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單基因遺傳病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的估計(jì)
bayes公式的應(yīng)用唐吟宇2/5/20231遺傳教研室一、概念前概率:根據(jù)親代的情況計(jì)算出來(lái)的概率條件概率:根據(jù)自己或子代情況計(jì)算出來(lái)的概率聯(lián)合概率:前概率與條件概率的乘積后概率:聯(lián)合概率的相對(duì)頻率2/5/20232遺傳教研室二、舉例說(shuō)明Ex1:慢性進(jìn)行性舞蹈病(AD)已知(條件):30歲以前發(fā)病的占1/3。一位女性,父親是患者,本人已到30歲尚未發(fā)病。問(wèn):該女性發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)還有多大?2/5/20233遺傳教研室解:30歲以前發(fā)病的占1/3可以從4個(gè)方面來(lái)理解1)30歲以前發(fā)病的可能性1/32)30歲以前不(沒(méi)有)發(fā)病的可能性2/33)30歲以后發(fā)病的可能性2/34)30歲以后不(沒(méi)有)發(fā)病的可能性1/3?ⅠⅡ
Aa(前提)2/5/20234遺傳教研室根據(jù)題目所給條件即:30歲尚未發(fā)病,與2)相符,所以2)即是本題的條件概率。Bayes方法首先要作“假設(shè)”,其依據(jù)是要回答的問(wèn)題只有在哪種“情況”下才會(huì)發(fā)生,就假設(shè)這種“情況”,另一個(gè)是相反的假設(shè),該女性表型正常,基因型為aa或Aa.2/5/20235遺傳教研室假設(shè):是Aa不是Aa(是aa)前概率:1/21/2條件概率:2/31聯(lián)合概率:1/2*2/3=1/31/2*1=1/2后概率:
1/31/3+1/2
1/21/3+1/2=0.40=0.602/5/20236遺傳教研室所以Aa的概率為0.40,即發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)為40%原來(lái)的方法50%Bayes方法40%(降低)2/5/20237遺傳教研室Ex2.Hurler綜合癥(AR)12?21ⅠⅡⅢⅣ2/5/20238遺傳教研室已知(條件):Ⅳ1正常(若Ⅳ1是患兒,不必再算)問(wèn):Ⅳ2發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)(Ⅳ3
Ⅳ4……
)解:Ⅲ1與Ⅲ2表型正常,基因型組合三種可能性AA*AAAA*AaAa*Aa均不能生患兒,與問(wèn)題不符2/5/20239遺傳教研室假設(shè)Ⅲ1和Ⅲ2同為AaⅢ1和Ⅲ2不同為Aa前概率(2/3*1/2*1/2)*(2/3*1/2*1/2)=1/36
1-1/36=35/36條件概率
3/4
1聯(lián)合概率
1/36*3/4
35/36*1后概率
3/143
140/1432/5/202310遺傳教研室Ⅳ2是患兒的風(fēng)險(xiǎn):3/143*1/4=3/572原來(lái)的方法1/6*1/6*1/4=1/144(0.69%)Bayes方法3/572=0.52%(降低)2/5/202311遺傳教研室Ex3.自毀容貌綜合癥(XR)214XAXaⅠⅢⅡⅣ2/5/202312遺傳教研室已知(條件):Ⅲ24個(gè)弟弟均正常問(wèn):Ⅳ1發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)關(guān)鍵是求Ⅲ2是XAXa的概率,這取決于Ⅱ4
是XAXa的概率。且若對(duì)Ⅲ2作假設(shè),則其4個(gè)弟弟均正常的條件就無(wú)法用。因此只能對(duì)Ⅱ4作假設(shè)(才能用條件)2/5/202313遺傳教研室假設(shè):Ⅱ4是XAXaⅡ4不是XAXa前概率:
1/21/2條件概率:
1/2*1/2*1/2*1/2=1/161聯(lián)合概率:1/2*1/16=1/321/2*1=1/2后概率:
1/17
16/172/5/202314遺傳教研室Ⅲ2是概率:1/17*1/2=1/34Ⅳ1
(兒子)是患兒的概率:1/34*1/2=1/68原來(lái)的方法1/2*1/2
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