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文檔簡(jiǎn)介
1、蛋白免疫印跡雜交(WesternBlot,WB)WB是將蛋白樣本通過(guò)聚丙烯酰胺電泳按分子量大小分離,再轉(zhuǎn)移到雜交膜上,然后通過(guò)一抗/二抗復(fù)合物對(duì)靶蛋白進(jìn)行特異性檢測(cè)的方法。WB是進(jìn)行微量蛋白質(zhì)分析比較成熟的技術(shù)之一。以下是總結(jié)WesternBlot操作方法及常見(jiàn)問(wèn)題分析,有助于成功完成WBoA第一部分:蛋白樣本提取制備蛋白樣品制備是WesternBlotting的第一步,更是決定WB成敗的關(guān)鍵步驟,總體原則和注意事項(xiàng):1 .盡可能提取完全或降低樣本復(fù)雜度只集中于提取目的蛋白(通過(guò)采用不同提取方法或選擇不同的試劑盒產(chǎn)品);2 .保持蛋白處于溶解狀態(tài)(通過(guò)裂解液的pH、鹽濃度、表面活性劑、還原劑等
2、的選擇);3 .提取過(guò)程防止蛋白降解、聚集、沉淀、修飾等,(低溫操作,加入合適的蛋白酶和磷酸酶抑制劑);4 .盡量去除核酸,多糖,脂類等干擾分子(通過(guò)加入核酸酶或采取不同提取策略);5 .樣品分裝,長(zhǎng)期于-80C中保存,避免反復(fù)凍融。方法的選擇自行配制抽提試劑,根據(jù)文獻(xiàn)方法或經(jīng)驗(yàn)提取購(gòu)買商品化試劑盒,按其說(shuō)明書的方法提取Example1:實(shí)驗(yàn)中提取腎臟總蛋白,具體實(shí)驗(yàn)過(guò)程如下:1 .提前一天4c解凍RIPA,一定要完全融化;配PBS(用于細(xì)胞試驗(yàn)則需高壓);2 .配制裂解液:PMSF:RIPA=1:99,PMSF終濃度為100mM(根據(jù)樣本數(shù)配制所需的量,臨用臨配);3 .裂解組織:每個(gè)樣品稱
3、取100mg,加1ml裂解液,勻漿后4c靜置2h使其充分裂解,14000g,4c離心10min,取上清。4 .蛋白定量:取少量上清稀釋30倍蛋白定量,然后計(jì)算出各樣本原液蛋白濃度。注意由于裂解液里含有較高濃度的洗滌劑,蛋白定量不能選用Bradford法,可以選用改良的Lowry's法或者BCA法。5 .樣品蛋白濃度均一化:根據(jù)蛋白定量計(jì)算的結(jié)果將各樣品蛋白濃度調(diào)整一致。具體方法為加入PBS稀釋至樣品濃度一致,本次蛋白濃度為3mg/ml。6 .分裝并存于-80C,避免反復(fù)凍融。第二部分:相關(guān)試劑的配制:1. 10%的SDS(戴口罩稱?。悍Q取SDS10g,先加雙蒸水80ml,再用磁力加熱
4、攪拌助溶,然后定容至100ml。室溫保存,如在長(zhǎng)期保存中出現(xiàn)沉淀,可在50c水浴溶化后,仍可使用。2. 1.5MTris/HCL(pH8.8)Trisbase18.17g溶解于80ml雙蒸水,用濃鹽酸調(diào)pH至8.8,最后定容至100ml,室溫下保存。3. 0.5MTris/HCL(pH6.8)Trisbase6.06g溶解于80ml雙蒸水,用濃鹽酸調(diào)pH至6.8,最后定容至100ml,室溫下保存。4. 30%丙烯酰胺/0.8%N,N'-亞甲丙烯酰胺丙烯酰胺(Acr)75g甲叉雙丙烯酰胺2g加雙蒸水150ml,37c加熱溶解后,定容至250ml,查證該溶液pH應(yīng)不大于7.0,4c棕色瓶保
5、存。使用時(shí)恢復(fù)至室溫且無(wú)沉淀。Becareful!:丙烯酰胺具有很強(qiáng)的神經(jīng)毒性并可通過(guò)皮膚吸收,具作用具有累積性。稱量丙烯酰胺和N,N'-亞甲丙烯酰胺時(shí)應(yīng)戴手套和口罩??烧J(rèn)為聚丙烯酰胺無(wú)毒,但也應(yīng)謹(jǐn)慎操作,因?yàn)樗€可能含有少量未聚合材料。5. 上樣緩沖液0.5mMTrisbase(pH6.8)2.5ml甘油2.0ml10%SDS4.0ml0.4%澳酚藍(lán)(mw669.97)1ml二琉基乙醇(mw78.14)0.5ml注:配好后分裝-20C保存。6. 電泳緩沖液10倍儲(chǔ)存液1倍應(yīng)用液Trisbase30g3g甘氨酸144g14.4gSDS10g1g加水至1000ml,PH值用HCl調(diào)8.3
6、。已經(jīng)配制了1000ml的儲(chǔ)存液。電泳緩沖液用應(yīng)老師的電泳槽應(yīng)用液300ml0用10倍的儲(chǔ)存液30ml加入水270ml。7.轉(zhuǎn)移緩沖液(臨用臨配,鐵盒子里攪拌混勻并4c預(yù)冷):Trisbase甘氨酸H2O(ml)甲醇(ml)終體積(ml)0.606g2.88g160402002.424g11.52g6401608002板膠轉(zhuǎn)移緩沖液的用量約為200ml。8 .洗滌緩沖液(TBS)10倍儲(chǔ)存液1倍應(yīng)用液Trisbase24.2g2.42gNaCl80g8g加水800ml,用HCL調(diào)整PH為7.6,再加水至1000ml,已經(jīng)配制了1000ml的TBS液,臨用時(shí)再加0.1%的Tween-20。一般做
7、兩板膠要用洗滌緩沖液500ml;用儲(chǔ)存液50ml力口入450ml水,后加0.5mlTween-20。9 .封閉緩沖液(5%脫脂奶粉)一10ml/膜脫脂奶粉2g洗滌緩沖液40ml兩板膠4張膜要用封閉緩沖液40ml0具體實(shí)驗(yàn)步驟:準(zhǔn)備:準(zhǔn)備器材:10%過(guò)硫酸錢;冰盒;預(yù)熱恒溫加熱器;拿出試劑(雙丙和TEMED提前從冰箱拿出平衡,否則凝膠過(guò)程產(chǎn)生的熱量會(huì)使低溫時(shí)溶解于儲(chǔ)存液中的氣體析出而導(dǎo)致氣泡);電泳儀器;洗干凈的板子和梳子;濾紙條用于吸水;剪刀;尺子;剪好的膜(根據(jù)目的蛋白分子量以及樣品個(gè)數(shù)決定)及比膜稍大些的干凈濾紙;脫脂奶粉;干凈的裝封閉液的容器約50ml大小;提前清洗玻璃板并晾干:注意不要
8、用清潔球之類的粗糙物品清洗玻璃板,可用洗潔精泡約2h,用自來(lái)水沖洗后再用蒸儲(chǔ)水沖洗干凈,置于架子上晾干。做膠分離膠:1.先稱取過(guò)硫酸胺,配兩板膠用10%的過(guò)硫酸胺150人一股要稱取過(guò)硫酸胺0.2-0.3mg,溶解到相應(yīng)量的雙蒸水中,混勻。分離膠(括號(hào)里為2板膠的用量)(ml)7.5%10%12%15%水(ml)4.9(7.35)4.1(6.15)3.4(5.1)2.4(3.6)1.5MTris/HCl2.5(3.75)2.5(3.75)2.5(3.75)2.5(3.75)(pH=8.8)丙/雙丙烯酰胺2.5(3.75)3.3(4.95)4.0(6.0)5.0(7.5)10%SDS100,(15
9、0)100,(150)100,(150)100,(150)10%過(guò)硫錢50,7550,7550,7550,75(力TEMED10,1510,1510,1510,15適用蛋白分子:量>100kDa60-100kDa20-60kDa<20kDa玻板間夾上膠條,用夾子將兩塊玻板夾緊。按以上方法配膠,加入TEMED后立即搖勻即可灌膠。灌膠時(shí),可用10ml槍吸取5ml膠沿玻璃放出,將膠加入到玻璃板的夾層中。加入的量略高于夾子的最高處(或者膠面開(kāi)到綠帶中間線高度時(shí)即可)加好后加入1ml的水壓膠。做分離膠時(shí),凝固時(shí)間大約為25-40分鐘,要根據(jù)溫度來(lái)確定。一般可以依據(jù)剩下在離心管中的膠的凝固情況
10、來(lái)確定膠的凝固。當(dāng)水和膠之間有一條折射線時(shí),說(shuō)明膠已凝了。冉等3min使膠充分凝固就可倒去膠上層水并用吸水紙將水吸干。注意:舊的1.0mm的板子短的玻璃在里面,新的在外面。過(guò)硫酸錢一般現(xiàn)配現(xiàn)用。注意各種試劑加入的順序,“三大三小”,后面加過(guò)硫酸錢,最后加TEMED。配制過(guò)程中每加入一種試劑要充分混勻,防止膠出現(xiàn)濃度不均的情況。要根據(jù)溫度調(diào)整TEMED的使用量。夏天凝結(jié)的快,冬天凝結(jié)的慢。冬天如果凝結(jié)的慢,兩板膠可以加TEMED20-3CU1。水封的時(shí)候水要慢慢加入,太快會(huì)導(dǎo)致膠面不平,封膠后切記勿動(dòng)。膠通常在0.51h內(nèi)凝集最好,過(guò)快膠太硬易龜裂,而且電泳時(shí)容易燒膠。下一步實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備a準(zhǔn)備樣品:
11、1. 預(yù)熱微量恒溫器(98C);2. 準(zhǔn)備一套中EP管并標(biāo)記,以用于混勻樣品和上樣緩沖液;3. 取出樣品,marker,上樣緩沖液置于冰上;4. 樣品:上樣緩沖液=3:1混勻,置于微量恒溫器上98C5min變性;b配制電泳緩沖液;c配4%濃縮膠,TEMED臨用時(shí)加濃縮膠(括號(hào)里為2板膠用量)3.00ml(4.5ml)0.5MTris/HCl(PH=6.8)丙/雙丙烯酰胺(30%/0.8%)10%SDS過(guò)硫酸胺(10%)TEMED1.25ml(1.875ml)0.67ml(1.005ml)50J(75山50d(75山5d(15山膠凝固后,迅速向上將梳子拔下,將玻璃板夾上電泳架,完整的玻璃板在外圍
12、。電泳槽中倒入電泳緩沖液(約300ml)。加足夠的電泳液后開(kāi)始準(zhǔn)備上樣。(電泳液至少要漫過(guò)內(nèi)側(cè)的小玻璃板)。注意:濃縮膠的加入很重要,由于其硬度比分離膠小,而且還要加入梳子,掌握其凝固的時(shí)機(jī)很重要。太遲膠要粘住梳子,太早膠凝固不好。用Bio-Rad的玻璃板用TEMED15也在溫度為22c時(shí)凝固的時(shí)間為10分鐘左右,溫度再高一些可以達(dá)到89分鐘,低一些可以延長(zhǎng)一些。膠的凝固很快,主要是加入TEMED后的動(dòng)作要迅速,以免在離心管中凝固了。加入的量要與玻璃板的最高線平行。灌膠時(shí)也要使膠沿玻璃板流下以免膠中有氣泡產(chǎn)生。插梳子時(shí)要使梳子保持水平。由于膠凝固時(shí)體積會(huì)收縮減小,從而使加樣孔的上樣體積減小,所
13、以在濃縮膠凝固的過(guò)程中要經(jīng)常在兩邊補(bǔ)膠(其實(shí)說(shuō)經(jīng)常有點(diǎn)過(guò)了,補(bǔ)12次就行了,不補(bǔ)膠問(wèn)題也不大)。待到濃縮膠凝固后,兩手分別捏住梳子的兩邊豎直向上輕輕將其拔出。插梳子要用力均勻,一次成型,且要注意梳子插入時(shí)哪面朝內(nèi)哪面朝外。加樣(加變性后的樣品):用微量進(jìn)樣器或加樣吸頭吸入樣品20d,加入到加樣孔中。用微量進(jìn)樣器貼壁吸取樣品,將樣品吸出時(shí)不要吸進(jìn)氣泡。將加樣器針頭插至加樣孔中緩慢加入樣品。(加樣太快可使樣品沖出加樣孔,若有氣泡也可能使樣品溢出。)加入下一個(gè)樣品時(shí),進(jìn)樣器需在外槽電泳緩沖液中洗滌3次,以免交叉污染。在第一孔和最后一孔加20M上樣緩沖液以避免邊緣效應(yīng),第二孔加3Mmarker,其他孔
14、加20M樣品(樣品加樣20-303都可以,但不超過(guò)30川加樣量取決于蛋白濃度),保證每個(gè)上樣孔蛋白濃量為30-50go電泳:100V,電泳2小時(shí),電泳時(shí)要注意電泳槽上的電泳緩沖液的量,較少時(shí),要從下槽中吸取一部分轉(zhuǎn)移到上槽。有時(shí)電泳的時(shí)間用不到2小時(shí),要依據(jù)澳酚藍(lán)的位置確定是否要停止電泳。通常電泳時(shí)澳酚藍(lán)到達(dá)膠的底端處附近即可停止電泳。轉(zhuǎn)膜:蛋白因結(jié)合SDS而帶電荷,在電場(chǎng)下從膠中轉(zhuǎn)至膜上,轉(zhuǎn)膜操作根據(jù)電轉(zhuǎn)儀制造商的說(shuō)明書進(jìn)行轉(zhuǎn)股方式分為半干和濕轉(zhuǎn)兩種,半干式轉(zhuǎn)膜速度快,而濕式成功率高并特別適合用于分子量大于100kDa的蛋白。要先將玻璃板撬掉才可剝膠,撬的時(shí)候動(dòng)作要輕,要在兩個(gè)邊上輕輕的反復(fù)
15、撬。撬一會(huì)兒玻璃板便開(kāi)始松動(dòng),直到撬去玻板。(撬時(shí)一定要小心,膠很易裂,要用巧勁)除去小玻璃板后,將濃縮膠輕輕刮去(濃縮膠影響操作),要避免把分離膠刮破。小心剝下分離膠蓋于濾紙上,用手調(diào)整使其與濾紙對(duì)齊,輕輕用玻棒搟去氣泡。將膜蓋于膠上,要蓋滿整個(gè)膠,(膜蓋下后不可再移動(dòng))并去除氣泡。準(zhǔn)備:1 .電泳期間,剪好濾紙和膜,寬度由marker及目的蛋白分子量確定,長(zhǎng)由加樣孔數(shù)決定;2 .配置轉(zhuǎn)膜緩沖液并預(yù)冷;3 .PVDF膜用甲醇活化(目的是為了活化PVDF膜上面的正電基團(tuán),使它更容易跟帶負(fù)電的蛋白質(zhì)結(jié)合,做小分子的蛋白轉(zhuǎn)移時(shí)多加甲醇也是這個(gè)目的)。半干法轉(zhuǎn)膜:電泳完畢后,用卡片從一角的縫隙撬下一
16、塊玻璃板,注意用力適度,用刀將沒(méi)用的膠切除:濃縮膠,加樣孔以外的膠,和澳酚藍(lán)下方的膠。先將PVDF膜和海綿泡在轉(zhuǎn)移緩沖液中,將PVDF膜做好標(biāo)記:剪刀剪下其一邊的兩角,一大,一小。將上述東西置于半干轉(zhuǎn)膜儀器上,“三明治”從下往上的順序依次是:(-)濾紙-膠-膜-濾紙(+)。用電轉(zhuǎn)緩沖液稍微潤(rùn)濕,轉(zhuǎn)膜100mA1.5h0注意防止轉(zhuǎn)膜時(shí)電源插反。濕法轉(zhuǎn)膜:“三明治”從下往上的順序依次為:(一)海綿-濾紙-膠-膜-濾紙-海綿(+),三明治安放的方向確認(rèn)正確,負(fù)極方為帶負(fù)電的膠里的蛋白,向正極方(膜)的電遷移。100mA轉(zhuǎn)膜一個(gè)半小時(shí)即可。火的黑面對(duì)槽的黑面,夾的白面對(duì)槽的紅面。電轉(zhuǎn)移時(shí)會(huì)產(chǎn)熱,在槽的
17、一邊放一塊冰來(lái)降溫。蛋白帶負(fù)電,膜要靠近正極CathodeAlterpaperGetMemtraneHrtsrpapefAnode注意:1 .避免用手直接接觸膜,應(yīng)使用銀子,手指上的油脂與蛋白會(huì)封閉轉(zhuǎn)膜效率并易產(chǎn)生背景污斑;2 .用卡片把玻板撬開(kāi)時(shí)注意用力要輕以免損壞玻板;3 .把膠從玻板上剝離時(shí)要保持膠的完整性,以及膠和膜之間不能有氣泡。若有氣泡則可用小玻棒輕輕滾下趕走氣泡;4 .濾紙膠膜之間的大小,一般是濾紙封膜方膠。5 .轉(zhuǎn)膜前要在轉(zhuǎn)膜緩沖液里平衡一下防止膠變形,也有助于進(jìn)一步去掉可能有礙于轉(zhuǎn)膜的雜質(zhì)。還有人在這一步浸泡幫助蛋白復(fù)性,可以直接在膠上檢測(cè)蛋白活性。封閉:轉(zhuǎn)膜完成后,將膜從轉(zhuǎn)
18、膜夾中取下,將膜用TBS從下向上浸濕后,移至含有封閉液的平皿中,室溫下脫色搖床上搖動(dòng)封閉1h。注意要將貼膠的一面朝上(正面)的放在封閉盒子中,加入封閉液。4c過(guò)夜。注意:如果選用AP作為顯色方法,封閉時(shí)就要選擇Tris緩沖系統(tǒng),不要用PBS,因?yàn)镻BS滋擾AP洗脫(10mim/次,洗脫3次):第二天,將封閉液倒掉,加入洗脫緩沖液,室溫下?lián)u10分鐘,倒掉;再加入洗脫緩沖液,室溫下?lián)u10分鐘,倒掉;加入洗脫緩沖液,搖10分鐘,倒掉。一抗孵育:準(zhǔn)備:拿出配制抗體的新管子并標(biāo)記(抗體名稱,稀釋比例,配制日期及所有人);抗體的稀釋:用洗脫緩沖液稀釋eg.1:200,則10d加2ml洗脫緩沖液;一抗原液用
19、之前要12000rpm離心20s或者用手輕彈使蛋白混勻。步驟:加入一抗每小盒2ml(皿用5ml),室溫下?lián)u動(dòng)孵育2小時(shí)。2h后回收一抗。洗脫:步驟同前(10mim/次,洗脫3次)。二抗孵育:準(zhǔn)備:拿出配制抗體的新管子并標(biāo)記(抗體名稱,稀釋比例,配制日期及所有人);二抗的稀釋直接依照稀釋倍數(shù)用洗脫液稀釋;二抗原液用之前要12000rpm離心20s或者用手輕彈使蛋白混勻。步驟:2小時(shí)加入二抗每小盒2ml(皿用5ml),室溫下?lián)u動(dòng)孵育1h后回收二抗。洗脫:步驟同前(10mim/次,洗脫3次),注意洗第三遍后,不要立即將洗脫緩沖液倒掉。顯影:辣根過(guò)氧化物酶HRP-ECL發(fā)光法:1)配置顯影液:2張膜配
20、A和B液各700d并混勻。2)準(zhǔn)備U盤或者刻錄盤,1000槍,槍頭,籃子,方蓋子,銀子,濾紙,1.5EP管,顯影液。3)將膜從盒中夾出,濾紙貼角吸干,正面朝上平整的放在方蓋子里,將顯影劑用槍打到膜上,盡量不要讓膜在盒子里挪動(dòng),均勻的在膜上澆顯影液35min,倒掉顯影液,并用濾紙拭干周圍。4)把膜放入機(jī)器(正面朝上),打開(kāi)電腦,snap軟件,此時(shí)再推進(jìn)機(jī)器,按鈕變成藍(lán)色,界面中間部分有2個(gè)圖標(biāo),左邊為單個(gè)拍照,時(shí)間在其下調(diào)試;另一個(gè)為連續(xù)拍照,點(diǎn)擊圖標(biāo)后輸入曝光時(shí)間(推薦30s,可跟據(jù)試劑情況延長(zhǎng)到幾分鐘),3次即可,顯影后,另存為As,再保存張exportasTIFF格式。AP-NBT/BIC
21、P顯色法:原理:本試劑盒采用BCIP和NBT為底物,可由標(biāo)記于二抗上的AP催化,產(chǎn)生化學(xué)顯色反應(yīng),在蛋白轉(zhuǎn)印膜陽(yáng)性蛋白條帶處形成藍(lán)紫色沉淀,適用于使用AP標(biāo)記抗體的Westernblot。與化學(xué)發(fā)光類試劑相比,本產(chǎn)品使用方便,可快速獲得結(jié)果;但檢測(cè)靈敏度不及化學(xué)發(fā)光類試劑。使用方法:用平頭銀子將膜取出,膜的下緣輕輕接觸吸水紙,去除膜上多余的漂洗液;正面朝上平整的放在干凈的方蓋子上,將顯影劑用槍均勻澆到膜上,盡量不要讓膜在盒子里挪動(dòng),并用不透明物體(如報(bào)紙)遮擋光線,室溫孵育515min,顯色20s后每10s觀察一次,至條帶明顯或有本底出現(xiàn)時(shí)用蒸儲(chǔ)水洗滌12次即可終止顯色反應(yīng),放濾紙上晾干即可觀
22、察與掃描。過(guò)程中常見(jiàn)的問(wèn)題及可能原因分析問(wèn)題可能原因驗(yàn)證或解決辦法轉(zhuǎn)股不充分膜沒(méi)有完全均勻濕透使用100%methanol浸透膜靶蛋白分子量小于10,000選擇小孔徑的膜,縮短轉(zhuǎn)移時(shí)間靶蛋白等電點(diǎn)等于或接近轉(zhuǎn)移緩沖液pH值可嘗試使用其他緩沖液如CAPSS沖液(pH10.5)或使用低pH值緩沖液如乙酸緩沖液甲醇濃度過(guò)高過(guò)高甲醇濃度會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)與SD的離,從而沉淀在凝膠中,同時(shí)會(huì)使凝膠收縮或父硬,從“抑制局分子事蛋白的轉(zhuǎn)移。降低甲醇濃度或者使用乙醇或異丙醇代替轉(zhuǎn)移時(shí)間/、夠Thickgel對(duì)于厚的膠以及高分子量蛋白需要延長(zhǎng)轉(zhuǎn)移時(shí)間背景高膜沒(méi)有完全均勻濕透使用100%methanol浸透膜洗膜不充分增加洗液體積和洗滌次數(shù)1阻斷/、充分增加封閉液孵育時(shí)間,或者提高溫度。選擇合適的封閉試劑(脫脂奶粉,BSA酪蛋白等)二抗?jié)舛冗^(guò)高降低二抗?jié)舛葯z測(cè)過(guò)程中膜干燥保證充分的反應(yīng)液,避免出現(xiàn)干膜現(xiàn)象曝光過(guò)度縮短曝光時(shí)間抗體與阻斷蛋白肩交叉反應(yīng)檢測(cè)抗體與阻斷蛋白的交叉反應(yīng)性,選擇無(wú)交叉反應(yīng)的封閉劑。洗滌液中加入Tween-20可減少交叉反應(yīng)沒(méi)有陽(yáng)性條帶抗體染色/、充分酶
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