HID IonAmpliSeq始祖推斷試劑盒 ThermoFisherScientific課件

新一代測(cè)序技術(shù)在疑難案件中的應(yīng)用新一代測(cè)序技術(shù)在疑難案件中的應(yīng)用CE—法庭DNA檢測(cè)技術(shù)金標(biāo)準(zhǔn)三十年的法庭科學(xué)DNA技術(shù)發(fā)展過(guò)程中,CE技術(shù)屢立奇功,目前大多數(shù)案件能夠用CE+STR的方法解決數(shù)據(jù)可靠、工作簡(jiǎn)單、快速、經(jīng)濟(jì)、數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)DNA擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性人類(lèi)重復(fù)序列DNA探針復(fù)合擴(kuò)增STR位點(diǎn)的DNA分型新一代技術(shù)的融入？CE—法庭DNA檢測(cè)技術(shù)金標(biāo)準(zhǔn)三十年的法庭科學(xué)DNA技術(shù)發(fā)展

DNA檢驗(yàn)技術(shù)1985年才開(kāi)始運(yùn)用于法庭科學(xué)檢驗(yàn)鑒定中，但由于可以到達(dá)個(gè)人認(rèn)定的作用發(fā)展迅速。20多年的發(fā)展，DNA從DNA指紋圖發(fā)展到STR檢驗(yàn)。DNA實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)靈敏度得到了提高，可以檢測(cè)到ng(10－6g

)級(jí)STRs英國(guó)第一起移民糾紛案

的DNA指紋圖高降解識(shí)別率高識(shí)別率能自動(dòng)分型結(jié)果數(shù)字化快速分型檢驗(yàn)時(shí)間縮短基于PCR方法微量DNA等位基因不連鎖費(fèi)用較貴信息量大

DNA檢驗(yàn)技術(shù)1985年才開(kāi)始運(yùn)用于法庭科學(xué)檢驗(yàn)鑒定中，但主要有以下幾方面的作用1、同一認(rèn)定：除同卵雙生的雙胞胎、骨髓移植的患者外，兩個(gè)人基因分型相同的概率只有100億分之一（10－10）。主要有以下幾方面的作用1、同一認(rèn)定：除同卵雙生的雙胞胎、骨髓2、親緣認(rèn)定（遺傳關(guān)系）2、親緣認(rèn)定（遺傳關(guān)系）母系遺傳（mtDNA）母系遺傳（mtDNA）父系遺傳（Y染色體）?uncle3rdcousinThomasJeffersonIIFieldJeffersonPeterJeffersonPresidentThomasJeffersonEstonHemingsThomasWoodsonDifferentYHaplotypeSameYHaplotypeJeffersonYHaplotypeJeffersonYHaplotype?父系遺傳（Y染色體）?uncle3rdcousinThom

3、現(xiàn)場(chǎng)重建3、現(xiàn)場(chǎng)重建1of6

樣本高度降解，僅能得到部分、甚至得不到STR圖譜復(fù)雜混合樣本解釋

復(fù)雜親緣關(guān)系鑒定未知來(lái)源的組織、體液溯源表型推斷始祖推斷……當(dāng)前法醫(yī)DNA實(shí)驗(yàn)室的挑戰(zhàn)更高的要求，更多的挑戰(zhàn)1of6樣本高度降解，僅能得到部分、甚至得不到STR圖譜當(dāng)疑難案件的檢測(cè)有待新技術(shù)的融入10混合檢測(cè)降解/痕量檢材數(shù)據(jù)庫(kù)無(wú)記錄疑難復(fù)雜家系但CE本身技術(shù)上的局限性,無(wú)法在一些疑難案件上取得實(shí)質(zhì)性的突破,領(lǐng)域中需要有新技術(shù)的融入疑難案件的檢測(cè)有待新技術(shù)的融入10混合檢測(cè)降解/痕量檢材數(shù)據(jù)新一代測(cè)序技術(shù)的引入新一代測(cè)序技術(shù)(NextGenerationSequencing)也稱(chēng)高通量測(cè)序同時(shí)能測(cè)幾千到幾百萬(wàn)的DNA片段，后續(xù)通過(guò)組裝和對(duì)比完成。下一代測(cè)序平臺(tái)能測(cè)到200-400bp，甚至更長(zhǎng)。高通量；全基因組；高覆蓋度新一代測(cè)序技術(shù)的引入新一代測(cè)序技術(shù)(NextGenerat廣東省廳NGS平臺(tái)一覽1of6廣東省廳NGS平臺(tái)一覽1of6124SNP位點(diǎn)（含90個(gè)常染色體位點(diǎn)和34個(gè)Y染色體位點(diǎn)）Pirangesfrom1x10-31–6x10-35擴(kuò)增長(zhǎng)度短(平均132,141nts,)適合降解DNA推薦1ng起始DNA對(duì)于43KenKiddSNPs，有99.99%的一致性微量、高度降解檢材,復(fù)雜親緣關(guān)系輔助鑒定HID-IonAmpliSeq?身份鑒定試劑盒124SNP位點(diǎn)（含90個(gè)常染色體位點(diǎn)和34個(gè)Y染色體位點(diǎn)Coverage%PositiveGenotypeMajor

Allele每個(gè)SNP位點(diǎn)信息樣本間的比對(duì)Y單倍型預(yù)測(cè)HID-IonAmpliSeq?身份鑒定試劑盒Coverage%PositiveGenotypeMajo因祖墳遷移事件，80余歲的事主無(wú)法確定祖墳內(nèi)究竟是否是自己的祖墳。故需要做相關(guān)親緣鑒定。但由于嚴(yán)重降解,毛細(xì)管電泳技術(shù)無(wú)法得到有效的分型。故通過(guò)二代測(cè)序技術(shù)進(jìn)行進(jìn)一步的檢測(cè)

NGS案例應(yīng)用(1):高度降解檢材檢材狀況：案件背景檢材狀況因祖墳遷移事件，80余歲的事主無(wú)法確定祖墳

NGS案例應(yīng)用(1):高度降解檢材牙齒檢材:參照血卡:牙齒檢材已經(jīng)嚴(yán)重降解,無(wú)法得到有效分型,并進(jìn)行下一步的鑒定NGS案例應(yīng)用(1):高度降解檢材牙齒檢材:參照血卡:牙齒

NGS案例應(yīng)用(1):高度降解檢材NGS結(jié)果展示:NGS案例應(yīng)用(1):高度降解檢材NGS結(jié)果展示:利用IDpanel進(jìn)行個(gè)體識(shí)別身份驗(yàn)證：牙齒檢材對(duì)照檢材符合孟德?tīng)栆?guī)律位點(diǎn)不符合孟德?tīng)栆?guī)律的位點(diǎn)常染色體位點(diǎn)79906811Y染色體位點(diǎn)24

3423

1全部位點(diǎn)1031249112NGS測(cè)序結(jié)果顯示，90個(gè)常染色SNP位點(diǎn)中，雙方均出齊的位點(diǎn)為79個(gè)，其中有11個(gè)位點(diǎn)不符合孟德?tīng)栠z傳規(guī)律。且Y位點(diǎn)有一個(gè)位點(diǎn)不一致，故排除墳?zāi)怪械墓嗜耸鞘轮鞯纳?/p>

NGS案例應(yīng)用(1):高度降解檢材利用IDpanel進(jìn)行個(gè)體識(shí)別身份驗(yàn)證：牙齒檢材最終信息常染色體位點(diǎn)Y染色體位點(diǎn)共出位點(diǎn)無(wú)名尸結(jié)果741993因無(wú)相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)和對(duì)照樣本，所以無(wú)法進(jìn)行相關(guān)比對(duì)。但是可建議放入宗卷，以便將來(lái)數(shù)據(jù)庫(kù)或其他參照樣本可以進(jìn)行對(duì)比利用IDpanel進(jìn)行個(gè)體識(shí)別身份驗(yàn)證：CE結(jié)果顯示無(wú)名尸骨高度降解：

NGS案例應(yīng)用(2):高度降解無(wú)名尸最終信息常染色體位點(diǎn)Y染色體位點(diǎn)共出位點(diǎn)無(wú)名尸結(jié)果7鑒定莫XX和莫XX的丈夫是否為孩子A和孩子B的親身父母。莫XX為骨髓移植患者，且移植已多年，效果不錯(cuò)，考慮其血液可能表現(xiàn)為供體基因分型，遂要求采其口腔拭子、血拭子、指甲和頭發(fā)；要求提供骨髓移植供體的血拭子；其丈夫、孩子A、孩子B的口腔拭子共8份檢材，使用IdentitySNPPanel在PGM平臺(tái)上檢測(cè)。同時(shí)使用GlobalFiler試劑盒結(jié)果作為參照.

NGS案例應(yīng)用(3):移植患者親子鑒定鑒定莫XX和莫XX的丈夫是否為孩子A和孩子B的親身父母。N莫XX、莫XX丈夫、兩個(gè)孩子的SNP分型符合孟德?tīng)栠z傳；該結(jié)果與使用GlobalFiler做出來(lái)的結(jié)果完全一致。莫XX血液與骨髓供體的SNP分型完全一致；與自身頭發(fā)分型不一致。莫XX頭發(fā)、指甲的SNP分型完全一致；Samples莫-口腔莫丈夫-口腔孩子B-口腔莫-血骨髓供體-血孩子A-口腔莫-頭發(fā)莫-指甲莫-口腔

67798888819191莫丈夫-口腔67

686565686262孩子B-口腔7968

7373868282莫-血886573

100767979骨髓供體-血886573100

767979孩子A-口腔8168867676

8282莫-頭發(fā)916282797982

100莫-指甲916282797982100

NGS案例應(yīng)用(3):移植患者親子鑒定莫XX、莫XX丈夫、兩個(gè)孩子的SNP分型符合孟德?tīng)栠z傳；該結(jié)Bone,teeth,andhairarethetypicalbiologicalsourcesleftfrommissingpersonsorremains失蹤人員/無(wú)名尸體常見(jiàn)生物性檢材：骨頭、牙齒、頭發(fā)IonAmpliSeq?technologycanstreamlinethemtGenomesequencingworkflowIonAmpliSeq技術(shù)科簡(jiǎn)化線粒體基因組測(cè)序流程線粒體全基因組/高變區(qū)測(cè)序試劑盒Averageampliconlengthis163ntAverageampliconoverlapof11ntIonAmpliSeq?mtGenome

Panels線粒體全基因組測(cè)序Bone,teeth,andhairarethe打拐工作開(kāi)展過(guò)程中懷疑安徽省的沈某（現(xiàn)年43歲）是山西省的連某（現(xiàn)年59歲，疑似姐姐）家中走失親人。由于年事已高，雙親皆故。所以需要進(jìn)行疑似親姐妹全同胞/半同胞鑒定。解決思路：

若直接采取傳統(tǒng)CE對(duì)全同胞進(jìn)行檢測(cè)需要檢測(cè)進(jìn)行至少超過(guò)39個(gè)STR位點(diǎn)，在根據(jù)IBS評(píng)分來(lái)進(jìn)行斷定，若IBS評(píng)分為42分以上，準(zhǔn)確率在百分之九十五以上。但其是建立在全同胞的基礎(chǔ)，結(jié)合打拐案情，可直接對(duì)兩者的線粒體進(jìn)行測(cè)序，判斷是否來(lái)自同一母系。

NGS案例應(yīng)用(4):疑似親姐妹打拐鑒定案件背景常規(guī)思路NGS案例應(yīng)用(4):疑似親姐妹打拐鑒定案件背景常規(guī)思路線粒體二代測(cè)序結(jié)果展示軟件分析的參考序列參考序列序列在該位點(diǎn)上的分型測(cè)試樣本在該位點(diǎn)上的分型線粒體二代測(cè)序結(jié)果展示軟件分析的參考序列參考序列序列在該位點(diǎn)連某沈某一致位點(diǎn)不一致位點(diǎn)線粒體全基因組25271326高變區(qū)24424高變區(qū)14618通過(guò)線粒體全基因組測(cè)序，排除連某與沈某是來(lái)自于同一母系連某沈某一致位點(diǎn)不一致位點(diǎn)線粒體全基因組25271326高變：

若直接采取傳統(tǒng)CE對(duì)全同胞進(jìn)行檢測(cè)需要檢測(cè)進(jìn)行至少超過(guò)39個(gè)STR位點(diǎn)，在根據(jù)IBS評(píng)分來(lái)進(jìn)行斷定，若IBS評(píng)分為42分以上，準(zhǔn)確率在百分之九十五以上。但其是建立在全同胞的基礎(chǔ)，結(jié)合打拐案情，可直接對(duì)兩者的線粒體進(jìn)行測(cè)序，判斷是否來(lái)自同一母系。

NGS案例應(yīng)用(5):疑似親姐妹打拐鑒定案件背景常規(guī)思路：NGS案例應(yīng)用(5):疑似親姐妹打拐鑒定案件背景常規(guī)思路疑似妹妹疑似姐姐一致位點(diǎn)不一致位點(diǎn)線粒體全基因組4848471高變區(qū)25550高變區(qū)14440通過(guò)線粒體全基因組測(cè)序，不排除兩份受檢者來(lái)自于同一母系PS:不一致位點(diǎn)為疑似姐姐在非高變區(qū)存在一個(gè)點(diǎn)異質(zhì)性變異疑似妹妹疑似姐姐一致位點(diǎn)不一致位點(diǎn)線粒體全基因組484847沒(méi)有嫌疑人，DNA數(shù)據(jù)庫(kù)未比中始祖推斷或者表型推斷，如眼睛顏色、頭發(fā)顏色和皮膚顏色，可以給案件偵查提供更多線索HID-IonAmpliSeq?祖先推斷試劑盒擴(kuò)增子長(zhǎng)度短(平均長(zhǎng)度122;130nt)推薦1ng起始DNA55KenKiddSNPs，99.77%的一致性165常染色體SNP沒(méi)有嫌疑人，DNA數(shù)據(jù)庫(kù)未比中HID-IonAmpliSe版式設(shè)計(jì)版式設(shè)計(jì)165常染色體SNP適合案件檢材或者降解DNA擴(kuò)增片段短(平均122;130nt)推薦1ng起始DNA對(duì)于55個(gè)

KenKiddSNP，有99.77%一致性HID-IonAmpliSeq?始祖推斷試劑盒版式設(shè)計(jì)版式設(shè)計(jì)HID-IonAmpliSeq?始祖推斷試對(duì)實(shí)驗(yàn)室積累種族樣本,包括5個(gè)封閉的滿族家系和5個(gè)封閉的新疆家系進(jìn)行始祖定位始祖認(rèn)定二代測(cè)序結(jié)果展示對(duì)實(shí)驗(yàn)室積累種族樣本,包括5個(gè)封閉的滿族家系和5個(gè)封閉的新疆5組封閉滿族種族定位：盡管都能定位到Han-HapMap,但是無(wú)法在地域上進(jìn)一步細(xì)分

NGS案例應(yīng)用(6):滿族及維族始祖認(rèn)定5組封閉滿族種族定位：盡管都能定位到Han-HapMap,但五組新疆建庫(kù)樣本種族定位：基本能夠定位在和維族遺傳很近的民族(Hazara),在地域定位比較一致準(zhǔn)確

NGS案例應(yīng)用(6):滿族及維族始祖認(rèn)定五組新疆建庫(kù)樣本種族定位：基本能夠定位在和維族遺傳很近的民族NGS-STR用于CE輔助的優(yōu)勢(shì)更加適合降解檢材：容納更多的mini-STR獲得更多的信息：同一分型不同序列NGS-STR用于CE輔助的優(yōu)勢(shì)更加適合降解檢材：容納更多的NGS-STR用于CE輔助的優(yōu)勢(shì)—可以給予更多信息9947A，NGS-D8S1179基因分形結(jié)果基因分型的結(jié)果類(lèi)似于CE的展示結(jié)果同一基因型不同分型的結(jié)果NGS-STR用于CE輔助的優(yōu)勢(shì)—可以給予更多信息9947ACE-STR復(fù)雜家系NGS-STR驗(yàn)證(1)

將十余對(duì)CE-STR復(fù)雜家系用STR-panel進(jìn)行驗(yàn)證：一致案例父親分型：11,13母親分型：8，98，12子代分型：CE-STR復(fù)雜家系NGS-STR驗(yàn)證(1)

將十余對(duì)CE-CE-STR復(fù)雜家系NGS-STR驗(yàn)證(2)

4,1413,13

4,13父親NGS分型：母親NGS分型：子代NGS分型：家系背景通過(guò)CE結(jié)果顯示父親在D19S433的分型為14,14.目前在D19S433的分型為13,13.小孩的分型為13,13.初步判定為時(shí)一個(gè)一步突變的家系.故用新一代測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行STR分型驗(yàn)證.CE結(jié)果與二代測(cè)序不符,且二代測(cè)序結(jié)果符合孟德?tīng)栠z傳定律CE-STR復(fù)雜家系NGS-STR驗(yàn)證(2)

4,1413CE-STR復(fù)雜家系NGS-STR驗(yàn)證(2)

CE-STR復(fù)雜家系NGS-STR驗(yàn)證(2)

/1138案件背景重新采用ID-PLUS試劑盒對(duì)結(jié)果進(jìn)行CE驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)父親和子代在D19S433基因座上確實(shí)存在4型的稀有突變,由于4型離基因座較遠(yuǎn),且接近引物序列,大小約為80bp,故被忽略./1138案件背景重新采用ID-PNGS在法庭科學(xué)應(yīng)用面臨的挑戰(zhàn)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)和相關(guān)指南的出臺(tái)基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫(kù)的建立及與一代STR數(shù)據(jù)庫(kù)的兼容性適合于中國(guó)人群的群體數(shù)據(jù)建立大量數(shù)據(jù)的信息挖掘及處理價(jià)格昂貴軟件及更多試劑盒NGS在法庭科學(xué)應(yīng)用面臨的挑戰(zhàn)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)和相關(guān)指南的出臺(tái)新一代測(cè)序技術(shù)在疑難案件中的應(yīng)用新一代測(cè)序技術(shù)在疑難案件中的應(yīng)用CE—法庭DNA檢測(cè)技術(shù)金標(biāo)準(zhǔn)三十年的法庭科學(xué)DNA技術(shù)發(fā)展過(guò)程中,CE技術(shù)屢立奇功,目前大多數(shù)案件能夠用CE+STR的方法解決數(shù)據(jù)可靠、工作簡(jiǎn)單、快速、經(jīng)濟(jì)、數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)DNA擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性人類(lèi)重復(fù)序列DNA探針復(fù)合擴(kuò)增STR位點(diǎn)的DNA分型新一代技術(shù)的融入？CE—法庭DNA檢測(cè)技術(shù)金標(biāo)準(zhǔn)三十年的法庭科學(xué)DNA技術(shù)發(fā)展

DNA檢驗(yàn)技術(shù)1985年才開(kāi)始運(yùn)用于法庭科學(xué)檢驗(yàn)鑒定中，但由于可以到達(dá)個(gè)人認(rèn)定的作用發(fā)展迅速。20多年的發(fā)展，DNA從DNA指紋圖發(fā)展到STR檢驗(yàn)。DNA實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)靈敏度得到了提高，可以檢測(cè)到ng(10－6g

)級(jí)STRs英國(guó)第一起移民糾紛案

的DNA指紋圖高降解識(shí)別率高識(shí)別率能自動(dòng)分型結(jié)果數(shù)字化快速分型檢驗(yàn)時(shí)間縮短基于PCR方法微量DNA等位基因不連鎖費(fèi)用較貴信息量大

DNA檢驗(yàn)技術(shù)1985年才開(kāi)始運(yùn)用于法庭科學(xué)檢驗(yàn)鑒定中，但主要有以下幾方面的作用1、同一認(rèn)定：除同卵雙生的雙胞胎、骨髓移植的患者外，兩個(gè)人基因分型相同的概率只有100億分之一（10－10）。主要有以下幾方面的作用1、同一認(rèn)定：除同卵雙生的雙胞胎、骨髓2、親緣認(rèn)定（遺傳關(guān)系）2、親緣認(rèn)定（遺傳關(guān)系）母系遺傳（mtDNA）母系遺傳（mtDNA）父系遺傳（Y染色體）?uncle3rdcousinThomasJeffersonIIFieldJeffersonPeterJeffersonPresidentThomasJeffersonEstonHemingsThomasWoodsonDifferentYHaplotypeSameYHaplotypeJeffersonYHaplotypeJeffersonYHaplotype?父系遺傳（Y染色體）?uncle3rdcousinThom

3、現(xiàn)場(chǎng)重建3、現(xiàn)場(chǎng)重建1of6

樣本高度降解，僅能得到部分、甚至得不到STR圖譜復(fù)雜混合樣本解釋

復(fù)雜親緣關(guān)系鑒定未知來(lái)源的組織、體液溯源表型推斷始祖推斷……當(dāng)前法醫(yī)DNA實(shí)驗(yàn)室的挑戰(zhàn)更高的要求，更多的挑戰(zhàn)1of6樣本高度降解，僅能得到部分、甚至得不到STR圖譜當(dāng)疑難案件的檢測(cè)有待新技術(shù)的融入49混合檢測(cè)降解/痕量檢材數(shù)據(jù)庫(kù)無(wú)記錄疑難復(fù)雜家系但CE本身技術(shù)上的局限性,無(wú)法在一些疑難案件上取得實(shí)質(zhì)性的突破,領(lǐng)域中需要有新技術(shù)的融入疑難案件的檢測(cè)有待新技術(shù)的融入10混合檢測(cè)降解/痕量檢材數(shù)據(jù)新一代測(cè)序技術(shù)的引入新一代測(cè)序技術(shù)(NextGenerationSequencing)也稱(chēng)高通量測(cè)序同時(shí)能測(cè)幾千到幾百萬(wàn)的DNA片段，后續(xù)通過(guò)組裝和對(duì)比完成。下一代測(cè)序平臺(tái)能測(cè)到200-400bp，甚至更長(zhǎng)。高通量；全基因組；高覆蓋度新一代測(cè)序技術(shù)的引入新一代測(cè)序技術(shù)(NextGenerat廣東省廳NGS平臺(tái)一覽1of6廣東省廳NGS平臺(tái)一覽1of6124SNP位點(diǎn)（含90個(gè)常染色體位點(diǎn)和34個(gè)Y染色體位點(diǎn)）Pirangesfrom1x10-31–6x10-35擴(kuò)增長(zhǎng)度短(平均132,141nts,)適合降解DNA推薦1ng起始DNA對(duì)于43KenKiddSNPs，有99.99%的一致性微量、高度降解檢材,復(fù)雜親緣關(guān)系輔助鑒定HID-IonAmpliSeq?身份鑒定試劑盒124SNP位點(diǎn)（含90個(gè)常染色體位點(diǎn)和34個(gè)Y染色體位點(diǎn)Coverage%PositiveGenotypeMajor

Allele每個(gè)SNP位點(diǎn)信息樣本間的比對(duì)Y單倍型預(yù)測(cè)HID-IonAmpliSeq?身份鑒定試劑盒Coverage%PositiveGenotypeMajo因祖墳遷移事件，80余歲的事主無(wú)法確定祖墳內(nèi)究竟是否是自己的祖墳。故需要做相關(guān)親緣鑒定。但由于嚴(yán)重降解,毛細(xì)管電泳技術(shù)無(wú)法得到有效的分型。故通過(guò)二代測(cè)序技術(shù)進(jìn)行進(jìn)一步的檢測(cè)

NGS案例應(yīng)用(1):高度降解檢材檢材狀況：案件背景檢材狀況因祖墳遷移事件，80余歲的事主無(wú)法確定祖墳

NGS案例應(yīng)用(1):高度降解檢材牙齒檢材:參照血卡:牙齒檢材已經(jīng)嚴(yán)重降解,無(wú)法得到有效分型,并進(jìn)行下一步的鑒定NGS案例應(yīng)用(1):高度降解檢材牙齒檢材:參照血卡:牙齒

NGS案例應(yīng)用(1):高度降解檢材NGS結(jié)果展示:NGS案例應(yīng)用(1):高度降解檢材NGS結(jié)果展示:利用IDpanel進(jìn)行個(gè)體識(shí)別身份驗(yàn)證：牙齒檢材對(duì)照檢材符合孟德?tīng)栆?guī)律位點(diǎn)不符合孟德?tīng)栆?guī)律的位點(diǎn)常染色體位點(diǎn)79906811Y染色體位點(diǎn)24

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1全部位點(diǎn)1031249112NGS測(cè)序結(jié)果顯示，90個(gè)常染色SNP位點(diǎn)中，雙方均出齊的位點(diǎn)為79個(gè)，其中有11個(gè)位點(diǎn)不符合孟德?tīng)栠z傳規(guī)律。且Y位點(diǎn)有一個(gè)位點(diǎn)不一致，故排除墳?zāi)怪械墓嗜耸鞘轮鞯纳?/p>

NGS案例應(yīng)用(1):高度降解檢材利用IDpanel進(jìn)行個(gè)體識(shí)別身份驗(yàn)證：牙齒檢材最終信息常染色體位點(diǎn)Y染色體位點(diǎn)共出位點(diǎn)無(wú)名尸結(jié)果741993因無(wú)相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)和對(duì)照樣本，所以無(wú)法進(jìn)行相關(guān)比對(duì)。但是可建議放入宗卷，以便將來(lái)數(shù)據(jù)庫(kù)或其他參照樣本可以進(jìn)行對(duì)比利用IDpanel進(jìn)行個(gè)體識(shí)別身份驗(yàn)證：CE結(jié)果顯示無(wú)名尸骨高度降解：

NGS案例應(yīng)用(2):高度降解無(wú)名尸最終信息常染色體位點(diǎn)Y染色體位點(diǎn)共出位點(diǎn)無(wú)名尸結(jié)果7鑒定莫XX和莫XX的丈夫是否為孩子A和孩子B的親身父母。莫XX為骨髓移植患者，且移植已多年，效果不錯(cuò)，考慮其血液可能表現(xiàn)為供體基因分型，遂要求采其口腔拭子、血拭子、指甲和頭發(fā)；要求提供骨髓移植供體的血拭子；其丈夫、孩子A、孩子B的口腔拭子共8份檢材，使用IdentitySNPPanel在PGM平臺(tái)上檢測(cè)。同時(shí)使用GlobalFiler試劑盒結(jié)果作為參照.

NGS案例應(yīng)用(3):移植患者親子鑒定鑒定莫XX和莫XX的丈夫是否為孩子A和孩子B的親身父母。N莫XX、莫XX丈夫、兩個(gè)孩子的SNP分型符合孟德?tīng)栠z傳；該結(jié)果與使用GlobalFiler做出來(lái)的結(jié)果完全一致。莫XX血液與骨髓供體的SNP分型完全一致；與自身頭發(fā)分型不一致。莫XX頭發(fā)、指甲的SNP分型完全一致；Samples莫-口腔莫丈夫-口腔孩子B-口腔莫-血骨髓供體-血孩子A-口腔莫-頭發(fā)莫-指甲莫-口腔

67798888819191莫丈夫-口腔67

686565686262孩子B-口腔7968

7373868282莫-血886573

100767979骨髓供體-血886573100

767979孩子A-口腔8168867676

8282莫-頭發(fā)916282797982

100莫-指甲916282797982100

NGS案例應(yīng)用(3):移植患者親子鑒定莫XX、莫XX丈夫、兩個(gè)孩子的SNP分型符合孟德?tīng)栠z傳；該結(jié)Bone,teeth,andhairarethetypicalbiologicalsourcesleftfrommissingpersonsorremains失蹤人員/無(wú)名尸體常見(jiàn)生物性檢材：骨頭、牙齒、頭發(fā)IonAmpliSeq?technologycanstreamlinethemtGenomesequencingworkflowIonAmpliSeq技術(shù)科簡(jiǎn)化線粒體基因組測(cè)序流程線粒體全基因組/高變區(qū)測(cè)序試劑盒Averageampliconlengthis163ntAverageampliconoverlapof11ntIonAmpliSeq?mtGenome

Panels線粒體全基因組測(cè)序Bone,teeth,andhairarethe打拐工作開(kāi)展過(guò)程中懷疑安徽省的沈某（現(xiàn)年43歲）是山西省的連某（現(xiàn)年59歲，疑似姐姐）家中走失親人。由于年事已高，雙親皆故。所以需要進(jìn)行疑似親姐妹全同胞/半同胞鑒定。解決思路：

若直接采取傳統(tǒng)CE對(duì)全同胞進(jìn)行檢測(cè)需要檢測(cè)進(jìn)行至少超過(guò)39個(gè)STR位點(diǎn)，在根據(jù)IBS評(píng)分來(lái)進(jìn)行斷定，若IBS評(píng)分為42分以上，準(zhǔn)確率在百分之九十五以上。但其是建立在全同胞的基礎(chǔ)，結(jié)合打拐案情，可直接對(duì)兩者的線粒體進(jìn)行測(cè)序，判斷是否來(lái)自同一母系。

NGS案例應(yīng)用(4):疑似親姐妹打拐鑒定案件背景常規(guī)思路NGS案例應(yīng)用(4):疑似親姐妹打拐鑒定案件背景常規(guī)思路線粒體二代測(cè)序結(jié)果展示軟件分析的參考序列參考序列序列在該位點(diǎn)上的分型測(cè)試樣本在該位點(diǎn)上的分型線粒體二代測(cè)序結(jié)果展示軟件分析的參考序列參考序列序列在該位點(diǎn)連某沈某一致位點(diǎn)不一致位點(diǎn)線粒體全基因組25271326高變區(qū)24424高變區(qū)14618通過(guò)線粒體全基因組測(cè)序，排除連某與沈某是來(lái)自于同一母系連某沈某一致位點(diǎn)不一致位點(diǎn)線粒體全基因組25271326高變：

若直接采取傳統(tǒng)CE對(duì)全同胞進(jìn)行檢測(cè)需要檢測(cè)進(jìn)行至少超過(guò)39個(gè)STR位點(diǎn)，在根據(jù)IBS評(píng)分來(lái)進(jìn)行斷定，若IBS評(píng)分為42分以上，準(zhǔn)確率在百分之九十五以上。但其是建立在全同胞的基礎(chǔ)，結(jié)合打拐案情，可直接對(duì)兩者的線粒體進(jìn)行測(cè)序，判斷是否來(lái)自同一母系。

NGS案例應(yīng)用(5):疑似親姐妹打拐鑒定案件背景常規(guī)思路：NGS案例應(yīng)用(5):疑似親姐妹打拐鑒定案件背景常規(guī)思路疑似妹妹疑似姐姐一致位點(diǎn)不一致位點(diǎn)線粒體全基因組4848471高變區(qū)25550高變區(qū)14440通過(guò)線粒體全基因組測(cè)序，不排除兩份受檢者來(lái)自于同一母系PS:不一致位點(diǎn)為疑似姐姐在非高變區(qū)存在一個(gè)點(diǎn)異質(zhì)性變異疑似妹妹疑似姐姐一致位點(diǎn)不一致位點(diǎn)線粒體全基因組484847沒(méi)有嫌疑人，DNA數(shù)據(jù)庫(kù)未比中始祖推斷或者表型推斷，如眼睛顏色、頭發(fā)顏色和皮膚顏色，可以給案件偵查提供更多線索HID-IonAmpliSeq?祖先推斷試劑盒擴(kuò)增子長(zhǎng)度短(平均長(zhǎng)度122;130nt)推薦1ng起始DNA55KenKiddSNPs，99.77%的一致性165常染色體SNP沒(méi)有嫌疑人，DNA數(shù)據(jù)庫(kù)未比中HID-IonAmpliSe版式設(shè)計(jì)版式設(shè)計(jì)165常染色體SNP適合案件檢材或者降解DNA擴(kuò)增片段短(平均122;130nt)推薦1ng起始DNA對(duì)于55個(gè)

KenKiddSNP，有99.77%一致性HID-IonAmpliSeq?始祖推斷試劑盒版式設(shè)計(jì)版式設(shè)計(jì)HID-IonAmpliSeq?始祖推斷試對(duì)實(shí)驗(yàn)室積累種族樣本,包括5