參考教程說明

ASP上機(jī) 幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化（分子1.弛豫結(jié)21.H2OMedeA創(chuàng)建模型：打開昨天創(chuàng)建好的結(jié)File→Open→FilefromDisk→選擇保存結(jié) 31.H2O創(chuàng)建輸入文件：INCAR、POSCAR、KPOINTS、FileExport文件名：H2O保存類型：cif保41.H2O用UltraEdit打開H2O.cif文件→ 51.H2O切換至Xs界面，登陸，進(jìn)入vasp文件夾將模板文件夾bak直接拷貝成H2O文件夾→cp-rbakH2O進(jìn)入H2O文件夾cdH2O編輯POSCARviPOSCAR將其中模型坐標(biāo)部分刪 dd/d]]進(jìn)入插入模 i右鍵粘貼，將UltraEdit 坐標(biāo)信息粘貼替換模板中的坐標(biāo)部分

cdvasp保存

Esc:wq

61.H2O ！各種原子的個數(shù)（一個O原子，兩個H原子71.H2O

catINCARSYSTEM=H2OISTART=0ICHARG=LREAL=.F.IBRION=2NSW=POTIM=EDIFFG=-

ENCUT=400eVNELM=60EDIFF=0.1E-04LCHARG=.F.LWAVE=.F.ISMEAR=0SIGMA=ALGO=

！不保留！不保留81.H2O

catKPOINTSmeshautoG 提示：對于10x10x10?大小的晶胞，使用Gamma點(diǎn)計算91.H2O切換至vasp2015cd..將O和H的贋勢文件連接成一個文件，命名為POTCARcatPAW/O/POTCAR進(jìn)入H2Ocd

>qsubvasp.pbs1.H2O實(shí)時查看計算過程：OUTCAR、tail-f退出此模式：ctrl1.H2O計算結(jié)束后，查看主要輸出文件：OUTCAR、OSZICARCONTCAR、viviOUTCAR到OUTCAR最末顯示右圖[[到最前1.H2O計算結(jié)束后，查看主要輸出文件：OUTCAR、OSZICARCONTCAR、viviOUTCAR向上翻步離子弛豫過后子坐標(biāo)及原子受。

1.H2O計算結(jié)束后，查看主要輸出文件：OUTCAR、OSZICARCONTCAR、viviOSZICAR向后翻1.H2O計算結(jié)束后，查看主要輸出文件：OUTCAR、OSZICARCONTCAR、viviCONTCAR即子弛豫過后的體即同同POSCAR的格式完全一致如果在計算時，結(jié)構(gòu)沒有收斂或者結(jié)構(gòu)優(yōu)化之后要接著進(jìn)行scf計算，則可業(yè)結(jié)束后生成的CONTCAR替代新作業(yè)中的POSCAR（cpCONTCARPOSCAR）。1.H2O計算結(jié)束后，查看主要輸出文件：OUTCAR、OSZICARCONTCAR、viXDATCARvi弛豫過后的原子坐標(biāo)時，取中間某一步結(jié)能量：建議采用本子記下來，注明體系及重要參數(shù)查看結(jié)構(gòu)：采用MedeA直接打開CONTCAR文1.H2O

練習(xí) O2分練習(xí)1O2MedeA中打開本地O2分子，并導(dǎo)出為cif文練習(xí)1O2創(chuàng)建O2文件夾準(zhǔn)備四個輸入文件 H2O的輸出文件（cp–rH2OO2）修改POTCAR（cpPAW/O/POTCARO2，只含有O的贋勢修改POSCAR、INCAR、cdINCAR文件需要填加KPOINTS不需修改，晶胞尺寸相同，k點(diǎn)不投作業(yè)練習(xí)1O2ISPIN=！打開ISPIN=！打開自旋極ICHARG=VOSKOWNNELM=！計算磁性需LREAL=EDIFF=0.1E-IBRION=LCHARG=NSW=ISMEAR=POTIM=EDIFFG=-SIGMA=ALGO=練習(xí)1