《生物工程專業(yè)專業(yè)實訓(xùn)》課程教學(xué)大綱

1、生物工程專業(yè)專業(yè)實訓(xùn)教學(xué)大綱編 號14113006實踐名稱專業(yè)實訓(xùn)周 數(shù)2學(xué) 分2學(xué) 期7承擔(dān)單位生工學(xué)院1. 專業(yè)實訓(xùn)目的和要求專業(yè)實訓(xùn)是生物工程專業(yè)非常重要的實踐性教學(xué)環(huán)節(jié)之一，是培養(yǎng)學(xué)生運用生物工程相關(guān)軟件設(shè)計和模擬具體某一工程和工藝過程的能力。專業(yè)實訓(xùn)目的是引導(dǎo)學(xué)生了解生物工程相關(guān)軟件，熟悉并掌握常用軟件的操作和使用，以培養(yǎng)學(xué)生獨立設(shè)計生物工程試驗，分析和模擬試驗過程，總結(jié)和展示工程工藝結(jié)果的能力。為該專業(yè)學(xué)生在以后的工作、科研中具備使用軟件、分析和設(shè)計工程案例打下基礎(chǔ)?；疽螅?1)本專業(yè)實訓(xùn)是生工專業(yè)學(xué)生完成化工原理、發(fā)酵工程、基因工程、細(xì)胞工程、蛋白質(zhì)工程等專業(yè)課程學(xué)習(xí)后，針對

2、本專業(yè)涉及的相關(guān)軟件使用培訓(xùn)。(2) 了解生物工程相關(guān)軟件及用途，掌握生物分離工藝流程圖制作，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測，系統(tǒng)進化樹構(gòu)建，引物設(shè)計，模擬分子克隆和統(tǒng)計分析等軟件使用2主要實訓(xùn)內(nèi)容2.1生物工藝流程圖制作要求學(xué)生根據(jù)設(shè)計任務(wù)，利用Visio2007軟件，制作一個完整的分離工藝流程圖 主要內(nèi)容：（1）了解Visio2007軟件的功能；（2）學(xué)習(xí)Vision2007軟件的使用（3）利用軟件合理設(shè)計流程圖；（4）利用軟件優(yōu)化流程圖2.2 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測和序列分析了解蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫和結(jié)構(gòu)預(yù)測在線軟件，選擇其中1-2個在線軟件，完成不同性質(zhì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測。主要內(nèi)容：(1)通過數(shù)據(jù)庫分析蛋白質(zhì)序列（S

3、WISS-PROT 數(shù)據(jù)庫、TrEMBL數(shù)據(jù)庫、ExPASy數(shù)據(jù)庫）；(2)了解蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫（PDB數(shù)據(jù)庫、NRL-3D 數(shù)據(jù)庫、NRL-3D 數(shù)據(jù)庫）；(3)利用上述數(shù)據(jù)可分析蛋白序列；(4)利用上述數(shù)據(jù)庫預(yù)測蛋白結(jié)構(gòu)和功能 2.3 系統(tǒng)進化樹構(gòu)建 MEGA軟件的目的就是提供一個以進化的角度從DNA和蛋白序列中提取有用的信息的工具。了解系統(tǒng)進化樹MEGA4.0軟件，利用MEGA4.0編輯序列數(shù)據(jù)、序列比對、構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹、推測物種間的進化距離?；疽螅?1)了解系統(tǒng)進化樹構(gòu)建軟件及其原理；(2)掌握MEGA4.0軟件的使用；(3)利用Mega4.0構(gòu)建進化樹；（4）結(jié)合進化樹分析物種間

4、的進化距離2.4 引物設(shè)計軟件了解引物設(shè)計原則，選擇合適的引物設(shè)計軟件，利用Primer5.0設(shè)計引物主要內(nèi)容：（1）學(xué)習(xí)引物設(shè)計原則；（2）學(xué)習(xí)Primer5.0軟件的操作；（3）利用Primer5.0設(shè)計引物；（4）利用Primer5.0分析并優(yōu)化引物設(shè)計2.5 模擬分子克隆了解分子克隆原理，利用Clone manager7.0軟件，修飾DNA分子，查詢酶切位點，模擬載體構(gòu)建，搜索開放讀碼框以及DNA和蛋白序列比對。主要內(nèi)容：（1）利用基因工程原理， 設(shè)計載體構(gòu)建方案；（2）學(xué)習(xí)Clone manager7.0軟件的使用；（3）利用Clone manager7.0，模擬載體構(gòu)建；（4）利用

5、Clone manager7.0修飾DNA分子和酶切位點查詢；（5）利用Clone manager7.0進行DNA和多肽的序列比對2.6 數(shù)據(jù)處理和繪圖Origin軟件功能強大，操作簡單，提供直觀的統(tǒng)計分析和繪圖環(huán)境。數(shù)據(jù)分析包括：數(shù)據(jù)的排列、調(diào)整、計算、統(tǒng)計、曲線擬合等。提供直線圖、散點圖、向量圖、柱狀圖、餅圖、極坐標(biāo)圖、三維圖表、統(tǒng)計圖表等幾十種二維和三維繪圖模板。同時可以自定義數(shù)學(xué)函數(shù)，圖形樣式和繪圖模板。了解Origin8.0軟件的用途，利用Origin8.0分析數(shù)據(jù)，作圖展示分析結(jié)果。主要內(nèi)容：（1）學(xué)習(xí)軟件Origin8.0的使用；（2）利用Origin8.0統(tǒng)計分析數(shù)據(jù)，繪圖展示結(jié)果4完成地點校內(nèi)。5考核與成績評定 按課程設(shè)計要求，根據(jù)學(xué)生的完成情況，完成質(zhì)量給出成績。其中，平時成績10%，軟件使用和操作40%，總結(jié)報告50%；采用優(yōu)秀、優(yōu)良、良好、及格、不及格給出成績，總成績及格者給予學(xué)分。6主要教學(xué)參