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宮頸癌篩查技術(shù)—
HPV12+2分型檢測(cè)宮頸癌篩查技術(shù)—
一、HPV12+2檢測(cè)的意義及臨床應(yīng)用一、HPV12+2檢測(cè)的意義及臨床應(yīng)用3HPV的型別目前已發(fā)現(xiàn)超過200種型別的人乳頭瘤病毒(HPV)。依據(jù)與生殖道腫瘤相關(guān)性,將HPV分為:低危型常引起外生殖道濕疣等良性病變;6、11、42、43、44等。
高危型與子宮頸癌及子宮頸上皮內(nèi)瘤變(CIN2/3)的發(fā)生相關(guān);16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、68等。3HPV的型別目前已發(fā)現(xiàn)超過200種型別的人乳頭瘤病毒(HPHPV分型檢測(cè)的意義
(1)預(yù)測(cè)受檢者發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)度,確定最佳的治療時(shí)期GaryM.Cliffordetal;CancerEpidemiolBiomarkersPrev2005;14(5):1157–64提示:不同的高危型促進(jìn)LSIL(低度鱗狀上皮內(nèi)病變)向SCC(鱗狀細(xì)胞癌)轉(zhuǎn)變的能力有差異。HPV16,18的致宮頸癌風(fēng)險(xiǎn)性大于其他高危型HPV。
HPV分型檢測(cè)的意義
(1)預(yù)測(cè)受檢者發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)度,確定最佳基線篩查細(xì)胞學(xué)陰性/高危HPV陽性的女性10年內(nèi)≥CIN3病變的累積發(fā)病率KhanMJ,etal.JNatlCancerInst2005;97:1072–1079.Follow-uptime(months)Otherhigh-riskHPV+HPV18+High-riskHPV–HPV16+Cumulativeincidencerate
of≥CIN3(%)17.2%(11.5–22.9)HPV16+13.6%(3.6–23.7)HPV18+3.0%(1.9–4.2)其它高危型HPV陽性0.8%(0.6–1.1)高危型HPV陰性4.51527395163758799119.5111020151050基線時(shí)HPV16/18陽性者相比其它12種高危HPV型別陽性者,有更高風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)展為高度宮頸病變HPV16/18陽性的短期風(fēng)險(xiǎn)也明顯高于其它致癌型HPV陽性基線篩查細(xì)胞學(xué)陰性/高危HPV陽性的女性10年內(nèi)≥CIN3病對(duì)204例宮頸癌患者前瞻性研究發(fā)現(xiàn),HPV18型感染者是預(yù)后不良的重要指標(biāo),HPV18陽性5年存活率54.1%,而其他高危型感染的存活率為83.8%。HPV18型陽性者復(fù)發(fā)率53.6%,而HPV16型復(fù)發(fā)率僅為15.9%51例宮頸癌手術(shù)患者中,9例發(fā)生淋巴轉(zhuǎn)移中有6例為HPV18型107例晚期宮頸癌患者放療治療組中,HPV18型陽性者5年存活率為15.5%,而HPV16型為73.1%對(duì)于群體而言HPV16型感染危害最大對(duì)于個(gè)體而言HPV18型感染危險(xiǎn)度最高對(duì)204例宮頸癌患者前瞻性研究發(fā)現(xiàn),HPV18型感染者是預(yù)后
(2)16、18亞型持續(xù)感染的危險(xiǎn)性大于其他亞型對(duì)巴西1611名婦女在4個(gè)月間隔2次檢測(cè)HPV,HPV16,18持續(xù)陽性致HSIL風(fēng)險(xiǎn)性大于其他高危型HPV持續(xù)陽性。(NicolasF.Schlecht,et.al.
JAMA.2001;286(24):3106-3114.)宮頸癌的必要條件高危型的HPV感染HPV持續(xù)感染(2)16、18亞型持續(xù)感染的危險(xiǎn)性大于其他亞型對(duì)巴(3)針對(duì)不同型別的感染采取不同的處理方案相同細(xì)胞及組織學(xué)類型HPV陽性與陰性要區(qū)別對(duì)待不同HPV感染型別要區(qū)別對(duì)待例如:建議HPV16,18型的患者直接進(jìn)行陰道鏡檢查;而對(duì)于其他型別的感染,要結(jié)合細(xì)胞學(xué)診斷,一般不需要采取任何治療方法,但需要按時(shí)隨訪。44歲女性,2008年10月24日,婦檢宮頸光滑,滴蟲(+)HPV16,52(+),TCT:炎細(xì)胞中度。未行陰道鏡檢查,2010年10月18日。陰道鏡下宮頸活檢病理:鱗狀細(xì)胞癌(中分化)。未按規(guī)范篩查及隨訪,導(dǎo)致宮頸癌發(fā)生。廣東省婦幼保健院案例分析(3)針對(duì)不同型別的感染采取不同的處理方案相同細(xì)胞及組織學(xué)類
二、凱普HPV12+2檢測(cè)試劑盒二、凱普HPV12+2檢測(cè)試劑盒熒光PCR原理在PCR反應(yīng)體系中有上下游引物,在熒光PCR體系中也有上下游引物,還加入了一個(gè)熒光基團(tuán)-探針在PCR擴(kuò)增過程中,特異性引物和探針分別與靶序列結(jié)合,由于此時(shí)熒光基團(tuán)與猝滅基團(tuán)離的很近,猝滅基團(tuán)對(duì)熒光基團(tuán)的發(fā)光起到了抑制作用,因此熒光基團(tuán)不發(fā)光。
Taq酶在引物的引導(dǎo)下復(fù)制靶序列;當(dāng)遇到結(jié)合在兩條引物之間的探針時(shí),發(fā)揮5′端外切酶功能,將探針?biāo)?,水解下來的熒光基團(tuán)受激發(fā)發(fā)射熒光,每合成一條DNA鏈發(fā)射一次熒光信號(hào)。當(dāng)靶序列呈指數(shù)增長時(shí),發(fā)射的熒光信號(hào)量相應(yīng)增長,因此只要標(biāo)本中含相應(yīng)型別的HPV病毒就會(huì)有熒光信號(hào)的積累,從而達(dá)到檢測(cè)HPVDNA的目的。熒光猝滅熒光PCR原理在PCR反應(yīng)體系中有上下游引物,在熒光PCRHPV系列產(chǎn)品13種高危型HPV檢測(cè)試劑盒
(HPV16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、68)
不分型14種高危型HPV檢測(cè)試劑盒
(HPV16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、66、68)
對(duì)HPV16、18分型HPV系列產(chǎn)品13種高危型HPV檢測(cè)試劑盒14種高危型HPV14種高危型人乳頭狀瘤病毒聯(lián)合16/18基因分型檢測(cè)(12+2)試劑盒產(chǎn)品特點(diǎn)至少需要四通道以上的熒光PCR檢測(cè)儀器,一次檢測(cè)出14種高危HPV型別:HPV-31,HPV-33,HPV-35,HPV-39,HPV-45,HPV-51,HPV-52,HPV-56,HPV-58,HPV-59,HPV-66和HPV-68,同時(shí)能對(duì)HPV16和HPV18進(jìn)行分型檢測(cè)。具有β-globin基因內(nèi)對(duì)照,可以監(jiān)測(cè)所檢測(cè)樣本的可靠性。在全封閉體系中完成擴(kuò)增與檢測(cè),有效控制污染操作簡(jiǎn)便,自動(dòng)化操作,完成整個(gè)過程只需要2-3個(gè)小時(shí)。檢測(cè)區(qū)域設(shè)計(jì)在HPV基因組E區(qū),避免造成漏診。
70%-80%的宮頸癌都是由HPV16、18型感染引發(fā)的,可見在HPV熒光分型的產(chǎn)品中,對(duì)HPV16、18分型的重要性SFDA與歐盟的CE認(rèn)證資質(zhì)14種高危型人乳頭狀瘤病毒聯(lián)合16/18基因分型檢測(cè)(12+DNA提取
取800ul樣本離心得沉淀
↓加入細(xì)胞裂解液50ul,煮沸10min↓12000離心10min即可上機(jī)若肉眼未見沉淀,可增加取樣量,再次離心收集沉淀;若沉淀雜質(zhì)較多,可用細(xì)胞保存液洗滌1-2次;血液多樣本,用蒸餾水洗滌1-2次;粘液多樣本,取樣時(shí)盡量去除粘液。應(yīng)注意防止爆蓋:金屬浴可壓重物(冰盒、冰袋等)水浴應(yīng)采用螺旋管蓋的離心管確保離心管質(zhì)量合格優(yōu)點(diǎn):簡(jiǎn)單、快捷、方便。缺點(diǎn):HPVDNA純度較差,含有血紅素、蛋白、脂類等PCR抑制劑。針對(duì)男性樣本或女性疣體樣本(棉拭子樣本),先用細(xì)胞保存液/生理鹽水洗脫,收集沉淀,而后與上述操作一致DNA提取取800ul樣本離心得沉淀若肉PCR試劑配制按樣本數(shù)加入所需溶液的對(duì)應(yīng)量,充分混勻再分裝PCR試劑配制按樣本數(shù)加入所需溶液的對(duì)應(yīng)量,充分混勻再分裝儀器檢測(cè)通道選擇儀器檢測(cè)通道選擇我們一般把熒光PCR的前15個(gè)循環(huán)信號(hào)作為熒光本底信號(hào)(baseline,基線期),即樣本的熒光背景值和陰性對(duì)照的熒光值,擴(kuò)增的熒光信號(hào)被熒光背景信號(hào)所掩蓋。檢查調(diào)整基線熒光閾值的缺省設(shè)置是3~15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍(儀器自動(dòng)設(shè)置,auto)。但我們通常采用手動(dòng)設(shè)置(manual),手動(dòng)設(shè)置的原則是該閾值要大于樣本的熒光背景值和陰性對(duì)照的熒光最高值,同時(shí)要盡量選擇進(jìn)入指數(shù)期的最初階段,真正的信號(hào)出現(xiàn)在熒光信號(hào)超過閾值后。檢查調(diào)整閾值結(jié)果分析我們一般把熒光PCR的前15個(gè)循環(huán)信號(hào)作為熒光本底信1
定性結(jié)果判讀1)陰性對(duì)照Ct值均應(yīng)顯示為Undet。陽性對(duì)照Ct值≤36。符合以上兩個(gè)條件,此反應(yīng)是為有效。2)樣品的Ct值顯示為Undet,判斷為陰性。3)樣品的Ct值≤40,判斷為陽性;4)若為40<Ct值<45的樣本建議重做,重做結(jié)果Ct值<40者為陽性,否則為陰性。5)如果出現(xiàn)Ct值<15的強(qiáng)陽性樣本,可直接報(bào)告為陽性或自動(dòng)分析,并將其從樣品表中剔除,再按上面步驟分析其他樣本,或建議進(jìn)行1/100稀釋重做。定性報(bào)告單上,定量結(jié)果欄及參考范圍設(shè)置為N/A(無效欄)結(jié)果分析1定性結(jié)果判讀定性報(bào)告單上,定量結(jié)果欄及參考范圍設(shè)置為N/1擴(kuò)增曲線出現(xiàn)交叉擴(kuò)增曲線出現(xiàn)交叉,主要是因?yàn)槎嘁?、多探針反?yīng)體系中,每種型別的擴(kuò)增效率不一樣所致。同時(shí),樣本本身的原因也可能造成熒光曲線的差異。常見問題及解決方案2單個(gè)臨床樣本擴(kuò)增曲線底部上坡式不斷抬高加入的樣本DNA含有很多雜質(zhì)。重做,加樣前,樣本DNA13000rpm離心10分鐘,移液時(shí)取上清,移液器槍頭浸入液面2mm處。1擴(kuò)增曲線出現(xiàn)交叉常見問題及解決方案2單個(gè)臨床樣本擴(kuò)增曲3個(gè)別熒光曲線突然(較大)下降反應(yīng)管內(nèi)留有氣泡,由于溫度升高后可能會(huì)造成氣泡破裂,使熒光值突變降低,加入模板DNA后混勻離心,把反應(yīng)管放置儀器內(nèi)時(shí)要檢查管內(nèi)是否有氣泡。4陰性對(duì)照產(chǎn)生較高熒光反應(yīng)MIX被污染;反應(yīng)管不干凈,有雜物;反應(yīng)過程中探針降解。5標(biāo)準(zhǔn)曲線的線性關(guān)系不佳加樣存在誤差,使得標(biāo)準(zhǔn)品不呈梯度;標(biāo)準(zhǔn)品出現(xiàn)降解,應(yīng)避免標(biāo)準(zhǔn)品反復(fù)凍融,或重新制備并稀釋標(biāo)準(zhǔn)品。常見問題及解決方案3個(gè)別熒光曲線突然(較大)下降常見問題及解決方案6閾值設(shè)置不同,是否會(huì)導(dǎo)致陰陽性結(jié)果判斷的不統(tǒng)一?結(jié)果的判讀不能只依賴于Ct值的大小,還要看是否出現(xiàn)明顯的擴(kuò)增曲線。二者結(jié)合才能判斷試驗(yàn)結(jié)果。閾值設(shè)置的高低會(huì)使Ct值有一定的變化,但變化一般都比較小。只有很少的樣本會(huì)出現(xiàn)在Ct=40左右波動(dòng)。這樣的樣本如擴(kuò)增曲線明顯可以判讀為陽性,如擴(kuò)增曲線不明顯或熒光增長值不高則建議重做。常見問題及解決方案6閾值設(shè)置不同,是否會(huì)導(dǎo)致陰陽性結(jié)果判斷的不統(tǒng)一?常見問題7檢測(cè)方法中“定性”和“定量”的問題目前,尚沒有任何一種檢測(cè)方法可以達(dá)到“定量”檢測(cè)HPV病毒的目的。這是由于采樣方法本身的局限性所造成的:在采集宮頸脫落細(xì)胞的過程中,雖然反復(fù)強(qiáng)調(diào)要采集“HPV易感區(qū)——轉(zhuǎn)化帶”的脫落細(xì)胞,但由于不同操作人員對(duì)“易感區(qū)”部位的判斷以及取樣手法的不同,我們不能準(zhǔn)確評(píng)估出取得的細(xì)胞樣品中攜帶病毒分子的細(xì)胞數(shù)量。比如:在第一次采集細(xì)胞樣品時(shí),取得了500個(gè)攜帶病毒分子的細(xì)胞,經(jīng)過檢測(cè)后,我們得出患者攜帶病毒數(shù)量是500;而對(duì)同一位患者進(jìn)行第二次采集細(xì)胞時(shí),由于多刷了一圈或者恰恰取到了“病灶區(qū)”,所以取得了1000個(gè)攜帶病毒分子的細(xì)胞,經(jīng)過檢測(cè),又得出攜帶病毒數(shù)量是1000。因?yàn)椴蓸硬僮鞅旧淼膯栴},使得前后這兩個(gè)數(shù)字已經(jīng)失去了它所具有的含義,因此,再將這兩個(gè)數(shù)字放在一起比較也就不具有任何實(shí)際意義。而且,因?yàn)椴《据d量與病變程度之間的關(guān)系尚沒有完全闡明,所以HPV病毒的定量檢測(cè)對(duì)臨床治療沒有任何指導(dǎo)意義。如果一定要使用“定量”這個(gè)詞語,那也只能在前面再加上“相對(duì)”二字。因?yàn)椋@個(gè)“定量”僅僅是將采集到的細(xì)胞樣品中的病毒數(shù)量進(jìn)行了“定量”,而不是對(duì)患者本身所攜帶的病毒數(shù)量進(jìn)行“定量”。常見問題及解決方案常見問題及解決方案創(chuàng)新專業(yè)追求卓越創(chuàng)新專業(yè)追求卓越
宮頸癌篩查技術(shù)—
HPV12+2分型檢測(cè)宮頸癌篩查技術(shù)—
一、HPV12+2檢測(cè)的意義及臨床應(yīng)用一、HPV12+2檢測(cè)的意義及臨床應(yīng)用25HPV的型別目前已發(fā)現(xiàn)超過200種型別的人乳頭瘤病毒(HPV)。依據(jù)與生殖道腫瘤相關(guān)性,將HPV分為:低危型常引起外生殖道濕疣等良性病變;6、11、42、43、44等。
高危型與子宮頸癌及子宮頸上皮內(nèi)瘤變(CIN2/3)的發(fā)生相關(guān);16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、68等。3HPV的型別目前已發(fā)現(xiàn)超過200種型別的人乳頭瘤病毒(HPHPV分型檢測(cè)的意義
(1)預(yù)測(cè)受檢者發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)度,確定最佳的治療時(shí)期GaryM.Cliffordetal;CancerEpidemiolBiomarkersPrev2005;14(5):1157–64提示:不同的高危型促進(jìn)LSIL(低度鱗狀上皮內(nèi)病變)向SCC(鱗狀細(xì)胞癌)轉(zhuǎn)變的能力有差異。HPV16,18的致宮頸癌風(fēng)險(xiǎn)性大于其他高危型HPV。
HPV分型檢測(cè)的意義
(1)預(yù)測(cè)受檢者發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)度,確定最佳基線篩查細(xì)胞學(xué)陰性/高危HPV陽性的女性10年內(nèi)≥CIN3病變的累積發(fā)病率KhanMJ,etal.JNatlCancerInst2005;97:1072–1079.Follow-uptime(months)Otherhigh-riskHPV+HPV18+High-riskHPV–HPV16+Cumulativeincidencerate
of≥CIN3(%)17.2%(11.5–22.9)HPV16+13.6%(3.6–23.7)HPV18+3.0%(1.9–4.2)其它高危型HPV陽性0.8%(0.6–1.1)高危型HPV陰性4.51527395163758799119.5111020151050基線時(shí)HPV16/18陽性者相比其它12種高危HPV型別陽性者,有更高風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)展為高度宮頸病變HPV16/18陽性的短期風(fēng)險(xiǎn)也明顯高于其它致癌型HPV陽性基線篩查細(xì)胞學(xué)陰性/高危HPV陽性的女性10年內(nèi)≥CIN3病對(duì)204例宮頸癌患者前瞻性研究發(fā)現(xiàn),HPV18型感染者是預(yù)后不良的重要指標(biāo),HPV18陽性5年存活率54.1%,而其他高危型感染的存活率為83.8%。HPV18型陽性者復(fù)發(fā)率53.6%,而HPV16型復(fù)發(fā)率僅為15.9%51例宮頸癌手術(shù)患者中,9例發(fā)生淋巴轉(zhuǎn)移中有6例為HPV18型107例晚期宮頸癌患者放療治療組中,HPV18型陽性者5年存活率為15.5%,而HPV16型為73.1%對(duì)于群體而言HPV16型感染危害最大對(duì)于個(gè)體而言HPV18型感染危險(xiǎn)度最高對(duì)204例宮頸癌患者前瞻性研究發(fā)現(xiàn),HPV18型感染者是預(yù)后
(2)16、18亞型持續(xù)感染的危險(xiǎn)性大于其他亞型對(duì)巴西1611名婦女在4個(gè)月間隔2次檢測(cè)HPV,HPV16,18持續(xù)陽性致HSIL風(fēng)險(xiǎn)性大于其他高危型HPV持續(xù)陽性。(NicolasF.Schlecht,et.al.
JAMA.2001;286(24):3106-3114.)宮頸癌的必要條件高危型的HPV感染HPV持續(xù)感染(2)16、18亞型持續(xù)感染的危險(xiǎn)性大于其他亞型對(duì)巴(3)針對(duì)不同型別的感染采取不同的處理方案相同細(xì)胞及組織學(xué)類型HPV陽性與陰性要區(qū)別對(duì)待不同HPV感染型別要區(qū)別對(duì)待例如:建議HPV16,18型的患者直接進(jìn)行陰道鏡檢查;而對(duì)于其他型別的感染,要結(jié)合細(xì)胞學(xué)診斷,一般不需要采取任何治療方法,但需要按時(shí)隨訪。44歲女性,2008年10月24日,婦檢宮頸光滑,滴蟲(+)HPV16,52(+),TCT:炎細(xì)胞中度。未行陰道鏡檢查,2010年10月18日。陰道鏡下宮頸活檢病理:鱗狀細(xì)胞癌(中分化)。未按規(guī)范篩查及隨訪,導(dǎo)致宮頸癌發(fā)生。廣東省婦幼保健院案例分析(3)針對(duì)不同型別的感染采取不同的處理方案相同細(xì)胞及組織學(xué)類
二、凱普HPV12+2檢測(cè)試劑盒二、凱普HPV12+2檢測(cè)試劑盒熒光PCR原理在PCR反應(yīng)體系中有上下游引物,在熒光PCR體系中也有上下游引物,還加入了一個(gè)熒光基團(tuán)-探針在PCR擴(kuò)增過程中,特異性引物和探針分別與靶序列結(jié)合,由于此時(shí)熒光基團(tuán)與猝滅基團(tuán)離的很近,猝滅基團(tuán)對(duì)熒光基團(tuán)的發(fā)光起到了抑制作用,因此熒光基團(tuán)不發(fā)光。
Taq酶在引物的引導(dǎo)下復(fù)制靶序列;當(dāng)遇到結(jié)合在兩條引物之間的探針時(shí),發(fā)揮5′端外切酶功能,將探針?biāo)?,水解下來的熒光基團(tuán)受激發(fā)發(fā)射熒光,每合成一條DNA鏈發(fā)射一次熒光信號(hào)。當(dāng)靶序列呈指數(shù)增長時(shí),發(fā)射的熒光信號(hào)量相應(yīng)增長,因此只要標(biāo)本中含相應(yīng)型別的HPV病毒就會(huì)有熒光信號(hào)的積累,從而達(dá)到檢測(cè)HPVDNA的目的。熒光猝滅熒光PCR原理在PCR反應(yīng)體系中有上下游引物,在熒光PCRHPV系列產(chǎn)品13種高危型HPV檢測(cè)試劑盒
(HPV16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、68)
不分型14種高危型HPV檢測(cè)試劑盒
(HPV16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、66、68)
對(duì)HPV16、18分型HPV系列產(chǎn)品13種高危型HPV檢測(cè)試劑盒14種高危型HPV14種高危型人乳頭狀瘤病毒聯(lián)合16/18基因分型檢測(cè)(12+2)試劑盒產(chǎn)品特點(diǎn)至少需要四通道以上的熒光PCR檢測(cè)儀器,一次檢測(cè)出14種高危HPV型別:HPV-31,HPV-33,HPV-35,HPV-39,HPV-45,HPV-51,HPV-52,HPV-56,HPV-58,HPV-59,HPV-66和HPV-68,同時(shí)能對(duì)HPV16和HPV18進(jìn)行分型檢測(cè)。具有β-globin基因內(nèi)對(duì)照,可以監(jiān)測(cè)所檢測(cè)樣本的可靠性。在全封閉體系中完成擴(kuò)增與檢測(cè),有效控制污染操作簡(jiǎn)便,自動(dòng)化操作,完成整個(gè)過程只需要2-3個(gè)小時(shí)。檢測(cè)區(qū)域設(shè)計(jì)在HPV基因組E區(qū),避免造成漏診。
70%-80%的宮頸癌都是由HPV16、18型感染引發(fā)的,可見在HPV熒光分型的產(chǎn)品中,對(duì)HPV16、18分型的重要性SFDA與歐盟的CE認(rèn)證資質(zhì)14種高危型人乳頭狀瘤病毒聯(lián)合16/18基因分型檢測(cè)(12+DNA提取
取800ul樣本離心得沉淀
↓加入細(xì)胞裂解液50ul,煮沸10min↓12000離心10min即可上機(jī)若肉眼未見沉淀,可增加取樣量,再次離心收集沉淀;若沉淀雜質(zhì)較多,可用細(xì)胞保存液洗滌1-2次;血液多樣本,用蒸餾水洗滌1-2次;粘液多樣本,取樣時(shí)盡量去除粘液。應(yīng)注意防止爆蓋:金屬浴可壓重物(冰盒、冰袋等)水浴應(yīng)采用螺旋管蓋的離心管確保離心管質(zhì)量合格優(yōu)點(diǎn):簡(jiǎn)單、快捷、方便。缺點(diǎn):HPVDNA純度較差,含有血紅素、蛋白、脂類等PCR抑制劑。針對(duì)男性樣本或女性疣體樣本(棉拭子樣本),先用細(xì)胞保存液/生理鹽水洗脫,收集沉淀,而后與上述操作一致DNA提取取800ul樣本離心得沉淀若肉PCR試劑配制按樣本數(shù)加入所需溶液的對(duì)應(yīng)量,充分混勻再分裝PCR試劑配制按樣本數(shù)加入所需溶液的對(duì)應(yīng)量,充分混勻再分裝儀器檢測(cè)通道選擇儀器檢測(cè)通道選擇我們一般把熒光PCR的前15個(gè)循環(huán)信號(hào)作為熒光本底信號(hào)(baseline,基線期),即樣本的熒光背景值和陰性對(duì)照的熒光值,擴(kuò)增的熒光信號(hào)被熒光背景信號(hào)所掩蓋。檢查調(diào)整基線熒光閾值的缺省設(shè)置是3~15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍(儀器自動(dòng)設(shè)置,auto)。但我們通常采用手動(dòng)設(shè)置(manual),手動(dòng)設(shè)置的原則是該閾值要大于樣本的熒光背景值和陰性對(duì)照的熒光最高值,同時(shí)要盡量選擇進(jìn)入指數(shù)期的最初階段,真正的信號(hào)出現(xiàn)在熒光信號(hào)超過閾值后。檢查調(diào)整閾值結(jié)果分析我們一般把熒光PCR的前15個(gè)循環(huán)信號(hào)作為熒光本底信1
定性結(jié)果判讀1)陰性對(duì)照Ct值均應(yīng)顯示為Undet。陽性對(duì)照Ct值≤36。符合以上兩個(gè)條件,此反應(yīng)是為有效。2)樣品的Ct值顯示為Undet,判斷為陰性。3)樣品的Ct值≤40,判斷為陽性;4)若為40<Ct值<45的樣本建議重做,重做結(jié)果Ct值<40者為陽性,否則為陰性。5)如果出現(xiàn)Ct值<15的強(qiáng)陽性樣本,可直接報(bào)告為陽性或自動(dòng)分析,并將其從樣品表中剔除,再按上面步驟分析其他樣本,或建議進(jìn)行1/100稀釋重做。定性報(bào)告單上,定量結(jié)果欄及參考范圍設(shè)置為N/A(無效欄)結(jié)果分析1定性結(jié)果判讀定性報(bào)告單上,定量結(jié)果欄及參考范圍設(shè)置為N/1擴(kuò)增曲線出現(xiàn)交叉擴(kuò)增曲線出現(xiàn)交叉,主要是因?yàn)槎嘁?、多探針反?yīng)體系中,每種型別的擴(kuò)增效率不一樣所致。同時(shí),樣本本身的原因也可能造成熒光曲線的差異。常見問題及解決方案2單個(gè)臨床樣本擴(kuò)增曲線底部上坡式不斷抬高加入的樣本DNA含有很多雜質(zhì)。重做,加樣前,樣本DNA1300
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