感染性疾病相關(guān)個(gè)體化醫(yī)學(xué)分子檢測(cè)技術(shù)指南

1、前言目錄.3.13.36.40.42.42.65.66），而一些小分子藥物對(duì)丙肝病毒無(wú)基因型要求，并且臨床治愈率很高。毒（如等），由于級(jí)實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展，但如果需要先進(jìn)行培養(yǎng)，則需要在）。）：）：）。當(dāng)），當(dāng)）：是由qPCRbDNALAMPTMANASBA靈敏度高較低高較高極高（LoD）(12-15IU/ml)(600IU/ml)（10IU/ml）（50IU/ml）特異性好好極好好好寬窄較寬線性范圍（10-10）（10-10）（10-10）多種病原體定量和僅用于僅用于臨床應(yīng)用定量和定性檢測(cè)定量和定性檢測(cè)定性檢測(cè)定性檢測(cè)定性檢測(cè)靈敏度高易受污靈敏度高易受污缺點(diǎn)染致假陽(yáng)性擴(kuò)增長(zhǎng)片段VersantHCVA

2、bbotCobasVersantLCxHCVSuperQuanCobas國(guó)產(chǎn)試劑RNA1.0Real-tiTaqmanHCVRNARNAAssaytAmplicormeHCVHCV3.0HCVMonitorv2.0檢測(cè)方法kPCRReal-tiReal-timbDNAReal-timeRT-PCRRT-PCRRT-PCRmePCRePCRPCR檢測(cè)限1512156152530600500線性范圍15-1.01012-1.043-6.9615-7.725-2.6330-1.47600-5.011000-5.01010101010010定量方法非競(jìng)爭(zhēng)性?xún)?nèi)標(biāo)內(nèi)標(biāo)外標(biāo)競(jìng)爭(zhēng)性競(jìng)爭(zhēng)性競(jìng)爭(zhēng)性?xún)?nèi)標(biāo)外標(biāo)內(nèi)標(biāo)內(nèi)標(biāo)

3、內(nèi)標(biāo)自動(dòng)化全自動(dòng)全自動(dòng)全自動(dòng)半自動(dòng)半自動(dòng)半自動(dòng)半自動(dòng)手工濃度單位IU/mLIU/mLIU/mLIU/mLIU/mLcp/mlIU/mLIU/mL或cp/mL基因型1-6型1-6型1-6型1-6型1-6型1-6型不確定FDANYYYNNYNCFDANYYNNNYY法、測(cè)序法（）、VersantHCVGenotypeAbbotReal-timeHCVGenotypeTrugeneHCVgenotyping2.0檢測(cè)原理LiPA實(shí)時(shí)PCRSSP直接測(cè)序和序列比對(duì)分型區(qū)域5-UTR和core5-UTR和NS5B5-UTR能否區(qū)分亞型可區(qū)分主要亞型可區(qū)分主要亞型區(qū)分1a和1b自動(dòng)化半自動(dòng)或手工全自動(dòng)半自

4、動(dòng)），歐洲），以）等，性能DNA測(cè)序qPCR基因芯片DHPLCHRMRFLP通量高低高高高低靈敏度高高高很高高一般重復(fù)性好好好好好好局限性耐藥株要占20%僅檢測(cè)已知位僅檢測(cè)已知位雜合突變檢適于已知位僅檢測(cè)已知位以上點(diǎn)、對(duì)靶基因要點(diǎn)、對(duì)靶基因要測(cè)稍顯困難點(diǎn)、操作繁瑣、求較高求較高要求高質(zhì)控難技術(shù)可靠性金標(biāo)準(zhǔn)-（可來(lái)源于室間質(zhì)量評(píng)價(jià)正確度驗(yàn)證計(jì)劃、均值與標(biāo)定濃度值，計(jì)算偏倚。另一種方法是采用患者標(biāo)本，收集臨床標(biāo)本），）。計(jì)算），），如，在）、檢測(cè)）：）：敏感水平HBV基因突變拉米夫定替比夫定恩替卡韋阿德福韋酯替諾福韋野生株SSSSSM204VRSIISM204IRRISSL180M+M204VRR

5、ISSA181T/VISSRSN236TSSSRIL180M+M204VI169TV173LM250VRRRSSL180M+M204V/IT184GS202I/GRRRSS注：S-敏感I-不敏感R-抵抗）。含劑的耐藥性進(jìn)行評(píng)估。檢測(cè)應(yīng)該基于種群測(cè)序。將耐藥相關(guān)替換變）。）：）、臨床背景急性HIV-1感染推薦意見(jiàn)不論是否立即開(kāi)始治療，推薦進(jìn)行耐藥檢測(cè)，基因型耐藥檢測(cè)最佳；如推遲治療，應(yīng)在治療前重新進(jìn)行基因型耐藥檢測(cè)慢性HIV-1感染不論是否開(kāi)始治療，推薦進(jìn)行耐藥檢測(cè)，基因型耐藥檢測(cè)最佳；如推遲治療，應(yīng)在治療前重新進(jìn)行基因型耐藥檢測(cè)病毒學(xué)失敗強(qiáng)力推薦對(duì)病毒載量1000拷貝/ml者進(jìn)行耐藥檢測(cè)，對(duì)病毒載量500拷貝/ml但1000拷貝/ml者盡管耐藥檢測(cè)不易成功但也應(yīng)考慮進(jìn)行檢測(cè)；初次或二次治療失敗，推薦進(jìn)行基因型耐藥檢測(cè)。多次治療失敗或明確或懷疑患者存在復(fù)雜耐藥突變位點(diǎn)，尤其是對(duì)蛋白酶抑制劑類(lèi)藥物，推薦基因型和表型耐藥分析聯(lián)合應(yīng)用；初始治療方案病毒抑制不理想推薦進(jìn)行耐藥檢測(cè)HIV感染孕婦推薦對(duì)所有孕婦在抗病毒治療前進(jìn)行基因型耐藥檢測(cè)。對(duì)已接受抗病毒治療的孕婦，只要能檢測(cè)出HIVRNA也應(yīng)進(jìn)行耐藥檢測(cè)母嬰傳播感染的新生兒推薦對(duì)所有母嬰傳播感染的新生兒在抗病毒治療前及改變治療方案前進(jìn)行耐藥檢暴露后預(yù)防用藥如