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第11章轉(zhuǎn)座子和逆轉(zhuǎn)座子
TransposonsandretrotansposonsThesun1642tomatovarietyproducesanelongatedfruit,which
isproducedbyaduplicationthataroseasaresultofthepresenceofthetransposableelementRider.第11章轉(zhuǎn)座子和逆轉(zhuǎn)座子
Transposonsan1轉(zhuǎn)座子
(transposon,Tn)
基因組中可以從一個(gè)基因座轉(zhuǎn)移到另一個(gè)基因座,具有移動(dòng)能力的一段DNA片段。
ADNAsequencecapableofmoving(transposing)fromonelocationtoanotherinagenome.2轉(zhuǎn)座子(transposon,Tn)基因組中可以從一個(gè)2DiscoveryofTransposableElementsMcClintock’sexperimentsinmaize:theDselement
1940-19503轉(zhuǎn)座因子的發(fā)現(xiàn)DiscoveryofTransposableElem3印第安彩虹玉米,具有從最大到最小易于區(qū)分的10對染色體。解離因子
(Dissociation,Ds):locatedatthesiteofthebreak激活因子
(Activator,Ac)
:unlinkedgeneticfactor4印第安彩虹玉米,具有從最大到最小易于區(qū)分的10對染色體。解離4555
TransposableelementinE.coli
,
19606TransposableelementinE.c6轉(zhuǎn)座子的分類7非復(fù)制性的轉(zhuǎn)座(占已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的多數(shù))復(fù)制性逆轉(zhuǎn)座逆轉(zhuǎn)座病毒樣的轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座子的分類7非復(fù)制性的轉(zhuǎn)座復(fù)制性逆轉(zhuǎn)座逆轉(zhuǎn)座病毒樣的轉(zhuǎn)座子7第一節(jié)細(xì)菌的轉(zhuǎn)座因子TransposableelementsinBacteria
兩大類:簡單轉(zhuǎn)座因子:只包含和轉(zhuǎn)座有關(guān)的基因序列。Simpletransposableelements
whichcarryonlytheinformationrequiredformovement.復(fù)合轉(zhuǎn)座因子:除了含有與轉(zhuǎn)座相關(guān)的基因外還有其它基因(如抗生素抗性基因)。ComplextransposableelementswhichcontainDNAsequencesnotdirectlyrelatedtotransposition.8第一節(jié)細(xì)菌的轉(zhuǎn)座因子兩大類:881.插入序列
(Insertionsequences,IS)
9不含任何宿主基因的可轉(zhuǎn)位的DNA序列,是最簡單的轉(zhuǎn)座因子。1.插入序列(Insertionsequences,IS9插入序列的結(jié)構(gòu)ThestructureofISelement10插入序列的結(jié)構(gòu)101011正向重復(fù)序列反向重復(fù)序列11正向重復(fù)序列反向重復(fù)序列11121212插入序列末端兩重復(fù)序列高度相似但不完全相同。AnISelementendsinshortinvertedterminalrepeats;usuallythetwocopiesoftherepeatarecloselyrelatedratherthanidentical.插入序列的中間序列常具有編碼轉(zhuǎn)座酶的功能。ISelementscodeforthetransposase.插入序列轉(zhuǎn)座后常導(dǎo)致靶位點(diǎn)的重復(fù)。WhenanISelementtransposes,asequenceofhostDNAatthesiteofinsertionisduplicated.13插入序列特點(diǎn):插入序列末端兩重復(fù)序列高度相似但不完全相同。13插入序列特點(diǎn)13DuplicationofashortsequenceofDNAattheinsertionsite14Duplicationofashortsequenc14TheISelementsarenormalconstituentsofbacterialchromosomesandplasmids.15TheISelementsarenormalcon15FormationofaconjugativeRplasmidbyrecombinationbetweenISelements16(Resistancetransferfactore,RTF)細(xì)菌耐藥性FormationofaconjugativeRp162.復(fù)合轉(zhuǎn)座子CompositeTransposons
CompositetransposonscontainavarietyofgenesthatresidebetweentwonearlyidenticalISelements.CompositetransposonisdesignatedbyTn,followedbyanumber.17四環(huán)素2.復(fù)合轉(zhuǎn)座子17四環(huán)素1718氯霉素四環(huán)素卡拉霉素18氯霉素四環(huán)素卡拉霉素18一些復(fù)合轉(zhuǎn)座子兩端的IS序列完全相同的,如Tn9和Tn903。Insomecases,ISmodulesareidentical,suchasTn9(directrepeatsofIS1)orTn903(invertedrepeatsofIS903).另外一些轉(zhuǎn)座子中,IS非常相似但不完全相同,因而用R和L表示。Inothercases,themodulesarecloselyrelated,butnotidentical.SowecandistinguishtheLandRmodulesinTn10orinTn5.復(fù)合轉(zhuǎn)座子特點(diǎn):一些復(fù)合轉(zhuǎn)座子兩端的IS序列完全相同的,如Tn9和Tn90319Aschematicmapofaplasmidcarryingsimpleandcompositetransposon-resistancegenes.20Aschematicmapofaplasmidc20IS序列既可以自我轉(zhuǎn)座又可以和復(fù)合轉(zhuǎn)座子共同轉(zhuǎn)座。AfunctionalISmodulecantransposeeitheritselfortheentiretransposon.當(dāng)IS序列完全相同時(shí),兩者均可獨(dú)立進(jìn)行轉(zhuǎn)座。WhenthetwoISmodulesareidentical,eithermodulecansponsorthetransposition.當(dāng)IS序列不完全相同時(shí),兩者之一引發(fā)轉(zhuǎn)座,L。Whenthemodulesaredifferent,transpositioncandependononeofthemodulesIS序列既可以自我轉(zhuǎn)座又可以和復(fù)合轉(zhuǎn)座子共同轉(zhuǎn)座。213.非復(fù)合型轉(zhuǎn)座子Noncompositetransposons22轉(zhuǎn)座酶抑制酶氨芐青霉素抗性反向重復(fù)序列3.非復(fù)合型轉(zhuǎn)座子Noncompositetranspo2223共整合體23共整合體23第二節(jié)真核生物的轉(zhuǎn)座因子
TransposableElementsinEukaryotesDNA轉(zhuǎn)座子
(cutandpastetransposons)AcandDselementsinmaizePelementsinDrosophila反轉(zhuǎn)座子(Retrotransposons)24第二節(jié)真核生物的轉(zhuǎn)座因子
TransposableEl241.玉米的Ac-Ds轉(zhuǎn)座系統(tǒng)
(TheAc-Dssysteminmaize)BarbaraMcClintock(1902-1992)1940s~1950s1983NobelPrize251.玉米的Ac-Ds轉(zhuǎn)座系統(tǒng)
(Th2526Movie26Movie26玉米中轉(zhuǎn)座因子效應(yīng)27?玉米中轉(zhuǎn)座因子效應(yīng)27?27282828其它植物中的轉(zhuǎn)座因子Transposableelementinotherplantspeassnapdragons29SBE直鏈支鏈其它植物中的轉(zhuǎn)座因子peassnapdragons29SBE29雜交劣育(Hybriddysgenesis):aconditioncausingsterility,elevatedmutationrate,andachromosomerearrangementintheoffspringofcrossesbetweencertainstrainsoffruitflies.
302.果蠅的P因子
PelementtransposonsinDrosophilia302.果蠅的P因子3031313132反向重復(fù)序列體細(xì)胞生殖細(xì)胞終止密碼子阻遏蛋白轉(zhuǎn)座酶32反向重體細(xì)胞生殖細(xì)胞終止密碼子阻遏蛋白轉(zhuǎn)座酶3266KD的轉(zhuǎn)座阻遏蛋白是造成現(xiàn)象差異的主要原因。(The66KDrepressorproteinisprovidedasamaternalfactorintheegg)3366KD的轉(zhuǎn)座阻遏蛋白是造成現(xiàn)象差異的主要原因。(Th33P-element-mediatedgenetransferinDrosophila34P-element-mediatedgene34343.反轉(zhuǎn)錄病毒與反轉(zhuǎn)座子
RetrovirusesandRetroposons
反轉(zhuǎn)錄病毒:單鏈的RNA病毒,依靠獨(dú)立的雙鏈DNA中間體結(jié)構(gòu)進(jìn)行感染。Retroviruses
aresingle-strandedRNAanimalvirusesthatemployadouble-strandedDNAintermediateforreplication.353.反轉(zhuǎn)錄病毒與反轉(zhuǎn)座子
Retroviruses35363636※Thelifecycleofaretrovirus※37※Thelifecycleofaretroviru37Thetypicalgenomeofaretroviruscontainsgag,pol,andenvgenes逆轉(zhuǎn)錄病毒基因表達(dá)38菱形衣殼蛋白外殼蛋白逆轉(zhuǎn)錄酶病毒側(cè)翼序列Thetypicalgenomeofaretrov38逆轉(zhuǎn)錄病毒可隨機(jī)整合到宿主細(xì)胞。TheviralDNAintegratesintothehostgenomeatrandomlyselectedsites.有時(shí)(幾率較?。┠孓D(zhuǎn)錄病毒可能將宿主細(xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤細(xì)胞。Sometimes(probablyratherrarely),theintegratedretroviruscanconvertahostcellintoatumorigenicstatethroughactivatingcertaintypesofhostgenes.39逆轉(zhuǎn)錄病毒可隨機(jī)整合到宿主細(xì)胞。393940啟動(dòng)子增強(qiáng)子40啟動(dòng)子40逆轉(zhuǎn)座子(Retroposon)
逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子指通過RNA為中介,反轉(zhuǎn)錄成DNA后進(jìn)行轉(zhuǎn)座的轉(zhuǎn)座因子。逆轉(zhuǎn)座作用出現(xiàn)在真核生物。
(TransposableelementsthatutilizereversetranscriptasetotransposethroughanRNAintermediatearetermedretrotransposons.)退化的逆病毒逆轉(zhuǎn)座子(Retroposon)逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子指41424242
逆轉(zhuǎn)座子在真核生物中可分為兩類:
病毒樣逆轉(zhuǎn)座子
(Viralretrotransposons):
與反轉(zhuǎn)錄病毒結(jié)構(gòu)類似,不同之處在于不形成病毒顆粒。
如YeastTyelements,Drosophila
copia
elements
非病毒樣逆轉(zhuǎn)座子
(Nonviralretrotransposons)
:
不形成逆轉(zhuǎn)錄酶和整合酶,依靠外源提供的轉(zhuǎn)座酶,真核生物基因組中所占比例最高。
LINEs(longinterspersedelements)and
SINEs
inmammals43逆轉(zhuǎn)座子在真核生物中可分為兩類:4343病毒與真核生物基因組中逆轉(zhuǎn)座子結(jié)構(gòu)比較44鼠白血病毒病毒與真核生物基因組中逆轉(zhuǎn)座子結(jié)構(gòu)比較44鼠白血病毒44酵母TY系列(YeastTyelements)About35Ty1copiesintheyeastgenome.
δsequences:330bp,about100copies.
soloδelement.45酵母TY系列(YeastTyelements)Abo45**3.Basesubstitutionformarkingoneδ
TranspositionthroughanRNAintermediate462.半乳糖誘導(dǎo)啟動(dòng)子1實(shí)驗(yàn)證明:**3.Basesubstitutionformark46Drosophila
copiaelements47Drosophilacopiaelements4747轉(zhuǎn)座因子的頻率不同的轉(zhuǎn)座因子的轉(zhuǎn)座頻率不同。每個(gè)世代轉(zhuǎn)座頻率約為10-3~10-4
。Newgerm-linetranspositionsareestimatedtooccuronceinevery50to100humanbirths.每個(gè)世代中轉(zhuǎn)座插入靶位點(diǎn)使某個(gè)基因所引起的突變和自發(fā)突變概率相當(dāng),約為10-5~
10-7
。48第三節(jié)轉(zhuǎn)座的遺傳學(xué)效應(yīng)
Geneticeffectoftransposition轉(zhuǎn)座因子的頻率不同的轉(zhuǎn)座因子的轉(zhuǎn)座頻率不同。48第三節(jié)轉(zhuǎn)4849TransposableelementsasgeneticparasitesReplicationandspreadofTesmayservenopurposeforthecell.TheinsertionofTesintoagenewilloftendestroyitsfunction,withharmfulconsequencesforthecell.ThetimeandenergyrequiretoreplicatelargenumbersofTesarelikelytoplaceametabolicburdenonthecell.49Transposableelementsasgen49人類中的轉(zhuǎn)座子50人類中的轉(zhuǎn)座子5050Repetitiveelementsfoundinthehumangene(HGO)codingforhomogentisate1,2-dioxygenase(尿黑酸-1,2-氧化酶),theenzymewhosedeficiencycausesalkaptonuria(尿黑酸尿).TheAlusequencesmakeupmorethan10%ofthehumangenome.51Repetitiveelementsfoundint51Transposableelementsingrassesareresponsibleforgenomesizedifferences其它生物中的轉(zhuǎn)座因子Green:transposons;Orange:genes52Transposableelementsingrass52轉(zhuǎn)座因子引起的遺傳效應(yīng)基因突變(編碼區(qū))染色體結(jié)構(gòu)改變(非編碼區(qū))轉(zhuǎn)座因子引起的遺傳效應(yīng)基因突變(編碼區(qū))53TransposobleelementcangeneratemutationsinadjacentgenesAbout50%ofallspontaneousmutationsinDrosophilaareduetotransposition,10%(mouse),0.2%(human).54Transposobleelementcangener54Retrotransposon-InducedMutationsinGrapeSkinColorSCIENCE,14MAY2004,VOL30455Retrotransposon-InducedSCIENCE55Transposableelementscancauserearrangementsofthegenomedeletioninversion56Transposableelementscancaus56Relocategenes57Relocategenes5757EvolutionarySignificanceofTransposableElements轉(zhuǎn)座子的馴化Transposase(轉(zhuǎn)座酶)regulateplantgenesinArabidopsisTelomeraseandreversetranscriptase(果蠅)
58EvolutionarySignificanceofT58HowdoplantsandanimalssurviveandthrivewithsomanyinsertionsingenesandsomuchmobileDNAinthegenome?安全島(safeheavens)多拷貝基因(基因組較小的生物)宿主細(xì)胞表觀遺傳調(diào)控宿主與轉(zhuǎn)座因子在細(xì)胞內(nèi)處于不斷博弈過程中。59Howdoplantsandanimalssurv59思考題:1、結(jié)合所學(xué)的知識,試分析一些致病菌極易產(chǎn)生抗藥性的原因?2、試分析生物是如何避免基因組中轉(zhuǎn)座行為所引起有害突變的。思考題:1、結(jié)合所學(xué)的知識,試分析一些致病菌極易產(chǎn)生抗藥性的60第11章轉(zhuǎn)座子和逆轉(zhuǎn)座子
TransposonsandretrotansposonsThesun1642tomatovarietyproducesanelongatedfruit,which
isproducedbyaduplicationthataroseasaresultofthepresenceofthetransposableelementRider.第11章轉(zhuǎn)座子和逆轉(zhuǎn)座子
Transposonsan61轉(zhuǎn)座子
(transposon,Tn)
基因組中可以從一個(gè)基因座轉(zhuǎn)移到另一個(gè)基因座,具有移動(dòng)能力的一段DNA片段。
ADNAsequencecapableofmoving(transposing)fromonelocationtoanotherinagenome.62轉(zhuǎn)座子(transposon,Tn)基因組中可以從一個(gè)62DiscoveryofTransposableElementsMcClintock’sexperimentsinmaize:theDselement
1940-195063轉(zhuǎn)座因子的發(fā)現(xiàn)DiscoveryofTransposableElem63印第安彩虹玉米,具有從最大到最小易于區(qū)分的10對染色體。解離因子
(Dissociation,Ds):locatedatthesiteofthebreak激活因子
(Activator,Ac)
:unlinkedgeneticfactor64印第安彩虹玉米,具有從最大到最小易于區(qū)分的10對染色體。解離6465565
TransposableelementinE.coli
,
196066TransposableelementinE.c66轉(zhuǎn)座子的分類67非復(fù)制性的轉(zhuǎn)座(占已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的多數(shù))復(fù)制性逆轉(zhuǎn)座逆轉(zhuǎn)座病毒樣的轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座子的分類7非復(fù)制性的轉(zhuǎn)座復(fù)制性逆轉(zhuǎn)座逆轉(zhuǎn)座病毒樣的轉(zhuǎn)座子67第一節(jié)細(xì)菌的轉(zhuǎn)座因子TransposableelementsinBacteria
兩大類:簡單轉(zhuǎn)座因子:只包含和轉(zhuǎn)座有關(guān)的基因序列。Simpletransposableelements
whichcarryonlytheinformationrequiredformovement.復(fù)合轉(zhuǎn)座因子:除了含有與轉(zhuǎn)座相關(guān)的基因外還有其它基因(如抗生素抗性基因)。ComplextransposableelementswhichcontainDNAsequencesnotdirectlyrelatedtotransposition.68第一節(jié)細(xì)菌的轉(zhuǎn)座因子兩大類:8681.插入序列
(Insertionsequences,IS)
69不含任何宿主基因的可轉(zhuǎn)位的DNA序列,是最簡單的轉(zhuǎn)座因子。1.插入序列(Insertionsequences,IS69插入序列的結(jié)構(gòu)ThestructureofISelement70插入序列的結(jié)構(gòu)107071正向重復(fù)序列反向重復(fù)序列11正向重復(fù)序列反向重復(fù)序列71721272插入序列末端兩重復(fù)序列高度相似但不完全相同。AnISelementendsinshortinvertedterminalrepeats;usuallythetwocopiesoftherepeatarecloselyrelatedratherthanidentical.插入序列的中間序列常具有編碼轉(zhuǎn)座酶的功能。ISelementscodeforthetransposase.插入序列轉(zhuǎn)座后常導(dǎo)致靶位點(diǎn)的重復(fù)。WhenanISelementtransposes,asequenceofhostDNAatthesiteofinsertionisduplicated.73插入序列特點(diǎn):插入序列末端兩重復(fù)序列高度相似但不完全相同。13插入序列特點(diǎn)73DuplicationofashortsequenceofDNAattheinsertionsite74Duplicationofashortsequenc74TheISelementsarenormalconstituentsofbacterialchromosomesandplasmids.75TheISelementsarenormalcon75FormationofaconjugativeRplasmidbyrecombinationbetweenISelements76(Resistancetransferfactore,RTF)細(xì)菌耐藥性FormationofaconjugativeRp762.復(fù)合轉(zhuǎn)座子CompositeTransposons
CompositetransposonscontainavarietyofgenesthatresidebetweentwonearlyidenticalISelements.CompositetransposonisdesignatedbyTn,followedbyanumber.77四環(huán)素2.復(fù)合轉(zhuǎn)座子17四環(huán)素7778氯霉素四環(huán)素卡拉霉素18氯霉素四環(huán)素卡拉霉素78一些復(fù)合轉(zhuǎn)座子兩端的IS序列完全相同的,如Tn9和Tn903。Insomecases,ISmodulesareidentical,suchasTn9(directrepeatsofIS1)orTn903(invertedrepeatsofIS903).另外一些轉(zhuǎn)座子中,IS非常相似但不完全相同,因而用R和L表示。Inothercases,themodulesarecloselyrelated,butnotidentical.SowecandistinguishtheLandRmodulesinTn10orinTn5.復(fù)合轉(zhuǎn)座子特點(diǎn):一些復(fù)合轉(zhuǎn)座子兩端的IS序列完全相同的,如Tn9和Tn90379Aschematicmapofaplasmidcarryingsimpleandcompositetransposon-resistancegenes.80Aschematicmapofaplasmidc80IS序列既可以自我轉(zhuǎn)座又可以和復(fù)合轉(zhuǎn)座子共同轉(zhuǎn)座。AfunctionalISmodulecantransposeeitheritselfortheentiretransposon.當(dāng)IS序列完全相同時(shí),兩者均可獨(dú)立進(jìn)行轉(zhuǎn)座。WhenthetwoISmodulesareidentical,eithermodulecansponsorthetransposition.當(dāng)IS序列不完全相同時(shí),兩者之一引發(fā)轉(zhuǎn)座,L。Whenthemodulesaredifferent,transpositioncandependononeofthemodulesIS序列既可以自我轉(zhuǎn)座又可以和復(fù)合轉(zhuǎn)座子共同轉(zhuǎn)座。813.非復(fù)合型轉(zhuǎn)座子Noncompositetransposons82轉(zhuǎn)座酶抑制酶氨芐青霉素抗性反向重復(fù)序列3.非復(fù)合型轉(zhuǎn)座子Noncompositetranspo8283共整合體23共整合體83第二節(jié)真核生物的轉(zhuǎn)座因子
TransposableElementsinEukaryotesDNA轉(zhuǎn)座子
(cutandpastetransposons)AcandDselementsinmaizePelementsinDrosophila反轉(zhuǎn)座子(Retrotransposons)84第二節(jié)真核生物的轉(zhuǎn)座因子
TransposableEl841.玉米的Ac-Ds轉(zhuǎn)座系統(tǒng)
(TheAc-Dssysteminmaize)BarbaraMcClintock(1902-1992)1940s~1950s1983NobelPrize851.玉米的Ac-Ds轉(zhuǎn)座系統(tǒng)
(Th8586Movie26Movie86玉米中轉(zhuǎn)座因子效應(yīng)87?玉米中轉(zhuǎn)座因子效應(yīng)27?87882888其它植物中的轉(zhuǎn)座因子Transposableelementinotherplantspeassnapdragons89SBE直鏈支鏈其它植物中的轉(zhuǎn)座因子peassnapdragons29SBE89雜交劣育(Hybriddysgenesis):aconditioncausingsterility,elevatedmutationrate,andachromosomerearrangementintheoffspringofcrossesbetweencertainstrainsoffruitflies.
902.果蠅的P因子
PelementtransposonsinDrosophilia302.果蠅的P因子9091319192反向重復(fù)序列體細(xì)胞生殖細(xì)胞終止密碼子阻遏蛋白轉(zhuǎn)座酶32反向重體細(xì)胞生殖細(xì)胞終止密碼子阻遏蛋白轉(zhuǎn)座酶9266KD的轉(zhuǎn)座阻遏蛋白是造成現(xiàn)象差異的主要原因。(The66KDrepressorproteinisprovidedasamaternalfactorintheegg)9366KD的轉(zhuǎn)座阻遏蛋白是造成現(xiàn)象差異的主要原因。(Th93P-element-mediatedgenetransferinDrosophila94P-element-mediatedgene34943.反轉(zhuǎn)錄病毒與反轉(zhuǎn)座子
RetrovirusesandRetroposons
反轉(zhuǎn)錄病毒:單鏈的RNA病毒,依靠獨(dú)立的雙鏈DNA中間體結(jié)構(gòu)進(jìn)行感染。Retroviruses
aresingle-strandedRNAanimalvirusesthatemployadouble-strandedDNAintermediateforreplication.953.反轉(zhuǎn)錄病毒與反轉(zhuǎn)座子
Retroviruses95963696※Thelifecycleofaretrovirus※97※Thelifecycleofaretroviru97Thetypicalgenomeofaretroviruscontainsgag,pol,andenvgenes逆轉(zhuǎn)錄病毒基因表達(dá)98菱形衣殼蛋白外殼蛋白逆轉(zhuǎn)錄酶病毒側(cè)翼序列Thetypicalgenomeofaretrov98逆轉(zhuǎn)錄病毒可隨機(jī)整合到宿主細(xì)胞。TheviralDNAintegratesintothehostgenomeatrandomlyselectedsites.有時(shí)(幾率較小)逆轉(zhuǎn)錄病毒可能將宿主細(xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤細(xì)胞。Sometimes(probablyratherrarely),theintegratedretroviruscanconvertahostcellintoatumorigenicstatethroughactivatingcertaintypesofhostgenes.99逆轉(zhuǎn)錄病毒可隨機(jī)整合到宿主細(xì)胞。3999100啟動(dòng)子增強(qiáng)子40啟動(dòng)子100逆轉(zhuǎn)座子(Retroposon)
逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子指通過RNA為中介,反轉(zhuǎn)錄成DNA后進(jìn)行轉(zhuǎn)座的轉(zhuǎn)座因子。逆轉(zhuǎn)座作用出現(xiàn)在真核生物。
(TransposableelementsthatutilizereversetranscriptasetotransposethroughanRNAintermediatearetermedretrotransposons.)退化的逆病毒逆轉(zhuǎn)座子(Retroposon)逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子指10110242102
逆轉(zhuǎn)座子在真核生物中可分為兩類:
病毒樣逆轉(zhuǎn)座子
(Viralretrotransposons):
與反轉(zhuǎn)錄病毒結(jié)構(gòu)類似,不同之處在于不形成病毒顆粒。
如YeastTyelements,Drosophila
copia
elements
非病毒樣逆轉(zhuǎn)座子
(Nonviralretrotransposons)
:
不形成逆轉(zhuǎn)錄酶和整合酶,依靠外源提供的轉(zhuǎn)座酶,真核生物基因組中所占比例最高。
LINEs(longinterspersedelements)and
SINEs
inmammals103逆轉(zhuǎn)座子在真核生物中可分為兩類:43103病毒與真核生物基因組中逆轉(zhuǎn)座子結(jié)構(gòu)比較104鼠白血病毒病毒與真核生物基因組中逆轉(zhuǎn)座子結(jié)構(gòu)比較44鼠白血病毒104酵母TY系列(YeastTyelements)About35Ty1copiesintheyeastgenome.
δsequences:330bp,about100copies.
soloδelement.105酵母TY系列(YeastTyelements)Abo105**3.Basesubstitutionformarkingoneδ
TranspositionthroughanRNAintermediate1062.半乳糖誘導(dǎo)啟動(dòng)子1實(shí)驗(yàn)證明:**3.Basesubstitutionformark106Drosophila
copiaelements107Drosophilacopiaelements47107轉(zhuǎn)座因子的頻率不同的轉(zhuǎn)座因子的轉(zhuǎn)座頻率不同。每個(gè)世代轉(zhuǎn)座頻率約為10-3~10-4
。Newgerm-linetranspositionsareestimatedtooccuronceinevery50to100humanbirths.每個(gè)世代中轉(zhuǎn)座插入靶位點(diǎn)使某個(gè)基因所引起的突變和自發(fā)突變概率相當(dāng),約為10-5~
10-7
。108第三節(jié)轉(zhuǎn)座的遺傳學(xué)效應(yīng)
Geneticeffectoftransposition轉(zhuǎn)座因子的頻率不同的轉(zhuǎn)座因子的轉(zhuǎn)座頻率不同。48第三節(jié)轉(zhuǎn)108109TransposableelementsasgeneticparasitesReplicationandspreadofTesmayservenopurposeforthecell.TheinsertionofTesintoagenewilloftendestroyitsfunction,
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