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非編碼RNA:是指不編碼蛋白質(zhì)的RNA上行使各自的生物學(xué)功能。
管家非編碼RNA:rRNA、tRNA、snoRNA(核仁小調(diào)控非編碼RNA:長(zhǎng)鏈非編碼RNAmiRNA常用數(shù)據(jù) 搜尋動(dòng)物的microRNA靶。是預(yù)測(cè)microRNA開發(fā)的搜尋動(dòng)物的microRNA靶。假陽性率也miRBase數(shù)據(jù)出 頁 搜索物可以直接寫具體物到其它數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)到 顯示 組信 點(diǎn)擊顯 位點(diǎn)信列下方頁面具體顯示匹配位lncRNA常用 、ONCODE等,利用gene 以“ANRIL”為例,輸入名ANRIL的別有很多較新的lncRNA在Lncrnadb對(duì)于較新的lncRNA可以使用UCSC數(shù)據(jù)庫式包括: 預(yù)測(cè)lncRNA與蛋白結(jié)合的數(shù)據(jù)庫RBPDB以ANRIL為點(diǎn)擊搜索結(jié)果頁面的RBPname可顯示具體信反過來,從蛋白預(yù)測(cè)結(jié)合的如果已知蛋白的結(jié)合序列可以進(jìn)行Blast搜 NONDMET033136.1如果想在NCBI上了解信息,可以用NCBIblast搜索該序 circRNA常用數(shù) 獲取環(huán)狀RNA點(diǎn)擊search后出 et數(shù)據(jù) circularRNA 提供circRNA 注顯示結(jié)circRNA驗(yàn)證反向引物設(shè)ncRNA相互關(guān)聯(lián) (degradomesequencing)搜尋micorRNA靶標(biāo),提miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA,miRNA-ceRNA和RNA-1根據(jù)lncRNA找microRNA以lncRNAHOTAIR為預(yù)測(cè)與3個(gè)腫瘤相2查找RNA的結(jié)合得到“HOTAIR”可能的靶向蛋與RNA結(jié)合的蛋白信Ensemble數(shù)據(jù)庫里的Hotair信HotaircDNA3根 找microRNA靶4查找ceRNA調(diào)控 名點(diǎn)擊miRNA后出現(xiàn)該miRNA的相關(guān)文 2【MirPathv.3】:顯示通路結(jié)可以同時(shí)分析多條miRNA通路交集的熱輸入miRNA名 搜索結(jié)4【miRGenv.3】:miRNA啟動(dòng)子和5【MirExTrav2.0】:尋找差異的miRNA 選擇好后點(diǎn)擊顯示下調(diào)最顯著
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