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1、PAGE 4PAGE 解惑練4新冠病毒的檢測1檢測患者因新冠病毒而產(chǎn)生的特異蛋白質(zhì)新型冠狀病毒IgM抗體快速檢測試劑盒,該試劑盒采用間接法檢測人新型冠狀病毒IgM抗體,僅需采取一滴血就有望在15分鐘內(nèi)肉眼觀察獲得檢測結(jié)果,且患者的血漿稀釋500至1000倍后,仍能檢測出陽性條帶。其實(shí)質(zhì)為利用抗原抗體雜交技術(shù),但是無論如何,現(xiàn)在抗體檢測還不能完全替代核酸檢測。2檢測新冠病毒的核酸新型冠狀病毒是一種僅含有RNA的病毒,病毒中特異性RNA序列是區(qū)分該病毒與其他病原體的標(biāo)志物。檢測原理:核酸檢測盒包括:逆轉(zhuǎn)錄酶試劑、病毒核酸標(biāo)準(zhǔn)試劑、熱穩(wěn)定DNA聚合酶、引物序列、特異性的熒光DNA探針(帶熒光的一段特
2、異性的新冠病毒的核酸序列,這個是最關(guān)鍵的,如果特異性不強(qiáng)或者是病毒在這一段發(fā)生變異,則很可能會判定為陰性,影響結(jié)果)等。目前采用RTPCR技術(shù)(逆轉(zhuǎn)錄熒光PCR技術(shù))。(1)先從樣本中提取RNA,RNA中可能有新冠病毒的RNA,同時也存在很多采樣患者的組織和存在于采樣部位的微生物的RNA。(2)先通過逆轉(zhuǎn)錄酶將樣本的RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。因?yàn)樾鹿诓《局械暮怂釣镽NA,而RNA極易降解,為了防止我們檢測的物質(zhì)在檢測過程中降解,我們把它轉(zhuǎn)換為更穩(wěn)定的DNA。(3)檢測擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物,即DNA片段。我們擴(kuò)增的病毒DNA片段能夠發(fā)出熒光而被儀器檢測到。這些擴(kuò)增出的供我們檢測的產(chǎn)物的多少,很大程度
3、上取決于樣本中目標(biāo)RNA量的多少。而目標(biāo)RNA量的多少又與樣本中病毒的多少相關(guān)。下圖顯示了相關(guān)原理:在PCR反應(yīng)體系中,包含一對特異性引物以及一個Taqman探針,該探針為一段特異性寡核苷酸序列,兩端分別標(biāo)記了報告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)。探針完整時,報告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號被淬滅基團(tuán)吸收;若反應(yīng)體系存在靶序列,PCR反應(yīng)時探針與模板結(jié)合,DNA聚合酶沿模板利用酶的外切酶活性將探針降解,報告基團(tuán)與淬滅基團(tuán)分離,發(fā)出熒光。每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個熒光分子產(chǎn)生。熒光定量PCR儀能夠監(jiān)測出熒光到達(dá)預(yù)先設(shè)定閾值的循環(huán)數(shù)(Ct值)與病毒核酸濃度有關(guān),病毒核酸濃度越高,Ct值越小。跟蹤訓(xùn)練1(2022濰坊
4、期末考試)“防疫攻堅(jiān)進(jìn)行時,不再是說走就走的旅行”,為控制跨境傳播,我國駐多國大使館先后發(fā)布通知,赴華人員需要提供新冠病毒核酸檢測及血清抗體檢測的雙陰性證明。目前,PCR技術(shù)(熒光PCR法)是病毒核酸檢測的主流方法,是新冠病毒檢測試劑盒采用最多的技術(shù)。IgM/IgG聯(lián)合檢測(膠體金法)是新冠抗體檢測試劑盒主要采用的技術(shù)。請分析回答下列問題:(1)新冠病毒是RNA病毒,所以需對樣本進(jìn)行_處理后再PCR擴(kuò)增,如果樣本存在目標(biāo)病原體,則會因?yàn)開的特異性,擴(kuò)增出相應(yīng)的目標(biāo)基因片段,由此判斷是否為陽性。(2)熒光PCR法,又稱qPCR法,是指在反應(yīng)體系中加入_,通過專門儀器實(shí)現(xiàn)實(shí)時熒光檢測,以_來測定P
5、CR循環(huán)后產(chǎn)物中核酸水平。(3)IgM和IgG均屬于免疫球蛋白家族,是機(jī)體在抗原物質(zhì)刺激下由漿細(xì)胞產(chǎn)生的抗體。IgM/IgG檢測試劑盒的原理是_,通過檢測人體內(nèi)相應(yīng)抗體間接證明是否感染。被病毒感染后,機(jī)體會產(chǎn)生一系列的變化來抵御這種入侵,其中IgM和IgG的含量會發(fā)生如圖所示變化。通過對COVID19患者研究發(fā)現(xiàn),病毒侵入人體后,大約需要57天產(chǎn)生IgM抗體,IgG抗體在感染后1015天時產(chǎn)生。通過檢測外周血中IgM和IgG,不僅可以鑒別是否感染,還可以辨別檢測者是近期感染或者是既往感染。當(dāng)核酸檢測結(jié)果為陽性,IgM()IgG()時,可判斷檢測者為_;已治愈的患者檢測結(jié)果應(yīng)為_。答案(1)逆轉(zhuǎn)
6、錄引物(2)熒光物質(zhì)熒光強(qiáng)度(3)抗原與抗體特異性結(jié)合近期感染核酸檢測結(jié)果為陰性,IgM()IgG()解析(1)基因工程中,目的基因的獲取方法有兩種,一種是直接從基因文庫中獲取,另外一種是人工合成,人工合成的方法必須已知目的基因序列,方法有兩種,DNA合成儀合成和PCR技術(shù)合成。PCR是擴(kuò)增DNA的一種方法,如果是RNA病毒,首先要轉(zhuǎn)化成DNA,也就是逆轉(zhuǎn)錄;利用PCR技術(shù)進(jìn)行新冠病毒核酸檢測時,如果樣本存在目標(biāo)病原體,就會因?yàn)橐锏奶禺愋?,擴(kuò)增出相應(yīng)的目標(biāo)基因片段,由此判斷是否為陽性。(2)熒光PCR是通過熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性的探針,對PCR產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記跟蹤,通過專門儀器實(shí)現(xiàn)實(shí)時熒光檢
7、測,以熒光強(qiáng)度的高低來判斷PCR循環(huán)后產(chǎn)物中的核酸水平。(3)新型冠狀病毒基因編碼多個結(jié)構(gòu)蛋白,這些蛋白包括多個抗原位點(diǎn),利用抗原與抗體特異性結(jié)合的原理,可通過抗體檢測抗原的存在,從而直接證明樣本中含有新型冠狀病毒,間接證明機(jī)體感染與否。2“實(shí)時熒光定量qPCR”是新冠疫情防控的一把利刃,通常在12h內(nèi)即可得到檢測結(jié)果。TaqMan探針是實(shí)時熒光定量RTPCR技術(shù)中一種常用探針(如圖1),其5端連接熒光基團(tuán)(R),3端連接淬滅劑(Q)。當(dāng)探針完整時,R發(fā)出的熒光信號被Q吸收而不發(fā)熒光。在PCR擴(kuò)增過程中,當(dāng)TaqDNA聚合酶遇到探針時會使探針?biāo)舛尫懦鲇坞x的R和Q,R發(fā)出的熒光信號被相應(yīng)儀器
8、檢測到,熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物數(shù)量完全同步(如圖2)。請據(jù)圖回答:(1)結(jié)合圖1和圖2分析,“熒光RTPCR技術(shù)”所用的試劑盒中通常都應(yīng)該含有_酶、_酶、TaqMan探針、引物、dNTP、Mg2、緩沖劑等。這種分子層面的熒光RTPCR檢測具有特異性和靈敏性都很高的特點(diǎn),主要與試劑盒中的_、_有關(guān)。(2)根據(jù)TaqMan探針功能分析,探針中堿基序列的設(shè)計(jì)應(yīng)主要依據(jù)_。新冠病毒(2019nCoV)是冠狀病毒大家庭中的新的一員,其堿基序列與引起SARS的冠狀病毒堿基序列有79.5%的相似性,與流感病毒堿基相似度也較高,因此在設(shè)計(jì)TaqMan探針時應(yīng)篩選出2019nCoV特有序列,以避免_(填“假
9、陰性”或“假陽性”)的出現(xiàn)。(3)根據(jù)圖1和圖2,TaqDNA聚合酶除了能催化DNA子鏈的延伸,還能_。(4)若每分子探針?biāo)忉尫诺腞基團(tuán)熒光強(qiáng)度為定值a,則反應(yīng)體系中某時刻熒光信號強(qiáng)度(Rn)主要與_、_有關(guān)。在檢測過程中,隨著PCR的進(jìn)行,反應(yīng)產(chǎn)物不斷累積,“雜交雙鏈”熒光信號的強(qiáng)度也等比例增加,增加了檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性,一般要達(dá)到或超過閾值時才確診??赏ㄟ^熒光強(qiáng)度的變化監(jiān)測產(chǎn)生量的變化從而得到一條熒光擴(kuò)增曲線圖(如下圖)?!捌脚_期”出現(xiàn)的最可能的原因是試劑盒中_等有限,超出一定的循環(huán)數(shù)后,熒光標(biāo)記的“雜交雙鏈”不再增加。(5)雖然熒光RTPCR是當(dāng)前被廣泛認(rèn)可的檢測手段之一,但是不斷有“假陰性”現(xiàn)象報道,通過上述過程分析,“假陰性”的可能原因有_(填字母)。a通過咽拭子取樣不規(guī)范或取樣所獲樣本量不足b在樣本運(yùn)輸、檢測中出現(xiàn)了損壞和污染c病毒相應(yīng)關(guān)鍵序列發(fā)生了基因突變答案(1
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