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1、第十一章第十一章 遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)第一節(jié)第一節(jié) DNA的結(jié)構(gòu)的結(jié)構(gòu)一、DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)二、其它的DNA構(gòu)型A型:在高鹽溶液或脫水狀態(tài)、RNA-RNA、DNA-RNA分子。旋轉(zhuǎn)一圈11個(gè)bp,每一螺旋高28.2。Z型:左旋DNA,存在于富含G-C的區(qū)域。 直徑18 ,旋轉(zhuǎn)一圈12個(gè)bp,每一螺旋高44.52。C、D及E型DNA:只在實(shí)驗(yàn)室條件下存在。form conditionBase turnRat pairHeight pairdiameter Brh9295低Na+ 10 36 3.38 19 Arh75,高Na+RNA-DNA 11 32.72.56 23 Cr
2、h66, Li+ 9.3338.6 3.32 19 D 不含G 8 E 不含G 7.5 Z富含G-C高K+ 12 30 3.71 18 計(jì)算機(jī)模擬DNA構(gòu)型BAZ第二節(jié) DNA重復(fù)序列真核基因組中編碼蛋白質(zhì)的序列大概只占0.5%5%。有大量的非編碼序列,這種現(xiàn)象稱DNA冗余現(xiàn)象。非編碼蛋白質(zhì)的序列重要有: tDNA、rDNA假基因(pseudogene)重復(fù)序列(repetitive sequence)基因間的間隔順序(spacer sequence)內(nèi)含子(intron)調(diào)控序列一、DNA的變性和復(fù)性變性(denaturation):也叫融解(melting),指在溫度、pH等因素作用下,D
3、NA分子的氫鍵受到破壞,雙鏈分開的過程。(GC)%=(Tm 69.3) x 2.49(1xSSC) 復(fù)性(renaturation):也叫退火(annealing),是變性的逆過程,DNA互補(bǔ)配對成為雙鏈的過程。DNA復(fù)性的快慢主要與三個(gè)因素有關(guān):1. DNA分子的大?。悍肿釉酱髲?fù)性越慢,所以原核生物DNA的復(fù)性比真核DNA快。2.DNA的復(fù)雜程度:分子越復(fù)雜復(fù)性越慢2. 。 DNA濃度:二級反應(yīng)方程 c 1 co:開始時(shí)單鏈DNA的濃度 = co 1+ kcot c:時(shí)間為t時(shí)單鏈DNA的濃度 k:反應(yīng)速度常數(shù) t:反應(yīng)時(shí)間將c/co對cot作圖,可得一S型曲線。DNA分子復(fù)雜程度及大小總D
4、NA的復(fù)性人總DNA的復(fù)性:20%30%50%二、DNA的重復(fù)序列(repetitive sequence)基因組DNA根據(jù)在基因組中拷貝數(shù)的多寡,可分為:單拷貝序列:約占基因組的4070%。少量重復(fù)序列:10拷貝以下,約占10%,主要是一些重復(fù)基因。中度重復(fù)序列:在10105拷貝,約占基因組的10%40%。可分為順向重復(fù)序列(directed sequence DR)和反向重復(fù)序列(inverted sequence IR)。高度重復(fù)序列:在105106拷貝,約占基因組的10%20%,主要是所謂的衛(wèi)星DNA。1.Alu順序,也稱Alu家族(family):是一種中度重復(fù)序列,長度300bp,
5、屬短順序型(指長度在10300bp以下),在人基因組中占5%6%,重復(fù)次數(shù)達(dá)300kc500kc,散在分布于整個(gè)基因組。300bp的Alu順序有一個(gè)Alu I的酶切位點(diǎn),被切為130bp及170bp,故名Alu順序。Alu成員有80%88%順序相同。Alu順序的兩側(cè)有710bp的DR,可以轉(zhuǎn)位(座),是靈長類兩類高拷貝的轉(zhuǎn)座因子之一(另一類為Li轉(zhuǎn)座因子)。人與嚙齒類動物有70%80%的同源性。2.Kpn順序,也稱Kpn家族:僅次于Alu的第二大家族,長度6.4kb,拷貝數(shù)3kc4.8kc,占基因組的3%6%??杀籏pn I切成四個(gè)段(1.2,1.5,1.8,1.9)。3.衛(wèi)星(satellite)DNA,也稱隨體DNA:長度僅在幾個(gè)到十幾個(gè)核苷酸,重復(fù)次數(shù)達(dá)100kc1000kc。真核細(xì)胞DNA中G+C的含量在30%50%之間,但有些DNA片段G+C含量卻特別高或特別第,因此在密度梯度離心的密度曲線中在主帶DNA的前或后出現(xiàn),因此稱衛(wèi)星DNA。中的衛(wèi)星DNA只在人、豚鼠等少數(shù)生物中出現(xiàn),更多的生物只有輕的衛(wèi)星DNA。例如果蠅的衛(wèi)星DNA:I型:ACAAACTII型:ATAAACTIII型:ACAAATT衛(wèi)星DNA主要存在于異染色質(zhì)區(qū),在染色體的配對、分離
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