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文檔簡介
cfDNA樣本及文 流Comet介流CometComet介流CometComet設(shè)開發(fā)原2CometCometComet基于Firefly技術(shù)進(jìn)行開發(fā)設(shè)計;(專利號:US20160304954AlComet是以cfDNA為樣本的擴(kuò)增子建3Comet設(shè)計開發(fā)原RandomerrorsdonotcreaterepetitivevariantsintandemsequencesCancermutationscreaterepetitivevariantsintandemsequencesFirefly-ConcatemersequencingforNGSRandomerrorsdonotcreaterepetitivevariantsintandemsequencesCancermutationscreaterepetitivevariantsintandemsequencesRollingCircle4CometComet基于Firefly原理設(shè)計開發(fā)的Comet具有更高的
CYP2C19SNV(nucleotide681inexon
NucleotidePosition5Comet
ysis&Day
Day
Day1- Day2-
Day5day<2hrhands-on6CfDNA樣本及文 流
7 流采
Streck 常 采血
采血
低溫高速離 轉(zhuǎn)移血漿混 -80℃保存或注意事項:1.不同采血管低速離心溫度不一2.兩個轉(zhuǎn)移血漿的步驟,注意不要吸到分界面以下成分或者沉淀抽提cfDNA(一類備案試劑盒MagicPureTMCell-FreeDNA產(chǎn)物cfDNA質(zhì)片段分布質(zhì)控標(biāo)
8文 流試劑 試劑高溫處理冰浴(cfDNA+試劑
恒溫孵
恒溫孵環(huán)化連接產(chǎn)注意事項:1.操作過程保持在冰上高溫處理過程恒溫孵育采用PCR文 流試劑 試劑不同溫度孵 PCR擴(kuò)環(huán)化連接產(chǎn)
擴(kuò)增產(chǎn)注意事項:1.操作過程保持在冰上不同溫度孵育處理結(jié)束后立即放入冰浴多個樣本操作時,試劑6文 流純化目的片段,目的片段加barcode磁珠
PCR擴(kuò)擴(kuò)增產(chǎn)
吸 乙 洗脫樣 洗脫
擴(kuò)增文注意事項:1.磁珠提前室溫平衡,純化過程保持室溫操作棄上清,乙醇,轉(zhuǎn)移洗脫液過程中不要碰到磁乙醇第二 后干燥時間根據(jù)實驗環(huán)境溫濕度進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整,避免過度干燥文 流磁珠
室溫育 磁珠
室溫孵 吸 乙
洗 純化文注意事項:1.磁珠提前室溫平棄上清,乙醇,轉(zhuǎn)移洗脫液過程中不要碰到磁乙醇第二 后干燥時間根據(jù)實驗環(huán)境溫濕度進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整,避免過度干燥文 流單個文庫濃度>0.5ng/uL(Qu
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