標準解讀
《GB/T 36806-2018 甘蔗桿狀病毒實時熒光PCR檢測方法》是一項國家標準,專門針對甘蔗桿狀病毒(Sugarcane bacilliform virus, SCBV)的檢測而設立。該標準詳細規(guī)定了采用實時熒光定量聚合酶鏈反應技術(Real-time fluorescence quantitative PCR, qPCR)來定性檢測甘蔗及其繁殖材料中是否存在SCBV的方法。
首先,在準備階段,需要對實驗所用的所有試劑和設備進行校準與驗證,確保其處于最佳工作狀態(tài)。這包括但不限于DNA提取試劑盒、qPCR儀以及特異性引物探針的設計或選擇等。對于樣品處理,則要求采集新鮮或冷凍保存的甘蔗葉片作為檢測樣本,并按照特定步驟提取總DNA。
接著是擴增體系構建環(huán)節(jié),根據(jù)標準推薦的比例配制反應混合液,加入適量模板DNA后進行封閉式循環(huán)擴增。在此過程中,通過監(jiān)測熒光信號的變化情況可以實時跟蹤目標序列的累積量。值得注意的是,為了保證結果準確性,還需設置陽性對照、陰性對照及內參基因對照等多個對照組別。
最后,在數(shù)據(jù)分析階段,依據(jù)Ct值(Cycle threshold value)判斷樣品是否含有SCBV:若樣品孔Ct值小于等于設定閾值且明顯低于空白對照,則判定為陽性;反之則為陰性。此外,還應結合電泳圖譜進一步確認檢測結果的有效性和可靠性。
該標準為實驗室提供了統(tǒng)一規(guī)范的操作流程和技術指標,有助于提高甘蔗桿狀病毒檢測工作的科學性與可比性,從而更好地服務于農業(yè)生產實踐中的病害防控需求。
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- 現(xiàn)行
- 正在執(zhí)行有效
- 2018-09-17 頒布
- 2019-04-01 實施
文檔簡介
ICS6502001
B16..
中華人民共和國國家標準
GB/T36806—2018
甘蔗桿狀病毒實時熒光
PCR檢測方法
DetectionofSugarcanebacilliformvirusbyreal-timePCR
2018-09-17發(fā)布2019-04-01實施
國家市場監(jiān)督管理總局發(fā)布
中國國家標準化管理委員會
中華人民共和國
國家標準
甘蔗桿狀病毒實時熒光
PCR檢測方法
GB/T36806—2018
*
中國標準出版社出版發(fā)行
北京市朝陽區(qū)和平里西街甲號
2(100029)
北京市西城區(qū)三里河北街號
16(100045)
網(wǎng)址
:
服務熱線
:400-168-0010
年月第一版
20189
*
書號
:155066·1-61159
版權專有侵權必究
GB/T36806—2018
前言
本標準按照給出的規(guī)則起草
GB/T1.1—2009。
本標準由全國植物檢疫標準化技術委員會提出并歸口
(SAC/TC271)。
本標準起草單位福建農林大學國家甘蔗工程技術研究中心農業(yè)部甘蔗及制品質量監(jiān)督檢驗測試
:、
中心農業(yè)部福建甘蔗生物學與遺傳育種重點實驗室
、。
本標準主要起草人高三基孫生仁吳小斌黃美婷傅華英王錦達張慧麗陳如凱
:、、、、、、、。
Ⅰ
GB/T36806—2018
甘蔗桿狀病毒實時熒光
PCR檢測方法
1范圍
本標準規(guī)定了甘蔗桿狀病毒SugarcanebacilliformIMvirus和甘蔗桿狀病
IM(,SCBIMV)MO
毒SugarcanebacilliformMOvirus實時熒光檢測方法的儀器與設備試劑與材料
(,SCBMOV)PCR、、
樣品的采集與前處理檢測以及結果判斷與表述等
、。
本標準適用于可能帶有和病毒的活體寄主植物的快速檢測診斷
SCBIMVSCBMOV、。
2縮略語
下列縮略語適用于本文件
。
十六烷基三甲基溴化銨
CTAB:(cetyltrimethylammoniumbromide)
值實時熒光反應中每個反應管內的熒光信號達到設定的閾值時所經歷的循環(huán)數(shù)
Ct:PCR,(cycle
threshold)
脫氧核糖核酸酶
DNase:(deoxyribonuclease)
乙二胺四乙酸二鈉
EDTA-Na2:(edetatedisodium)
羧基熒光素
FAM:6-(6-carboxy-fluorescein)
聚合酶鏈式反應
PCR:(polymerasechainreaction)
核糖核酸酶
RNase:(ribonuclease)
逆轉錄酶核糖核酸酶
RT/RNaseH:/H(reversetranscriptase/RNaseH)
甘蔗桿狀病毒SugarcanebacilliformIMvirus
SCBIMV:IM()
甘蔗桿狀病毒SugarcanebacilliformMOvirus
SCBMOV:MO()
甘蔗桿狀病毒Sugarcanebacilliformvirus
SCBV:()
羧基四甲基羅丹明
TAMRA:6-(6-carboxytetramethylrhodamine)
三羥甲基氨基甲烷鹽酸鹽
Tris-HCl:[Tris(hydroxymethyl)aminomethanehydrochloride]
3甘蔗桿狀病毒基本信息
甘蔗桿狀病毒屬于花椰菜花葉病毒科Caulimiviridae桿狀病毒屬Badnavirus英文名
()DNA(),
稱為Sugarcanebacilliformvirus縮寫為國際病毒分類委員會于年將的
,SCBV。(ICTV)2012SCBV
個分離物正式定為甘蔗桿狀病毒SugarcanebacilliformIMvirus和甘蔗桿狀病
2IM(,SCBIMV)MO
毒SugarcanebacilliformMOvirus兩個不同的種甘蔗桿狀病毒其他信息參見附錄
(,SCBMOV)。A。
4方法原理
在比對甘蔗桿狀病毒基因組序列的基礎上設計一對僅在該病毒基因間保守的特異
,RT/RNaseH
性引物和一條特異性的熒光雙標記探針在實時熒光擴增反應中探針的熒光
TaqMan。PCR,TaqMan
信號強度伴隨著目標序列
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