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文檔簡介
Lecture2.NucleicacidsandthePengChenPh.DDepartmentofChemicalBiologyCollegeofChemistry,Central一、核酸的化(nucleic核苷酸 戊
核苷
戊核 脫氧核核酸中的糖,核糖中2位有OH,脫氧核糖中2位無中2位無OH的DNA高的多,DNA的功能要求其具有較高的在DNA在DNA和RNA不存在母堿嘧啶和嘌呤(圖左側(cè))五種DNA和RNA的堿基(圖右側(cè)堿基嘌嘌腺嘌鳥嘌尿嘧胸腺 腺 脫氧胸三三種核苷酸。5’-OH磷酸化形成5’脫氧腺Nucleicacidsarepolymersof二、核酸的結(jié)一級結(jié)構(gòu):脫氧核苷酸分子間連接方式及排列二級結(jié)構(gòu):DNA的兩條多聚核苷酸鏈間通過氫三級結(jié)構(gòu):DNA雙鏈進一步折疊卷曲形成的構(gòu)1953年,Watson和Crick根據(jù)Chargaff規(guī)律和DNANa鹽纖維的X光衍射分析提出了DNA 、證明DNA有特異性、發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化活性不局限于特定細菌的特定性1953tsonCri在Frnlin和ilin對進行線衍射的基礎(chǔ)上提出★DNA的Na鹽纖維和DNA晶體的X光衍射分Watson-Crick雙螺旋結(jié)構(gòu)模型(B-★磷酸與脫氧核糖彼★大溝:寬1.2nm,深★小溝:寬0.6nm,深★兩條反平行的多核苷酸鏈繞ThreemaindoublestrandconformationstermedA,B,andZBconformationisthemost螺螺螺旋螺旋軸通過每對堿基的中心,堿基垂軸堆積。大溝和小溝同樣深,而大溝B—DNA:典型的Watson-Crick雙螺旋右手雙右手雙螺旋,外形 左手螺旋,外形細天然B-DNA的局部區(qū)域可以形成Z-DNAMajorgrooveandminorDNA的高級DNA在雙螺旋的基礎(chǔ)上通 和折疊形成的構(gòu)11﹑超螺旋 機連型說明DNA鏈中螺旋與超螺松DNA超螺 雙螺旋DNA導(dǎo)致正超螺
雙螺旋DNA的開導(dǎo)致負(fù)超正超螺
拓?fù)洚愪逡?/p>
松弛
拓?fù)洚悩?gòu)
負(fù)超螺The"epigeneticcode"controlsgeneactivitywithchemicaltagsthatmarkDNA(purplediamonds)andthe"tails"ofhistoneproteins(purpletriangles).ThesemarkingshelpdeterminewhethergeneswillbetranscribedbyRNApolymerase.GeneshiddenfromaccesstoRNApolymerasearenotexpressed.QuadruplexDNAGuanineDNAWatson和Crick在提出DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型時對 模型進行了探討結(jié)構(gòu)由于兩條鏈上的堿基-G只能與C配對,A只能與T配對,兩條鏈?zhǔn)茄a,一條核苷酸排列順序決定了另一條核苷酸排列DNA分子的每一條鏈都含有合成它的互補鏈的所需的全部 模 分別作為模板合成新鏈,產(chǎn)生互補的兩條鏈新形成的兩個DNA分子與原來的DNA分子堿基序列完全每個子代分子的一條鏈來自親代DNA,另一條是新合成的,這種制方式稱為DNA的半保留方一,DNA的半保 機三種 的假半保留 保留WEAVER:FIG.按照三 假設(shè)保DNA分子的預(yù)期的梯度保半半保隨隨機預(yù)期的梯WEAVER:FIG.證實DNA的半保 方式的實15N密度標(biāo)記后都取樣提取并進行CsCl平衡
DNA分子對CsCl進行梯度超離心進行梯度密度的UV梯度密度的紫外光掃描光密驗支持半保 的假CsCl度超離心結(jié)E.coli細胞生長4.1代的別構(gòu)成子代分子的一半,這些 WEAVER:FIG.1
有關(guān)的酶和蛋白 叉的前進而移2,單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB蛋白單鏈DNA被SSB蛋白結(jié)合后可受保護,不被酶水解。如T4噬體的gp323,旋轉(zhuǎn)酶,又稱拓?fù)洚悩?gòu)酶利用ATP水解提供能量使DNA的兩條鏈同時發(fā)生斷裂和再連DNAreplicationinDNA合成的片段的合成需要RNA引酶(Primase)是一編碼為dnaG,鏈和后滯RNA引12nt)(紅色)(綠箭頭WEAVER:FIG.后滯鏈的后滯鏈合成為長為100-1000bp)片段 片“Okazakifragments”片段合成的起始需要引物酶合成6-15ntRNA物PolIII延伸RNA引物使一個 PolI的5’-3’外切酶活性降解RNA部分,用DNA取。該階滯鏈?zhǔn)遣贿B續(xù)的短片段(沒有豁口片段由DNA連接酶共價縫合DNA前導(dǎo)鏈DNA前新合前新合成滑 后引新 片 物
導(dǎo)親親螺單鏈后滯單鏈
剛合剛合成片DNAreplicationinSolidphasesynthesisofRNAMessageRNAmRNAisamoleculeofRNAencodingachemical"blueprint"foraproteinproduct.tRNAanditscloverleafRibosomemRNARibosomalRNA(rRNA)isthecentralcomponentoftheThecatalyticcentreresponsibleforpeptidebondformation,thepeptidyltransferasecentre,isthoughttobelocatedinthe28SrRNA.SmallnuclearRNAAclassofsmallRNAmoleculesfoundwithinthecellnucleus.InvolvedinavarietyofimportantprocessessuchasRNAsplicing(removalofintrons).Alwaysassociatedwithspecificproteins,andthecomplexesarereferredtoassmallnuclearribonucleoproteins(snRNPs).RNAInterferenceRNAworldEvolutionofRNASolidphasesynthesisof2所有已知的DNA聚合酶都需要引物,如 真核生物的線DNA的末端新近
RNA引 模去除引物留下的豁口原核生物,環(huán) ,DNA聚合酶I可以消除引物
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