn)金(或刷卡)支付。報名咨詢: 聯(lián)系人:章老師手機(jī)號-mail:Huasitai如您或您的學(xué)生計劃參加請?zhí)顚憟竺聿⒂趫蟮角鞍l(fā)送至聯(lián)系人E-mail。為確保您已報名成功,請之后來電或者發(fā)短信予以確認(rèn)。如有疑問,歡迎垂詢!"-生物數(shù)據(jù)分析技能實訓(xùn)會報名表地點:南京錦江都城酒店時間:2018年7月12日-15日請用“”代替“”單位名稱郵編單位地址姓名性別職稱/職務(wù)手機(jī)常用郵箱發(fā)票抬頭納稅人識別號發(fā)票內(nèi)容會議費 會務(wù)費 其他(請注明):注冊費大寫: 萬 千 百 十元整小寫: (不含住宿費)是否代定住宿是否雙人間:培訓(xùn)人員優(yōu)惠價190元/天/人。單人間:培訓(xùn)人員優(yōu)惠價380元/天/

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