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文檔簡介
1、醫(yī)學信息檢索 第一章 概述第二章 檢索的基本知識第三章 常用的生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫第四章 網絡檢索工具 第一節(jié) 文獻概述 第二節(jié) 檢索概述 第一章 概述 一、概念 二、類型 第一節(jié) 文獻概述 一、概念信息(Information)知識(Knowledge)情報(Information/Intelligence)文獻(Literature/Document) 信息 英國科學家波普爾(K.Popper)認為信息可以分成三大類:第一類是有關客觀物質世界的信息,即信息是事物存在方式及其運動規(guī)律、特點的外在表現(xiàn)形式;第二類是有關人類主觀精神世界的信息,它反映人類所感受的事物運動狀態(tài)及其變化方式,處于意識和思維
2、狀態(tài)的信息;第三類是有關概念世界的信息,它反映人類所表述的事物運動狀態(tài)及其變化方式,用語言、文字、圖像、影視數(shù)據(jù)等各種載體來表示。 信息知識 國際經濟合作與發(fā)展組織(OECD)在1996年發(fā)表的以知識為基礎的經濟報告中將知識分成:知道是什么的知識(Know-what)知道為什么的知識(Know-why)知道怎么做的知識(Know-how)知道誰有知識(Know-who) 信息知識情報 情報為交流對象的有用的知識,是知識的一部分,是進入人類社會交流系統(tǒng)的運動著的知識。 它具有三個基本屬性:知識性傳遞性效用性 信息知識未被認識的知識情報未被激活的知識未被傳遞的知識科學研究情報服務 信息知識情報文獻
3、思維加工記錄 根據(jù)國家標準文獻著錄總則,文獻的定義為:記錄有知識的一切載體聯(lián)系手段實質內容外在形式 二、類型(一)按文獻加工的深度分類 一次文獻 二次文獻 三次文獻 零次文獻 一次文獻 即原始文獻(Primary Literature),指文獻作者以本人的研究成果為基本素材撰寫而成的。 如,期刊論文、技術報告、學位論文等。 特點: 創(chuàng)造性 新穎性 系統(tǒng)性 二次文獻 將量大、無序、分散的一次文獻收集起來,進行加工、整理、簡化和排序,形成檢索一次文獻線索的新的文獻形式。 如,大多數(shù)的檢索工具 特點:濃縮性 匯集性 系統(tǒng)性 檢索性 三次文獻 是綜合一、二次文獻,將有關內容進行系統(tǒng)整理,“濃縮”而成的
4、新的文獻形式。一般是在充分研究現(xiàn)有相關文獻的基礎上,綜述已取得的進展或存在的問題,或加評論、分析,或預測發(fā)展趨勢,可使讀者不必大量閱讀一次文獻,就可了解當前的研究水平,動態(tài),是屬于經過高度智力加工的高層次信息產品。 特點:信息含量高 綜合性強 參考價值大 三次文獻三次文獻根據(jù)不同需要而分為兩大類:1. 期刊文獻型,即期刊中的綜述性文獻。 常有如下字樣出現(xiàn): review(綜述) comment(評論) advance(進展) progress(進展) updated trend(最新趨勢)等;2. 圖書文獻型,即通常所說的參考工具書。 如,百科全書、年鑒、手冊、指南、辭典等。 零次文獻 非出版
5、型文獻,指未經情報加工直接記錄在載體上的原始信息。 如,實驗數(shù)據(jù)記錄、原始調查、觀測記錄資料等。 特點:零散性 不成熟性 客觀性 口頭交流的信息也屬于零次文獻 研究活動(實驗、觀察、思考) 信息的直接記錄或傳遞 零次文獻(創(chuàng)造知識的素材) 將知識以文字等形式固化 一次文獻(初始的知識產品) 將分散的文獻序列化 二次文獻(一次文獻的替代品)將知識重新組合,使知識序列化 三次文獻(濃縮的新的信息產品) 二、類型(二)按文獻的載體分類 印刷型 縮微型 視聽型 機讀型 二、類型(二)按文獻的載體分類 印刷型 縮微型 視聽型 機讀型 二、類型(三)按出版形式分類 圖書 期刊 特種文獻 是指一些記錄的知識
6、比較系統(tǒng)、成熟的文獻。一般都有固定的裝禎,并通過出版發(fā)行。 在每一種正式出版的圖書的版權頁或其他明顯部位標有一個國際標準書號ISBN(International Standard Book Number),是一種國際通行的出版物代碼,代表某種特定圖書的某一版本。ISBN的唯一性和專指性使讀者有可能利用它通過某些檢索系統(tǒng)查詢某種特定圖書。 如: ISBN 7-5383-0276-X 科學圖書組號出版者號書名號校驗號 醫(yī)學書籍最常用的是如下幾類:教科書專科參考書專著系列叢書工具書 如我國高等醫(yī)藥院校規(guī)劃教材內科學 主要是供醫(yī)學生系統(tǒng)學習醫(yī)學知識之用。 其結構和編排系統(tǒng)性和邏輯性較強,內容以較為成熟
7、的最基本的理論知識為主,但論述的詳細程度和深度有限,可用以幫助構建最基本的知識結構。 教科書 和教科書結構相似,但內容豐富得多, 如: 黃家駟外科學 諸福棠實用兒科學 主要是供專業(yè)人員學習參考。 ??茀⒖紩?以某一專門領域、某一疾病或一個專題為中心的科學著作。 如,國內出版的實用高血壓 骨質疏松學 風濕病學 專著往往不是按照學科體系,而是圍繞一個專題來組織相關知識,因此論述較為詳盡、深入,有利于專業(yè)人員在某一領域知識的深化。 專著 往往圍繞一個中心論題或針對某一特定讀者群進行編輯。它所包含的每一本書,都是一部獨立完整的著作。 如,國外出版的幾種病理學系列叢書: Current Topics i
8、n Pathology, Major Problems in Pathology 這類叢書一般卷數(shù)甚多,每一卷都相當于一本專著。 系列叢書 主要指百科全書、年鑒、手冊、指南等一類不是用來系統(tǒng)學習,而是供遇到問題時查找,在編排上往往采用條目式。 如, 中國醫(yī)學科學年鑒 中國醫(yī)學百科全書工具書 期刊 期刊概況 期刊的主要類型 期刊中文獻變化規(guī)律 期刊的評價 期刊概況 期刊(Periodical,Journal)是一種定期或不定期出版的連續(xù)出版物,有固定的名稱、版式和編輯出版單位,有連續(xù)的年、卷、期號、出版日期,每期有多篇文章。 與圖書相比,科技期刊內容專深新穎,出版周期短,傳播面廣,連續(xù)性強,能較
9、快地反映科技發(fā)展的水平和動態(tài),是科技人員最重視的一類資料。 世界上最早的期刊1665年1月5日創(chuàng)刊的“Journal des Scavans”(學者雜志)世界上第一種醫(yī)學期刊16711829年由解剖學家Thomas Bartholin編輯,丹麥哥本哈根皇家醫(yī)學會發(fā)行的“Acta Medical et Phiolsophica Medical Journal”(醫(yī)學和哲學學報)中國最早的醫(yī)學期刊:1887年創(chuàng)刊的英文版“Chinese Medical Journal”(中華醫(yī)學雜志)和1915年創(chuàng)刊的中文版中華醫(yī)學雜志期刊概況 期刊用卷(Volume, Vol.)和期(Number, No.或I
10、ssue)作連續(xù)出版的標識。對一定期限內(一般為一年)出版的期刊劃分為一卷或幾卷,每卷再分為若干期。卷號自創(chuàng)刊開始累計,期號在一卷內連續(xù)計數(shù)。 國際標準連續(xù)出版物編碼ISSN(International Standard Serial Number)是國際上用于識別連續(xù)出版物的國際標準化編碼系統(tǒng)。每一種經過申請的出版物都可得到一個固定不變的標準號碼。ISSN具有專指性,可用于查詢特定的期刊。 如:ISSN 0317-8471(前7位是期刊代號,末位是校驗碼) 國內統(tǒng)一刊號:地區(qū)號+報刊登記號+中圖法分類號 如:CN41-1105/R(眼科新進展)期刊概況 非法期刊簡單說是指違反某國、某地區(qū)新聞
11、出版條例、法規(guī)的期刊。國家新聞出版總署與掃黃打非辦先后公布了數(shù)批非法期刊。非法期刊往往具有錄用率高、發(fā)表快、不能開正規(guī)發(fā)票等特點。因此,了解非法期刊的類型以及非法期刊的識別方法是非常必要的。期刊概況 非法期刊的類型 根據(jù)國家新聞出版總署的期刊出版管理條例中的相關原則,非法期刊大致有以下幾種:非法境外期刊 目前國家新聞出版總署也將香港、澳門和臺灣等地區(qū)出版的期刊納入境外期刊。國內出版的非法境外期刊主要來自香港,其主辦單位有:“中華臨床醫(yī)藥學會”、“國際出版集團”、“中華國際會”等。它們在香港注冊,卻主要在大陸地區(qū)非法征稿、出版。這類期刊在國際上沒有任何影響力,專門以搞有償發(fā)表為目的。期刊概況 刊
12、號嚴重錯誤或杜撰刊號的期刊 公開發(fā)行的合法期刊必須同時具備國際標準連續(xù)出版物編碼ISSN(International Standard Serial Number)和國內統(tǒng)一刊號CN。ISSN由連字符連接兩組4位數(shù)字構成,前7位是期刊代號,末位是校驗碼;CN包括地區(qū)號、報刊登記號(范圍為1000 -5998)和中圖法分類號。ISSN和CN二者缺一即可判斷為非法期刊。非法期刊的兩種刊號往往都是杜撰出來的。期刊概況 合法期刊制造的非法期刊 這主要是指正規(guī)期刊在正刊之外辦的增刊、???、專輯等。根據(jù)期刊出版管理規(guī)定第三十四條規(guī)定,期刊可以在正??谥獬霭嬖隹C糠N期刊每年可以出版兩期增刊,但必須獲得
13、許可和增刊準印號。增刊內容必須符合正刊的業(yè)務范圍,其開本必須和正刊一致,并且要在封面上標明“增刊”字樣。但是, 不少合法期刊每年都出數(shù)本增刊,增刊規(guī)模遠超正刊,比正刊厚得多,且往往未獲得增刊許可證。增刊發(fā)表的論文與正刊相比往往質量不高,多不被評審機構認同。期刊概況 非學術期刊辦的學術版 例如科普雜志辦的學術版。這類刊物以做有償發(fā)表為主,但往往沒有得到期刊主管部門的批準,而是悄悄辦的額外期刊,也不隨原刊一同發(fā)行,其目的是向發(fā)表論文的作者收取版面費,搞盈利創(chuàng)收。這類期刊也屬于非法期刊。期刊概況 非法期刊的識別 通常情況下,可以利用刊號常識來判斷非法期刊。除此之外,還可以用以下方法進行識別。直接向期
14、刊所在地的新聞出版部門詢問期刊的合法性 以下為全國各省市的期刊地區(qū)代號:北京 ll, 上海 3l, 湖北 42, 云南 53,天津 l2,江蘇 32,湖南 43,西藏 54,河北 l3,浙江 33,廣東 44,陜西 61,山西 l4,安徽 34,廣西 45,甘肅 62,內蒙古 l5,福建 35,海南 46,青海 63,遼寧 2l,江西 36,重慶 50,寧夏 64,吉林 22,山東 37,四川 5l,新疆 65,黑龍江 23,河南 4l,貴州 52。如果一本期刊的地區(qū)代碼超出以上范圍,則肯定是非法期刊。但是,目前不少非法期刊在掃黃打非活動后“汲取教訓”,將錯誤刊號改得非常逼真而難以辨認,這時就
15、可以直接向其刊號的所屬地的新聞出版部門詢問真實性。期刊概況 國際刊號效驗法 按國際標準ISO3297規(guī)定,一個國際標準刊號由以“1SSN”為前綴的8位數(shù)字(兩段4位數(shù)字,中間以一個連字符“”相連)組成。在前綴ISSN與數(shù)字之間應空一個字距。如:西南教育的國際刊號為1SSN 18101198,其中前7位為單純的數(shù)字序號,最后一位為校驗位,其數(shù)值根據(jù)前7位數(shù)字依次以82加權之和,以11為模數(shù)計算得到。期刊概況 國際刊號效驗法 國際標準刊號(ISSN)校驗位數(shù)字的計算方法如下(以西南教育為例):(1)1SSN的前7位數(shù)字為基數(shù),如1810119;(2)取82為各位數(shù)的加權因子,8765432;(3)
16、對應各位相乘得:8 56 6 0 4 3 18;(4)乘積相加:8+56+6+O+4+3+1895;(5)以模11除和數(shù)95/11得8余7;(6)以11減去余數(shù)117得4;(7)將所得余數(shù)加到1SSN的第八位(校驗位)檢驗即可準確判斷該期刊是否為合法期刊。西南教育ISSN的最后以為是8,而余數(shù)為 4,則可判斷該刊為非法期刊。再如中心理衛(wèi)生雜志的ISSN為10006729,依次計算為:8000+24+21+4=57,57除11得5余2,1129,與效驗位(ISSN最后一位)9相符合,則為合法期刊。但是,一旦非法期刊刊號的杜撰者也知道了這一效驗法,就能制造出符合效驗規(guī)則的國際刊號,這時向當?shù)匦侣劤?/p>
17、版部門查詢才是最準確的方法了。期刊概況 期刊網絡查詢法 一是期刊目錄查詢,如“中國中文核心期刊”,“國家期刊獎目錄”,“中國期刊方陣目錄”等,一般的,知名期刊都曾獲得過一些國家的獎項。作者投稿最好選擇知名期刊投,不要輕易投一些陌生期刊。二是數(shù)據(jù)庫查詢法。目前國內有五大學術期刊數(shù)據(jù)庫:清華大學中國知網的中國期刊全文數(shù)據(jù)庫、中國醫(yī)學科學院信息研究所開發(fā)研制的中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫、中國人民解放軍醫(yī)學圖書館數(shù)據(jù)庫研究部研制開發(fā)的中文生物醫(yī)學期刊數(shù)據(jù)庫、由萬方數(shù)據(jù)股份有限公司研制的萬方數(shù)據(jù)資源系統(tǒng)以及維普資訊網的中文科技期刊全文數(shù)據(jù)庫,但該數(shù)據(jù)庫目前還收錄了不少非法期刊,準確性較前4種低。非法期刊是不
18、允許收錄與廣告的。一般的,作者對期刊感到陌生,對期刊名稱感到古怪的才有需要進行相關的查詢,一些知名學術期刊往往都是眾所周知的。網絡查詢法可以將部分非法期刊拒之門外,在必要的時候才向新聞出版部門核實,以便節(jié)省人力財力。期刊概況 按內容多學科綜合性期刊??菩云诳垂δ軐W術性期刊科普性期刊快報、簡訊性期刊檢索性期刊綜述性期刊按刊期周刊 旬刊 半月刊 月刊 雙月刊 季刊半年刊 年刊科技期刊的主要類型 ScienceNature PNAS中國科學科學通報LancetBMJN Engl J Med JAMA中華醫(yī)學雜志多學科綜合性期刊如:自然科學醫(yī)學如:中華內科雜志 中華心血管病雜志 糖尿病??菩云诳?按
19、內容多學科綜合性期刊??菩云诳垂δ軐W術性期刊科普性期刊快報、簡訊性期刊檢索性期刊綜述性期刊按刊期周刊 旬刊 半月刊 月刊 雙月刊 季刊半年刊 年刊科技期刊的主要類型 快報、簡訊性期刊:學術性期刊上的論文一般篇幅較長,作者或出版商為使一些科學研究成果及早與讀者見面,將論文壓縮成比文摘稍長的短文,以“快報”(short report)或“簡報”brief communication)等形式提前出版。此類期刊國外較多見。綜述性期刊:這類期刊一般只選擇性刊載綜述性文獻,刊名多含有Review(綜述)字樣。 按內容多學科綜合性期刊??菩云诳垂δ軐W術性期刊科普性期刊快報、簡訊性期刊檢索性期刊綜述性期刊
20、按刊期周刊 旬刊 半月刊 月刊 雙月刊 季刊半年刊 年刊科技期刊的主要類型 布拉德福定律 文獻集中分散規(guī)律; 齊普夫定律 各種詞匯、術語在科技文獻中出現(xiàn)的頻率; 洛特卡定律 學科領域著者數(shù)量與所寫論文數(shù)量的分布規(guī)律; 巴爾頓-凱普勒方程、普賴斯指數(shù) 文獻隨時間增長和老化的規(guī)律; 加菲爾德定律 文獻之間相互引證的規(guī)律??萍计诳形墨I的變化規(guī)律 布拉德福定律布拉德福(Samue Clement Bradford,1878-1948), 英國文獻學家和化學家。布拉德福定律 如果將科學雜志按其刊載某個學科主題的論文數(shù)量,以遞減順序排列起來,就可以在所有這些期刊中區(qū)分出載文率最高的“核心”部分和包含著與
21、核心部分同等數(shù)量論文的隨后幾區(qū),這時核心區(qū)和后繼各區(qū)中所含的期刊數(shù)成1:a:a2: 的關系(a1)。 也就是說,按期刊刊載某個學科論文的數(shù)量的大小來劃分區(qū)域,可見,大量與該學科有關的論文,刊登在少量的期刊上,這個區(qū)域稱為“核心區(qū)”,在這一區(qū)域的少量的學術期刊,稱“核心期刊”,與此同時,有關這一學科的文章也在其它雜志上發(fā)表,這就產生了文獻集中與分散的現(xiàn)象。 區(qū) 期刊數(shù)量 論文數(shù)量核心區(qū) 6 420相關區(qū)1 36 420相關區(qū)2 216 420布拉德福定律 所謂核心期刊,是指刊載某學科文獻數(shù)量大,被引用率和利用率較高,學術水平較高和實用性較強的部分學術期刊。 核心期刊是指刊載某學科文獻數(shù)量大,文摘
22、率、引文率和使用率均高的那種部分高質量的期刊。布拉德福定律 文獻引證規(guī)律加菲爾德定律 在學術期刊中,學術文獻之間并不是彼此孤立存在的,而是相互關聯(lián),有著千絲萬縷的聯(lián)系。在文獻引用與被引用當中形成了一種規(guī)律,即科技文獻的引證關系鏈。這一規(guī)律由美國著名的情報學家加菲爾德(Eugene Garfield)首次發(fā)現(xiàn),并基于這個基本原理由當時他主持的美國科學情報研究所創(chuàng)建了“Science Citation Index”(科學引文索引)這一著名的檢索工具。 某人某刊某篇文獻引用另一人另一刊另一文獻來源作者來源期刊來源文獻被引作者被引期刊被引文獻citing文獻引證規(guī)律加菲爾德定律來源文獻Citing被引
23、文獻Cited 某人某刊某篇文獻引用另一人另一刊另一文獻來源作者來源期刊來源文獻被引作者被引期刊被引文獻citing他人citingciting他人S C I 四大檢索系統(tǒng)(四大索引)SCI 科學引文索引 (Science Citation Index) EI 工程索引(Engineering Index)ISTP 科技會議錄索引 (Index to Scientific and Technical Proceedings)ISR 科學評論索引 (Index to Scientific Reviews) 1.影響因子(Impact Factor,IF) 是國際上通用的期刊評價指標。 定義: 用
24、某刊的被引用次數(shù)除以該刊刊載的論文數(shù)。 計算方法: 該刊前兩年發(fā)表論文在統(tǒng)計當年被引用的總數(shù) 該刊前兩年發(fā)表的論文的總數(shù) 學術期刊的評價指標 計算1996年Science的影響因子C1=1995年發(fā)表的文獻在1996年被引用的次數(shù)=24189(次)C2=1994年發(fā)表的文獻在1996年被引用的次數(shù)=25170(次)A1=1995年發(fā)表的文獻數(shù)=1037(篇)A2=1994年發(fā)表的文獻數(shù)=1054(篇)則:IF=(C1+C2)/(A1+A2) =(24189+25170)/(1037+1054) = 23.605(次/篇) 被引頻次(被引次數(shù)):A刊前兩年被引頻次為100(發(fā)文100篇)B刊前兩
25、年被引頻次為90 (發(fā)文50篇) 影響因子( Impact Factor):A刊:IF=100/100=1B刊:IF=90/50=1.8BAAB 影響因子(IF)表示期刊中每篇文獻的平均被引證程度。 由于它是一個相對統(tǒng)計量,所以可公平地評價和處理大期刊和小期刊由于發(fā)文量不同所帶來的偏差。 一般來說,某刊影響因子越大,則說明它的被引用率越高,學術作用也越大。 SCI收錄期刊的平均影響因子約為1左右,其中影響因子最高者達48.9,我國被SCI收錄的期刊的影響因子多小于1,與發(fā)達國家還有較大的差距。根據(jù)美國ISI公布的2001年的期刊的影響因子,中國兩種英文版科技期刊的影響因子首次超過1,這兩種期刊
26、是細胞研究IF為2.102和世界胃腸病學雜志IF為1.445 2.即時指數(shù)(Immediacy Index) 也稱即時指標或當年指標,是指期刊文獻當年被引用的程度。 計算方法: 當年某種期刊所發(fā)表的論文被引用總次數(shù) 該刊當年發(fā)表論文的總數(shù) 實際上也就是某刊最新一年的影響因子,數(shù)值越高,表明該刊所載論文被引用的速度越快,論文的影響力也就越大。即時指數(shù)可用來表示某種期刊揭示科學上研究熱點的快慢程度,可以在一定程度上說明期刊的學術質量。學術期刊的評價指標 學術期刊的評價工具ISI(美國科學情報研究所):Journal Citation Reports(期刊引用報告,JCR) 北京大學圖書館:中文核心
27、期刊要目總覽 學術期刊的評價工具Journal Citation Reports(期刊引用報告,JCR) SCI由美國科學情報研究所(ISI)出版,是一套綜合性(包括醫(yī)學)檢索工具,收錄60多個國家1945年以后的期刊。從1975年開始每年發(fā)行上一年的期刊引用報告(Journal Citation Reports,簡稱JCR)。JCR是美國科學情報研究所繼編輯出版SCI之后,又出版的另一種新型期刊評價分析工具。從1975年開始,JCR成為SCI索引中的一個新的組成部分,以后逐漸單獨成冊,按年度出版,并有光盤版和網絡版。目前,JCR已涵蓋自然科學和社會科學6600多種期刊參考文獻的引用數(shù)據(jù),包括
28、總被引頻次、影響因子、即年指標、被引半衰期等重要指標,并可按任一指標進行排序。 學術期刊的評價工具Journal Citation Reports(期刊引用報告,JCR) 由于SCI的網絡版(Science Citation Index Expanded,簡稱SCIE)期刊數(shù)量多,涉及多達170多個學科領域,期刊質量和影響力存在很大的差距,因此,很難以IF評價不同學科領域的期刊學術水平。針對這種情況,為了更科學地對期刊的學術水平進行評價,中國科學院文獻情報中心組織相關學科資深專家根據(jù)JCR每年公布的期刊引證報告數(shù)據(jù),將該年期刊按照學科方式分成四個區(qū)。一區(qū)期刊被認定為學術質量最高,其他依次排序為二區(qū)、三區(qū)和四區(qū)。中國科學院文獻情報中心的2012年JCR期刊分區(qū)報告將6428種期刊分為數(shù)學、物理、化學、地學、地學天文、生物學、農林科學、醫(yī)學、工程技術、環(huán)境科學、管理科學、社會科學和綜合性期刊13大類。 學術期刊的評價工具中文核心期刊要目總覽 由北京大學圖書館與北京地區(qū)高
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