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1、各種生物活性物質(zhì)的保存Experience 2009-08-16 16:34:36閱讀336評(píng)論0字號(hào):大中小訂閱 DNA、RNA、蛋白質(zhì)、抗體和探針的保存方法:(網(wǎng)上搜索,僅供參考人_,1.DNA短期保存,兩年之內(nèi)吧,無菌水和TE緩沖液是ok的。如果是長 期保存,比如10年20年的話,我推薦你剛提取好的DNA直接保存 到乙醇里,放一200,放10年沒問題。需要用的時(shí)候,再離心后, 棄去乙醇,加水或TE溶解即可。長期保存用TE, DNA本來就是酸性,所以需要弱堿性環(huán)境保存, 如果用中性或者酸性環(huán)境保存容易降解。保存兩年應(yīng)該會(huì)降解的!還 是不要超過兩年,再一年內(nèi)都有降解的可能,所以還是要盡快的利
2、用 了。做成干粉不太可能,哪里有那么多的量!還是在一80度以下保 存吧,也要避免反復(fù)凍融。如果DNA很純的話,應(yīng)該影響不是很大啊,有文獻(xiàn)報(bào)道高純 DNA的最佳保存條件是4度,你也可以應(yīng)證一下你的DNA有沒有降 解啊,跑個(gè)電泳看看啊,如果出現(xiàn)smear,就不要用了?。√峒兊腄NA放在4度一段時(shí)間(數(shù)周-數(shù)月)都沒問題。但是長 期保存建議-20度,并且濃度不要稀釋的太低,否則容易降解。2.RNARNA若要長期保存,需沉淀下來后置于無水乙醇凍在-70度,用的編輯版word 時(shí)候再離心下來除去無水乙醇用DEPC水溶解。保存RNA應(yīng)該盡量低溫。為了防止痕量RNase的污染,從富含 RNase的樣品(如胰
3、臟、肝臟)中分離到的 內(nèi)人需要貯存在甲醛中 以保存高質(zhì)量的RNA,對(duì)于長期貯存更是如此。從大鼠肝臟中提取 的RNA,在水中貯存一個(gè)星期就基本降解了,而從大鼠脾臟中提取 的RNA,在水中保存3年仍保持穩(wěn)定。另外,長度大于4kb的轉(zhuǎn)錄 本對(duì)于痕量RNase的降解比小轉(zhuǎn)錄本更敏感。為了增加貯存RNA樣 品的穩(wěn)定性,可以將RNA溶解在去離子的甲酰胺中,存于-70。用 于保存RNA的甲酰胺一定不能含有降解RNA的雜物。來源于胰臟的 RNA至少可以在甲酰胺中保存一年。當(dāng)準(zhǔn)備使用RNA時(shí),可以使用 下列方法沉淀RNA:加入NaAc至0.3乂,12,000乂8離心5分鐘。RNA即使是放在-80度下也會(huì)降解,所
4、以最好的保存方法是將 RNA逆轉(zhuǎn)成cDNA后保存。提取的RNA保存在DEPC處理的水中,加入RNAse抑止劑,在 -80度保存2個(gè)月,應(yīng)該是可以保證不降解的。最好是反轉(zhuǎn)錄后保存。一旦生物樣品被收集采摘,離體組織的RNA會(huì)立刻變得非常不 穩(wěn)定,極易被降解。由于特異及非特異的RNA降解,或者由于樣品 采集過程中的應(yīng)激反應(yīng)產(chǎn)生新的RNA都會(huì)引起RNA狀態(tài)的改變。對(duì) 于生物芯片、基因表達(dá)矩陣分析(Array Analysis)、定量RT-PCR等 實(shí)驗(yàn)來說,采樣后立即穩(wěn)定樣品里的RNA以保存當(dāng)時(shí)RNA的表達(dá)狀 態(tài),是精確/定量研究基因表達(dá)分析的重要前提。記得以前學(xué)植物遺 傳的同學(xué)常常要帶著液氮罐,騎著
5、單車到田里采樣那個(gè)液氮罐的編輯版word 蓋子有點(diǎn)問題,一顛就冒白煙,嚇得一路上行人、車輛紛紛躲避,很 是招搖,據(jù)說有一次覺得液氮不夠了,趕著坐出租回來,那可是連哄 帶騙才上了的士,到學(xué)校時(shí)司機(jī)已經(jīng)緊張得面無人色了一一這真令貪 玩的我們非常羨慕,只恨這等趣事怎么就落不到我們頭上。對(duì)當(dāng)事人 來說,每周一次帶著液氮罐到處跑實(shí)在不算一種有趣的經(jīng)歷。沒有辦 法,為了保持樣品的內(nèi)人完整真實(shí),要么當(dāng)場提內(nèi)人,要么液氮保 存,一直如此。不過自從有了內(nèi)人囿與這種有趣的場面就會(huì)越來越 少了。RNAlater是特殊的樣品儲(chǔ)存液,只要在采樣后立即將新鮮樣品浸 入這種液體試劑,RNlater可以迅速滲透到組織或其他生
6、物樣本中, 穩(wěn)定并保護(hù)RNA完整而不被降解,確保下游分析得到的數(shù)據(jù)真實(shí)反 應(yīng)樣品的表達(dá)信息。樣品儲(chǔ)存液中保存的新鮮樣品可以在不超過37 度的高溫天氣下保存一天,或者在25度室溫下保存一周;或者4度 冰箱存放一個(gè)月;或者負(fù)20度長期保存而使RNA保持完整免受降解。 這種技術(shù)為在不同溫度和不同地點(diǎn)下的采樣、運(yùn)輸和保存樣品提供了 極大的方便,同樣適合手術(shù)/解剖過程中部分樣品的保存。RNAlater的用法非常簡單,只要在采樣后立即將樣品完全浸入適 量(10ul/1mg組織或者5倍體積)的RNAlater中即可。取樣的動(dòng)作 要盡量快速利索,組織樣品的大小以厚度不超過0.5公分為宜。對(duì)于 一些小的組織如小
7、鼠的脾、腎等器官則可以整個(gè)取出浸入溶液中,較 大的則應(yīng)切開為厚度小于0.5公分的小塊,以確保RNAlater能迅速擴(kuò) 散滲透入組織塊中的所有細(xì)胞中。采樣的容器應(yīng)該足夠大以容納10編輯版word倍于組織重量的溶液,避免組織塊擠在一起,同時(shí)建議將溶液加滿容 器以避免在運(yùn)輸過程中組織塊露出液面。保存在RNAlater中的樣品RNA可以:37下穩(wěn)定保存1天18-25保存7天2-8穩(wěn)定4周-20永久保存.蛋白質(zhì)辛辛苦苦純化得到的那么一點(diǎn)蛋白,可千萬不能因?yàn)椴欢迷趺?保存而白白浪費(fèi)了!選擇什么樣的貯存方法取決于該蛋白的穩(wěn)定性和 你打算保存多長時(shí)間以及下一步你打算如何利用。一般來說,蛋白溶 液應(yīng)避免極端的
8、pH (強(qiáng)酸or強(qiáng)堿),同時(shí)也不能接近其等電點(diǎn)的pH。 另外,還應(yīng)該避免其他物質(zhì)的摻入。如果保存時(shí)間在24h以內(nèi),大多數(shù)蛋白可以放置到4。如果保存時(shí)間在24h以上,應(yīng)該考慮避免蛋白溶液長菌,可以事先過 濾一下(through a 0.22 m filter)或者加入抑菌的物質(zhì)(如疊氮化鈉)。如果保存時(shí)間超過一周,則應(yīng)該將蛋白溶液冷凍起來。通過液氮 或干冰冷凍的方法使蛋白溶液迅速冷凍,可以有效避免蛋白的變性。 為避免多次凍溶致使蛋白活性降低或變性,應(yīng)該將蛋白溶液分裝保 存,一次用多少就取多少。除此之外,還可以加入一些甘油(5-50% (w/v)或者血清(10 mg/ml)幫助目的蛋白保持穩(wěn)定。如
9、果打算保存數(shù)月之久,則需要將其放置于-20,此時(shí)要加入編輯版word一定量甘油,避免“凍傷”。另外,還可以用硫酸鏤將蛋白沉淀置于4保存(損失較多,不 建議采用);也可以將蛋白以干粉狀態(tài)保存(保存時(shí)間最久)。新提取的蛋白可以分裝存在-80度冰箱,保存(保險(xiǎn)系數(shù))1年, 如果加入buffer煮過的蛋白在-20保存。最好提取的蛋白,一部分保 存,一部分立刻加Buffer煮,做實(shí)驗(yàn)。 蛋白的穩(wěn)定性及保存方法-PIERCE公司技術(shù)資料Proteins comprise an extremely heterogeneous class of biological macromolecules. They
10、are often unstable when not in their native environments, which can vary considerably among cell compartments and extracellular fluids. If certain buffer conditions are not maintained, extracted proteins may not function properly or remain soluble.Proteins can lose activity as a result of proteolysi
11、s, aggregation and suboptimal buffer conditions. Purified proteins often need to be stored for an extended period of time while retaining their original structural integrity and/or activity. The extent of storage shelf life can vary from a few days to more than a year and is dependent on the natu of
12、 the protein and the storage conditions used. Optimal conditions for storage are distinctive to each protein; nevertheless, it is possible to suggest some general編輯版word guidelines for protein storage and stability. Common conditions for protein storage are summarized and compared below.Generally, t
13、here are tradeoffs associated with each method. For example, proteins stored in solution at 4 can be dispensed conveniently as needed but require morediligence to prevent microbial or proteolytic degradation; such proteins may not be stable for more than a few days or weeks. By contrast, lyophilizat
14、ion allows for long-term storage of protein with very little threat of degradation, but the protein must be reconstituted before use and may be damaged by the lyophilization process.TnlMe Lu UbarcpniTmsu of FtvMii SiiQrnpii ifaindiiiQiiaBXlHSIE# rMHl IliDOiiCli4nclurlir|cSohLIiDm il l 1C呼氣、堂警苜zom4i小
15、 I.TMTQE tTll! PC. -tpiglicEx-eded 沿 bwriu)It?liT Ui拿E EnCnilbIVtirtYxih1樂ofDNriLjirlrj Jjht fiHJVtiU蟲Md-MaChlfH! IE I,1#邛布lin訪叩砧 imullip-lj!1 liilbte照明r* nw? h中 for iHfMxnyni:E gRHurraBj融般聞pwiritK2, Cohdiijoii Pi ofvjite 口向bitui、PrbiMM EuMbitarTa器 t Pg 沖的卡Woiklhic CtfUEirEunPMSF (PbeLn liibdEyhiiLl
16、bi 1加 rule piQEaKyoi-iuiMDtunoiduit1 raMPepmiai AAcid-pLweasesI唯,血3網(wǎng)加工TIUN,七皓徐梅t 曄 iidApmDiiiiinSeLlElC MCtlZFlM-.”*iulTliifll 聯(lián) minel曄mlEDTAmid EGTAQjJ g1編輯版word 問:純化后的蛋白質(zhì)4度保存約15天,怎么分子量發(fā)生了變化? 答:蛋白質(zhì)樣品如果是溶液狀態(tài)的,在4度下頂多保存一個(gè)禮拜。15 天太長了。估計(jì)分降解成很多小蛋白。電泳時(shí)出現(xiàn)很多條帶。在-20 度也就是保存一個(gè)月。最好的保存辦法還是將蛋白樣品凍干成粉末。 保存,這樣保存的時(shí)間會(huì)很
17、長。如果條件不具備,-70度也可以。蛋 白樣品最忌諱反復(fù)凍融。答:蛋白保存應(yīng)根據(jù)對(duì)活性的要求及蛋白的種類而定:抗體:除非一 些公司特別要求-20凍存,一般4可穩(wěn)定一年(無菌,如加疊氮鈉), 因?yàn)榭贵w是一種具有非常穩(wěn)定結(jié)構(gòu)的蛋白;要求具有活性的蛋白,最 好根據(jù)需要小量保存4 (一周)、-20 (一個(gè)月)、-80 (六個(gè)月)、液 氮(基本無限期),反復(fù)凍融會(huì)導(dǎo)致諸多不良后果,如聚集、修飾、 降解、污染等(取決于蛋白濃度、緩沖液成分及蛋白本身的特點(diǎn)); 凍干是一種很好的長期保存法(如條件具備),在大多數(shù)情況下可以 很好地保存蛋白的活性,但不適于某些蛋白(因有些蛋白對(duì)凍干重溶 時(shí)必然產(chǎn)生的鹽離子濃度的
18、急劇變化反應(yīng)不佳,其活性會(huì)永久喪失(應(yīng)具體對(duì)待,尚無規(guī)律可循)。另:蛋白聚集與二硫鍵形成是兩個(gè)概念,巰基乙醇只負(fù)責(zé)維持SH的 游離狀態(tài),形成二硫鍵是一化學(xué)反應(yīng),產(chǎn)生純凈物,聚集一般只通過 一些離子鍵、范德華力、疏水力形成,可以用物理方法分開。答:較長時(shí)間的保存最好用DTT。在加入緩沖液中24小時(shí)內(nèi),巰基 乙醇被氧化,其后可加速蛋白的失活,而DTT不危及蛋白質(zhì)的巰基。編輯版word 因此,最好是在制備蛋白質(zhì)樣品的時(shí)候用大約12mmol/L巰基乙醇, 而長期儲(chǔ)存則使用1-5mmol/L的DTT。(見蛋白質(zhì)技術(shù)手冊)另外,我有印象看產(chǎn)品目錄的時(shí)候,看到有一種用于western的試劑 盒,提供的試劑可
19、以在還原二硫鍵之后在巰基上烷基化,這樣就防止 了二硫鍵的再次生成。.抗體抗體儲(chǔ)存容器應(yīng)由不吸附蛋白質(zhì)的材料制成,常用的有聚丙烯, 聚碳酸酯和硼硅酸玻璃。如儲(chǔ)存的抗體中蛋白濃度很低(10-100Mg/L),就應(yīng)另加隔離蛋白以減少容器對(duì)抗體蛋白的吸附, 隔離蛋白常用0.1%-1.0%的牛血清白蛋白。絕大多數(shù)已稀釋的抗體應(yīng)存在4-8條件下,以免凍融對(duì)抗體 蛋白產(chǎn)生有害效應(yīng)??贵w原液和已分離的免疫球蛋白組分應(yīng)保存于 -20條件下,并避免反復(fù)凍融。冷凍的抗體溶液應(yīng)置于室溫中緩慢 地解凍,應(yīng)絕對(duì)避免用高溫快速解凍。被細(xì)菌污染的抗體常會(huì)出現(xiàn)假陽性結(jié)果,應(yīng)將污染的抗體溶液及 其他試劑棄之。為防止細(xì)菌污染,可于
20、抗體溶液中加入0.01%疊氮鈉。 抗體經(jīng)真空冷凍干燥后置-20以下可保存3-5年。保存稀釋后的單抗應(yīng)加入0.1%疊氮鈉濃度。大多數(shù)稀釋抗體可進(jìn) 行冷凍保存,少數(shù)抗體可能會(huì)丟失抗原活性。大多數(shù)單抗,只要蛋白 濃度適當(dāng),可在4下保存數(shù)月。其他注意事項(xiàng):編輯版word分裝可以最大程度的降低反復(fù)凍融對(duì)抗體活性的損害,同時(shí)也降 低了由于多次從同一管中吸取抗體造成的污染可能性。分裝的量以一 次實(shí)驗(yàn)用完為好,最少不能少于10ul每份。因?yàn)榉盅b體積越小,抗體 的濃度越可能會(huì)受到蒸發(fā)以及管壁吸附的影響。復(fù)融后的分裝抗體如果一次用不完,將剩余母液保存在4oC,避 免再凍起來!抗體工作液應(yīng)該當(dāng)天配制當(dāng)天用完,在4o
21、C盡量不要 超過1天。絕對(duì)避免將抗體保存在自動(dòng)除霜冰箱中。盡量將抗體保存 在冰箱里層,而不是門上。無論是保存還是運(yùn)輸,絕對(duì)避免反復(fù)凍融!反復(fù)凍融會(huì)導(dǎo)致抗體 變性,導(dǎo)致多聚體形成,從而降低抗體的結(jié)合能力!蛋白在高濃度時(shí)更不容易降解(1 mg/ml或者更高),這就是為 什么在抗體中加入85人之類作為穩(wěn)定劑的原因了;另一方面,加入 的蛋白也可以減少抗體由于管壁吸附所造成的損失。但是如果抗體要 用來標(biāo)記的話,則不能加入蛋白穩(wěn)定劑,因?yàn)檫@些穩(wěn)定劑會(huì)和抗體一 起競爭結(jié)合標(biāo)記物。為了防止微生物污染,疊氮化鈉經(jīng)常被加入到抗體中(終濃度 0.02% (w/v)。疊氮化鈉會(huì)干擾任何含有氨基基團(tuán)的偶聯(lián),因此在 進(jìn)行
22、偶聯(lián)之前,應(yīng)將疊氮化鈉去除。偶聯(lián)后的抗體可以加入疊氮化鈉 保存,但是濃度只能是0.01%。對(duì)于需要偶聯(lián)的抗體,thimerosal (merthiolate)可以替代疊氮化鈉作為保護(hù)劑!編輯版word注:疊氮化鈉的去除方式:可以通過凝膠電泳或過濾的方式去除! IgG的分子量是150kDa (IgM是600kDa);疊氮化鈉的分子量只有65Da。使用cut off 14kDa 的濾膜即可將疊氮化鈉從抗體中去除。純化IgG:不要保存稀釋的抗體,高濃度有利于保存。IgG會(huì)粘附 于玻璃或塑料,低于0.1mg/ml的蛋白會(huì)很快被吸收并變性失去活性。下面是我的讀書筆記,內(nèi)容全部摘錄自味也8 Antibod
23、ies這本 書。該書中專門有Handling Antibodies這樣一個(gè)章節(jié),對(duì)于像我這樣 的入門級(jí)還是很有啟發(fā)的。首先要樹立的一個(gè)觀念是“抗體可一點(diǎn)兒都不脆弱,很強(qiáng)悍 的”。“Antibodies have a compact three-domain structure that has evolved to retain activity in most biological settings. One practical advantage of such compact and stable protein domain is that they are resistant to
24、a broad range of mildly denaturing conditions, making long-term storage of antibodies relatively easy. Storage buffers seldom need to be supplemented with glycerol or other stabilizing compounds that are commonly added to help maintain the activity of proteins purified in the lab.”經(jīng)常使用的抗體可以4保存;長期保存可
25、以置于-20?!癢orking solutions of antibodies are conveniently stored at 4. At this temperature they are stable for months to years without loss of activity. For編輯版word long-term storage, antibodies can be kept conveniently at -20 in the serum, tissue culture supernatant, or ascitic fluid in which they ar
26、e collected. Lower temperatures will not hurt the antibody activities, but there is no significant advantage in lower-temperature storage.”也有例外,不是所有抗體在4都穩(wěn)定,有些得在常溫保存?!癟he only group of antibodies that should not be stored at 4 are the so-called cryoproteins, which are sensitive to low-temperature sto
27、rage, where they precipitate. Some mouse antibodies of the IgG3 subclass may fit these characteristics. If antibodies precipitate at 4 over time, they should be kept at room temperature with addition of sodium azide.”盡管抗體很穩(wěn)定,還是要避免反復(fù)凍融,因?yàn)樗赡茉斐煽贵w活力的 喪失。原因是“Antibody solutions should not be frozen and t
28、hawed repeatedly, because this can lead to denaturation of antibodies that may lead to unwanted protein-protein aggregation. Aggregation of antibodies can cause the loss of activity due to steric interference of the antigen combining site or by generating insoluble material that is lost during centr
29、ifugation or filtration.”抗體到底可以保存多長時(shí)間?什么?十年?“Antibodies are remarkably stable. If tightly sealed to avoid evaporation, they can be stored at 4 for months with no loss of activity. Antibodies stored at -20 have been shown to keep their activity for decades.”編輯版word這么強(qiáng)悍!那,抗體到底怕什么?The only problem comm
30、only encountered in storing antibodies is contamination of these solutions with bacteria or fUngi. This can be prevented by addition of antimicrobial agents; for example, by adding sodium azide to 0.02% or, as an alternative, Merthiolate to 0.01%.”何時(shí)需要添加疊氮化納?什么時(shí)候又不能添加?“Although usefUl and effective
31、for most settings, sodium azide is not appropriate in some assays, because it blocks the cytochrome electron transport system and therefore is toxic to most organisms. In addition, the primary amine on the azide would attack the stability of the antibodys interaction with conjugate or matrix in coupling methods. If sodium azide is already present in a solution, it can be removed by dialysis or gel filtration.”自己純化的抗體,保存的時(shí)候要注意什么?Purified preparations of antibodies are stable in most commonly used buffers. The pH should be kept
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