中醫(yī)藥信息學方法與科技創(chuàng)新重要知識點總結(jié)_第1頁
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文檔簡介

1、中醫(yī)藥信息技術(shù)重點內(nèi)容詳解中醫(yī)藥信息是否依賴于人而存在?由于世界是有物質(zhì)、能量和信息組成。傳統(tǒng)的中醫(yī)藥學因產(chǎn)生時條件的限制, 無法深入研究物質(zhì)和能量,其所研究的對象就是信息,并且是認識論信息。中醫(yī) 藥學的知識是由人類發(fā)現(xiàn)、積累的,中醫(yī)藥信息是在中醫(yī)藥領(lǐng)域中存在的信息, 中醫(yī)藥信息,中醫(yī)藥信息是依賴于人類的智慧而存在的,所以中醫(yī)藥信息是是一 種認識論信息。而中醫(yī)藥信息是在中醫(yī)實踐過程中,醫(yī)者作為主體對開放環(huán)境中 所觀察對象狀態(tài)的一種體驗。這種體驗所得到的的信息具有明顯的主客融合的特 征,所以中醫(yī)藥信息一定是認知論信息。由此可見,中醫(yī)藥信息是依賴于人而存 在的。中醫(yī)藥信息的特點是什么?整體信息:中

2、醫(yī)藥信息是完全開放狀態(tài)下,人體與自然、社會交流后產(chǎn)生的綜 合狀態(tài),是一種人體自身信息、自然環(huán)境信息與社會環(huán)境信息交叉產(chǎn)生的整體信 息而非部分信息。獲取中醫(yī)藥信息時,不能只獲取局部信息、某一個空間信息, 而是要全部把握一個時間流程或一個循環(huán)的時間信息。認識論信息:中藥信息相對重視主體認識與客體信息融合后包括觀察在內(nèi)的體 驗?,F(xiàn)象信息:中醫(yī)藥信息并非單純的本質(zhì)現(xiàn)象,是包括了本質(zhì)在內(nèi)的現(xiàn)象信息。 這種現(xiàn)象信息包括大量穩(wěn)定與不穩(wěn)定關(guān)系的現(xiàn)象變化狀態(tài)與方式。不穩(wěn)定關(guān)系的 獲取是中醫(yī)藥信息獲取的特征,因而在混雜的前提下,能觀察到細微的現(xiàn)象變化。時間信息:中醫(yī)藥信息相對重視體驗對象在時間上延續(xù)變化的狀態(tài)與方

3、式,而 對空間信息的把握略差。從中醫(yī)藥信息的獲取的內(nèi)容上看,獲取的是在客體表現(xiàn) 出來的綜合變化狀態(tài),這種變化狀態(tài)主要是隨著時間的推移產(chǎn)生的,對于空間分 割產(chǎn)生的信息獲取能力相對較弱。大數(shù)據(jù)環(huán)境下中醫(yī)藥數(shù)據(jù)有何特點,及其對中醫(yī)藥療效評價的積極作用是 什么?中醫(yī)藥數(shù)據(jù)特點:關(guān)注整體而非抽樣。中醫(yī)藥信息有著整體信息性,相對重視人體在開放環(huán)境下 的整體變化狀態(tài),以及人體在時間上的延續(xù)變化狀態(tài),而較少進行空間切割。允許數(shù)據(jù)混雜性。中醫(yī)是非完全客觀的概念,是主客融合的產(chǎn)物,辯證具有不 確定性。關(guān)注事物間相關(guān)關(guān)系。對中醫(yī)藥療效評價的積極作用:整體性。除局部病灶療效之外,整體變化狀態(tài)受到更多關(guān)注,這對認識中醫(yī)

4、 藥學所重視的人體整體功能變化及其與周圍環(huán)境和諧性變化具有積極意義?;祀s性:證候及其機體功能的改變、人體感覺變化的改變,產(chǎn)生的療效是一 種的模糊效果,這種在小數(shù)據(jù)處理概念中被判定為不可靠的并非精確的模糊變 化。但中醫(yī)治療中出現(xiàn)的理化指標不變,但感覺改善的情況,也是健康恢復的標相關(guān)性:在大數(shù)據(jù)的概念下,中醫(yī)藥學所重視的相關(guān)關(guān)系得到認可。這種相 關(guān)關(guān)系能夠幫助中醫(yī)藥學發(fā)現(xiàn)機體及其環(huán)境改變導致的穩(wěn)態(tài)與和諧的破壞,以及 這種狀態(tài)的改善。認識活動雙方都具有主體性,是的不僅僅是客觀檢測到的指標, 而且是醫(yī)患雙方的主體感覺都具有重要意義,對于帶病生存具有重要意義。何謂引文分析法?其應(yīng)用領(lǐng)域有哪些?引文分析:

5、利用數(shù)學及統(tǒng)計學的方法和比較、歸納、抽象、概括等邏輯方法,對 科學期刊、論文、著者等各種分析對象的引證與被引證現(xiàn)象進行分析,揭示其中 的數(shù)量特征和內(nèi)在規(guī)律,達到評價、預測科學發(fā)展趨勢的目的。應(yīng)用領(lǐng)域:測定學科的影響和重要性:通過文獻引用頻率的分析研究可以測定某一學科的 影響和某一國家某些學科的重要性。研究學科的結(jié)構(gòu):采用英文聚類分析,通過引文間的網(wǎng)狀關(guān)系,探明有關(guān)學科 間的親緣關(guān)系和結(jié)構(gòu),劃定某學科的作者集體;分析推測學科間的交叉、滲透和 衍生趨勢;還能對某一學科的產(chǎn)生背景、發(fā)展概況、突破性成就、相互滲透和今 后發(fā)展方向進行分析,從而揭示科學的動態(tài)結(jié)構(gòu)和某些發(fā)展規(guī)律。評價人才:在人才評價方面,

6、某著者的論文被引用程度可以是衡量該論文學術(shù) 價值和影響的一種測度,同時,也從科研成果被利用的角度反映了該著者在本學 科領(lǐng)域內(nèi)的影響和地位。中醫(yī)藥知識工程的核心和難點是什么?核心:獲得、存儲與處理中醫(yī)藥經(jīng)驗性知識。難點:中醫(yī)藥領(lǐng)域知識體系具有模糊性、復雜性、多樣性的特點,不利于邏輯推理 和數(shù)據(jù)分析工具的直接應(yīng)用。中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的領(lǐng)域特點和質(zhì)量問題,增加開展知識發(fā)現(xiàn)研究的難度。中醫(yī)藥學的研究對象是人體,是一個開放性的復雜巨系統(tǒng)。尚未建立一套中醫(yī)藥知識發(fā)現(xiàn)結(jié)果的傳播、詮釋和評價機制,導致所獲得知 識不能充分利用。語義網(wǎng)絡(luò)的內(nèi)涵和特點是什么?請簡要說明語義網(wǎng)絡(luò)技術(shù)在UMSl中的應(yīng) 用?內(nèi)涵:自然語言理解的

7、概念,是一種采用網(wǎng)絡(luò)形式表達復雜的概念及概念間相互 關(guān)系的方法。是帶有標記的有向圖,是知識的一種圖解表達,有節(jié)點和弧線/鏈 組成。特點:明確表示出重要的相關(guān)性可以從直接相連的節(jié)點推導出相關(guān)事實,而不必歷遍整個知識庫能夠利用“IS-A”“Subet”鏈在語義網(wǎng)絡(luò)中建立屬性繼承的層次關(guān)系能夠?qū)^承的屬性進行演繹推理能夠利用少量基本概念的記號建立狀態(tài)和動作描述在UMSL中的應(yīng)用:UMLS予以網(wǎng)絡(luò)包括語義類型和語義關(guān)系兩個部分,語義類型是語義網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點, 節(jié)點與節(jié)點之間的關(guān)系即為語義關(guān)系,語義類型和語義關(guān)系構(gòu)成網(wǎng)狀的語義結(jié) 構(gòu)。語義網(wǎng)絡(luò)為超級敘詞表中所有概念提供語義類型和語義關(guān)系,超級敘詞表中 的每一

8、個概念至少被標引一種語義類型。具體而言,語義網(wǎng)絡(luò)包括135種語義類 型和54種語義關(guān)系。語義類型的高層分為“實體”和“事件”兩大類,并有此 層層展開形成樹狀結(jié)構(gòu)。最基本的語義關(guān)系是“isa”關(guān)系,其它53種語義關(guān)系 均為非等級關(guān)系,即相關(guān)關(guān)系。情報學的內(nèi)涵是什么?中醫(yī)藥情報采集的原則和方法各是什么?內(nèi)涵:研究情報的產(chǎn)生、傳遞、利用規(guī)律和用現(xiàn)代化信息技術(shù)與手段使情報流通 過程、情報系統(tǒng)保持最佳效能狀態(tài)的一門科學。它能使人們正確認識情報自身及 其傳播規(guī)律,充分利用信息技術(shù)和手段,提高情報產(chǎn)生、加工、貯存、流通、利 用的效率。原則:先近后遠、先內(nèi)后外、先易后難、先簡后繁、先本專業(yè)后其它專業(yè)。方法:針

9、對研究主題。系統(tǒng)檢索/追溯法/循環(huán)法針對信息的類型和性質(zhì)動態(tài)的公開信息一問卷調(diào)查、參考觀察、專家咨詢靜態(tài)的公開信息一預定米購、信息檢索、日常積累非公開的動態(tài)信息一訪問交談、技術(shù)截獲非公開的靜態(tài)消息一預定索取、委托購買什么是科技查新?科技查新是否就是文獻檢索或?qū)<以u審,請說明理由? 科技查新:科技查新是以文獻為基礎(chǔ),以文獻檢索和情報調(diào)研為手段,以檢出結(jié) 果為依據(jù),通過綜合分析,對查新項目的新穎性進行情報學審查,寫出有依據(jù)、 有分析、有對比、有結(jié)論的查新報告的情報研究工作。以通過檢出文獻的客觀事 實來對項目的新穎性做出結(jié)論。科技查新有別于文獻檢索:科技查新是文獻檢索和情報調(diào)研相結(jié)合的情報研究工作,

10、而文獻檢索是迅速準確 找出與特定的檢索需求相關(guān)的文獻信息的過程??萍疾樾率且钥萍嘉墨I為基礎(chǔ),以文獻檢索和情報調(diào)研為手段,以檢出結(jié)果為依 據(jù),通過綜合分析,對科技項目的新穎性進行情報學審查,寫出有根據(jù)、有分析、 有對比、有結(jié)論的查新報告。科技查新是有別于專家評審:專家評審側(cè)重于對客體或成功的先進性、科學性和實用性作出評價,其中著重于 科學性和實用性的主觀知識審查。而科技查新是以檢出文獻的客觀事實來評價客 體或成果的新穎性,是文獻檢索、情報調(diào)研等方面的結(jié)論,是較系統(tǒng)、較準確的 客觀依據(jù)和情報學評價。查新報告的新穎性及其判斷原則各是什么?新穎性原則:在查新委托之日之前所查項目的科學技術(shù)內(nèi)容部分或全部

11、沒有在國內(nèi)外刊物 中公開發(fā)表過相對變化的概念,是根據(jù)委托人提供的柴新項目的查新點,通過一定范圍的 文獻信息查詢,將檢索結(jié)果與查新項目的查新點對比分析,從而判斷查詢項目的 新穎性。動態(tài)的概念,其變化條件取決于信息采集與分析的查新過程,起決定性作用 的是必須有全面的信息支持和科學的分析方法。新穎性的判斷原則:相同排斥原則:科學技術(shù)領(lǐng)域術(shù)解決手段、預期效果等。單獨對比原則:一個查新點與已公開發(fā)表的一篇文獻的相關(guān)內(nèi)容和技術(shù)要點單獨 對比;非一個查新點與幾篇對比文獻的內(nèi)容或技術(shù)要點組合比較;不要求一片文 獻覆蓋所有查新點。具體(下位)概念否定一般(上位)概念原則:“用鐵制成”,使“用金屬制成 的同一產(chǎn)品

12、”喪失新穎性。突破傳統(tǒng)原則:如數(shù)值范圍。文獻公開時間為先原則:公開時間早的否定公開時間晚的。十.醫(yī)學信息標準分為哪幾類?制定標準的目的和意義是什么?醫(yī)學信息標準分為三類:框架標準、基礎(chǔ)標準、操作標準目的:在一定的范圍內(nèi)后的最佳秩序意義:對現(xiàn)實問題或潛在問題制定共同使用和重復使用的條款的活動。十一.影響因子是評價期刊質(zhì)量的重要指標,請問影響因子是如何計算出來的。影響因子是國際通用的期刊評價指標,影響因子定義為“在兩年時間內(nèi),某一 期刊上發(fā)表的所有文章所引用的總次數(shù)與這兩年內(nèi)該期刊上所發(fā)表的文章數(shù)量 的總和的比值”;簡而言之,期刊的影響因子就是指在二年實現(xiàn)內(nèi)該期刊上所發(fā) 表文章的平均被引用率。計算

13、方法:期刊影響因子=該年引用該刊前兩年論文的總次數(shù)/前兩年該刊所發(fā)表的論文總數(shù)。論文量、時間和被引用次數(shù)是計算影響因子的三個基本要素。十二、目前很多中文數(shù)據(jù)庫都帶有文獻分析功能,請以CNKI為例,說說如何 利用數(shù)據(jù)庫自帶功能進行學術(shù)脈絡(luò)整理。CNKI有強大的對文獻基本信息分析的功能,在基本信息中就包括:作者、 出版年、來源期刊、文獻類型、會議名稱、國家/地區(qū)、基金資助機構(gòu)、授權(quán) 號;團體作者、機構(gòu)、機構(gòu)擴展、語種、WOS學科類別、編者、叢書名稱、研 究方向。在這些基本信息中就可以對文獻的基本信息有大致的掌握,并且在眾 多文獻中選擇符合自己需求的文獻進行閱讀。通過出版年代的分析:了解這一研究領(lǐng)域

14、的發(fā)展趨勢;通過作者分析:發(fā)現(xiàn)這 一研究領(lǐng)域中的核心人員、高產(chǎn)研究者;通過國家/地區(qū)分析:發(fā)現(xiàn)研究領(lǐng)域 的高產(chǎn)國家、進行國家與國家之間對比;通過機構(gòu)分析機構(gòu)分析有利于了解這 一研究領(lǐng)域高產(chǎn)大學或研究所、發(fā)現(xiàn)機構(gòu)與機構(gòu)之間的合作、了解可以深造的 機構(gòu);通過文獻類型分析:有利于對各期刊文獻類型有大致了解;通過基金資 助機構(gòu)分析:有利于了解該領(lǐng)域項目資助情況;通過來源出版物:有利于了解研究領(lǐng)域論文集中發(fā)表的期刊CNKI有引文分析功能:在時間上向前回溯某作者寫作論文引用的參考文 獻或者追蹤該論文發(fā)表后的被引用情況。基于以往的、已知的信息搜尋新的、 未知的信息;追蹤自己或?qū)κ值难芯壳闆r;通過“引文”回溯

15、某個研究的起源; 可以探索研究論文之間的隱藏聯(lián)系。CNKI有被引參考文獻檢索功能:以一篇文章、一個作者、一個期刊、一 篇會議文獻或者一本書作為檢索詞,進行被引文獻的檢索.在不了解關(guān)鍵詞或 者難于限定關(guān)鍵詞的時候,可以從一篇高質(zhì)量的文獻出發(fā),了解課題的全貌。十三、請簡單介紹一下SCI數(shù)據(jù)庫。SCI,全稱 Science Citation Index,是 Web of Science 當中一個子庫,全 球最權(quán)威的自然科學引文數(shù)據(jù)庫。收錄自然科學8200多種國際性、高影響力的 學術(shù)期刊,數(shù)據(jù)最早可以回溯到1900年。創(chuàng)刊于1961年,它是根據(jù)現(xiàn)代情報學 家加菲爾德(Eugene Garfield)

16、1953年提出的引文思想而創(chuàng)立的,SCI是由美 國科學情報所(ISI)出版。SCI有170個學科領(lǐng)域,每周收錄25000多篇文獻,423000篇參考文獻。目前, 被SCI 收錄中醫(yī)期刊有2本Chinese Journal of Integrative Medicine (中國中西醫(yī)結(jié)合雜志)IF: 1.346 (2017)Journal of Traditional Chinese Medicine (中醫(yī)雜志)IF: 0.857 (2017)十四、當檢索獲得文獻太多時,可以用哪些方法來選擇閱讀文獻? 文獻的檢索規(guī)范和準確可以增加文獻的可利用情況。明確主題:確定標題、規(guī)范關(guān)鍵詞和文章年限進行搜

17、索。要檢索精確匹配的短語,注意使用引號。注意不同的拼寫形式,盡量準確。關(guān)閉詞形還原和內(nèi)部同義字查找功能注意通配符、連字號和撇號的使用規(guī)范和注意事項。方法:1選擇高影響力文獻在排序方式中選擇被引頻次(降序),在信息欄了解題名、 作者、期刊信息、關(guān)鍵詞、作者信息等,通過參考文獻了解相關(guān)文獻的前序研究 ;查看Related Records;三維度檢索-把握課題脈絡(luò);查找ESI高水平論文。選擇最新發(fā)表的文獻排序方式查找出版日期(降序),找文獻級別用量指標。選擇相關(guān)領(lǐng)域的論文在 Web of science中精確學科類別選擇綜述文獻在文獻類型中選擇Reviewo一、標書撰寫:未有指定選題的前提下,請闡述

18、你的選題思路問題發(fā)現(xiàn):提出問題往往比解決問題重要。在科研學習中,可以根據(jù)導師現(xiàn) 研究方向,以及師兄師姐的畢業(yè)課題,在平時的實驗或文獻閱讀中發(fā)現(xiàn)疑惑或 感興趣的點。同時,也需要了解和掌握項目資助部門的申報指南,根據(jù)資助范 圍要求、研究類型要求更能幫助我們發(fā)現(xiàn)更合適的課題。文獻與實地調(diào)研:在上一步確定大概方向以后,就可就提出的問題確定大致 方向,并就簡單的方向查閱相關(guān)文獻,深化對相關(guān)領(lǐng)域的認識,并就提出問題 的可行性進行檢驗。檢索歷年課題研究和資助情況,對選題有個更深更全面的 認識。提出選題:選題不宜過寬過大,符合需要性、創(chuàng)新性、科學性、可行性等選 題原則。并就選題向?qū)熯M行審閱或者討論,更能提高

19、選題的正確性。選題論證與確定:在經(jīng)過大量的相關(guān)領(lǐng)域了解以及相關(guān)人士的意見后,就 可以確定選題了。二、綜述:請闡述綜述的選題原則。結(jié)合所學知識選自己專長的或有基礎(chǔ)的題目,否則難以寫出水平較高的綜述。根據(jù)所占有文獻資料的質(zhì)和量選題。選題一定要能反映出新的學科矛盾的焦點、新成果、新動向。題目不宜過大、范圍不宜過寬。這樣查閱文獻的數(shù)量相對較小,撰寫時易于 歸納整理,否則,題目選得過大,查閱文獻花費的時間太多,影響實習,而且歸 納整理困難,最后寫出的綜述大題小作或是文不對題。機構(gòu)A欲研發(fā)一種具有糖尿病治療功效的藥物,應(yīng)如何進行專利檢索與分析, 以了解目前相關(guān)技術(shù)的研究現(xiàn)狀與競爭情況。(請列出專利檢索分析

20、項目及可 得出結(jié)論,如:統(tǒng)計申請日期f年度申請量f年度申請變化趨勢)專利檢索:首先打開中華人民共和國國家知識產(chǎn)權(quán)局(SIPO)-在菜單欄中 選擇公共服務(wù)T專檢索查詢T專利檢索與分析系統(tǒng)一常規(guī)檢索T在發(fā)明名稱中 輸入糖尿病治療藥物-有187條搜索結(jié)果專利信息分析:看檢索結(jié)果統(tǒng)計的內(nèi)容申請人統(tǒng)計:中國科學院上海藥物研究所和廈門賽諾邦生物科技股份有限公 司在糖尿病治療藥物方面都有五項專利,說明在糖尿病治療藥物研究上這兩所 有比較熟悉。其次還有復旦大學、浙江工業(yè)大學、浙江大學都有專利項目。發(fā)明人統(tǒng)計:翁文貴、劉超、閆肅都有七次發(fā)明人統(tǒng)計,這三人都來自廈門 賽諾邦生物科技股份有限公司。技術(shù)領(lǐng)域統(tǒng)計:A6

21、1P3/10技術(shù)領(lǐng)域占129篇。申請日統(tǒng)計:在2016年相關(guān)方面占26篇,其次是2014/2015.2017.2018年。2019年有5個相關(guān)專利。公開日統(tǒng)計2017年做多占26篇,隨后2018/2016年逐次下降。設(shè)想并描述一個與你專業(yè)相關(guān)的循證醫(yī)學或數(shù)據(jù)挖掘/人工智能應(yīng)用場景,包括提出問題、擬采用的方法或技術(shù)、預期結(jié)果等,要求思路清晰,字數(shù)不限。問題:糖尿病性心臟病是糖尿病的主要并發(fā)癥之一,最終會導致終末期 心臟病。目前臨床上尚缺乏靈敏度高的診斷糖尿病性心臟病的早期標志 物。因此,能否通過篩選糖尿病性心臟病的心臟組織的差異表達基因來 挖掘靈敏度高的標志物,對于糖尿病性心臟病的診斷和治療具有重要 意義。方法技術(shù):隨著基因芯片技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用,產(chǎn)生了許多基因表達譜數(shù) 據(jù),如何挖掘有價值的數(shù)據(jù)信息,已成為生物信息學的研究熱點。生物 信息學的發(fā)展也為糖尿病性心臟病的研究提供了新的思路??梢詫τ擅绹鴩⑸锛夹g(shù)信息中心NCBI創(chuàng)建并維護的基因表達數(shù)據(jù)-GEO中糖尿病 腎性心臟病的基因芯片進行分析,篩選出核心基因和重要的信號通路,構(gòu) 建差異基因的互作網(wǎng)絡(luò)

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