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文檔簡介

13蛋白質(zhì)生物合成13.1蛋白質(zhì)合成體系13.2蛋白質(zhì)的生物合成13.3蛋白質(zhì)定位13.1.1mRNA與遺傳密碼蛋白質(zhì)是由20種氨基酸組成的,不同的蛋白質(zhì)中氨基酸排列順序不同,這種排列順序是按照基因中的堿基順序決定的。基因的遺傳信息在轉錄過程中從DNA轉移到mRNA,再由mRNA將遺傳信息表達為蛋白質(zhì)中氨基酸順序的過程稱翻譯。即蛋白質(zhì)的生物合成過程。蛋白質(zhì)合成過程中需要200多種生物大分子參加,包括核糖體、mRNA、tRNA及多種蛋白質(zhì)因子。用體外翻譯系統(tǒng)也可以進行蛋白質(zhì)的生物合成。如細菌無細胞系統(tǒng)、動物無核細胞系統(tǒng)、網(wǎng)織紅細胞裂解系統(tǒng)和麥胚系統(tǒng)等。只要加入外源mRNA模板,則可進行體外翻譯。13.1.1.1mRNA原核細胞每個mRNA分子常帶有多個功能相關蛋白質(zhì)的編碼信息,以一種多順反子的形式排列,在翻譯過程中可同時合成幾種蛋白質(zhì);真核細胞每個mRNA一般只帶一種蛋白質(zhì)編碼信息,是單順反子的形式。不同的蛋白質(zhì)有各自不同的mRNA,mRNA除含有編碼區(qū)外,兩端還有非編碼區(qū)。非編碼區(qū)對于mRNA的模板活性是必需的,特別是5’-端非編碼區(qū)在蛋白質(zhì)合成中可能是與核糖體結合的部位?;蛑懈鞣N序列的一般排列次序為:啟動信號—5‘-端前導區(qū)(非編碼區(qū))—編碼區(qū)—3‘-端尾序列(非編碼區(qū))—3‘端終止子。13.1.1.2遺傳密碼的破譯⑴遺傳密碼mRNA中蘊藏遺傳信息的堿基順序稱為遺傳密碼(Geneticcode)。mRNA分子上以5‘→3’方向,從AUG開始每三個連續(xù)的核苷酸(三聯(lián)體)組成一個密碼子(codon)。mRNA中的4種堿基可以組成64種密碼子。這些密碼代表了20種氨基酸,同時決定了翻譯過程的起始與終止位置。每種氨基酸至少有一種密碼子,最多的有6種密碼子。通過遺傳學和生物化學實驗,1966年編排出了遺傳密碼字典。⑵遺傳密碼的破譯基因密碼的破譯先后經(jīng)歷了五十年代的數(shù)學推理階段和1961-1965年的實驗研究階段。物理學家GeorgeGamov(1954)根據(jù)DNA中有4種核苷酸和蛋白質(zhì)中有20種氨基酸的對應關系,推理認為3個核苷酸為一個氨基酸編碼,可編64種氨基酸(43=64)是最理想的。因為在有四種核苷酸條件下,64是能滿足于20種氨基酸編碼的最小數(shù)。Brenner和Grick(1961)根據(jù)DNA鏈與蛋白質(zhì)鏈的共線性(colinearity),肯定了三個核苷酸為一個氨基酸編碼的推理。隨后的實驗研究證明此推理是正確的。①均聚核苷酸指導均聚肽合成Nirenberg和Mathaei(1961)合成了polyU作為模板,加入體外無細胞翻譯系統(tǒng)中。將翻譯產(chǎn)物分析后,發(fā)現(xiàn)合成的肽鏈中的氨基酸殘基全部是Phe。確認了第一個Phe的密碼子(UUU)。以polyA和polyC為模板,證明了分別可指導合成polyLys和polyPro,確定了AAA是Lys的密碼子,CCC是pro的密碼子。但類似的實驗不能證明GGG是何種氨基酸的密碼子,因為polyG產(chǎn)生牢固的氫鍵結合,形成三股螺旋,而不與核糖體結合。②特定共聚核苷酸Speyer等(1963)用2個堿基的共聚物(mixedcopolymers)破譯密碼的方法。以A和C原料合成polyAC。polyAC含有8種不同的密碼子:CCC、CCA、CAA、AAA、AAC、ACC、ACA和CAC。實驗中AC共聚物作模板翻譯出的肽鏈由6種氨基酸組成,即Asp、His、Thr、Pro和Lys,其中Pro和Lys的密碼子已證明是CCC和AAA。根據(jù)共聚物成份不同的比例和翻譯產(chǎn)物中氨基酸比例亦不同的關系,確定了Asp、Glu和Thr的密碼子含2AlC;His的密碼子含1A2C;Thr的密碼子也可以含1A2C;Pro為3C或1A2C;Lys為3A。但此方法不能確定A和C的排列方式,而只能顯示密碼子中堿基組成及組成比例。③核糖體結合技術Nirenberg等(1964)建立了aa-tRNA與確定密碼子結合實驗的破譯密碼新方法。在缺乏蛋白質(zhì)合成所需的因子的條件下,特異aa-tRNA可與核糖體-mRNA復合物結合。它并不一定需要長的mRNA分子,三核苷酸就可以與核糖體結合。例如,當polyU與核糖體混合時,僅有Phe-tRNA與之結合;Pro-tRNA特異地與polyC結合等。64個三核苷酸(密碼子)都可按設想的序列合成,但有一些三核苷酸序列與核糖體結合不是很有效,因此不能確定它們是否能為特異的氨基酸編碼。1。體外翻譯系統(tǒng)2。人工合成核酸3核糖體結合技術④重復共聚物(repeatingcopolymers)破譯密碼Nishimura等人應用有機化學和酶學技術,制備了已知的核苷酸重復序列。蛋白質(zhì)在核糖體上的合成可以在這些有規(guī)律的共聚物的任一點開始,并把特異的氨基酸參入肽鏈。例如,重復序列CUCUCUCUCU......是多肽Leu-Ser-Leu-Ser...或是Ser-Leu-Ser...的mRNA;使用共聚物構成三核苷酸為單位的重復順序。如(AAG)n,它可合成:polyLys、polyArg和polyGlu三種類型的多肽,即AAG是Lys的密碼子,AGA是Arg的密碼子,GAA是Glu的密碼子。1965年破譯了所有氨基酸的密碼子13.1.1.3遺傳密碼的基本性質(zhì)①密碼子的方向性②讀碼的連續(xù)性兩個密碼子之間無任何核苷酸或其它成分加以分隔,即密碼子間無逗號。因此從起始碼AUG開始,三個堿基代表一個氨基酸,從mRNA的5‘→3’方向構成一個連續(xù)的讀框,直至終止碼。如果在讀框中間插入或缺失一個堿基就會造成移碼突變,引起突變位點下游氨基排列的錯誤。③起始密碼子和終止密碼子:AUG是起始密碼子,也是Met(或者fMet)的密碼子。原核和真核生物肽鏈合成的第一個氨基酸都是Met(或者fMet);少數(shù)細菌中也用GUG做為起始碼(起始位點編碼fMet,密碼表中編碼Val);真核生物偶爾也用CUG作起始蛋氨酸的密碼。密碼子UAA,UAG,UGA是肽鏈成的終止密碼,不代表任何氨基酸,也稱無意義密碼子。④密碼子有簡并性(degeneracy)一種氨基酸有幾個密碼子的現(xiàn)象稱為密碼子的簡并性。簡并性主要是因密碼子第3個堿基發(fā)生擺動現(xiàn)象形成的。密碼子的專一性主要由前兩個堿基決定,這對保證物種穩(wěn)定性有一定意義。但并不是所有的簡并性都是前兩個核苷酸相同。如GCU,GCC,GCA,GCG都代表Ala。Met和Trp只有1個密碼子,其它氨基酸均有2個以上密碼子,如Arg有6個密碼子。⑤密碼子有通用性,即不論是病毒、原核生物還是真核生物密碼子的含義都是相同的。但真核線粒體的密碼子有例外:線粒體中UGA不是終止密碼子,而編碼Trp;肽鏈內(nèi)的Met由AUG和AUA二個密碼子編碼,起始部位的Met由AUG、AUA、AUU和AGG均可編碼;AGA和AGG不是Arg的密碼子,而是終止密碼子,即UAA、UAG、AGA和AGG均為終止密碼子。⑥密碼與反密碼子的相互識別——變偶性由于一種tRNA(如Ala-tRNAAla)能識別幾種密碼子,而且某些反密碼子中含稀有堿基次黃嘌呤(I),I可與A、U或C配對。一般是反密碼子的5’-端堿基與密碼子的3’-端堿基非正規(guī)配對,但能使正確的氨基酸進入非正確的密碼子的現(xiàn)象稱為變偶性。Crick(1966)提出了“擺動(變偶)假說”解釋了此現(xiàn)象?!皵[動假說”認為:堿基間除標準配對外,還可以有非標準的配對。密碼子第1、2堿基必需按標準配對,第3堿基的配對可以有一定靈活性,但不是任意組合。反密碼與密碼堿基配對時的搖擺現(xiàn)象⑦每個密碼子三聯(lián)體(triplet)決定一種氨基酸性質(zhì)相近的氨基酸的密碼子排列較近,這有利于在基因突變時不會引起蛋白質(zhì)功能的變化。13.1.2tRNA的結構與功能在蛋白質(zhì)生物合成過程中,tRNA主要起轉運氨基酸的作用。由于tRNA分子的同工性,細胞內(nèi)tRNA的種類(40多種)比氨基酸的種類多。tRNA的分子量為25~30kD,沉降常數(shù)約4S,由約80個核苷酸組成,其中含有大量稀有堿基,如假尿嘧啶核苷(ψ),各種甲基化的嘌呤和嘧啶核苷,二氫尿嘧啶(D)和胸腺嘧啶(T)核苷等。原核和真核細胞一個tRNA分子一般有10~15個稀有堿基,其功能不十分清楚。tRNA中有15~16個核苷酸的種類和位置不變,為固定核苷酸。其它的為可變核苷酸。13.1.2.1tRNA的二級結構通過對tRNA分子分段酶解和鍵自由能(△G)的計算,證明單股tRNA鏈可通過自身折疊形成四個螺旋區(qū)和四個環(huán)的基本結構,類似一個三葉草,稱為三葉草結構(cloverleafstructure)。所有的tRNA均為三葉草狀結構。二級結構的特點①3'端含CCA-OH序列。氨基酸接在腺苷酸殘基(A)上,CCA-OH序列稱為氨基酸接受臂(aminoacidacceptorarm)。3‘-端第5~11位核苷酸與5’-端第1~7位核苷酸形成螺旋區(qū),稱為氨基酸接受臂(aminoacidacceptorstem)。②TψC環(huán);TψC環(huán)由7個堿基組成,參與tRNA與核糖體表面的結合。③額外環(huán)或可變環(huán)(extrovariableloop)。堿基種類和數(shù)量(3~18個堿基)高度可變,并富含稀有堿基。④反密碼子環(huán)(anti-cordonloop)。由7個堿基組成,處于中間位的3個堿基為反密碼子。反密碼子可與mRNA中的密碼子結合。毗鄰反密碼子的3‘端堿基往往為烷化修飾嘌呤,其5’端為U,即:U-反密碼子-修飾嘌呤。13.1.2.2tRNA的三維結構①tRNA的三維結構(threedimensionalstructure)是倒“L”形。②氨基酸接受臂CCA序列和反密碼子處于倒L的兩端。③D環(huán)和TψC環(huán)形成了倒L的角。不同tRNA倒L形的角有輕微改變,以允許tRNA在執(zhí)行不同功能時改變其功能。每種氨基酸都只有一種氨酰tRNA合成酶。因此細胞內(nèi)有20種氨酰tRNA合成酶。tRNA分子中的反密碼環(huán)上反密碼子的三個堿基與mRNA分子中的密碼子靠堿基配對原則而形成氫鍵,達到相互識別的目的。但在密碼子與反密碼子結合時具有一定擺動性。13.1.2.3氨酰-tRNA合成酶(aaRS)aaRS存在于細胞漿中,分子量2.27×104~2.7×105,由一個或幾個亞基組成。單個亞基間的大小差別較大。aaRS的活性中心一般含有一個或幾個-SH基,它在催化中發(fā)揮作用。aaRS具有高度的特異性,它既能識別特異的氨基酸,又能識別攜帶該氨基酸的特異tRNA。aaRS對氨基酸有嚴格的特異性,而對與此氨基酸相適應的數(shù)種同工tRNA則無嚴格的特異性。aaRS催化的反應過程分二步進行:首先是氨基酸被aaRS活化生成結合于酶上的氨酰腺苷酸(AA-AMP),然后是tRNA的氨基酰化。aa-tRNA復合物的形成是非常精確的。tRNA分子結合到酶上時,識別已結合的AA-AMP,可將錯誤的AA-AMP水解掉而加以校正。一旦一個特殊的氨基酸被連接到tRNA分子上,在蛋白質(zhì)合成的后續(xù)步驟中便沒有任何特異的識別和校正方式。13.1.3rRNA和核糖體核糖體(ribosome,核蛋白體)是由rRNA和蛋白質(zhì)組成的亞細胞顆粒,位于胞漿內(nèi)。一類核糖體附著于粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng),參與分泌性蛋白質(zhì)的合成,另一類游離于胞漿,參與細胞固有蛋白質(zhì)的合成。在一個生長旺盛的細菌中大約有20000個核糖體,其中蛋白質(zhì)占細胞總蛋白質(zhì)的10%,RNA占細胞總RNA的80%。核糖體有大、小兩個亞基。在原核細胞和真核細胞中核糖體的組成不同。13.1.3.1核糖體的組成核糖體的組分包括rRNA和蛋白質(zhì)。⑴rRNA組成核糖體的rRNA為單股鏈,可自行折疊形成螺旋區(qū)和環(huán)區(qū),所有螺旋區(qū)的堿基都是保守的;⑵蛋白質(zhì)與rRNA或核糖體亞基結合的蛋白質(zhì)有二類:①核糖體蛋白質(zhì)核糖體蛋白質(zhì)是一類與rRNA或核糖體亞基緊密連接的蛋白質(zhì)。如E.coli30S亞基上的21種蛋白質(zhì)及50S亞基上的34種蛋白質(zhì)(共54種,小亞基上的S20與大亞基上的L26是相同);真核細胞40S亞基上的30種蛋白質(zhì)及60S亞基上的45-50種蛋白質(zhì)(共約80種),都屬核糖體蛋白質(zhì)。②核糖體相關蛋白質(zhì)(proteinsassociatedwithribosome;PAR)這類蛋白質(zhì)與核糖體亞基疏松締合,是對核糖體循環(huán)發(fā)揮調(diào)節(jié)作用的蛋白質(zhì)。如起始因子(IF或eIF)和延長因子(EF)等。PAR不是構成核糖體的固有成分。13.1.3.2核糖體的結構運用電子顯微鏡術、免疫學方法、中子衍射技術、雙功能試劑交聯(lián)法、不同染料間單態(tài)-單態(tài)能量轉移測定、活性核糖體顆粒重建等方法。完成了對E.coli核糖體54種蛋白質(zhì)氨基酸序列及三種rRNA一級和二級結構的測定。①核糖體的顆粒的大小和形狀30S亞基的大小為5.5×22×22nm,小亞基是一扁平不對稱顆粒,由頭和體組成,分別占小亞基的1/3和2/3。在頭和體之間的部分是頸,并有1-2個突起稱為葉或平臺。50S亞基為11.5×23×23nm,呈三葉半球形。RNA和蛋白質(zhì)的分布相對集中,RNA主要定位于核糖體中央,蛋白質(zhì)在顆粒外圍。13.1.3.3核糖體的結合位點rRNA與蛋白質(zhì)共同構成的核糖體功能區(qū)是核糖體表現(xiàn)功能的重要部位。①mRNA結合位點:位于30s小亞基頭部,負責與mRNA的結合,特別是16srRNA的3’-端與mRNA的AUG之前的一段序列互補是這種結合必不可少的。②A位點:(Aminoacyl-tRNAsite)是結合新進入的氨基酰-tRNA的位置。即氨基酰-tRNA位或受位。它大部分位于大亞基而小部分位于小亞基,③P位點:(peptidyl-tRNAsite)是結合起始tRNA并向A位給出氨基酸的位置。又稱肽酰基-tRNA位或給位。它大部分位于小亞基,小部分位于大亞基,④轉肽酶活性部位位于P位和A位的連接處。rRNA作為催化劑。13.2蛋白質(zhì)的生物合成蛋白質(zhì)生的合成(翻譯,Translation)是把mRNA分子中堿基排列順序轉變?yōu)榈鞍踪|(zhì)中的氨基酸排列順序的過程。參與蛋白質(zhì)生物合成的成份至少有200種,主要由mRNA、tRNA、核糖體以及有關的酶和蛋白因子組成。蛋白質(zhì)是由20種氨基酸合成的。某些蛋白質(zhì)中含有羥脯氨酸、羥賴氨酸、γ-羧基谷氨酸等,都是在肽鏈合成后的加工修飾過程中形成的。氨基酸在核糖體上縮合成多肽鏈是通過核糖體循環(huán)而實現(xiàn)的。此循環(huán)可分為肽鏈合成的起始(initiation),肽鏈的延伸(elongation)和肽鏈合成的終止(termination)三個過程。13.2.1氨基酸的激活與氨酰-tRNA的合成在蛋白質(zhì)生物合成中,各種氨基酸在參入肽鏈之前必須先經(jīng)活化,然后再由其特異的tRNA攜帶至核糖體上,才能以mRNA為模板縮合成肽鏈。氨基酸活化后與相應的tRNA結合的反應,是由特異的aaRS催化的。氨基酸的活化反應

aaRS催化下,利用ATP供能,在氨基酸羧基上進行活化,形成氨基酰-AMP,再與aaRS結合形成三聯(lián)復合物,此復合物再與特異的tRNA作用,將氨基酰轉移到特異tRNA的氨基酸臂上。原核細胞中起始氨基酸(Met)活化后,需經(jīng)甲?;纬蒮Met-tRNA。真核細胞無此過程。13.2.2原核生物肽鏈合成的起始①三元復合物(trimercomplex)的形成在起始因子3(InitiationFactor,IF3)介導和IF-1促進下,核糖體30S小亞基附著于mRNA的起始信號部位,形成IF3-30S亞基-mRNA三元復合物。mRNA上位于AUG的上游8~13個核苷酸處有一短的SD序列(Shine-Dalgarno,核糖體結合序列),它與30S小亞基16SrRNA的3’端部分序列互補,是核糖體結合位點。SD序列可使核糖體選擇mRNA上AUG的正確位置起始肽鏈合成。②30S前起始復合物的形成在IF2作用下,fMet-tRNAMet與mRNA分子中的起始密碼子(AUG或GUG)相結合(密碼子與反密碼子反應)。同時IF3從三元復合物脫落,形成30S前起始復合物:IF2-30S亞基-mRNA-fMet-tRNAMet復合物。③70S起始復合物形成50S亞基與30S前起始復合物結合,同時IF2脫落,形成70S起始復合物:30S亞基-mRNA-50S亞基-fMet-tRNAMet復合物。此時fMet-tRNAMet占據(jù)著50S亞基的P位,而50S的A位暫空,有待于對應mRNA中第二個密碼的相應氨酰-tRNA進入,從而進入延長階段。13.2.3肽鏈的延長肽鏈的延長包括:進位、肽鍵形成、脫落和移位等過程。肽鏈合成的延長需兩種延長因子(Elongationfactor,EF)EF-T和EF-G以及GTP供能。①進位在GTP、EF-T等參與下,新的氨酰-tRNA進入50S大亞基A位,并與mRNA分子上相應的密碼子結合。結合在mRNA上的fMet-tRNAMet(或肽酰-tRNA)占據(jù)著P位點,新進入的氨酰-tRNA則結合到A位點,并與mRNA上第二個密碼子結合。②肽鍵形成在大亞基上肽酰轉移酶催化下,P位點上tRNA攜帶的甲酰蛋氨?;?或肽酰基)轉移給A位上新進入的氨基酰-tRNA的氨基酸,即P位上的氨基酸(或肽的3‘端氨基酸)的α-COOH基,與A位上的氨基酸的α-NH2基形成肽鏈。在P位點上的tRNA成為無負載的tRNA,而A位上的tRNA負載著二肽?;ɑ蚨嚯孽;?。③脫落50S亞基P位上無負載的tRNA脫落。④移位在EF-G和GTP的作用下,核糖體沿mRNA鏈(5‘→3’)相對移動。每次移動相當于一個密碼子的距離,使下一個密碼子能準確定位于A位點。原來處于A位點上的二肽酰tRNA轉移到P位點上,空出A位點。隨后再依次進位、肽鍵形成、脫落和移位進行下一循環(huán)。延長過程每重復一次,肽鏈延伸一個氨基酸殘基。多次重復使肽鏈增長到必要的長度。肽鏈的延伸是從N端開始的。13.2.4肽鏈合成的終止與釋放肽鏈合成的終止,需終止因子或釋放因子(ReleasingFactor,RF)參與。RF可識別mRNA鏈上終止密碼子,使肽鏈釋放,核糖體解聚。①當mRNA上肽鏈合成終止密碼子出現(xiàn)在核糖體的A位點上。終止因子(RF)—可識別終止密碼子,并在A位點上與終止密碼子相結合,從而阻止肽鏈的繼續(xù)延伸。②終止因子可使核糖體P位點上的肽酰轉移酶發(fā)生變構,酶活性從轉肽作用變?yōu)樗庾饔?,使tRNA所攜帶的多肽鏈與tRNA之間的酯鍵被水解切斷,多肽鏈從核糖體及tRNA釋放出來。核糖體與mRNA分離;在核糖體P位上的tRNA和A位上的RF脫落。在IF3的參與下,與mRNA分離的核糖體又分離為大小兩個亞基,可重新投入另一條肽鏈的合成過程。mRNA鏈上同時結合著許多個核糖體,稱為多核糖體。兩個核糖體之間有一定的長度裸露的mRNA鏈間隔,所以多核糖體可在一條mRNA鏈上同時合成幾條多肽鏈。13.2.5真核生物蛋白質(zhì)的生物合成真核細胞的蛋白質(zhì)生物合成過程和原核細胞基本類似。但參與真核蛋白質(zhì)生物合成的核糖體結構、大小、組成和mRNA的結構等不同,特別是真核細胞蛋白質(zhì)合成的起始步驟更復雜。已發(fā)現(xiàn)的真核起始因子有近10種(eukaryoteInitiationFactor,eIF)13.2.5.1真核生物蛋白質(zhì)生物合成的起始起始復合物形成位于mRNA5’端AUG上游的帽子結構。①形成43S核糖體復合物:40S小亞基與elF3和elF4c組成。②形成43S前起始復合物:在43S核糖體復合物上,連接elF2-GTP-Met-tRNAMet復合物。③形成48S前起始復合物:由mRNA及帽結合蛋白1(CBP1)、elF4A、elF4B和elF4F共同構成一個mRNA復合物。mRNA復合物與43S前起始復合物作用,形成48S前起始復合物。④形成80S起始復合物:在elF5的作用下,48S前起始復合物中的所有elF釋放出,并與60S大亞基結合,最終形成80S起始復合物:40S亞基-mRNA-Met-tRNAMet-60S亞基在真核生物蛋白質(zhì)生物合成的起始階段,40S核糖體亞基一般可選擇第一個起始密碼子AUG,開始對mRNA翻譯。由于AUG是唯一的起始密碼子;并且,40S亞基與帶帽的mRNA5'末端接觸,沿著mRNA"掃描"一直到抵達第一個AUG處再開始翻譯。13.2.5.2肽鏈的延長和終止真核細胞蛋白質(zhì)生物合成延長和終止中所涉及的因子比較簡單。真核細胞肽鏈延長和終止所涉及的因子

因子功能EF1α促使aa-tRNA與核糖體結合EF1βγ使EF1α再循環(huán)EF2轉位RF肽鏈釋放延長因子(EF1α)可與GTP和aa-tRNA形成復合物,并把aa-tRNA供給核糖體。EF1βγ能催化GDP-GTP交換,有助于EF1α再循環(huán)利用;EF2催化GTP水解和使aa-tRNA從A位轉移至P位。肽鏈合成的終止僅涉及釋放因子(RF)。RF可識別所有的三種終止密碼子UAA,UAG和UGA。終止肽鏈合成。RF活化肽鏈酰轉移酶釋放新生肽鏈后,即從核糖體解離。13.2.6肽鏈合成后的加工mRNA翻譯的多肽大多數(shù)為無功能的初級產(chǎn)物,需經(jīng)折疊、修飾、剪切等加工過程后才具有活性。原核的有些蛋白質(zhì)要分泌到細胞外,真核的許多蛋白質(zhì)要易位到細胞器或胞液中。13.2.6.1蛋白質(zhì)的修飾蛋白質(zhì)的修飾一般伴隨著肽鏈合成的進行。修飾有利于折疊,也與蛋白質(zhì)的易位和分泌有關。多肽鏈的修飾包括:①N-端的Met(fMet)殘基,以及有些多肽鏈N-端的多個殘基或C-端的殘基都會被切除;②一些多肽鏈還要經(jīng)過一定的剪接;③氨基酸側鏈的修飾:二硫鍵形成、磷酸化、糖基化、脂化、核糖基化和乙酰化等。磷酸化糖基化13.2.6.2蛋白質(zhì)的折疊蛋白質(zhì)的折疊是由多肽鏈中氨基酸順序決定的。但環(huán)境條件對折疊有影響。肽鏈折疊與肽鏈合成同步進行。隨著肽鏈的延伸,空間構象不斷調(diào)整,最終成為天然態(tài)的構象。一些酶和分子伴侶可參與肽鏈的折疊,稱它們?yōu)橹郫B蛋白(foldlinghelper)。①酶如蛋白質(zhì)二硫鍵異構酶(proteindisulfide1somerase,PDI)可加速形成蛋白質(zhì)中正確的二硫鍵;肽酰脯酰順反異構酶(peptidylprolylcis/transisomerase,PPI)可催化肽脯氨酰之間肽鍵的旋轉反應,從而加速蛋白質(zhì)的折疊過程。②分子伴侶(chaperonin)是細胞內(nèi)一類能幫助新生肽鏈正確組裝、成熟和跨膜運輸,自身卻不是終產(chǎn)物分子的成分的蛋白質(zhì),類似酶但又無酶的專一性特征,所以稱為分子伴侶。分子伴侶所識別的靶蛋白部位是它們部分折疊的非天然狀態(tài),促進折疊的機理尚不清楚。13.2.7抑制翻譯的抗菌素很多抗菌素對蛋白質(zhì)合成都有抑制作用。①四環(huán)素族(tetracyclinefamily)抑制氨基酰–tRNA與原核細胞核糖體的結合,而抑制多種細菌的蛋白質(zhì)合成。②氯霉素(chloromycetin)與原核細胞核糖體的50S亞基結合,阻斷肽鍵的形成。高濃度時,對哺乳動物線粒體內(nèi)核糖體50S亞基也有作用。③鏈霉素(Streptomycin)和卡那霉素(Kanamycin)與原核細胞核糖體30S亞基結合而改變其構象,引起讀碼錯誤,導致合成錯誤的蛋白質(zhì)。④嘌呤霉素(Puromycin)結構與氨酰–tRNA末端相似,帶有游離氨基,可以取代氨基酰–tRNA進入核糖體受位,使正在延長中的肽鏈轉移到嘌呤霉素的氨基上,這種異常肽鏈很容易從核糖體上釋放下來,從而終止肽鏈的延長。對真核及原核細胞都有作用,不能用于臨床治療。⑤亞胺環(huán)己酮(Cycloheximide)對真核細胞有作用,能抑制核糖體上的多肽轉移酶。此外,白喉毒素也能抑制蛋白質(zhì)合成,它是由白喉棒狀桿菌產(chǎn)生的,卻不抑制細菌的蛋白質(zhì)合成。此毒素可對延長因子–2進行酶促反應,使其修飾成腺苷二磷酸核糖衍生物,從而使動物延長因子–2失活,抑制肽鏈的移位作用。由于它是一種酶蛋白,極小量即能完全抑制蛋白質(zhì)合成,成為一種劇毒物。13.3蛋白質(zhì)的易位原核生物和真核生物新合成的蛋白質(zhì)只有被運送到各自特定的亞細胞部位或分泌到胞外才具有功能活性,該過程就稱為蛋白質(zhì)定位(易位)。蛋白質(zhì)的易位可分為共翻譯易位和翻譯后易位兩種途徑。①共翻譯(co-translation)易位分泌蛋白和跨膜蛋白在合成過程中,N-端都有一段信號肽(signalpeptide)序列,它可引導分泌蛋白和跨膜蛋白的肽鏈通過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜,過膜后則被內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的信號肽酶切除。信號肽常位于蛋白質(zhì)的N-端,長度為15~36個氨基

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