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文檔簡介
1、一 實驗原理 以(抗體和抗原)之間的專一性作用為基礎(chǔ)的用于研究(蛋白質(zhì)相互作用)的經(jīng)典方法。是確定兩種蛋白質(zhì)在完整(細(xì)胞內(nèi)生理性)相互作用的有效方法。 如果用蛋白質(zhì)X的抗體免疫沉淀X,那么與X在體內(nèi)結(jié)合的蛋白質(zhì)Y也能沉淀下來。 問題:細(xì)胞怎樣保持生理狀態(tài)-不變性?抗X一 實驗原理 以(抗體和抗原)之間的專一性作用為基應(yīng)用與區(qū)別測定兩種目標(biāo)蛋白質(zhì)是否在體內(nèi)結(jié)合確定一種特定蛋白質(zhì)的新的作用搭檔 與只取決于檢測焦點是初級靶分子(抗原)還是次級靶分子(相互作用蛋白)應(yīng)用與區(qū)別實驗基本原理1.提取蛋白2.在細(xì)胞裂解液中加入抗X的抗體3.孵育后再加入 A或G(于 上) 若細(xì)胞中有與興趣蛋白結(jié)合的目的蛋白,
2、就可以形成復(fù)合物:“YX抗X抗體 A或G3.經(jīng)變性、聚丙烯酰胺凝膠電泳,復(fù)合物又被分開。(抗原、x抗體)有一個很重要的特性就是能與抗體的段結(jié)合 瓊脂糖珠實驗基本原理1.提取蛋白有一個很重要的特性就是能與抗體的段結(jié)原理圖解原理圖解瓊脂糖珠復(fù)合物 A是一種金黃色葡萄球菌細(xì)胞壁蛋白質(zhì),能特異性地與人和哺乳動物抗體(主要是)的區(qū)結(jié)合。目前多用 預(yù)先結(jié)合在 上。瓊脂糖珠復(fù)合物 A是一種金黃色葡萄球菌細(xì)胞壁蛋白質(zhì),能特異性的作用及具體原理“捕獲”抗體,形成復(fù)合物, 抗體-目的蛋白 非共價健結(jié)合 共價結(jié)合加樣緩沖液-煮沸變性-離心 管(抗體-目的蛋白-少量非特異性吸附蛋白)。的作用及具體原理“捕獲”抗體,形
3、成復(fù)合物,二 特征優(yōu)點(1 相互作用的蛋白質(zhì)都是經(jīng)翻譯后修飾的,處于天然狀態(tài)(2 蛋白的相互作用是在自然狀態(tài)下進(jìn)行的,可以避免人為的影響(3 可以分離得到天然狀態(tài)的相互作用蛋白復(fù)合物二 特征優(yōu)點二 特征局限性(1 可能檢測不到低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)相互作用(2 兩種蛋白質(zhì)的結(jié)合可能不是直接結(jié)合,有第三者在中間起橋梁作用;(3 必須在實驗前預(yù)測目的蛋白是什么,以選擇最后檢測的抗體,若預(yù)測不正確,實驗就得不到結(jié)果。二 特征局限性 三 實驗流程 提取細(xì)胞總蛋白 離心,上清電泳(抗原抗體) 準(zhǔn)備珠子,洗3遍 珠子加入蛋白裂解液(去除非特異性蛋白背景) 離心去珠子,取上清 測蛋白濃度 (法) 加一
4、抗反應(yīng)(4過夜) 加珠子捕捉復(fù)合物 (室溫1h或4過夜) 離心,收集沉淀,預(yù)冷 洗3遍 上樣緩沖液懸浮沉淀,加熱游離抗原、抗體、珠子 三 實驗流程 四 實驗結(jié)果分析 分析質(zhì)譜分析檢測目的蛋白四 實驗結(jié)果分析結(jié)果分析 標(biāo)難曲線只對同一塊凝膠上的樣品的分子量測定才具有可靠性。 以每個蛋白標(biāo)準(zhǔn)的分子量對數(shù)對它的相對遷移率作圖得標(biāo)準(zhǔn)曲線,量出未知蛋白的遷移率即可測出其分于量。 結(jié)果分析 標(biāo)難曲線只對同一塊凝膠上的樣品的分一抗一抗一抗(兔抗) 曝光后的蛋白條帶二抗 (辣根酶標(biāo)記的羊抗兔)X光片曝光顯影 試劑含有轉(zhuǎn)印蛋白的膜 +轉(zhuǎn)印膜上蛋白檢測示意圖 結(jié)果分析一抗一抗一抗(兔抗) 曝光后的蛋白條帶二抗 (
5、辣根酶標(biāo)記的羊與質(zhì)譜分析流程與質(zhì)譜分析流程三 實驗的關(guān)鍵1. 實驗最需要注意點就是抗體的性質(zhì)。特別是多抗的特異性是問題。2. 為防止蛋白的分解、修飾,溶解抗原的緩沖液必須加蛋白酶抑制劑,低溫下進(jìn)行實驗。3. 考慮抗體/緩沖液的比例。抗體過少就不能檢出抗原,過多則就不能沉降在上,殘存在上清。緩沖劑太少則不能溶解抗原,過多則抗原被稀釋。4. 確定蛋白間的相互作用是發(fā)生在細(xì)胞中,而不是由于細(xì)胞的溶解才發(fā)生的,這需要進(jìn)行蛋白質(zhì)的定位來確定。?三 實驗的關(guān)鍵注意的問題:1.裂解液 細(xì)胞裂解采用溫和的裂解條件,不能破壞細(xì)胞內(nèi)存在的所有蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)相互作用,多采用非離子變性劑(40或 100)。每種細(xì)胞的裂
6、解條件是不一樣的,通過經(jīng)驗確定。 不能用高濃度的變性劑(0.2),細(xì)胞裂解液中要加各種酶抑制劑,如商品化的。注意的問題:1.裂解液 細(xì)胞裂解采用溫和的裂解條件,不能破裂解液普利萊基因技術(shù)有限公司100 : 50 ( 7.4), 150 , 1% 40, 0.1% .(100元)說明:1. 裂解液臨用前可新鮮加入最終濃度為1的或其它蛋白酶抑制劑。2. 裂解液中蛋白樣品含有較高濃度的去垢劑,不能用法但可用法或改良法測定蛋白濃度裂解液普利萊基因技術(shù)有限公司100 :裂解液成分 國內(nèi)博士: 細(xì)胞裂解液: 50 (7.5), 150 , 0.540, 1 使用前加入至終濃度1、 (混合物)。 劉巖 30
7、0 20 , 8.0, 300 , 0.2 , 10% (甘油), 0.2 , 0.2 20裂解液成分 國內(nèi)博士:2.1免疫沉淀中抗體的選擇2.1免疫沉淀中抗體的選擇注意的問題:2.2抗體使用對照抗體:(陰性和陽性) 陰性:單克隆抗體:同一種屬的 兔多克隆抗體:正常兔 陽性:細(xì)胞內(nèi)某種蛋白的抗體(做膜蛋白A,用膜蛋白B)注意的問題:2.2抗體使用對照抗體:(陰性和陽性)未檢測到目得蛋白或蛋白很少 可能原因 處理方法1.樣品被蛋白酶降解: 添加蛋白酶抑制劑;所有操作保持4以下冰上操作并防止凍融2.抗體濃度太低:調(diào)整抗體濃度,必要時設(shè)立濃度梯度,摸索最佳濃度3.抗抗體親合力太低: 選用適合于和/或的相應(yīng)抗體4抗體未與珠子結(jié)合: 選用適合于的相應(yīng)珠子,正確保存防止變質(zhì)或干燥5未暴露在融合蛋白構(gòu)象的表面:改變?nèi)诤媳磉_(dá)部位6.裂解液嚴(yán)謹(jǐn)度太高: 改用低嚴(yán)謹(jǐn)度裂解液未檢測到目得蛋白或蛋白很少 可能原因 目得蛋白高背景:可能原因 處理方法非特異蛋白結(jié)合 在無血清培養(yǎng)液中裂解細(xì)胞; 在免疫沉淀前用 ()珠子預(yù)洗, 免疫沉淀后增加漂洗次數(shù)和嚴(yán)謹(jǐn)度(高鹽或去垢劑)裂解液嚴(yán)謹(jǐn)度太低 改用高嚴(yán)謹(jǐn)度裂解液實驗儀器或液體被污染 使用潔凈的儀器或液體轉(zhuǎn)移膜上的非特異吸附 戴手套, 用鑷子夾取, 不要接觸膜轉(zhuǎn)移面目得蛋白高背
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