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文檔簡介
1、關(guān)于蛋白質(zhì)的分離純化與定性定量分析第一張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月什么是蛋白質(zhì)的分離純化分離:將蛋白質(zhì)混合物分成單一的蛋白成分。純化:得到單一蛋白的純品。第二張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月為什么要純化蛋白質(zhì)?研究特定蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能(酶、生物活性蛋白,etc)制備抗體蛋白質(zhì)晶體學(xué)研究研究蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用第三張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月怎樣純化蛋白質(zhì)?生化學(xué)家根據(jù)特定蛋白質(zhì)與其他蛋白質(zhì)的性質(zhì)差異,來分離或純化它。可溶性、等電點、分子大小、生物學(xué)性質(zhì)可溶性:硫酸銨沉淀等電點:離子交換層析分子大?。耗z過濾層析生物學(xué)性質(zhì):親和層析第四張,PPT共一百頁,創(chuàng)作
2、于2022年6月蛋白質(zhì)純化的基本設(shè)計原則原料應(yīng)易得到,并盡可能富含目的蛋白;應(yīng)有特異性的蛋白質(zhì)檢測方法(最重要的因素,決定了純化能否成功);分級分離,先粗后細;純化條件盡量溫和,避免蛋白失活。第五張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月蛋白質(zhì)的檢測方法蛋白質(zhì)的活性檢測方法:必須快,必須是特異性的蛋白質(zhì)的免疫學(xué)檢測方法:western-blot,前提是有特異的抗體第六張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月分離純化的一般程序前處理(取決于采用的材料) 動物材料處理:剔除結(jié)締組織和脂肪組織 種子處理:去種皮,有機溶劑脫脂 動物細胞破碎:勻漿器、超聲波處理 植物組織:研磨,纖維素酶 細菌破碎:超聲波
3、,溶菌酶如果蛋白質(zhì)定位于某一細胞器,可用差速離心法將其分離。第七張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月相對離心力/g時間/min沉降的組分1 0005真核細胞4 00010葉綠體、細胞碎片、細胞核15 00020線粒體、細菌30 00030溶酶體、細菌細胞碎片100 000310 h核糖體第八張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月第九張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月粗分級分離(rough fractionation) 獲得蛋白質(zhì)提取液后,用一定方法,將蛋白質(zhì)與其它雜蛋白分離開來。 常用方法:鹽析、等電點沉淀、有機溶劑分級分離等 特點:簡便、處理量大、既能除去大量雜質(zhì)(包括脫鹽),又
4、能濃縮蛋白質(zhì)溶液。第十張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月細分級分離(fine fractionation) 主要方法: 層析:凝膠過濾、離子交換層析、吸附層析、親和層析等 第十一張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月1. 蛋白質(zhì)的層析分離第十二張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月層析(chromatography)chrome意為“色彩”,graphy源自希臘文,意為“寫”。“層析”就是“色譜” 。層析最早由俄國植物學(xué)家 于1903年創(chuàng)造,1941年英國學(xué)者Martin和Synge提出分配層析,此后這種方法得到很大的發(fā)展。層析是利用物質(zhì)在固定相與流動相之間不同的分配比例,達到分離目
5、的的技術(shù)。第十三張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月固定相:固定相是層析的基質(zhì)。通常是固體(如吸附劑,凝膠,離子交換劑等),能與待分離的化合物進行可逆的吸附,溶解,交換等作用。流動相:在層析過程中,推動固定相上待分離的物質(zhì)朝著一個方向移動的液體、氣體等,都稱為流動相。柱層析中一般稱為洗脫劑,薄層層析時稱為展層劑。 第十四張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月按操作形式不同分類:柱層析:將固定相裝于柱內(nèi),使樣品沿一個方向移動而達到分離。紙層析:用濾紙做液體的載體,點樣后,用流動相展開,以達到分離鑒定的目的。薄層層析:將適當(dāng)粒度的吸附劑鋪成薄層,以紙層析類似的方法進行物質(zhì)的分離和鑒定。 紙層
6、析和薄層層析主要適用于小分子物質(zhì)的快速檢測分析和少量分離制備,通常為一次性使用;柱層析是常用的層析形式,適用于樣品分析、分離。生物化學(xué)中常用的凝膠層析、離子交換層析、親和層析、高效液相色譜等都通常采用柱層析形式。第十五張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月第十六張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月怎樣純化蛋白質(zhì)?生化學(xué)家根據(jù)特定蛋白質(zhì)與其他蛋白質(zhì)的性質(zhì)差異,來分離或純化它。可溶性、等電點、分子大小、生物學(xué)性質(zhì)可溶性:硫酸銨沉淀等電點:離子交換層析分子大小:凝膠過濾層析生物學(xué)性質(zhì):親和層析第十七張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月1. 離子交換層析離子交換層析利用物質(zhì)的電荷與層析載體(
7、離子交換劑)電荷之間的相互作用而達到分離純化的目的,屬于吸附層析。離子交換層析的固定相稱為離子交換劑,由基質(zhì)和基團兩部分組成。基質(zhì):纖維素、瓊脂糖、葡聚糖、苯乙烯-二乙烯苯等高分子聚合物;基團:共價結(jié)合在基質(zhì)上的帶電基團,可分為正電基團和負電基團。第十八張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月第十九張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月Ion-Exchange chromatographyIf pH mobile phase =7.2 Then charge of the proteins: (-) (-) (+) (+)-+-+Anion exchange column = + charg
8、ed第二十張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月Increased salt concentrationIon-Exchange chromatography-+-Na+Na+Na+Na+Na+Na+Cl-Cl-Cl-Cl-Cl-Cl-+-Na+Na+Na+第二十一張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月基本操作過程樣品制備,裝柱與平衡上樣(樣品溶解于A液中)洗脫:穿透峰,洗脫峰收集、鑒定第二十二張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月離子交換層析有兩種洗脫方式分步洗脫:用間斷地遞增的不同離子強度的流動相分次洗脫樣品蛋白的方法;梯度洗脫:連續(xù)改變流動相離子強度的方法。目前隨著層析的自動化,梯
9、度洗脫成為大多數(shù)情況下的首選方案。第二十三張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月分步洗脫第二十四張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月梯度洗脫第二十五張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月2. 凝膠過濾層析利用分子量不同的蛋白質(zhì),通過凝膠分子篩時速度不同來分離蛋白質(zhì)的方法。固定相:凝膠顆粒(gel bead),多孔的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),其網(wǎng)孔決定了凝膠的分級分離范圍,即能被該凝膠分離的蛋白質(zhì)混合物的Mr范圍,如Sephadex G-50的分離范圍是150030000。常用的凝膠有Sephadex、Sepharose、Sephacryl、Superdex等。第二十六張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022
10、年6月Size-exclusion chromatography第二十七張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月Size-exclusion chromatographyAbsorbance at 280 is used to identify protein-containing fractions. You can also perform an enzyme specific assay.第二十八張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月要根據(jù)待分離物質(zhì)的分子量,選擇特定的凝膠過濾基質(zhì);凝膠過濾層析不僅可用于親水性分子的分離,也可用于疏水性分子的分離,當(dāng)用于疏水性分子分離時,該類層析往往被
11、稱為“凝膠通透層析”;凝膠過濾層析可提供樣品的分子量信息;凝膠過濾的上樣量一般在柱床體積的15;凝膠過濾的樣品濃度越大越好,但一般不要超過100mg/ml。凝膠過濾的注意事項第二十九張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月第三十張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月3. 親和層析以樣品的生物活性為依據(jù)的分離方法。生物分子的特點是有專一的活性,如酶與底物的結(jié)合,抗原與抗體,激素與受體,糖與凝集素等。將上述作用體系的一方連接到層析基質(zhì)上,使之固定化,就有可能分離純化專一作用的另一方。第三十一張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月Affinity chromatographyMakes use
12、of specific binding interactions between molecules 1- Incubate crude sample with the immobilized ligand 2- Wash away non bound sample components from solid support 3- Elute 第三十二張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月Commonly used affinity columns:Ni2+ binds to poly Histines (example 6xHis)Specific antibodies (anti-Fla
13、g tag)glutathione binds to GSTProtein A or G binds antibodiesAffinity chromatography第三十三張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月Possible elution strategies:pHIon strenghDenatureCompetitor ligand or analogAffinity chromatography第三十四張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月Ni-NTA columnsThe high affinity of the Ni-NTA resins for 6xHis-tagged
14、 proteins or peptides is due to:1- the strength with which these ions are held to the NTA resinNTA has a tetradentate chelating group that occupies four of six sites in the nickel coordination sphere第三十五張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月2- the specificity of the interaction between histidine residues and immobili
15、zed nickel ions第三十六張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月第三十七張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月在各種表達載體上都帶有各種標(biāo)簽蛋白,如GST-tag、His-tag、V5-tag等,它們不僅可用于鑒定蛋白表達與否,更可用于與之相連的目標(biāo)蛋白的純化;通過免疫親和層析技術(shù),只需一步,即可純化帶有標(biāo)簽的目標(biāo)蛋白。親和層析是基因工程中最常用的純化技術(shù)第三十八張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月高效與簡便:一旦固定化配體制備好后,操作使用非常方便;親和層析是高度濃縮的過程;可從樣品中去除大量雜質(zhì);可在活性物質(zhì)中去除理化性質(zhì)幾乎完全相同的但已失活的那些“雜質(zhì)”。親和層析的
16、優(yōu)點第三十九張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月免疫親和層析:將蛋白質(zhì)抗體偶聯(lián)到免疫親和柱可用于抗原蛋白的純化;凝集素親和層析:凝集素是一大類能專一性和糖類和糖復(fù)合物結(jié)合的蛋白質(zhì),固定化凝集素可用于糖蛋白純化;染料親和層析:有多種染料可與各種類型的酶結(jié)合,又不受酶的作用,可用于多種蛋白的分離。親和層析中的三大通用技術(shù)第四十張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月4. 疏水層析與反向?qū)游龅鞍踪|(zhì)具有親水與疏水兩重性,如果在層析基質(zhì)上接上疏水的基團,就能在一定條件下與某些蛋白質(zhì)的疏水基團相互作用,使之吸附,而達到分離純化的目的。一般情況下,是高鹽吸附(12M 硫酸銨),降低流動相的鹽濃度,使樣品
17、洗脫。疏水層析的機制與離子交換層析正好相反,因此兩者是互補的。第四十一張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月反向?qū)游?,或稱反相色譜,reverse phase chromatography,是液相色譜分析中最常用的技術(shù)。當(dāng)反相色譜用于蛋白質(zhì)分離時,其原理與疏水層析基本相同,區(qū)別在于:疏水層析的配基疏水性較弱(苯基等),所以高鹽吸附,低鹽洗脫;反相色譜配基疏水性強(C18等),所以需要使用有機溶劑洗脫。反向?qū)游雠c疏水層析原理相同第四十二張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月反相色譜分離蛋白質(zhì)的原理第四十三張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月反相色譜是最高效的蛋白質(zhì)層析技術(shù)之一第四十四張,
18、PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月第四十五張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月2. 蛋白質(zhì)的電泳分離第四十六張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月電泳(electrophoresis)帶電粒子在電場中向與自身電荷相反的電極移動的現(xiàn)象稱為電泳。蛋白質(zhì)是兩性電解質(zhì),在不同pH溶液中帶不同電荷,在直流電場中能夠泳動。第四十七張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月電泳基本原理蛋白質(zhì)在電場中泳動時,受到兩種方向相反的力的作用:電場力 FqE,q為帶電量,E為電場強度摩擦力 Fffv,f為摩擦系數(shù),v為遷移速度當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)以恒速運動時,F(xiàn)Ff0,即qEfv,此時:v/Eq/fq/6r第四十八張,PP
19、T共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月在一定介質(zhì)中,蛋白質(zhì)的q/f是一個定值,因此v/E也是定值,它被稱為電泳遷移率,即:v/E可通過實驗測定,蛋白質(zhì)的值為0.110-4 1.010-4 cm2V-1s-1,它是蛋白質(zhì)的特性之一。第四十九張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月電泳的分類自由電泳(移動界面電泳)區(qū)帶電泳:在支持物上,蛋白質(zhì)混合物被分離成若干區(qū)帶。穩(wěn)態(tài)電泳:蛋白質(zhì)遷移一段時間后達到穩(wěn)態(tài),帶的寬度不再隨時間而改變。第五十張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月1. 聚丙烯酰胺凝膠電泳凝膠由丙烯酰胺(Acr)和甲叉雙丙烯酰胺(bis)經(jīng)共聚合而成,此過程在TEMED和過硫酸銨催化下進行。A
20、cr在AP和TEMED的作用下形成單鏈,隨后通過bis的作用交叉互聯(lián)形成網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),聚合成凝膠。凝膠的孔徑可在較寬范圍內(nèi)變化,以迎合不同的分離需要。第五十一張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月第五十二張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月根據(jù)凝膠的均勻性(孔徑、pH)可分為連續(xù)與不連續(xù)兩類;根據(jù)是否加蛋白質(zhì)變性劑,可分為變性與非變性兩類;根據(jù)是否加還原劑2-巰基乙醇或DTT,可分為還原與非還原兩類;還可根據(jù)電泳裝置的不同,分為圓盤電泳和平板電泳。PAGE的分類第五十三張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月平板PAGE第五十四張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月不連續(xù)平板PAGE,是使
21、用 最廣泛的蛋白質(zhì)電泳技術(shù),它由濃縮膠與分離膠兩部分組成。不連續(xù)PAGE有很高的分辨力,因為它有以下三種效應(yīng):濃縮效應(yīng)電荷效應(yīng)分子篩效應(yīng)不連續(xù)PAGE第五十五張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月制備凝膠樣品電泳目的蛋白檢測基本操作第五十六張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月染色法:考馬斯亮藍染色法(多種類型可選)、銀染法;活性檢測法:適用于Native PAGE,其中蛋白質(zhì)保持天然活性,可用酶學(xué)方法檢測;免疫印跡法:用特異性抗體檢測蛋白質(zhì)的技術(shù)。PAGE的檢測方法多種多樣第五十七張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月2. 等電聚焦電泳根據(jù)蛋白質(zhì)的等電點進行分離的一種技術(shù)。基本原理:利
22、用兩性電解質(zhì)載體形成一個連續(xù)而穩(wěn)定的線性pH梯度,使pH從正極到負極逐漸增加。蛋白質(zhì)分子在偏離其等電點的pH位置帶電,因此在電場中可以移動;當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)移動到pH等于pI位點,其靜電荷為0,在電場中不再移動,據(jù)此可將不同pI的蛋白質(zhì)分離。第五十八張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月第五十九張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月優(yōu)點樣品加樣位置和體積不受限制;分辨率高于其它類型電泳;可測定pI值;缺點樣品在pI區(qū)域易沉淀,為增加樣品溶解度,可以在膠中加入尿素,但導(dǎo)致蛋白質(zhì)失活;樣品前處理麻煩。等電聚焦的優(yōu)缺點第六十張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月3. 雙向電泳將等電聚焦技術(shù)與SDS技術(shù)
23、組合起來的新技術(shù),是目前分離蛋白質(zhì)混合物最強大的技術(shù),也是蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重要技術(shù)?;静襟E:第一相等電聚焦后,在等電聚焦的垂直的方向進行第二相SDS。第六十一張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月pH 3 - - - - - - 10(1) IEF等電聚焦電泳(2)SDS(3)染色脫色第六十二張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月考馬斯亮藍銀 染第六十三張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月可綜合利用層析和電泳分離純化蛋白質(zhì)第六十四張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月第六十五張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月蛋白質(zhì)的濃縮超濾法使用特制薄膜對溶液中的溶質(zhì)分子進行選擇性過濾的技術(shù)
24、。常用離心力使蛋白質(zhì)透過濾膜,而使蛋白質(zhì)截留在膜內(nèi)。第六十六張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月冷凍干燥法在冷凍狀態(tài)下使樣品中水分升華而濃縮蛋白質(zhì)的技術(shù),保持蛋白質(zhì)構(gòu)象的最好方法。注意:必須保證蛋白質(zhì)始終處于冷凍狀態(tài)(在70冰箱預(yù)冷),為提高溶解度可加賦形劑(右旋糖酐、甘露醇等)。第六十七張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月吸收法采用吸水劑直接吸去蛋白質(zhì)溶液中的水。PEG、蔗糖、凝膠干粉等。沉淀法硫酸銨、PEG、有機溶劑沉淀;免疫沉淀。第六十八張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月3. 蛋白質(zhì)的含量測定第六十九張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月蛋白質(zhì)的含量測定目前蛋白質(zhì)的直接定
25、量分析技術(shù)只能測定樣品的總蛋白含量;目前沒有任何方法能直接分析樣品中某一特定蛋白成分的含量;最常用的蛋白定量方法是比色法,包括Bradford(考馬斯亮藍)、BCA法、紫外分光光度法等。第七十張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月1. Lowry法1951年Lowry在Folin酚試劑法和雙縮脲法的基礎(chǔ)上建立原理:第一步反應(yīng):在堿性溶液中蛋白與Cu2+反應(yīng)形成紫紅色的絡(luò)合物; 第二步反應(yīng):酚試劑(磷鉬酸和磷鎢酸混合液)與蛋白質(zhì)芳香族氨基酸反應(yīng)呈深藍色。第七十一張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月優(yōu)點:同時分析多個樣品,簡便;靈敏度提高;避免酚試劑局限于色氨酸和酪氨酸所造成的蛋白質(zhì)含量測定
26、偏差。缺點:要求溶液完全溶解透明;酚試劑在堿性溶液中穩(wěn)定性差,導(dǎo)致測定誤差;反應(yīng)受多種物質(zhì)干擾。第七十二張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月2. Bradford法由Bradford等人于1976年建立?;驹恚嚎捡R斯亮藍G-250在一定條件下可與蛋白質(zhì)結(jié)合,導(dǎo)致其顏色從紅色變?yōu)樗{色,最大光吸收峰從465nm移至595nm,其吸收度與蛋白質(zhì)濃度成正比。目前絕大多數(shù)公司都提供基于此原理的蛋白質(zhì)定量試劑盒。第七十三張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月優(yōu)缺點優(yōu)點:操作簡便,配合酶標(biāo)儀,可同時測定多個樣品;可測定低達25 g/ml的蛋白質(zhì)樣品;對干擾劑不敏感;缺點:染料主要結(jié)合蛋白質(zhì)的疏水區(qū)
27、,因此不同組成的蛋白質(zhì)與染料的結(jié)合比例不同。第七十四張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月3. BCA法原理:第一步,在堿性溶液中,蛋白質(zhì)與Cu2+反應(yīng)形成復(fù)合物;第二步,BCA試劑與該復(fù)合物反應(yīng),生成深紫色化合物,在562nm處有吸收峰。優(yōu)點:操作簡便,線性范圍202000 g/ml;有試劑盒出售。第七十五張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月4. 紫外分光光度法原理:蛋白質(zhì)中的Trp、Tyr在280nm有特征性吸收;肽鍵在215nm附近有特異吸收??赏ㄟ^測定該波長的光吸收度,計算蛋白質(zhì)濃度。CA/KL,其中A為吸光度,K為摩爾消光系數(shù),L為光程。K值可通過各種方法得到(包括軟件分析等)
28、。第七十六張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月優(yōu)缺點優(yōu)點:操作簡便,且敏感度高(20 g/ml );樣品不損失,測定后可繼續(xù)使用。缺點:核酸可干擾測定結(jié)果;不同蛋白質(zhì)芳香族氨基酸含量變動較大。第七十七張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月5. 凱氏定氮法1883年,丹麥化學(xué)家Kjeldahl建立,基于蛋白質(zhì)的含氮量在16%左右。蛋白質(zhì)+硫酸CO2+H2O+NH3硫酸銨+強堿氨優(yōu)點:適用樣品廣泛,結(jié)果可靠缺點:樣品中非蛋白態(tài)氨影響測定值;蛋白質(zhì)氨基酸有偏差時(大量堿性氨基酸、酰胺、小分子量氨基酸)誤差較大;操作繁瑣。第七十八張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月4. 蛋白質(zhì)分子量的測定第
29、七十九張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月1. SDS測定分子量基本原理:SDS可以破壞蛋白質(zhì)中的疏水鍵和氫鍵,并按一定比例(1g蛋白質(zhì)結(jié)合1.4g SDS)和蛋白質(zhì)組成復(fù)合物,使蛋白質(zhì)帶的負電荷的量遠遠超過其本身的電荷量,并與蛋白質(zhì)的分子量成正比。2-巰基乙醇破壞了蛋白質(zhì)二硫鍵,使蛋白質(zhì)呈橢圓棒形,其軸長與分子量成正比。q/fq/6r,所有蛋白質(zhì)的遷移率都相同。第八十張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月在SDS中遷移的蛋白質(zhì)的分子量與電泳遷移率的關(guān)系符合下述公式:lg MrlgKbmK1bm其中Mr為蛋白質(zhì)相對分子量,K、K1為常數(shù),b為斜率,m為遷移率。注意:此公式也適用于核酸在瓊
30、脂糖凝膠中的遷移第八十一張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月第八十二張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月第八十三張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月在半對數(shù)坐標(biāo)紙上做出標(biāo)準(zhǔn)曲線注意:標(biāo)準(zhǔn)曲線的斜率會根據(jù)所用凝膠濃度而發(fā)生微小的改變。第八十四張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月2. 凝膠過濾層析法測定分子量蛋白質(zhì)在凝膠過濾層析柱中的洗脫體積Ve,與其分子量的關(guān)系如下式所示:lg MrK1K2 Ve在實驗中,只要測得幾種蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)物的Ve,并以它們的lg Mr對Ve作圖得一直線,再測出樣品的Ve,即可從圖中得到樣品的分子量。第八十五張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月SD
31、S與凝膠過濾法是互補的凝膠過濾法測得的是蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)(如果它有的話)的分子量;SDS測得的是蛋白質(zhì)亞基的分子量;在有2-巰基乙醇(或DTT)存在時,SDS可測得蛋白質(zhì)每條多肽鏈的分子量。綜合應(yīng)用這兩種方法,可得到待測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的許多信息。第八十六張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月例如: 凝膠過濾法得到的蛋白質(zhì)分子量:180kD SDS(不加還原劑)結(jié)果:45kD SDS(加還原劑)結(jié)果:兩條蛋白帶(15kD和30kD)則結(jié)論是: 該蛋白質(zhì)由4個相同的亞基組成,每個亞基由兩條多肽鏈經(jīng)二硫鍵連接而成,兩條多肽鏈的分子量分別為15kD和30kD。第八十七張,PPT共一百頁,創(chuàng)作于2022年6月質(zhì)譜法是最精確的分子量測
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