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文檔簡介

1、基因制藥基因工程制藥第一節(jié) 概述第二節(jié) 基因藥物生產(chǎn)的基本過程第三節(jié) 目的基因的獲得第四節(jié) 基因表達(dá)第五節(jié) 基因工程菌的穩(wěn)定性第六節(jié) 基因工程菌發(fā)酵第七節(jié) 基因工程藥物的分離純化第八節(jié) 基因工程藥物的質(zhì)量控制第二章 基因工程制藥第一節(jié) 概 述生物技術(shù)的核心就是基因工程,基因工程技術(shù)最成功的應(yīng)用就是用于生物治療的新型生物藥物的研制。傳統(tǒng)生物藥物由于來源及制備上的困難、價(jià)格等因素的影響,此外在制備過程可能受到的病毒、衣原體、支原體等的感染等問題,促使人們尋求安全、實(shí)用、療效可靠的新方法來制備生物藥物?;蚬こ陶谥饾u顯示其在生物技術(shù)藥物制備上的優(yōu)勢(shì)。應(yīng)用基因工程技術(shù)可十分方便且有效地解決上述提到的

2、問題,從質(zhì)和量上都可以得到改進(jìn),而且可以創(chuàng)造全新物質(zhì)。如今,癌癥、病毒性疾病、心血管疾病以及內(nèi)分泌等方面的預(yù)防、治療和診斷已可通過基因工程技術(shù)獲得。利用基因工程技術(shù)生產(chǎn)藥品的優(yōu)點(diǎn):(1)可以大量生產(chǎn)過去難以獲得的生理活性蛋白和多肽(如胰島素、干擾素、細(xì)胞因子等),為臨床使用提供有效的保障;(2)可以提供足夠數(shù)量的生理活性物質(zhì),以便對(duì)其生理、生化和結(jié)構(gòu)進(jìn)行深入的研究,從而擴(kuò)大這些物質(zhì)的應(yīng)用范圍;(3)利用基因工程技術(shù)可以發(fā)現(xiàn)、挖掘更多的內(nèi)源性生理活性物質(zhì);(4)內(nèi)源性生理活性物質(zhì)在作為藥物使用時(shí)存在的不足之處,可通過基因工程和蛋白質(zhì)工程進(jìn)行改造和去除。如白細(xì)胞介素-2的第125位半胱氨酸是游離的

3、,有可能引起-S-S-鍵的錯(cuò)配而導(dǎo)致活性下降,如將此半胱氨酸改為絲氨酸或丙氨酸,白細(xì)胞介素-2的活性以及熱穩(wěn)定性均有提高;(5)利用基因工程技術(shù)可獲得新型化合物,擴(kuò)大藥物篩選來源。 基因工程技術(shù)可將不同種類和用途的基因,在原核細(xì)胞中表達(dá)的特性使其不僅在醫(yī)藥,而且在很多行業(yè)中都會(huì)有重要的應(yīng)用。第二節(jié) 基因工程藥物生產(chǎn)的基本過程基因工程技術(shù)就是將重組對(duì)象的目的基因插入載體,拼接后轉(zhuǎn)入新的宿主細(xì)胞,構(gòu)建工程菌(或細(xì)胞),實(shí)現(xiàn)遺傳物質(zhì)的重新組合,并使目的基因在工程菌內(nèi)進(jìn)行復(fù)制和表達(dá)的技術(shù)?;蚬こ趟幬镏圃斓闹饕绦蚴牵耗康幕虻目寺。瑯?gòu)建DNA重組體,將DNA重組體轉(zhuǎn)入宿主菌構(gòu)建工程菌,工程菌的發(fā)酵,

4、外源基因表達(dá)產(chǎn)物的分離純化,產(chǎn)品的檢驗(yàn)等。以上程序中的每個(gè)階段都包含若干細(xì)致的步驟,這些程序和步驟將會(huì)隨研究和生產(chǎn)條件的不同而改變。DNA重組技術(shù)基因工程藥物生產(chǎn)的上游和下游上 游:主要指的是目的基因分離、工程菌(或細(xì)胞)構(gòu)建。上游階段的工作主要在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)完成;(DNA重組技術(shù))下 游:主要指的是從工程菌(或細(xì)胞)的大規(guī)模培養(yǎng)一直到產(chǎn)品的分離純化、質(zhì)量控制等。工程菌(或細(xì)胞)構(gòu)建中重要的工具該過程中重要的工具便是酶:限制性內(nèi)切酶和連接酶是將所需目的基因插入適當(dāng)?shù)妮d體質(zhì)?;蚴删w中并轉(zhuǎn)入E. coli 或其它宿主菌(細(xì)胞)大量復(fù)制目的基因過程中的重要工具。同時(shí)為保證目的基因的正確性,對(duì)目的基因要

5、進(jìn)行限制性內(nèi)切酶和核苷酸序列分析?;虮磉_(dá)系統(tǒng)就是上述的工程菌或細(xì)胞,有原核生物和真核生物兩類表達(dá)系統(tǒng);選擇基因表達(dá)的系統(tǒng)主要考慮的是保證表達(dá)蛋白質(zhì)的功能,其次要考慮的是表達(dá)量的多少和分離純化的難易。Cutting by enzymes下游階段在產(chǎn)業(yè)化中是極其重要的下游階段是將實(shí)驗(yàn)室成果產(chǎn)業(yè)化、商品化,主要包括工程菌大規(guī)模發(fā)酵最佳參數(shù)的確立,新型生物反應(yīng)器的研制,高效分離介質(zhì)及裝置的開發(fā),分離純化的優(yōu)化控制,高純度產(chǎn)品的制備技術(shù),生物傳感器等一系列儀器儀表的設(shè)計(jì)和制造,電子計(jì)算機(jī)的優(yōu)化控制等。工程菌的發(fā)酵工藝不同于傳統(tǒng)的抗生素和氨基酸發(fā)酵,需要對(duì)影響目的基因表達(dá)的因素進(jìn)行分析,對(duì)各種影響因素進(jìn)

6、行優(yōu)化,建立適于目的基因高效表達(dá)的發(fā)酵工藝,同時(shí)建立一系列相應(yīng)的分離純化、質(zhì)量控制、產(chǎn)品保存等技術(shù)。第三節(jié) 目的基因的獲得對(duì)于目的基因的獲得需要根據(jù)目的基因的來源采取適當(dāng)?shù)姆椒ā?duì)于真核細(xì)胞來源的目的基因,是不能直接進(jìn)行分離的。真核細(xì)胞中單拷貝基因僅是染色體DNA中的很小一部分,即使多拷貝基因也是極少的,因此從染色體中分離純化目的基因是很困難的。另外,原核表達(dá)系統(tǒng)是有局限性的,主要是由于真核基因的內(nèi)含子及基因的后翻譯過程,所以真核系統(tǒng)得到了相應(yīng)發(fā)展。克隆真核基因常用的方法逆轉(zhuǎn)錄:逆轉(zhuǎn)錄酶催化的反應(yīng),即以RNA為模板合成DNA的過程稱為逆轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄酶逆轉(zhuǎn)錄病毒:需在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下首先將RNA轉(zhuǎn)

7、變?yōu)閏DNA,再在DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯等蛋白酶作用下擴(kuò)增的一類病毒。 一、逆轉(zhuǎn)錄法逆轉(zhuǎn)錄酶及其催化特性RNA3 5 依賴于RNA的DNA聚合酶RNA3 5 核糖核酸酶H53 53 cDNA依賴DNA的DNA聚合酶cDNA雜種分子35 53 雙鏈DNA新合成的雙鏈DNA整合到寄主染色體DNA中克隆真核基因常用的方法基因表達(dá)系統(tǒng)就是上述的工程菌或細(xì)胞,有原核生物和真核生物兩類表達(dá)系統(tǒng);第二節(jié) 基因工程藥物生產(chǎn)的基本過程下 游:主要指的是從工程菌(或細(xì)胞)的大規(guī)模培養(yǎng)一直到產(chǎn)品的分離純化、質(zhì)量控制等。cDNA片段與載體的連接基因工程技術(shù)就是將重組對(duì)象的目的基因插入載體,拼接后轉(zhuǎn)入新的宿主細(xì)胞,構(gòu)建

8、工程菌(或細(xì)胞),實(shí)現(xiàn)遺傳物質(zhì)的重新組合,并使目的基因在工程菌內(nèi)進(jìn)行復(fù)制和表達(dá)的技術(shù)。下游階段是將實(shí)驗(yàn)室成果產(chǎn)業(yè)化、商品化,主要包括工程菌大規(guī)模發(fā)酵最佳參數(shù)的確立,新型生物反應(yīng)器的研制,高效分離介質(zhì)及裝置的開發(fā),分離純化的優(yōu)化控制,高純度產(chǎn)品的制備技術(shù),生物傳感器等一系列儀器儀表的設(shè)計(jì)和制造,電子計(jì)算機(jī)的優(yōu)化控制等。在真核細(xì)胞中mRNA的3末端常常含有一多聚腺苷酸polyA組成的末端,長達(dá)20250個(gè)腺苷酸,可采用Oligo dT-纖維素,以親和層析法將mRNA從細(xì)胞總RNA中分離出來。發(fā)夾結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)切除后,雙鏈cDNA分子的大小常用變性瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行測(cè)定。核酸酶S1專一性切除單鏈DNA,因

9、此用它可以切除發(fā)夾結(jié)構(gòu)。3、cDNA第二鏈的合成6、cDNA文庫的鑒定(5)利用基因工程技術(shù)可獲得新型化合物,擴(kuò)大藥物篩選來源。同時(shí)為保證目的基因的正確性,對(duì)目的基因要進(jìn)行限制性內(nèi)切酶和核苷酸序列分析。第三節(jié) 目的基因的獲得coli 或其它宿主菌(細(xì)胞)大量復(fù)制目的基因過程中的重要工具。以上程序中的每個(gè)階段都包含若干細(xì)致的步驟,這些程序和步驟將會(huì)隨研究和生產(chǎn)條件的不同而改變。下 游:主要指的是從工程菌(或細(xì)胞)的大規(guī)模培養(yǎng)一直到產(chǎn)品的分離純化、質(zhì)量控制等。16逆轉(zhuǎn)錄過程一、逆轉(zhuǎn)錄法1、mRNA的純化2、cDNA第一鏈的合成3、cDNA第二鏈的合成4、cDNA克隆5、將重組體導(dǎo)入宿主細(xì)胞6、cD

10、NA文庫的鑒定7、目的cDNA克隆的分離和鑒定18cDNA文庫1、mRNA的純化分離純化目的基因的mRNA極其困難 種類多;總RNA總量少(2%5%);相對(duì)分子質(zhì)量大小很不一致,由幾百到幾千個(gè)核苷酸組成。在真核細(xì)胞中mRNA的3末端常常含有一多聚腺苷酸polyA組成的末端,長達(dá)20250個(gè)腺苷酸,可采用Oligo dT-纖維素,以親和層析法將mRNA從細(xì)胞總RNA中分離出來。洗脫方法是高濃度鹽溶液使mRNA特異結(jié)合于寡聚dT,再以低鹽溶液和蒸餾水將其洗脫,經(jīng)過兩次寡聚dT,可得到較純的mRNA。2、cDNA第一鏈的合成一般mRNA都帶有3-polyA,所以可用寡聚dT作為引物,在逆轉(zhuǎn)錄酶的催化

11、下,開始cDNA鏈的合成。在合成反應(yīng)體系中加入一種放射性標(biāo)記的dNTP,在反應(yīng)中以及反應(yīng)后可通過測(cè)定放射性標(biāo)記的dNTP摻入量,計(jì)算出cDNA的合成效率;在凝膠電泳后,進(jìn)行放射自顯影分析產(chǎn)物的分子大小,探索最佳反應(yīng)條件。一次好的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)可使寡聚dT選出的mRNA有5% 30%被拷貝。RT-PCR反轉(zhuǎn)錄PCRmRNA-cDNA-PCR對(duì)于目的基因的獲得需要根據(jù)目的基因的來源采取適當(dāng)?shù)姆椒?。基因工程技術(shù)就是將重組對(duì)象的目的基因插入載體,拼接后轉(zhuǎn)入新的宿主細(xì)胞,構(gòu)建工程菌(或細(xì)胞),實(shí)現(xiàn)遺傳物質(zhì)的重新組合,并使目的基因在工程菌內(nèi)進(jìn)行復(fù)制和表達(dá)的技術(shù)。(4)內(nèi)源性生理活性物質(zhì)在作為藥物使用時(shí)存在的不

12、足之處,可通過基因工程和蛋白質(zhì)工程進(jìn)行改造和去除。7、目的cDNA克隆的分離和鑒定另外,原核表達(dá)系統(tǒng)是有局限性的,主要是由于真核基因的內(nèi)含子及基因的后翻譯過程,所以真核系統(tǒng)得到了相應(yīng)發(fā)展。(3)利用基因工程技術(shù)可以發(fā)現(xiàn)、挖掘更多的內(nèi)源性生理活性物質(zhì);應(yīng)用基因工程技術(shù)可十分方便且有效地解決上述提到的問題,從質(zhì)和量上都可以得到改進(jìn),而且可以創(chuàng)造全新物質(zhì)。(1)可以大量生產(chǎn)過去難以獲得的生理活性蛋白和多肽(如胰島素、干擾素、細(xì)胞因子等),為臨床使用提供有效的保障;6、cDNA文庫的鑒定工程菌的發(fā)酵工藝不同于傳統(tǒng)的抗生素和氨基酸發(fā)酵,需要對(duì)影響目的基因表達(dá)的因素進(jìn)行分析,對(duì)各種影響因素進(jìn)行優(yōu)化,建立適

13、于目的基因高效表達(dá)的發(fā)酵工藝,同時(shí)建立一系列相應(yīng)的分離純化、質(zhì)量控制、產(chǎn)品保存等技術(shù)。在凝膠電泳后,進(jìn)行放射自顯影分析產(chǎn)物的分子大小,探索最佳反應(yīng)條件。核酸酶S1專一性切除單鏈DNA,因此用它可以切除發(fā)夾結(jié)構(gòu)。3、cDNA第二鏈的合成先用堿解或RNaseH酶解的方法除去cDNA-mRNA雜交鏈中的mRNA鏈,然后以cDNA第一鏈為模板合成第二鏈。由于第一鏈cDNA鏈3末端往往形成一個(gè)發(fā)夾形結(jié)構(gòu),所以,可以從這一點(diǎn)開始合成cDNA第二鏈。此反應(yīng)是在DNA聚合酶I催化下完成的。核酸酶S1專一性切除單鏈DNA,因此用它可以切除發(fā)夾結(jié)構(gòu)。發(fā)夾結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)切除后,雙鏈cDNA分子的大小常用變性瓊脂糖凝膠電泳

14、進(jìn)行測(cè)定。4、cDNA克隆用于cDNA克隆的載體有兩類:質(zhì)粒DNA(如pUC、pBR322等)和噬菌體DNA(如gt10、 gt11等)。根據(jù)重組后插入的cDNA是否能夠表達(dá)、能否經(jīng)轉(zhuǎn)錄和翻譯合成蛋白質(zhì),又將載體分為表達(dá)型和非表達(dá)型載體。pUC及gt11為表達(dá)型載體,在cDNA插入位置的上游具有啟動(dòng)基因順序;而pBR322及gt10為非表達(dá)型載體。在cDNA克隆操作中應(yīng)該根據(jù)不同的需要選擇適當(dāng)?shù)妮d體。cDNA插入片段小于10kb,可選質(zhì)粒載體,如大于10kb則應(yīng)選用噬菌體DNA為載體。選用表達(dá)型載體可以增加目的基因的篩選方法,有利于目的基因的篩選。cDNA片段與載體的連接方法一:加同聚尾連接,

15、用3末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶催化,使載體與cDNA的3末端帶上互補(bǔ)的同型多聚體序列,如載體加上polyC(或A)的尾巴,則cDNA加上polyG(或T)的尾巴,這兩種粘性末端只能使載體與cDNA連接而不能自我環(huán)化,借助同型多聚體的退火作用形成重組分子,最后用T4 DNA連接酶封口。cDNA片段與載體的連接方法二:加人工接頭連接,用T4 DNA連接酶在平末端接上人工接頭可以使DNA發(fā)生連接。所謂人工接頭是指人工合成的、連接在目的基因兩端的含有某些限制酶切位點(diǎn)的寡核苷酸片段。cDNA連上人工接頭后,用該限制酶酶切就可得到粘性末端,從而能夠與載體連接;cDNA中也可能帶有同樣的限制酶切點(diǎn),為了保護(hù)cDNA不受限制酶破壞,可在加接頭前用甲基化酶修飾這些限制酶切位點(diǎn)。5、將重組體導(dǎo)入宿主細(xì)胞體外包裝的噬菌體,感染感受態(tài)大腸桿菌形成噬菌斑;或轉(zhuǎn)化感受態(tài)大腸桿菌使質(zhì)粒進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。6、cDNA文庫的鑒定根據(jù)重組體的表型進(jìn)行篩選,主要有抗性基因失活法和菌落或噬菌斑顏色改變法。然后采用凝膠電泳、分子雜交、DNA序列分析測(cè)定等方法進(jìn)行進(jìn)一步篩選和鑒定。7、目的cDNA克隆的分離和鑒定從cDNA文庫中分離特異的cDNA克隆,主要采用:(1)核酸探針雜交法。用層析和高分辨電泳等技術(shù)純化微克量的目的蛋白質(zhì),根據(jù)目的蛋白質(zhì)純品的氨基酸序列分析結(jié)果,人工合成相應(yīng)的單鏈寡核苷酸作為探針,從cDN

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