ASCO腫瘤生物標記物檢測進展培訓課件

1、主要內(nèi)容肺癌驅(qū)動基因的突變譜 對EGFR TKI耐藥情況的實時檢測驅(qū)動基因檢測技術的進展1ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022主要內(nèi)容肺癌驅(qū)動基因的突變譜 1ASCO腫瘤生物標記物檢測主要內(nèi)容肺癌驅(qū)動基因的突變譜 對EGFR TKI耐藥情況的實時檢測驅(qū)動基因檢測技術的進展2ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022主要內(nèi)容肺癌驅(qū)動基因的突變譜 2ASCO腫瘤生物標記物檢測NSCLC在高加索人群驅(qū)動基因突變譜Giaccone G, et al. 2013 ASCO Abstract 7513. Aisner DL, et al. 2014 ASCO Abstract 11030

2、.美國LCMC I肺腺癌結(jié)果高加索人群NSCLC發(fā)生EGFR基因突變約占20%3ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022NSCLC在高加索人群驅(qū)動基因突變譜Giaccone G, NSCLC在亞洲人群驅(qū)動基因突變譜中國檢測結(jié)果日本檢測結(jié)果EGFR依然是亞裔腺癌最常見的驅(qū)動基因，約占50%Koh Y, et al. 2013 ASCO Abstract 7572. Wu YL, et al. 2011. 4ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022NSCLC在亞洲人群驅(qū)動基因突變譜中國檢測結(jié)果日本檢測結(jié)果E肺癌驅(qū)動基因的突變譜：腺癌 & 鱗癌腺癌鱗癌21%25%36%7.8%3.3

3、%2.6%2.2%0.8%0.7%0.7%0.1%肺腺癌與肺鱗癌發(fā)生模式不同，腺癌以突變?yōu)橹鳎[癌以擴增為主。Aisner DL, et al. 2014 ASCO Abstract 11030. Gadgeel SM, et al. 2014 ASCO Abstract 7592.5ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022肺癌驅(qū)動基因的突變譜：腺癌 & 鱗癌腺癌鱗癌21%25%36評估6785例NSCLC患者腫瘤標志物以指導聯(lián)合治療策略Xiu J, et al. 2014 ASCO Abstract e19012.6ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022評估6785例NSC

4、LC患者腫瘤標志物以指導聯(lián)合治療策略X研究設計與結(jié)果EGFR突變率：12.7%過表達率：57%擴增率：61%EGFR突變患者中：66% MET高表達，7% MET擴增患者或可獲益于EGFR和MET雙重靶向治療54% TP53突變患者或可對TKI耐藥，對放療交叉耐藥入組患者：N=6785NSCLC研究方法：多平臺檢測6種腫瘤標志物測序法(Sanger，二代測序)蛋白表達(IHC)基因擴增(CISH/FISH)研究終點：各腫瘤標志物的突變、表達、擴增、重排率Xiu J, et al. 2014 ASCO Abstract e19012.7ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022研究設計與結(jié)

5、果EGFR入組患者：N=6785研究方法：研究終研究結(jié)果ALKALK重排率：2.8%ALK重排陽性患者中：19% EGFR擴增，3% MET擴增，2% HER2擴增患者或可獲益于克唑替尼、西妥昔單抗、曲妥珠單抗、onartuzumabBRAFBRAF突變率：3.3%BRAF突變患者中：58% EGFR高表達，48% MET高表達患者或可獲益于Dabrafenib、西妥昔單抗、onartuzumab研究結(jié)論：多靶點基因變異發(fā)生可能并不相斥Xiu J, et al. 2014 ASCO Abstract e19012.8ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022研究結(jié)果ALK研究結(jié)論：多靶點

6、基因變異發(fā)生可能并不相斥Xiu主要內(nèi)容肺癌驅(qū)動基因的突變譜 對EGFR-TKI耐藥情況的實時檢測驅(qū)動基因檢測技術的進展9ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022主要內(nèi)容肺癌驅(qū)動基因的突變譜 9ASCO腫瘤生物標記物檢測無創(chuàng)、動態(tài)監(jiān)控獲得性EGFR-T790M突變以及探索TKI治療的晚期NSCLC患者T790M突變異質(zhì)性Zheng D, et al. 2014 ASCO Abstract 11049.10ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022無創(chuàng)、動態(tài)監(jiān)控獲得性EGFR-T790M突變以及探索TKI治研究設計和結(jié)果T790M突變率：36/66(54.5%)Zheng D, et

7、 al. 2014 ASCO Abstract 11049.檢測標本66例NSCLC患者PD后血漿cfDNA研究終點：T790突變率數(shù)字PCR法檢測T790M突變16.7%（6/36）例僅有T790M突變，83.3(30/36)例T790M突變和敏感突變共存9.1%（6/66）患者僅有EGFR敏感突變36.4%（24/66）患者未檢測到EGFR突變T790M positive rate:54.5%(36/66)11ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022研究設計和結(jié)果T790M突變率：36/66(54.5%)Zh血液檢測可早于影像學發(fā)現(xiàn)腫瘤進展在臨床PD前中位2個月時即可在血漿cfDN

8、A中檢測到T790M (范圍：1.5-3.5個月)時間 (月)EGFR突變率 (%)僅T790M雙突變僅外顯子19缺失/L858R80.00%60.00%40.00%20.00%0.00%m-2(n=12)-2m0(n=16)0m 2(n=44)2m 4(n=20)490%EGFR敏感突變率：數(shù)字PCR法和ARMS法結(jié)果相似(80-90%)Thress K, et al. 2014 ASCO Abstract 8092.AZD9291研究入組EGFR突變陽性患者檢測標本：(n=38)AZD9291臨床研究(NCT0182632)中入組患者血漿及部分相應腫瘤組織研究終點：EGFR突變率ARMS平

9、臺羅氏Cobas凱杰Therascreen EGFR突變檢測試劑盒數(shù)字PCR平臺BioRad 微滴數(shù)字PCR PCR(MolecularMD) BEAMing(Inostics)21ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022研究設計所有四種方法檢測血液EGFR突變率均和組織標本一致性EGFR敏感突變四種檢測方法檢測EGFR敏感突變具有高靈敏度和高特異性T790MDigital PCR和AS-PCR檢測NSCLC患者血漿T790M突變與組織相比具有高靈敏度，其中Digital PCR更有優(yōu)勢Roche cobas AS-PCRQiagen therascreen ARMSMolMD dro

10、plet dPCRInostics BEAMing dPCR19 DEL assaysSensitivity86%(24/28)82%(23/28)-90%(19/21)Specificity100%(10/10)100%(10/10)-100(10/10)concordance89%87%-93%L858R assaySensitivity90%(9/10)78%(7/9)90%(9/10)100%(9/9)Specificity100%(28/28)100%(28/28)100%(28/28)91%(19/21)concordance97%95%97%93%T790M assaySensi

11、tivity41%(7/17)29%(5/17)71%(12/17)69%(9/13)Specificity100%(6/6)100%(6/6)83%(5/6)67%(4/6)Concordance57%48%74%68%研究結(jié)果Thress K, et al. 2014 ASCO Abstract 8092.22ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022EGFR敏感突變Roche cobas AS-PCRQiagNSCLC患者M1b期T790M突變明顯高于M1a/M0期組織和血漿檢測T790M突變狀態(tài)對AZD9291臨床有效率Plasma ctDNADisease classifica

12、tionT790M+T790M-M1a/M025%(3/12)75%(9/12)M1b77%(20/26)23%(6/26)研究結(jié)果Thress K, et al. 2014 ASCO Abstract 8092.TissuePlasmaT790M(+)T790M(-)T790M(+)T790M(-)Response Rate(CR&PR)62%(26/42)26%(6/23)63%(24/38)29%(10/34)Disease control Rate(CR, PR&SD)95%(40/42)70%(16/23)89%(34/38)76%(26/34)23ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10

13、/2/2022NSCLC患者M1b期T790M突變明顯高于M1a/M0期組研究結(jié)果EGFR-T790M突變率：數(shù)字PCR法高于ARMS法(67-71% vs 29-41%)轉(zhuǎn)移性患者高于局部疾病患者(77% vs 25%)T790M突變與AZD9291療效相關性基線T790M突變可以定量的患者緩解率為71%，而基線水平檢測不到T790M突變的患者緩解率為31%Thress K, et al. 2014 ASCO Abstract 8092.結(jié)論：Digital PCR檢測T790M突變敏感度達70-80%，且一致性高，優(yōu)于其他檢測方法。24ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022研究結(jié)

14、果EGFR-T790M突變率：Thress K, et二代測序(NGS)檢測晚期EGFR突變肺腺癌患者循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)中EGFR敏感突變和耐藥突變Goldber SB, et al. 2014 ASCO Abstract 8093.25ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022二代測序(NGS)檢測晚期EGFR突變肺腺癌患者循環(huán)腫瘤DN研究設計Goldber SB, et al. 2014 ASCO Abstract 8093.檢測標本：(n=52)52例EGFR敏感突變肺腺癌患者血漿標本其中32例患者在治療中多次取血樣其中31例患者在獲得性耐藥時活檢取樣研究終點ctDNA中

15、EGFR敏感突變、T790M突變NGS檢測患者特征患者數(shù)（n=22）腫瘤特征患者數(shù)（n=22）年齡（歲）64（46-79）肺腺癌22（100%）性別 男 女16（73%）6（27%）EGFR基因敏感突變 19DEL 21L858R13（59%）9（41%）吸煙狀態(tài) 從不吸煙 既往吸煙12（55%）10（45%）獲得性耐藥T790M突變陽性陰性11（50%）11（50%）26ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022研究設計Goldber SB, et al. 2014 AS研究結(jié)論Goldber SB, et al. 2014 ASCO Abstract 8093.突變腫瘤和血漿都檢測到腫瘤和血漿都未檢測到僅在血漿中檢測到僅在腫瘤中檢測到共計EGFR T790M765422獲得性耐藥患者腫瘤組織和血漿中EGFR T790M 耐藥突變檢測結(jié)果 在獲得性耐藥的患者中，有11/22（50%）患者的腫瘤組織發(fā)生T790M突變 - 7/11例患者同時伴有腫瘤和血漿T790M突變 在未存在腫瘤T790M突變的患者中，5例僅在血漿中檢測到T790M突變，說 明可能存在腫瘤異質(zhì)性NGS檢測ctDNA EGFR敏感和耐藥突變可行但仍需優(yōu)化27ASCO腫瘤生物標記物檢測進展10/2/2022研究結(jié)論Goldber SB, e