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基因表達(dá)調(diào)控09基因表達(dá)調(diào)控09第一節(jié)基因表達(dá)調(diào)控的基本概念一、基因表達(dá)的基本概念基因(gene):遺傳的基本單位,是負(fù)載特定遺傳信息的DNA片斷?;蚪M(genome):指含有一個生物體生存、發(fā)育、活動和繁殖所需要的全部遺傳信息的整套核酸?;虮磉_(dá)(geneexpression):基因轉(zhuǎn)錄與翻譯的過程。12/11/20222DepartmentofBiochemistry第一節(jié)基因表達(dá)調(diào)控的基本概念一、基因表達(dá)的基本概念12/1最新基因表達(dá)調(diào)控09課件最新基因表達(dá)調(diào)控09課件最新基因表達(dá)調(diào)控09課件最新基因表達(dá)調(diào)控09課件最新基因表達(dá)調(diào)控09課件最新基因表達(dá)調(diào)控09課件四、基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義(一)適應(yīng)環(huán)境、維持生長和增殖環(huán)境是在不斷變化的。通過調(diào)控,可使生物體表達(dá)出合適的蛋白質(zhì)分子。(二)維持細(xì)胞分化和個體發(fā)育生長、發(fā)育的不同階段,不同組織器官內(nèi)蛋白質(zhì)分子分布、種類和含量存在很大差異,這是調(diào)節(jié)細(xì)胞表型的關(guān)鍵。12/11/20229DepartmentofBiochemistry四、基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義(一)適應(yīng)環(huán)境、維持生長和增殖1不同層次上的調(diào)控一、基因表達(dá)的多級調(diào)控
基因激活
轉(zhuǎn)錄起始調(diào)控
轉(zhuǎn)錄后加工
翻譯調(diào)控
翻譯后加工轉(zhuǎn)錄起始水平的調(diào)控最為重要第二節(jié)基因表達(dá)調(diào)控的基本原理12/11/202210DepartmentofBiochemistry不同層次上的調(diào)控一、基因表達(dá)的多級調(diào)控轉(zhuǎn)錄起二、基因轉(zhuǎn)錄激活受轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白和啟動子相互作用的調(diào)節(jié)(一)特異DNA序列特異DNA序列主要指具有調(diào)節(jié)功能的DNA序列。它們決定基因的轉(zhuǎn)錄活性。原核生物大多數(shù)基因表達(dá)調(diào)控是通過操縱子機(jī)制實(shí)現(xiàn)的。真核基因調(diào)控機(jī)制普遍涉及編碼基因兩側(cè)的DNA序列——順式作用元件。12/11/202211DepartmentofBiochemistry二、基因轉(zhuǎn)錄激活受轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白和啟動子相互作用的調(diào)節(jié)(一)特1.原核生物:操縱子機(jī)制蛋白質(zhì)因子特異DNA序列編碼序列啟動序列操縱序列其他調(diào)節(jié)序列(promoter)(operator)全圖12/11/202212DepartmentofBiochemistry1.原核生物:操縱子機(jī)制蛋白質(zhì)因子特異DNA序列
操縱子(operon):通常由2個以上的編碼序列與啟動序列(promotor)、操縱序列(operator)以及其它調(diào)節(jié)序列在基因組中成簇串聯(lián)組成。啟動序列(promotor):RNA聚合酶結(jié)合并啟動轉(zhuǎn)錄的特異DNA序列。又稱啟動子。
各種原核啟動序列特定區(qū)域內(nèi)(通常在轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游-10及-35區(qū)域)存在共有序列(consensussequence)12/11/202213DepartmentofBiochemistry操縱子(operon):通常由2個以上的編碼序列與啟動序列-35盒-10,TATA盒12/11/202214DepartmentofBiochemistry-35盒-10,TATA盒12/10/202214Dep共有序列(consensussequence)決定啟動序列的轉(zhuǎn)錄活性大小。某些特異因子(蛋白質(zhì))決定RNA聚合酶對一個或一套啟動序列的特異性識別和結(jié)合能力。啟動子:指RNA聚合酶識別、結(jié)合并開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。原核生物啟動子序列按功能的不同可分為三個部位,即起始部位、結(jié)合部位、識別部位。12/11/202215DepartmentofBiochemistry共有序列(consensussequence)決定啟動序操縱序列(operator):與啟動序列毗鄰或接近的DNA序列,是原核阻遏蛋白的結(jié)合位點(diǎn)。其DNA序列常與啟動序列交錯、重疊。當(dāng)操縱序列結(jié)合有阻遏蛋白時,會阻礙RNA聚合酶與啟動序列的結(jié)合,或是RNA聚合酶不能沿DNA向前移動,阻礙轉(zhuǎn)錄。啟動序列編碼序列操縱序列pol阻遏蛋白12/11/202216DepartmentofBiochemistry操縱序列(operator):與啟動序列毗鄰或接近的DNA序其他調(diào)節(jié)序列、調(diào)節(jié)蛋白例如:激活蛋白(activator)可結(jié)合啟動序列鄰近的DNA序列,促進(jìn)RNA聚合酶與啟動序列的結(jié)合,增強(qiáng)RNA聚合酶活性。有些基因在沒有激活蛋白存在時,RNA聚合酶很少或完全不能結(jié)合啟動序列。12/11/202217DepartmentofBiochemistry其他調(diào)節(jié)序列、調(diào)節(jié)蛋白例如:12/10/202217Dep2.真核生物不同真核生物的順式作用元件中也會發(fā)現(xiàn)一些共有序列,如TATA盒、CAAT盒等,這些共有序列是RNA聚合酶或特異轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)。
順式作用元件(cis-actingelement)——可影響自身基因表達(dá)活性的DNA序列BADNA編碼序列轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)補(bǔ)充12/11/202218DepartmentofBiochemistry2.真核生物不同真核生物的順式作用元件中也會發(fā)現(xiàn)一些共有序列(二)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白-增強(qiáng)或抑制轉(zhuǎn)錄活性原核生物基因調(diào)節(jié)蛋白(DNA結(jié)合蛋白)分為三類:特異因子:決定RNA聚合酶對一個或一套啟動序列的特異性識別和結(jié)合能力。阻遏蛋白(repressor):可結(jié)合特異DNA序列——操縱序列,阻遏基因轉(zhuǎn)錄。激活蛋白(activator):可結(jié)合啟動序列鄰近的DNA序列,促進(jìn)RNA聚合酶與啟動序列的結(jié)合,增強(qiáng)RNA聚合酶活性。分解(代謝)物基因激活蛋白(catabolitegeneactivatonprotein,CAP)就是一種激活蛋白。有些基因在沒有激活蛋白存在時,RNA聚合酶很少或完全不能結(jié)合啟動序列。12/11/202219DepartmentofBiochemistry(二)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白-增強(qiáng)或抑制轉(zhuǎn)錄活性原核生物基因調(diào)節(jié)蛋白(真核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白又稱轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactor)。絕大多數(shù)真核轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子由某一基因表達(dá)后,通過與特異的順式作用元件結(jié)合(DNA-蛋白質(zhì)相互作用)反式激活另一基因的轉(zhuǎn)錄,稱為反式作用因子(trans-actingfactor)。這種調(diào)節(jié)作用稱為反式作用。12/11/202220DepartmentofBiochemistry真核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白又稱轉(zhuǎn)錄因子(transcripti順式作用蛋白還有蛋白質(zhì)因子可特異識別、結(jié)合自身基因的調(diào)節(jié)序列,調(diào)節(jié)自身基因的表達(dá),稱順式作用。12/11/202221DepartmentofBiochemistry順式作用蛋白還有蛋白質(zhì)因子可特異識別、結(jié)合自身基因的調(diào)節(jié)序列cDNAaDNAC順式調(diào)節(jié)mRNAC蛋白質(zhì)CBAmRNA蛋白質(zhì)AA反式調(diào)節(jié)補(bǔ)充12/11/202222DepartmentofBiochemistrycDNAaDNAC順式調(diào)節(jié)mRNAC蛋白質(zhì)CBA(三)DNA-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用--轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白對轉(zhuǎn)錄起始調(diào)節(jié)的方式
DNA-蛋白質(zhì)相互作用(DNA-proteininteraction)主要指反式作用因子和順式作用元件之間的特異識別。通常是非共價結(jié)合,被識別的DNA結(jié)合位點(diǎn)通常呈對稱、或不完全對稱結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(protein-proteininteraction)某些調(diào)節(jié)蛋白在結(jié)合DNA前,需通過蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,形成二聚體(dimer)或多聚體(polymer)。二聚化同二聚體異二聚體12/11/202223DepartmentofBiochemistry(三)DNA-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用DNA-蛋白質(zhì)(四)RNA聚合酶-與啟動序列/啟動子相結(jié)合1、啟動序列/啟動子與RNA聚合酶活性RNA聚合酶與其的親和力,影響轉(zhuǎn)錄。2、調(diào)節(jié)蛋白與RNA聚合酶活性一些特異調(diào)節(jié)蛋白在適當(dāng)環(huán)境信號刺激下表達(dá),然后通過DNA-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用影響RNA聚合酶活性。12/11/202224DepartmentofBiochemistry(四)RNA聚合酶-與啟動序列/啟動子相結(jié)合1、啟動序列/啟一、原核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)特點(diǎn)(一)因子決定RNA聚合酶識別特異性(二)操縱子模型的普遍性(三)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)是重要因素第三節(jié)原核基因表達(dá)調(diào)節(jié)12/11/202225DepartmentofBiochemistry一、原核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)特點(diǎn)(一)因子決定RNA聚合酶識別E.coli乳糖操縱子(lacoperon)包含:
三個結(jié)構(gòu)基因:Z編碼-半乳糖苷酶、 Y編碼通透酶、A乙?;D(zhuǎn)移酶
一個操縱序列O一個啟動序列P一個調(diào)節(jié)基因I一個分解代謝物基因激活蛋白結(jié)合位點(diǎn)(catabolitegeneactivationprotein,CAP)(一)乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)二、原核生物轉(zhuǎn)錄起始調(diào)節(jié)-操縱子調(diào)控模式12/11/202226DepartmentofBiochemistryE.coli乳糖操縱子(lacoperon)包含:三個結(jié)乳糖操縱子結(jié)構(gòu)模式調(diào)控區(qū)CAP結(jié)合位點(diǎn)啟動序列操縱序列結(jié)構(gòu)基因Z:β-半乳糖苷酶Y:透酶A:乙酰基轉(zhuǎn)移酶ZYAOPDNA12/11/202227DepartmentofBiochemistry乳糖操縱子結(jié)構(gòu)模式調(diào)控區(qū)CAP結(jié)合位點(diǎn)啟動序列操縱序列
沒有乳糖存在時,lac操縱子處于阻遏狀態(tài)。I序列表達(dá)的lac阻遏蛋白與O序列結(jié)合,阻礙RNA聚合酶與P序列結(jié)合,抑制轉(zhuǎn)錄啟動。
有乳糖存在時,lac操縱子可被誘導(dǎo)。乳糖在通透酶催化、轉(zhuǎn)運(yùn)進(jìn)入細(xì)胞,再經(jīng)-半乳糖苷酶催化,轉(zhuǎn)變成半乳糖。半乳糖作為誘導(dǎo)劑分子結(jié)合阻遏蛋白,使蛋白構(gòu)象變化,導(dǎo)致阻遏蛋白與O序列解離,發(fā)生轉(zhuǎn)錄。(二)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)圖解12/11/202228DepartmentofBiochemistry沒有乳糖存在時,lac操縱子處于阻遏狀態(tài)。I序列表達(dá)的l當(dāng)沒有葡萄糖及cAMP濃度較高時,cAMP與CAP結(jié)合,這時CAP結(jié)合在lac啟動序列附近的CAP位點(diǎn),可刺激RNA轉(zhuǎn)錄活性。當(dāng)有葡萄糖存在時,cAMP濃度較低,cAMP與CAP結(jié)合受阻,lac操縱子表達(dá)下降。(三)CAP的正性調(diào)節(jié)圖解12/11/202229DepartmentofBiochemistry當(dāng)沒有葡萄糖及cAMP濃度較高時,cAMP與CAP結(jié)合,這Lac阻遏蛋白負(fù)性調(diào)節(jié)與cAMP正性調(diào)節(jié)兩種機(jī)制協(xié)調(diào)合作單獨(dú)存在乳糖時,細(xì)菌利用乳糖作為能源。當(dāng)葡萄糖和乳糖共同存在時,細(xì)菌首先利用葡萄糖作為能源物質(zhì)。這時,葡萄糖通過降低cAMP濃度,阻礙cAMP與CAP結(jié)合而抑制lac操縱子轉(zhuǎn)錄,使細(xì)菌只能利用葡萄糖。葡萄糖對lac操縱子的阻遏作用稱分解代謝阻遏(catabolicrepression)。
(四)協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)圖解12/11/202230DepartmentofBiochemistryLac阻遏蛋白負(fù)性調(diào)節(jié)與cAMP正性調(diào)節(jié)兩種機(jī)制協(xié)調(diào)合作單獨(dú)三、原核生物轉(zhuǎn)錄終止調(diào)節(jié)大腸桿菌中存在兩種主要的轉(zhuǎn)錄終止機(jī)制:依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止不依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止大腸桿菌中存在兩種終止調(diào)節(jié)方式:衰減抗終止12/11/202231DepartmentofBiochemistry三、原核生物轉(zhuǎn)錄終止調(diào)節(jié)大腸桿菌中存在兩種主要的轉(zhuǎn)錄終止機(jī)制四、原核生物翻譯水平調(diào)節(jié)(一)蛋白質(zhì)分子結(jié)合于啟動序列或啟動序列周圍進(jìn)行自我調(diào)節(jié)調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合mRNA靶位點(diǎn),阻止核蛋白體識別翻譯起始區(qū),阻斷翻譯調(diào)節(jié)蛋白一般作用于自身mRNA,抑制自身的合成,稱自我控制(autogenouscontrol)。12/11/202232DepartmentofBiochemistry四、原核生物翻譯水平調(diào)節(jié)(一)蛋白質(zhì)分子結(jié)合于啟動序列或啟動(二)反義RNA對翻譯的調(diào)節(jié)作用調(diào)節(jié)RNA-調(diào)節(jié)基因表達(dá)的RNA分子反義RNA含有與特定mRNA翻譯起始部位互補(bǔ)的序列,通過與mRNA雜交,阻斷30S小亞基對起始密碼的識別以及與SD序列的結(jié)合,抑制翻譯起始。稱為反義控制(antisensecontrol)。12/11/202233DepartmentofBiochemistry(二)反義RNA對翻譯的調(diào)節(jié)作用調(diào)節(jié)RNA-調(diào)節(jié)基因表達(dá)的R附:其它轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)機(jī)制轉(zhuǎn)錄衰減(attenuation)色氨酸操縱子是一種阻遏型操縱子當(dāng)有色氨酸結(jié)合阻遏蛋白時,阻遏蛋白構(gòu)象改變可結(jié)合O序列,阻斷基因轉(zhuǎn)錄基因重組SOS反應(yīng)衰減重組SOS12/11/202234DepartmentofBiochemistry附:其它轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)機(jī)制轉(zhuǎn)錄衰減(attenuation)衰減重一、真核基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)(一)真核基因組結(jié)構(gòu)龐大第四節(jié)真核基因表達(dá)調(diào)節(jié)哺乳類動物基因組DNA約3×109堿基對人基因組編碼基因約有3~4個(2~2.5萬),其中60%存在可變剪接。編碼序列僅占總長的1%rDNA等重復(fù)基因約占5%~10%12/11/202235DepartmentofBiochemistry一、真核基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)(一)真核基因組結(jié)構(gòu)龐大第四節(jié)真核(二)單順反子(monocistron)即一個編碼基因轉(zhuǎn)錄生成一個mRNA分子,經(jīng)翻譯生成一條多肽鏈。(三)重復(fù)序列單拷貝序列(一次或數(shù)次)高度重復(fù)序列(106次)中度重復(fù)序列(103~104次)多拷貝序列(四)基因不連續(xù)性12/11/202236DepartmentofBiochemistry(二)單順反子(monocistron)即一個編碼基因轉(zhuǎn)錄二、真核基因表達(dá)調(diào)控特點(diǎn)(一)RNA聚合酶有三種,分別負(fù)責(zé)三種RNA轉(zhuǎn)錄。(二)轉(zhuǎn)錄激活狀態(tài)的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)明顯變化1.對核酸酶敏感活化基因常有超敏位點(diǎn),位于調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合位點(diǎn)附近。12/11/202237DepartmentofBiochemistry二、真核基因表達(dá)調(diào)控特點(diǎn)(一)RNA聚合酶(二)轉(zhuǎn)錄激活狀態(tài)2.DNA拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)變化天然雙鏈DNA均以負(fù)性超螺旋構(gòu)象存在;基因活化后RNA-pol正超螺旋負(fù)超螺旋轉(zhuǎn)錄方向3.DNA堿基修飾變化真核DNA約有5%的胞嘧啶被甲基化,甲基化范圍與基因表達(dá)程度呈反比。12/11/202238DepartmentofBiochemistry2.DNA拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)變化天然雙鏈DNA均以負(fù)性超螺旋構(gòu)象存在4.組蛋白變化①富含Lys組蛋白水平降低②H2A,H2B二聚體不穩(wěn)定性增加③組蛋白H3、H4發(fā)生乙?;?、甲基化或磷酸化修飾④H3組蛋白巰基暴露組蛋白修飾對于基因表達(dá)影響的機(jī)制也包括兩種相互包容的理論。即:組蛋白的修飾直接影響染色質(zhì)或核小體的結(jié)構(gòu),以及化學(xué)修飾征集了其他調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì),為其他功能分子與組蛋白結(jié)合搭建了一個平臺。這些理論構(gòu)成了“組蛋白密碼”的假說。12/11/202239DepartmentofBiochemistry4.組蛋白變化①富含Lys組蛋白水平降低組蛋白修飾組蛋白修飾對染色質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的影響組蛋白氨基酸殘基位點(diǎn)修飾類型功能H3Lys-4甲基化激活H3Lys-9甲基化染色質(zhì)濃縮H3Lys-9甲基化DNA甲基化所必需H3Lys-9乙?;せ頗3Ser-10磷酸化激活H3Lys-14乙?;乐筁ys-9的甲基化H3Lys-79甲基化端粒沉默H4Arg-3甲基化H4Lys-5乙?;b配H4Lys-12乙?;b配H4Lys-16乙酰化核小體裝配H4Lys-16乙?;疐lyX激活12/11/202240DepartmentofBiochemistry組蛋白修飾對染色質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的影響組蛋白氨基酸殘基位點(diǎn)修飾類(三)正性調(diào)節(jié)占主導(dǎo)(四)轉(zhuǎn)錄與翻譯分隔進(jìn)行(五)轉(zhuǎn)錄后修飾、加工更為復(fù)雜采用正性調(diào)節(jié)機(jī)制更精確:采用多種正性調(diào)節(jié)元件、正性調(diào)節(jié)蛋白可提高基因表達(dá)調(diào)節(jié)的特異性和精確性。采用負(fù)性調(diào)節(jié)不經(jīng)濟(jì):在正性調(diào)節(jié)中,大多數(shù)基因不結(jié)合調(diào)節(jié)蛋白,所以是沒有活性的;只要細(xì)胞表達(dá)一組激活蛋白時,相關(guān)靶基因即可被激活。轉(zhuǎn)錄在細(xì)胞核,翻譯在細(xì)胞漿。因此,轉(zhuǎn)錄與翻譯產(chǎn)物的分布、定位等環(huán)節(jié)均可以被調(diào)控。12/11/202241DepartmentofBiochemistry(三)正性調(diào)節(jié)占主導(dǎo)(四)轉(zhuǎn)錄與翻譯分隔進(jìn)行(五)轉(zhuǎn)錄后修飾三、RNApolⅠ和polⅢ的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)(一)RNApolⅠ轉(zhuǎn)錄體系的控制RNAPolI的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物只有rRNA前體,經(jīng)剪接修飾生成除5SrRNA外的各種rRNA。啟動子元件包括:核心元件(coreelement)或核心啟動子(corepromoter)和上游控制元件(upstreamcontrolelement,UCE)。轉(zhuǎn)錄因子包括:上游結(jié)合因子(UBF1)、選擇性因子1(SL1)12/11/202242DepartmentofBiochemistry三、RNApolⅠ和polⅢ的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)(一)RNA(二)RNApolⅢ轉(zhuǎn)錄體系的控制RNAPolIII的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物:多種小分子RNA,包括tRNA、5SrRNA和一部分小核RNA。啟動子位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)下游(即轉(zhuǎn)錄區(qū)內(nèi)),稱內(nèi)部控制區(qū)(internalcontrolregions,ICR)。轉(zhuǎn)錄起始需多種轉(zhuǎn)錄因子12/11/202243DepartmentofBiochemistry(二)RNApolⅢ轉(zhuǎn)錄體系的控制RNAPolII四、RNApolⅡ的轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)節(jié)RNApolⅡ轉(zhuǎn)錄生成所有mRNA前體及大部分snRNA參與的DNA調(diào)控序列和轉(zhuǎn)錄因子復(fù)雜的多按功能特性,真核基因順式作用元件分為三種:啟動子、增強(qiáng)子、沉默子(一)順式作用元件影響基因轉(zhuǎn)錄活性12/11/202244DepartmentofBiochemistry四、RNApolⅡ的轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)節(jié)RNApolⅡ1.啟動子真核基因啟動子是RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)周圍的一組轉(zhuǎn)錄控制組件,至少包括一個轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)以及一個以上的功能組件。TATA盒GC盒CAAT盒12/11/202245DepartmentofBiochemistry1.啟動子真核基因啟動子是RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)周圍的一組轉(zhuǎn)2.增強(qiáng)子(enhancer)指遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、決定基因的時間、空間特異性、增強(qiáng)啟動子轉(zhuǎn)錄活性的DNA序列。其發(fā)揮作用的方式通常與方向、距離無關(guān)。增強(qiáng)子也由若干功能元件組成。酵母中的上游激活序列(UASs)。某些基因的負(fù)性調(diào)節(jié)元件,當(dāng)其結(jié)合特異蛋白因子時,對基因轉(zhuǎn)錄起阻遏作用。3.沉默子(silencer)12/11/202246DepartmentofBiochemistry2.增強(qiáng)子(enhancer)指遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、決定基因的(二)反式作用因子-重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)控蛋白1.轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子分類
按功能特性分為:
基本轉(zhuǎn)錄因子(generaltranscriptionfactors)是RNA聚合酶結(jié)合啟動子所必需的一組蛋白因子決定三種RNA(mRNA、tRNA及rRNA)轉(zhuǎn)錄的類別主要參與RNA聚合酶與轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)附近的DNA特異序列形成穩(wěn)定的轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物。
特異轉(zhuǎn)錄因子(specialtranscriptionfactors)為個別基因轉(zhuǎn)錄所需,決定該基因的時間、空間特異性表達(dá)。有轉(zhuǎn)錄激活因子和轉(zhuǎn)錄抑制因子兩種。12/11/202247DepartmentofBiochemistry(二)反式作用因子-重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)控蛋白1.轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子2.轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子結(jié)構(gòu)包括三個結(jié)構(gòu)區(qū)域:
DNA結(jié)合域轉(zhuǎn)錄激活域TF蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)結(jié)合域(二聚化結(jié)構(gòu)域)谷氨酰胺富含域酸性激活域脯氨酸富含域12/11/202248DepartmentofBiochemistry2.轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子結(jié)構(gòu)包括三個結(jié)構(gòu)區(qū)域:DNA結(jié)合域最常見的DNA結(jié)合域1.鋅指(zincfinger)C——CysH——His常結(jié)合GC盒圖示12/11/202249DepartmentofBiochemistry最常見的DNA結(jié)合域1.鋅指(zincfinger)C2.堿性α-螺旋常結(jié)合CAAT盒12/11/202250DepartmentofBiochemistry2.堿性α-螺旋常結(jié)合CAAT盒12/10/2022503.堿性亮氨酸拉鏈
(bZIP)
堿性螺旋-環(huán)-螺旋
(bHLH)等圖示12/11/202251DepartmentofBiochemistry3.堿性亮氨酸拉鏈
(bZIP)
堿性螺旋-環(huán)(三)mRNA轉(zhuǎn)錄激活-起始復(fù)合物形成polⅡTFⅡHTAFTFⅡFTAFTAFTFⅡATFⅡBTBP真核RNA聚合酶Ⅱ在轉(zhuǎn)錄因子幫助下,形成的轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物TATADNATBP相關(guān)因子EBP增強(qiáng)子結(jié)合蛋白12/11/202252DepartmentofBiochemistry(三)mRNA轉(zhuǎn)錄激活-起始復(fù)合物形成polⅡTFⅡHTA真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)是復(fù)雜的、多樣的*不同的DNA元件組合可產(chǎn)生多種類型的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)方式;*多種轉(zhuǎn)錄因子又可結(jié)合相同或不同的DNA元件。*轉(zhuǎn)錄因子與DNA元件結(jié)合后,對轉(zhuǎn)錄激活過程所產(chǎn)生的效果各異,有正性調(diào)節(jié)或負(fù)性調(diào)節(jié)之分。12/11/202253DepartmentofBiochemistry真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)是復(fù)雜的、多樣的*不同的DNA元件組合可產(chǎn)生五、RNApolⅡ的轉(zhuǎn)錄終止的調(diào)節(jié)(一)HIV基因組轉(zhuǎn)錄終止調(diào)節(jié)HIV基因的有效表達(dá)需要病毒蛋白Tat,它是一種抗終止蛋白。Tat與轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物5’特異RNA序列結(jié)合,并與宿主蛋白質(zhì)、RNApolⅡ相互作用,在延長中的RNA形成特定的二級結(jié)構(gòu),阻止HIV基因組轉(zhuǎn)錄提早終止。12/11/202254DepartmentofBiochemistry五、RNApolⅡ的轉(zhuǎn)錄終止的調(diào)節(jié)(一)HIV基因組(二)熱休克蛋白基因的轉(zhuǎn)錄終止調(diào)節(jié)在應(yīng)激條件下,細(xì)胞作出一系列反應(yīng),包括暫時性停止大多數(shù)基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯,啟動一套能夠提高細(xì)胞生存能力的蛋白質(zhì)即熱休克蛋白(heatshockprotein,HSP)的基因轉(zhuǎn)錄等。熱休克時,熱休克轉(zhuǎn)錄因子(HSTF)轉(zhuǎn)變?yōu)榛钚誀顟B(tài)--基因快速誘導(dǎo)表達(dá)。12/11/202255DepartmentofBiochemistry(二)熱休克蛋白基因的轉(zhuǎn)錄終止調(diào)節(jié)在應(yīng)激條件下,細(xì)胞作出一系六、轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)節(jié)(一)hnRNA加工成熟的調(diào)節(jié)加工過程包括加帽、加尾、剪接、堿基修飾和編輯等。(二)mRNA運(yùn)輸、胞漿內(nèi)穩(wěn)定性的調(diào)節(jié)通過與蛋白質(zhì)結(jié)合形成核蛋白體復(fù)合物(ribonucleoprotein,RNP)進(jìn)行。高等真核細(xì)胞mRNA半壽期較原核長,一般為幾小時;半壽期可影響蛋白質(zhì)合成量穩(wěn)定性可調(diào)節(jié)的mRNA,可能含有與特異蛋白質(zhì)相互作用的反應(yīng)元件,影響降解速度12/11/202256DepartmentofBiochemistry六、轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)節(jié)(一)hnRNA加工成熟的調(diào)節(jié)12/10七、翻譯水平以及翻譯后階段的調(diào)節(jié)調(diào)節(jié)點(diǎn)主要在蛋白質(zhì)合成的起始和延長階段;以起始階段為主(一)翻譯起始因子(eIF)活性的調(diào)節(jié)磷酸化調(diào)節(jié)(二)RNA結(jié)合蛋白(RBP)的調(diào)節(jié)RBP是指那些能與RNA特異序列結(jié)合的蛋白質(zhì)RBP參與基因表達(dá)的許多調(diào)節(jié)環(huán)節(jié),如:轉(zhuǎn)錄終止、RNA剪切、RNA轉(zhuǎn)運(yùn)、RNA胞漿穩(wěn)定性的控制、翻譯起始等等12/11/202257DepartmentofBiochemistry七、翻譯水平以及翻譯后階段的調(diào)節(jié)調(diào)節(jié)點(diǎn)主要在蛋白質(zhì)合成的起始(三)對翻譯產(chǎn)物水平及活性的調(diào)節(jié)新合成蛋白質(zhì)的半衰期長短是決定蛋白質(zhì)生物學(xué)功能的重要影響因素。通過對新生肽鏈的水解和運(yùn)輸,可以控制蛋白質(zhì)的濃度在特定的部位或亞細(xì)胞器保持在合適的水平。許多蛋白質(zhì)需要在合成后經(jīng)過特定的修飾才具有功能活性。如磷酸化、甲基化、?;揎?、等等,可以達(dá)到調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)功能的作用。12/11/202258DepartmentofBiochemistry(三)對翻譯產(chǎn)物水平及活性的調(diào)節(jié)新合成蛋白質(zhì)的半衰期長短是決(四)小分子RNA對基因表達(dá)的調(diào)節(jié)非編碼RNA(non-codingRNA,ncRNA):微小RNA(microRNA,miRNA)小干擾RNA(smallinterferingRNA,siRNA)細(xì)胞核小分子RNA(snRNA)核仁小分子RNA(snoRNA)核酶(ribosome),等等RNA組學(xué)(RNomics):研究細(xì)胞內(nèi)所有小分子RNA的種類、結(jié)構(gòu)和功能12/11/202259DepartmentofBiochemistry(四)小分子RNA對基因表達(dá)的調(diào)節(jié)非編碼RNA(non-co1.微小RNA(microRNA,miRNA)是一大家族小分子非編碼單鏈RNA,長度約20~25個堿基,由一段具有發(fā)夾環(huán)結(jié)構(gòu)、長度為70~90個堿基的單鏈RNA前體(pre-miRNA)經(jīng)Dicer酶剪切后形成。成熟的miRNA與其他蛋白質(zhì)一起組成RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體(RNA-inducedsilencingcomplex,RISC),通過與其靶mRNA分子的3’非編碼區(qū)域(3’-UTR)互補(bǔ)配對,抑制該mRNA翻譯。12/11/202260DepartmentofBiochemistry1.微小RNA(microRNA,miRNA)是一大家族miRNA的特點(diǎn):其長度一般為20~25個堿基;在不同生物體中普遍存在;其序列在不同生物中具有一定的保守性;具有明顯的表達(dá)階段特異性和組織特異性;miRNA基因以單拷貝、多拷貝或基因簇等多種形式存在于基因組中,大多位于基因間隔區(qū)。12/11/202261DepartmentofBiochemistrymiRNA的特點(diǎn):其長度一般為20~25個堿基;12/10/2.小干擾RNA(smallinterferingRNA,siRNA)是細(xì)胞內(nèi)一類雙鏈RNA(double-strandedRNA,dsRNA)在特定情況下通過一定酶切機(jī)制,轉(zhuǎn)變?yōu)榫哂刑囟ㄩL度(21~23個堿基)和特定序列的小片段RNA。雙鏈siRNA參與RISC組成,與特異的靶mRNA完全互補(bǔ)結(jié)合,導(dǎo)致靶mRNA降解,阻斷翻譯過程。由siRNA介導(dǎo)的基因表達(dá)抑制作用被稱為RNA干涉(RNAinterference,RNAi)。12/11/202262DepartmentofBiochemistry2.小干擾RNA(smallinterferingRN
>30bp雙鏈RNA(dsRNA)水解生成21-23ntsiRNA5’3’3’5’
RISC形成
識別特異序列并使其降解RNA干擾作用機(jī)制12/11/202263DepartmentofBiochemistry>30bp雙鏈RNA(dsRNA)水解生成5’3’3siRNAmiRNA前體內(nèi)源或外源長雙鏈RNA誘導(dǎo)產(chǎn)生內(nèi)源發(fā)夾環(huán)結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物結(jié)構(gòu)雙鏈分子單鏈分子功能降解mRNA阻遏其翻譯靶mRNA結(jié)合需完全互補(bǔ)不需完全互補(bǔ)生物學(xué)效應(yīng)抑制轉(zhuǎn)座子活性和病毒感染發(fā)育過程的調(diào)節(jié)siRNA和miRNA的差異比較12/11/202264DepartmentofBiochemistrysiRNAmiRNA前體內(nèi)源或外源長雙鏈RNA誘導(dǎo)產(chǎn)生內(nèi)源發(fā)操縱子模式圖I-調(diào)節(jié)基因P-啟動序列O-操縱序列(操縱基因)Z、Y、A-三種結(jié)構(gòu)基因12/11/202265DepartmentofBiochemistry操縱子模式圖I-調(diào)節(jié)基因12/10/202265Depar(cis-actingelement)真核生物編碼基因兩側(cè)的DNA序列可影響自身基因的表達(dá)活性通常是非編碼序列包括啟動子、增強(qiáng)子、沉默子順式作用元件(cis-actingelement)12/11/202266DepartmentofBiochemistry(cis-actingelement)真核生物編碼基因兩側(cè)基因產(chǎn)物特異識別、結(jié)合自身基因的調(diào)節(jié)序列,調(diào)節(jié)自身基因的開啟或關(guān)閉稱為順式調(diào)節(jié)基因產(chǎn)物特異識別、結(jié)合其它基因的調(diào)節(jié)序列,調(diào)節(jié)其它基因的開啟或關(guān)閉稱為反式調(diào)節(jié)反式與順式12/11/202267DepartmentofBiochemistry基因產(chǎn)物特異識別、結(jié)合自身基因的調(diào)節(jié)序列,調(diào)節(jié)自身基因的開啟乳糖水解12/11/202268DepartmentofBiochemistry乳糖水解12/10/202268Departmentof阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)圖解mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol沒有乳糖存在時阻遏基因12/11/202269DepartmentofBiochemistry阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)圖解mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpo有乳糖存在時mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol啟動轉(zhuǎn)錄mRNA乳糖半乳糖β-半乳糖苷酶12/11/202270DepartmentofBiochemistry有乳糖存在時mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol啟動轉(zhuǎn)錄CAP的正性調(diào)節(jié)圖解++++轉(zhuǎn)錄無葡萄糖,cAMP濃度高時有葡萄糖,cAMP濃度低時ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAP12/11/202271DepartmentofBiochemistryCAP的正性調(diào)節(jié)圖解++++轉(zhuǎn)錄無葡萄糖,cAMP濃協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)圖解mRNA低半乳糖時高半乳糖時葡萄糖低cAMP濃度高葡萄糖高cAMP濃度低RNA-polOOOO12/11/202272DepartmentofBiochemistry協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)圖解mRNA低半乳糖時高半乳糖時葡萄糖低1.色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)E.coli色氨酸操縱子(lacoperon)包含:五個結(jié)構(gòu)基因一個操縱序列O一個啟動序列P一個調(diào)節(jié)基因I一個前導(dǎo)序列附:轉(zhuǎn)錄衰減(attenuation)12/11/202273DepartmentofBiochemistry1.色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)E.coli色氨酸操縱子(lacop12/11/202274DepartmentofBiochemistry12/10/202274DepartmentofBio色氨酸操縱子是一種阻遏型操縱子,參與該操縱子機(jī)制的阻遏蛋白有兩種分子構(gòu)象。當(dāng)有色氨酸結(jié)合阻遏蛋白時,阻遏蛋白構(gòu)象改變可結(jié)合O序列,阻斷基因轉(zhuǎn)錄。當(dāng)沒有色氨酸結(jié)合阻遏蛋白時,阻遏蛋白不能結(jié)合O序列,基因開始轉(zhuǎn)錄。12/11/202275DepartmentofBiochemistry色氨酸操縱子是一種阻遏型操縱子,參與該操縱子機(jī)制的阻遏蛋白2、轉(zhuǎn)錄衰減機(jī)制當(dāng)色氨酸豐富時,色氨酸操縱子使用衰減作用來終止和減弱轉(zhuǎn)錄。轉(zhuǎn)錄衰減的DNA作用部位稱為衰減子(attenuator)它是位于結(jié)構(gòu)基因上游前導(dǎo)序列中具有終止子結(jié)構(gòu)的短序列。前導(dǎo)序列轉(zhuǎn)錄的RNA5’端162個核苷酸順序,這段mRNA包含4個彼此互補(bǔ)的區(qū)域,可形成獨(dú)特的二級結(jié)構(gòu)。區(qū)域1還是一個開放閱讀框,可編碼一個含14個氨基酸的短肽,稱為前導(dǎo)肽。前導(dǎo)肽的第10、11位是兩個連續(xù)的Trp。12/11/202276DepartmentofBiochemistry2、轉(zhuǎn)錄衰減機(jī)制當(dāng)色氨酸豐富時,色氨酸操縱子使用衰減作用來
當(dāng)Trp缺乏時,沒有色氨酸-tRNA供給,前導(dǎo)肽的翻譯至Trp密碼子(UGG)時停止,核糖體不再移動,占據(jù)1區(qū)位置,區(qū)域2,3配對,區(qū)域4空出,不形成轉(zhuǎn)錄終止信號。當(dāng)有足夠的Trp供給時,前導(dǎo)14肽繼續(xù)合成,核糖體占據(jù)1區(qū)和2區(qū),3、4區(qū)配對形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。其后又緊跟一串U殘基,轉(zhuǎn)錄終止。12/11/202277DepartmentofBiochemistry當(dāng)Trp缺乏時,沒有色氨酸-tRNA供給,前12/11/202278DepartmentofBiochemistry12/10/202278DepartmentofBio12/11/202279DepartmentofBiochemistry12/10/202279DepartmentofBio基因重組圖解沙門菌鞭毛素基因的調(diào)節(jié)H2鞭毛素阻遏蛋白Hin重組酶轉(zhuǎn)位片段hinH2IH1H1鞭毛素hinH2IDNA啟動序列H1啟動序列12/11/202280DepartmentofBiochemistry基因重組圖解沙門菌鞭毛素基因的調(diào)節(jié)H2鞭毛素阻遏蛋白SOS反應(yīng)
SOS基因紫外線激活RecALexA阻遏蛋白與DNA損傷修復(fù)有關(guān)的酶和蛋白質(zhì)基因表達(dá)LexA阻遏蛋白操縱序列DNA12/11/202281DepartmentofBiochemistrySOS反應(yīng)SOS基因紫外線激活RecALexA阻遏蛋白鋅指結(jié)構(gòu)12/11/202282DepartmentofBiochemistry鋅指結(jié)構(gòu)12/10/202282Departmentof與DNA結(jié)合HLH形成二聚體12/11/202283DepartmentofBiochemistry與DNA結(jié)合HLH形成二聚體12/10/202283De12/11/202284DepartmentofBiochemistry12/10/202284DepartmentofBio再見!12/11/202285DepartmentofBiochemistry再見!12/10/202285Departmentof
結(jié)束語謝謝大家聆聽?。?!86
結(jié)束語謝謝大家聆聽?。?!86基因表達(dá)調(diào)控09基因表達(dá)調(diào)控09第一節(jié)基因表達(dá)調(diào)控的基本概念一、基因表達(dá)的基本概念基因(gene):遺傳的基本單位,是負(fù)載特定遺傳信息的DNA片斷?;蚪M(genome):指含有一個生物體生存、發(fā)育、活動和繁殖所需要的全部遺傳信息的整套核酸。基因表達(dá)(geneexpression):基因轉(zhuǎn)錄與翻譯的過程。12/11/202288DepartmentofBiochemistry第一節(jié)基因表達(dá)調(diào)控的基本概念一、基因表達(dá)的基本概念12/1最新基因表達(dá)調(diào)控09課件最新基因表達(dá)調(diào)控09課件最新基因表達(dá)調(diào)控09課件最新基因表達(dá)調(diào)控09課件最新基因表達(dá)調(diào)控09課件最新基因表達(dá)調(diào)控09課件四、基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義(一)適應(yīng)環(huán)境、維持生長和增殖環(huán)境是在不斷變化的。通過調(diào)控,可使生物體表達(dá)出合適的蛋白質(zhì)分子。(二)維持細(xì)胞分化和個體發(fā)育生長、發(fā)育的不同階段,不同組織器官內(nèi)蛋白質(zhì)分子分布、種類和含量存在很大差異,這是調(diào)節(jié)細(xì)胞表型的關(guān)鍵。12/11/202295DepartmentofBiochemistry四、基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義(一)適應(yīng)環(huán)境、維持生長和增殖1不同層次上的調(diào)控一、基因表達(dá)的多級調(diào)控
基因激活
轉(zhuǎn)錄起始調(diào)控
轉(zhuǎn)錄后加工
翻譯調(diào)控
翻譯后加工轉(zhuǎn)錄起始水平的調(diào)控最為重要第二節(jié)基因表達(dá)調(diào)控的基本原理12/11/202296DepartmentofBiochemistry不同層次上的調(diào)控一、基因表達(dá)的多級調(diào)控轉(zhuǎn)錄起二、基因轉(zhuǎn)錄激活受轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白和啟動子相互作用的調(diào)節(jié)(一)特異DNA序列特異DNA序列主要指具有調(diào)節(jié)功能的DNA序列。它們決定基因的轉(zhuǎn)錄活性。原核生物大多數(shù)基因表達(dá)調(diào)控是通過操縱子機(jī)制實(shí)現(xiàn)的。真核基因調(diào)控機(jī)制普遍涉及編碼基因兩側(cè)的DNA序列——順式作用元件。12/11/202297DepartmentofBiochemistry二、基因轉(zhuǎn)錄激活受轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白和啟動子相互作用的調(diào)節(jié)(一)特1.原核生物:操縱子機(jī)制蛋白質(zhì)因子特異DNA序列編碼序列啟動序列操縱序列其他調(diào)節(jié)序列(promoter)(operator)全圖12/11/202298DepartmentofBiochemistry1.原核生物:操縱子機(jī)制蛋白質(zhì)因子特異DNA序列
操縱子(operon):通常由2個以上的編碼序列與啟動序列(promotor)、操縱序列(operator)以及其它調(diào)節(jié)序列在基因組中成簇串聯(lián)組成。啟動序列(promotor):RNA聚合酶結(jié)合并啟動轉(zhuǎn)錄的特異DNA序列。又稱啟動子。
各種原核啟動序列特定區(qū)域內(nèi)(通常在轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游-10及-35區(qū)域)存在共有序列(consensussequence)12/11/202299DepartmentofBiochemistry操縱子(operon):通常由2個以上的編碼序列與啟動序列-35盒-10,TATA盒12/11/2022100DepartmentofBiochemistry-35盒-10,TATA盒12/10/202214Dep共有序列(consensussequence)決定啟動序列的轉(zhuǎn)錄活性大小。某些特異因子(蛋白質(zhì))決定RNA聚合酶對一個或一套啟動序列的特異性識別和結(jié)合能力。啟動子:指RNA聚合酶識別、結(jié)合并開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。原核生物啟動子序列按功能的不同可分為三個部位,即起始部位、結(jié)合部位、識別部位。12/11/2022101DepartmentofBiochemistry共有序列(consensussequence)決定啟動序操縱序列(operator):與啟動序列毗鄰或接近的DNA序列,是原核阻遏蛋白的結(jié)合位點(diǎn)。其DNA序列常與啟動序列交錯、重疊。當(dāng)操縱序列結(jié)合有阻遏蛋白時,會阻礙RNA聚合酶與啟動序列的結(jié)合,或是RNA聚合酶不能沿DNA向前移動,阻礙轉(zhuǎn)錄。啟動序列編碼序列操縱序列pol阻遏蛋白12/11/2022102DepartmentofBiochemistry操縱序列(operator):與啟動序列毗鄰或接近的DNA序其他調(diào)節(jié)序列、調(diào)節(jié)蛋白例如:激活蛋白(activator)可結(jié)合啟動序列鄰近的DNA序列,促進(jìn)RNA聚合酶與啟動序列的結(jié)合,增強(qiáng)RNA聚合酶活性。有些基因在沒有激活蛋白存在時,RNA聚合酶很少或完全不能結(jié)合啟動序列。12/11/2022103DepartmentofBiochemistry其他調(diào)節(jié)序列、調(diào)節(jié)蛋白例如:12/10/202217Dep2.真核生物不同真核生物的順式作用元件中也會發(fā)現(xiàn)一些共有序列,如TATA盒、CAAT盒等,這些共有序列是RNA聚合酶或特異轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)。
順式作用元件(cis-actingelement)——可影響自身基因表達(dá)活性的DNA序列BADNA編碼序列轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)補(bǔ)充12/11/2022104DepartmentofBiochemistry2.真核生物不同真核生物的順式作用元件中也會發(fā)現(xiàn)一些共有序列(二)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白-增強(qiáng)或抑制轉(zhuǎn)錄活性原核生物基因調(diào)節(jié)蛋白(DNA結(jié)合蛋白)分為三類:特異因子:決定RNA聚合酶對一個或一套啟動序列的特異性識別和結(jié)合能力。阻遏蛋白(repressor):可結(jié)合特異DNA序列——操縱序列,阻遏基因轉(zhuǎn)錄。激活蛋白(activator):可結(jié)合啟動序列鄰近的DNA序列,促進(jìn)RNA聚合酶與啟動序列的結(jié)合,增強(qiáng)RNA聚合酶活性。分解(代謝)物基因激活蛋白(catabolitegeneactivatonprotein,CAP)就是一種激活蛋白。有些基因在沒有激活蛋白存在時,RNA聚合酶很少或完全不能結(jié)合啟動序列。12/11/2022105DepartmentofBiochemistry(二)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白-增強(qiáng)或抑制轉(zhuǎn)錄活性原核生物基因調(diào)節(jié)蛋白(真核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白又稱轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactor)。絕大多數(shù)真核轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子由某一基因表達(dá)后,通過與特異的順式作用元件結(jié)合(DNA-蛋白質(zhì)相互作用)反式激活另一基因的轉(zhuǎn)錄,稱為反式作用因子(trans-actingfactor)。這種調(diào)節(jié)作用稱為反式作用。12/11/2022106DepartmentofBiochemistry真核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白又稱轉(zhuǎn)錄因子(transcripti順式作用蛋白還有蛋白質(zhì)因子可特異識別、結(jié)合自身基因的調(diào)節(jié)序列,調(diào)節(jié)自身基因的表達(dá),稱順式作用。12/11/2022107DepartmentofBiochemistry順式作用蛋白還有蛋白質(zhì)因子可特異識別、結(jié)合自身基因的調(diào)節(jié)序列cDNAaDNAC順式調(diào)節(jié)mRNAC蛋白質(zhì)CBAmRNA蛋白質(zhì)AA反式調(diào)節(jié)補(bǔ)充12/11/2022108DepartmentofBiochemistrycDNAaDNAC順式調(diào)節(jié)mRNAC蛋白質(zhì)CBA(三)DNA-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用--轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白對轉(zhuǎn)錄起始調(diào)節(jié)的方式
DNA-蛋白質(zhì)相互作用(DNA-proteininteraction)主要指反式作用因子和順式作用元件之間的特異識別。通常是非共價結(jié)合,被識別的DNA結(jié)合位點(diǎn)通常呈對稱、或不完全對稱結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(protein-proteininteraction)某些調(diào)節(jié)蛋白在結(jié)合DNA前,需通過蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,形成二聚體(dimer)或多聚體(polymer)。二聚化同二聚體異二聚體12/11/2022109DepartmentofBiochemistry(三)DNA-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用DNA-蛋白質(zhì)(四)RNA聚合酶-與啟動序列/啟動子相結(jié)合1、啟動序列/啟動子與RNA聚合酶活性RNA聚合酶與其的親和力,影響轉(zhuǎn)錄。2、調(diào)節(jié)蛋白與RNA聚合酶活性一些特異調(diào)節(jié)蛋白在適當(dāng)環(huán)境信號刺激下表達(dá),然后通過DNA-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用影響RNA聚合酶活性。12/11/2022110DepartmentofBiochemistry(四)RNA聚合酶-與啟動序列/啟動子相結(jié)合1、啟動序列/啟一、原核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)特點(diǎn)(一)因子決定RNA聚合酶識別特異性(二)操縱子模型的普遍性(三)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)是重要因素第三節(jié)原核基因表達(dá)調(diào)節(jié)12/11/2022111DepartmentofBiochemistry一、原核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)特點(diǎn)(一)因子決定RNA聚合酶識別E.coli乳糖操縱子(lacoperon)包含:
三個結(jié)構(gòu)基因:Z編碼-半乳糖苷酶、 Y編碼通透酶、A乙?;D(zhuǎn)移酶
一個操縱序列O一個啟動序列P一個調(diào)節(jié)基因I一個分解代謝物基因激活蛋白結(jié)合位點(diǎn)(catabolitegeneactivationprotein,CAP)(一)乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)二、原核生物轉(zhuǎn)錄起始調(diào)節(jié)-操縱子調(diào)控模式12/11/2022112DepartmentofBiochemistryE.coli乳糖操縱子(lacoperon)包含:三個結(jié)乳糖操縱子結(jié)構(gòu)模式調(diào)控區(qū)CAP結(jié)合位點(diǎn)啟動序列操縱序列結(jié)構(gòu)基因Z:β-半乳糖苷酶Y:透酶A:乙?;D(zhuǎn)移酶ZYAOPDNA12/11/2022113DepartmentofBiochemistry乳糖操縱子結(jié)構(gòu)模式調(diào)控區(qū)CAP結(jié)合位點(diǎn)啟動序列操縱序列
沒有乳糖存在時,lac操縱子處于阻遏狀態(tài)。I序列表達(dá)的lac阻遏蛋白與O序列結(jié)合,阻礙RNA聚合酶與P序列結(jié)合,抑制轉(zhuǎn)錄啟動。
有乳糖存在時,lac操縱子可被誘導(dǎo)。乳糖在通透酶催化、轉(zhuǎn)運(yùn)進(jìn)入細(xì)胞,再經(jīng)-半乳糖苷酶催化,轉(zhuǎn)變成半乳糖。半乳糖作為誘導(dǎo)劑分子結(jié)合阻遏蛋白,使蛋白構(gòu)象變化,導(dǎo)致阻遏蛋白與O序列解離,發(fā)生轉(zhuǎn)錄。(二)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)圖解12/11/2022114DepartmentofBiochemistry沒有乳糖存在時,lac操縱子處于阻遏狀態(tài)。I序列表達(dá)的l當(dāng)沒有葡萄糖及cAMP濃度較高時,cAMP與CAP結(jié)合,這時CAP結(jié)合在lac啟動序列附近的CAP位點(diǎn),可刺激RNA轉(zhuǎn)錄活性。當(dāng)有葡萄糖存在時,cAMP濃度較低,cAMP與CAP結(jié)合受阻,lac操縱子表達(dá)下降。(三)CAP的正性調(diào)節(jié)圖解12/11/2022115DepartmentofBiochemistry當(dāng)沒有葡萄糖及cAMP濃度較高時,cAMP與CAP結(jié)合,這Lac阻遏蛋白負(fù)性調(diào)節(jié)與cAMP正性調(diào)節(jié)兩種機(jī)制協(xié)調(diào)合作單獨(dú)存在乳糖時,細(xì)菌利用乳糖作為能源。當(dāng)葡萄糖和乳糖共同存在時,細(xì)菌首先利用葡萄糖作為能源物質(zhì)。這時,葡萄糖通過降低cAMP濃度,阻礙cAMP與CAP結(jié)合而抑制lac操縱子轉(zhuǎn)錄,使細(xì)菌只能利用葡萄糖。葡萄糖對lac操縱子的阻遏作用稱分解代謝阻遏(catabolicrepression)。
(四)協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)圖解12/11/2022116DepartmentofBiochemistryLac阻遏蛋白負(fù)性調(diào)節(jié)與cAMP正性調(diào)節(jié)兩種機(jī)制協(xié)調(diào)合作單獨(dú)三、原核生物轉(zhuǎn)錄終止調(diào)節(jié)大腸桿菌中存在兩種主要的轉(zhuǎn)錄終止機(jī)制:依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止不依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止大腸桿菌中存在兩種終止調(diào)節(jié)方式:衰減抗終止12/11/2022117DepartmentofBiochemistry三、原核生物轉(zhuǎn)錄終止調(diào)節(jié)大腸桿菌中存在兩種主要的轉(zhuǎn)錄終止機(jī)制四、原核生物翻譯水平調(diào)節(jié)(一)蛋白質(zhì)分子結(jié)合于啟動序列或啟動序列周圍進(jìn)行自我調(diào)節(jié)調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合mRNA靶位點(diǎn),阻止核蛋白體識別翻譯起始區(qū),阻斷翻譯調(diào)節(jié)蛋白一般作用于自身mRNA,抑制自身的合成,稱自我控制(autogenouscontrol)。12/11/2022118DepartmentofBiochemistry四、原核生物翻譯水平調(diào)節(jié)(一)蛋白質(zhì)分子結(jié)合于啟動序列或啟動(二)反義RNA對翻譯的調(diào)節(jié)作用調(diào)節(jié)RNA-調(diào)節(jié)基因表達(dá)的RNA分子反義RNA含有與特定mRNA翻譯起始部位互補(bǔ)的序列,通過與mRNA雜交,阻斷30S小亞基對起始密碼的識別以及與SD序列的結(jié)合,抑制翻譯起始。稱為反義控制(antisensecontrol)。12/11/2022119DepartmentofBiochemistry(二)反義RNA對翻譯的調(diào)節(jié)作用調(diào)節(jié)RNA-調(diào)節(jié)基因表達(dá)的R附:其它轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)機(jī)制轉(zhuǎn)錄衰減(attenuation)色氨酸操縱子是一種阻遏型操縱子當(dāng)有色氨酸結(jié)合阻遏蛋白時,阻遏蛋白構(gòu)象改變可結(jié)合O序列,阻斷基因轉(zhuǎn)錄基因重組SOS反應(yīng)衰減重組SOS12/11/2022120DepartmentofBiochemistry附:其它轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)機(jī)制轉(zhuǎn)錄衰減(attenuation)衰減重一、真核基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)(一)真核基因組結(jié)構(gòu)龐大第四節(jié)真核基因表達(dá)調(diào)節(jié)哺乳類動物基因組DNA約3×109堿基對人基因組編碼基因約有3~4個(2~2.5萬),其中60%存在可變剪接。編碼序列僅占總長的1%rDNA等重復(fù)基因約占5%~10%12/11/2022121DepartmentofBiochemistry一、真核基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)(一)真核基因組結(jié)構(gòu)龐大第四節(jié)真核(二)單順反子(monocistron)即一個編碼基因轉(zhuǎn)錄生成一個mRNA分子,經(jīng)翻譯生成一條多肽鏈。(三)重復(fù)序列單拷貝序列(一次或數(shù)次)高度重復(fù)序列(106次)中度重復(fù)序列(103~104次)多拷貝序列(四)基因不連續(xù)性12/11/2022122DepartmentofBiochemistry(二)單順反子(monocistron)即一個編碼基因轉(zhuǎn)錄二、真核基因表達(dá)調(diào)控特點(diǎn)(一)RNA聚合酶有三種,分別負(fù)責(zé)三種RNA轉(zhuǎn)錄。(二)轉(zhuǎn)錄激活狀態(tài)的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)明顯變化1.對核酸酶敏感活化基因常有超敏位點(diǎn),位于調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合位點(diǎn)附近。12/11/2022123DepartmentofBiochemistry二、真核基因表達(dá)調(diào)控特點(diǎn)(一)RNA聚合酶(二)轉(zhuǎn)錄激活狀態(tài)2.DNA拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)變化天然雙鏈DNA均以負(fù)性超螺旋構(gòu)象存在;基因活化后RNA-pol正超螺旋負(fù)超螺旋轉(zhuǎn)錄方向3.DNA堿基修飾變化真核DNA約有5%的胞嘧啶被甲基化,甲基化范圍與基因表達(dá)程度呈反比。12/11/2022124DepartmentofBiochemistry2.DNA拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)變化天然雙鏈DNA均以負(fù)性超螺旋構(gòu)象存在4.組蛋白變化①富含Lys組蛋白水平降低②H2A,H2B二聚體不穩(wěn)定性增加③組蛋白H3、H4發(fā)生乙?;?、甲基化或磷酸化修飾④H3組蛋白巰基暴露組蛋白修飾對于基因表達(dá)影響的機(jī)制也包括兩種相互包容的理論。即:組蛋白的修飾直接影響染色質(zhì)或核小體的結(jié)構(gòu),以及化學(xué)修飾征集了其他調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì),為其他功能分子與組蛋白結(jié)合搭建了一個平臺。這些理論構(gòu)成了“組蛋白密碼”的假說。12/11/2022125DepartmentofBiochemistry4.組蛋白變化①富含Lys組蛋白水平降低組蛋白修飾組蛋白修飾對染色質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的影響組蛋白氨基酸殘基位點(diǎn)修飾類型功能H3Lys-4甲基化激活H3Lys-9甲基化染色質(zhì)濃縮H3Lys-9甲基化DNA甲基化所必需H3Lys-9乙?;せ頗3Ser-10磷酸化激活H3Lys-14乙?;乐筁ys-9的甲基化H3Lys-79甲基化端粒沉默H4Arg-3甲基化H4Lys-5乙酰化裝配H4Lys-12乙?;b配H4Lys-16乙?;诵◇w裝配H4Lys-16乙?;疐lyX激活12/11/2022126DepartmentofBiochemistry組蛋白修飾對染色質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的影響組蛋白氨基酸殘基位點(diǎn)修飾類(三)正性調(diào)節(jié)占主導(dǎo)(四)轉(zhuǎn)錄與翻譯分隔進(jìn)行(五)轉(zhuǎn)錄后修飾、加工更為復(fù)雜采用正性調(diào)節(jié)機(jī)制更精確:采用多種正性調(diào)節(jié)元件、正性調(diào)節(jié)蛋白可提高基因表達(dá)調(diào)節(jié)的特異性和精確性。采用負(fù)性調(diào)節(jié)不經(jīng)濟(jì):在正性調(diào)節(jié)中,大多數(shù)基因不結(jié)合調(diào)節(jié)蛋白,所以是沒有活性的;只要細(xì)胞表達(dá)一組激活蛋白時,相關(guān)靶基因即可被激活。轉(zhuǎn)錄在細(xì)胞核,翻譯在細(xì)胞漿。因此,轉(zhuǎn)錄與翻譯產(chǎn)物的分布、定位等環(huán)節(jié)均可以被調(diào)控。12/11/2022127DepartmentofBiochemistry(三)正性調(diào)節(jié)占主導(dǎo)(四)轉(zhuǎn)錄與翻譯分隔進(jìn)行(五)轉(zhuǎn)錄后修飾三、RNApolⅠ和polⅢ的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)(一)RNApolⅠ轉(zhuǎn)錄體系的控制RNAPolI的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物只有rRNA前體,經(jīng)剪接修飾生成除5SrRNA外的各種rRNA。啟動子元件包括:核心元件(coreelement)或核心啟動子(corepromoter)和上游控制元件(upstreamcontrolelement,UCE)。轉(zhuǎn)錄因子包括:上游結(jié)合因子(UBF1)、選擇性因子1(SL1)12/11/2022128DepartmentofBiochemistry三、RNApolⅠ和polⅢ的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)(一)RNA(二)RNApolⅢ轉(zhuǎn)錄體系的控制RNAPolIII的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物:多種小分子RNA,包括tRNA、5SrRNA和一部分小核RNA。啟動子位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)下游(即轉(zhuǎn)錄區(qū)內(nèi)),稱內(nèi)部控制區(qū)(internalcontrolregions,ICR)。轉(zhuǎn)錄起始需多種轉(zhuǎn)錄因子12/11/2022129DepartmentofBiochemistry(二)RNApolⅢ轉(zhuǎn)錄體系的控制RNAPolII四、RNApolⅡ的轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)節(jié)RNApolⅡ轉(zhuǎn)錄生成所有mRNA前體及大部分snRNA參與的DNA調(diào)控序列和轉(zhuǎn)錄因子復(fù)雜的多按功能特性,真核基因順式作用元件分為三種:啟動子、增強(qiáng)子、沉默子(一)順式作用元件影響基因轉(zhuǎn)錄活性12/11/2022130DepartmentofBiochemistry四、RNApolⅡ的轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)節(jié)RNApolⅡ1.啟動子真核基因啟動子是RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)周圍的一組轉(zhuǎn)錄控制組件,至少包括一個轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)以及一個以上的功能組件。TATA盒GC盒CAAT盒12/11/2022131DepartmentofBiochemistry1.啟動子真核基因啟動子是RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)周圍的一組轉(zhuǎn)2.增強(qiáng)子(enhancer)指遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、決定基因的時間、空間特異性、增強(qiáng)啟動子轉(zhuǎn)錄活性的DNA序列。其發(fā)揮作用的方式通常與方向、距離無關(guān)。增強(qiáng)子也由若干功能元件組成。酵母中的上游激活序列(UASs)。某些基因的負(fù)性調(diào)節(jié)元件,當(dāng)其結(jié)合特異蛋白因子時,對基因轉(zhuǎn)錄起阻遏作用。3.沉默子(silencer)12/11/2022132DepartmentofBiochemistry2.增強(qiáng)子(enhancer)指遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、決定基因的(二)反式作用因子-重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)控蛋白1.轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子分類
按功能特性分為:
基本轉(zhuǎn)錄因子(generaltranscriptionfactors)是RNA聚合酶結(jié)合啟動子所必需的一組蛋白因子決定三種RNA(mRNA、tRNA及rRNA)轉(zhuǎn)錄的類別主要參與RNA聚合酶與轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)附近的DNA特異序列形成穩(wěn)定的轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物。
特異轉(zhuǎn)錄因子(specialtranscriptionfactors)為個別基因轉(zhuǎn)錄所需,決定該基因的時間、空間特異性表達(dá)。有轉(zhuǎn)錄激活因子和轉(zhuǎn)錄抑制因子兩種。12/11/2022133DepartmentofBiochemistry(二)反式作用因子-重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)控蛋白1.轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子2.轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子結(jié)構(gòu)包括三個結(jié)構(gòu)區(qū)域:
DNA結(jié)合域轉(zhuǎn)錄激活域TF蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)結(jié)合域(二聚化結(jié)構(gòu)域)谷氨酰胺富含域酸性激活域脯氨酸富含域12/11/2022134DepartmentofBiochemistry2.轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子結(jié)構(gòu)包括三個結(jié)構(gòu)區(qū)域:DNA結(jié)合域最常見的DNA結(jié)合域1.鋅指(zincfinger)C——CysH——His常結(jié)合GC盒圖示12/11/2022135DepartmentofBiochemistry最常見的DNA結(jié)合域1.鋅指(zincfinger)C2.堿性α-螺旋常結(jié)合CAAT盒12/11/2022136DepartmentofBiochemistry2.堿性α-螺旋常結(jié)合CAAT盒12/10/2022503.堿性亮氨酸拉鏈
(bZIP)
堿性螺旋-環(huán)-螺旋
(bHLH)等圖示12/11/2022137DepartmentofBiochemistry3.堿性亮氨酸拉鏈
(bZIP)
堿性螺旋-環(huán)(三)mRNA轉(zhuǎn)錄激活-起始復(fù)合物形成polⅡTFⅡHTAFTFⅡFTAFTAFTFⅡATFⅡBTBP真核RNA聚合酶Ⅱ在轉(zhuǎn)錄因子幫助下,形成的轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物TATADNATBP相關(guān)因子EBP增強(qiáng)子結(jié)合蛋白12/11/2022138DepartmentofBiochemistry(三)mRNA轉(zhuǎn)錄激活-起始復(fù)合物形成polⅡTFⅡHTA真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)是復(fù)雜的、多樣的*不同的DNA元件組合可產(chǎn)生多種類型的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)方式;*多種轉(zhuǎn)錄因子又可結(jié)合相同或不同的DNA元件。*轉(zhuǎn)錄因子與DNA元件結(jié)合后,對轉(zhuǎn)錄激活過程所產(chǎn)生的效果各異,有正性調(diào)節(jié)或負(fù)性調(diào)節(jié)之分。12/11/2022139DepartmentofBiochemistry真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)是復(fù)雜的、多樣的*不同的DNA元件組合可產(chǎn)生五、RNApolⅡ的轉(zhuǎn)錄終止的調(diào)節(jié)(一)HIV基因組轉(zhuǎn)錄終止調(diào)節(jié)HIV基因的有效表達(dá)需要病毒蛋白Tat,它是一種抗終止蛋白。Tat與轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物5’特異RNA序列結(jié)合,并與宿主蛋白質(zhì)、RNApolⅡ相互作用,在延長中的RNA形成特定的二級結(jié)構(gòu),阻止HIV基因組轉(zhuǎn)錄提早終止。12/11/2022140DepartmentofBiochemistry五、RNApolⅡ的轉(zhuǎn)錄終止的調(diào)節(jié)(一)HIV基因組(二)熱休克蛋白基因的轉(zhuǎn)錄終止調(diào)節(jié)在應(yīng)激條件下,細(xì)胞作出一系列反應(yīng),包括暫時性停止大多數(shù)基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯,啟動一套能夠提高細(xì)胞生存能力的蛋白質(zhì)即熱休克蛋白(heatshockprotein,HSP)的基因轉(zhuǎn)錄等。熱休克時,熱休克轉(zhuǎn)錄因子(HSTF)轉(zhuǎn)變?yōu)榛钚誀顟B(tài)--基因快速誘導(dǎo)表達(dá)。12/11/2022141DepartmentofBiochemistry(二)熱休克蛋白基因的轉(zhuǎn)錄終止調(diào)節(jié)在應(yīng)激條件下,細(xì)胞作出一系六、轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)節(jié)(一)hnRNA加工成熟的調(diào)節(jié)加工過程包括加帽、加尾、剪接、堿基修飾和編輯等。(二)mRNA運(yùn)輸、胞漿內(nèi)穩(wěn)定性的調(diào)節(jié)通過與蛋白質(zhì)結(jié)合形成核蛋白體復(fù)合物(ribonucleoprotein,RNP)進(jìn)行。高等真核細(xì)胞mRNA半壽期較原核長,一般為幾小時;半壽期可影響蛋白質(zhì)合成量穩(wěn)定性可調(diào)節(jié)的mRNA,可能含有與特異蛋白質(zhì)相互作用的反應(yīng)元件,影響降解速度12/11/2022142DepartmentofBiochemistry六、轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)節(jié)(一)hnRNA加工成熟的調(diào)節(jié)12/10七、翻譯水平以及翻譯后階段的調(diào)節(jié)調(diào)節(jié)點(diǎn)主要在蛋白質(zhì)合成的起始和延長階段;以起始階段為主(一)翻譯起始因子(eIF)活性的調(diào)節(jié)磷酸化調(diào)節(jié)(二)RNA結(jié)合蛋白(RBP)的調(diào)節(jié)RBP是指那些能與RNA特異序列結(jié)合的蛋白質(zhì)RBP參與基因表達(dá)的許多調(diào)節(jié)環(huán)節(jié),如:轉(zhuǎn)錄終止、RNA剪切、RNA轉(zhuǎn)運(yùn)、RNA胞漿穩(wěn)定性的控制、翻譯起始等等12/11/2022143DepartmentofBiochemistry七、翻譯水平以及翻譯后階段的調(diào)節(jié)調(diào)節(jié)點(diǎn)主要在蛋白質(zhì)合成的起始(三)對翻譯產(chǎn)物水平及活性的調(diào)節(jié)新合成蛋白質(zhì)的半衰期長短是決定蛋白質(zhì)生物學(xué)功能的重要影響因素。通過對新生肽鏈的水解和運(yùn)輸,可以控制蛋白質(zhì)的濃度在特定的部位或亞細(xì)胞器保持在合適的水平。許多蛋白質(zhì)需要在合成后經(jīng)過特定的修飾才具有功能活性。如磷酸化、甲基化、?;揎棥⒌鹊?,可以達(dá)到調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)功能的作用。12/11/2022144DepartmentofBiochemistry(三)對翻譯產(chǎn)物水平及活性的調(diào)節(jié)新合成蛋白質(zhì)的半衰期長短是決(四)小分子RNA對基因表達(dá)的調(diào)節(jié)非編碼RNA(non-codingRNA,ncRNA):微小RNA(microRNA,miRNA)小干擾RNA(smallinterferingRNA,siRNA)細(xì)胞核小分子RNA(snRNA)核仁小分子RNA(snoRNA)核酶(ribosome),等等RNA組學(xué)(RNomics):研究細(xì)胞內(nèi)所有小分子RNA的種類、結(jié)構(gòu)和功能12/11/2022145DepartmentofBiochemistry(四)小分子RNA對基因表達(dá)的調(diào)節(jié)非編碼RNA(non-co1.微小RNA(microRNA,miRNA)是一大家族小分子非編碼單鏈RNA,長度約20~25個堿基,由一段具有發(fā)夾環(huán)結(jié)構(gòu)、長度為70~90個堿基的單鏈RNA前體(pre-miRNA)經(jīng)Dicer酶剪切后形成。成熟的miRNA與其他蛋白質(zhì)一起組成RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體(RNA-inducedsilencingcomplex,RISC),通過與其靶mRNA分子的3’非編碼區(qū)域(3’-UTR)互補(bǔ)配對,抑制該mRNA翻譯。12/11/2022146DepartmentofBiochemistry1.微小RNA(mi
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