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文檔簡介

丙型肝炎病毒核酸

定量檢測技術(shù)PCRfluorescencequantitativeGotyouthinking?

HepatitisCVirus的基因結(jié)構(gòu)3’UTR有多聚U區(qū)域(polyU)及1段高度保守的98個(gè)堿基的區(qū)域,稱為X-tail。不同基因型的HCV的多聚U有不同的長度。3’UTR末端150個(gè)核苷酸序列(包括多聚U區(qū)和3’X-tail)含有HCV復(fù)制所必需的33’順式復(fù)制元件,可能作為啟動(dòng)子來起始負(fù)鏈RNA的合成。Wethikn5′UTR

進(jìn)行序列信息比對TheperformanceoftheblastGenBank查找全序列DNASTAR軟件包中的MegAlign軟件,采用ClustalW法確定引物設(shè)計(jì)序列中國大陸HCV感染的趨勢:中國大陸HCV流行基因型主要為1,2,3和6型,沒有發(fā)現(xiàn)4和5基因型。中國大陸地區(qū)最常見的基因型為1b和2a,流行率為73.1%和18.5%,其次為3a,6a,3b,6n和1a。基因3型和6型的地理分布越來越廣。常用的技術(shù)熒光染料法熒光探針法Real-timequantitativePCR定量檢測常用方法

改進(jìn)建議TaqMan?/TaqMan-MGB?SYBRGreenIMolecularBeacon絕對定量

標(biāo)準(zhǔn)曲線由已知濃度的RNA、質(zhì)?;蚝铣傻墓焰満怂嵘啥课粗0鍢?biāo)準(zhǔn)樣品和未知樣品同時(shí)反應(yīng)先用特異性引物(反向)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄擴(kuò)增,再以合成的cDNA為模板,以特異性引物(正、反向)進(jìn)行PCR反應(yīng)Rotor-GeneQInstrumentsOthers…MGB探針、分子信標(biāo)此外,現(xiàn)在的試劑盒

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