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文檔簡介
時間分辨熒光蛋白Time-ResolvedProteinFluorescence熒光蛋白的時間分辨測量time-resolvedmeasurementsofprotein
fluorescence越來越普遍原因:時域(TD)和頻域(FD)儀器越來越可靠研究的挑戰(zhàn)缺少簡單的脈沖光源從蛋白質(zhì)隨時間變化的數(shù)據(jù)解釋該現(xiàn)象1、蛋白質(zhì)的熒光的單光子激發(fā)需要波長在280至305納米的范圍內(nèi)。2、蛋白質(zhì)熒光激發(fā)脈沖激光二極管尚未公布。脈沖LED用于蛋白質(zhì)的熒光激發(fā)剛剛宣布,但脈沖寬度超過1納秒。3、最近的研究所用的脈沖將Ti的三倍頻輸出:藍寶石激光或同步加速器輻射。缺乏的認(rèn)識色氨酸本身的強度衰減多個色氨酸殘基存在于一個單一的蛋白質(zhì),并顯示在復(fù)雜的衰變動力學(xué)當(dāng)中色氨酸本身在在中性pH溶液中顯示一個多指數(shù)或者非指數(shù)衰減1.INTENSITYDECAYSOFTRYPTOPHAN:
THEROTAMERMODEL色氨酸旋轉(zhuǎn)異構(gòu)體模型的強度衰變用時間分辨在解釋蛋白質(zhì)的衰變強度時的困難在于對色氨酸本身強度衰減缺乏了解在中性水溶液中的色氨酸的強度衰減是一種已知的雙指數(shù)衰減,時間近3.1和0.5ns色氨酸雙指數(shù)衰變占主導(dǎo)地位是由于旋轉(zhuǎn)異構(gòu)體的存在芳香族氨基酸和相關(guān)化合物在20°C,pH值7時的強度衰減吲哚色氨酸NATA酪氨酸O-甲基酪氨酸在溶液中的色氨酸側(cè)鏈采用不同的構(gòu)象,一個色氨酸溶液可以被視為一個的旋轉(zhuǎn)異構(gòu)體的混合物,即所謂的旋轉(zhuǎn)異構(gòu)體。在中性水溶液中,色氨酸兩性離子形式時氨基被質(zhì)子化(NH3+)和羧基電離(CO2–)。在溶液中的色氨酸能自淬滅,涉及吲哚環(huán)和帶正電荷的銨基團。色氨酸也可以由氨基酸側(cè)鏈淬火銨基淬火依賴于一定PH下色氨酸熒光量子產(chǎn)率隨著pH從8提高到10的氨基發(fā)生解離,量子產(chǎn)量和平均壽命增加約三倍如何通過氨基淬火解釋
色氨酸在pH值為7的雙指數(shù)衰減?旋轉(zhuǎn)異構(gòu)體在淬火過程顯示了比0.5納秒短的衰減時間旋轉(zhuǎn)異構(gòu)體的存在可能是在中性pH值色氨酸的多指數(shù)衰減的主要的原因酪氨酸和色氨酸及其中性的結(jié)構(gòu)類似物2.TIME-RESOLVEDINTENSITYDECAYSOF
TRYPTOPHANANDTYROSINE
色氨酸和酪氨酸的時間分辨強度衰變
過去不能夠可靠地解決其衰減時間和幅度現(xiàn)在已知的0.5-和3.1-ns衰減組件顯示不同的發(fā)射光譜2.1色氨酸的衰變相關(guān)的發(fā)射光譜假設(shè)一個樣本顯示多指數(shù)衰減,其衰減在不同的發(fā)射波長不同。然后描述的強度衰減中αi(λ)是與波長相關(guān)的指數(shù)前因素和τi的衰減時間。這個表達式假設(shè)衰減時間與波長無關(guān)。發(fā)射光譜由于每個組件可以計算的短期和長期ns色氨酸的衰減成分的光譜分辨率
2.2酪氨酸及其中性衍生物的強度衰變酪氨酸也可以顯示復(fù)雜的衰變動力學(xué),但其性質(zhì)與色氨酸是相反的。酪氨酸及其中性類似物
N-乙酰基-L-酪氨酰胺的頻域的強度衰減酪氨酸本身顯示一個單指數(shù)衰變而NATyrA顯示一個雙指數(shù)衰變(可能是基態(tài)旋轉(zhuǎn)異構(gòu)體的存在)酪氨酸在水中的強度衰減通常是一個單一的指數(shù)3.INTENSITYANDANISOTROPYDECAYSOFPROTEINS
蛋白的強度和各向異性衰變由于NATA顯示一個衰減時間,我們可以預(yù)期單色氨酸的蛋白質(zhì),顯示單指數(shù)衰減。但是大多數(shù)單-色氨酸的蛋白質(zhì)顯示雙重或三重指數(shù)衰減3.1單指數(shù)強度和核糖核酸酶T1的各向異性衰減最單一的色氨酸蛋白顯示多指數(shù)衰減。然而,有有兩個已知的例外天青蛋白、核糖核酸酶T1米曲霉。大多數(shù)的核糖核酸酶不包含色氨酸。核糖核酸酶T1,它包含一個不尋常的單一的色氨酸殘基,一些條件下表現(xiàn)一個單指數(shù)衰減核糖核酸酶T1由
104個氨基酸組成的單鏈多肽
在2’-存在的核糖核酸酶T1結(jié)構(gòu)GMP(2′-GMP刪除)。59色氨酸位于α-螺旋和表之間的結(jié)構(gòu)。核糖核酸酶T1有四個苯丙氨酸,九個酪氨酸,和一個單一的—色氨酸殘基在位置59。色氨酸殘基的活性位點附近。時間分辨熒光強度和各向異性
在緩沖水溶液的pH值5.5的核糖核酸酶T1衰減該衰變成為在pH7雙指數(shù)。單指數(shù)衰變是方便的,因為變化的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)可以被預(yù)期會導(dǎo)致更復(fù)雜的衰減動力學(xué)。檢測出單指數(shù)衰變成為多指數(shù)衰減比檢測在一個多指數(shù)衰減的變化簡單一些3.2膜聯(lián)蛋白V:鈣離子敏感的單色氨酸蛋白質(zhì)對于大多數(shù)的蛋白質(zhì),甚至與單色氨酸殘基,強度和各向異性衰減更為復(fù)雜。一個例子是膜聯(lián)蛋白V,它具有一個單一的色氨酸殘基膜聯(lián)蛋白是一類同源蛋白以鈣依賴性方式結(jié)合到細(xì)胞膜上。在不存在鈣時膜聯(lián)蛋白V呈高度非指數(shù)的強度衰減鈣會導(dǎo)致強度衰減變得更像一個單一的指數(shù)。表明了附近的淬滅基團在無鈣的形式存在晶體膜聯(lián)蛋白Ⅴ的結(jié)構(gòu)是與該現(xiàn)象一致,因為在鈣的存在下色氨酸殘基移離蛋白質(zhì)3.3有兩個色氨酸蛋白質(zhì)的各向異性衰減在多色氨酸殘基的蛋白中,每個殘基可以是剛性的或移動的。在相同的蛋白質(zhì)色氨酸殘基在不同的位置可以有不同的運動和各向異性衰變。時間分辨的單色氨酸的各向異性衰變的磷轉(zhuǎn)運蛋白突變體。296nm激發(fā)4.ANISOTROPYDECAYSOFPROTEINS
蛋白的各向異性衰變前面我們看到的與蛋白質(zhì)的研究基于色氨酸殘基的數(shù)量有限色氨酸殘基的數(shù)目增加時,它變得不切實際解決個別殘基在這樣的情況下,必須翔實的研究野生型蛋白質(zhì)的壽命分布相移和解調(diào)的頻率依賴性在學(xué)葉菌的β-葡萄糖苷酶的熒光發(fā)射因素
中性pH在5,45和85℃。在所指示的溫度S.葉菌β-色氨糖苷酶壽命分布衰變是高度異質(zhì)性,解釋雙峰壽命分布方面,隨著溫度的增加,這兩個組逐步向更短的壽命遷移5.TIME-DEPENDENTSPECTRAL
RELAXATIONOFTRYPTOPHAN
色氨酸的光譜松弛時間在這一分析,我們假設(shè)每個色氨酸殘基在所有的波長顯示相同的壽命。然而,一個單一的色氨酸殘基的壽命可能不是在所有的發(fā)射波長相同。吲哚甘油20°C的強度衰減不同的波長的發(fā)射光譜進行測量強度衰減強度衰減在310nm處,藍色波長比在390納米衰減得更迅速強度衰減在380nm處顯示的上升時間是一個激發(fā)態(tài)過程的證明衰變相關(guān)光譜(頂部)和時間分辨發(fā)射譜(下)。DAS和TRES是從吲哚的甘油在20℃下相同時間分辨衰變計算出來衰變相關(guān)的光譜和時間分辨發(fā)射
從譜圖,在30℃,289-nm激發(fā)髓鞘堿性蛋白6.PERSPECTIVESONPROTEINFLUORESCENCE
透視熒光蛋白大量的蛋白結(jié)構(gòu)的可用性允許的蛋白質(zhì)和它們的光譜特性的結(jié)構(gòu)特征的相關(guān)性研究。如其中側(cè)鏈?zhǔn)亲钣锌赡芤遭缟彼?。能量轉(zhuǎn)移從短到長波長色氨酸已經(jīng)看到了幾種蛋白質(zhì)。發(fā)射最大值可以是與曝光相關(guān)溶劑,從蛋白質(zhì)看去結(jié)構(gòu)。熒光蛋白的更加深刻的理解將允許它的使用來回答更具體的問題關(guān)于蛋白質(zhì)功能和蛋白質(zhì)的相互作用與其他生物分子。多光子激發(fā)顯微鏡MultiphotonExcitationandMicroscopy多光子激發(fā)特點激發(fā)波長:兩個或多個光子同時激發(fā),激發(fā)波長是單光子激發(fā)波長的兩倍或多倍多光子激發(fā):依賴于多個光子同時到達的時間:使用脈沖飛秒激光器(i.e.10-16seconds),且能提供更高的峰值功率;熒光限制在焦點處,能滿足多個光子同時達到產(chǎn)生多光子吸收。熒光強度正比于激光強度多光子激發(fā)---一個非線性過程多光子與單光子比較
單光子
雙光子*照明錐體大體積激發(fā)
*激發(fā)局限在焦點
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