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文檔簡介

先進(jìn)計(jì)算助力科研探索先進(jìn)計(jì)算助力科研探索101020304無處不在的計(jì)算先進(jìn)計(jì)算助力科研探索精準(zhǔn)化HPC方案期許與展望目錄01020304無處不在的計(jì)算先進(jìn)計(jì)算助力科研探索精準(zhǔn)化HP進(jìn)一步考慮E級超算在解決人類共同面臨的能源危機(jī)、環(huán)境污染和氣候變化等重大問題上的巨大作用,在E級機(jī)的研制中加強(qiáng)協(xié)同,與綜合性國家科學(xué)中心、科創(chuàng)中心等創(chuàng)新資源形成合力;——白春禮HPC助力科研探索進(jìn)一步考慮E級超算在解決人類共同面臨的能源危機(jī)、環(huán)境污染和氣HPC助力大科學(xué)裝置——高能物理HPC助力大科學(xué)裝置——高能物理每日~5TB數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)保留10+年海量天文數(shù)據(jù)整合分析天體分析和挖掘天文大數(shù)據(jù)可視化擴(kuò)展應(yīng)用:農(nóng)業(yè)、遙感、能源等HPC助力大科學(xué)裝置——FAST每日~5TB數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)保留10+年海量天文數(shù)據(jù)整合分析天體分析部分應(yīng)用研究防災(zāi)減災(zāi)區(qū)域天氣和氣候?yàn)?zāi)害及次生災(zāi)害預(yù)測與防治洪水淹沒范圍遙感數(shù)據(jù)同化研究汶川地震發(fā)生過程的動力學(xué)模擬臺風(fēng)登陸前后異常變化機(jī)理研究清潔能源光伏電站功率預(yù)測與環(huán)境關(guān)系研究大型風(fēng)電場風(fēng)電量短期預(yù)報(bào)模式系統(tǒng)生態(tài)農(nóng)業(yè)旱區(qū)多遙感平臺農(nóng)田信息精準(zhǔn)獲取技術(shù)集成與應(yīng)用全球大宗作物遙感定量監(jiān)測關(guān)鍵技術(shù)高分辨率全國農(nóng)作物產(chǎn)量預(yù)測大氣污染防治大氣污染預(yù)報(bào)與調(diào)控模式京津冀地區(qū)城市化對大氣邊界層和區(qū)域環(huán)境氣候的影響研究氣象氣候街區(qū)可分辨氣象數(shù)值模擬技術(shù)研究高分辨率氣候系統(tǒng)模式的研制與評估高分辨率區(qū)域氣候模式開發(fā)與業(yè)務(wù)化HPC助力大科學(xué)裝置——地球模擬器部分應(yīng)用研究防災(zāi)減災(zāi)區(qū)域天氣和氣候?yàn)?zāi)害及次生災(zāi)害預(yù)測與防治清1實(shí)驗(yàn)2理論3計(jì)算

模擬4大數(shù)據(jù)

研究疫苗研制高能物理氣候研究新型材料生物醫(yī)學(xué)生態(tài)環(huán)境地球模擬類人智能科學(xué)

研究計(jì)算已經(jīng)無處不在,但支撐科學(xué)進(jìn)步的本質(zhì)從未改變。滿足科學(xué)研究的需要是HPC系統(tǒng)的唯一目標(biāo)。應(yīng)用的支撐是衡量的重要指標(biāo)無處不在的計(jì)算多元融合的計(jì)算模式、概念、技術(shù)和應(yīng)用科學(xué)計(jì)算數(shù)據(jù)密集型計(jì)算類腦計(jì)算量子計(jì)算終端計(jì)算邊緣計(jì)算人機(jī)物三元融合計(jì)算云計(jì)算網(wǎng)絡(luò)計(jì)算人工智能深度學(xué)習(xí)智能計(jì)算并行計(jì)算高性能計(jì)算計(jì)算機(jī)大型機(jī)小型機(jī)個人電腦智能手機(jī)超級計(jì)算模擬仿真神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器智慧計(jì)算無邊界計(jì)算認(rèn)知計(jì)算低功耗計(jì)算霧計(jì)算光子計(jì)算1實(shí)驗(yàn)2理論3計(jì)算

模擬4大數(shù)據(jù)

研究疫苗研制高能物理氣候研2014年11月,“中科院先進(jìn)計(jì)算技術(shù)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)化聯(lián)盟”正式成立中科院首個技術(shù)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)化聯(lián)盟,曙光作為理事長單位與研究所(特別是應(yīng)用類)緊密結(jié)合,重點(diǎn)面向國家在高性能計(jì)算、云計(jì)算、大數(shù)據(jù)等應(yīng)用領(lǐng)域的技術(shù)與裝備的需求,開展協(xié)同研發(fā)和產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用推廣,建立成果孵化轉(zhuǎn)化平臺聯(lián)盟的成立,符合新時期國家深化科技體制改革的政策精神,是中科院深入推進(jìn)《“率先行動”計(jì)劃》,服務(wù)國民經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場的重要舉措,對中科院探索“兩鏈嫁接”的有效途徑和模式具有重要的示范意義——中國科學(xué)院院長白春禮中科院先進(jìn)計(jì)算中心與產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟2014年11月,“中科院先進(jìn)計(jì)算技術(shù)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)化聯(lián)盟”正式曙光與中科院大氣所合資公司,布局生態(tài)環(huán)境大數(shù)據(jù)。曙光與中科院電子所合資企業(yè),專注于地理空間大數(shù)據(jù)處理國內(nèi)領(lǐng)先的指靜脈生物識別技術(shù)廠商和身份認(rèn)證解決方案提供商。曙光與VMware首家合資企業(yè),依托曙光多年自主研發(fā)基礎(chǔ),保障云安全國標(biāo)審查。中科曙光發(fā)展思路曙光與中科院大氣所合資公司,布局生態(tài)環(huán)境大數(shù)據(jù)。曙光與中科院曙光高性能計(jì)算平臺曙光XData大數(shù)據(jù)計(jì)算平臺曙光深度學(xué)習(xí)計(jì)算平臺曙光ParaStor數(shù)據(jù)存儲平臺曙光EasyOP運(yùn)維管理平臺曙光科學(xué)大數(shù)據(jù)引擎曙光高性能計(jì)算平臺曙光XData大數(shù)據(jù)計(jì)算平臺曙光深度學(xué)EasyOP在線運(yùn)維服務(wù)機(jī)房基礎(chǔ)設(shè)施:機(jī)房、機(jī)柜、配電、空調(diào)等通用計(jì)算節(jié)點(diǎn)胖節(jié)點(diǎn)協(xié)處理器節(jié)點(diǎn)計(jì)算網(wǎng)絡(luò)存儲系統(tǒng)監(jiān)控管理網(wǎng)絡(luò)網(wǎng)絡(luò)安全集群功能節(jié)點(diǎn)HPC基礎(chǔ)軟件環(huán)境集群監(jiān)控管理軟件作業(yè)調(diào)度軟件應(yīng)用WebPortalHPC應(yīng)用:物理、化學(xué)、材料、生命科學(xué)、CAE、氣象、海洋、環(huán)境、遙感、天文、高能物理、石油物探、動漫渲染、金融…基礎(chǔ)設(shè)施層硬件資源層基礎(chǔ)軟件層應(yīng)用軟件層先進(jìn)計(jì)算服務(wù)先進(jìn)計(jì)算服務(wù)平臺(計(jì)算力)科技創(chuàng)新服務(wù)平臺(創(chuàng)新力)產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新服務(wù)平臺(生態(tài)環(huán))中科曙光HPC布局EasyOP機(jī)房基礎(chǔ)設(shè)施:機(jī)房、機(jī)柜、配電、空調(diào)等通用計(jì)算節(jié)圖:某超算中心計(jì)算資源在各學(xué)科的分布HPC應(yīng)用特征分析圖:某超算中心計(jì)算資源在各學(xué)科的分布HPC應(yīng)用特征分析主頻穩(wěn)定在2.8GHz(Base)AVX指令調(diào)用數(shù)4000-8000波動(HPL的1/10)性能大部分依賴高主頻,AVX有一定收益主頻內(nèi)存讀AVX指令集內(nèi)存寫內(nèi)存讀帶寬36GB/s,寫帶寬55GB/s內(nèi)存訪問密集,內(nèi)存帶寬敏感HPC應(yīng)用特征分析——材料計(jì)算主頻穩(wěn)定在2.8GHz(Base)性能大部分依賴高主頻,AV2個刀片(4顆CPU)共享1個100Gb/sMulti-HostInfiniBand刀片型號CX20-G30CPU2個IntelXeonE3-1200v6系列CPU內(nèi)存8個DDR4DIMM插槽硬盤2個本地2.5寸SATA/SSD硬盤或2個內(nèi)置M.2PCIeSSD網(wǎng)絡(luò)100Gb/sInfiniBand(2個刀片共享)PCIe3.0E3-1200v5刀片應(yīng)用測試結(jié)果高主頻直接性能提升,對AVX加速提供進(jìn)一步補(bǔ)償Multi-host提供高性價比組網(wǎng)方案節(jié)約軟件license費(fèi)用,充分發(fā)揮軟件license效能配套資源——高主頻計(jì)算資源M-ProBlade1CPU0Blade1CPU1Blade2CPU0Blade2CPU2100Gb/sMulti-HostIB2個刀片(4顆CPU)共享刀片型號CX20-G30CPU2M-Pro加速效果M-Pro加速效果以大批量串行(或小規(guī)模并行)任務(wù)為主要特性,任務(wù)量通常在數(shù)百以上通常開啟超線程運(yùn)行,相比關(guān)閉狀態(tài)性能提升(內(nèi)存足夠情況下提升更明顯)內(nèi)存消耗較大,通常每線程4GB左右大批量任務(wù)、龐大的基因數(shù)據(jù)帶來存儲巨大壓力(帶寬和IOPS)高負(fù)荷生物信息應(yīng)用的存儲負(fù)載(分布式存儲)BWA應(yīng)用的4K小數(shù)據(jù)塊讀寫操作HPC應(yīng)用特征分析——生物信息以大批量串行(或小規(guī)模并行)任務(wù)為主要特性,任務(wù)量通常在數(shù)百以生物信息為代表的應(yīng)用,任務(wù)量大,需要足夠多的物理計(jì)算核心打開超線程可提升性能,不同于傳統(tǒng)hpc應(yīng)用(通常關(guān)閉)海量任務(wù)批次提交,瞬間提升存儲壓力生物信息、天文等海量數(shù)據(jù)存儲,數(shù)據(jù)密集型業(yè)務(wù)基于全新的Zen架構(gòu),性能大幅提升單處理器最多32核心每顆處理器8個

內(nèi)存通道,雙路實(shí)測性能280GB/s需求驅(qū)動資源分區(qū)<——AMDParastor多核心大內(nèi)存超線程業(yè)務(wù)對存儲壓力大——>曙光A620-G30配套資源——AMD計(jì)算資源以生物信息為代表的應(yīng)用,任務(wù)量大,需要足夠多的物理計(jì)算核心基數(shù)據(jù)、元數(shù)據(jù)分離保障元數(shù)據(jù)性能全冗余配置保障系統(tǒng)高可用;支持透明分級存儲提升性價比;分布式鎖機(jī)制改善小文件讀寫;RDMA協(xié)議提供超高讀寫性能;配套存儲——分布式并行存儲Parastor數(shù)據(jù)、元數(shù)據(jù)分離保障元數(shù)據(jù)性能全冗余配置保障系統(tǒng)高可用;支持曙光Xmachine系列異構(gòu)計(jì)算節(jié)點(diǎn)、SuperBox深度學(xué)習(xí)平臺、圖形工作站人工智能——曙光視覺計(jì)算產(chǎn)品線X580-G30雙路SkylakeCPU;3UPI支持8個3.5”熱插拔盤位支持4個雙寬GPU加速卡額外支持2個PCIe3x16插槽(1+1)冗余2000W鈦金電源X740-G30雙路SkylakeCPU;3UPI支持8個2.5”熱插拔盤位支持6個雙寬GPU加速卡額外支持1個PCIe3x16插槽(1+1)冗余2000W鉑金電源X780-G30雙路SkylakeCPU;3UPI支持24個2.5”熱插拔盤位支持8個雙寬GPU加速卡額外支持2個PCIe3x16插槽(2+2)冗余1600W鉑金電源SupreBox支持20個PCIe3.0X16插槽,同時支持20個人工智能在線處理加速器最大支持1TB內(nèi)存W560-G20雙路機(jī)塔互換支持3個雙寬圖形顯示卡冗余電源曙光Xmachine系列異構(gòu)計(jì)算節(jié)點(diǎn)、SuperBox深度學(xué)人工智能——SoThisAI平臺人工智能——SoThisAI平臺8U2×2×33D-Torus6×32-ports頁板前面板192×100GbpsQSFP接口后面板48×400GbpsTorus互聯(lián)接口管理模塊液冷制冷曙光硅元交換機(jī)4/5/6D-Torus3D-Torus硅元交換機(jī)高可擴(kuò)展網(wǎng)絡(luò)——硅元交換機(jī)8U曙光硅元交換機(jī)4/5/6D-Torus3D-Torus作業(yè)調(diào)度Portal可視化作業(yè)提交遠(yuǎn)程三維設(shè)計(jì)調(diào)度管理桌面管理可視化+計(jì)算——曙光Gridview4.0管理調(diào)度系統(tǒng)作業(yè)調(diào)度Portal可視化作業(yè)提交遠(yuǎn)程三維設(shè)計(jì)調(diào)度管理桌面管專業(yè)的7*24小時高性能計(jì)算機(jī)遠(yuǎn)程運(yùn)維高性能計(jì)算專家在線咨詢服務(wù)智能化,自動化運(yùn)維服務(wù)大數(shù)據(jù)在線分析在線運(yùn)維平臺——EasyOP專業(yè)的7*24小時高性能計(jì)算機(jī)遠(yuǎn)程運(yùn)維高性能計(jì)算專家在線咨詢新型材料污染治理天文探索……先進(jìn)計(jì)算E級機(jī)產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟曙光希望依托在HPC、先進(jìn)計(jì)算、E級技術(shù)領(lǐng)域的技術(shù)積累,更好的為中國科研事業(yè),做出更多貢獻(xiàn)!期許與展望新型材料污染治理天文探索……先進(jìn)計(jì)算E級機(jī)產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟曙光希望依02先進(jìn)計(jì)算助力科研探索課件25先進(jìn)計(jì)算助力科研探索先進(jìn)計(jì)算助力科研探索2601020304無處不在的計(jì)算先進(jìn)計(jì)算助力科研探索精準(zhǔn)化HPC方案期許與展望目錄01020304無處不在的計(jì)算先進(jìn)計(jì)算助力科研探索精準(zhǔn)化HP進(jìn)一步考慮E級超算在解決人類共同面臨的能源危機(jī)、環(huán)境污染和氣候變化等重大問題上的巨大作用,在E級機(jī)的研制中加強(qiáng)協(xié)同,與綜合性國家科學(xué)中心、科創(chuàng)中心等創(chuàng)新資源形成合力;——白春禮HPC助力科研探索進(jìn)一步考慮E級超算在解決人類共同面臨的能源危機(jī)、環(huán)境污染和氣HPC助力大科學(xué)裝置——高能物理HPC助力大科學(xué)裝置——高能物理每日~5TB數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)保留10+年海量天文數(shù)據(jù)整合分析天體分析和挖掘天文大數(shù)據(jù)可視化擴(kuò)展應(yīng)用:農(nóng)業(yè)、遙感、能源等HPC助力大科學(xué)裝置——FAST每日~5TB數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)保留10+年海量天文數(shù)據(jù)整合分析天體分析部分應(yīng)用研究防災(zāi)減災(zāi)區(qū)域天氣和氣候?yàn)?zāi)害及次生災(zāi)害預(yù)測與防治洪水淹沒范圍遙感數(shù)據(jù)同化研究汶川地震發(fā)生過程的動力學(xué)模擬臺風(fēng)登陸前后異常變化機(jī)理研究清潔能源光伏電站功率預(yù)測與環(huán)境關(guān)系研究大型風(fēng)電場風(fēng)電量短期預(yù)報(bào)模式系統(tǒng)生態(tài)農(nóng)業(yè)旱區(qū)多遙感平臺農(nóng)田信息精準(zhǔn)獲取技術(shù)集成與應(yīng)用全球大宗作物遙感定量監(jiān)測關(guān)鍵技術(shù)高分辨率全國農(nóng)作物產(chǎn)量預(yù)測大氣污染防治大氣污染預(yù)報(bào)與調(diào)控模式京津冀地區(qū)城市化對大氣邊界層和區(qū)域環(huán)境氣候的影響研究氣象氣候街區(qū)可分辨氣象數(shù)值模擬技術(shù)研究高分辨率氣候系統(tǒng)模式的研制與評估高分辨率區(qū)域氣候模式開發(fā)與業(yè)務(wù)化HPC助力大科學(xué)裝置——地球模擬器部分應(yīng)用研究防災(zāi)減災(zāi)區(qū)域天氣和氣候?yàn)?zāi)害及次生災(zāi)害預(yù)測與防治清1實(shí)驗(yàn)2理論3計(jì)算

模擬4大數(shù)據(jù)

研究疫苗研制高能物理氣候研究新型材料生物醫(yī)學(xué)生態(tài)環(huán)境地球模擬類人智能科學(xué)

研究計(jì)算已經(jīng)無處不在,但支撐科學(xué)進(jìn)步的本質(zhì)從未改變。滿足科學(xué)研究的需要是HPC系統(tǒng)的唯一目標(biāo)。應(yīng)用的支撐是衡量的重要指標(biāo)無處不在的計(jì)算多元融合的計(jì)算模式、概念、技術(shù)和應(yīng)用科學(xué)計(jì)算數(shù)據(jù)密集型計(jì)算類腦計(jì)算量子計(jì)算終端計(jì)算邊緣計(jì)算人機(jī)物三元融合計(jì)算云計(jì)算網(wǎng)絡(luò)計(jì)算人工智能深度學(xué)習(xí)智能計(jì)算并行計(jì)算高性能計(jì)算計(jì)算機(jī)大型機(jī)小型機(jī)個人電腦智能手機(jī)超級計(jì)算模擬仿真神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器智慧計(jì)算無邊界計(jì)算認(rèn)知計(jì)算低功耗計(jì)算霧計(jì)算光子計(jì)算1實(shí)驗(yàn)2理論3計(jì)算

模擬4大數(shù)據(jù)

研究疫苗研制高能物理氣候研2014年11月,“中科院先進(jìn)計(jì)算技術(shù)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)化聯(lián)盟”正式成立中科院首個技術(shù)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)化聯(lián)盟,曙光作為理事長單位與研究所(特別是應(yīng)用類)緊密結(jié)合,重點(diǎn)面向國家在高性能計(jì)算、云計(jì)算、大數(shù)據(jù)等應(yīng)用領(lǐng)域的技術(shù)與裝備的需求,開展協(xié)同研發(fā)和產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用推廣,建立成果孵化轉(zhuǎn)化平臺聯(lián)盟的成立,符合新時期國家深化科技體制改革的政策精神,是中科院深入推進(jìn)《“率先行動”計(jì)劃》,服務(wù)國民經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場的重要舉措,對中科院探索“兩鏈嫁接”的有效途徑和模式具有重要的示范意義——中國科學(xué)院院長白春禮中科院先進(jìn)計(jì)算中心與產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟2014年11月,“中科院先進(jìn)計(jì)算技術(shù)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)化聯(lián)盟”正式曙光與中科院大氣所合資公司,布局生態(tài)環(huán)境大數(shù)據(jù)。曙光與中科院電子所合資企業(yè),專注于地理空間大數(shù)據(jù)處理國內(nèi)領(lǐng)先的指靜脈生物識別技術(shù)廠商和身份認(rèn)證解決方案提供商。曙光與VMware首家合資企業(yè),依托曙光多年自主研發(fā)基礎(chǔ),保障云安全國標(biāo)審查。中科曙光發(fā)展思路曙光與中科院大氣所合資公司,布局生態(tài)環(huán)境大數(shù)據(jù)。曙光與中科院曙光高性能計(jì)算平臺曙光XData大數(shù)據(jù)計(jì)算平臺曙光深度學(xué)習(xí)計(jì)算平臺曙光ParaStor數(shù)據(jù)存儲平臺曙光EasyOP運(yùn)維管理平臺曙光科學(xué)大數(shù)據(jù)引擎曙光高性能計(jì)算平臺曙光XData大數(shù)據(jù)計(jì)算平臺曙光深度學(xué)EasyOP在線運(yùn)維服務(wù)機(jī)房基礎(chǔ)設(shè)施:機(jī)房、機(jī)柜、配電、空調(diào)等通用計(jì)算節(jié)點(diǎn)胖節(jié)點(diǎn)協(xié)處理器節(jié)點(diǎn)計(jì)算網(wǎng)絡(luò)存儲系統(tǒng)監(jiān)控管理網(wǎng)絡(luò)網(wǎng)絡(luò)安全集群功能節(jié)點(diǎn)HPC基礎(chǔ)軟件環(huán)境集群監(jiān)控管理軟件作業(yè)調(diào)度軟件應(yīng)用WebPortalHPC應(yīng)用:物理、化學(xué)、材料、生命科學(xué)、CAE、氣象、海洋、環(huán)境、遙感、天文、高能物理、石油物探、動漫渲染、金融…基礎(chǔ)設(shè)施層硬件資源層基礎(chǔ)軟件層應(yīng)用軟件層先進(jìn)計(jì)算服務(wù)先進(jìn)計(jì)算服務(wù)平臺(計(jì)算力)科技創(chuàng)新服務(wù)平臺(創(chuàng)新力)產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新服務(wù)平臺(生態(tài)環(huán))中科曙光HPC布局EasyOP機(jī)房基礎(chǔ)設(shè)施:機(jī)房、機(jī)柜、配電、空調(diào)等通用計(jì)算節(jié)圖:某超算中心計(jì)算資源在各學(xué)科的分布HPC應(yīng)用特征分析圖:某超算中心計(jì)算資源在各學(xué)科的分布HPC應(yīng)用特征分析主頻穩(wěn)定在2.8GHz(Base)AVX指令調(diào)用數(shù)4000-8000波動(HPL的1/10)性能大部分依賴高主頻,AVX有一定收益主頻內(nèi)存讀AVX指令集內(nèi)存寫內(nèi)存讀帶寬36GB/s,寫帶寬55GB/s內(nèi)存訪問密集,內(nèi)存帶寬敏感HPC應(yīng)用特征分析——材料計(jì)算主頻穩(wěn)定在2.8GHz(Base)性能大部分依賴高主頻,AV2個刀片(4顆CPU)共享1個100Gb/sMulti-HostInfiniBand刀片型號CX20-G30CPU2個IntelXeonE3-1200v6系列CPU內(nèi)存8個DDR4DIMM插槽硬盤2個本地2.5寸SATA/SSD硬盤或2個內(nèi)置M.2PCIeSSD網(wǎng)絡(luò)100Gb/sInfiniBand(2個刀片共享)PCIe3.0E3-1200v5刀片應(yīng)用測試結(jié)果高主頻直接性能提升,對AVX加速提供進(jìn)一步補(bǔ)償Multi-host提供高性價比組網(wǎng)方案節(jié)約軟件license費(fèi)用,充分發(fā)揮軟件license效能配套資源——高主頻計(jì)算資源M-ProBlade1CPU0Blade1CPU1Blade2CPU0Blade2CPU2100Gb/sMulti-HostIB2個刀片(4顆CPU)共享刀片型號CX20-G30CPU2M-Pro加速效果M-Pro加速效果以大批量串行(或小規(guī)模并行)任務(wù)為主要特性,任務(wù)量通常在數(shù)百以上通常開啟超線程運(yùn)行,相比關(guān)閉狀態(tài)性能提升(內(nèi)存足夠情況下提升更明顯)內(nèi)存消耗較大,通常每線程4GB左右大批量任務(wù)、龐大的基因數(shù)據(jù)帶來存儲巨大壓力(帶寬和IOPS)高負(fù)荷生物信息應(yīng)用的存儲負(fù)載(分布式存儲)BWA應(yīng)用的4K小數(shù)據(jù)塊讀寫操作HPC應(yīng)用特征分析——生物信息以大批量串行(或小規(guī)模并行)任務(wù)為主要特性,任務(wù)量通常在數(shù)百以生物信息為代表的應(yīng)用,任務(wù)量大,需要足夠多的物理計(jì)算核心打開超線程可提升性能,不同于傳統(tǒng)hpc應(yīng)用(通常關(guān)閉)海量任務(wù)批次提交,瞬間提升存儲壓力生物信息、天文等海量數(shù)據(jù)存儲,數(shù)據(jù)密集型業(yè)務(wù)基于全新的Zen架構(gòu),性能大幅提升單處理器最多32核心每顆處理器8個

內(nèi)存通道,雙路實(shí)測性能280GB/s需求驅(qū)動資源分區(qū)<——AMDParastor多核心大內(nèi)存超線程業(yè)務(wù)對存儲壓力大——>曙光A620-G30配套資源——AMD計(jì)算資源以生物信息為代表的應(yīng)用,任務(wù)量大,需要足夠多的物理計(jì)算核心基數(shù)據(jù)、元數(shù)據(jù)分離保障元數(shù)據(jù)性能全冗余配置保障系統(tǒng)高可用;支持透明分級存儲提升性價比;分布式鎖機(jī)制改善小文件讀寫;RDMA協(xié)議提供超高讀寫性能;配套存儲——分布式并行存儲Parastor數(shù)據(jù)、元數(shù)據(jù)分離保障元數(shù)據(jù)性能全冗余配置保障系統(tǒng)高可用;支持曙光Xmachine系列異構(gòu)計(jì)算節(jié)點(diǎn)、SuperBox深度學(xué)習(xí)平臺、圖形工作站人工智能——曙光視覺計(jì)算產(chǎn)品線X580-G30雙路SkylakeCPU;3UPI支持8個3.5”熱插拔盤位支持4個雙寬GPU加速卡額外支持2個PCIe3x16插槽(1+1)冗余2000W鈦金電源X740-G30雙路SkylakeCPU;3UPI支持8個2

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